Bug fix: AliHLTTPCRawSpacePointContainer
[u/mrichter/AliRoot.git] / HLT / global / AliHLTGlobalEsdConverterComponent.cxx
1 // $Id$
2
3 //**************************************************************************
4 //* This file is property of and copyright by the ALICE HLT Project        * 
5 //* ALICE Experiment at CERN, All rights reserved.                         *
6 //*                                                                        *
7 //* Primary Authors: Matthias Richter <Matthias.Richter@ift.uib.no>        *
8 //*                  for The ALICE HLT Project.                            *
9 //*                                                                        *
10 //* Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
11 //* documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
12 //* without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
13 //* copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
14 //* appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
15 //* about the suitability of this software for any purpose. It is          *
16 //* provided "as is" without express or implied warranty.                  *
17 //**************************************************************************
18
19 //  @file   AliHLTGlobalEsdConverterComponent.cxx
20 //  @author Matthias Richter
21 //  @date   
22 //  @brief  Global ESD converter component.
23 // 
24
25 // see header file for class documentation
26 // or
27 // refer to README to build package
28 // or
29 // visit http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt
30
31 #include <cassert>
32 #include "AliHLTGlobalEsdConverterComponent.h"
33 #include "AliHLTGlobalBarrelTrack.h"
34 #include "AliHLTExternalTrackParam.h"
35 #include "AliHLTTrackMCLabel.h"
36 #include "AliHLTCTPData.h"
37 #include "AliHLTErrorGuard.h"
38 #include "AliESDEvent.h"
39 #include "AliESDtrack.h"
40 #include "AliESDMuonTrack.h"
41 #include "AliESDMuonCluster.h"
42 #include "AliCDBEntry.h"
43 #include "AliCDBManager.h"
44 #include "AliPID.h"
45 #include "TTree.h"
46 #include "TList.h"
47 #include "TClonesArray.h"
48 #include "AliHLTESDCaloClusterMaker.h"
49 #include "AliHLTCaloClusterDataStruct.h"
50 #include "AliHLTCaloClusterReader.h"
51 #include "AliESDCaloCluster.h"
52 #include "AliESDVZERO.h"
53 #include "AliHLTGlobalVertexerComponent.h"
54 #include "AliHLTVertexFinderBase.h"
55
56 /** ROOT macro for the implementation of ROOT specific class methods */
57 ClassImp(AliHLTGlobalEsdConverterComponent)
58
59 AliHLTGlobalEsdConverterComponent::AliHLTGlobalEsdConverterComponent()
60   : AliHLTProcessor()
61   , fWriteTree(0)
62   , fVerbosity(0)
63   , fESD(NULL)
64   , fSolenoidBz(-5.00668)
65   , fBenchmark("EsdConverter")
66 {
67   // see header file for class documentation
68   // or
69   // refer to README to build package
70   // or
71   // visit http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt
72 }
73
74 AliHLTGlobalEsdConverterComponent::~AliHLTGlobalEsdConverterComponent()
75 {
76   // see header file for class documentation
77   if (fESD) delete fESD;
78   fESD=NULL;
79 }
80
81 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::Configure(const char* arguments)
82 {
83   // see header file for class documentation
84   int iResult=0;
85   if (!arguments) return iResult;
86
87   TString allArgs=arguments;
88   TString argument;
89   int bMissingParam=0;
90
91   TObjArray* pTokens=allArgs.Tokenize(" ");
92   if (pTokens) {
93     for (int i=0; i<pTokens->GetEntries() && iResult>=0; i++) {
94       argument=((TObjString*)pTokens->At(i))->String(); 
95       if (argument.IsNull()) continue;
96       
97       if (argument.CompareTo("-solenoidBz")==0) {
98         if ((bMissingParam=(++i>=pTokens->GetEntries()))) break;
99         HLTWarning("argument -solenoidBz is deprecated, magnetic field set up globally (%f)", GetBz());
100         continue;
101       } else {
102         HLTError("unknown argument %s", argument.Data());
103         iResult=-EINVAL;
104         break;
105       }
106     }
107     delete pTokens;
108   }
109   if (bMissingParam) {
110     HLTError("missing parameter for argument %s", argument.Data());
111     iResult=-EINVAL;
112   }
113
114   return iResult;
115 }
116
117 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::Reconfigure(const char* cdbEntry, const char* chainId)
118 {
119   // see header file for class documentation
120   int iResult=0;
121   const char* path=NULL;
122   const char* defaultNotify="";
123   if (cdbEntry) {
124     path=cdbEntry;
125     defaultNotify=" (default)";
126   }
127   if (path) {
128     HLTInfo("reconfigure from entry %s%s, chain id %s", path, defaultNotify,(chainId!=NULL && chainId[0]!=0)?chainId:"<none>");
129     AliCDBEntry *pEntry = AliCDBManager::Instance()->Get(path/*,GetRunNo()*/);
130     if (pEntry) {
131       TObjString* pString=dynamic_cast<TObjString*>(pEntry->GetObject());
132       if (pString) {
133         HLTInfo("received configuration object string: \'%s\'", pString->String().Data());
134         iResult=Configure(pString->String().Data());
135       } else {
136         HLTError("configuration object \"%s\" has wrong type, required TObjString", path);
137       }
138     } else {
139       HLTError("can not fetch object \"%s\" from CDB", path);
140     }
141   }
142   
143   return iResult;
144 }
145
146 void AliHLTGlobalEsdConverterComponent::GetInputDataTypes(AliHLTComponentDataTypeList& list)
147 {
148   // see header file for class documentation
149   list.push_back(kAliHLTDataTypeTrack);
150   list.push_back(kAliHLTDataTypeTrackMC);
151   list.push_back(kAliHLTDataTypeCaloCluster);
152   list.push_back(kAliHLTDataTypedEdx );
153   list.push_back(kAliHLTDataTypeESDVertex );
154   list.push_back(kAliHLTDataTypeESDObject);
155   list.push_back(kAliHLTDataTypeTObject);
156   list.push_back(kAliHLTDataTypeGlobalVertexer);
157   list.push_back(kAliHLTDataTypeV0Finder); // array of track ids for V0s
158   list.push_back(kAliHLTDataTypeKFVertex); // KFVertex object from vertexer
159   list.push_back(kAliHLTDataTypePrimaryFinder); // array of track ids for prim vertex
160   list.push_back(kAliHLTDataTypeESDContent);
161 }
162
163 AliHLTComponentDataType AliHLTGlobalEsdConverterComponent::GetOutputDataType()
164 {
165   // see header file for class documentation
166   return kAliHLTDataTypeESDObject|kAliHLTDataOriginOut;
167 }
168
169 void AliHLTGlobalEsdConverterComponent::GetOutputDataSize(unsigned long& constBase, double& inputMultiplier)
170 {
171   // see header file for class documentation
172   constBase=2000000;
173   inputMultiplier=10.0;
174 }
175
176 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::DoInit(int argc, const char** argv)
177 {
178   // see header file for class documentation
179   int iResult=0;
180   TString argument="";
181   int bMissingParam=0;
182
183   // default list of skiped ESD objects
184   TString skipObjects=
185     // "AliESDRun,"
186     // "AliESDHeader,"
187     // "AliESDZDC,"
188     "AliESDFMD,"
189     // "AliESDVZERO,"
190     // "AliESDTZERO,"
191     // "TPCVertex,"
192     // "SPDVertex,"
193     // "PrimaryVertex,"
194     // "AliMultiplicity,"
195     // "PHOSTrigger,"
196     // "EMCALTrigger,"
197     // "SPDPileupVertices,"
198     // "TrkPileupVertices,"
199     "Cascades,"
200     "Kinks,"
201     "AliRawDataErrorLogs,"
202     "AliESDACORDE";
203
204   iResult=Reconfigure(NULL, NULL);
205   TString allArgs = "";
206   for ( int i = 0; i < argc; i++ ) {
207     if ( !allArgs.IsNull() ) allArgs += " ";
208     allArgs += argv[i];
209   }
210
211   TObjArray* pTokens=allArgs.Tokenize(" ");
212   if (pTokens) {
213     for (int i=0; i<pTokens->GetEntries() && iResult>=0; i++) {
214       argument=((TObjString*)pTokens->At(i))->String(); 
215       if (argument.IsNull()) continue;
216
217       // -notree
218       if (argument.CompareTo("-notree")==0) {
219         fWriteTree=0;
220         
221         // -tree
222       } else if (argument.CompareTo("-tree")==0) {
223         fWriteTree=1;
224       } else if (argument.CompareTo("-solenoidBz")==0) {
225         if ((bMissingParam=(++i>=pTokens->GetEntries()))) break;
226         HLTInfo("Magnetic Field set to: %s", ((TObjString*)pTokens->At(i))->String().Data());
227         HLTWarning("argument '-solenoidBz' is deprecated, solenoid field initiaized from CDB settings");
228         continue;
229       } else if (argument.Contains("-skipobject=")) {
230         argument.ReplaceAll("-skipobject=", "");
231         skipObjects=argument;
232       } else {
233         HLTError("unknown argument %s", argument.Data());
234         iResult=-EINVAL;
235         break;
236       }
237     }
238   }
239   if (bMissingParam) {
240     HLTError("missing parameter for argument %s", argument.Data());
241     iResult=-EINVAL;
242   }
243
244   fSolenoidBz=GetBz();
245
246   if (iResult>=0) {
247     fESD = new AliESDEvent;
248     if (fESD) {
249       fESD->CreateStdContent();
250
251       // remove some of the objects which are not needed
252       if (fESD->GetList() && !skipObjects.IsNull()) {
253         pTokens=skipObjects.Tokenize(",");
254         if (pTokens) {
255           const char* id=NULL;
256           TIter next(pTokens);
257           TObject* pObject=NULL;
258           while ((pObject=next())!=NULL) {
259             id=((TObjString*)pObject)->String().Data();
260             TObject* pObj=fESD->GetList()->FindObject(id);
261             if (pObj) {
262               HLTDebug("removing object %s", id);
263               fESD->GetList()->Remove(pObj);
264               delete pObj;
265             } else {
266               HLTWarning("failed to remove object '%s' from ESD", id);
267             }
268           }
269           fESD->GetStdContent();
270           delete pTokens;
271         }
272       }
273     } else {
274       iResult=-ENOMEM;
275     }
276
277     SetupCTPData();
278   }
279
280   fBenchmark.SetTimer(0,"total");
281
282   return iResult;
283 }
284
285 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::DoDeinit()
286 {
287   // see header file for class documentation
288   if (fESD) delete fESD;
289   fESD=NULL;
290
291   return 0;
292 }
293
294 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::DoEvent(const AliHLTComponentEventData& /*evtData*/, 
295                                                AliHLTComponentTriggerData& trigData)
296 {
297   // see header file for class documentation
298   int iResult=0;
299   if (!fESD) return -ENODEV;
300
301   if (IsDataEvent()) fBenchmark.StartNewEvent();
302   fBenchmark.Start(0);
303
304   AliESDEvent* pESD = fESD;
305
306   pESD->Reset(); 
307   pESD->SetMagneticField(fSolenoidBz);
308   pESD->SetRunNumber(GetRunNo());
309   pESD->SetPeriodNumber(GetPeriodNumber());
310   pESD->SetOrbitNumber(GetOrbitNumber());
311   pESD->SetBunchCrossNumber(GetBunchCrossNumber());
312   pESD->SetTimeStamp(GetTimeStamp());
313
314   const AliHLTCTPData* pCTPData=CTPData();
315   if (pCTPData) {
316     AliHLTUInt64_t mask=pCTPData->ActiveTriggers(trigData);
317     for (int index=0; index<gkNCTPTriggerClasses; index++) {
318       if ((mask&((AliHLTUInt64_t)0x1<<index)) == 0) continue;
319       pESD->SetTriggerClass(pCTPData->Name(index), index);
320     }
321     pESD->SetTriggerMask(mask);
322   }
323
324   TTree* pTree = NULL;
325   if (fWriteTree)
326     pTree = new TTree("esdTree", "Tree with HLT ESD objects");
327  
328   if (pTree) {
329     pTree->SetDirectory(0);
330   }
331
332   if ((iResult=ProcessBlocks(pTree, pESD))>=0) {
333     // TODO: set the specification correctly
334     if (pTree) {
335       // the esd structure is written to the user info and is
336       // needed in te ReadFromTree method to read all objects correctly
337       pTree->GetUserInfo()->Add(pESD);
338       pESD->WriteToTree(pTree);
339       iResult=PushBack(pTree, kAliHLTDataTypeESDTree|kAliHLTDataOriginOut, 0);
340     } else {
341       iResult=PushBack(pESD, kAliHLTDataTypeESDObject|kAliHLTDataOriginOut, 0);
342     }
343     fBenchmark.AddOutput(GetLastObjectSize());
344   }
345   if (pTree) {
346     // clear user info list to prevent objects from being deleted
347     pTree->GetUserInfo()->Clear();
348     delete pTree;
349   }
350
351   fBenchmark.Stop(0);
352   HLTInfo( fBenchmark.GetStatistics() );
353
354   return iResult;
355 }
356
357 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::ProcessBlocks(TTree* pTree, AliESDEvent* pESD)
358 {
359   // see header file for class documentation
360
361   int iResult=0;
362   int iAddedDataBlocks=0;
363
364   // check if there is an ESD block in the input and copy its content first to the
365   // ESD
366   const TObject* pEsdObj = GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeESDObject, "AliESDEvent");
367   AliESDEvent* pInputESD=NULL;
368   if (pEsdObj) pInputESD=dynamic_cast<AliESDEvent*>(const_cast<TObject*>(pEsdObj));
369   if (pInputESD) {
370     pInputESD->GetStdContent();
371     *pESD=*pInputESD;
372   }
373   if (GetNextInputObject()!=NULL) {
374     HLTWarning("handling of multiple ESD input objects not implemented, skipping input");
375   }
376
377   // Barrel tracking
378   // tracks are based on the TPC tracks, and only updated from the ITS information
379   // Sequence:
380   // 1) extract MC information for TPC and ITS from specific data blocks and store in
381   //    intermediate vector arrays
382   // 2) extract TPC tracks, update with MC labels if available, the track parameters
383   //    are estimated at the first cluster position
384   // 2.1) propagate to last cluster position and update kTPCout, sets also outer param (fOp)
385   // 2.2) update kTPCin, sets also inner param (fIp) and TPC inner param (fTPCInner)
386   // 2.3) update kTPCrefit using the same parameters at the first cluster position
387   //      HLT has strictly spoking no refit, but we want the flag to be set
388   //      can be changed to be done after all the individual barrel detector parameters
389   //      have been updated by looping over the tracks again
390   // 3) extract ITS tracks, the tracks are actually TPC tracks updated from the ITS
391   //    tracking information
392   // 3.1) TODO 2010-07-12: handle ITS standalone tracks by updating kITSout before kITSin
393   // 3.2) update with kITSin
394   //    TODO 2010-07-12 find out if the kITSrefit has to be set as well
395   // 4) extract TRD tracks and add to ESD
396   //    TODO 2010-07-12 at the moment there is no matching or merging of TPC and TRD tracks
397   // 5) Add Trigger Detectors 
398   //    VZERO, ZDC
399
400   // 1) first read MC information (if present)
401   std::map<int,int> mcLabelsTPC;
402   std::map<int,int> mcLabelsITS;
403
404   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrackMC|kAliHLTDataOriginTPC);
405        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
406
407     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
408
409     AliHLTTrackMCData* dataPtr = reinterpret_cast<AliHLTTrackMCData*>( pBlock->fPtr );
410     if (sizeof(AliHLTTrackMCData)+dataPtr->fCount*sizeof(AliHLTTrackMCLabel)==pBlock->fSize) {
411       for( unsigned int il=0; il<dataPtr->fCount; il++ ){
412         AliHLTTrackMCLabel &lab = dataPtr->fLabels[il];
413         mcLabelsTPC[lab.fTrackID] = lab.fMCLabel;
414       }
415     } else {
416       HLTWarning("data mismatch in block %s (0x%08x): count %d, size %d -> ignoring track MC information", 
417                  DataType2Text(pBlock->fDataType).c_str(), pBlock->fSpecification, 
418                  dataPtr->fCount, pBlock->fSize);
419     }
420   }
421  
422   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrackMC|kAliHLTDataOriginITS);
423        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
424
425     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
426
427     AliHLTTrackMCData* dataPtr = reinterpret_cast<AliHLTTrackMCData*>( pBlock->fPtr );
428     if (sizeof(AliHLTTrackMCData)+dataPtr->fCount*sizeof(AliHLTTrackMCLabel)==pBlock->fSize) {
429       for( unsigned int il=0; il<dataPtr->fCount; il++ ){
430         AliHLTTrackMCLabel &lab = dataPtr->fLabels[il];
431         mcLabelsITS[lab.fTrackID] = lab.fMCLabel;
432       }
433     } else {
434       HLTWarning("data mismatch in block %s (0x%08x): count %d, size %d -> ignoring track MC information", 
435                  DataType2Text(pBlock->fDataType).c_str(), pBlock->fSpecification, 
436                  dataPtr->fCount, pBlock->fSize);
437     }
438   }
439
440
441   // read dEdx information (if present)
442   // TODO 2010-07-12 this needs to be verified
443
444   AliHLTFloat32_t *dEdxTPC = 0; 
445   Int_t ndEdxTPC = 0;
446   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypedEdx|kAliHLTDataOriginTPC);
447        pBlock!=NULL; pBlock=NULL/*GetNextInputBlock() there is only one block*/) {
448     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
449     dEdxTPC = reinterpret_cast<AliHLTFloat32_t*>( pBlock->fPtr );
450     ndEdxTPC = pBlock->fSize / (3*sizeof(AliHLTFloat32_t));
451   }
452
453   // 2) convert the TPC tracks to ESD tracks
454   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrack|kAliHLTDataOriginTPC);
455        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
456     if (pInputESD && pInputESD->GetNumberOfTracks()>0) {
457       HLTWarning("Tracks array already filled from the input esd block, additional filling from TPC tracks block might cause inconsistent content");
458     }
459     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
460     vector<AliHLTGlobalBarrelTrack> tracks;
461     if ((iResult=AliHLTGlobalBarrelTrack::ConvertTrackDataArray(reinterpret_cast<const AliHLTTracksData*>(pBlock->fPtr), pBlock->fSize, tracks))>=0) {
462       for (vector<AliHLTGlobalBarrelTrack>::iterator element=tracks.begin();
463            element!=tracks.end(); element++) {
464         Float_t points[4] = {
465           static_cast<Float_t>(element->GetX()),
466           static_cast<Float_t>(element->GetY()),
467           static_cast<Float_t>(element->GetLastPointX()),
468           static_cast<Float_t>(element->GetLastPointY())
469         };
470
471         Int_t mcLabel = -1;
472         if( mcLabelsTPC.find(element->TrackID())!=mcLabelsTPC.end() )
473           mcLabel = mcLabelsTPC[element->TrackID()];
474         element->SetLabel( mcLabel );
475
476         AliESDtrack iotrack;
477
478         // for the moment, the number of clusters are not set when processing the
479         // kTPCin update, only at kTPCout
480         // there ar emainly three parameters updated for kTPCout
481         //   number of clusters
482         //   chi2
483         //   pid signal
484         // The first one can be updated already at that stage here, while the two others
485         // eventually require to update from the ITS tracks before. The exact scheme
486         // needs to be checked
487         iotrack.SetID( element->TrackID() );
488
489         // 2.1 set kTPCout
490         // TODO 2010-07-12 disabled for the moment because of bug
491         // https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?69875
492         // the propagation does not work, there is an offset in z
493         // propagate to last cluster and update parameters with flag kTPCout
494         // Note: updating with flag kITSout further down will overwrite the outer
495         // parameter again so this can be done only for ITS standalone tracks, meaning
496         // tracks in the ITS not associated with any TPC track
497         // HLT does not provide such standalone tracking
498         {
499           AliHLTGlobalBarrelTrack outPar(*element);       
500           //outPar.AliExternalTrackParam::PropagateTo( element->GetLastPointX(), fSolenoidBz );
501           const Int_t N=10; // number of steps.
502           const Float_t xRange = element->GetLastPointX() - element->GetX();
503           const Float_t xStep = xRange / N ;
504           for(int i = 1; i <= N; ++i) {
505             if(!outPar.AliExternalTrackParam::PropagateTo(element->GetX() + xStep * i, fSolenoidBz)) break;
506           }
507           outPar.SetLabel(element->GetLabel());
508           iotrack.UpdateTrackParams(&outPar,AliESDtrack::kTPCout);
509         }
510         // 2.2 TPC tracking estimates parameters at first cluster
511         iotrack.UpdateTrackParams(&(*element),AliESDtrack::kTPCin);
512
513         // 2.3 use the same parameters also for kTPCrefit, there is no proper refit in HLT
514         // maybe this can be done later, however also the inner parameter is changed which
515         // is used as a reference point in the display. That point should be at the first
516         // TPC cluster
517         iotrack.UpdateTrackParams(&(*element),AliESDtrack::kTPCrefit);
518         iotrack.SetTPCPoints(points);
519         if( element->TrackID()<ndEdxTPC ){
520           AliHLTFloat32_t *val = &(dEdxTPC[3*element->TrackID()]);
521           iotrack.SetTPCsignal( val[0], val[1], (UChar_t) val[2] ); 
522           //AliTPCseed s;
523           //s.Set( element->GetX(), element->GetAlpha(),
524           //element->GetParameter(), element->GetCovariance() );
525           //s.SetdEdx( val[0] );
526           //s.CookPID();
527           //iotrack.SetTPCpid(s.TPCrPIDs() );
528         } else {
529           if( dEdxTPC ) HLTWarning("Wrong number of dEdx TPC labels");
530         }
531         iotrack.SetLabel(mcLabel);
532         pESD->AddTrack(&iotrack);
533         if (fVerbosity>0) element->Print();
534       }
535       HLTInfo("converted %d track(s) to AliESDtrack and added to ESD", tracks.size());
536       iAddedDataBlocks++;
537     } else if (iResult<0) {
538       HLTError("can not extract tracks from data block of type %s (specification %08x) of size %d: error %d", 
539                DataType2Text(pBlock->fDataType).c_str(), pBlock->fSpecification, pBlock->fSize, iResult);
540     }
541   }
542
543
544   // Get ITS SPD vertex
545   for( const AliHLTComponentBlockData *i= GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeESDVertex|kAliHLTDataOriginITS); i!=NULL; i=GetNextInputBlock() ){
546     fBenchmark.AddInput(i->fSize);
547   }
548
549   for ( const TObject *iter = GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeESDVertex|kAliHLTDataOriginITS); iter != NULL; iter = GetNextInputObject() ) {
550     AliESDVertex *vtx = dynamic_cast<AliESDVertex*>(const_cast<TObject*>( iter ) );
551     pESD->SetPrimaryVertexSPD( vtx );
552   }
553
554   // 3.1. now update ESD tracks with the ITSOut info
555   // updating track parameters with flag kITSout will overwrite parameter set above with flag kTPCout
556   // TODO 2010-07-12 there are some issues with this updating sequence, for the moment update with
557   // flag kITSout is disabled, would require
558   // a) to update kTPCout after kITSout
559   // b) update only for ITS standalone tracks. The HLT ITS tracker does not provide standalone
560   //    tracking, every track is related to a TPC track
561   // Furthermore there seems to be a bug as the data blocks describe track parameters around the
562   // vertex, not at the outer ITS
563   // bug https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?69872
564   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrack|kAliHLTDataOriginITSOut);
565        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
566     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
567     vector<AliHLTGlobalBarrelTrack> tracks;
568     if ((iResult=AliHLTGlobalBarrelTrack::ConvertTrackDataArray(reinterpret_cast<const AliHLTTracksData*>(pBlock->fPtr), pBlock->fSize, tracks))>0) {
569       for (vector<AliHLTGlobalBarrelTrack>::iterator element=tracks.begin();
570            element!=tracks.end(); element++) {
571         int tpcID=element->TrackID();
572         // the ITS tracker assigns the TPC track used as seed for a certain track to
573         // the trackID
574         if( tpcID<0 || tpcID>=pESD->GetNumberOfTracks()) continue;
575         AliESDtrack *tESD = pESD->GetTrack( tpcID );
576         element->SetLabel(tESD->GetLabel());
577         // 2010-07-12 disabled, see above, bugfix https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?69872
578         //if( tESD ) tESD->UpdateTrackParams( &(*element), AliESDtrack::kITSout );
579       }
580     }
581   }
582
583   // 3.2. now update ESD tracks with the ITS info
584   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrack|kAliHLTDataOriginITS);
585        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
586     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
587     vector<AliHLTGlobalBarrelTrack> tracks;
588     if ((iResult=AliHLTGlobalBarrelTrack::ConvertTrackDataArray(reinterpret_cast<const AliHLTTracksData*>(pBlock->fPtr), pBlock->fSize, tracks))>0) {
589       for (vector<AliHLTGlobalBarrelTrack>::iterator element=tracks.begin();
590            element!=tracks.end(); element++) {
591         int tpcID=element->TrackID();
592         // the ITS tracker assigns the TPC track used as seed for a certain track to
593         // the trackID
594         if( tpcID<0 || tpcID>=pESD->GetNumberOfTracks()) continue;
595         Int_t mcLabel = -1;
596         if( mcLabelsITS.find(element->TrackID())!=mcLabelsITS.end() )
597           mcLabel = mcLabelsITS[element->TrackID()];
598         AliESDtrack *tESD = pESD->GetTrack( tpcID );
599         if (!tESD) continue;
600         // the labels for the TPC and ITS tracking params can be different, e.g.
601         // there can be a decay. The ITS label should then be the better one, the
602         // TPC label is saved in a member of AliESDtrack
603         if (mcLabel>=0) {
604           // upadte only if the ITS label is available, otherwise keep TPC label
605           element->SetLabel( mcLabel );
606         } else {
607           // bugfix https://savannah.cern.ch/bugs/?69713
608           element->SetLabel( tESD->GetLabel() );          
609         }
610         tESD->UpdateTrackParams( &(*element), AliESDtrack::kITSin );
611
612         // TODO: add a proper refit
613         //tESD->UpdateTrackParams( &(*element), AliESDtrack::kTPCrefit );
614       }
615     }
616   }
617
618   // update with  vertices and vertex-fitted tracks
619   // output of the GlobalVertexerComponent
620   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeGlobalVertexer);
621        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
622     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);   
623     AliHLTGlobalVertexerComponent::FillESD( pESD, reinterpret_cast<AliHLTGlobalVertexerComponent::AliHLTGlobalVertexerData* >(pBlock->fPtr) );
624   }
625
626   // update with  vertices and vertex-fitted tracks
627   // output of PrimaryVertexer and V0Finder components
628   TObject* pBase = (TObject*)GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeKFVertex | kAliHLTDataOriginOut);
629   if (pBase) {
630     AliKFVertex* kfVertex = dynamic_cast<AliKFVertex *>(pBase);
631     if (kfVertex) {
632       const AliHLTComponentBlockData* pP = GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypePrimaryFinder | kAliHLTDataOriginOut);
633       if (pP && pP->fSize && pP->fPtr) {
634         const AliHLTComponentBlockData* pV0 = GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeV0Finder | kAliHLTDataOriginOut);
635         if (pV0 && pV0->fPtr && pInputESD && pInputESD->GetNumberOfV0s()>0) {
636           const int* v0s = static_cast<const int*>(pV0->fPtr);
637           HLTWarning("V0 array already filled from the input esd block, additional filling from V0 block of %d entries might cause inconsistent content", v0s[0]);
638         }
639         AliHLTVertexFinderBase::FillESD(pESD, kfVertex, pP->fPtr, pV0?pV0->fPtr:NULL);
640       } else
641         HLTWarning("Problem with primary finder's data block");
642     } else {
643       HLTWarning("primary vertex block of wrong type, expecting AliKFVertex instead of %s", pBase->GetName());
644     }
645   } else {
646     // throw an error if there is a V0 data block which can not be handled without
647     // the AliKFVertex object
648     if (GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeV0Finder | kAliHLTDataOriginOut)!=NULL) {
649       ALIHLTERRORGUARD(1, "missing AliKFVertex object ignoring V0 data block of type %s",
650                        DataType2Text(kAliHLTDataTypeV0Finder|kAliHLTDataOriginOut).c_str());
651     }
652   }
653
654   // Fill DCA parameters for TPC tracks
655   // TODO 2010-07-12 this propagates also the TPC inner param to beamline
656   // sounds not very reasonable
657   // https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?69873
658   for (int i=0; i<pESD->GetNumberOfTracks(); i++) {
659     if (!pESD->GetTrack(i) || 
660         !pESD->GetTrack(i)->GetTPCInnerParam() ) continue;
661     pESD->GetTrack(i)->RelateToVertexTPC(pESD->GetPrimaryVertexTracks(), fSolenoidBz, 1000 );    
662   }
663
664   // loop over all tracks and set the TPC refit flag by updating with the
665   // original TPC inner parameter if not yet set
666   // TODO: replace this by a proper refit
667   // code is comented for the moment as it does not fully solve the problems with
668   // the display
669   // - would set the main parameters to the TPC inner wall again, or
670   // - changes the inner param if the parameters are propagated, so we loose the track
671   //   reference point for the display
672   // with the current sequence we have the latter case as the DCA operations above
673   // change the TPC inner parameters
674   /*
675   for (int i=0; i<pESD->GetNumberOfTracks(); i++) {
676     if (!pESD->GetTrack(i) || 
677         !pESD->GetTrack(i)->GetTPCInnerParam() ||
678         pESD->GetTrack(i)->IsOn(AliESDtrack::kTPCrefit)) continue;
679     AliESDtrack* tESD=pESD->GetTrack(i);
680     AliHLTGlobalBarrelTrack inner(*tESD->GetTPCInnerParam());
681     inner.SetLabel(tESD->GetLabel());
682     tESD->UpdateTrackParams(&inner, AliESDtrack::kTPCrefit);
683   }
684   */
685
686   // 4. convert the HLT TRD tracks to ESD tracks                        
687   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrack | kAliHLTDataOriginTRD);
688        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
689     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
690     vector<AliHLTGlobalBarrelTrack> tracks;
691     if ((iResult=AliHLTGlobalBarrelTrack::ConvertTrackDataArray(reinterpret_cast<const AliHLTTracksData*>(pBlock->fPtr), pBlock->fSize, tracks))>0) {
692       for (vector<AliHLTGlobalBarrelTrack>::iterator element=tracks.begin();
693            element!=tracks.end(); element++) {
694         
695         Double_t TRDpid[AliPID::kSPECIES], eProb(0.2), restProb((1-eProb)/(AliPID::kSPECIES-1)); //eprob(element->GetTRDpid...);
696         for(Int_t i=0; i<AliPID::kSPECIES; i++){
697           switch(i){
698           case AliPID::kElectron: TRDpid[AliPID::kElectron]=eProb; break;
699           default: TRDpid[i]=restProb; break;
700           }
701         }
702         
703         AliESDtrack iotrack;
704         iotrack.UpdateTrackParams(&(*element),AliESDtrack::kTRDout);
705         iotrack.SetStatus(AliESDtrack::kTRDin);
706         iotrack.SetTRDpid(TRDpid);
707         
708         pESD->AddTrack(&iotrack);
709         if (fVerbosity>0) element->Print();
710       }
711       HLTInfo("converted %d track(s) to AliESDtrack and added to ESD", tracks.size());
712       iAddedDataBlocks++;
713     } else if (iResult<0) {
714       HLTError("can not extract tracks from data block of type %s (specification %08x) of size %d: error %d", 
715                DataType2Text(pBlock->fDataType).c_str(), pBlock->fSpecification, pBlock->fSize, iResult);
716     }
717   }
718   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeCaloCluster | kAliHLTDataOriginAny); pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) 
719     {
720       fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
721       AliHLTCaloClusterHeaderStruct *caloClusterHeaderPtr = reinterpret_cast<AliHLTCaloClusterHeaderStruct*>(pBlock->fPtr);
722
723       HLTDebug("%d HLT clusters from spec: 0x%X", caloClusterHeaderPtr->fNClusters, pBlock->fSpecification);
724
725       //AliHLTCaloClusterReader reader;
726       //reader.SetMemory(caloClusterHeaderPtr);
727
728       AliHLTESDCaloClusterMaker clusterMaker;
729
730       int nClusters = clusterMaker.FillESD(pESD, caloClusterHeaderPtr);
731      
732       HLTInfo("converted %d cluster(s) to AliESDCaloCluster and added to ESD", nClusters);
733       iAddedDataBlocks++;
734     }
735   
736   // 5) Add Trigger Detectors 
737   //    VZERO, ZDC
738
739   // FIXME: the size of all input blocks can be added in one loop
740   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginVZERO);
741        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
742     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
743   }
744
745   for ( const TObject *pObject = GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginVZERO); 
746         pObject != NULL; pObject = GetNextInputObject() ) {
747     AliESDVZERO *esdVZERO = dynamic_cast<AliESDVZERO*>(const_cast<TObject*>( pObject ) );
748     if (esdVZERO) {
749       pESD->SetVZEROData( esdVZERO );
750       break;
751     } else {
752       ALIHLTERRORGUARD(1, "input object of data type %s is not of class AliESDVZERO",
753                        DataType2Text(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginVZERO).c_str());
754     }
755   }
756
757   // FIXME: the size of all input blocks can be added in one loop
758   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginZDC);
759        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
760     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
761   }
762   for ( const TObject *pObject = GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginZDC); 
763         pObject != NULL; pObject = GetNextInputObject() ) {
764     AliESDZDC *esdZDC = dynamic_cast<AliESDZDC*>(const_cast<TObject*>( pObject ) );
765     if (esdZDC) {
766 #ifndef HAVE_NOT_ALIZDCRECONSTRUCTOR_r43770
767       pESD->SetZDCData( esdZDC );
768 #else
769       ALIHLTERRORGUARD(1, "Processing of ZDC data requires AliRoot r43770m skipping data block of type %s",
770                        DataType2Text(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginZDC).c_str());
771 #endif
772       break;
773     } else {
774       ALIHLTERRORGUARD(1, "input object of data type %s is not of class AliESDZDC",
775                        DataType2Text(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginZDC).c_str());
776     }
777   }
778
779   // Add tracks and clusters from MUON.
780   for( const AliHLTComponentBlockData *i= GetFirstInputBlock(kAliHLTAnyDataType | kAliHLTDataOriginMUON); i!=NULL; i=GetNextInputBlock() ){
781     fBenchmark.AddInput(i->fSize);
782   }
783
784   for (const TObject* obj = GetFirstInputObject(kAliHLTAnyDataType | kAliHLTDataOriginMUON);
785        obj != NULL;
786        obj = GetNextInputObject()
787       )
788   {
789     const TClonesArray* tracklist = NULL;
790     const TClonesArray* clusterlist = NULL;
791     if (obj->IsA() == AliESDEvent::Class())
792     {
793       const AliESDEvent* event = static_cast<const AliESDEvent*>(obj);
794       HLTDebug("Received a MUON ESD with specification: 0x%X", GetSpecification(obj));
795       if (event->GetList() == NULL) continue;
796       tracklist = dynamic_cast<const TClonesArray*>(event->GetList()->FindObject("MuonTracks"));
797       if (tracklist == NULL) continue;
798       clusterlist = dynamic_cast<const TClonesArray*>(event->GetList()->FindObject("MuonClusters"));
799       if (clusterlist == NULL) continue;
800     }
801     else if (obj->IsA() == TClonesArray::Class())
802     {
803       if (!strcmp(obj->GetName(), "MuonTracks")) {
804         tracklist = static_cast<const TClonesArray*>(obj);
805         HLTDebug("Received a MUON TClonesArray of tracks with specification: 0x%X", GetSpecification(obj));
806       } else {
807         clusterlist = static_cast<const TClonesArray*>(obj);
808         HLTDebug("Received a MUON TClonesArray of clusters with specification: 0x%X", GetSpecification(obj));
809       }
810     }
811     else
812     {
813       // Cannot handle this object type.
814       continue;
815     }
816     // copy tracks
817     if (tracklist) {
818       HLTDebug("Received %d MUON tracks.", tracklist->GetEntriesFast());
819       if (tracklist->GetEntriesFast() > 0)
820       {
821         const AliESDMuonTrack* track = dynamic_cast<const AliESDMuonTrack*>(tracklist->UncheckedAt(0));
822         if (track == NULL)
823         {
824           HLTError(Form("%s from MUON does not contain AliESDMuonTrack objects.", obj->ClassName()));
825           continue;
826         }
827       }
828       for (Int_t i = 0; i < tracklist->GetEntriesFast(); ++i)
829       {
830         AliESDMuonTrack* track = pESD->NewMuonTrack();
831         *track = *(static_cast<const AliESDMuonTrack*>(tracklist->UncheckedAt(i)));
832       }
833     }
834     // copy clusters
835     if (clusterlist) {
836       HLTDebug("Received %d MUON clusters.", clusterlist->GetEntriesFast());
837       if (clusterlist->GetEntriesFast() > 0)
838       {
839         const AliESDMuonCluster* cluster = dynamic_cast<const AliESDMuonCluster*>(clusterlist->UncheckedAt(0));
840         if (cluster == NULL)
841         {
842           HLTError(Form("%s from MUON does not contain AliESDMuonCluster objects.", obj->ClassName()));
843           continue;
844         }
845       }
846       for (Int_t i = 0; i < clusterlist->GetEntriesFast(); ++i)
847       {
848         AliESDMuonCluster* cluster = pESD->NewMuonCluster();
849         *cluster = *(static_cast<const AliESDMuonCluster*>(clusterlist->UncheckedAt(i)));
850       }
851     }
852   }
853   
854   if (iAddedDataBlocks>0 && pTree) {
855     pTree->Fill();
856   }
857   
858   if (iResult>=0) iResult=iAddedDataBlocks;
859   return iResult;
860 }