ITS/AliITS.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
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   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
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  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18
  19 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  20 //                                                                           //
  21 //      An overview of the basic philosophy of the ITS code development      //
  22 // and analysis is show in the figure below.                                 //
  23 //Begin_Html                                                                 //
  24 /*
  25 <img src="picts/ITS/ITS_Analysis_schema.gif">
  26 </pre>
  27 <br clear=left>
  28 <font size=+2 color=red>
  29 <p>Roberto Barbera is in charge of the ITS Offline code (1999).
  30 <a href="mailto:roberto.barbera@ct.infn.it">Roberto Barbera</a>.
  31 </font>
  32 <pre>
  33 */
  34 //End_Html
  35 //
  36 //  AliITS. Inner Traking System base class.
  37 //  This class contains the base procedures for the Inner Tracking System
  38 //
  39 //Begin_Html
  40 /*
  41 <img src="picts/ITS/AliITS_Class_Diagram.gif">
  42 </pre>
  43 <br clear=left>
  44 <font size=+2 color=red>
  45 <p>This show the class diagram of the different elements that are part of
  46 the AliITS class.
  47 </font>
  48 <pre>
  49 */
  50 //End_Html
  51 //
  52 // Version: 0
  53 // Written by Rene Brun, Federico Carminati, and Roberto Barbera
  54 //
  55 // Version: 1
  56 // Modified and documented by Bjorn S. Nilsen
  57 // July 11 1999
  58 //
  59 // Version: 2
  60 // Modified and documented by A. Bologna
  61 // October 18 1999
  62 //
  63 // AliITS is the general base class for the ITS. Also see AliDetector for
  64 // futher information.
  65 //
  66 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  67
  68 #include <stdlib.h>
  69 #include <TClonesArray.h>
  70 #include <TFile.h>
  71 #include <TParticle.h>
  72 #include <TString.h>
  73 #include <TTree.h>
  74 #include <TVirtualMC.h>
  75 #include "AliDetector.h"
  76 #include "AliITS.h"
  77 #include "AliITSDetTypeSim.h"
  78 #include "AliITSDDLRawData.h"
  79 #include "AliITSLoader.h"
  80 #include "AliITShit.h"
  81 #include "AliITSmodule.h"
  82 #include "AliITSpListItem.h"
  83 #include "AliITSsimulation.h"
  84 #include "AliITSsimulationFastPoints.h"
  85 #include "AliMC.h"
  86 #include "AliITSDigitizer.h"
  87 #include "AliITSRecPoint.h"
  88 #include "AliITSsegmentationSPD.h"
  89 #include "AliITSsegmentationSDD.h"
  90 #include "AliITSsimulationSDD.h"
  91 #include "AliITSCalibrationSDD.h"
  92 #include "AliITSCalibrationSSD.h"
  93 #include "AliITSsegmentationSSD.h"
  94 #include "AliITSRawStreamSPD.h"
  95 #include "AliITSRawStreamSSD.h"
  96 #include "AliITSRawStreamSDD.h"
  97 #include "AliRawReader.h"
  98 #include "AliRun.h"
  99 #include "AliLog.h"
 100 #include "AliITSInitGeometry.h"
 101 #include "AliITSFOSignalsSPD.h"
 102
 103 ClassImp(AliITS)
 104
 105 //______________________________________________________________________
 106 AliITS::AliITS() : AliDetector(),
 107 fDetTypeSim(0),
 108 fEuclidOut(0),
 109 fOpt("All"),
 110 fIdN(0),
 111 fIdSens(0),
 112 fIdName(0),
 113 fITSmodules(0),
 114 fTiming(kFALSE),
 115 fSimuParam(0),
 116 fModA(0),
 117 fpSDigits(0)
 118 {
 119   // Default initializer for ITS
 120   //      The default constructor of the AliITS class. In addition to
 121   // creating the AliITS class it zeros the variables fIshunt (a member
 122   // of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros the pointers
 123   // fIdSens, and fIdName. The AliDetector default constructor
 124   // is also called.
 125
 126 //    SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 127 //PH    SetMarkerColor(kRed);
 128 }
 129 //______________________________________________________________________
 130 AliITS::AliITS(const Char_t *title):
 131   AliDetector("ITS",title),
 132   fDetTypeSim(0),
 133   fEuclidOut(0),
 134   fOpt("All"),
 135   fIdN(0),
 136   fIdSens(0),
 137   fIdName(0),
 138   fITSmodules(0),
 139   fTiming(kFALSE),
 140   fSimuParam(0),
 141   fModA(0),
 142   fpSDigits(0)
 143 {
 144     //     The standard Constructor for the ITS class.
 145     // It also zeros the variables
 146     // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and zeros
 147     // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the
 148     // ROOT macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The
 149     // variables passes with this constructor, const char *name and *title,
 150     // are used by the constructor of AliDetector class. See AliDetector
 151     // class for a description of these parameters and its constructor
 152     // functions.
 153     // Inputs:
 154     //   Char_t *title  Simulation title for the ITS
 155     // Outputs:
 156     //   none.
 157     // Return:
 158     //   none.
 159
 160     fHits = new TClonesArray("AliITShit",1560); // from AliDetector
 161     if(gAlice->GetMCApp()) gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
 162     //fNhits=0;  //done in AliDetector(name,title)
 163     SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 164     fDetTypeSim   = new AliITSDetTypeSim();
 165     //PH  SetMarkerColor(kRed);
 166     if(!fLoader) MakeLoader(AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
 167     fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 168 }
 169 //______________________________________________________________________
 170 AliITS::AliITS(const char *name, const char *title):
 171   AliDetector(name,title),
 172   fDetTypeSim(0),
 173   fEuclidOut(0),
 174   fOpt("All"),
 175   fIdN(0),
 176   fIdSens(0),
 177   fIdName(0),
 178   fITSmodules(0),
 179   fTiming(kFALSE),
 180   fSimuParam(0),
 181   fModA(0),
 182   fpSDigits(0)
 183 {
 184   //     The standard Constructor for the ITS class.
 185   // It also zeros the variables
 186   // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and zeros
 187   // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the
 188   // ROOT macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The
 189   // variables passes with this constructor, const char *name and *title,
 190   // are used by the constructor of AliDetector class. See AliDetector
 191   // class for a description of these parameters and its constructor
 192   // functions.
 193
 194   fHits = new TClonesArray("AliITShit",1560);
 195   if(gAlice->GetMCApp()) gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
 196   //fNhits=0;  //done in AliDetector(name,title)
 197
 198   SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 199
 200   fDetTypeSim   = new AliITSDetTypeSim();
 201   //PH  SetMarkerColor(kRed);
 202   if(!fLoader) MakeLoader(AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
 203   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 204
 205 }
 206 //______________________________________________________________________
 207 AliITS::~AliITS(){
 208     // Default destructor for ITS.
 209     //     The default destructor of the AliITS class. In addition to deleting
 210     // the AliITS class it deletes the memory pointed to by
 211     // fIdSens, fIdName, fDetTypeSim and it's contents.
 212     // Inputs:
 213     //      none.
 214     // Outputs:
 215     //      none.
 216     // Return:
 217     //      none.
 218
 219     if (fHits) {
 220       fHits->Delete();
 221       delete fHits;
 222       fHits=0;
 223     }
 224     if(fITSmodules) {
 225         this->ClearModules();
 226         delete fITSmodules;
 227         fITSmodules = 0;
 228     }// end if fITSmodules!=0
 229
 230     delete[] fIdName;  // Array of TStrings
 231     delete[] fIdSens;
 232     Int_t size   = AliITSgeomTGeo::GetNModules();
 233     if (fDetTypeSim){
 234       delete fDetTypeSim;
 235       fDetTypeSim = 0;
 236     }
 237     if(fSimuParam){
 238       delete fSimuParam;
 239       fSimuParam=0;
 240     }
 241     if(fModA){
 242       if(size>0){
 243         for(Int_t j=0; j<size; j++){
 244           fModA[j]->Delete();
 245           delete fModA[j];
 246         }
 247       }
 248       delete []fModA;
 249     }
 250     if(fpSDigits){
 251       fpSDigits->Delete();
 252       delete fpSDigits;
 253     }
 254 }
 255 //______________________________________________________________________
 256 AliDigitizer* AliITS::CreateDigitizer(AliRunDigitizer* manager)const{
 257     // Creates the AliITSDigitizer in a standard way for use via AliModule.
 258     // This function can not be included in the .h file because of problems
 259     // with the order of inclusion (recursive).
 260     // Inputs:
 261     //    AliRunDigitizer *manager  The Manger class for Digitization
 262     // Output:
 263     //    none.
 264     // Return:
 265     //    A new AliITSRunDigitizer (cast as a AliDigitizer).
 266
 267      return new AliITSDigitizer(manager);
 268 }
 269 //______________________________________________________________________
 270 void AliITS::Init(){
 271     // Initializer ITS after it has been built
 272     //     This routine initializes the AliITS class. It is intended to be
 273     // called from the Init function in AliITSv?. Besides displaying a banner
 274     // indicating that it has been called it initializes the array fIdSens
 275     // and sets the default segmentation, response, digit and raw cluster
 276     // classes therefore it should be called after a call to CreateGeometry.
 277     // Inputs:
 278     //      none.
 279     // Outputs:
 280     //      none.
 281     // Return:
 282     //      none.
 283     Int_t i;
 284     // Array of TStrings
 285     if(gMC) for(i=0;i<fIdN;i++) fIdSens[i] = gMC->VolId(fIdName[i]);
 286
 287 }
 288 //______________________________________________________________________
 289 void AliITS::SetDefaults(){
 290     // sets the default segmentation, response, digit and raw cluster classes.
 291     // Inputs:
 292     //      none.
 293     // Outputs:
 294     //      none.
 295     // Return:
 296     //      none.
 297     AliInfoClass("AliITS::Setting Defaults");
 298     if(!fDetTypeSim) {
 299      Error("SetDefaults()","fDetTypeSim is 0!");
 300      return;
 301     }
 302
 303     fDetTypeSim->SetDefaults();
 304     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 305
 306 }
 307 //______________________________________________________________________
 308 void AliITS::SetDefaultSimulation(){
 309     // sets the default simulation.
 310     // Inputs:
 311     //      none.
 312     // Outputs:
 313     //      none.
 314     // Return:
 315     //      none.
 316     if(!fDetTypeSim) {
 317      Error("SetDefaultSimulation()","fDetTypeSim is 0!");
 318      return;
 319     }
 320
 321     fDetTypeSim->SetDefaultSimulation();
 322     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 323
 324 }
 325
 326
 327 //______________________________________________________________________
 328 void AliITS::MakeBranch(Option_t* option){
 329     // Creates Tree branches for the ITS.
 330     // Inputs:
 331     //      Option_t *option    String of Tree types S,D, and/or R.
 332     //      const char *file    String of the file name where these branches
 333     //                          are to be stored. If blank then these branches
 334     //                          are written to the same tree as the Hits were
 335     //                          read from.
 336     // Outputs:
 337     //      none.
 338     // Return:
 339     //      none.
 340   if(!fDetTypeSim) {
 341     Error("MakeBranch","fDetTypeSim is 0!");
 342     return;
 343   }
 344
 345   Bool_t cH = (strstr(option,"H")!=0);
 346   Bool_t cS = (strstr(option,"S")!=0);
 347   Bool_t cD = (strstr(option,"D")!=0);
 348
 349   if(cH && (fHits == 0x0)) fHits = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
 350   AliDetector::MakeBranch(option);
 351
 352   if(cS) MakeBranchS(0);
 353   if(cD) MakeBranchD(0);
 354
 355
 356 }
 357 //___________________________________________________________________
 358 void AliITS::MakeBranchS(const char* fl){
 359
 360   // Creates Tree Branch for the ITS summable digits.
 361   // Inputs:
 362   //      cont char *fl  File name where SDigits branch is to be written
 363   //                     to. If blank it write the SDigits to the same
 364   //                     file in which the Hits were found.
 365
 366
 367   if(!fDetTypeSim){
 368     Error("MakeBranchS","fDetTypeSim is 0!");
 369   }
 370   Int_t buffersize = 4000;
 371   char branchname[30];
 372
 373   // only one branch for SDigits.
 374   sprintf(branchname,"%s",GetName());
 375
 376   if(fLoader->TreeS()){
 377     TClonesArray* sdig = (TClonesArray*)fDetTypeSim->GetSDigits();
 378     MakeBranchInTree(fLoader->TreeS(),branchname,&sdig,buffersize,fl);
 379   }
 380 }
 381 //______________________________________________________________________
 382 void AliITS::MakeBranchD(const char* file){
 383
 384   //Make branch for digits
 385   if(!fDetTypeSim) {
 386     Warning("MakeBranchD","fDetTypeSim is 0!");
 387     return;
 388   }
 389   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 390   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 391   MakeBranchInTreeD(fLoader->TreeD(),file);
 392 }
 393
 394 //___________________________________________________________________
 395 void AliITS:: MakeBranchInTreeD(TTree* treeD, const char* file){
 396   // Creates Tree branches for the ITS.
 397
 398   if(!fDetTypeSim){
 399     Error("MakeBranchS","fDetTypeSim is 0!");
 400   }
 401   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 402   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 403
 404   const Char_t *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 405   const Char_t* digclass;
 406   Int_t buffersize = 4000;
 407   Char_t branchname[30];
 408
 409   if(!fDetTypeSim->GetDigits()){
 410     fDetTypeSim->SetDigits(new TObjArray(fgkNTYPES));
 411   }
 412   for(Int_t i=0;i<fgkNTYPES;i++){
 413     digclass = fDetTypeSim->GetDigitClassName(i);
 414     TString classn = digclass;
 415     if(!((fDetTypeSim->GetDigits())->At(i))){
 416       (fDetTypeSim->GetDigits())->AddAt(new TClonesArray(classn.Data(),1000),i);
 417     }
 418     else ResetDigits(i);
 419     if(fgkNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
 420     else sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
 421     TObjArray* dig = DigitsAddress(i);
 422     if(GetDigits() && treeD) AliDetector::MakeBranchInTree(treeD,branchname, &dig,buffersize,file);
 423   }
 424
 425 }
 426 //______________________________________________________________________
 427 void AliITS::SetTreeAddress(){
 428     // Set branch address for the Trees.
 429     // Inputs:
 430     //      none.
 431     // Outputs:
 432     //      none.
 433     // Return:
 434     //      none.
 435
 436   if(!fDetTypeSim) {
 437     Error("SetTreeAddress","fDetTypeSim is 0!");
 438     return;
 439   }
 440
 441   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 442   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 443
 444   TTree *treeS = fLoader->TreeS();
 445   TTree *treeD = fLoader->TreeD();
 446   if (fLoader->TreeH() && (fHits == 0x0)) {
 447       fHits = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
 448   }
 449   AliDetector::SetTreeAddress();
 450
 451   fDetTypeSim->SetTreeAddressS(treeS, (Char_t*)GetName());
 452   fDetTypeSim->SetTreeAddressD(treeD, (Char_t*)GetName());
 453 }
 454 //______________________________________________________________________
 455 void AliITS::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits){
 456     // Add an ITS hit
 457     //     The function to add information to the AliITShit class. See the
 458     // AliITShit class for a full description. This function allocates the
 459     // necessary new space for the hit information and passes the variable
 460     // track, and the pointers *vol and *hits to the AliITShit constructor
 461     // function.
 462     // Inputs:
 463     //      Int_t   track   Track number which produced this hit.
 464     //      Int_t   *vol    Array of Integer Hit information. See AliITShit.h
 465     //      Float_t *hits   Array of Floating Hit information.  see AliITShit.h
 466     // Outputs:
 467     //      none.
 468     // Return:
 469     //      none.
 470   TClonesArray &lhits = *fHits;
 471   new(lhits[fNhits++]) AliITShit(fIshunt,track,vol,hits);
 472 }
 473
 474 //______________________________________________________________________
 475 void AliITS::FillModules(Int_t evnt,Int_t bgrev,Int_t nmodules,
 476                          Option_t *option, const char *filename){
 477   // fill the modules with the sorted by module hits; add hits from
 478   // background if option=Add.
 479
 480   static TTree *trH1;                 //Tree with background hits
 481   static Bool_t first=kTRUE;
 482   static TFile *file;
 483   const char *addBgr = strstr(option,"Add");
 484
 485   evnt = nmodules; // Dummy use of variables to remove warnings
 486   if (addBgr ) {
 487     if(first) {
 488       file=new TFile(filename);
 489     } // end if first
 490     first=kFALSE;
 491     file->cd();
 492     file->ls();
 493     // Get Hits Tree header from file
 494     if(trH1) delete trH1;
 495     trH1=0;
 496
 497     char treeName[20];
 498     sprintf(treeName,"TreeH%d",bgrev);
 499     trH1 = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 500     if (!trH1) {
 501       Error("FillModules","cannot find Hits Tree for event:%d",bgrev);
 502     } // end if !trH1
 503     // Set branch addresses
 504   } // end if addBgr
 505
 506   FillModules(fLoader->TreeH(),0); // fill from this file's tree.
 507
 508   if (addBgr ) {
 509     FillModules(trH1,10000000); // Default mask 10M.
 510     TTree *fAli=fLoader->GetRunLoader()->TreeK();
 511     TFile *fileAli=0;
 512     if (fAli) fileAli =fAli->GetCurrentFile();
 513     fileAli->cd();
 514   } // end if add
 515
 516
 517 }
 518 //______________________________________________________________________
 519 void AliITS::FillModules(TTree *treeH, Int_t mask) {
 520     // fill the modules with the sorted by module hits;
 521     // can be called many times to do a merging
 522     // Inputs:
 523     //      TTree *treeH  The tree containing the hits to be copied into
 524     //                    the modules.
 525     //      Int_t mask    The track number mask to indecate which file
 526     //                    this hits came from.
 527     // Outputs:
 528     //      none.
 529     // Return:
 530     //      none.
 531
 532     if (treeH == 0x0)
 533      {
 534        Error("FillModules","Tree is NULL");
 535      }
 536     Int_t lay,lad,det,index;
 537     AliITShit *itsHit=0;
 538     AliITSmodule *mod=0;
 539     char branchname[20];
 540     sprintf(branchname,"%s",GetName());
 541     TBranch *branch = treeH->GetBranch(branchname);
 542     if (!branch) {
 543         Error("FillModules","%s branch in TreeH not found",branchname);
 544         return;
 545     } // end if !branch
 546     branch->SetAddress(&fHits);
 547     Int_t nTracks =(Int_t) treeH->GetEntries();
 548     Int_t iPrimTrack,h;
 549     for(iPrimTrack=0; iPrimTrack<nTracks; iPrimTrack++){
 550         ResetHits();
 551         Int_t nBytes = treeH->GetEvent(iPrimTrack);
 552         if (nBytes <= 0) continue;
 553         Int_t nHits = fHits->GetEntriesFast();
 554         for(h=0; h<nHits; h++){
 555             itsHit = (AliITShit *)fHits->UncheckedAt(h);
 556             itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
 557             if (GetITSgeom()) {
 558                 index = GetITSgeom()->GetModuleIndex(lay,lad,det);
 559             } else {
 560                 index=det-1; // This should not be used.
 561             } // end if [You must have fITSgeom for this to work!]
 562             mod = GetModule(index);
 563             itsHit->SetTrack(itsHit->GetTrack()+mask); // Set track mask.
 564             mod->AddHit(itsHit,iPrimTrack,h);
 565         } // end loop over hits
 566     } // end loop over tracks
 567 }
 568
 569 //______________________________________________________________________
 570 Bool_t AliITS::InitModules(Int_t size,Int_t &nmodules){
 571     // Initialize the modules array.
 572     // Inputs:
 573     //      Int_t size  Size of array of the number of modules to be
 574     //                  created. If size <=0 then the number of modules
 575     //                  is gotten from AliITSgeom class kept in fITSgeom.
 576     // Outputs:
 577     //      Int_t &nmodules The number of modules existing.
 578     // Return:
 579     //      none.
 580
 581     if(fITSmodules){
 582         fITSmodules->Delete();
 583         delete fITSmodules;
 584     } // end fir fITSmoudles
 585
 586     if(!fDetTypeSim) {
 587       Error("InitModules","fDetTypeSim is null!");
 588       return kFALSE;
 589     }
 590     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 591
 592     Int_t nl,indexMAX,index;
 593
 594     if(size<=0){ // default to using data stored in AliITSgeom
 595         if(fDetTypeSim->GetITSgeom()==0) {
 596             Error("InitModules","fITSgeom not defined");
 597             return kFALSE;
 598         } // end if fITSgeom==0
 599         nl = fDetTypeSim->GetITSgeom()->GetNlayers();
 600         indexMAX = fDetTypeSim->GetITSgeom()->GetIndexMax();
 601         nmodules = indexMAX;
 602         fITSmodules = new TObjArray(indexMAX);
 603         for(index=0;index<indexMAX;index++){
 604             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 605         } // end for index
 606     }else{
 607         fITSmodules = new TObjArray(size);
 608         for(index=0;index<size;index++) {
 609             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 610         } // end for index
 611
 612         nmodules = size;
 613     } // end i size<=0
 614     return kTRUE;
 615 }
 616 //______________________________________________________________________
 617 void AliITS::Hits2SDigits(){
 618     // Standard Hits to summable Digits function.
 619     // Inputs:
 620     //      none.
 621     // Outputs:
 622     //      none.
 623
 624
 625    if(!fDetTypeSim) {
 626      Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is null!");
 627      return;
 628   }
 629
 630   SetDefaults();
 631   fLoader->LoadHits("read");
 632   fLoader->LoadSDigits("recreate");
 633   AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader();
 634   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 635   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 636
 637   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < rl->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
 638         // Do the Hits to Digits operation. Use Standard input values.
 639         // Event number from file, no background hit merging , use size from
 640         // AliITSgeom class, option="All", input from this file only.
 641     rl->GetEvent(iEvent);
 642     if (!fLoader->TreeS()) fLoader->MakeTree("S");
 643     MakeBranch("S");
 644     SetTreeAddress();
 645     HitsToPreDigits(iEvent,0,-1," ",fOpt," ");
 646   } // end for iEvent
 647
 648   fLoader->UnloadHits();
 649   fLoader->UnloadSDigits();
 650
 651 }
 652 //______________________________________________________________________
 653 void AliITS::Hits2Digits(){
 654
 655   //Conversion from hits to digits
 656   if(!fDetTypeSim) {
 657     Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is 0!");
 658     return;
 659   }
 660
 661   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 662   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 663   SetDefaults();
 664
 665   fLoader->LoadHits("read");
 666   fLoader->LoadDigits("recreate");
 667   AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader();
 668   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < rl->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
 669     rl->GetEvent(iEvent);
 670     if (!fLoader->TreeD()) fLoader->MakeTree("D");
 671     MakeBranch("D");
 672     SetTreeAddress();
 673     HitsToDigits(iEvent,0,-1," ",fOpt," ");
 674   }
 675
 676   fLoader->UnloadHits();
 677   fLoader->UnloadDigits();
 678
 679 }
 680
 681 //______________________________________________________________________
 682 void AliITS::HitsToDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
 683                           Option_t *option,Option_t *opt,
 684                           const char *filename){
 685     //   Keep galice.root for signal and name differently the file for
 686     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
 687     // the condition below will disappear when the geom class will be
 688     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
 689     // 7 is the SDD beam test version.
 690     // Inputs:
 691     //      Int_t evnt       Event to be processed.
 692     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
 693     //      Int_t nmodules   Not used.
 694     //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
 695     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
 696     //                       background hits are considered.
 697     //      Test_t *filename File name containing the background hits..
 698     // Outputs:
 699     //      none.
 700     // Return:
 701     //      none.
 702
 703   if(!fDetTypeSim) {
 704     Error("HitsToDigits","fDetTypeSim is null!");
 705     return;
 706   }
 707   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 708   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 709   if(!GetITSgeom()) return; // need transformations to do digitization.
 710   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
 711
 712   const char *all = strstr(opt,"All");
 713   const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
 714                         strstr(opt,"SSD")};
 715   static Bool_t setDef=kTRUE;
 716   if (setDef) SetDefaultSimulation();
 717   setDef=kFALSE;
 718
 719   Int_t nmodules;
 720   InitModules(size,nmodules);
 721   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
 722
 723   // Reset Fast-OR signals for this event
 724   fDetTypeSim->ResetFOSignals();
 725
 726   AliITSsimulation *sim      = 0;
 727   AliITSmodule     *mod      = 0;
 728   Int_t id;
 729   for(Int_t module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
 730     id       = geom->GetModuleType(module);
 731     if (!all && !det[id]) continue;
 732     sim      = (AliITSsimulation*)fDetTypeSim->GetSimulationModel(id);
 733     if (!sim) {
 734       Error("HitsToDigits","The simulation class was not "
 735             "instanciated for module %d type %s!",module,
 736             geom->GetModuleTypeName(module));
 737       exit(1);
 738     } // end if !sim
 739     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
 740     sim->DigitiseModule(mod,module,evNumber);
 741     // fills all branches - wasted disk space
 742     fLoader->TreeD()->Fill();
 743     ResetDigits();
 744   } // end for module
 745
 746   ClearModules();
 747
 748   // Add random noise to FO signals
 749   if (all || det[0]) { // SPD present
 750     fDetTypeSim->ProcessNoiseForFastOr();
 751   }
 752
 753   // Add Fast-OR signals to event (only one object per event)
 754   if (all || det[0]) { // SPD present
 755     fDetTypeSim->WriteFOSignals();
 756   }
 757
 758
 759   fLoader->TreeD()->GetEntries();
 760   fLoader->TreeD()->AutoSave();
 761   // reset tree
 762   fLoader->TreeD()->Reset();
 763 }
 764 //_____________________________________________________________________
 765 void AliITS::Hits2PreDigits(){
 766   // Turn hits into SDigits
 767
 768   if(!fDetTypeSim) {
 769     Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is 0!");
 770     return;
 771   }
 772
 773   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 774   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 775   SetDefaults();
 776
 777   HitsToPreDigits(fLoader->GetRunLoader()->GetEventNumber(),
 778                   0,-1," ",fOpt," ");
 779 }
 780
 781 //______________________________________________________________________
 782 void AliITS::HitsToPreDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
 783                              Option_t *option,Option_t *opt,
 784                              const char *filename){
 785     //   Keep galice.root for signal and name differently the file for
 786     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
 787     // the condition below will disappear when the geom class will be
 788     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
 789     // 7 is the SDD beam test version.
 790     // Inputs:
 791     //      Int_t evnt       Event to be processed.
 792     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
 793     //      Int_t nmodules   Not used.
 794     //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
 795     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
 796     //                       background hits are considered.
 797     //      Test_t *filename File name containing the background hits..
 798     // Outputs:
 799     //      none.
 800     // Return:
 801     //      none.
 802
 803
 804   if(!fDetTypeSim) {
 805     Error("HitsToPreDigits","fDetTypeSim is null!");
 806     return;
 807   }
 808   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 809   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 810
 811   if(!GetITSgeom()){
 812     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
 813     return; // need transformations to do digitization.
 814   }
 815   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
 816
 817   const char *all = strstr(opt,"All");
 818   const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
 819                         strstr(opt,"SSD")};
 820   static Bool_t setDef=kTRUE;
 821   if (setDef) SetDefaultSimulation();
 822   setDef=kFALSE;
 823
 824   Int_t nmodules;
 825   InitModules(size,nmodules);
 826   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
 827
 828
 829   AliITSsimulation *sim      = 0;
 830   AliITSmodule     *mod      = 0;
 831   Int_t id,module;
 832   for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
 833     id       = geom->GetModuleType(module);
 834     if (!all && !det[id]) continue;
 835     sim      = (AliITSsimulation*)GetSimulationModel(id);
 836     if (!sim) {
 837       Error("HitsToPreDigits","The simulation class was not "
 838             "instanciated for module %d type %s!",module,
 839             geom->GetModuleTypeName(module));
 840       exit(1);
 841     } // end if !sim
 842     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
 843     sim->SDigitiseModule(mod,module,evNumber);
 844     // fills all branches - wasted disk space
 845     fLoader->TreeS()->Fill();
 846     fDetTypeSim->ResetSDigits();
 847   } // end for module
 848
 849   ClearModules();
 850
 851
 852   fLoader->TreeS()->GetEntries();
 853   fLoader->TreeS()->AutoSave();
 854   fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
 855   // reset tree
 856   fLoader->TreeS()->Reset();
 857 }
 858
 859 //_____________________________________________________________________
 860 void AliITS::HitsToFastRecPoints(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
 861                                   Option_t *opt0,Option_t *opt1,
 862                                  const char *flnm){
 863     // keep galice.root for signal and name differently the file for
 864     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
 865     // the condition below will disappear when the geom class will be
 866     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
 867     // Inputs:
 868     //      Int_t evnt       Event to be processed.
 869     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
 870     //      Int_t size       Size used by InitModules. See InitModules.
 871     //      Option_t *opt0   Option passed to FillModules. See FillModules.
 872     //      Option_t *opt1   String indicating if merging hits or not. To
 873     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
 874     //                       background hits are considered.
 875     //      Test_t *flnm     File name containing the background hits..
 876     // Outputs:
 877     //      none.
 878     // Return:
 879     //      none.
 880
 881
 882
 883   if(!GetITSgeom()){
 884     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
 885     return; // need transformations to do digitization.
 886   }
 887   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
 888
 889   AliITSLoader *pITSloader = (AliITSLoader*)fLoader;
 890
 891   const char *all = strstr(opt1,"All");
 892   const char *det[3] ={strstr(opt1,"SPD"),strstr(opt1,"SDD"),
 893                        strstr(opt1,"SSD")};
 894   Int_t nmodules;
 895   InitModules(size,nmodules);
 896   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,opt0,flnm);
 897
 898   AliITSsimulation *sim      = 0;
 899   AliITSmodule     *mod      = 0;
 900   Int_t id,module;
 901
 902   TTree *lTR = pITSloader->TreeR();
 903   if(!lTR) {
 904     pITSloader->MakeTree("R");
 905     lTR = pITSloader->TreeR();
 906   }
 907
 908   TClonesArray* ptarray = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
 909   TBranch* branch = (TBranch*)lTR->Branch("ITSRecPointsF",&ptarray);
 910   branch->SetAddress(&ptarray);
 911   //m.b. : this change is nothing but a nice way to make sure
 912   //the CPU goes up !
 913   for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
 914     id       = geom->GetModuleType(module);
 915     if (!all && !det[id]) continue;
 916     sim      = (AliITSsimulation*)GetSimulationModel(id);
 917     if (!sim) {
 918       Error("HitsToFastPoints","The simulation class was not "
 919             "instantiated for module %d type %s!",module,
 920             geom->GetModuleTypeName(module));
 921       exit(1);
 922     } // end if !sim
 923     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
 924     sim->CreateFastRecPoints(mod,module,gRandom,ptarray);
 925     lTR->Fill();
 926     ptarray->Clear();
 927   } // end for module
 928
 929   ClearModules();
 930   fLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 931   delete ptarray;
 932 }
 933 //_____________________________________________________________________
 934 Int_t AliITS::Hits2Clusters(TTree *hTree, TTree *cTree) {
 935   //------------------------------------------------------------
 936   // This function creates ITS clusters
 937   //------------------------------------------------------------
 938   if(!GetITSgeom()){
 939     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
 940     return 1; // need transformations to do digitization.
 941   }
 942   AliITSgeom *geom=GetITSgeom();
 943   Int_t mmax=geom->GetIndexMax();
 944
 945   InitModules(-1,mmax);
 946   FillModules(hTree,0);
 947
 948   TClonesArray *points = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
 949   TBranch *branch=cTree->GetBranch("ITSRecPoints");
 950   if (!branch) cTree->Branch("ITSRecPoints",&points);
 951   else branch->SetAddress(&points);
 952
 953   AliITSsimulationFastPoints sim;
 954   Int_t ncl=0;
 955   for (Int_t m=0; m<mmax; m++) {
 956     AliITSmodule *mod=GetModule(m);
 957     sim.CreateFastRecPoints(mod,m,gRandom,points);
 958     ncl+=points->GetEntriesFast();
 959     cTree->Fill();
 960     points->Clear();
 961   }
 962
 963   AliDebug(1,Form("Number of found fast clusters : %d",ncl));
 964
 965   //cTree->Write();
 966
 967   delete points;
 968   return 0;
 969 }
 970
 971 //_____________________________________________________________________
 972 void AliITS::CheckLabels(Int_t lab[3]) const {
 973   //------------------------------------------------------------
 974   // Tries to find mother's labels
 975   //------------------------------------------------------------
 976
 977   if(lab[0]<0 && lab[1]<0 && lab[2]<0) return; // In case of no labels just exit
 978
 979   Int_t ntracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
 980   for (Int_t i=0;i<3;i++){
 981     Int_t label = lab[i];
 982     if (label>=0 && label<ntracks) {
 983       TParticle *part=(TParticle*)gAlice->GetMCApp()->Particle(label);
 984       if (part->P() < 0.005) {
 985         Int_t m=part->GetFirstMother();
 986         if (m<0) {
 987           continue;
 988         }
 989         if (part->GetStatusCode()>0) {
 990           continue;
 991         }
 992         lab[i]=m;
 993       }
 994     }
 995   }
 996
 997 }
 998
 999 //______________________________________________________________________
1000 void AliITS::SDigitsToDigits(Option_t *opt){
1001   // Standard Summable digits to Digits function.
1002   // Inputs:
1003   //      none.
1004   // Outputs:
1005   //      none.
1006   if (!fDetTypeSim) {
1007     AliError("fDetTypeSim is 0!");
1008     return;
1009   }
1010
1011   const char *all = strstr(opt,"All");
1012   const char *det[3] ={strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
1013                        strstr(opt,"SSD")};
1014
1015   // Reset Fast-OR signals for this event
1016   fDetTypeSim->ResetFOSignals();
1017
1018   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
1019   SetDefaults();
1020   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
1021   fDetTypeSim->SDigitsToDigits(opt,(Char_t*)GetName());
1022
1023   // Add random noise to FO signals
1024   if (all || det[0]) { // SPD present
1025     fDetTypeSim->ProcessNoiseForFastOr();
1026   }
1027   // Add Fast-OR signals to event (only one object per event)
1028   if (all || det[0]) { // SPD present
1029     fDetTypeSim->WriteFOSignals();
1030   }
1031 }
1032
1033 //______________________________________________________________________
1034 void AliITS::ResetDigits(){
1035     // Reset number of digits and the digits array for the ITS detector.
1036     // Inputs:
1037     //      none.
1038     // Outputs:
1039     //      none.
1040     if(!fDetTypeSim) {
1041       Error("ResetDigits","fDetTypeSim is 0!");
1042       return;
1043     }
1044
1045     fDetTypeSim->ResetDigits();
1046
1047
1048 }
1049 //______________________________________________________________________
1050 void AliITS::ResetDigits(Int_t branch){
1051     // Reset number of digits and the digits array for this branch.
1052     // Inputs:
1053     //      none.
1054     // Outputs:
1055     //      none.
1056
1057     if(!fDetTypeSim) {
1058       Error("ResetDigits","fDetTypeSim is 0!");
1059       return;
1060     }
1061
1062     fDetTypeSim->ResetDigits(branch);
1063
1064 }
1065 //______________________________________________________________________
1066 void AliITS::AddSumDigit(AliITSpListItem &sdig){
1067     // Adds the a module full of summable digits to the summable digits tree.
1068     // Inputs:
1069     //      AliITSpListItem &sdig   SDigit to be added to SDigits tree.
1070     // Outputs:
1071     //      none.
1072     // Return:
1073     //      none.
1074
1075     if(!fDetTypeSim) {
1076       Error("AddSumDigit","fDetTypeSim is 0!");
1077       return;
1078     }
1079     fDetTypeSim->AddSumDigit(sdig);
1080
1081 }
1082 //______________________________________________________________________
1083 void AliITS::AddSimDigit(Int_t branch, AliITSdigit *d){
1084     //    Add a simulated digit.
1085     // Inputs:
1086     //      Int_t id        Detector type number.
1087     //      AliITSdigit *d  Digit to be added to the Digits Tree. See
1088     //                      AliITSdigit.h
1089     // Outputs:
1090     //      none.
1091     // Return:
1092     //      none.
1093
1094     if(!fDetTypeSim) {
1095       Error("AddSimDigit","fDetTypeSim is 0!");
1096       return;
1097     }
1098     fDetTypeSim->AddSimDigit(branch,d);
1099
1100 }
1101 //______________________________________________________________________
1102 void AliITS::AddSimDigit(Int_t branch,Float_t phys,Int_t *digits,Int_t *tracks,
1103                          Int_t *hits,Float_t *charges, Int_t sigexpanded){
1104   //   Add a simulated digit to the list.
1105   // Inputs:
1106   //      Int_t id        Detector type number.
1107   //      Float_t phys    Physics indicator. See AliITSdigits.h
1108   //      Int_t *digits   Integer array containing the digits info. See
1109   //                      AliITSdigit.h
1110   //      Int_t *tracks   Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()]
1111   //                      containing the track numbers that contributed to
1112   //                      this digit.
1113   //      Int_t *hits     Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()]
1114   //                      containing the hit numbers, from AliITSmodule, that
1115   //                      contributed to this digit.
1116   //      Float_t *charge Floating point array of the signals contributed
1117   //                      to this digit by each track.
1118   // Outputs:
1119   //      none.
1120   // Return:
1121   //      none.
1122
1123     if(!fDetTypeSim) {
1124       Error("AddSimDigit","fDetTypeSim is 0!");
1125       return;
1126     }
1127     fDetTypeSim->AddSimDigit(branch,phys,digits,tracks,hits,charges,sigexpanded);
1128
1129 }
1130 //______________________________________________________________________
1131 void AliITS::Digits2Raw(){
1132     // convert digits of the current event to raw data
1133
1134   if(!fDetTypeSim) {
1135     Error("Digits2Raw","fDetTypeSim is 0!");
1136     return;
1137   }
1138   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
1139   SetDefaults();
1140   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
1141   fDetTypeSim->GetLoader()->LoadDigits();
1142   TTree* digits = fDetTypeSim->GetLoader()->TreeD();
1143   if (!digits) {
1144       Error("Digits2Raw", "no digits tree");
1145       return;
1146   }
1147   fDetTypeSim->SetTreeAddressD(digits,(Char_t*)GetName());
1148
1149    // Get the FO signals for this event
1150   AliITSFOSignalsSPD* foSignals = NULL;
1151   AliRunLoader* runLoader = AliRunLoader::Instance();
1152   AliITSLoader* itsLoader = (AliITSLoader*) runLoader->GetLoader("ITSLoader");
1153   if (!itsLoader) {
1154     AliError("ITS loader is NULL.");
1155   }
1156    else {
1157       if(!itsLoader->TreeD()) AliError("   !!! No TreeD available !!!");
1158       foSignals = (AliITSFOSignalsSPD*)itsLoader->TreeD()->GetUserInfo()->FindObject("AliITSFOSignalsSPD");
1159       if(!foSignals) AliError("FO signals not retrieved");
1160      }
1161
1162   Bool_t deleteFOsignalsLater = kFALSE;
1163   if (!foSignals) {
1164     AliError("FO signals not available. No FO bits will be written.");
1165     foSignals = new AliITSFOSignalsSPD(); // make a temporary dummy signals object
1166     deleteFOsignalsLater = kTRUE;
1167   }
1168
1169
1170   AliITSDDLModuleMapSDD* ddlsdd=fDetTypeSim->GetDDLModuleMapSDD();
1171   Char_t rawSDD=fDetTypeSim->GetSimuParam()->GetSDDRawDataFormat();
1172   AliITSDDLRawData rawWriter;
1173
1174   rawWriter.SetSDDRawFormat(rawSDD);
1175   //Verbose level
1176   // 0: Silent
1177   // 1: cout messages
1178   // 2: txt files with digits
1179   //BE CAREFUL, verbose level 2 MUST be used only for debugging and
1180   //it is highly suggested to use this mode only for debugging digits files
1181   //reasonably small, because otherwise the size of the txt files can reach
1182   //quickly several MB wasting time and disk space.
1183   rawWriter.SetVerbose(0);
1184
1185   //SILICON PIXEL DETECTOR
1186   AliDebug(1,"Formatting raw data for SPD");
1187   rawWriter.RawDataSPD(digits->GetBranch("ITSDigitsSPD"),foSignals);
1188   if(deleteFOsignalsLater) delete foSignals;
1189
1190   //SILICON DRIFT DETECTOR
1191   AliDebug(1,Form("Formatting raw data for SDD - Format code =%d",rawSDD));
1192   rawWriter.RawDataSDD(digits->GetBranch("ITSDigitsSDD"),ddlsdd);
1193
1194   //SILICON STRIP DETECTOR
1195   AliDebug(1,"Formatting raw data for SSD");
1196   rawWriter.RawDataSSD(digits->GetBranch("ITSDigitsSSD"));
1197
1198   fLoader->UnloadDigits();
1199 }
1200 //______________________________________________________________________
1201 AliLoader* AliITS::MakeLoader(const char* topfoldername){
1202     //builds ITSgetter (AliLoader type)
1203     //if detector wants to use castomized getter, it must overload this method
1204
1205     AliDebug(1,Form("Creating AliITSLoader. Top folder is %s.",
1206          topfoldername));
1207     fLoader = new AliITSLoader(GetName(),topfoldername);
1208     return fLoader;
1209 }
1210 //______________________________________________________________________
1211 Bool_t AliITS::Raw2SDigits(AliRawReader* rawReader)
1212 {
1213   //
1214   // Converts RAW data to SDigits
1215   //
1216   // Get TreeS
1217   //
1218   Int_t last   = -1;
1219   Int_t size   = AliITSgeomTGeo::GetNModules();
1220   if(!fModA) {
1221     fModA = new TClonesArray*[size];
1222     for (Int_t mod = 0; mod < size; mod++) fModA[mod] = new TClonesArray("AliITSpListItem", 10000);
1223   }
1224   AliLoader* loader =  (AliRunLoader::Instance())->GetLoader("ITSLoader");
1225   if (!loader){
1226     Error("Open","Can not get ITS loader from Run Loader");
1227     return kFALSE;
1228   }
1229
1230   TTree* tree = 0;
1231   tree = loader->TreeS();
1232   if (!tree){
1233     loader->MakeTree("S");
1234     tree = loader->TreeS();
1235   }
1236   //
1237   // Array for SDigits
1238   //
1239   if(!fpSDigits){
1240     fpSDigits = new TClonesArray("AliITSpListItem",10000);
1241   }
1242   TClonesArray& aSDigits = *fpSDigits;
1243   Int_t bufsize = 32000;
1244   tree->Branch("ITS", &fpSDigits, bufsize);
1245   Int_t npx = 0;
1246   //
1247   // SPD
1248   //
1249   AliITSsegmentationSPD* segSPD = (AliITSsegmentationSPD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(0);
1250   if(!segSPD){
1251     AliWarning("Set AliITS defaults");
1252     SetDefaults();
1253     segSPD = (AliITSsegmentationSPD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(0);
1254   }
1255   npx = segSPD->Npx();
1256   Double_t thr, sigma;
1257
1258   AliITSRawStreamSPD inputSPD(rawReader);
1259   while(1){
1260     Bool_t next  = inputSPD.Next();
1261     if (!next) break;
1262
1263     Int_t module = inputSPD.GetModuleID();
1264     Int_t column = inputSPD.GetColumn();
1265     Int_t row    = inputSPD.GetRow();
1266     Int_t index  = npx * column + row;
1267
1268     if (module >= size) continue;
1269
1270     last = (fModA[module])->GetEntries();
1271     TClonesArray& dum = *fModA[module];
1272     fDetTypeSim->GetSimuParam()->SPDThresholds(module,thr,sigma);
1273     thr += 1.;
1274     new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, thr);
1275   }
1276   rawReader->Reset();
1277
1278   //
1279   // SDD
1280   //
1281   AliITSsegmentationSDD* segSDD = (AliITSsegmentationSDD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(1);
1282   npx = segSDD->Npx();
1283   Int_t scalef=AliITSsimulationSDD::ScaleFourier(segSDD);
1284   Int_t firstSDD=AliITSgeomTGeo::GetModuleIndex(3,1,1);
1285   Int_t firstSSD=AliITSgeomTGeo::GetModuleIndex(5,1,1);
1286
1287   AliITSRawStream* inputSDD=AliITSRawStreamSDD::CreateRawStreamSDD(rawReader);
1288   for(Int_t iMod=firstSDD; iMod<firstSSD; iMod++){
1289     AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)fDetTypeSim->GetCalibrationModel(iMod);
1290     Bool_t isZeroSupp=cal->GetZeroSupp();
1291     if(isZeroSupp){
1292       for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD->SetZeroSuppLowThreshold(iMod-firstSDD,iSid,cal->GetZSLowThreshold(iSid));
1293     }else{
1294       for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD->SetZeroSuppLowThreshold(iMod-firstSDD,iSid,0);
1295     }
1296   }
1297
1298   AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap=fDetTypeSim->GetDDLModuleMapSDD();
1299   inputSDD->SetDDLModuleMap(ddlmap);
1300   while(inputSDD->Next()){
1301     if(inputSDD->IsCompletedModule()==kFALSE &&
1302        inputSDD->IsCompletedDDL()==kFALSE){
1303
1304       Int_t module = inputSDD->GetModuleID();
1305       Int_t anode  = inputSDD->GetCoord1()+segSDD->NpzHalf()*inputSDD->GetChannel();
1306       Int_t time   = inputSDD->GetCoord2();
1307       Int_t signal10 = inputSDD->GetSignal();
1308       Int_t index = AliITSpList::GetIndex(anode,time,scalef*npx);
1309
1310       if (module >= size) continue;
1311       last = fModA[module]->GetEntries();
1312       TClonesArray& dum = *fModA[module];
1313       new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, Double_t(signal10));
1314       ((AliITSpListItem*) dum.At(last))->AddSignalAfterElect(module, index, Double_t(signal10));
1315     }
1316   }
1317   delete inputSDD;
1318   rawReader->Reset();
1319
1320   //
1321   // SSD
1322   //
1323   AliITSsegmentationSSD* segSSD = (AliITSsegmentationSSD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(2);
1324   npx = segSSD->Npx();
1325   AliITSRawStreamSSD inputSSD(rawReader);
1326   while(1){
1327     Bool_t next  = inputSSD.Next();
1328     if (!next) break;
1329
1330     Int_t module  = inputSSD.GetModuleID();
1331     if(module<0)AliError(Form("Invalid SSD  module %d \n",module));
1332     if(module<0)continue;
1333     Int_t side    = inputSSD.GetSideFlag();
1334     Int_t strip   = inputSSD.GetStrip();
1335     Int_t signal  = inputSSD.GetSignal();
1336     Int_t index  = npx * side + strip;
1337
1338     if (module >= size) continue;
1339
1340     last = fModA[module]->GetEntries();
1341     TClonesArray& dum = *fModA[module];
1342     new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, Double_t(signal));
1343   }
1344   rawReader->Reset();
1345   AliITSpListItem* sdig = 0;
1346
1347   Int_t firstssd = GetITSgeom()->GetStartDet(kSSD);
1348   Double_t adcToEv = 1.;
1349   for (Int_t mod = 0; mod < size; mod++)
1350     {
1351       if(mod>=firstssd) {
1352         AliITSCalibrationSSD* calssd = (AliITSCalibrationSSD*)fDetTypeSim->GetCalibrationModel(mod);
1353         adcToEv = 1./calssd->GetSSDDEvToADC(1.);
1354       }
1355       Int_t nsdig =  fModA[mod]->GetEntries();
1356       for (Int_t ie = 0; ie < nsdig; ie++) {
1357         sdig = (AliITSpListItem*) (fModA[mod]->At(ie));
1358         Double_t digsig = sdig->GetSignal();
1359         if(mod>=firstssd) digsig*=adcToEv; // for SSD: convert back charge from ADC to electron
1360         new (aSDigits[ie]) AliITSpListItem(-1, -1, mod, sdig->GetIndex(), digsig);
1361         Float_t sig = sdig->GetSignalAfterElect();
1362         if(mod>=firstssd) sig*=adcToEv;
1363         if (sig > 0.) {
1364           sdig = (AliITSpListItem*)aSDigits[ie];
1365           sdig->AddSignalAfterElect(mod, sdig->GetIndex(), Double_t(sig));
1366         }
1367       }
1368
1369       tree->Fill();
1370       aSDigits.Clear();
1371       fModA[mod]->Clear();
1372     }
1373   loader->WriteSDigits("OVERWRITE");
1374   return kTRUE;
1375 }
1376
1377 //______________________________________________________________________
1378 void AliITS::UpdateInternalGeometry(){
1379   //reads new geometry from TGeo
1380 //   AliDebug(1,"Delete ITSgeom and create a new one reading TGeo");
1381
1382   AliITSVersion_t version = (AliITSVersion_t)IsVersion();
1383   Int_t minor = 0;
1384   if(version==kvPPRasymmFMD) minor=2;  // default minor version for this geom.
1385   AliITSInitGeometry initgeom;
1386   AliITSgeom* geom = initgeom.CreateAliITSgeom(version,minor);
1387   SetITSgeom(geom);
1388 }
1389 //______________________________________________________________________
1390 AliTriggerDetector* AliITS::CreateTriggerDetector() const {
1391   // create an AliITSTrigger object (and set trigger conditions as input)
1392   return new AliITSTrigger(fDetTypeSim->GetTriggerConditions());
1393 }