]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - HLT/BASE/AliHLTSystem.cxx
- bugfix HLTOUT processing: handler execution for sub-collections
[u/mrichter/AliRoot.git] / HLT / BASE / AliHLTSystem.cxx
1 // $Id$
2
3 //**************************************************************************
4 //* This file is property of and copyright by the ALICE HLT Project        * 
5 //* ALICE Experiment at CERN, All rights reserved.                         *
6 //*                                                                        *
7 //* Primary Authors: Matthias Richter <Matthias.Richter@ift.uib.no>        *
8 //*                  for The ALICE HLT Project.                            *
9 //*                                                                        *
10 //* Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
11 //* documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
12 //* without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
13 //* copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
14 //* appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
15 //* about the suitability of this software for any purpose. It is          *
16 //* provided "as is" without express or implied warranty.                  *
17 //**************************************************************************
18
19 /** @file   AliHLTSystem.cxx
20     @author Matthias Richter
21     @date   
22     @brief  Implementation of HLT module management.
23 */
24
25 #if __GNUC__>= 3
26 using namespace std;
27 #endif
28
29 #include <cassert>
30 #include "AliHLTStdIncludes.h"
31 #include "AliHLTSystem.h"
32 #include "AliHLTComponentHandler.h"
33 #include "AliHLTComponent.h"
34 #include "AliHLTConfiguration.h"
35 #include "AliHLTConfigurationHandler.h"
36 #include "AliHLTTask.h"
37 #include "AliHLTModuleAgent.h"
38 #include "AliHLTOfflineInterface.h"
39 #include "AliHLTDataSource.h"
40 #include "AliHLTOUT.h"
41 #include "AliHLTOUTHandler.h"
42 #include "AliHLTOUTTask.h"
43 #include <TObjArray.h>
44 #include <TObjString.h>
45 #include <TStopwatch.h>
46 //#include <TSystem.h>
47 #include <TROOT.h>
48 //#include <TInterpreter.h>
49
50 /** HLT default component libraries */
51 const char* AliHLTSystem::fgkHLTDefaultLibs[]= {
52   "libAliHLTUtil.so", 
53   "libAliHLTRCU.so", 
54   "libAliHLTTPC.so", 
55   //  "libAliHLTSample.so",
56   //"libAliHLTPHOS.so",
57   "libAliHLTMUON.so",
58   "libAliHLTTRD.so",
59   "libAliHLTTrigger.so",
60   NULL
61 };
62
63 /** ROOT macro for the implementation of ROOT specific class methods */
64 ClassImp(AliHLTSystem)
65
66 AliHLTSystem::AliHLTSystem(AliHLTComponentLogSeverity loglevel)
67   :
68   fpComponentHandler(AliHLTComponentHandler::CreateHandler()),
69   fpConfigurationHandler(AliHLTConfigurationHandler::CreateHandler()),
70   fTaskList(),
71   fState(0),
72   fChains(),
73   fStopwatches(new TObjArray),
74   fEventCount(-1),
75   fGoodEvents(-1),
76   fpChainHandlers(NULL),
77   fpEsdHandlers(NULL),
78   fpProprietaryHandlers(NULL),
79   fpHLTOUTTask(NULL)
80 {
81   // see header file for class documentation
82   // or
83   // refer to README to build package
84   // or
85   // visit http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt
86
87   if (fgNofInstances++>0) {
88     // July 2008: multiple instances are now allowed
89     // AliHLTSystem is used in multiple instances for the kChain HLTOUT handler
90     //HLTWarning("multiple instances of AliHLTSystem, you should not use more than one at a time");
91   }
92
93   SetGlobalLoggingLevel(loglevel);
94   SetFrameworkLog(loglevel);
95   if (fpComponentHandler) {
96     AliHLTComponentEnvironment env;
97     memset(&env, 0, sizeof(AliHLTComponentEnvironment));
98     env.fAllocMemoryFunc=AliHLTSystem::AllocMemory;
99     env.fLoggingFunc=NULL;
100     fpComponentHandler->SetEnvironment(&env);
101     InitAliLogFunc(fpComponentHandler);
102     if (fgNofInstances==1) {
103     fpComponentHandler->AnnounceVersion();
104     }
105   } else {
106     HLTFatal("can not create Component Handler");
107   }
108   if (fpConfigurationHandler) {
109     AliHLTConfiguration::GlobalInit(fpConfigurationHandler);
110   } else {
111     HLTFatal("can not create Configuration Handler");
112   }
113 }
114
115 AliHLTSystem::~AliHLTSystem()
116 {
117   // see header file for class documentation
118   fgNofInstances--;
119   CleanTaskList();
120   AliHLTConfiguration::GlobalDeinit(fpConfigurationHandler);
121   if (fpConfigurationHandler) {
122     fpConfigurationHandler->Destroy();
123   }
124   fpConfigurationHandler=NULL;
125   
126   if (fpComponentHandler) {
127     fpComponentHandler->Destroy();
128   }
129   fpComponentHandler=NULL;
130 }
131
132 int AliHLTSystem::fgNofInstances=0;
133
134 int AliHLTSystem::AddConfiguration(AliHLTConfiguration* pConf)
135 {
136   // see header file for class documentation
137   HLTLogKeyword("configuration handling");
138   int iResult=0;
139   if (pConf) {
140     HLTError("function not yet implemented");
141     iResult=-ENOSYS;
142   } else {
143     iResult=-EINVAL;
144   }
145   return iResult;
146 }
147
148 int AliHLTSystem::InsertConfiguration(AliHLTConfiguration* pConf, AliHLTConfiguration* pPrec)
149 {
150   // see header file for class documentation
151   HLTLogKeyword("configuration handling");
152   int iResult=0;
153   if (pConf) {
154     if (pPrec) {
155       // find the position
156       HLTError("function not yet implemented");
157       iResult=-ENOSYS;
158     }
159   } else {
160     iResult=-EINVAL;
161   }
162   return iResult;
163 }
164
165 int AliHLTSystem::DeleteConfiguration(AliHLTConfiguration* pConf)
166 {
167   // see header file for class documentation
168   HLTLogKeyword("configuration handling");
169   int iResult=0;
170   if (pConf) {
171     HLTError("function not yet implemented");
172     iResult=-ENOSYS;
173   } else {
174     iResult=-EINVAL;
175   }
176   return iResult;
177 }
178
179 int AliHLTSystem::BuildTaskList(const char* id)
180 {
181   // see header file for class documentation
182   int iResult=0;
183   if (id) {
184     if (fpConfigurationHandler) {
185       AliHLTConfiguration* pConf=fpConfigurationHandler->FindConfiguration(id);
186       if (pConf) {
187         iResult=BuildTaskList(pConf);
188       } else {
189         HLTError("unknown configuration \"%s\"", id);
190         iResult=-EEXIST;
191       }
192     } else {
193       iResult=-EFAULT;
194     }
195   } else {
196     iResult=-EINVAL;
197   }
198   return iResult;
199 }
200
201 int AliHLTSystem::BuildTaskList(AliHLTConfiguration* pConf)
202 {
203   // see header file for class documentation
204   int iResult=0;
205   if (pConf) {
206     AliHLTTask* pTask=NULL;
207     if ((pTask=FindTask(pConf->GetName()))!=NULL) {
208       if (pTask->GetConf()!=pConf) {
209         HLTError("configuration mismatch, there is already a task with configuration name \"%s\", but it is different. Most likely configuration %p is not registered properly", pConf->GetName(), pConf);
210         iResult=-EEXIST;
211       }
212       // task for this configuration exists, terminate
213       pTask=NULL;
214     } else if (pConf->SourcesResolved(1)!=1) {
215         HLTError("configuration \"%s\" has unresolved sources, aborting ...", pConf->GetName());
216         iResult=-ENOLINK;
217     } else {
218       pTask=new AliHLTTask(pConf);
219       if (pTask==NULL) {
220         iResult=-ENOMEM;
221       } else {
222         pTask->SetLocalLoggingLevel(GetLocalLoggingLevel());
223       }
224     }
225     static int iterationLevel=0;
226     if (pTask && iResult>=0) {
227       // check for circular dependencies
228       if ((iResult=pConf->FollowDependency(pConf->GetName()))>0) {
229         HLTError("detected circular dependency for configuration \"%s\"", pTask->GetName());
230         pTask->PrintDependencyTree(pTask->GetName(), 1/*use the configuration list*/);
231         HLTError("aborted ...");
232         iResult=-ELOOP;
233       }
234       if (iResult>=0) {
235         // check whether all dependencies are already in the task list
236         // create the missing ones
237         // this step is an iterative process which calls this function again for the missing
238         // configurations, in order to avoid the currently processed task to be created
239         // again it is added to the list temporarily and removed afterwards
240         // This is of high importance to preserve the order of the tasks. Furthermore, the
241         // InsertTask method has to be used in order to set all the cross links right 
242         fTaskList.Add(pTask);
243         AliHLTConfiguration* pDep=pConf->GetFirstSource();
244         while (pDep!=NULL && iResult>=0) {
245           HLTDebug("iteration %d: checking dependency %s (%p)", iterationLevel, pDep->GetName(), pDep);
246           if (FindTask(pDep->GetName())==NULL) {
247             HLTDebug("iteration %d: building task list for configuration %s (%p)", iterationLevel, pDep->GetName(), pDep);
248             iterationLevel++;
249             iResult=BuildTaskList(pDep);
250             iterationLevel--;
251           }
252           pDep=pConf->GetNextSource();
253         }
254         // remove the temporarily added task
255         fTaskList.Remove(pTask);
256
257         // insert the task and set the cross-links
258         if (iResult>=0) {
259           HLTDebug("iteration %d: inserting task %s (%p)", iterationLevel, pTask->GetName(), pTask);
260           iResult=InsertTask(pTask);
261         }
262       } else {
263         delete pTask;
264         pTask=NULL;
265       }
266     }
267   } else {
268     iResult=-EINVAL;
269   }
270   return iResult;
271 }
272
273 int AliHLTSystem::CleanTaskList()
274 {
275   // see header file for class documentation
276   int iResult=0;
277   TObjLink* lnk=NULL;
278   while ((lnk=fTaskList.LastLink())!=NULL) {
279     delete (lnk->GetObject());
280     fTaskList.Remove(lnk);
281   }
282   return iResult;
283 }
284
285 int AliHLTSystem::InsertTask(AliHLTTask* pTask)
286 {
287   // see header file for class documentation
288   int iResult=0;
289   TObjLink *lnk = NULL;
290   if ((iResult=pTask->CheckDependencies())>0)
291     lnk=fTaskList.FirstLink();
292   while (lnk && iResult>0) {
293     AliHLTTask* pCurr = (AliHLTTask*)lnk->GetObject();
294     //HLTDebug("checking  \"%s\"", pCurr->GetName());
295     iResult=pTask->Depends(pCurr);
296     if (iResult>0) {
297       iResult=pTask->SetDependency(pCurr);
298       pCurr->SetTarget(pTask);
299       HLTDebug("set dependency  \"%s\" for configuration \"%s\"", pCurr->GetName(), pTask->GetName());
300     }
301     if (pCurr->Depends(pTask)) {
302       // circular dependency
303       HLTError("circular dependency: can not resolve dependencies for configuration \"%s\"", pTask->GetName());
304       iResult=-ELOOP;
305     } else if ((iResult=pTask->CheckDependencies())>0) {
306       lnk = lnk->Next();
307     }
308   }
309   if (iResult==0) {
310       if (lnk) {
311         fTaskList.AddAfter(lnk, pTask);
312       } else {
313         fTaskList.AddFirst(pTask);
314       }
315       HLTDebug("task \"%s\" (%p) inserted (size %d)", pTask->GetName(), pTask, sizeof(AliHLTTask));
316   } else if (iResult>0) {
317     HLTError("can not resolve dependencies for configuration \"%s\" (%d unresolved)", pTask->GetName(), iResult);
318     iResult=-ENOLINK;
319   }
320   return iResult;
321 }
322
323 AliHLTTask* AliHLTSystem::FindTask(const char* id)
324 {
325   // see header file for class documentation
326   AliHLTTask* pTask=NULL;
327   if (id) {
328     pTask=dynamic_cast<AliHLTTask*>(fTaskList.FindObject(id)); 
329   }
330   return pTask;
331 }
332
333 void AliHLTSystem::PrintTaskList()
334 {
335   // see header file for class documentation
336   HLTLogKeyword("task list");
337   TObjLink *lnk = NULL;
338   HLTMessage("Task List");
339   lnk=fTaskList.FirstLink();
340   while (lnk) {
341     TObject* obj=lnk->GetObject();
342     if (obj) {
343       HLTMessage("  %s - status:", obj->GetName());
344       AliHLTTask* pTask=(AliHLTTask*)obj;
345       pTask->PrintStatus();
346     } else {
347     }
348     lnk = lnk->Next();
349   }
350 }
351
352 int AliHLTSystem::Run(Int_t iNofEvents, int bStop)
353 {
354   // see header file for class documentation
355   int iResult=0;
356   int iCount=0;
357   SetStatusFlags(kRunning);
358   if (fEventCount>=0 || (iResult=InitTasks())>=0) {
359     if (fEventCount>=0 || (iResult=StartTasks())>=0) {
360       if (fEventCount==0) {
361         InitBenchmarking(fStopwatches);
362       } else {
363         ResumeBenchmarking(fStopwatches);    
364       }
365       for (int i=fEventCount; i<fEventCount+iNofEvents && iResult>=0; i++) {
366         if (fpHLTOUTTask) {
367           if (iNofEvents>1 && i==fEventCount) {
368             HLTWarning("can not add more than one event to the HLTOUT, skipping all but last block");
369           }
370           // reset and prepare for new data
371           fpHLTOUTTask->Reset();
372         }
373         if ((iResult=ProcessTasks(i))>=0) {
374           fGoodEvents++;
375           iCount++;
376         } else {
377           // TODO: define different running modes to either ignore errors in
378           // event processing or not
379           // currently ignored 
380           iResult=0;
381         }
382       }
383       fEventCount+=iNofEvents;
384       if (bStop) StopTasks();
385       else PauseBenchmarking(fStopwatches);
386     }
387     if (bStop) DeinitTasks();
388   }
389   if (iResult>=0) {
390     iResult=iCount;
391   } else  if (iResult==-126 /*ENOKEY*/) {
392     iResult=0; // do not propagate the error
393   }
394   ClearStatusFlags(kRunning);
395   return iResult;
396 }
397
398 int AliHLTSystem::InitTasks()
399 {
400   // see header file for class documentation
401   int iResult=0;
402   TObjLink *lnk=fTaskList.FirstLink();
403
404   if (lnk==NULL) {
405     HLTWarning("Task list is empty, skipping HLT");
406     return -126 /*ENOKEY*/;
407   }
408   while (lnk && iResult>=0) {
409     TObject* obj=lnk->GetObject();
410     if (obj) {
411       AliHLTTask* pTask=(AliHLTTask*)obj;
412       iResult=pTask->Init(NULL, fpComponentHandler);
413 //       ProcInfo_t ProcInfo;
414 //       gSystem->GetProcInfo(&ProcInfo);
415 //       HLTInfo("task %s initialized (%d), current memory usage %d %d", pTask->GetName(), iResult, ProcInfo.fMemResident, ProcInfo.fMemVirtual);
416     } else {
417     }
418     lnk = lnk->Next();
419   }
420   if (iResult<0) {
421     HLTError("can not initialize task list, error %d", iResult);
422   }
423
424   return iResult;
425 }
426
427 int AliHLTSystem::InitBenchmarking(TObjArray* pStopwatches)
428 {
429   // see header file for class documentation
430   int iResult=0;
431   if (pStopwatches==NULL) return 0;
432
433   for (int i=0; i<(int)AliHLTComponent::kSWTypeCount; i++) {
434     TStopwatch* pStopwatch= new TStopwatch;
435     if (pStopwatch) {
436       pStopwatch->Reset();
437       pStopwatches->AddAt(pStopwatch, i);
438     } else {
439       iResult=-ENOMEM;
440       break;
441     }
442   }
443
444   TObjLink *lnk=fTaskList.FirstLink();
445   while (lnk && iResult>=0) {
446     TObject* obj=lnk->GetObject();
447     if (obj) {
448       AliHLTTask* pTask=(AliHLTTask*)obj;
449       AliHLTComponent* pComp=NULL;
450       if (iResult>=0 && (pComp=pTask->GetComponent())!=NULL) {
451         switch (pComp->GetComponentType()) {
452         case AliHLTComponent::kProcessor:
453           pComp->SetStopwatches(pStopwatches);
454           break;
455         case AliHLTComponent::kSource:
456           {
457             // this switch determines whether the time consumption of the
458             // AliHLTComponent base methods should be counted to the input
459             // stopwatch or base stopwatch.
460             //int inputBase=(int)AliHLTComponent::kSWBase;
461             int inputBase=(int)AliHLTComponent::kSWInput;
462             pComp->SetStopwatch(pStopwatches->At(inputBase), AliHLTComponent::kSWBase);
463             pComp->SetStopwatch(pStopwatches->At((int)AliHLTComponent::kSWInput), AliHLTComponent::kSWDA);
464           }
465           break;
466         case AliHLTComponent::kSink:
467           {
468             // this switch determines whether the time consumption of the
469             // AliHLTComponent base methods should be counted to the output
470             // stopwatch or base stopwatch.
471             //int outputBase=(int)AliHLTComponent::kSWBase;
472             int outputBase=(int)AliHLTComponent::kSWOutput;
473             pComp->SetStopwatch(pStopwatches->At(outputBase), AliHLTComponent::kSWBase);
474             pComp->SetStopwatch(pStopwatches->At((int)AliHLTComponent::kSWOutput), AliHLTComponent::kSWDA);
475           }
476           break;
477         default:
478           HLTWarning("unknown component type %d", (int)pComp->GetComponentType());
479         }
480       }
481     } else {
482     }
483     lnk = lnk->Next();
484   }
485   return iResult;
486 }
487
488 int AliHLTSystem::PauseBenchmarking(TObjArray* pStopwatches) const
489 {
490   // see header file for class documentation
491   if (pStopwatches==NULL) return 0;
492
493   for (int i=0; i<(int)AliHLTComponent::kSWTypeCount; i++) {
494     if (!pStopwatches->At(i)) continue;
495     TStopwatch* pSw=dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(i));
496     if (pSw) pSw->Stop();
497   }
498   return 0;
499 }
500
501 int AliHLTSystem::ResumeBenchmarking(TObjArray* pStopwatches) const
502 {
503   // see header file for class documentation
504   if (pStopwatches==NULL) return 0;
505
506   for (int i=0; i<(int)AliHLTComponent::kSWTypeCount; i++) {
507     if (!pStopwatches->At(i)) continue;
508     TStopwatch* pSw=dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(i));
509     if (pSw) pSw->Continue();
510   }
511   return 0;
512 }
513
514 int AliHLTSystem::PrintBenchmarking(TObjArray* pStopwatches, int bClean) const
515 {
516   // see header file for class documentation
517   int iInitialized=1;
518   if (pStopwatches==NULL) return 0;
519
520   for (int i=0; i<(int)AliHLTComponent::kSWTypeCount; i++) {
521     if (!dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(i))) {
522       iInitialized=0;
523       break;
524     }
525   }
526
527   if (iInitialized!=0) {
528     HLTImportant("HLT statistics:\n"
529             "    base:              R:%.3fs C:%.3fs\n"
530             "    input:             R:%.3fs C:%.3fs\n"
531             "    output:            R:%.3fs C:%.3fs\n"
532             "    event processing : R:%.3fs C:%.3fs"
533             , dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(AliHLTComponent::kSWBase))->RealTime()
534             , dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(AliHLTComponent::kSWBase))->CpuTime()
535             , dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(AliHLTComponent::kSWInput))->RealTime()
536             , dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(AliHLTComponent::kSWInput))->CpuTime()
537             , dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(AliHLTComponent::kSWOutput))->RealTime()
538             , dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(AliHLTComponent::kSWOutput))->CpuTime()
539             , dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(AliHLTComponent::kSWDA))->RealTime()
540             , dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(AliHLTComponent::kSWDA))->CpuTime()
541             );
542   }
543
544   if (bClean) {
545     for (int i=0; i<(int)AliHLTComponent::kSWTypeCount; i++) {
546       TObject* pObj=pStopwatches->RemoveAt(i);
547       if (pObj) delete pObj;
548     }
549   }
550   return 0;
551 }
552
553 int AliHLTSystem::StartTasks()
554 {
555   // see header file for class documentation
556   int iResult=0;
557   TObjLink *lnk=fTaskList.FirstLink();
558   while (lnk && iResult>=0) {
559     TObject* obj=lnk->GetObject();
560     if (obj) {
561       AliHLTTask* pTask=(AliHLTTask*)obj;
562       iResult=pTask->StartRun();
563 //       ProcInfo_t ProcInfo;
564 //       gSystem->GetProcInfo(&ProcInfo);
565 //       HLTInfo("task %s started (%d), current memory usage %d %d", pTask->GetName(), iResult, ProcInfo.fMemResident, ProcInfo.fMemVirtual);
566     } else {
567     }
568     lnk = lnk->Next();
569   }
570   if (iResult<0) {
571     HLTError("can not start task list, error %d", iResult);
572   } else {
573     SetStatusFlags(kStarted);
574     fEventCount=0;
575     fGoodEvents=0;
576     if ((iResult=SendControlEvent(kAliHLTDataTypeSOR))<0) {
577       HLTError("can not send SOR event");
578     }
579   }
580   return iResult;
581 }
582
583 int AliHLTSystem::ProcessTasks(Int_t eventNo)
584 {
585   // see header file for class documentation
586   int iResult=0;
587   HLTDebug("processing event no %d", eventNo);
588   TObjLink *lnk=fTaskList.FirstLink();
589   while (lnk && iResult>=0) {
590     TObject* obj=lnk->GetObject();
591     if (obj) {
592       AliHLTTask* pTask=(AliHLTTask*)obj;
593       iResult=pTask->ProcessTask(eventNo);
594 //       ProcInfo_t ProcInfo;
595 //       gSystem->GetProcInfo(&ProcInfo);
596 //       HLTInfo("task %s processed (%d), current memory usage %d %d", pTask->GetName(), iResult, ProcInfo.fMemResident, ProcInfo.fMemVirtual);
597     } else {
598     }
599     lnk = lnk->Next();
600   }
601
602   if (iResult>=0) {
603     HLTImportant("Event %d successfully finished (%d)", eventNo, iResult);
604     iResult=0;
605   } else {
606     HLTError("Processing of event %d failed (%d)", eventNo, iResult);
607   }
608
609   return iResult;
610 }
611
612 int AliHLTSystem::StopTasks()
613 {
614   // see header file for class documentation
615   int iResult=0;
616   if ((iResult=SendControlEvent(kAliHLTDataTypeEOR))<0) {
617     HLTError("can not send EOR event");
618   }
619   TObjLink *lnk=fTaskList.FirstLink();
620   while (lnk) {
621     TObject* obj=lnk->GetObject();
622     if (obj) {
623       AliHLTTask* pTask=(AliHLTTask*)obj;
624       int locResult=pTask->EndRun();
625       if (iResult>=0 && locResult<0) iResult=locResult;
626 //       ProcInfo_t ProcInfo;
627 //       gSystem->GetProcInfo(&ProcInfo);
628 //       HLTInfo("task %s stopped (%d), current memory usage %d %d", pTask->GetName(), iResult, ProcInfo.fMemResident, ProcInfo.fMemVirtual);
629     } else {
630     }
631     lnk = lnk->Next();
632   }
633   PrintBenchmarking(fStopwatches, 1 /*clean*/);
634   ClearStatusFlags(kStarted);
635   return iResult;
636 }
637
638 int AliHLTSystem::SendControlEvent(AliHLTComponentDataType dt)
639 {
640   // see header file for class documentation
641
642   // disabled for the moment
643   return 0;
644
645   int iResult=0;
646   AliHLTRunDesc runDesc;
647   memset(&runDesc, 0, sizeof(AliHLTRunDesc));
648   runDesc.fStructSize=sizeof(AliHLTRunDesc);
649   AliHLTDataSource::AliSpecialEventGuard g(&runDesc, dt, kAliHLTVoidDataSpec);
650   HLTDebug("sending event %s, run descriptor %p", AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str(), &runDesc);
651   TObjLink *lnk=fTaskList.FirstLink();
652   while (lnk && iResult>=0) {
653     TObject* obj=lnk->GetObject();
654     if (obj) {
655       AliHLTTask* pTask=(AliHLTTask*)obj;
656       iResult=pTask->ProcessTask(-1);
657     } else {
658     }
659     lnk = lnk->Next();
660   }
661   HLTDebug("event %s done (%d)", AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str(), iResult);
662   return iResult;
663 }
664
665 int AliHLTSystem::DeinitTasks()
666 {
667   // see header file for class documentation
668   int iResult=0;
669   TObjLink *lnk=fTaskList.FirstLink();
670   while (lnk && iResult>=0) {
671     TObject* obj=lnk->GetObject();
672     if (obj) {
673       AliHLTTask* pTask=(AliHLTTask*)obj;
674       iResult=pTask->Deinit();
675 //       ProcInfo_t ProcInfo;
676 //       gSystem->GetProcInfo(&ProcInfo);
677 //       HLTInfo("task %s cleaned (%d), current memory usage %d %d", pTask->GetName(), iResult, ProcInfo.fMemResident, ProcInfo.fMemVirtual);
678     } else {
679     }
680     lnk = lnk->Next();
681   }
682   fEventCount=-1;
683   fGoodEvents=-1;
684
685   return iResult;
686 }
687
688 void* AliHLTSystem::AllocMemory( void* /*param*/, unsigned long size )
689 {
690   // see header file for class documentation
691   void* p=NULL;
692   try {
693     p=(void*)new char[size];
694   }
695   catch (...) {
696     AliHLTLogging log;
697     log.LoggingVarargs(kHLTLogError, "AliHLTSystem" , "AllocMemory" , __FILE__ , __LINE__ , "exeption during memory allocation" );
698   }
699   return p;
700 }
701
702 int AliHLTSystem::Reconstruct(int nofEvents, AliRunLoader* runLoader, 
703                               AliRawReader* rawReader)
704 {
705   // see header file for class documentation
706   int iResult=0;
707   if (runLoader || rawReader || nofEvents==0) {
708     if (nofEvents>0) {HLTInfo("Run Loader %p, Raw Reader %p , %d event(s)", runLoader, rawReader, nofEvents);}
709     if (CheckStatus(kReady)) {
710       if (nofEvents==0) {
711         // special case to close the reconstruction
712         if (!CheckStatus(kError)) {
713         StopTasks();
714         DeinitTasks();
715         }
716       } else {
717       if ((iResult=AliHLTOfflineInterface::SetParamsToComponents(runLoader, rawReader))>=0) {
718         // the system always remains started after event processing, a specific
719         // call with nofEvents==0 is needed to execute the stop sequence
720         if ((iResult=Run(nofEvents, 0))<0) SetStatusFlags(kError);
721       }
722       }
723     } else {
724       HLTError("wrong state %#x, required flags %#x", GetStatusFlags(), kReady);
725     }
726   } else {
727     HLTError("missing RunLoader (%p)/RawReader (%p) instance", runLoader, rawReader);
728     iResult=-EINVAL;
729   }
730   return iResult;
731 }
732
733 int AliHLTSystem::FillESD(int eventNo, AliRunLoader* runLoader, AliESDEvent* esd)
734 {
735   // see header file for class documentation
736   int iResult=0;
737   if (runLoader || esd) {
738     HLTInfo("Event %d: Run Loader %p, ESD %p", eventNo, runLoader, esd);
739     iResult=AliHLTOfflineInterface::FillComponentESDs(eventNo, runLoader, esd);
740   } else {
741     HLTError("missing run loader/ESD instance(s)");
742     iResult=-EINVAL;
743   }
744   return iResult;
745 }
746
747 int AliHLTSystem::ProcessHLTOUT(AliHLTOUT* pHLTOUT, AliESDEvent* esd)
748 {
749   // see header file for class documentation
750   int iResult=0;
751   if (!pHLTOUT) return -EINVAL;
752   HLTDebug("processing %d HLT data blocks", pHLTOUT->GetNofDataBlocks());
753
754   // add the current HLTOUT task to the collection
755   if (fpHLTOUTTask) {
756     AliHLTOUT* pTask=dynamic_cast<AliHLTOUT*>(fpHLTOUTTask);
757     if (pTask && (iResult=pTask->Init())>=0) {
758       if (pTask->GetNofDataBlocks()>0) {
759         pHLTOUT->AddSubCollection(pTask);
760       }
761     } else {
762       HLTWarning("can not initialize HLTOUT sub collection %s for reconstruction chain (%d), data blocks are lost", pTask?fpHLTOUTTask->GetName():"nil", iResult);
763       iResult=0;
764     }
765   }
766
767   
768   //
769   // process all kChain handlers first
770   //
771   if ((iResult=ProcessHLTOUTkChain(pHLTOUT))<0) {
772     HLTWarning("Processing of kChain-type data blocks failed with error code %d", iResult);
773     iResult=0;
774   } 
775
776   if (!fpEsdHandlers)
777     fpEsdHandlers=new AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector;
778   if (!fpProprietaryHandlers)
779     fpProprietaryHandlers=new AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector;
780
781   AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector* pEsdHandlers=reinterpret_cast<AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector*>(fpEsdHandlers);
782   AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector* pProprietaryHandlers=reinterpret_cast<AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector*>(fpProprietaryHandlers);
783   if (!pEsdHandlers || !pProprietaryHandlers) return -ENOMEM;
784
785   // invalidate all blocks
786   AliHLTOUT::InvalidateBlocks(*pEsdHandlers);
787   AliHLTOUT::InvalidateBlocks(*pProprietaryHandlers);
788
789   // first come first serve: the ESD of the first handler is also filled into
790   // the main ESD. Has to be changed later.
791   // currently, merging to the provided ESDs crashes at the level of the
792   // TTree::Fill in AliReconstruction, furthermore, the wrong ESD is passed
793   // by the framework
794   AliESDEvent* pMasterESD=NULL;
795   pMasterESD=esd;
796
797   AliHLTComponentDataTypeList esdBlocks;
798
799   for (iResult=pHLTOUT->SelectFirstDataBlock();
800        iResult>=0;
801        iResult=pHLTOUT->SelectNextDataBlock()) {
802     AliHLTComponentDataType dt=kAliHLTVoidDataType;
803     AliHLTUInt32_t spec=kAliHLTVoidDataSpec;
804     pHLTOUT->GetDataBlockDescription(dt, spec);
805     AliHLTOUTHandler* pHandler=pHLTOUT->GetHandler();
806     AliHLTModuleAgent::AliHLTOUTHandlerType handlerType=pHLTOUT->GetDataBlockHandlerType();
807
808     // default handling for ESD data blocks does not require an explicite handler
809     if (!pHandler && (dt==kAliHLTDataTypeESDObject || dt==kAliHLTDataTypeESDTree)) {
810       handlerType=AliHLTModuleAgent::kEsd;
811     }
812     const char* pMsg="invalid";
813     switch (handlerType) {
814     case AliHLTModuleAgent::kEsd:
815       {
816         if (pHandler) {
817           // schedule for later processing
818           pHLTOUT->InsertHandler(*pEsdHandlers, pHLTOUT->GetDataBlockHandlerDesc());
819         } else {
820           AliHLTComponentDataTypeList::iterator element=esdBlocks.begin();
821           for (; element!=esdBlocks.end(); element++) {
822             if (*element==dt) {
823               HLTWarning("multiple ESDs of identical data type %s, please add appropriate handler to merge ESDs", AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str());
824               break;
825             }
826           }
827           if (element==esdBlocks.end()) esdBlocks.push_back(dt);
828
829           // write directly
830           const AliHLTUInt8_t* pBuffer=NULL;
831           AliHLTUInt32_t size=0;
832           if (pHLTOUT->GetDataBuffer(pBuffer, size)>=0) {
833             pHLTOUT->WriteESD(pBuffer, size, dt);
834             if (pMasterESD) {
835               pHLTOUT->WriteESD(pBuffer, size, dt, pMasterESD);
836               pMasterESD=NULL;
837             }
838             pHLTOUT->ReleaseDataBuffer(pBuffer);
839           }
840           pHLTOUT->MarkDataBlockProcessed();
841         }
842       }
843       break;
844     case AliHLTModuleAgent::kRawReader:
845       // handled in the AliRawReaderHLT
846       break;
847     case AliHLTModuleAgent::kRawStream:
848       HLTWarning("HLTOUT handler type 'kRawStream' not yet implemented: agent %s, data type %s, specification %#x",
849                  pMsg, pHLTOUT->GetAgent()?pHLTOUT->GetAgent()->GetModuleId():"invalid",
850                  AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str(), spec);
851       break;
852     case AliHLTModuleAgent::kChain:
853       HLTWarning("HLTOUT handler type 'kChain' has already been processed: agent %s, data type %s, specification %#x\n"
854                  "New block of this type added by the chain? Skipping data block ...",
855                  pMsg, pHLTOUT->GetAgent()?pHLTOUT->GetAgent()->GetModuleId():"invalid",
856                  AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str(), spec);
857       break;
858     case AliHLTModuleAgent::kProprietary:
859       HLTDebug("processing proprietary data: agent %s, data type %s, specification %#x",
860                  pMsg, pHLTOUT->GetAgent()?pHLTOUT->GetAgent()->GetModuleId():"invalid",
861                  AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str(), spec);
862       if (pHandler) {
863         AliHLTOUT::AliHLTOUTLockGuard g(pHLTOUT);
864         int res=pHandler->ProcessData(pHLTOUT);
865         if (res<0) {
866           HLTWarning("processing proprietary data failed (%d): agent %s, data type %s, specification %#x",
867                      res, pMsg, pHLTOUT->GetAgent()?pHLTOUT->GetAgent()->GetModuleId():"invalid",
868                      AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str(), spec);
869         }
870       }
871       break;
872     case AliHLTModuleAgent::kUnknownOutput:
873       pMsg="unknown";
874       // fall trough intended
875     default:
876       HLTWarning("%s handler type: agent %s, data type %s, specification %#x, ... skipping data block",
877                  pMsg, pHLTOUT->GetAgent()?pHLTOUT->GetAgent()->GetModuleId():"invalid",
878                  AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str(), spec);
879     }
880   }
881   // TODO: the return value of SelectFirst/NextDataBlock must be
882   // changed in order to avoid this check
883   if (iResult==-ENOENT) iResult=0;
884
885   AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector::iterator handler;
886
887   // process and write all esd data blocks
888   for (handler=pEsdHandlers->begin(); handler!=pEsdHandlers->end() && iResult>=0; handler++) {
889     AliHLTOUT::AliHLTOUTSelectionGuard g(pHLTOUT, &(*handler));     
890     AliHLTOUTHandler* pHandler=*handler;
891     const AliHLTUInt8_t* pBuffer=NULL;
892     AliHLTUInt32_t size=0;
893     pHandler->ProcessData(pHLTOUT);
894     if ((size=pHandler->GetProcessedData(pBuffer))>0) {
895       AliHLTModuleAgent::AliHLTOUTHandlerDesc desc=*handler;
896       AliHLTComponentDataType dt=desc;
897       pHLTOUT->WriteESD(pBuffer, size, dt);
898       if (pMasterESD) {
899         pHLTOUT->WriteESD(pBuffer, size, dt, pMasterESD);
900         pMasterESD=NULL;
901       }
902       pHandler->ReleaseProcessedData(pBuffer, size);
903     }
904     pHLTOUT->MarkDataBlocksProcessed(&(*handler));
905   }
906
907   // process all kProprietary data blocks
908   for (handler=pProprietaryHandlers->begin(); handler!=pProprietaryHandlers->end() && iResult>=0; handler++) {
909     AliHLTOUT::AliHLTOUTSelectionGuard g(pHLTOUT, &(*handler));     
910     AliHLTOUTHandler* pHandler=*handler;
911     const AliHLTUInt8_t* pBuffer=NULL;
912     AliHLTUInt32_t size=0;
913     pHandler->ProcessData(pHLTOUT);
914     if ((size=pHandler->GetProcessedData(pBuffer))>0) {
915       HLTWarning("data produced by kProprietary handler ignored");
916       pHandler->ReleaseProcessedData(pBuffer, size);
917     }
918     pHLTOUT->MarkDataBlocksProcessed(&(*handler));
919   }
920
921   // remove all empty handlers form the list (handlers which did not get a block this time)
922   AliHLTOUT::RemoveEmptyDuplicateHandlers(*pEsdHandlers);
923   AliHLTOUT::RemoveEmptyDuplicateHandlers(*pProprietaryHandlers);
924
925   return iResult;
926 }
927
928 int AliHLTSystem::ProcessHLTOUTkChain(AliHLTOUT* pHLTOUT)
929 {
930   // see header file for class documentation
931   int iResult=0;
932   if (!pHLTOUT) return -EINVAL;
933
934   if (!fpChainHandlers)
935     fpChainHandlers=new AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector;
936
937   AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector* pChainHandlers=reinterpret_cast<AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector*>(fpChainHandlers);
938   if (!pChainHandlers) return -ENOMEM;
939
940   // invalidate all blocks
941   AliHLTOUT::InvalidateBlocks(*pChainHandlers);
942
943   // fill the list
944   pHLTOUT->FillHandlerList(*pChainHandlers, AliHLTModuleAgent::kChain);
945
946   // process all defined chain handlers
947   AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector::iterator chainHandler;
948   for (chainHandler=pChainHandlers->begin(); chainHandler!=pChainHandlers->end() && iResult>=0; chainHandler++) {
949     if (chainHandler->IsEmpty()) continue;
950     AliHLTOUT::AliHLTOUTSelectionGuard g(pHLTOUT, &(*chainHandler));        
951     AliHLTOUTHandler* pHandler=*chainHandler;
952     const AliHLTUInt8_t* pBuffer=NULL;
953     AliHLTUInt32_t size=0;
954     pHandler->ProcessData(pHLTOUT);
955     if ((size=pHandler->GetProcessedData(pBuffer))>0) {
956       AliHLTModuleAgent::AliHLTOUTHandlerDesc desc=*chainHandler;
957       AliHLTComponentDataType dt=desc;
958
959       pHandler->ReleaseProcessedData(pBuffer, size);
960     }
961     pHLTOUT->MarkDataBlocksProcessed(&(*chainHandler));
962   }
963
964   // remove all empty handlers form the list (handlers which did not get a block this time)
965   AliHLTOUT::RemoveEmptyDuplicateHandlers(*pChainHandlers);
966
967   return iResult;
968 }
969
970 int AliHLTSystem::LoadComponentLibraries(const char* libraries)
971 {
972   // see header file for class documentation
973   int iResult=0;
974   if (libraries) {
975     if (fpComponentHandler) {
976       TString libs(libraries);
977       TObjArray* pTokens=libs.Tokenize(" ");
978       if (pTokens) {
979         int iEntries=pTokens->GetEntries();
980         for (int i=0; i<iEntries && iResult>=0; i++) {
981           iResult=fpComponentHandler->LoadLibrary((((TObjString*)pTokens->At(i))->GetString()).Data());
982         }
983         delete pTokens;
984       }
985       if (iResult>=0) {
986         SetStatusFlags(kLibrariesLoaded);
987       } else {
988         // lets see if we need this, probably not
989         //fpComponentHandler->UnloadLibraries();
990         ClearStatusFlags(kLibrariesLoaded);
991       }
992     } else {
993       iResult=-EFAULT;
994       HLTFatal("no component handler available");
995     }
996   } else {
997     iResult=-EINVAL;
998   }
999   return iResult;
1000 }
1001
1002 int AliHLTSystem::Configure(AliRunLoader* runloader)
1003 {
1004   // see header file for class documentation
1005   return Configure(NULL, runloader);
1006 }
1007
1008 int AliHLTSystem::Configure(AliRawReader* rawReader, AliRunLoader* runloader)
1009 {
1010   // see header file for class documentation
1011   int iResult=0;
1012   if (CheckStatus(kRunning)) {
1013     HLTError("HLT system in running state, can not configure");
1014     return -EBUSY;
1015   }
1016   ClearStatusFlags(kTaskListCreated);
1017   if (CheckFilter(kHLTLogDebug))
1018     AliHLTModuleAgent::PrintStatus();
1019   if (CheckStatus(kConfigurationLoaded)==0) {
1020     iResult=LoadConfigurations(rawReader, runloader);
1021   } else {
1022     if (fChains.Length()==0) {
1023       HLTError("custom configuration(s) specified, but no configuration to run in local reconstruction, use \'chains=<chain,...>\' option");
1024       iResult=-ENOENT;
1025     }
1026   }
1027   if (iResult>=0) {
1028     SetStatusFlags(kConfigurationLoaded);
1029     if (CheckFilter(kHLTLogDebug))
1030       fpConfigurationHandler->PrintConfigurations();
1031     iResult=BuildTaskListsFromReconstructionChains(rawReader, runloader);
1032     if (iResult>=0) {
1033       SetStatusFlags(kTaskListCreated);
1034     }
1035   }
1036   if (iResult<0) SetStatusFlags(kError);
1037   
1038   return iResult;
1039 }
1040
1041 int AliHLTSystem::ScanOptions(const char* options)
1042 {
1043   // see header file for class documentation
1044   int iResult=0;
1045   if (options) {
1046     //AliHLTComponentHandler::TLibraryMode libMode=AliHLTComponentHandler::kDynamic;
1047     TString libs("");
1048     TString alloptions(options);
1049     TObjArray* pTokens=alloptions.Tokenize(" ");
1050     if (pTokens) {
1051       int iEntries=pTokens->GetEntries();
1052       for (int i=0; i<iEntries; i++) {
1053         TString token=(((TObjString*)pTokens->At(i))->GetString());
1054         if (token.Contains("loglevel=")) {
1055           TString param=token.ReplaceAll("loglevel=", "");
1056           if (param.IsDigit()) {
1057             SetGlobalLoggingLevel((AliHLTComponentLogSeverity)param.Atoi());
1058           } else if (param.BeginsWith("0x") &&
1059                      param.Replace(0,2,"",0).IsHex()) {
1060             int severity=0;
1061             sscanf(param.Data(),"%x", &severity);
1062             SetGlobalLoggingLevel((AliHLTComponentLogSeverity)severity);
1063           } else {
1064             HLTWarning("wrong parameter for option \'loglevel=\', (hex) number expected");
1065           }
1066         } else if (token.Contains("frameworklog=")) {
1067           TString param=token.ReplaceAll("frameworklog=", "");
1068           if (param.IsDigit()) {
1069             SetFrameworkLog((AliHLTComponentLogSeverity)param.Atoi());
1070           } else if (param.BeginsWith("0x") &&
1071                      param.Replace(0,2,"",0).IsHex()) {
1072             int severity=0;
1073             sscanf(param.Data(),"%x", &severity);
1074             SetFrameworkLog((AliHLTComponentLogSeverity)severity);
1075           } else {
1076             HLTWarning("wrong parameter for option \'loglevel=\', (hex) number expected");
1077           }
1078         } else if (token.Contains("alilog=off")) {
1079           SwitchAliLog(0);
1080         } else if (token.Contains("config=")) {
1081           TString param=token.ReplaceAll("config=", "");
1082           Int_t error=0;
1083           gROOT->Macro(param.Data(), &error);
1084           if (error==0) {
1085             SetStatusFlags(kConfigurationLoaded);
1086           } else {
1087             HLTError("can not execute macro \'%s\'", param.Data());
1088             iResult=-EBADF;
1089           }
1090         } else if (token.Contains("chains=")) {
1091           TString param=token.ReplaceAll("chains=", "");
1092           fChains=param.ReplaceAll(",", " ");
1093           if (fChains.IsNull()) fChains=" "; // disable all chains
1094         } else if (token.Contains("libmode=")) {
1095           TString param=token.ReplaceAll("libmode=", "");
1096           param.ReplaceAll(",", " ");
1097           if (fpComponentHandler) {
1098             if (param.CompareTo("static")==0) {
1099               fpComponentHandler->SetLibraryMode(AliHLTComponentHandler::kStatic);
1100             } else if (param.CompareTo("dynamic")==0) {
1101               fpComponentHandler->SetLibraryMode(AliHLTComponentHandler::kDynamic);
1102             } else {
1103               HLTWarning("wrong argument for option \'libmode=\', use \'static\' or \'dynamic\'");
1104             }
1105           }
1106         } else if (token.BeginsWith("lib") && token.EndsWith(".so")) {
1107           libs+=token;
1108           libs+=" ";
1109         } else {
1110           HLTWarning("unknown option \'%s\'", token.Data());
1111         }
1112       }
1113       delete pTokens;
1114     }
1115
1116     if (iResult>=0) {
1117       if (libs.IsNull()) {
1118         const char** deflib=fgkHLTDefaultLibs;
1119         while (*deflib) {
1120           libs+=*deflib++;
1121           libs+=" ";
1122         }
1123       }
1124       if ((!CheckStatus(AliHLTSystem::kLibrariesLoaded)) &&
1125           (LoadComponentLibraries(libs.Data())<0)) {
1126         HLTError("error while loading HLT libraries");
1127         iResult=-EFAULT;
1128       }
1129     }
1130   }
1131   return iResult;
1132 }
1133
1134 int AliHLTSystem::Reset(int bForce)
1135 {
1136   // see header file for class documentation
1137   int iResult=0;
1138   if (!bForce && CheckStatus(kRunning)) {
1139     HLTError("HLT system in running state, can not configure");
1140     return -EBUSY;
1141   }
1142   CleanTaskList();
1143   ClearStatusFlags(~kUninitialized);
1144   return iResult;
1145 }
1146
1147 int AliHLTSystem::LoadConfigurations(AliRawReader* rawReader, AliRunLoader* runloader)
1148 {
1149   // see header file for class documentation
1150   if (CheckStatus(kRunning)) {
1151     HLTError("HLT system in running state, can not configure");
1152     return -EBUSY;
1153   }
1154   int iResult=0;
1155   AliHLTModuleAgent* pAgent=AliHLTModuleAgent::GetFirstAgent();
1156   TString extralibs;
1157   while (pAgent && iResult>=0) {
1158     const char* deplibs=pAgent->GetRequiredComponentLibraries();
1159     if (deplibs) {
1160       HLTDebug("required libraries \'%s\' for agent %s (%p)", deplibs, pAgent->GetName(), pAgent);
1161       extralibs+=deplibs;
1162     }
1163     if (iResult>=0) {
1164       HLTDebug("load configurations for agent %s (%p)", pAgent->GetName(), pAgent);
1165       pAgent->CreateConfigurations(fpConfigurationHandler, rawReader, runloader);
1166       pAgent=AliHLTModuleAgent::GetNextAgent();
1167     }
1168   }
1169   if (iResult>=0) {
1170     iResult=LoadComponentLibraries(extralibs.Data());
1171   }
1172
1173   return iResult;
1174 }
1175
1176 int AliHLTSystem::BuildTaskListsFromReconstructionChains(AliRawReader* rawReader, AliRunLoader* runloader)
1177 {
1178   // see header file for class documentation
1179   if (CheckStatus(kRunning)) {
1180     HLTError("HLT system in running state, can not configure");
1181     return -EBUSY;
1182   }
1183   if (!CheckStatus(kConfigurationLoaded)) {
1184     HLTWarning("configurations not yet loaded");
1185     return 0;
1186   }
1187
1188   int iResult=0;
1189   int bHaveOutput=0;
1190
1191   // query chains
1192   TString chains;
1193   if (fChains.Length()>0) {
1194     chains=fChains;
1195     HLTImportant("custom reconstruction chain: %s", chains.Data());
1196   } else {
1197     AliHLTModuleAgent* pAgent=AliHLTModuleAgent::GetFirstAgent();
1198     while ((pAgent || fChains.Length()>0) && iResult>=0) {
1199       const char* agentchains=pAgent->GetReconstructionChains(rawReader, runloader);
1200       if (agentchains) {
1201         if (!chains.IsNull()) chains+=" ";
1202         chains+=agentchains;
1203         HLTInfo("reconstruction chains for agent %s (%p): %s", pAgent->GetName(), pAgent, agentchains);
1204       }
1205       pAgent=AliHLTModuleAgent::GetNextAgent();
1206     }
1207   }
1208
1209   // build task list for chains
1210   TObjArray* pTokens=chains.Tokenize(" ");
1211   if (pTokens) {
1212     int iEntries=pTokens->GetEntries();
1213     for (int i=0; i<iEntries && iResult>=0; i++) {
1214       const char* pCID=((TObjString*)pTokens->At(i))->GetString().Data();
1215       AliHLTConfiguration* pConf=fpConfigurationHandler->FindConfiguration(pCID);
1216       if (pConf) {
1217         iResult=BuildTaskList(pConf);
1218         if (true) { // condition was deprecated but kept for sake of svn diff
1219           // bHaveOutput variable has to be set for both running modes
1220           // AliHLTSimulation and AliHLTReconstruction
1221           assert(fpComponentHandler!=NULL);
1222           TString cid=pConf->GetComponentID();
1223           if (runloader!=NULL && cid.CompareTo("HLTOUT")==0) {
1224             // remove from the input of a global HLTOUT configuration
1225             chains.ReplaceAll(pCID, "");
1226           } else if (bHaveOutput==0) {
1227             // check whether this configuration produces data output
1228             if ((bHaveOutput=fpComponentHandler->HasOutputData(cid.Data()))<0) {
1229               bHaveOutput=0;
1230               chains.ReplaceAll(pCID, "");
1231             }
1232           }
1233         }
1234       } else {
1235         HLTWarning("can not find configuration %s", pCID);
1236       }
1237     }
1238     delete pTokens;
1239   }
1240
1241   // build HLTOUT for simulation
1242   if (iResult>=0 && runloader) {
1243     if (bHaveOutput) {
1244       // there are components in the chain which produce data which need to be
1245       // piped to an HLTOUT
1246       if (fpComponentHandler->FindComponentIndex("HLTOUT")>=0 ||
1247           fpComponentHandler->LoadLibrary("libHLTsim.so")>=0) {
1248         AliHLTConfiguration globalout("_globalout_", "HLTOUT", chains.Data(), NULL);
1249         iResult=BuildTaskList("_globalout_");
1250       } else {
1251         HLTError("can not load libHLTsim.so and HLTOUT component");
1252         iResult=-EFAULT;
1253       }
1254     }
1255   }
1256
1257   // build HLTOUT task for reconstruction
1258   // Matthias 08.07.2008 the rawReader is never set when running embedded into
1259   // AliReconstruction. The system is configured during AliHLTReconstructor::Init
1260   // where the RawReader is not available. It is available in the first invocation
1261   // of Reconstruct.
1262   // 
1263   // That means that policy is slightly changed:
1264   // - if the run loader is available -> AliSimulation
1265   // - no run loader available -> AliReconstruction
1266   if (iResult>=0 && !runloader) {
1267     if (bHaveOutput) {
1268       // there are components in the chain which produce data which need to be
1269       // piped to an HLTOUT sub-collection
1270       if (!fpHLTOUTTask) {
1271         fpHLTOUTTask=new AliHLTOUTTask(chains.Data());
1272         if (fpHLTOUTTask) {
1273           if (fpHLTOUTTask->GetConf() && fpHLTOUTTask->GetConf()->SourcesResolved()>=0) {
1274             iResult=InsertTask(fpHLTOUTTask);
1275           } else {
1276             HLTError("HLTOUT task (%s) sources not resolved", fpHLTOUTTask->GetName());
1277             iResult=-ENOENT;
1278           }
1279         }
1280       }
1281     }
1282   }
1283
1284   if (iResult>=0) SetStatusFlags(kTaskListCreated);
1285
1286   return iResult;
1287 }
1288
1289 int AliHLTSystem::CheckStatus(int flag)
1290 {
1291   // see header file for class documentation
1292   if (flag==kUninitialized && flag==fState) return 1;
1293   if ((fState&flag)==flag) return 1;
1294   return 0;
1295 }
1296
1297 int AliHLTSystem::GetStatusFlags()
1298 {
1299   // see header file for class documentation
1300   return fState;
1301 }
1302
1303 int AliHLTSystem::SetStatusFlags(int flags)
1304 {
1305   // see header file for class documentation
1306   fState|=flags;
1307   return fState;
1308 }
1309
1310 int AliHLTSystem::ClearStatusFlags(int flags)
1311 {
1312   // see header file for class documentation
1313   fState&=~flags;
1314   return fState;
1315 }
1316
1317 void* AliHLTSystem::FindDynamicSymbol(const char* library, const char* symbol)
1318 {
1319   // see header file for class documentation
1320   if (fpComponentHandler==NULL) return NULL;
1321   return fpComponentHandler->FindSymbol(library, symbol);
1322 }
1323
1324 void AliHLTSystem::SetFrameworkLog(AliHLTComponentLogSeverity level) 
1325 {
1326   // see header file for class documentation
1327   SetLocalLoggingLevel(level);
1328   if (fpComponentHandler) fpComponentHandler->SetLocalLoggingLevel(level);
1329   if (fpConfigurationHandler) fpConfigurationHandler->SetLocalLoggingLevel(level);
1330 }