EMCAL/AliEMCALRecPoint.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id$ */
  16 //_________________________________________________________________________
  17 //  Reconstructed Points for the EMCAL
  18 //  A RecPoint is a cluster of digits
  19 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)
  20 //*-- Author: Dmitri Peressounko (RRC KI & SUBATECH)
  21 //*-- Author: Heather Gray (LBL) merged AliEMCALRecPoint and AliEMCALTowerRecPoint 02/04
  22
  23 // --- ROOT system ---
  24 class Riostream;
  25 #include <TPad.h>
  26 class TGraph;
  27 class TPaveText;
  28 #include <TClonesArray.h>
  29 #include <TMath.h>
  30
  31 // --- Standard library ---
  32
  33 // --- AliRoot header files ---
  34 //#include "AliGenerator.h"
  35 class AliGenerator;
  36 #include "AliRunLoader.h"
  37 #include "AliRun.h"
  38 class AliEMCAL;
  39 #include "AliEMCALLoader.h"
  40 #include "AliEMCALGeometry.h"
  41 #include "AliEMCALHit.h"
  42 #include "AliEMCALDigit.h"
  43 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  44
  45 ClassImp(AliEMCALRecPoint)
  46
  47 //____________________________________________________________________________
  48 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint()
  49   : AliRecPoint(),
  50     fGeomPtr(0),
  51     fClusterType(-1),
  52     fCoreEnergy(0),
  53     fDispersion(0),
  54     fEnergyList(0),
  55     fTimeList(0),
  56     fAbsIdList(0),
  57     fTime(0.),
  58     fCoreRadius(10),  //HG check this
  59     fMulParent(0),
  60     fMaxParent(0),
  61     fParentsList(0),
  62     fSuperModuleNumber(0)
  63 {
  64   // ctor
  65   fMaxTrack = 0 ;
  66   fMulDigit = 0 ;
  67   fAmp   = 0. ;
  68   //  fLocPos.SetX(1.e+6)  ;      //Local position should be evaluated
  69
  70   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::GetRunLoader();
  71   fGeomPtr = dynamic_cast<AliEMCAL*>(rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"))->GetGeometry();
  72   //fGeomPtr = AliEMCALGeometry::GetInstance();
  73   fGeomPtr->GetTransformationForSM(); // Global <-> Local
  74 }
  75
  76 //____________________________________________________________________________
  77 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const char * opt)
  78   : AliRecPoint(opt),
  79     fGeomPtr(0),
  80     fClusterType(-1),
  81     fCoreEnergy(0),
  82     fDispersion(0),
  83     fEnergyList(0),
  84     fTimeList(0),
  85     fAbsIdList(0),
  86     fTime(-1.),
  87     fCoreRadius(10),  //HG check this
  88     fMulParent(0),
  89     fMaxParent(1000),
  90     fParentsList(0),
  91     fSuperModuleNumber(0)
  92 {
  93   // ctor
  94   fMaxTrack = 1000 ;
  95   fMulDigit   = 0 ;
  96   fAmp   = 0. ;
  97   fParentsList = new Int_t[fMaxParent];
  98
  99   //fLocPos.SetX(1.e+6)  ;      //Local position should be evaluated
 100   //fGeomPtr = AliEMCALGeometry::GetInstance();
 101   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::GetRunLoader();
 102   fGeomPtr = dynamic_cast<AliEMCAL*>(rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"))->GetGeometry();
 103   fGeomPtr->GetTransformationForSM(); // Global <-> Local
 104 }
 105
 106 //____________________________________________________________________________
 107 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const AliEMCALRecPoint & rp)
 108   : AliRecPoint(rp),
 109     fGeomPtr(rp.fGeomPtr),
 110     fClusterType(rp.fClusterType),
 111     fCoreEnergy(rp.fCoreEnergy),
 112     fDispersion(rp.fDispersion),
 113     fEnergyList(0),
 114     fTimeList(0),
 115     fAbsIdList(0),
 116     fTime(rp.fTime),
 117     fCoreRadius(rp.fCoreRadius),
 118     fMulParent(rp.fMulParent),
 119     fMaxParent(rp.fMaxParent),
 120     fParentsList(0),
 121     fSuperModuleNumber(rp.fSuperModuleNumber)
 122 {
 123   //copy ctor
 124   fLambda[0] = rp.fLambda[0];
 125   fLambda[1] = rp.fLambda[1];
 126
 127   fEnergyList = new Float_t[rp.fMulDigit];
 128   fTimeList = new Float_t[rp.fMulDigit];
 129   fAbsIdList = new Int_t[rp.fMulDigit];
 130   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulDigit; i++) {
 131     fEnergyList[i] = rp.fEnergyList[i];
 132     fTimeList[i] = rp.fTimeList[i];
 133     fAbsIdList[i] = rp.fAbsIdList[i];
 134   }
 135   fParentsList = new Int_t[rp.fMulParent];
 136   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulParent; i++) fParentsList[i] = rp.fParentsList[i];
 137
 138 }
 139 //____________________________________________________________________________
 140 AliEMCALRecPoint::~AliEMCALRecPoint()
 141 {
 142   // dtor
 143   if ( fEnergyList )
 144     delete[] fEnergyList ;
 145   if ( fTimeList )
 146     delete[] fTimeList ;
 147   if ( fAbsIdList )
 148     delete[] fAbsIdList ;
 149    if ( fParentsList)
 150     delete[] fParentsList;
 151 }
 152
 153 //____________________________________________________________________________
 154 void AliEMCALRecPoint::AddDigit(AliEMCALDigit & digit, Float_t Energy)
 155 {
 156   // Adds a digit to the RecPoint
 157   // and accumulates the total amplitude and the multiplicity
 158
 159   if(fEnergyList == 0)
 160     fEnergyList =  new Float_t[fMaxDigit];
 161   if(fTimeList == 0)
 162     fTimeList =  new Float_t[fMaxDigit];
 163   if(fAbsIdList == 0) {
 164     fAbsIdList =  new Int_t[fMaxDigit];
 165     fSuperModuleNumber = fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit.GetId());
 166   }
 167
 168   if ( fMulDigit >= fMaxDigit ) { // increase the size of the lists
 169     fMaxDigit*=2 ;
 170     Int_t * tempo = new Int_t[fMaxDigit];
 171     Float_t * tempoE =  new Float_t[fMaxDigit];
 172     Float_t * tempoT =  new Float_t[fMaxDigit];
 173     Int_t * tempoId = new Int_t[fMaxDigit];
 174
 175     Int_t index ;
 176     for ( index = 0 ; index < fMulDigit ; index++ ){
 177       tempo[index]   = fDigitsList[index] ;
 178       tempoE[index]  = fEnergyList[index] ;
 179       tempoT[index]  = fTimeList[index] ;
 180       tempoId[index] = fAbsIdList[index] ;
 181     }
 182
 183     delete [] fDigitsList ;
 184     fDigitsList =  new Int_t[fMaxDigit];
 185
 186     delete [] fEnergyList ;
 187     fEnergyList =  new Float_t[fMaxDigit];
 188
 189     delete [] fTimeList ;
 190     fTimeList =  new Float_t[fMaxDigit];
 191
 192     delete [] fAbsIdList ;
 193     fAbsIdList =  new Int_t[fMaxDigit];
 194
 195     for ( index = 0 ; index < fMulDigit ; index++ ){
 196       fDigitsList[index] = tempo[index] ;
 197       fEnergyList[index] = tempoE[index] ;
 198       fTimeList[index] = tempoT[index] ;
 199       fAbsIdList[index]  = tempoId[index] ;
 200     }
 201
 202     delete [] tempo ;
 203     delete [] tempoE ;
 204     delete [] tempoT ;
 205     delete [] tempoId ;
 206   } // if
 207
 208   fDigitsList[fMulDigit]   = digit.GetIndexInList()  ;
 209   fEnergyList[fMulDigit]   = Energy ;
 210   fTimeList[fMulDigit]     = digit.GetTime() ;
 211   fAbsIdList[fMulDigit]    = digit.GetId();
 212   fMulDigit++ ;
 213   fAmp += Energy ;
 214
 215 }
 216 //____________________________________________________________________________
 217 Bool_t AliEMCALRecPoint::AreNeighbours(AliEMCALDigit * digit1, AliEMCALDigit * digit2 ) const
 218 {
 219   // Tells if (true) or not (false) two digits are neighbours
 220   // A neighbour is defined as being two digits which share a corner
 221
 222   static Bool_t areNeighbours = kFALSE ;
 223   static Int_t nSupMod=0, nTower=0, nIphi=0, nIeta=0;
 224   static int nSupMod1=0, nTower1=0, nIphi1=0, nIeta1=0;
 225   static Int_t relid1[2] , relid2[2] ; // ieta, iphi
 226   static Int_t rowdiff=0, coldiff=0;
 227
 228   areNeighbours = kFALSE ;
 229
 230   fGeomPtr->GetCellIndex(digit1->GetId(), nSupMod,nTower,nIphi,nIeta);
 231   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nTower,nIphi,nIeta, relid1[0],relid1[1]);
 232
 233   fGeomPtr->GetCellIndex(digit2->GetId(), nSupMod1,nTower1,nIphi1,nIeta1);
 234   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod1,nTower1,nIphi1,nIeta1, relid2[0],relid2[1]);
 235
 236   rowdiff = TMath::Abs( relid1[0] - relid2[0] ) ;
 237   coldiff = TMath::Abs( relid1[1] - relid2[1] ) ;
 238
 239   if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 ) && (coldiff + rowdiff > 0))
 240   areNeighbours = kTRUE ;
 241
 242   return areNeighbours;
 243 }
 244
 245 //____________________________________________________________________________
 246 Int_t AliEMCALRecPoint::Compare(const TObject * obj) const
 247 {
 248   // Compares two RecPoints according to their position in the EMCAL modules
 249
 250   Float_t delta = 1 ; //Width of "Sorting row". If you change this
 251                       //value (what is senseless) change as well delta in
 252                       //AliEMCALTrackSegmentMakerv* and other RecPoints...
 253   Int_t rv ;
 254
 255   AliEMCALRecPoint * clu = (AliEMCALRecPoint *)obj ;
 256
 257   TVector3 locpos1;
 258   GetLocalPosition(locpos1);
 259   TVector3 locpos2;
 260   clu->GetLocalPosition(locpos2);
 261
 262   Int_t rowdif = (Int_t)(TMath::Ceil(locpos1.X()/delta)-TMath::Ceil(locpos2.X()/delta)) ;
 263   if (rowdif> 0)
 264     rv = 1 ;
 265   else if(rowdif < 0)
 266     rv = -1 ;
 267   else if(locpos1.Y()>locpos2.Y())
 268     rv = -1 ;
 269   else
 270     rv = 1 ;
 271
 272   return rv ;
 273 }
 274
 275 //____________________________________________________________________________
 276 Int_t AliEMCALRecPoint::DistancetoPrimitive(Int_t px, Int_t py)
 277 {
 278   // Compute distance from point px,py to  a AliEMCALRecPoint considered as a Tmarker
 279   // Compute the closest distance of approach from point px,py to this marker.
 280   // The distance is computed in pixels units.
 281   // HG Still need to update -> Not sure what this should achieve
 282
 283   TVector3 pos(0.,0.,0.) ;
 284   GetLocalPosition(pos) ;
 285   Float_t x =  pos.X() ;
 286   Float_t y =  pos.Y() ;
 287   const Int_t kMaxDiff = 10;
 288   Int_t pxm  = gPad->XtoAbsPixel(x);
 289   Int_t pym  = gPad->YtoAbsPixel(y);
 290   Int_t dist = (px-pxm)*(px-pxm) + (py-pym)*(py-pym);
 291
 292   if (dist > kMaxDiff) return 9999;
 293   return dist;
 294 }
 295
 296 //___________________________________________________________________________
 297  void AliEMCALRecPoint::Draw(Option_t *option)
 298  {
 299    // Draw this AliEMCALRecPoint with its current attributes
 300
 301    AppendPad(option);
 302  }
 303
 304 //______________________________________________________________________________
 305 void AliEMCALRecPoint::ExecuteEvent(Int_t /*event*/, Int_t, Int_t)
 306 {
 307   // Execute action corresponding to one event
 308   // This member function is called when a AliEMCALRecPoint is clicked with the locator
 309   //
 310   // If Left button is clicked on AliEMCALRecPoint, the digits are switched on
 311   // and switched off when the mouse button is released.
 312
 313   //  static Int_t pxold, pyold;
 314
 315   /* static TGraph *  digitgraph = 0 ;
 316   static TPaveText* clustertext = 0 ;
 317
 318   if (!gPad->IsEditable()) return;
 319
 320   switch (event) {
 321
 322
 323   case kButton1Down:{
 324     AliEMCALDigit * digit ;
 325     AliEMCALGeometry * emcalgeom =  (AliEMCALGetter::Instance())->EMCALGeometry() ;
 326
 327     Int_t iDigit;
 328     Int_t relid[2] ;
 329
 330     const Int_t kMulDigit=AliEMCALRecPoint::GetDigitsMultiplicity() ;
 331     Float_t * xi = new Float_t [kMulDigit] ;
 332     Float_t * zi = new Float_t [kMulDigit] ;
 333
 334     for(iDigit = 0; iDigit < kMulDigit; iDigit++) {
 335       Fatal("AliEMCALRecPoint::ExecuteEvent", " -> Something wrong with the code");
 336       digit = 0 ; //dynamic_cast<AliEMCALDigit *>((fDigitsList)[iDigit]);
 337       emcalgeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 338       emcalgeom->PosInAlice(relid, xi[iDigit], zi[iDigit]) ;
 339     }
 340
 341     if (!digitgraph) {
 342       digitgraph = new TGraph(fMulDigit,xi,zi);
 343       digitgraph-> SetMarkerStyle(5) ;
 344       digitgraph-> SetMarkerSize(1.) ;
 345       digitgraph-> SetMarkerColor(1) ;
 346       digitgraph-> Draw("P") ;
 347     }
 348     if (!clustertext) {
 349
 350       TVector3 pos(0.,0.,0.) ;
 351       GetLocalPosition(pos) ;
 352       clustertext = new TPaveText(pos.X()-10,pos.Z()+10,pos.X()+50,pos.Z()+35,"") ;
 353       Text_t  line1[40] ;
 354       Text_t  line2[40] ;
 355       sprintf(line1,"Energy=%1.2f GeV",GetEnergy()) ;
 356       sprintf(line2,"%d Digits",GetDigitsMultiplicity()) ;
 357       clustertext ->AddText(line1) ;
 358       clustertext ->AddText(line2) ;
 359       clustertext ->Draw("");
 360     }
 361     gPad->Update() ;
 362     Print("") ;
 363     delete[] xi ;
 364     delete[] zi ;
 365    }
 366
 367 break;
 368
 369   case kButton1Up:
 370     if (digitgraph) {
 371       delete digitgraph  ;
 372       digitgraph = 0 ;
 373     }
 374     if (clustertext) {
 375       delete clustertext ;
 376       clustertext = 0 ;
 377     }
 378
 379     break;
 380
 381     }*/
 382 }
 383 //____________________________________________________________________________
 384 void AliEMCALRecPoint::EvalAll(Float_t logWeight,TClonesArray * digits)
 385 {
 386   // Evaluates all shower parameters
 387
 388   EvalLocalPosition(logWeight, digits) ;
 389   //  printf("eval position done\n");
 390   EvalElipsAxis(logWeight, digits) ;
 391   //  printf("eval axis done\n");
 392   EvalDispersion(logWeight, digits) ;
 393   //  printf("eval dispersion done\n");
 394   //EvalCoreEnergy(logWeight, digits);
 395  // printf("eval energy done\n");
 396   EvalTime(digits) ;
 397   //  printf("eval time done\n");
 398
 399   EvalPrimaries(digits) ;
 400   //  printf("eval pri done\n");
 401   EvalParents(digits);
 402   //  printf("eval parent done\n");
 403 }
 404
 405 //____________________________________________________________________________
 406 void  AliEMCALRecPoint::EvalDispersion(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 407 {
 408   // Calculates the dispersion of the shower at the origin of the RecPoint
 409
 410   Double_t d = 0., wtot = 0., w = 0., xyzi[3], diff=0.;
 411   Int_t iDigit=0, nstat=0, i=0;
 412   AliEMCALDigit * digit ;
 413
 414   // Calculates the centre of gravity in the local EMCAL-module coordinates
 415   if (!fLocPos.Mag())
 416     EvalLocalPosition(logWeight, digits) ;
 417
 418   // Calculates the dispersion in coordinates
 419   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 420     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 421
 422     fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 423     w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
 424
 425     if(w>0.0) {
 426       wtot += w;
 427       nstat++;
 428       for(i=0; i<3; i++ ) {
 429         diff = xyzi[i] - double(fLocPos[i]);
 430         d   += w * diff*diff;
 431       }
 432     }
 433   }
 434
 435   if ( wtot > 0 && nstat>1) d /= wtot ;
 436   else                      d = 0. ;
 437
 438   fDispersion = TMath::Sqrt(d) ;
 439 }
 440
 441 //____________________________________________________________________________
 442 void AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 443 {
 444   // Calculates the center of gravity in the local EMCAL-module coordinates
 445   //  Info("Print", " logWeight %f : cluster energy %f ", logWeight, fAmp); // for testing
 446
 447   AliEMCALDigit * digit;
 448   Int_t i=0, nstat=0;
 449   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 450
 451   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 452     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
 453
 454     fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 455     // printf(" Id %i : Local x,y,z %f %f %f \n", digit->GetId(), xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 456
 457     if(logWeight > 0.0) w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
 458     else                w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
 459
 460     if(w>0.0) {
 461       wtot += w ;
 462       nstat++;
 463       for(i=0; i<3; i++ ) {
 464         clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
 465         clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
 466       }
 467     }
 468   }
 469   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 470   if ( wtot > 0 ) {
 471     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
 472     for(i=0; i<3; i++ ) {
 473       clXYZ[i] /= wtot;
 474       if(nstat>1) {
 475         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);
 476         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
 477         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
 478           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
 479         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
 480       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
 481     }
 482   } else {
 483     for(i=0; i<3; i++ ) {
 484       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
 485     }
 486   }
 487   // clRmsXYZ[i] ??
 488   fLocPos.SetX(clXYZ[0]);
 489   fLocPos.SetY(clXYZ[1]);
 490   fLocPos.SetZ(clXYZ[2]);
 491
 492 //  if (gDebug==2)
 493 //    printf("EvalLocalPosition: eta,phi,r = %f,%f,%f", fLocPos.X(), fLocPos.Y(), fLocPos.Z()) ;
 494   fLocPosM = 0 ; // covariance matrix
 495 }
 496
 497 //void AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionSimple()
 498 //{ // Weight is proportional of cell energy
 499 //}
 500
 501 //______________________________________________________________________________
 502 void AliEMCALRecPoint::EvalCoreEnergy(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 503 {
 504   // This function calculates energy in the core,
 505   // i.e. within a radius rad = fCoreEnergy around the center. Beyond this radius
 506   // in accordance with shower profile the energy deposition
 507   // should be less than 2%
 508
 509   AliEMCALDigit * digit ;
 510   const Float_t kDeg2Rad = TMath::DegToRad() ;
 511
 512   Int_t iDigit;
 513
 514   if (!fLocPos.Mag()) {
 515     EvalLocalPosition(logWeight, digits);
 516   }
 517
 518   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 519     digit = (AliEMCALDigit *) ( digits->At(fDigitsList[iDigit]) ) ;
 520
 521     Float_t ieta = 0.0;
 522     Float_t iphi = 0.0;
 523     //fGeomPtr->PosInAlice(digit->GetId(), ieta, iphi);
 524     fGeomPtr->EtaPhiFromIndex(digit->GetId(),ieta, iphi) ;
 525     iphi = iphi * kDeg2Rad;
 526
 527     Float_t distance = TMath::Sqrt((ieta-fLocPos.X())*(ieta-fLocPos.X())+(iphi-fLocPos.Y())*(iphi-fLocPos.Y())) ;
 528     if(distance < fCoreRadius)
 529       fCoreEnergy += fEnergyList[iDigit] ;
 530   }
 531
 532 }
 533 //____________________________________________________________________________
 534 void  AliEMCALRecPoint::EvalElipsAxis(Float_t logWeight,TClonesArray * digits)
 535 {
 536   // Calculates the axis of the shower ellipsoid in eta and phi
 537
 538   Double_t wtot = 0. ;
 539   Double_t x    = 0.;
 540   Double_t z    = 0.;
 541   Double_t dxx  = 0.;
 542   Double_t dzz  = 0.;
 543   Double_t dxz  = 0.;
 544
 545   const Float_t kDeg2Rad = TMath::DegToRad();
 546   AliEMCALDigit * digit ;
 547
 548   TString gn(fGeomPtr->GetName());
 549
 550   Int_t iDigit;
 551
 552   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 553     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 554     Float_t etai = 0. ;
 555     Float_t phii = 0. ;
 556     if(gn.Contains("SHISH")) { // have to be change - Feb 28, 2006
 557     //copied for shish-kebab geometry, ieta,iphi is cast as float as eta,phi conversion
 558     // for this geometry does not exist
 559       int nSupMod=0, nTower=0, nIphi=0, nIeta=0;
 560       int iphi=0, ieta=0;
 561       fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nTower,nIphi,nIeta);
 562       fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nTower,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 563       etai=(Float_t)ieta;
 564       phii=(Float_t)iphi;
 565     } else {
 566       fGeomPtr->EtaPhiFromIndex(digit->GetId(), etai, phii);
 567       phii = phii * kDeg2Rad;
 568     }
 569
 570     Double_t w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
 571
 572     dxx  += w * etai * etai ;
 573     x    += w * etai ;
 574     dzz  += w * phii * phii ;
 575     z    += w * phii ;
 576
 577     dxz  += w * etai * phii ;
 578
 579     wtot += w ;
 580   }
 581
 582   if ( wtot > 0 ) {
 583     dxx /= wtot ;
 584     x   /= wtot ;
 585     dxx -= x * x ;
 586     dzz /= wtot ;
 587     z   /= wtot ;
 588     dzz -= z * z ;
 589     dxz /= wtot ;
 590     dxz -= x * z ;
 591
 592     fLambda[0] =  0.5 * (dxx + dzz) + TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz )  ;
 593     if(fLambda[0] > 0)
 594       fLambda[0] = TMath::Sqrt(fLambda[0]) ;
 595     else
 596       fLambda[0] = 0;
 597
 598     fLambda[1] =  0.5 * (dxx + dzz) - TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz )  ;
 599
 600     if(fLambda[1] > 0) //To avoid exception if numerical errors lead to negative lambda.
 601       fLambda[1] = TMath::Sqrt(fLambda[1]) ;
 602     else
 603       fLambda[1]= 0. ;
 604   } else {
 605     fLambda[0]= 0. ;
 606     fLambda[1]= 0. ;
 607   }
 608
 609   //  printf("Evalaxis: lambdas  = %f,%f", fLambda[0],fLambda[1]) ;
 610
 611 }
 612
 613 //______________________________________________________________________________
 614 void  AliEMCALRecPoint::EvalPrimaries(TClonesArray * digits)
 615 {
 616   // Constructs the list of primary particles (tracks) which have contributed to this RecPoint
 617
 618   AliEMCALDigit * digit ;
 619   Int_t * tempo    = new Int_t[fMaxTrack] ;
 620
 621   Int_t index ;
 622   for ( index = 0 ; index < GetDigitsMultiplicity() ; index++ ) { // all digits
 623     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At( fDigitsList[index] )) ;
 624     Int_t nprimaries = digit->GetNprimary() ;
 625     if ( nprimaries == 0 ) continue ;
 626     Int_t * newprimaryarray = new Int_t[nprimaries] ;
 627     Int_t ii ;
 628     for ( ii = 0 ; ii < nprimaries ; ii++)
 629       newprimaryarray[ii] = digit->GetPrimary(ii+1) ;
 630
 631     Int_t jndex ;
 632     for ( jndex = 0 ; jndex < nprimaries ; jndex++ ) { // all primaries in digit
 633       if ( fMulTrack > fMaxTrack ) {
 634         fMulTrack = fMaxTrack ;
 635         Error("GetNprimaries", "increase fMaxTrack ")  ;
 636         break ;
 637       }
 638       Int_t newprimary = newprimaryarray[jndex] ;
 639       Int_t kndex ;
 640       Bool_t already = kFALSE ;
 641       for ( kndex = 0 ; kndex < fMulTrack ; kndex++ ) { //check if not already stored
 642         if ( newprimary == tempo[kndex] ){
 643           already = kTRUE ;
 644           break ;
 645         }
 646       } // end of check
 647       if ( !already && (fMulTrack < fMaxTrack)) { // store it
 648         tempo[fMulTrack] = newprimary ;
 649         fMulTrack++ ;
 650       } // store it
 651     } // all primaries in digit
 652     delete [] newprimaryarray ;
 653   } // all digits
 654
 655
 656   fTracksList = new Int_t[fMulTrack] ;
 657   for(index = 0; index < fMulTrack; index++)
 658    fTracksList[index] = tempo[index] ;
 659
 660   delete [] tempo ;
 661
 662 }
 663
 664 //______________________________________________________________________________
 665 void  AliEMCALRecPoint::EvalParents(TClonesArray * digits)
 666 {
 667   // Constructs the list of parent particles (tracks) which have contributed to this RecPoint
 668
 669   AliEMCALDigit * digit ;
 670   Int_t * tempo    = new Int_t[fMaxParent] ;
 671
 672   Int_t index ;
 673   for ( index = 0 ; index < GetDigitsMultiplicity() ; index++ ) { // all digits
 674     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At( fDigitsList[index] )) ;
 675     Int_t nparents = digit->GetNiparent() ;
 676     if ( nparents == 0 ) continue ;
 677     Int_t * newparentarray = new Int_t[nparents] ;
 678     Int_t ii ;
 679     for ( ii = 0 ; ii < nparents ; ii++)
 680       newparentarray[ii] = digit->GetIparent(ii+1) ;
 681
 682     Int_t jndex ;
 683     for ( jndex = 0 ; jndex < nparents ; jndex++ ) { // all primaries in digit
 684       if ( fMulParent > fMaxParent ) {
 685         fMulTrack = - 1 ;
 686         Error("GetNiparent", "increase fMaxParent")  ;
 687         break ;
 688       }
 689       Int_t newparent = newparentarray[jndex] ;
 690       Int_t kndex ;
 691       Bool_t already = kFALSE ;
 692       for ( kndex = 0 ; kndex < fMulParent ; kndex++ ) { //check if not already stored
 693         if ( newparent == tempo[kndex] ){
 694           already = kTRUE ;
 695           break ;
 696         }
 697       } // end of check
 698       if ( !already && (fMulTrack < fMaxTrack)) { // store it
 699         tempo[fMulParent] = newparent ;
 700         fMulParent++ ;
 701       } // store it
 702     } // all parents in digit
 703     delete [] newparentarray ;
 704   } // all digits
 705
 706   if (fMulParent>0) {
 707     fParentsList = new Int_t[fMulParent] ;
 708     for(index = 0; index < fMulParent; index++)
 709       fParentsList[index] = tempo[index] ;
 710   }
 711
 712   delete [] tempo ;
 713
 714 }
 715
 716 //____________________________________________________________________________
 717 void AliEMCALRecPoint::GetLocalPosition(TVector3 & lpos) const
 718 {
 719   // returns the position of the cluster in the local reference system of ALICE
 720
 721   lpos.SetX(fLocPos.X()) ;
 722   lpos.SetY(fLocPos.Y()) ;
 723   lpos.SetZ(fLocPos.Z()) ;
 724 }
 725
 726 //____________________________________________________________________________
 727 void AliEMCALRecPoint::GetGlobalPosition(TVector3 & gpos) const
 728 {
 729   // returns the position of the cluster in the global reference system of ALICE
 730   // These are now the Cartesian X, Y and Z
 731   //  cout<<" geom "<<geom<<endl;
 732   fGeomPtr->GetGlobal(fLocPos, gpos, fSuperModuleNumber);
 733 }
 734
 735 //____________________________________________________________________________
 736 Float_t AliEMCALRecPoint::GetMaximalEnergy(void) const
 737 {
 738   // Finds the maximum energy in the cluster
 739
 740   Float_t menergy = 0. ;
 741
 742   Int_t iDigit;
 743
 744   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 745
 746     if(fEnergyList[iDigit] > menergy)
 747       menergy = fEnergyList[iDigit] ;
 748   }
 749   return menergy ;
 750 }
 751
 752 //____________________________________________________________________________
 753 Int_t AliEMCALRecPoint::GetMultiplicityAtLevel(Float_t H) const
 754 {
 755   // Calculates the multiplicity of digits with energy larger than H*energy
 756
 757   Int_t multipl   = 0 ;
 758   Int_t iDigit ;
 759   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 760
 761     if(fEnergyList[iDigit] > H * fAmp)
 762       multipl++ ;
 763   }
 764   return multipl ;
 765 }
 766
 767 //____________________________________________________________________________
 768 Int_t  AliEMCALRecPoint::GetNumberOfLocalMax(AliEMCALDigit **  maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
 769                                                Float_t locMaxCut,TClonesArray * digits) const
 770 {
 771   // Calculates the number of local maxima in the cluster using fLocalMaxCut as the minimum
 772   // energy difference between two local maxima
 773
 774   AliEMCALDigit * digit ;
 775   AliEMCALDigit * digitN ;
 776
 777   Int_t iDigitN ;
 778   Int_t iDigit ;
 779
 780   for(iDigit = 0; iDigit < fMulDigit; iDigit++)
 781     maxAt[iDigit] = (AliEMCALDigit*) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 782
 783   for(iDigit = 0 ; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 784     if(maxAt[iDigit]) {
 785       digit = maxAt[iDigit] ;
 786
 787       for(iDigitN = 0; iDigitN < fMulDigit; iDigitN++) {
 788         digitN = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigitN]) ;
 789
 790         if ( AreNeighbours(digit, digitN) ) {
 791           if (fEnergyList[iDigit] > fEnergyList[iDigitN] ) {
 792             maxAt[iDigitN] = 0 ;
 793             // but may be digit too is not local max ?
 794             if(fEnergyList[iDigit] < fEnergyList[iDigitN] + locMaxCut)
 795               maxAt[iDigit] = 0 ;
 796           }
 797           else {
 798             maxAt[iDigit] = 0 ;
 799             // but may be digitN too is not local max ?
 800             if(fEnergyList[iDigit] > fEnergyList[iDigitN] - locMaxCut)
 801               maxAt[iDigitN] = 0 ;
 802           }
 803         } // if Areneighbours
 804       } // while digitN
 805     } // slot not empty
 806   } // while digit
 807
 808   iDigitN = 0 ;
 809   for(iDigit = 0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 810     if(maxAt[iDigit] ){
 811       maxAt[iDigitN] = maxAt[iDigit] ;
 812       maxAtEnergy[iDigitN] = fEnergyList[iDigit] ;
 813       iDigitN++ ;
 814     }
 815   }
 816   return iDigitN ;
 817 }
 818
 819 //____________________________________________________________________________
 820 Int_t AliEMCALRecPoint::GetPrimaryIndex() const
 821 {
 822   // Get the primary track index in TreeK which deposits the most energy
 823   // in Digits which forms RecPoint. Kinematics, Hits and Digits must be
 824   // loaded before the call of the method.
 825
 826   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::GetRunLoader();
 827   if (!rl)
 828     AliError(Form(" No Runloader ")) ;
 829
 830   AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>
 831     (rl->GetDetectorLoader("EMCAL"));
 832
 833   // Get the list of digits forming this RecPoint
 834   Int_t  nDigits   = fMulDigit   ;
 835   Int_t *digitList = fDigitsList ;
 836
 837   // Find the digit with maximum amplitude
 838   AliEMCALDigit *digit = 0;
 839   TClonesArray *digits = emcalLoader->Digits();
 840   Int_t maxAmp = 0;
 841   Int_t bestDigitIndex = -1;
 842   for (Int_t iDigit=0; iDigit<nDigits; iDigit++) {
 843     digit = static_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(digitList[iDigit]));
 844     if (digit->GetAmp() > maxAmp) {
 845       maxAmp = digit->GetAmp();
 846       bestDigitIndex = iDigit;
 847     }
 848   }
 849
 850   digit = static_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(digitList[bestDigitIndex]));
 851
 852   // Get the list of hits producing this digit,
 853   // find which hit has deposited more energy
 854   // and find the primary track.
 855
 856   AliEMCALHit *hit = 0;
 857   TClonesArray *hits = emcalLoader->Hits();
 858
 859   Double_t maxedep  =  0;
 860   Int_t    maxtrack = -1;
 861   Int_t    nHits    = hits ->GetEntries();
 862   Int_t    id       = digit->GetId();
 863   for (Int_t iHit=0; iHit<nHits; iHit++) {
 864     hit = static_cast<AliEMCALHit*> (hits->At(iHit)) ;
 865     if(hit->GetId() == id){
 866       Double_t edep  = hit->GetEnergy();
 867       Int_t    track = hit->GetIparent();//Primary();
 868       if(edep > maxedep){
 869         maxedep  = edep;
 870         maxtrack = track;
 871       }
 872     }
 873   }
 874   if (maxtrack != -1) return maxtrack;
 875   return -12345;                       // no track found :(
 876 }
 877
 878 //____________________________________________________________________________
 879 void AliEMCALRecPoint::EvalTime(TClonesArray * digits){
 880   // time is set to the time of the digit with the maximum energy
 881
 882   Float_t maxE = 0;
 883   Int_t maxAt = 0;
 884   for(Int_t idig=0; idig < fMulDigit; idig++){
 885     if(fEnergyList[idig] > maxE){
 886       maxE = fEnergyList[idig] ;
 887       maxAt = idig;
 888     }
 889   }
 890   fTime = ((AliEMCALDigit*) digits->At(fDigitsList[maxAt]))->GetTime() ;
 891
 892 }
 893
 894 //______________________________________________________________________________
 895 void AliEMCALRecPoint::Paint(Option_t *)
 896 {
 897   // Paint this ALiRecPoint as a TMarker  with its current attributes
 898
 899   TVector3 pos(0.,0.,0.)  ;
 900   GetLocalPosition(pos)   ;
 901   Coord_t x = pos.X()     ;
 902   Coord_t y = pos.Z()     ;
 903   Color_t markercolor = 1 ;
 904   Size_t  markersize = 1. ;
 905   Style_t markerstyle = 5 ;
 906
 907   if (!gPad->IsBatch()) {
 908     gVirtualX->SetMarkerColor(markercolor) ;
 909     gVirtualX->SetMarkerSize (markersize)  ;
 910     gVirtualX->SetMarkerStyle(markerstyle) ;
 911   }
 912   gPad->SetAttMarkerPS(markercolor,markerstyle,markersize) ;
 913   gPad->PaintPolyMarker(1,&x,&y,"") ;
 914 }
 915
 916 //______________________________________________________________________________
 917 Float_t AliEMCALRecPoint::EtaToTheta(Float_t arg) const
 918 {
 919   //Converts Theta (Radians) to Eta(Radians)
 920   return (2.*TMath::ATan(TMath::Exp(-arg)));
 921 }
 922
 923 //______________________________________________________________________________
 924 Float_t AliEMCALRecPoint::ThetaToEta(Float_t arg) const
 925 {
 926   //Converts Eta (Radians) to Theta(Radians)
 927   return (-1 * TMath::Log(TMath::Tan(0.5 * arg)));
 928 }
 929
 930 //____________________________________________________________________________
 931 void AliEMCALRecPoint::Print(Option_t *) const
 932 {
 933   // Print the list of digits belonging to the cluster
 934   return;
 935   TString message ;
 936   message  = "AliEMCALRecPoint:\n" ;
 937   message +=  " digits # = " ;
 938   Info("Print", message.Data()) ;
 939
 940   Int_t iDigit;
 941   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
 942     printf(" %d ", fDigitsList[iDigit] ) ;
 943   printf("\n");
 944
 945   Info("Print", " Energies = ") ;
 946   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
 947     printf(" %f ", fEnergyList[iDigit] ) ;
 948   printf("\n");
 949
 950   Info("Print", "\n Abs Ids = ") ;
 951   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
 952     printf(" %i ", fAbsIdList[iDigit] ) ;
 953   printf("\n");
 954
 955   Info("Print", " Primaries  ") ;
 956   for(iDigit = 0;iDigit < fMulTrack; iDigit++)
 957     printf(" %d ", fTracksList[iDigit]) ;
 958
 959   printf("\n Local x %6.2f y %7.2f z %7.1f \n", fLocPos[0], fLocPos[1], fLocPos[2]);
 960
 961   message  = "       ClusterType     = %d" ;
 962   message += "       Multiplicity    = %d" ;
 963   message += "       Cluster Energy  = %f" ;
 964   message += "       Core energy     = %f" ;
 965   message += "       Core radius     = %f" ;
 966   message += "       Number of primaries %d" ;
 967   message += "       Stored at position %d" ;
 968   Info("Print", message.Data(), fClusterType, fMulDigit, fAmp, fCoreEnergy, fCoreRadius, fMulTrack, GetIndexInList() ) ;
 969 }