FMD/AliFMDPreprocessor.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 2004, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id$ */
  16 /** @file    AliFMDPreprocessor.cxx
  17     @author  Hans Hjersing Dalsgaard <canute@nbi.dk>
  18     @date    Mon Mar 27 12:39:09 2006
  19     @brief   Shuttle "preprocessor" for the FMD
  20 */
  21 //___________________________________________________________________
  22 //
  23 // The class processes data points from DCS (via Amanada), and DAQ DA
  24 // files (via FXS) to make calibration data for the FMD.
  25 //
  26 // Data points:
  27 //    *  Nothing yet.
  28 //
  29 // DAQ FXS file:
  30 //    * pedestals - a (ASCII) Comma Separated Values files with the
  31 //                  fields
  32 //                       rcu     DDL number
  33 //                       board   FEC board number
  34 //                       chip    ALTRO chip number on FEC
  35 //                       channel ALTRO channel number
  36 //                       strip   VA1 strip number
  37 //                       sample  Sample number
  38 //                       ped     Mean of ADC spectra
  39 //                       noise   Spread of ADC spectra
  40 //                       mu      Mean of Gaussian fit to ADC spectra
  41 //                       sigma   Variance of Gaussian fit to ADC spectra
  42 //                       chi2    Chi^2 per degrees of freedom of fit
  43 //    * Gains     - a (ASCII) Comma Separated Values files with the
  44 //                  fields
  45 //                       rcu     DDL number
  46 //                       board   FEC board number
  47 //                       chip    ALTRO chip number on FEC
  48 //                       channel ALTRO channel number
  49 //                       strip   VA1 strip number
  50 //                       gain    Slope of gain
  51 //                       error   Error on gain
  52 //                       chi2    Chi^2 per degrees of freedom of fit
  53 //
  54 // See also
  55 //
  56 //   http://aliceinfo.cern.ch/Offline/Activities/Shuttle.html
  57 //
  58 // Latest changes by Christian Holm Christensen
  59 //
  60
  61 // #include <iostream>
  62
  63 #include <fstream>
  64 #include "AliFMDPreprocessor.h"
  65 #include "AliFMDCalibPedestal.h"
  66 #include "AliFMDCalibGain.h"
  67 #include "AliFMDCalibStripRange.h"
  68 #include "AliFMDCalibSampleRate.h"
  69 #include "AliFMDParameters.h"
  70 #include "AliCDBMetaData.h"
  71 #include "AliCDBManager.h"
  72 // #include "AliDCSValue.h"
  73 #include "AliLog.h"
  74 #include <TTimeStamp.h>
  75 // #include <TFile.h>
  76 #include <TObjString.h>
  77 #include <TString.h>
  78 #include <TNamed.h>
  79
  80
  81 ClassImp(AliFMDPreprocessor)
  82 #if 0 // Do not remove - here to make Emacs happy
  83 ;
  84 #endif
  85
  86
  87 //____________________________________________________
  88 AliFMDPreprocessor::AliFMDPreprocessor(AliShuttleInterface* shuttle)
  89   : AliPreprocessor("FMD", shuttle)
  90 {
  91   AddRunType("PHYSICS");
  92   AddRunType("STANDALONE");
  93   AddRunType("PEDESTAL");
  94   AddRunType("GAIN");
  95 }
  96
  97
  98 //____________________________________________________
  99 Bool_t AliFMDPreprocessor::GetAndCheckFileSources(TList*&     list,
 100                                                   Int_t       system,
 101                                                   const char* id)
 102 {
 103   // Convinience function
 104   // Parameters:
 105   //   list     On return, list of files.
 106   //   system   Alice system (DAQ, DCS, ...)
 107   //   id       File id
 108   // Return:
 109   //   kTRUE on success.
 110   list = GetFileSources(system, id);
 111   if (!list) {
 112     TString sys;
 113     switch (system) {
 114     case kDAQ: sys = "DAQ";     break;
 115     case kDCS: sys = "DCS";     break;
 116     default:   sys = "unknown"; break;
 117     }
 118     Log(Form("Failed to get file sources for %s/%s", sys.Data(), system));
 119     return kFALSE;
 120   }
 121   return kTRUE;
 122 }
 123
 124 //____________________________________________________
 125 AliCDBEntry*
 126 AliFMDPreprocessor::GetFromCDB(const char* second, const char* third)
 127 {
 128   return GetFromOCDB(second, third);
 129 }
 130
 131
 132 //____________________________________________________
 133 UInt_t AliFMDPreprocessor::Process(TMap* /* dcsAliasMap */)
 134 {
 135   // Main member function.
 136   // Parameters:
 137   //    dcsAliassMap   Map of DCS data point aliases.
 138   // Return
 139   //    0 on success, >0 otherwise
 140   Bool_t resultPed   = kTRUE;
 141   Bool_t resultGain  = kTRUE;
 142   Bool_t resultRange = kTRUE;
 143   Bool_t resultRate  = kTRUE;
 144   Bool_t resultZero  = kTRUE;
 145
 146   // Do we need this ?
 147   // if(!dcsAliasMap) return 1;
 148   //
 149   // Invoking the cdb manager and the FMD parameters class
 150   // AliCDBManager* cdb   = AliCDBManager::Instance();
 151   // cdb->SetDefaultStorage("local://$ALICE_ROOT");
 152   // cdb->SetRun(0);
 153   AliFMDParameters* pars = AliFMDParameters::Instance();
 154   pars->Init(this, false, AliFMDParameters::kAltroMap);
 155   // This is if the SOR contains Fee parameters, and we run a DA to
 156   // extract these parameters.   The same code could work if we get
 157   // the information from DCS via the FXS
 158   TList* files = 0;
 159   AliFMDCalibSampleRate*      calibRate  = 0;
 160   AliFMDCalibStripRange*      calibRange = 0;
 161   AliFMDCalibZeroSuppression* calibZero  = 0;
 162   // Disabled for now.
 163   //#if 0
 164   if (GetAndCheckFileSources(files, kDAQ,pars->GetConditionsShuttleID()))
 165     GetInfoCalibration(files, calibRate, calibRange, calibZero);
 166   resultRate  = (!calibRate  ? kFALSE : kTRUE);
 167   resultRange = (!calibRange ? kFALSE : kTRUE);
 168   resultZero  = (!calibZero  ? kFALSE : kTRUE);
 169   //#endif
 170
 171   // Gt the run type
 172   TString runType(GetRunType());
 173
 174   //Creating calibration objects
 175   AliFMDCalibPedestal* calibPed  = 0;
 176   AliFMDCalibGain*     calibGain = 0;
 177   if (runType.Contains("PEDESTAL", TString::kIgnoreCase)) {
 178     if (GetAndCheckFileSources(files, kDAQ, pars->GetPedestalShuttleID())) {
 179       if(files->GetSize())
 180         calibPed = GetPedestalCalibration(files);
 181     }
 182     resultPed = (calibPed ? kTRUE : kFALSE);
 183   }
 184   if (runType.Contains("GAIN", TString::kIgnoreCase)) {
 185     if (GetAndCheckFileSources(files, kDAQ, pars->GetGainShuttleID())) {
 186       if(files->GetSize())
 187         calibGain = GetGainCalibration(files);
 188     }
 189     resultGain = (calibGain ? kTRUE : kFALSE);
 190   }
 191
 192   //Storing Calibration objects
 193   AliCDBMetaData metaData;
 194   metaData.SetBeamPeriod(0);
 195   metaData.SetResponsible("Hans H. Dalsgaard");
 196   metaData.SetComment("Preprocessor stores pedestals and gains for the FMD.");
 197
 198   if(calibPed)  {
 199     resultPed  = Store("Calib","Pedestal", calibPed, &metaData, 0, kTRUE);
 200     delete calibPed;
 201   }
 202   if(calibGain) {
 203     resultGain = Store("Calib","PulseGain", calibGain, &metaData, 0, kTRUE);
 204     delete calibGain;
 205   }
 206   if(calibRange) {
 207     resultRange = Store("Calib","StripRange", calibRange, &metaData, 0, kTRUE);
 208     delete calibRange;
 209   }
 210   if(calibRate) {
 211     resultRate = Store("Calib","SampleRate", calibRate, &metaData, 0, kTRUE);
 212     delete calibRate;
 213   }
 214   if(calibZero) {
 215     resultZero = Store("Calib","ZeroSuppression", calibZero,&metaData,0,kTRUE);
 216     delete calibZero;
 217   }
 218
 219   //#if 0
 220   // Disabled until we implement GetInfoCalibration properly
 221   Bool_t success = (resultPed && resultGain  && resultRange &&
 222                     resultRate  && resultZero);
 223   //#endif
 224   //  Bool_t success = resultPed && resultGain;
 225   Log(Form("FMD preprocessor was %s", (success ? "successful" : "failed")));
 226   return (success ? 0 : 1);
 227 }
 228
 229 //____________________________________________________________________
 230 Bool_t
 231 AliFMDPreprocessor::GetInfoCalibration(TList* files,
 232                                        AliFMDCalibSampleRate*&      s,
 233                                        AliFMDCalibStripRange*&      r,
 234                                        AliFMDCalibZeroSuppression*& z)
 235 {
 236   // Get info calibrations.
 237   // Parameters:
 238   //     files List of files.
 239   //     s     On return, newly allocated object
 240   //     r     On return, newly allocated object
 241   //     z     On return, newly allocated object
 242   // Return:
 243   //     kTRUE on success
 244   if (!files) return kTRUE; // Should really be false
 245   if (files->GetEntries() <= 0) return kTRUE;
 246
 247   s = new AliFMDCalibSampleRate();
 248   r = new AliFMDCalibStripRange();
 249   z = new AliFMDCalibZeroSuppression();
 250
 251   AliFMDParameters*    pars     = AliFMDParameters::Instance();
 252   TIter                iter(files);
 253   TObjString*          fileSource;
 254
 255   while((fileSource = dynamic_cast<TObjString*>(iter.Next()))) {
 256     const Char_t* filename = GetFile(kDAQ, pars->GetConditionsShuttleID(), fileSource->GetName());
 257     std::ifstream in(filename);
 258     if(!in) {
 259       Log(Form("File %s not found!", filename));
 260       continue;
 261     }
 262     s->ReadFromFile(in);
 263     r->ReadFromFile(in);
 264   }
 265   return kTRUE;
 266 }
 267
 268
 269 //____________________________________________________________________
 270 AliFMDCalibPedestal*
 271 AliFMDPreprocessor::GetPedestalCalibration(TList* pedFiles)
 272 {
 273   // Read DAQ DA produced CSV files of pedestals, and return a
 274   // calibration object.
 275   // Parameters:
 276   //   pedFiles     List of pedestal files
 277   // Return
 278   //   A pointer to a newly allocated AliFMDCalibPedestal object, or
 279   //   null in case of errors.
 280   if(!pedFiles) return 0;
 281
 282   AliFMDCalibPedestal* calibPed = new AliFMDCalibPedestal();
 283   AliFMDParameters*    pars     = AliFMDParameters::Instance();
 284   TIter                iter(pedFiles);
 285   TObjString*          fileSource;
 286
 287   while((fileSource = dynamic_cast<TObjString*>(iter.Next()))) {
 288     const Char_t* filename = GetFile(kDAQ, pars->GetPedestalShuttleID(), fileSource->GetName());
 289     std::ifstream in(filename);
 290     if(!in) {
 291       Log(Form("File %s not found!", filename));
 292       continue;
 293     }
 294
 295     // Get header (how long is it ?)
 296     TString header;
 297     header.ReadLine(in);
 298     header.ToLower();
 299     if(!header.Contains("pedestal")) {
 300       Log("File header is not from pedestal!");
 301       continue;
 302     }
 303     Log("File contains data from pedestals");
 304
 305     // Read columns line
 306     int lineno = 2;
 307     header.ReadLine(in);
 308
 309     // Loop until EOF
 310     while(in.peek()!=EOF) {
 311       if(in.bad()) {
 312         Log(Form("Bad read at line %d in %s", lineno, filename));
 313         break;
 314       }
 315       UShort_t det, sec, strip;
 316       Char_t ring;
 317       Float_t ped, noise, mu, sigma, chi2ndf;
 318       Char_t c[8];
 319
 320       in >> det      >> c[0]
 321          >> ring     >> c[1]
 322          >> sec      >> c[2]
 323          >> strip    >> c[3]
 324          >> ped      >> c[4]
 325          >> noise    >> c[5]
 326          >> mu       >> c[6]
 327          >> sigma    >> c[7]
 328          >> chi2ndf;
 329       lineno++;
 330
 331       // Ignore trailing garbage
 332       // if (strip > 127) continue;
 333
 334       //Setting DDL to comply with the FMD in DAQ
 335       // UInt_t FmdDDLBase = 3072;
 336       // ddl = ddl - FmdDDLBase;
 337       //Setting the pedestals via the hardware address
 338
 339
 340       // pars->Hardware2Detector(ddl,board,chip,channel,det,ring,sec,str);
 341       // strip += str;
 342
 343       calibPed->Set(det,ring,sec,strip,ped,noise);
 344
 345     }
 346   }
 347   return calibPed;
 348 }
 349
 350 //____________________________________________________________________
 351 AliFMDCalibGain*
 352 AliFMDPreprocessor::GetGainCalibration(TList* gainFiles)
 353 {
 354   // Read DAQ DA produced CSV files of pedestals, and return a
 355   // calibration object.
 356   // Parameters:
 357   //   pedFiles     List of pedestal files
 358   // Return
 359   //   A pointer to a newly allocated AliFMDCalibPedestal object, or
 360   //   null in case of errors.
 361   if(!gainFiles) return 0;
 362
 363   AliFMDCalibGain*  calibGain  = new AliFMDCalibGain();
 364   AliFMDParameters* pars       = AliFMDParameters::Instance();
 365   TIter             iter(gainFiles);
 366   TObjString*       fileSource;
 367   while((fileSource = dynamic_cast<TObjString *>(iter.Next()))) {
 368     const Char_t* filename = GetFile(kDAQ, pars->GetGainShuttleID(), fileSource->GetName());
 369     std::ifstream in(filename);
 370     if(!in) {
 371       Log(Form("File %s not found!", filename));
 372       continue;
 373     }
 374
 375     //Get header (how long is it ?)
 376     TString header;
 377     header.ReadLine(in);
 378     header.ToLower();
 379     if(!header.Contains("gain")) {
 380       Log("File header is not from gain!");
 381       continue;
 382     }
 383     Log("File contains data from pulse gain");
 384
 385     // Read column headers
 386     header.ReadLine(in);
 387
 388     int lineno  = 2;
 389     // Read until EOF
 390     while(in.peek()!=EOF) {
 391       if(in.bad()) {
 392         Log(Form("Bad read at line %d in %s", lineno, filename));
 393         break;
 394       }
 395       UShort_t det, sec, strip;
 396       Char_t ring;
 397
 398       Float_t gain,error,  chi2ndf;
 399       Char_t c[6];
 400
 401       in >> det      >> c[0]
 402          >> ring     >> c[1]
 403          >> sec      >> c[2]
 404          >> strip    >> c[3]
 405          >> gain     >> c[4]
 406          >> error    >> c[5]
 407          >> chi2ndf;
 408       lineno++;
 409       // Ignore trailing garbage
 410       //if(strip > 127) continue;
 411
 412       //Setting DDL to comply with the FMD in DAQ
 413       // UInt_t FmdDDLBase = 3072;
 414       // ddl = ddl - FmdDDLBase;
 415       //Setting the pedestals via the hardware address
 416       //   pars->Hardware2Detector(ddl,board,chip,channel,det,ring,sec,str);
 417
 418       // strip += str;
 419       calibGain->Set(det,ring,sec,strip,gain);
 420     }
 421   }
 422   return calibGain;
 423 }
 424
 425 //____________________________________________________________________
 426 //
 427 // EOF
 428 //