]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - ITS/AliITS.cxx
Make the code compatible with the new AliRun
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITS.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /*
17 $Log$
18 Revision 1.34  2001/02/11 15:51:39  mariana
19 Set protection in MakeBranch
20
21 Revision 1.33  2001/02/10 22:26:39  mariana
22 Move the initialization of the containers for raw clusters in MakeTreeC()
23
24 Revision 1.32  2001/02/08 23:55:31  nilsen
25 Removed fMajor/MinorVersion variables in favor of variables in derived classes.
26 Set arrays char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"} as const.
27
28 Revision 1.31  2001/02/02 23:57:28  nilsen
29 Added include file that are no londer included in AliITSgeom.h
30
31 Revision 1.30  2001/01/30 09:23:13  hristov
32 Streamers removed (R.Brun)
33
34 Revision 1.29  2001/01/26 20:01:09  hristov
35 Major upgrade of AliRoot code
36
37 Revision 1.28  2000/12/18 14:02:00  barbera
38 new version of the ITS tracking to take into account the new TPC track parametrization
39
40 Revision 1.27  2000/12/08 13:49:27  barbera
41 Hidden declaration in a for loop removed to be compliant with HP-UX compiler
42
43 Revision 1.26  2000/11/27 13:12:13  barbera
44 New version containing the files for tracking
45
46 Revision 1.25  2000/11/12 22:38:05  barbera
47 Added header file for the SPD Bari model
48
49 Revision 1.24  2000/10/09 22:18:12  barbera
50 Bug fixes from MAriana to le AliITStest.C run correctly
51
52 Revision 1.23  2000/10/05 20:47:42  nilsen
53 fixed dependencies of include files. Tryed but failed to get a root automaticly
54 generates streamer function to work. Modified SetDefaults.
55
56 Revision 1.9.2.15  2000/10/04 16:56:40  nilsen
57 Needed to include stdlib.h
58
59 =======
60 Revision 1.22  2000/10/04 19:45:52  barbera
61 Corrected by F. Carminati for v3.04
62
63 Revision 1.21  2000/10/02 21:28:08  fca
64 Removal of useless dependecies via forward declarations
65
66 Revision 1.20  2000/10/02 16:31:39  barbera
67 General code clean-up
68
69 Revision 1.9.2.14  2000/10/02 15:43:51  barbera
70 General code clean-up (e.g., printf -> cout)
71
72 Revision 1.19  2000/09/22 12:13:25  nilsen
73 Patches and updates for fixes to this and other routines.
74
75 Revision 1.18  2000/07/12 05:32:20  fca
76 Correcting several syntax problem with static members
77
78 Revision 1.17  2000/07/10 16:07:18  fca
79 Release version of ITS code
80
81 Revision 1.9.2.3  2000/02/02 13:42:09  barbera
82 fixed AliITS.cxx for new AliRun structure. Added ITS hits list to list of hits which will have their track numbers updated
83
84 Revision 1.9.2.2  2000/01/23 03:03:13  nilsen
85 //fixed FillModule. Removed fi(fabs(xl)<dx....
86
87 Revision 1.9.2.1  2000/01/12 19:03:32  nilsen
88 This is the version of the files after the merging done in December 1999.
89 See the ReadMe110100.txt file for details
90
91 Revision 1.9  1999/11/14 14:33:25  fca
92 Correct problems with distructors and pointers, thanks to I.Hrivnacova
93
94 Revision 1.8  1999/09/29 09:24:19  fca
95 Introduction of the Copyright and cvs Log
96
97 */
98
99 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
100 //
101 //      An overview of the basic philosophy of the ITS code development
102 // and analysis is show in the figure below.
103 //Begin_Html
104 /*
105 <img src="picts/ITS/ITS_Analysis_schema.gif">
106 </pre>
107 <br clear=left>
108 <font size=+2 color=red>
109 <p>Roberto Barbera is in charge of the ITS Offline code (1999).
110 <a href="mailto:roberto.barbera@ct.infn.it">Roberto Barbera</a>.
111 </font>
112 <pre>
113 */
114 //End_Html
115 //
116 //  AliITS. Inner Traking System base class.
117 //  This class contains the base procedures for the Inner Tracking System
118 //
119 //Begin_Html
120 /*
121 <img src="picts/ITS/AliITS_Class_Diagram.gif">
122 </pre>
123 <br clear=left>
124 <font size=+2 color=red>
125 <p>This show the class diagram of the different elements that are part of
126 the AliITS class.
127 </font>
128 <pre>
129 */
130 //End_Html
131 //
132 // Version: 0
133 // Written by Rene Brun, Federico Carminati, and Roberto Barbera
134 //
135 // Version: 1
136 // Modified and documented by Bjorn S. Nilsen
137 // July 11 1999
138 //
139 // Version: 2
140 // Modified and documented by A. Bologna
141 // October 18 1999
142 //
143 // AliITS is the general base class for the ITS. Also see AliDetector for
144 // futher information.
145 //
146 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
147 #include <iostream.h>
148 #include <iomanip.h>
149 #include <fstream.h>
150 #include <stdlib.h>
151 #include <TMath.h>
152 #include <TRandom.h>
153 #include <TBranch.h>
154 #include <TVector.h>
155 #include <TClonesArray.h>
156 #include <TROOT.h>
157 #include <TObjectTable.h>
158 #include <TFile.h>
159 #include <TTree.h>
160 #include <TString.h>
161
162
163
164 #include "AliRun.h"
165 #include "AliITS.h"
166 #include "AliITSMap.h"
167 #include "AliITSDetType.h"
168 #include "AliITSClusterFinder.h"
169 //#include "AliITSsimulation.h"
170 #include "AliITSsimulationSPD.h"
171 #include "AliITSsimulationSDD.h"
172 #include "AliITSsimulationSSD.h"
173 #include "AliITSresponse.h"
174 #include "AliITSsegmentationSPD.h"
175 #include "AliITSresponseSPD.h"
176 #include "AliITSresponseSPDbari.h"
177 #include "AliITSsegmentationSDD.h"
178 #include "AliITSresponseSDD.h"
179 #include "AliITSsegmentationSSD.h"
180 #include "AliITSresponseSSD.h"
181 #include "AliITShit.h"
182 #include "AliITSgeom.h"
183 #include "AliITSdigit.h"
184 #include "AliITSmodule.h"
185 #include "AliITSRecPoint.h"
186 #include "AliITSRawCluster.h"
187 #include "AliMC.h"
188 #include "stdlib.h"
189
190 #include "AliITStrack.h"
191 #include "AliITSiotrack.h"
192 #include "AliITStracking.h" 
193 #include "../TPC/AliTPC.h"
194 #include "../TPC/AliTPCParam.h"
195
196
197 ClassImp(AliITS)
198  
199 //_____________________________________________________________________________
200 AliITS::AliITS() : AliDetector() {
201   //
202   // Default initialiser for ITS
203   //     The default constructor of the AliITS class. In addition to
204   // creating the AliITS class it zeros the variables fIshunt (a member
205   // of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros the pointers
206   // fITSpoints, fIdSens, and fIdName. The AliDetector default constructor
207   // is also called.
208   //
209
210
211   fIshunt     = 0;
212   fEuclidOut  = 0;
213
214   fNDetTypes = kNTYPES;
215   fIdN        = 0;
216   fIdName     = 0;
217   fIdSens     = 0;
218   fITSmodules = 0;
219   //
220   fDetTypes   = 0;
221   //
222   fDtype  = 0;
223   fNdtype = 0;
224   fCtype  = 0;
225   fNctype = 0;
226   fRecPoints = 0;
227   fNRecPoints = 0;
228   fTreeC = 0;
229   //
230   fITSgeom=0;
231 }
232
233 //_____________________________________________________________________________
234 AliITS::AliITS(const char *name, const char *title):AliDetector(name,title){
235   //
236   // Default initialiser for ITS
237   //     The constructor of the AliITS class. In addition to creating the
238   // AliITS class, it allocates memory for the TClonesArrays fHits and
239   // fDigits, and for the TObjArray fITSpoints. It also zeros the variables
240   // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros
241   // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the ROOT
242   // macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The variables
243   // passes with this constructor, const char *name and *title, are used by
244   // the constructor of AliDetector class. See AliDetector class for a
245   // description of these parameters and its constructor functions.
246   //
247
248
249   fHits       = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
250   gAlice->AddHitList(fHits);
251
252   fNDetTypes = kNTYPES;
253
254   fNdtype = new Int_t[kNTYPES];
255   fDtype = new TObjArray(kNTYPES);
256
257   fNctype = new Int_t[kNTYPES];
258   fCtype = new TObjArray(kNTYPES);
259
260
261   fRecPoints = 0;
262   fNRecPoints = 0;
263
264   fTreeC = 0;
265
266   fITSmodules = 0; 
267
268   fIshunt     = 0;
269   fEuclidOut  = 0;
270   fIdN        = 0;
271   fIdName     = 0;
272   fIdSens     = 0;
273  
274   fDetTypes = new TObjArray(kNTYPES);  
275
276   Int_t i;
277   for(i=0;i<kNTYPES;i++) {
278     (*fDetTypes)[i]=new AliITSDetType(); 
279     fNdtype[i]=0;
280     fNctype[i]=0;
281    }
282   //
283
284   SetMarkerColor(kRed);
285
286   fITSgeom=0;
287 }
288 //___________________________________________________________________________
289 AliITS::AliITS(AliITS &source){
290   // copy constructor
291   if(this==&source) return;
292   Error("AliITS::Copy constructor",
293         "You are not allowed to make a copy of the AliITS");
294   exit(1);
295 }
296 //____________________________________________________________________________
297 AliITS& AliITS::operator=(AliITS &source){
298   // assignment operator
299   if(this==&source) return *this;
300   Error("AliITS::operator=",
301         "You are not allowed to make a copy of the AliITS");
302   exit(1);
303   return *this; //fake return
304 }
305 //____________________________________________________________________________
306 void AliITS::ClearModules(){
307   //clear the modules TObjArray
308
309   if(fITSmodules) fITSmodules->Delete();
310
311 }
312 //_____________________________________________________________________________
313 AliITS::~AliITS(){
314   //
315   // Default distructor for ITS
316   //     The default destructor of the AliITS class. In addition to deleting
317   // the AliITS class it deletes the memory pointed to by the fHits, fDigits,
318   // fIdSens, fIdName, and fITSpoints.
319   //
320
321
322   delete fHits;
323   delete fDigits;
324   delete fRecPoints;
325 //  delete fIdName;        // TObjArray of TObjStrings
326   if(fIdName!=0) delete[] fIdName;  // Array of TStrings
327   if(fIdSens!=0) delete[] fIdSens;
328   if(fITSmodules!=0) {
329       this->ClearModules();
330       delete fITSmodules;
331   }// end if fITSmodules!=0
332
333   //
334   if(fDtype) {
335     fDtype->Delete();
336     delete fDtype;
337   }
338   delete [] fNdtype;
339   if (fCtype) {
340     fCtype->Delete();
341     delete fCtype;
342   }
343   delete [] fNctype;
344   //
345
346   if (fDetTypes) {
347     fDetTypes->Delete();
348     delete fDetTypes;
349   }
350
351   if (fTreeC) delete fTreeC;
352
353   if (fITSgeom) delete fITSgeom;
354
355 }
356
357 //___________________________________________
358 AliITSDetType* AliITS::DetType(Int_t id)
359 {
360   //return pointer to id detector type
361     return ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id]);
362
363 }
364 //___________________________________________
365 void AliITS::SetClasses(Int_t id, const char *digit, const char *cluster)
366 {
367   //set the digit and cluster classes to be used for the id detector type
368     ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->ClassNames(digit,cluster);
369
370 }
371 //___________________________________________
372 void AliITS::SetResponseModel(Int_t id, AliITSresponse *response)
373 {
374   //set the response model for the id detector type
375
376     ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->ResponseModel(response);
377
378 }
379
380 //___________________________________________
381 void AliITS::SetSegmentationModel(Int_t id, AliITSsegmentation *seg)
382 {
383   //set the segmentation model for the id detector type
384
385     ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->SegmentationModel(seg);
386
387 }
388
389 //___________________________________________
390 void AliITS::SetSimulationModel(Int_t id, AliITSsimulation *sim)
391 {
392   //set the simulation model for the id detector type
393
394    ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->SimulationModel(sim);
395
396 }
397 //___________________________________________
398 void AliITS::SetReconstructionModel(Int_t id, AliITSClusterFinder *reconst)
399 {
400   //set the cluster finder model for the id detector type
401
402    ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->ReconstructionModel(reconst);
403
404 }
405
406 //_____________________________________________________________________________
407 void AliITS::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits){
408   //
409   // Add an ITS hit
410   //     The function to add information to the AliITShit class. See the
411   // AliITShit class for a full description. This function allocates the
412   // necessary new space for the hit information and passes the variable
413   // track, and the pointers *vol and *hits to the AliITShit constructor
414   // function.
415   //
416   TClonesArray &lhits = *fHits;
417   new(lhits[fNhits++]) AliITShit(fIshunt,track,vol,hits);
418 }
419 //_____________________________________________________________________________
420 void AliITS::AddRealDigit(Int_t id, Int_t *digits) 
421 {
422   // add a real digit - as coming from data
423
424   TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)(*fDtype)[id]);
425   new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigit(digits);
426
427 }
428 //_____________________________________________________________________________
429 void AliITS::AddSimDigit(Int_t id, AliITSdigit *d) 
430 {
431
432   // add a simulated digit
433
434   TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)(*fDtype)[id]);
435
436   switch(id)
437   {
438   case 0:
439      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSPD(*((AliITSdigitSPD*)d));
440      break;
441   case 1:
442      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSDD(*((AliITSdigitSDD*)d));
443      break;
444   case 2:
445      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSSD(*((AliITSdigitSSD*)d));
446      break;
447   }
448
449 }
450
451 //_____________________________________________________________________________
452 void AliITS::AddSimDigit(Int_t id,Float_t phys,Int_t *digits,Int_t *tracks,Int_t *hits,Float_t *charges){
453
454   // add a simulated digit to the list
455
456   TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)(*fDtype)[id]);
457   switch(id)
458   {
459   case 0:
460      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSPD(digits,tracks,hits);
461      break;
462   case 1:
463      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSDD(phys,digits,tracks,hits,charges);
464      break;
465   case 2:
466      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSSD(digits,tracks,hits);
467      break;
468   }
469  
470 }
471
472 //_____________________________________________________________________________
473 void AliITS::AddCluster(Int_t id, AliITSRawCluster *c) 
474 {
475
476   // add a cluster to the list
477
478   TClonesArray &lcl = *((TClonesArray*)(*fCtype)[id]);
479
480   switch(id)
481   {
482   case 0:
483      new(lcl[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSPD(*((AliITSRawClusterSPD*)c));
484      break;
485   case 1:
486      new(lcl[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSDD(*((AliITSRawClusterSDD*)c));
487      break;
488   case 2:
489      new(lcl[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSSD(*((AliITSRawClusterSSD*)c));
490      break;
491   }
492
493 }
494
495
496 //_____________________________________________________________________________
497 void AliITS::AddRecPoint(const AliITSRecPoint &r)
498 {
499   //
500   // Add a reconstructed space point to the list
501   //
502   TClonesArray &lrecp = *fRecPoints;
503   new(lrecp[fNRecPoints++]) AliITSRecPoint(r);
504 }
505  
506
507 //____________________________________________
508 void AliITS::ResetDigits()
509 {
510     //
511     // Reset number of digits and the digits array for the ITS detector
512     //
513
514     if (!fDtype) return;
515
516     Int_t i;
517     for (i=0;i<kNTYPES;i++ ) {
518         if ((*fDtype)[i])    ((TClonesArray*)(*fDtype)[i])->Clear();
519         if (fNdtype)  fNdtype[i]=0;
520     }
521 }
522
523 //____________________________________________
524 void AliITS::ResetDigits(Int_t i)
525 {
526     //
527     // Reset number of digits and the digits array for this branch
528     //
529   if ((*fDtype)[i])    ((TClonesArray*)(*fDtype)[i])->Clear();
530   if (fNdtype)  fNdtype[i]=0;
531 }
532
533
534 //____________________________________________
535 void AliITS::ResetClusters()
536 {
537     //
538     // Reset number of clusters and the clusters array for ITS
539     //
540
541     Int_t i;
542     for (i=0;i<kNTYPES;i++ ) {
543         if ((*fCtype)[i])    ((TClonesArray*)(*fCtype)[i])->Clear();
544         if (fNctype)  fNctype[i]=0;
545     }
546
547 }
548
549 //____________________________________________
550 void AliITS::ResetClusters(Int_t i)
551 {
552     //
553     // Reset number of clusters and the clusters array for this branch
554     //
555         if ((*fCtype)[i])    ((TClonesArray*)(*fCtype)[i])->Clear();
556         if (fNctype)  fNctype[i]=0;
557
558 }
559
560
561 //____________________________________________
562 void AliITS::ResetRecPoints()
563 {
564     //
565     // Reset number of rec points and the rec points array 
566     //
567     if (fRecPoints) fRecPoints->Clear();
568     fNRecPoints = 0;
569
570 }
571
572 //_____________________________________________________________________________
573 Int_t AliITS::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t ){
574   //
575   // Distance from mouse to ITS on the screen. Dummy routine
576   //     A dummy routine used by the ROOT macro display.C to allow for the
577   // use of the mouse (pointing device) in the macro. In general this should
578   // never be called. If it is it returns the number 9999 for any value of
579   // x and y.
580   //
581   return 9999;
582 }
583
584 //_____________________________________________________________________________
585 void AliITS::Init(){
586   //
587   // Initialise ITS after it has been built
588   //     This routine initializes the AliITS class. It is intended to be called
589   // from the Init function in AliITSv?. Besides displaying a banner
590   // indicating that it has been called it initializes the array fIdSens
591   // and sets the default segmentation, response, digit and raw cluster classes
592   // Therefore it should be called after a call to CreateGeometry.
593   //
594   Int_t i;
595
596 //
597   SetDefaults();
598 // Array of TStrings
599   for(i=0;i<fIdN;i++) fIdSens[i] = gMC->VolId(fIdName[i]);
600 //
601 }
602
603 //_____________________________________________________________________________
604 void AliITS::SetDefaults()
605 {
606   // sets the default segmentation, response, digit and raw cluster classes
607
608   printf("SetDefaults\n");
609
610   AliITSDetType *iDetType;
611
612
613   //SPD 
614
615   iDetType=DetType(0); 
616   if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
617     AliITSsegmentationSPD *seg0=new AliITSsegmentationSPD(fITSgeom);
618     SetSegmentationModel(0,seg0); 
619   }
620   if (!iDetType->GetResponseModel()) {
621      SetResponseModel(0,new AliITSresponseSPD()); 
622   }
623   // set digit and raw cluster classes to be used
624   
625   const char *kData0=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
626   if (strstr(kData0,"real")) {
627       iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSPD");
628   } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSPD","AliITSRawClusterSPD");
629
630   // SDD                                          //
631   iDetType=DetType(1); 
632   if (!iDetType->GetResponseModel()) {
633     SetResponseModel(1,new AliITSresponseSDD()); 
634   }
635   AliITSresponse *resp1=iDetType->GetResponseModel();
636   if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
637     AliITSsegmentationSDD *seg1=new AliITSsegmentationSDD(fITSgeom,resp1);
638     SetSegmentationModel(1,seg1); 
639   }
640   const char *kData1=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
641   const char *kopt=iDetType->GetResponseModel()->ZeroSuppOption();
642   if ((!strstr(kopt,"2D")) && (!strstr(kopt,"1D")) || strstr(kData1,"real") ) {
643       iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSDD");
644   } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSDD","AliITSRawClusterSDD");
645
646   // SSD
647   iDetType=DetType(2); 
648   if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
649     AliITSsegmentationSSD *seg2=new AliITSsegmentationSSD(fITSgeom);
650     SetSegmentationModel(2,seg2); 
651   }
652   if (!iDetType->GetResponseModel()) {
653     SetResponseModel(2,new AliITSresponseSSD()); 
654   }
655   const char *kData2=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
656   if (strstr(kData2,"real")) {
657       iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSSD");
658   } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSSD","AliITSRawClusterSSD");
659
660   if (kNTYPES>3) {
661     Warning("SetDefaults","Only the three basic detector types are initialised!");
662   } 
663
664 }
665
666
667
668 //_____________________________________________________________________________
669 void AliITS::SetDefaultSimulation()
670 {
671   // to be written
672
673 }
674 //_____________________________________________________________________________
675 void AliITS::SetDefaultClusterFinders()
676 {
677   // to be written
678
679 }
680 //_____________________________________________________________________________
681
682 void AliITS::MakeTreeC(Option_t *option)
683 {
684   // create a separate tree to store the clusters
685
686   cout << "AliITS::MakeTreeC" << endl;
687
688      char *optC = strstr(option,"C");
689      if (optC && !fTreeC) fTreeC = new TTree("TC","Clusters in ITS");
690      else return;
691
692      Int_t buffersize = 4000;
693      char branchname[30];
694
695      const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
696
697      char digclass[40];
698      char clclass[40];
699
700      // one branch for Clusters per type of detector
701      Int_t i;
702      for (i=0; i<kNTYPES ;i++) {
703        AliITSDetType *iDetType=DetType(i); 
704        iDetType->GetClassNames(digclass,clclass);
705        // clusters
706        (*fCtype)[i] = new TClonesArray(clclass,10000); 
707         if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sClusters%s",GetName(),det[i]);
708         else  sprintf(branchname,"%sClusters%d",GetName(),i+1);
709         if (fCtype   && fTreeC) {
710            TreeC()->Branch(branchname,&((*fCtype)[i]), buffersize);
711            cout << "Making Branch " << branchname;
712            cout << " for Clusters of detector type " << i+1 << endl;
713         }       
714      }
715
716 }
717
718 //_____________________________________________________________________________
719 void AliITS::GetTreeC(Int_t event)
720 {
721
722   cout << "AliITS::GetTreeC" << endl;
723
724   // get the clusters tree for this event and set the branch address
725     char treeName[20];
726     char branchname[30];
727
728     const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
729
730     ResetClusters();
731     if (fTreeC) {
732           delete fTreeC;
733     }
734
735     sprintf(treeName,"TreeC%d",event);
736     fTreeC = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
737
738     TBranch *branch;
739     if (fTreeC) {
740         Int_t i;
741         for (i=0; i<kNTYPES; i++) {
742            if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sClusters%s",GetName(),det[i]);
743            else  sprintf(branchname,"%sClusters%d",GetName(),i+1);
744            if (fCtype) {
745                 branch = fTreeC->GetBranch(branchname);
746                 if (branch) branch->SetAddress(&((*fCtype)[i]));
747             }
748         }
749     } else {
750         Error("AliITS::GetTreeC",
751                 "cannot find Clusters Tree for event:%d\n",event);
752     }
753
754 }
755 //_____________________________________________________________________________
756 void AliITS::MakeBranch(Option_t* option, char *file)
757 {
758   //
759   // Creates Tree branches for the ITS.
760   //
761   //
762   Int_t buffersize = 4000;
763   char branchname[30];
764   sprintf(branchname,"%s",GetName());
765
766   AliDetector::MakeBranch(option,file);
767
768   char *cD = strstr(option,"D");
769   char *cR = strstr(option,"R");
770
771   if (cD) {
772   //
773   // one branch for digits per type of detector
774   //
775    const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
776
777    char digclass[40];
778    char clclass[40];
779
780    Int_t i;
781    for (i=0; i<kNTYPES ;i++) {
782        AliITSDetType *iDetType=DetType(i); 
783        iDetType->GetClassNames(digclass,clclass);
784        // digits
785        if(!((*fDtype)[i])) (*fDtype)[i] = new TClonesArray(digclass,10000);
786        else ResetDigits(i);
787    }
788
789    for (i=0; i<kNTYPES ;i++) {
790       if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
791       else  sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);      
792       if (fDtype && gAlice->TreeD()) {
793         gAlice->MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(), 
794                          branchname, &((*fDtype)[i]), buffersize, file);
795             cout << "Making Branch " << branchname;
796             cout << " for digits of type "<< i+1 << endl;
797       } 
798     }
799   }
800
801   if (cR) {
802   //
803   // only one branch for rec points for all detector types
804   //
805     sprintf(branchname,"%sRecPoints",GetName());
806  
807     if(!fRecPoints) fRecPoints=new TClonesArray("AliITSRecPoint",10000);
808
809     if (fRecPoints && gAlice->TreeR()) {
810       gAlice->MakeBranchInTree(gAlice->TreeR(), 
811                                branchname, &fRecPoints, buffersize, file) ;
812       cout << "Making Branch " << branchname;
813       cout << " for reconstructed space points" << endl;
814     }
815   }     
816 }
817
818 //___________________________________________
819 void AliITS::SetTreeAddress()
820 {
821
822   // Set branch address for the Trees.
823
824   char branchname[30];
825   AliDetector::SetTreeAddress();
826
827   const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
828
829   TBranch *branch;
830   TTree *treeD = gAlice->TreeD();
831   TTree *treeR = gAlice->TreeR();
832
833   Int_t i;
834   if (treeD) {
835       for (i=0; i<kNTYPES; i++) {
836           if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
837           else  sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
838           if (fDtype) {
839               branch = treeD->GetBranch(branchname);
840               if (branch) branch->SetAddress(&((*fDtype)[i]));
841           }
842       }
843   }
844
845  
846   if (treeR) {
847     sprintf(branchname,"%sRecPoints",GetName());
848       branch = treeR->GetBranch(branchname);
849       if (branch) branch->SetAddress(&fRecPoints);
850   }
851   
852
853 }
854
855 //____________________________________________________________________________
856 void AliITS::InitModules(Int_t size,Int_t &nmodules){
857
858   //initialize the modules array
859
860   if(fITSmodules){ 
861       fITSmodules->Delete();
862       delete fITSmodules;
863   }
864
865     Int_t nl,indexMAX,index;
866
867     if(size<=0){ // default to using data stored in AliITSgeom
868         if(fITSgeom==0) {
869             Error("AliITS::InitModules",
870                 "in AliITS::InitModule fITSgeom not defined\n");
871             return;
872         } // end if fITSgeom==0
873         nl = fITSgeom->GetNlayers();
874         indexMAX = fITSgeom->GetModuleIndex(nl,fITSgeom->GetNladders(nl),
875                                             fITSgeom->GetNdetectors(nl))+1;
876         nmodules = indexMAX;
877         fITSmodules = new TObjArray(indexMAX);
878         for(index=0;index<indexMAX;index++){
879                 fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
880         } // end for index
881     }else{
882         fITSmodules = new TObjArray(size);
883         for(index=0;index<size;index++) {
884             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
885         }
886
887         nmodules = size;
888     } // end i size<=0
889 }
890
891 //____________________________________________________________________________
892 void AliITS::FillModules(Int_t evnt,Int_t bgrev,Int_t nmodules,Option_t *option,Text_t *filename){
893
894   // fill the modules with the sorted by module hits; add hits from background
895   // if option=Add
896
897
898     static TTree *trH1;                 //Tree with background hits
899     static TClonesArray *fHits2;        //List of hits for one track only
900
901     static Bool_t first=kTRUE;
902     static TFile *file;
903     char *addBgr = strstr(option,"Add");
904
905
906     if (addBgr ) {
907         if(first) {
908             cout<<"filename "<<filename<<endl;
909             file=new TFile(filename);
910             cout<<"I have opened "<<filename<<" file "<<endl;
911             fHits2     = new TClonesArray("AliITShit",1000  );
912         }           
913         first=kFALSE;
914         file->cd();
915         file->ls();
916         // Get Hits Tree header from file
917         if(fHits2) fHits2->Clear();
918         if(trH1) delete trH1;
919         trH1=0;
920         
921         char treeName[20];
922         sprintf(treeName,"TreeH%d",bgrev);
923         trH1 = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
924         //printf("TrH1 %p of treename %s for event %d \n",trH1,treeName,bgrev);
925         
926         if (!trH1) {
927             Error("AliITS::FillModules",
928             "cannot find Hits Tree for event:%d\n",bgrev);
929         }
930         // Set branch addresses
931         TBranch *branch;
932         char branchname[20];
933         sprintf(branchname,"%s",GetName());
934         if (trH1 && fHits2) {
935             branch = trH1->GetBranch(branchname);
936             if (branch) branch->SetAddress(&fHits2);
937         }
938
939         // test
940         //Int_t ntracks1 =(Int_t)TrH1->GetEntries();
941         //printf("background - ntracks1 - %d\n",ntracks1);
942    }
943
944     //Int_t npart = gAlice->GetEvent(evnt);
945     //if(npart<=0) return;
946     TClonesArray *itsHits = this->Hits();
947     Int_t lay,lad,det,index;
948     AliITShit *itsHit=0;
949     AliITSmodule *mod=0;
950
951     TTree *iTH = gAlice->TreeH();
952     Int_t ntracks =(Int_t) iTH->GetEntries();
953
954     Int_t t,h;
955     for(t=0; t<ntracks; t++){
956         gAlice->ResetHits();
957         iTH->GetEvent(t);
958         Int_t nhits = itsHits->GetEntriesFast();
959         //printf("nhits %d\n",nhits);
960         if (!nhits) continue;
961         for(h=0; h<nhits; h++){
962             itsHit = (AliITShit *)itsHits->UncheckedAt(h);
963             itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
964             // temporarily index=det-1 !!!
965             if(fITSgeom) index = fITSgeom->GetModuleIndex(lay,lad,det);
966             else index=det-1;
967             //
968             mod = this->GetModule(index);
969             mod->AddHit(itsHit,t,h);
970         } // end loop over hits 
971     } // end loop over tracks
972
973     // open the file with background
974     
975     if (addBgr ) {
976           Int_t track,i;
977           ntracks =(Int_t)trH1->GetEntries();
978             //printf("background - ntracks1 %d\n",ntracks);
979             //printf("background - Start loop over tracks \n");     
980             //   Loop over tracks
981
982             for (track=0; track<ntracks; track++) {
983
984                 if (fHits2)       fHits2->Clear();
985                 trH1->GetEvent(track);
986                 //   Loop over hits
987                 for(i=0;i<fHits2->GetEntriesFast();++i) {
988
989                     itsHit=(AliITShit*) (*fHits2)[i];
990                     itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
991                     // temporarily index=det-1 !!!
992                     if(fITSgeom) index = fITSgeom->GetModuleIndex(lay,lad,det);
993                     else index=det-1;
994                     //
995                     mod = this->GetModule(index);
996                     mod->AddHit(itsHit,track,i);
997                }  // end loop over hits
998             } // end loop over tracks
999
1000             TTree *fAli=gAlice->TreeK();
1001             TFile *fileAli=0;
1002             
1003             if (fAli) fileAli =fAli->GetCurrentFile();
1004             fileAli->cd();
1005
1006     } // end if add
1007
1008     //gObjectTable->Print();
1009
1010 }
1011
1012 //____________________________________________________________________________
1013
1014 void AliITS::SDigits2Digits()
1015 {
1016   
1017   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1018   
1019   // SPD
1020   AliITSDetType *iDetType;
1021   iDetType=DetType(0);
1022   AliITSsegmentationSPD *seg0=(AliITSsegmentationSPD*)iDetType->GetSegmentationModel();
1023   AliITSresponseSPD *res0 = (AliITSresponseSPD*)iDetType->GetResponseModel();
1024   AliITSsimulationSPD *sim0=new AliITSsimulationSPD(seg0,res0);
1025   SetSimulationModel(0,sim0);
1026   // test
1027   // printf("SPD dimensions %f %f \n",seg0->Dx(),seg0->Dz());
1028   // printf("SPD npixels %d %d \n",seg0->Npz(),seg0->Npx());
1029   // printf("SPD pitches %d %d \n",seg0->Dpz(0),seg0->Dpx(0));
1030   // end test
1031   // 
1032   // SDD
1033   //Set response functions
1034   Float_t baseline = 10.;
1035   Float_t noise = 1.75;
1036   
1037   // SDD compression param: 2 fDecrease, 2fTmin, 2fTmax or disable, 2 fTolerance
1038
1039   iDetType=DetType(1);
1040   AliITSresponseSDD *res1 = (AliITSresponseSDD*)iDetType->GetResponseModel();
1041   if (!res1) {
1042     res1=new AliITSresponseSDD();
1043     SetResponseModel(1,res1);
1044   }
1045    res1->SetMagicValue(900.);
1046    Float_t maxadc = res1->MaxAdc();    
1047    Float_t topValue = res1->MagicValue();
1048    Float_t norm = maxadc/topValue;
1049
1050    Float_t fCutAmp = baseline + 2.*noise;
1051    fCutAmp *= norm;
1052    Int_t cp[8]={0,0,(int)fCutAmp,(int)fCutAmp,0,0,0,0}; //1D
1053
1054   //res1->SetZeroSupp("2D");
1055   res1->SetZeroSupp("1D");
1056   res1->SetNoiseParam(noise,baseline);
1057   res1->SetDo10to8(kTRUE);
1058   res1->SetCompressParam(cp);
1059   res1->SetMinVal(4);
1060   res1->SetDiffCoeff(3.6,40.);
1061   //res1->SetMagicValue(96.95);
1062   AliITSsegmentationSDD *seg1=(AliITSsegmentationSDD*)iDetType->GetSegmentationModel();
1063   if (!seg1) {
1064     seg1 = new AliITSsegmentationSDD(geom,res1);
1065     SetSegmentationModel(1,seg1);
1066   }
1067   AliITSsimulationSDD *sim1=new AliITSsimulationSDD(seg1,res1);
1068   sim1->SetDoFFT(1);
1069   sim1->SetCheckNoise(kFALSE);
1070   SetSimulationModel(1,sim1);
1071
1072   // SSD
1073   iDetType=DetType(2);
1074   AliITSsegmentationSSD *seg2=(AliITSsegmentationSSD*)iDetType->GetSegmentationModel();
1075   AliITSresponseSSD *res2 = (AliITSresponseSSD*)iDetType->GetResponseModel();
1076   res2->SetSigmaSpread(3.,2.);
1077   AliITSsimulationSSD *sim2=new AliITSsimulationSSD(seg2,res2);
1078   SetSimulationModel(2,sim2);
1079  
1080   cerr<<"Digitizing ITS...\n";
1081  
1082   TStopwatch timer;
1083   timer.Start();
1084   HitsToDigits(0,0,-1," ","All"," ");
1085   timer.Stop(); timer.Print();
1086
1087   delete sim0;
1088   delete sim1;
1089   delete sim2;
1090 }
1091
1092
1093 //____________________________________________________________________________
1094 void AliITS::HitsToDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size, Option_t *option, Option_t *opt,Text_t *filename)
1095 {
1096     // keep galice.root for signal and name differently the file for 
1097     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
1098   
1099    // the condition below will disappear when the geom class will be
1100    // initialised for all versions - for the moment it is only for v5 !
1101    // 7 is the SDD beam test version  
1102    Int_t ver = this->IsVersion(); 
1103    if(ver!=5 && ver!=7) return; 
1104
1105    char *all = strstr(opt,"All");
1106    char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),strstr(opt,"SSD")};
1107
1108    Int_t nmodules;
1109    InitModules(size,nmodules); 
1110    FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
1111
1112    //TBranch *branch;
1113    AliITSsimulation* sim;
1114    //TObjArray *branches=gAlice->TreeD()->GetListOfBranches();
1115    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1116
1117    Int_t id,module;
1118    Int_t first,last;
1119    for (id=0;id<kNTYPES;id++) {
1120         if (!all && !det[id]) continue;
1121         //branch = (TBranch*)branches->UncheckedAt(id);
1122         AliITSDetType *iDetType=DetType(id); 
1123         sim = (AliITSsimulation*)iDetType->GetSimulationModel();
1124         if (!sim) {
1125            Error("HitsToDigits","The simulation class was not instantiated!");
1126            exit(1);
1127            // or SetDefaultSimulation();
1128         }
1129         if(geom) {
1130           first = geom->GetStartDet(id);
1131           last = geom->GetLastDet(id);
1132         } else first=last=0;
1133         cout << "det type " << id << " first, last "<< first << last << endl;
1134         for(module=first;module<=last;module++) {
1135             AliITSmodule *mod = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
1136             sim->DigitiseModule(mod,module,evNumber);
1137             // fills all branches - wasted disk space
1138             gAlice->TreeD()->Fill(); 
1139             ResetDigits();
1140             // try and fill only the branch 
1141             //branch->Fill();
1142             //ResetDigits(id);
1143         } // loop over modules
1144    } // loop over detector types
1145
1146    ClearModules();
1147
1148    Int_t nentries=(Int_t)gAlice->TreeD()->GetEntries();
1149    cout << "nentries in TreeD" << nentries << endl;
1150
1151    char hname[30];
1152    sprintf(hname,"TreeD%d",evNumber);
1153    gAlice->TreeD()->Write(hname,TObject::kOverwrite);
1154    // reset tree
1155    gAlice->TreeD()->Reset();
1156
1157 }
1158
1159
1160 //____________________________________________________________________________
1161 void AliITS::DigitsToRecPoints(Int_t evNumber,Int_t lastentry,Option_t *opt)
1162 {
1163   // cluster finding and reconstruction of space points
1164   
1165    // the condition below will disappear when the geom class will be
1166    // initialised for all versions - for the moment it is only for v5 !
1167    // 7 is the SDD beam test version  
1168    Int_t ver = this->IsVersion(); 
1169    if(ver!=5) return; 
1170
1171    char *all = strstr(opt,"All");
1172    char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),strstr(opt,"SSD")};
1173
1174    static Bool_t first=kTRUE;
1175    if (!TreeC() && first) {
1176        MakeTreeC("C");
1177        first=kFALSE;
1178    }
1179
1180    TTree *treeC=TreeC();
1181  
1182
1183    //TBranch *branch;
1184    AliITSClusterFinder* rec;
1185
1186    //TObjArray *branches=gAlice->TreeR()->GetListOfBranches();
1187    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1188
1189    Int_t id,module;
1190    for (id=0;id<kNTYPES;id++) {
1191         if (!all && !det[id]) continue;
1192         //branch = (TBranch*)branches->UncheckedAt(id);
1193         AliITSDetType *iDetType=DetType(id); 
1194         rec = (AliITSClusterFinder*)iDetType->GetReconstructionModel();
1195         if (!rec) {
1196            Error("DigitsToRecPoints","The cluster finder class was not instantiated!");
1197            exit(1);
1198            // or SetDefaultClusterFinders();
1199         }
1200         TClonesArray *itsDigits  = this->DigitsAddress(id);
1201
1202         Int_t first,last;
1203         if(geom) {
1204           first = geom->GetStartDet(id);
1205           last = geom->GetLastDet(id);
1206         } else first=last=0;
1207         //printf("first last %d %d\n",first,last);
1208         for(module=first;module<=last;module++) {
1209               this->ResetDigits();
1210               if (all) gAlice->TreeD()->GetEvent(lastentry+module);
1211               else gAlice->TreeD()->GetEvent(lastentry+(module-first));
1212               Int_t ndigits = itsDigits->GetEntriesFast();
1213               if (ndigits) rec->FindRawClusters();
1214               gAlice->TreeR()->Fill(); 
1215               ResetRecPoints();
1216               treeC->Fill();
1217               ResetClusters();
1218               // try and fill only the branch 
1219               //branch->Fill();
1220               //ResetRecPoints(id);
1221         } // loop over modules
1222    } // loop over detector types
1223
1224
1225    Int_t nentries=(Int_t)gAlice->TreeR()->GetEntries();
1226    Int_t ncentries=(Int_t)treeC->GetEntries();
1227    cout << " nentries ncentries " << nentries << ncentries <<  endl;
1228
1229    char hname[30];
1230    sprintf(hname,"TreeR%d",evNumber);
1231    gAlice->TreeR()->Write(hname,TObject::kOverwrite);
1232    // reset tree
1233    gAlice->TreeR()->Reset();
1234
1235    sprintf(hname,"TreeC%d",evNumber);
1236    treeC->Write(hname,TObject::kOverwrite);
1237    treeC->Reset();
1238 }
1239
1240
1241 //____________________________________________________________________________
1242 void AliITS::HitsToFastRecPoints(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
1243 Option_t *option,Option_t *opt,Text_t *filename)
1244 {
1245     // keep galice.root for signal and name differently the file for 
1246     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
1247   
1248
1249    // the condition below will disappear when the geom class will be
1250    // initialised for all versions - for the moment it is only for v5 !  
1251    Int_t ver = this->IsVersion(); 
1252    if(ver!=5) return; 
1253
1254    char *all = strstr(opt,"All");
1255    char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),strstr(opt,"SSD")};
1256
1257    Int_t nmodules;
1258    InitModules(size,nmodules);
1259    FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
1260
1261
1262    AliITSsimulation* sim;
1263    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1264
1265    TRandom *random=new TRandom[9];
1266    random[0].SetSeed(111);
1267    random[1].SetSeed(222);
1268    random[2].SetSeed(333);              
1269    random[3].SetSeed(444);
1270    random[4].SetSeed(555);
1271    random[5].SetSeed(666);              
1272    random[6].SetSeed(777);
1273    random[7].SetSeed(888);
1274    random[8].SetSeed(999);              
1275
1276
1277    Int_t id,module;
1278    for (id=0;id<kNTYPES;id++) {
1279         if (!all && !det[id]) continue;
1280         AliITSDetType *iDetType=DetType(id); 
1281         sim = (AliITSsimulation*)iDetType->GetSimulationModel();
1282         if (!sim) {
1283            Error("HitsToFastPoints","The simulation class was not instantiated!");
1284            exit(1);
1285            // or SetDefaultSimulation();
1286         }
1287         Int_t first = geom->GetStartDet(id);
1288         Int_t last = geom->GetLastDet(id);
1289         for(module=first;module<=last;module++) {
1290             AliITSmodule *mod = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
1291             sim->CreateFastRecPoints(mod,module,random);
1292             gAlice->TreeR()->Fill(); 
1293             ResetRecPoints();
1294         } // loop over modules
1295    } // loop over detector types
1296
1297
1298    ClearModules();
1299
1300    //Int_t nentries=(Int_t)gAlice->TreeR()->GetEntries();
1301
1302    char hname[30];
1303    sprintf(hname,"TreeR%d",evNumber);
1304    gAlice->TreeR()->Write(hname,TObject::kOverwrite);
1305    // reset tree
1306    gAlice->TreeR()->Reset();
1307
1308    delete [] random;
1309
1310 }
1311
1312 //________________________________________________________________
1313
1314 AliITStrack  AliITS::Tracking(AliITStrack &track, AliITStrack *reference,TObjArray *fastpoints, Int_t
1315 **vettid, Bool_t flagvert ) { 
1316                                                                                 
1317 //Origin  A. Badala' and G.S. Pappalardo:  e-mail Angela.Badala@ct.infn.it, Giuseppe.S.Pappalardo@ct.infn.it 
1318
1319                                                                                     
1320   TList *list= new TList();   
1321
1322   AliITStrack tr(track);
1323   
1324   list->AddLast(&tr);
1325   
1326   Double_t Pt=(tr).GetPt();
1327   //cout << "\n Pt = " << Pt <<"\n";
1328
1329   AliITStracking obj(list, reference, this, fastpoints,TMath::Abs(Pt),vettid, flagvert);
1330   list->Delete();
1331   delete list;
1332
1333   Int_t itot=-1;
1334   TVector VecTotLabref(18);
1335   Int_t lay, k;
1336   for(lay=5; lay>=0; lay--) {
1337     TVector VecLabref(3); 
1338     VecLabref=(*reference).GetLabTrack(lay);
1339     for(k=0; k<3; k++) {itot++; VecTotLabref(itot)=VecLabref(k);}    
1340   }
1341   Long_t labref;
1342   Int_t freq;  
1343   (*reference).Search(VecTotLabref, labref, freq);
1344     
1345   if(freq < 5) labref=-labref;          
1346   (*reference).SetLabel(labref);
1347
1348   return *reference; 
1349
1350 }
1351
1352
1353
1354 //________________________________________________________________
1355
1356
1357
1358 void AliITS::DoTracking(Int_t evNumber, Int_t min_t, Int_t max_t, TFile *file, Bool_t flagvert) {
1359
1360 //   ex macro for tracking ITS
1361
1362   printf("begin DoTracking - file %p\n",file);
1363
1364   const char *pname="75x40_100x60";
1365   
1366   struct GoodTrack {
1367     Int_t lab,code;
1368     Float_t px,py,pz,x,y,z,pxg,pyg,pzg,ptg;
1369     Bool_t flag;
1370   };
1371   
1372
1373   gAlice->GetEvent(0);
1374
1375   AliTPC *TPC=(AliTPC*)gAlice->GetDetector("TPC");
1376   AliTPCParam *digp = (AliTPCParam*)file->Get(pname);
1377   if (digp!=0) TPC->SetParam(digp);
1378   
1379   GoodTrack gt[7000];
1380   Int_t ngood=0;
1381   ifstream in("good_tracks");
1382
1383   cerr<<"Reading good tracks...\n";
1384   while (in>>gt[ngood].lab>>gt[ngood].code
1385           >>gt[ngood].px >>gt[ngood].py>>gt[ngood].pz
1386           >>gt[ngood].x  >>gt[ngood].y >>gt[ngood].z
1387           >>gt[ngood].pxg  >>gt[ngood].pyg >>gt[ngood].pzg
1388           >>gt[ngood].ptg >>gt[ngood].flag) {
1389     ngood++;
1390     cerr<<ngood<<'\r';
1391     if (ngood==7000) {
1392       cerr<<"Too many good tracks !\n";
1393       break;
1394     }
1395   }
1396   if (!in.eof()) cerr<<"Read error (good_tracks) !\n";
1397   
1398   
1399 // Load tracks
1400   TFile *tf=TFile::Open("tpctracks.root");
1401   if (!tf->IsOpen()) {cerr<<"Can't open tpctracks.root !\n"; return ;}
1402   TObjArray tracks(200000);
1403   TTree *tracktree=(TTree*)tf->Get("TreeT");
1404   TBranch *tbranch=tracktree->GetBranch("tracks");
1405   Int_t nentr=(Int_t)tracktree->GetEntries();
1406   Int_t kk;
1407   for (kk=0; kk<nentr; kk++) {
1408     AliTPCtrack *iotrack=new AliTPCtrack;
1409     tbranch->SetAddress(&iotrack);
1410     tracktree->GetEvent(kk);
1411     tracks.AddLast(iotrack);
1412   }   
1413   tf->Close();
1414
1415
1416   Int_t nt = tracks.GetEntriesFast();
1417   cerr<<"Number of found tracks "<<nt<<endl;
1418   
1419   TVector DataOut(9);
1420   Int_t kkk=0;
1421   
1422   Double_t ptg=0.,pxg=0.,pyg=0.,pzg=0.;
1423
1424   //////////////////////////////  good tracks definition in TPC  ////////////////////////////////
1425       
1426   ofstream out1 ("AliITSTrag.out");
1427   Int_t i;
1428   for (i=0; i<ngood; i++) out1 << gt[i].ptg << "\n";
1429   out1.close();
1430
1431
1432   TVector vec(5);
1433   TTree *TR=gAlice->TreeR();
1434   Int_t nent=(Int_t)TR->GetEntries();
1435   TClonesArray  *recPoints = RecPoints();
1436   Int_t numbpoints;
1437   Int_t totalpoints=0;
1438   Int_t *np = new Int_t[nent];
1439   Int_t **vettid = new Int_t* [nent];
1440   Int_t mod;
1441   for (mod=0; mod<nent; mod++) {
1442     vettid[mod]=0;
1443     this->ResetRecPoints();
1444     //gAlice->TreeR()->GetEvent(mod+1); //first entry in TreeR is empty
1445     gAlice->TreeR()->GetEvent(mod); //first entry in TreeR is empty
1446     numbpoints = recPoints->GetEntries();
1447     totalpoints+=numbpoints;
1448     np[mod] = numbpoints;
1449   //cout<<" mod = "<<mod<<"   numbpoints = "<<numbpoints<<"\n"; getchar();
1450     vettid[mod] = new Int_t[numbpoints];
1451     Int_t ii;
1452     for (ii=0;ii<numbpoints; ii++) *(vettid[mod]+ii)=0;
1453   }
1454
1455   AliTPCtrack *track;
1456
1457      
1458   if(min_t < 0) {min_t = 0; max_t = nt-1;}   
1459
1460 /*
1461   ///////////////////////////////// Definition of vertex end its error ////////////////////////////
1462   ////////////////////////// In the future it will be given by a method ///////////////////////////
1463   Double_t Vx=0.;
1464   Double_t Vy=0.;
1465   Double_t Vz=0.;
1466   
1467   Float_t sigmavx=0.0050;      // 50  microns
1468   Float_t sigmavy=0.0050;      // 50  microns
1469   Float_t sigmavz=0.010;       // 100 microns
1470
1471   //Vx+=gRandom->Gaus(0,sigmavx);  Vy+=gRandom->Gaus(0,sigmavy);  Vz+=gRandom->Gaus(0,sigmavz);
1472   TVector vertex(3), ervertex(3)
1473   vertex(0)=Vx; vertex(1)=Vy; vertex(2)=Vz;
1474   ervertex(0)=sigmavx;  ervertex(1)=sigmavy;  ervertex(2)=sigmavz;
1475   /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1476 */      
1477
1478   //TDirectory *savedir=gDirectory; 
1479
1480   TTree tracktree1("TreeT","Tree with ITS tracks");
1481   AliITSiotrack *iotrack=0;
1482   tracktree1.Branch("ITStracks","AliITSiotrack",&iotrack,32000,0);
1483
1484   ofstream out ("AliITSTra.out");
1485   
1486   Int_t j;       
1487   for (j=min_t; j<=max_t; j++) {     
1488     track=(AliTPCtrack*)tracks.UncheckedAt(j);
1489     Int_t flaglab=0;
1490     if (!track) continue;
1491     ////// elimination of not good tracks ////////////   
1492     Int_t ilab=TMath::Abs(track->GetLabel());
1493     Int_t iii;
1494     for (iii=0;iii<ngood;iii++) {
1495          //cout<<" ilab, gt[iii].lab = "<<ilab<<" "<<gt[iii].lab<<"\n"; getchar();
1496       if (ilab==gt[iii].lab) { 
1497         flaglab=1;
1498         ptg=gt[iii].ptg; 
1499         pxg=gt[iii].pxg;
1500         pyg=gt[iii].pyg;
1501         pzg=gt[iii].pzg;        
1502         break;
1503       }
1504     }
1505          //cout<<" j flaglab =  " <<j<<" "<<flaglab<<"\n";  getchar();
1506     if (!flaglab) continue;
1507          //cout<<" j =  " <<j<<"\n";  getchar();
1508   /*            
1509     ////// old propagation to the end of TPC //////////////       
1510     Double_t xk=76.;
1511     track->PropagateTo(xk);
1512     xk-=0.11;
1513     track->PropagateTo(xk,42.7,2.27); //C
1514     xk-=2.6;
1515     track->PropagateTo(xk,36.2,1.98e-3); //C02
1516     xk-=0.051;
1517     track->PropagateTo(xk,42.7,2.27); //C 
1518     /////////////////////////////////////////////////// 
1519          */
1520                  
1521          ////// new propagation to the end of TPC //////////////
1522     Double_t xk=77.415;
1523     track->PropagateTo(xk, 28.94, 1.204e-3);     //Ne
1524          xk -=0.01;
1525     track->PropagateTo(xk, 44.77, 1.71);         //Tedlar
1526          xk -=0.04;
1527     track->PropagateTo(xk, 44.86, 1.45);         //Kevlar
1528          xk -=2.0;
1529     track->PropagateTo(xk, 41.28, 0.029);        //Nomex         
1530     xk-=16;
1531     track->PropagateTo(xk,36.2,1.98e-3); //C02
1532          xk -=0.01;
1533     track->PropagateTo(xk, 24.01, 2.7);  //Al    
1534          xk -=0.01;
1535     track->PropagateTo(xk, 44.77, 1.71);         //Tedlar
1536          xk -=0.04;
1537     track->PropagateTo(xk, 44.86, 1.45);         //Kevlar
1538          xk -=0.5;
1539     track->PropagateTo(xk, 41.28, 0.029);        //Nomex                                                 
1540                      
1541        ///////////////////////////////////////////////////////////////                   
1542   
1543    ///////////////////////////////////////////////////////////////
1544     AliITStrack trackITS(*track);
1545     AliITStrack result(*track);
1546     AliITStrack primarytrack(*track); 
1547     
1548 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1549          TVector Vgeant(3);
1550          Vgeant=result.GetVertex(); 
1551                           
1552   // Definition of Dv and Zv for vertex constraint      
1553      Double_t sigmaDv=0.0050;  Double_t sigmaZv=0.010;  
1554     //Double_t sigmaDv=0.0015;  Double_t sigmaZv=0.0015;                                  
1555         Double_t uniform= gRandom->Uniform();
1556         Double_t signdv;
1557         if(uniform<=0.5) signdv=-1.;
1558            else
1559                  signdv=1.;
1560          
1561         Double_t Vr=TMath::Sqrt(Vgeant(0)*Vgeant(0)+ Vgeant(1)*Vgeant(1));
1562           Double_t Dv=gRandom->Gaus(signdv*Vr,(Float_t)sigmaDv); 
1563     Double_t Zv=gRandom->Gaus(Vgeant(2),(Float_t)sigmaZv);
1564                                 
1565   //cout<<" Dv e Zv = "<<Dv<<" "<<Zv<<"\n";                             
1566     trackITS.SetDv(Dv);  trackITS.SetZv(Zv);
1567     trackITS.SetsigmaDv(sigmaDv); trackITS.SetsigmaZv(sigmaZv); 
1568     result.SetDv(Dv);  result.SetZv(Zv);
1569     result.SetsigmaDv(sigmaDv); result.SetsigmaZv(sigmaZv);
1570     primarytrack.SetDv(Dv);  primarytrack.SetZv(Zv);
1571     primarytrack.SetsigmaDv(sigmaDv); primarytrack.SetsigmaZv(sigmaZv);                                                                 
1572
1573 /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////        
1574                 
1575     primarytrack.PrimaryTrack();
1576     TVector  d2=primarytrack.Getd2();
1577     TVector  tgl2=primarytrack.Gettgl2();
1578     TVector  dtgl=primarytrack.Getdtgl();
1579     trackITS.Setd2(d2); trackITS.Settgl2(tgl2);  trackITS.Setdtgl(dtgl); 
1580     result.Setd2(d2); result.Settgl2(tgl2);  result.Setdtgl(dtgl);         
1581          /*                      
1582     trackITS.SetVertex(vertex); trackITS.SetErrorVertex(ervertex);
1583     result.SetVertex(vertex);   result.SetErrorVertex(ervertex);   
1584     */                         
1585     Tracking(trackITS,&result,recPoints,vettid, flagvert);  
1586              
1587      cout<<" progressive track number = "<<j<<"\r";
1588    // cout<<j<<"\r";
1589     //cout<<" progressive track number = "<<j<<"\n";
1590     Long_t labITS=result.GetLabel();
1591     //cout << " ITS track label = " << labITS << "\n";              
1592     int lab=track->GetLabel();              
1593   //  cout << " TPC track label = " << lab <<"\n";
1594     //result.GetClusters(); getchar();  //to print the cluster matrix
1595          
1596 //propagation to vertex
1597         
1598     Double_t rbeam=3.;
1599      
1600     result.Propagation(rbeam);
1601        
1602     TMatrix *cov;
1603          cov=&result.GetCMatrix();       
1604     Double_t pt=TMath::Abs(result.GetPt());
1605     Double_t Dr=result.GetD();
1606     Double_t Z=result.GetZ();
1607     Double_t tgl=result.GetTgl();
1608     Double_t C=result.GetC();
1609     Double_t Cy=C/2.;
1610     Double_t Dz=Z-(tgl/Cy)*TMath::ASin(result.arga(rbeam));
1611           Dz-=Vgeant(2);
1612           
1613          // cout<<" Dr e dz alla fine = "<<Dr<<" "<<Dz<<"\n"; getchar();
1614     Double_t phi=result.Getphi();
1615     Double_t phivertex = phi - TMath::ASin(result.argA(rbeam));
1616     Double_t duepi=2.*TMath::Pi();       
1617     if(phivertex>duepi) phivertex-=duepi;
1618     if(phivertex<0.) phivertex+=duepi;
1619     Double_t Dtot=TMath::Sqrt(Dr*Dr+Dz*Dz);
1620          
1621 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////      
1622     Int_t NumofCluster, idmodule,idpoint;
1623     NumofCluster=result.GetNumClust();
1624     if(NumofCluster >=5)  {      
1625
1626
1627       AliITSiotrack outtrack;
1628
1629       iotrack=&outtrack;
1630
1631       iotrack->SetStatePhi(phi);
1632       iotrack->SetStateZ(Z);
1633       iotrack->SetStateD(Dr);
1634       iotrack->SetStateTgl(tgl);
1635       iotrack->SetStateC(C);
1636                 Double_t radius=result.Getrtrack();
1637                 iotrack->SetRadius(radius);
1638                 Int_t charge;
1639                 if(C>0.) charge=-1;  else charge=1;
1640                 iotrack->SetCharge(charge);
1641                 
1642                 
1643
1644       iotrack->SetCovMatrix(cov);         
1645
1646       Double_t px=pt*TMath::Cos(phi);
1647       Double_t py=pt*TMath::Sin(phi);
1648       Double_t pz=pt*tgl;
1649                 
1650       Double_t xtrack=Dr*TMath::Sin(phi);
1651       Double_t ytrack=Dr*TMath::Cos(phi);
1652       Double_t ztrack=Dz+Vgeant(2);
1653
1654
1655       iotrack->SetPx(px);
1656       iotrack->SetPy(py);
1657       iotrack->SetPz(pz);
1658       iotrack->SetX(xtrack);
1659       iotrack->SetY(ytrack);
1660       iotrack->SetZ(ztrack);
1661       iotrack->SetLabel(labITS);
1662                 
1663       Int_t il;         
1664                 for(il=0;il<6; il++){
1665                   iotrack->SetIdPoint(il,result.GetIdPoint(il));
1666                   iotrack->SetIdModule(il,result.GetIdModule(il));              
1667                 }
1668       tracktree1.Fill();
1669
1670    //cout<<" labITS = "<<labITS<<"\n";
1671         //cout<<" phi z Dr tgl C = "<<phi<<" "<<Z<<" "<<Dr<<" "<<tgl<<" "<<C<<"\n";  getchar();    
1672
1673      DataOut(kkk) = ptg; kkk++; DataOut(kkk)=labITS; kkk++; DataOut(kkk)=lab; kkk++;            
1674
1675       for (il=0;il<6;il++) {
1676         idpoint=result.GetIdPoint(il);
1677         idmodule=result.GetIdModule(il);
1678         *(vettid[idmodule]+idpoint)=1; 
1679         iotrack->SetIdPoint(il,idpoint);
1680         iotrack->SetIdModule(il,idmodule);
1681       }
1682       
1683     //  cout<<"  +++++++++++++  pt e ptg = "<<pt<<" "<<ptg<<"  ++++++++++\n";
1684       Double_t difpt= (pt-ptg)/ptg*100.;                                        
1685       DataOut(kkk)=difpt; kkk++;                                             
1686       Double_t lambdag=TMath::ATan(pzg/ptg);
1687       Double_t   lam=TMath::ATan(tgl);      
1688       Double_t diflam = (lam - lambdag)*1000.;
1689       DataOut(kkk) = diflam; kkk++;                                         
1690       Double_t phig=TMath::ATan(pyg/pxg);
1691       Double_t phi=phivertex;  
1692       Double_t difphi = (phi - phig)*1000.;
1693       DataOut(kkk)=difphi; kkk++;
1694       DataOut(kkk)=Dtot*1.e4; kkk++;
1695       DataOut(kkk)=Dr*1.e4; kkk++;
1696       DataOut(kkk)=Dz*1.e4; kkk++;
1697       Int_t r;
1698       for (r=0; r<9; r++) { out<<DataOut(r)<<" ";}
1699       out<<"\n";
1700       kkk=0;  
1701                 
1702             
1703     } // end if on NumofCluster
1704   //gObjectTable->Print();    // stampa memoria     
1705   }  //  end for (int j=min_t; j<=max_t; j++)
1706   
1707   out.close();  
1708   
1709  
1710   static Bool_t first=kTRUE;
1711   static TFile *tfile;
1712
1713         if(first) {
1714             tfile=new TFile("itstracks.root","RECREATE");
1715             //cout<<"I have opened itstracks.root file "<<endl;
1716         }           
1717         first=kFALSE;
1718         tfile->cd();
1719         tfile->ls();
1720
1721    char hname[30];
1722    sprintf(hname,"TreeT%d",evNumber);
1723
1724   tracktree1.Write(hname);
1725
1726
1727   
1728             TTree *fAli=gAlice->TreeK();
1729             TFile *fileAli=0;
1730             
1731             if (fAli) fileAli =fAli->GetCurrentFile();
1732             fileAli->cd();
1733      
1734   ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1735
1736   printf("delete vectors\n");
1737   if(np) delete [] np;
1738   if(vettid) delete [] vettid;
1739   
1740 }