ITS/AliITS.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
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   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
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  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18
  19 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  20 //                                                                           //
  21 //      An overview of the basic philosophy of the ITS code development      //
  22 // and analysis is show in the figure below.                                 //
  23 //Begin_Html                                                                 //
  24 /*
  25 <img src="picts/ITS/ITS_Analysis_schema.gif">
  26 </pre>
  27 <br clear=left>
  28 <font size=+2 color=red>
  29 <p>Roberto Barbera is in charge of the ITS Offline code (1999).
  30 <a href="mailto:roberto.barbera@ct.infn.it">Roberto Barbera</a>.
  31 </font>
  32 <pre>
  33 */
  34 //End_Html
  35 //
  36 //  AliITS. Inner Traking System base class.
  37 //  This class contains the base procedures for the Inner Tracking System
  38 //
  39 //Begin_Html
  40 /*
  41 <img src="picts/ITS/AliITS_Class_Diagram.gif">
  42 </pre>
  43 <br clear=left>
  44 <font size=+2 color=red>
  45 <p>This show the class diagram of the different elements that are part of
  46 the AliITS class.
  47 </font>
  48 <pre>
  49 */
  50 //End_Html
  51 //
  52 // Version: 0
  53 // Written by Rene Brun, Federico Carminati, and Roberto Barbera
  54 //
  55 // Version: 1
  56 // Modified and documented by Bjorn S. Nilsen
  57 // July 11 1999
  58 //
  59 // Version: 2
  60 // Modified and documented by A. Bologna
  61 // October 18 1999
  62 //
  63 // AliITS is the general base class for the ITS. Also see AliDetector for
  64 // futher information.
  65 //
  66 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  67
  68 #include <stdlib.h>
  69 #include <TClonesArray.h>
  70 #include <TFile.h>
  71 #include <TParticle.h>
  72 #include <TString.h>
  73 #include <TTree.h>
  74 #include <TVirtualMC.h>
  75 #include "AliDetector.h"
  76 #include "AliITS.h"
  77 #include "AliITSDetTypeSim.h"
  78 #include "AliITSDDLRawData.h"
  79 #include "AliITSLoader.h"
  80 #include "AliITShit.h"
  81 #include "AliITSmodule.h"
  82 #include "AliITSpListItem.h"
  83 #include "AliITSsimulation.h"
  84 #include "AliITSsimulationFastPoints.h"
  85 #include "AliMC.h"
  86 #include "AliITSRecPoint.h"
  87 #include "AliITSsegmentationSPD.h"
  88 #include "AliITSsegmentationSDD.h"
  89 #include "AliITSsimulationSDD.h"
  90 #include "AliITSCalibrationSDD.h"
  91 #include "AliITSCalibrationSSD.h"
  92 #include "AliITSsegmentationSSD.h"
  93 #include "AliITSRawStreamSPD.h"
  94 #include "AliITSRawStreamSSD.h"
  95 #include "AliITSRawStreamSDD.h"
  96 #include "AliRawReader.h"
  97 #include "AliRun.h"
  98 #include "AliLog.h"
  99 #include "AliITSInitGeometry.h"
 100 #include "AliITSFOSignalsSPD.h"
 101
 102 ClassImp(AliITS)
 103
 104 //______________________________________________________________________
 105 AliITS::AliITS() : AliDetector(),
 106 fDetTypeSim(0),
 107 fEuclidOut(0),
 108 fOpt("All"),
 109 fIdN(0),
 110 fIdSens(0),
 111 fIdName(0),
 112 fITSmodules(0),
 113 fTiming(kFALSE),
 114 fSimuParam(0),
 115 fModA(0),
 116 fpSDigits(0)
 117 {
 118   // Default initializer for ITS
 119   //      The default constructor of the AliITS class. In addition to
 120   // creating the AliITS class it zeros the variables fIshunt (a member
 121   // of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros the pointers
 122   // fIdSens, and fIdName. The AliDetector default constructor
 123   // is also called.
 124
 125 //    SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 126 //PH    SetMarkerColor(kRed);
 127 }
 128 //______________________________________________________________________
 129 AliITS::AliITS(const Char_t *title):
 130   AliDetector("ITS",title),
 131   fDetTypeSim(0),
 132   fEuclidOut(0),
 133   fOpt("All"),
 134   fIdN(0),
 135   fIdSens(0),
 136   fIdName(0),
 137   fITSmodules(0),
 138   fTiming(kFALSE),
 139   fSimuParam(0),
 140   fModA(0),
 141   fpSDigits(0)
 142 {
 143     //     The standard Constructor for the ITS class.
 144     // It also zeros the variables
 145     // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and zeros
 146     // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the
 147     // ROOT macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The
 148     // variables passes with this constructor, const char *name and *title,
 149     // are used by the constructor of AliDetector class. See AliDetector
 150     // class for a description of these parameters and its constructor
 151     // functions.
 152     // Inputs:
 153     //   Char_t *title  Simulation title for the ITS
 154     // Outputs:
 155     //   none.
 156     // Return:
 157     //   none.
 158
 159     fHits = new TClonesArray("AliITShit",1560); // from AliDetector
 160     if(gAlice->GetMCApp()) gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
 161     //fNhits=0;  //done in AliDetector(name,title)
 162     SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 163     fDetTypeSim   = new AliITSDetTypeSim();
 164     //PH  SetMarkerColor(kRed);
 165     if(!fLoader) MakeLoader(AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
 166     fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 167 }
 168 //______________________________________________________________________
 169 AliITS::AliITS(const char *name, const char *title):
 170   AliDetector(name,title),
 171   fDetTypeSim(0),
 172   fEuclidOut(0),
 173   fOpt("All"),
 174   fIdN(0),
 175   fIdSens(0),
 176   fIdName(0),
 177   fITSmodules(0),
 178   fTiming(kFALSE),
 179   fSimuParam(0),
 180   fModA(0),
 181   fpSDigits(0)
 182 {
 183   //     The standard Constructor for the ITS class.
 184   // It also zeros the variables
 185   // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and zeros
 186   // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the
 187   // ROOT macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The
 188   // variables passes with this constructor, const char *name and *title,
 189   // are used by the constructor of AliDetector class. See AliDetector
 190   // class for a description of these parameters and its constructor
 191   // functions.
 192
 193   fHits = new TClonesArray("AliITShit",1560);
 194   if(gAlice->GetMCApp()) gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
 195   //fNhits=0;  //done in AliDetector(name,title)
 196
 197   SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 198
 199   fDetTypeSim   = new AliITSDetTypeSim();
 200   //PH  SetMarkerColor(kRed);
 201   if(!fLoader) MakeLoader(AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
 202   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 203
 204 }
 205 //______________________________________________________________________
 206 AliITS::~AliITS(){
 207     // Default destructor for ITS.
 208     //     The default destructor of the AliITS class. In addition to deleting
 209     // the AliITS class it deletes the memory pointed to by
 210     // fIdSens, fIdName, fDetTypeSim and it's contents.
 211     // Inputs:
 212     //      none.
 213     // Outputs:
 214     //      none.
 215     // Return:
 216     //      none.
 217
 218     if (fHits) {
 219       fHits->Delete();
 220       delete fHits;
 221       fHits=0;
 222     }
 223     if(fITSmodules) {
 224         this->ClearModules();
 225         delete fITSmodules;
 226         fITSmodules = 0;
 227     }// end if fITSmodules!=0
 228
 229     delete[] fIdName;  // Array of TStrings
 230     delete[] fIdSens;
 231     Int_t size   = AliITSgeomTGeo::GetNModules();
 232     if (fDetTypeSim){
 233       delete fDetTypeSim;
 234       fDetTypeSim = 0;
 235     }
 236     if(fSimuParam){
 237       delete fSimuParam;
 238       fSimuParam=0;
 239     }
 240     if(fModA){
 241       if(size>0){
 242         for(Int_t j=0; j<size; j++){
 243           fModA[j]->Delete();
 244           delete fModA[j];
 245         }
 246       }
 247       delete []fModA;
 248     }
 249     if(fpSDigits){
 250       fpSDigits->Delete();
 251       delete fpSDigits;
 252     }
 253 }
 254
 255 //______________________________________________________________________
 256 void AliITS::Init(){
 257     // Initializer ITS after it has been built
 258     //     This routine initializes the AliITS class. It is intended to be
 259     // called from the Init function in AliITSv?. Besides displaying a banner
 260     // indicating that it has been called it initializes the array fIdSens
 261     // and sets the default segmentation, response, digit and raw cluster
 262     // classes therefore it should be called after a call to CreateGeometry.
 263     // Inputs:
 264     //      none.
 265     // Outputs:
 266     //      none.
 267     // Return:
 268     //      none.
 269     Int_t i;
 270     // Array of TStrings
 271     if(gMC) for(i=0;i<fIdN;i++) fIdSens[i] = gMC->VolId(fIdName[i]);
 272
 273 }
 274 //______________________________________________________________________
 275 void AliITS::SetDefaults(){
 276     // sets the default segmentation, response, digit and raw cluster classes.
 277     // Inputs:
 278     //      none.
 279     // Outputs:
 280     //      none.
 281     // Return:
 282     //      none.
 283     AliInfoClass("AliITS::Setting Defaults");
 284     if(!fDetTypeSim) {
 285      Error("SetDefaults()","fDetTypeSim is 0!");
 286      return;
 287     }
 288
 289     fDetTypeSim->SetDefaults();
 290     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 291
 292 }
 293 //______________________________________________________________________
 294 void AliITS::SetDefaultSimulation(){
 295     // sets the default simulation.
 296     // Inputs:
 297     //      none.
 298     // Outputs:
 299     //      none.
 300     // Return:
 301     //      none.
 302     if(!fDetTypeSim) {
 303      Error("SetDefaultSimulation()","fDetTypeSim is 0!");
 304      return;
 305     }
 306
 307     fDetTypeSim->SetDefaultSimulation();
 308     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 309
 310 }
 311
 312
 313 //______________________________________________________________________
 314 void AliITS::MakeBranch(Option_t* option){
 315     // Creates Tree branches for the ITS.
 316     // Inputs:
 317     //      Option_t *option    String of Tree types S,D, and/or R.
 318     //      const char *file    String of the file name where these branches
 319     //                          are to be stored. If blank then these branches
 320     //                          are written to the same tree as the Hits were
 321     //                          read from.
 322     // Outputs:
 323     //      none.
 324     // Return:
 325     //      none.
 326   if(!fDetTypeSim) {
 327     Error("MakeBranch","fDetTypeSim is 0!");
 328     return;
 329   }
 330
 331   Bool_t cH = (strstr(option,"H")!=0);
 332   Bool_t cS = (strstr(option,"S")!=0);
 333   Bool_t cD = (strstr(option,"D")!=0);
 334
 335   if(cH && (fHits == 0x0)) fHits = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
 336   AliDetector::MakeBranch(option);
 337
 338   if(cS) MakeBranchS(0);
 339   if(cD) MakeBranchD(0);
 340
 341
 342 }
 343 //___________________________________________________________________
 344 void AliITS::MakeBranchS(const char* fl){
 345
 346   // Creates Tree Branch for the ITS summable digits.
 347   // Inputs:
 348   //      cont char *fl  File name where SDigits branch is to be written
 349   //                     to. If blank it write the SDigits to the same
 350   //                     file in which the Hits were found.
 351
 352
 353   if(!fDetTypeSim){
 354     Error("MakeBranchS","fDetTypeSim is 0!");
 355   }
 356   Int_t buffersize = 4000;
 357   char branchname[31];
 358
 359   // only one branch for SDigits.
 360   snprintf(branchname,30,"%s",GetName());
 361
 362   if(fLoader->TreeS()){
 363     TClonesArray* sdig = (TClonesArray*)fDetTypeSim->GetSDigits();
 364     MakeBranchInTree(fLoader->TreeS(),branchname,&sdig,buffersize,fl);
 365   }
 366 }
 367 //______________________________________________________________________
 368 void AliITS::MakeBranchD(const char* file){
 369
 370   //Make branch for digits
 371   if(!fDetTypeSim) {
 372     Warning("MakeBranchD","fDetTypeSim is 0!");
 373     return;
 374   }
 375   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 376   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 377   MakeBranchInTreeD(fLoader->TreeD(),file);
 378 }
 379
 380 //___________________________________________________________________
 381 void AliITS:: MakeBranchInTreeD(TTree* treeD, const char* file){
 382   // Creates Tree branches for the ITS.
 383
 384   if(!fDetTypeSim){
 385     Error("MakeBranchS","fDetTypeSim is 0!");
 386   }
 387   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 388   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 389
 390   const Char_t *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 391   const Char_t* digclass;
 392   Int_t buffersize = 4000;
 393   Char_t branchname[31];
 394
 395   if(!fDetTypeSim->GetDigits()){
 396     fDetTypeSim->SetDigits(new TObjArray(fgkNTYPES));
 397   }
 398   for(Int_t i=0;i<fgkNTYPES;i++){
 399     digclass = fDetTypeSim->GetDigitClassName(i);
 400     TString classn = digclass;
 401     if(!((fDetTypeSim->GetDigits())->At(i))){
 402       (fDetTypeSim->GetDigits())->AddAt(new TClonesArray(classn.Data(),1000),i);
 403     }
 404     else ResetDigits(i);
 405     if(fgkNTYPES==3) snprintf(branchname,30,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
 406     else sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
 407     TObjArray* dig = DigitsAddress(i);
 408     if(GetDigits() && treeD) AliDetector::MakeBranchInTree(treeD,branchname, &dig,buffersize,file);
 409   }
 410
 411 }
 412 //______________________________________________________________________
 413 void AliITS::SetTreeAddress(){
 414     // Set branch address for the Trees.
 415     // Inputs:
 416     //      none.
 417     // Outputs:
 418     //      none.
 419     // Return:
 420     //      none.
 421
 422   if(!fDetTypeSim) {
 423     Error("SetTreeAddress","fDetTypeSim is 0!");
 424     return;
 425   }
 426
 427   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 428   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 429
 430   TTree *treeS = fLoader->TreeS();
 431   TTree *treeD = fLoader->TreeD();
 432   if (fLoader->TreeH() && (fHits == 0x0)) {
 433       fHits = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
 434   }
 435   AliDetector::SetTreeAddress();
 436
 437   fDetTypeSim->SetTreeAddressS(treeS, (Char_t*)GetName());
 438   fDetTypeSim->SetTreeAddressD(treeD, (Char_t*)GetName());
 439 }
 440 //______________________________________________________________________
 441 void AliITS::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits){
 442     // Add an ITS hit
 443     //     The function to add information to the AliITShit class. See the
 444     // AliITShit class for a full description. This function allocates the
 445     // necessary new space for the hit information and passes the variable
 446     // track, and the pointers *vol and *hits to the AliITShit constructor
 447     // function.
 448     // Inputs:
 449     //      Int_t   track   Track number which produced this hit.
 450     //      Int_t   *vol    Array of Integer Hit information. See AliITShit.h
 451     //      Float_t *hits   Array of Floating Hit information.  see AliITShit.h
 452     // Outputs:
 453     //      none.
 454     // Return:
 455     //      none.
 456   TClonesArray &lhits = *fHits;
 457   new(lhits[fNhits++]) AliITShit(fIshunt,track,vol,hits);
 458 }
 459
 460 //______________________________________________________________________
 461 void AliITS::FillModules(Int_t /* evnt */,Int_t bgrev,Int_t /* nmodules */,
 462                          Option_t *option, const char *filename){
 463   // fill the modules with the sorted by module hits; add hits from
 464   // background if option=Add.
 465
 466   static TTree *trH1;                 //Tree with background hits
 467   static Bool_t first=kTRUE;
 468   static TFile *file;
 469   const char *addBgr = strstr(option,"Add");
 470
 471   if (addBgr ) {
 472     if(first) {
 473       file=new TFile(filename);
 474     } // end if first
 475     first=kFALSE;
 476     file->cd();
 477     file->ls();
 478     // Get Hits Tree header from file
 479     if(trH1) delete trH1;
 480     trH1=0;
 481
 482     char treeName[21];
 483     snprintf(treeName,20,"TreeH%d",bgrev);
 484     trH1 = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 485     if (!trH1) {
 486       Error("FillModules","cannot find Hits Tree for event:%d",bgrev);
 487     } // end if !trH1
 488     // Set branch addresses
 489   } // end if addBgr
 490
 491   FillModules(fLoader->TreeH(),0); // fill from this file's tree.
 492
 493   if (addBgr ) {
 494     FillModules(trH1,10000000); // Default mask 10M.
 495     TTree *fAli=fLoader->GetRunLoader()->TreeK();
 496     TFile *fileAli=0;
 497     if (fAli) {
 498       fileAli =fAli->GetCurrentFile();
 499       fileAli->cd();
 500     }
 501   } // end if add
 502
 503
 504 }
 505 //______________________________________________________________________
 506 void AliITS::FillModules(TTree *treeH, Int_t mask) {
 507     // fill the modules with the sorted by module hits;
 508     // can be called many times to do a merging
 509     // Inputs:
 510     //      TTree *treeH  The tree containing the hits to be copied into
 511     //                    the modules.
 512     //      Int_t mask    The track number mask to indecate which file
 513     //                    this hits came from.
 514     // Outputs:
 515     //      none.
 516     // Return:
 517     //      none.
 518
 519     if (treeH == 0x0)
 520      {
 521        AliError("Tree H  is NULL");
 522        return;
 523      }
 524     Int_t lay,lad,det,index;
 525     AliITShit *itsHit=0;
 526     AliITSmodule *mod=0;
 527     char branchname[21];
 528     snprintf(branchname,20,"%s",GetName());
 529     TBranch *branch = treeH->GetBranch(branchname);
 530     if (!branch) {
 531         Error("FillModules","%s branch in TreeH not found",branchname);
 532         return;
 533     } // end if !branch
 534     branch->SetAddress(&fHits);
 535     Int_t nTracks =(Int_t) treeH->GetEntries();
 536     Int_t iPrimTrack,h;
 537     for(iPrimTrack=0; iPrimTrack<nTracks; iPrimTrack++){
 538         ResetHits();
 539         Int_t nBytes = treeH->GetEvent(iPrimTrack);
 540         if (nBytes <= 0) continue;
 541         Int_t nHits = fHits->GetEntriesFast();
 542         for(h=0; h<nHits; h++){
 543             itsHit = (AliITShit *)fHits->UncheckedAt(h);
 544             itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
 545             if (GetITSgeom()) {
 546                 index = GetITSgeom()->GetModuleIndex(lay,lad,det);
 547             } else {
 548                 index=det-1; // This should not be used.
 549             } // end if [You must have fITSgeom for this to work!]
 550             mod = GetModule(index);
 551             itsHit->SetTrack(itsHit->GetTrack()+mask); // Set track mask.
 552             mod->AddHit(itsHit,iPrimTrack,h);
 553         } // end loop over hits
 554     } // end loop over tracks
 555 }
 556
 557 //______________________________________________________________________
 558 Bool_t AliITS::InitModules(Int_t size,Int_t &nmodules){
 559     // Initialize the modules array.
 560     // Inputs:
 561     //      Int_t size  Size of array of the number of modules to be
 562     //                  created. If size <=0 then the number of modules
 563     //                  is gotten from AliITSgeom class kept in fITSgeom.
 564     // Outputs:
 565     //      Int_t &nmodules The number of modules existing.
 566     // Return:
 567     //      none.
 568
 569     if(fITSmodules){
 570         fITSmodules->Delete();
 571         delete fITSmodules;
 572     } // end fir fITSmoudles
 573
 574     if(!fDetTypeSim) {
 575       Error("InitModules","fDetTypeSim is null!");
 576       return kFALSE;
 577     }
 578     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 579
 580     Int_t nl,indexMAX,index;
 581
 582     if(size<=0){ // default to using data stored in AliITSgeom
 583         if(fDetTypeSim->GetITSgeom()==0) {
 584             Error("InitModules","fITSgeom not defined");
 585             return kFALSE;
 586         } // end if fITSgeom==0
 587         nl = fDetTypeSim->GetITSgeom()->GetNlayers();
 588         indexMAX = fDetTypeSim->GetITSgeom()->GetIndexMax();
 589         nmodules = indexMAX;
 590         fITSmodules = new TObjArray(indexMAX);
 591         for(index=0;index<indexMAX;index++){
 592             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 593         } // end for index
 594     }else{
 595         fITSmodules = new TObjArray(size);
 596         for(index=0;index<size;index++) {
 597             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 598         } // end for index
 599
 600         nmodules = size;
 601     } // end i size<=0
 602     return kTRUE;
 603 }
 604 //______________________________________________________________________
 605 void AliITS::Hits2SDigits(){
 606     // Standard Hits to summable Digits function.
 607     // Inputs:
 608     //      none.
 609     // Outputs:
 610     //      none.
 611
 612
 613    if(!fDetTypeSim) {
 614      Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is null!");
 615      return;
 616   }
 617
 618   SetDefaults();
 619   fLoader->LoadHits("read");
 620   fLoader->LoadSDigits("recreate");
 621   AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader();
 622   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 623   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 624
 625   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < rl->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
 626         // Do the Hits to Digits operation. Use Standard input values.
 627         // Event number from file, no background hit merging , use size from
 628         // AliITSgeom class, option="All", input from this file only.
 629     rl->GetEvent(iEvent);
 630     if (!fLoader->TreeS()) fLoader->MakeTree("S");
 631     MakeBranch("S");
 632     SetTreeAddress();
 633     HitsToPreDigits(iEvent,0,-1," ",fOpt," ");
 634   } // end for iEvent
 635
 636   fLoader->UnloadHits();
 637   fLoader->UnloadSDigits();
 638
 639 }
 640 //______________________________________________________________________
 641 void AliITS::Hits2Digits(){
 642
 643   //Conversion from hits to digits
 644   if(!fDetTypeSim) {
 645     Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is 0!");
 646     return;
 647   }
 648
 649   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 650   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 651   SetDefaults();
 652
 653   fLoader->LoadHits("read");
 654   fLoader->LoadDigits("recreate");
 655   AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader();
 656   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < rl->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
 657     rl->GetEvent(iEvent);
 658     if (!fLoader->TreeD()) fLoader->MakeTree("D");
 659     MakeBranch("D");
 660     SetTreeAddress();
 661     HitsToDigits(iEvent,0,-1," ",fOpt," ");
 662   }
 663
 664   fLoader->UnloadHits();
 665   fLoader->UnloadDigits();
 666
 667 }
 668
 669 //______________________________________________________________________
 670 void AliITS::HitsToDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
 671                           Option_t *option,Option_t *opt,
 672                           const char *filename){
 673     //   Keep galice.root for signal and name differently the file for
 674     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
 675     // the condition below will disappear when the geom class will be
 676     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
 677     // 7 is the SDD beam test version.
 678     // Inputs:
 679     //      Int_t evnt       Event to be processed.
 680     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
 681     //      Int_t nmodules   Not used.
 682     //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
 683     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
 684     //                       background hits are considered.
 685     //      Test_t *filename File name containing the background hits..
 686     // Outputs:
 687     //      none.
 688     // Return:
 689     //      none.
 690
 691   if(!fDetTypeSim) {
 692     Error("HitsToDigits","fDetTypeSim is null!");
 693     return;
 694   }
 695   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 696   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 697   if(!GetITSgeom()) return; // need transformations to do digitization.
 698   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
 699
 700   const char *all = strstr(opt,"All");
 701   const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
 702                         strstr(opt,"SSD")};
 703   static Bool_t setDef=kTRUE;
 704   if (setDef) SetDefaultSimulation();
 705   setDef=kFALSE;
 706
 707   Int_t nmodules;
 708   InitModules(size,nmodules);
 709   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
 710
 711   // Reset Fast-OR signals for this event
 712   fDetTypeSim->ResetFOSignals();
 713
 714   AliITSsimulation *sim      = 0;
 715   AliITSmodule     *mod      = 0;
 716   Int_t id;
 717   for(Int_t module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
 718     id       = geom->GetModuleType(module);
 719     if (!all && !det[id]) continue;
 720     sim      = (AliITSsimulation*)fDetTypeSim->GetSimulationModel(id);
 721     if (!sim) {
 722       Error("HitsToDigits","The simulation class was not "
 723             "instanciated for module %d type %s!",module,
 724             geom->GetModuleTypeName(module));
 725       exit(1);
 726     } // end if !sim
 727     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
 728     sim->DigitiseModule(mod,module,evNumber);
 729     // fills all branches - wasted disk space
 730     fLoader->TreeD()->Fill();
 731     ResetDigits();
 732   } // end for module
 733
 734   ClearModules();
 735
 736   // Add random noise to FO signals
 737   if (all || det[0]) { // SPD present
 738     fDetTypeSim->ProcessNoiseForFastOr();
 739   }
 740
 741   // Add Fast-OR signals to event (only one object per event)
 742   if (all || det[0]) { // SPD present
 743     fDetTypeSim->WriteFOSignals();
 744   }
 745
 746
 747   fLoader->TreeD()->GetEntries();
 748   fLoader->TreeD()->AutoSave();
 749   // reset tree
 750   fLoader->TreeD()->Reset();
 751 }
 752 //_____________________________________________________________________
 753 void AliITS::Hits2PreDigits(){
 754   // Turn hits into SDigits
 755
 756   if(!fDetTypeSim) {
 757     Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is 0!");
 758     return;
 759   }
 760
 761   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 762   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 763   SetDefaults();
 764
 765   HitsToPreDigits(fLoader->GetRunLoader()->GetEventNumber(),
 766                   0,-1," ",fOpt," ");
 767 }
 768
 769 //______________________________________________________________________
 770 void AliITS::HitsToPreDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
 771                              Option_t *option,Option_t *opt,
 772                              const char *filename){
 773     //   Keep galice.root for signal and name differently the file for
 774     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
 775     // the condition below will disappear when the geom class will be
 776     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
 777     // 7 is the SDD beam test version.
 778     // Inputs:
 779     //      Int_t evnt       Event to be processed.
 780     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
 781     //      Int_t nmodules   Not used.
 782     //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
 783     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
 784     //                       background hits are considered.
 785     //      Test_t *filename File name containing the background hits..
 786     // Outputs:
 787     //      none.
 788     // Return:
 789     //      none.
 790
 791
 792   if(!fDetTypeSim) {
 793     Error("HitsToPreDigits","fDetTypeSim is null!");
 794     return;
 795   }
 796   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 797   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 798
 799   if(!GetITSgeom()){
 800     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
 801     return; // need transformations to do digitization.
 802   }
 803   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
 804
 805   const char *all = strstr(opt,"All");
 806   const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
 807                         strstr(opt,"SSD")};
 808   static Bool_t setDef=kTRUE;
 809   if (setDef) SetDefaultSimulation();
 810   setDef=kFALSE;
 811
 812   Int_t nmodules;
 813   InitModules(size,nmodules);
 814   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
 815
 816
 817   AliITSsimulation *sim      = 0;
 818   AliITSmodule     *mod      = 0;
 819   Int_t id,module;
 820   for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
 821     id       = geom->GetModuleType(module);
 822     if (!all && !det[id]) continue;
 823     sim      = (AliITSsimulation*)GetSimulationModel(id);
 824     if (!sim) {
 825       Error("HitsToPreDigits","The simulation class was not "
 826             "instanciated for module %d type %s!",module,
 827             geom->GetModuleTypeName(module));
 828       exit(1);
 829     } // end if !sim
 830     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
 831     sim->SDigitiseModule(mod,module,evNumber);
 832     // fills all branches - wasted disk space
 833     fLoader->TreeS()->Fill();
 834     fDetTypeSim->ResetSDigits();
 835   } // end for module
 836
 837   ClearModules();
 838
 839
 840   fLoader->TreeS()->GetEntries();
 841   fLoader->TreeS()->AutoSave();
 842   fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
 843   // reset tree
 844   fLoader->TreeS()->Reset();
 845 }
 846
 847 //_____________________________________________________________________
 848 void AliITS::HitsToFastRecPoints(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
 849                                   Option_t *opt0,Option_t *opt1,
 850                                  const char *flnm){
 851     // keep galice.root for signal and name differently the file for
 852     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
 853     // the condition below will disappear when the geom class will be
 854     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
 855     // Inputs:
 856     //      Int_t evnt       Event to be processed.
 857     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
 858     //      Int_t size       Size used by InitModules. See InitModules.
 859     //      Option_t *opt0   Option passed to FillModules. See FillModules.
 860     //      Option_t *opt1   String indicating if merging hits or not. To
 861     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
 862     //                       background hits are considered.
 863     //      Test_t *flnm     File name containing the background hits..
 864     // Outputs:
 865     //      none.
 866     // Return:
 867     //      none.
 868
 869
 870
 871   if(!GetITSgeom()){
 872     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
 873     return; // need transformations to do digitization.
 874   }
 875   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
 876
 877   AliITSLoader *pITSloader = (AliITSLoader*)fLoader;
 878
 879   const char *all = strstr(opt1,"All");
 880   const char *det[3] ={strstr(opt1,"SPD"),strstr(opt1,"SDD"),
 881                        strstr(opt1,"SSD")};
 882   Int_t nmodules;
 883   InitModules(size,nmodules);
 884   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,opt0,flnm);
 885
 886   AliITSsimulation *sim      = 0;
 887   AliITSmodule     *mod      = 0;
 888   Int_t id,module;
 889
 890   TTree *lTR = pITSloader->TreeR();
 891   if(!lTR) {
 892     pITSloader->MakeTree("R");
 893     lTR = pITSloader->TreeR();
 894   }
 895
 896   TClonesArray* ptarray = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
 897   TBranch* branch = (TBranch*)lTR->Branch("ITSRecPointsF",&ptarray);
 898   branch->SetAddress(&ptarray);
 899   //m.b. : this change is nothing but a nice way to make sure
 900   //the CPU goes up !
 901   for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
 902     id       = geom->GetModuleType(module);
 903     if (!all && !det[id]) continue;
 904     sim      = (AliITSsimulation*)GetSimulationModel(id);
 905     if (!sim) {
 906       Error("HitsToFastPoints","The simulation class was not "
 907             "instantiated for module %d type %s!",module,
 908             geom->GetModuleTypeName(module));
 909       exit(1);
 910     } // end if !sim
 911     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
 912     sim->CreateFastRecPoints(mod,module,gRandom,ptarray);
 913     lTR->Fill();
 914     ptarray->Clear();
 915   } // end for module
 916
 917   ClearModules();
 918   fLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 919   delete ptarray;
 920 }
 921 //_____________________________________________________________________
 922 Int_t AliITS::Hits2Clusters(TTree *hTree, TTree *cTree) {
 923   //------------------------------------------------------------
 924   // This function creates ITS clusters
 925   //------------------------------------------------------------
 926   if(!GetITSgeom()){
 927     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
 928     return 1; // need transformations to do digitization.
 929   }
 930   AliITSgeom *geom=GetITSgeom();
 931   Int_t mmax=geom->GetIndexMax();
 932
 933   InitModules(-1,mmax);
 934   FillModules(hTree,0);
 935
 936   TClonesArray *points = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
 937   TBranch *branch=cTree->GetBranch("ITSRecPoints");
 938   if (!branch) cTree->Branch("ITSRecPoints",&points);
 939   else branch->SetAddress(&points);
 940
 941   AliITSsimulationFastPoints sim;
 942   Int_t ncl=0;
 943   for (Int_t m=0; m<mmax; m++) {
 944     AliITSmodule *mod=GetModule(m);
 945     sim.CreateFastRecPoints(mod,m,gRandom,points);
 946     ncl+=points->GetEntriesFast();
 947     cTree->Fill();
 948     points->Clear();
 949   }
 950
 951   AliDebug(1,Form("Number of found fast clusters : %d",ncl));
 952
 953   //cTree->Write();
 954
 955   delete points;
 956   return 0;
 957 }
 958
 959 //_____________________________________________________________________
 960 void AliITS::CheckLabels(Int_t lab[3]) const {
 961   //------------------------------------------------------------
 962   // Tries to find mother's labels
 963   //------------------------------------------------------------
 964
 965   if(lab[0]<0 && lab[1]<0 && lab[2]<0) return; // In case of no labels just exit
 966
 967   Int_t ntracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
 968   for (Int_t i=0;i<3;i++){
 969     Int_t label = lab[i];
 970     if (label>=0 && label<ntracks) {
 971       TParticle *part=(TParticle*)gAlice->GetMCApp()->Particle(label);
 972       if (part->P() < 0.005) {
 973         Int_t m=part->GetFirstMother();
 974         if (m<0) {
 975           continue;
 976         }
 977         if (part->GetStatusCode()>0) {
 978           continue;
 979         }
 980         lab[i]=m;
 981       }
 982     }
 983   }
 984
 985 }
 986
 987 //______________________________________________________________________
 988 void AliITS::SDigitsToDigits(Option_t *opt){
 989   // Standard Summable digits to Digits function.
 990   // Inputs:
 991   //      none.
 992   // Outputs:
 993   //      none.
 994   if (!fDetTypeSim) {
 995     AliError("fDetTypeSim is 0!");
 996     return;
 997   }
 998
 999   const char *all = strstr(opt,"All");
1000   const char *det[3] ={strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
1001                        strstr(opt,"SSD")};
1002
1003   // Reset Fast-OR signals for this event
1004   fDetTypeSim->ResetFOSignals();
1005
1006   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
1007   SetDefaults();
1008   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
1009   fDetTypeSim->SDigitsToDigits(opt,(Char_t*)GetName());
1010
1011   // Add random noise to FO signals
1012   if (all || det[0]) { // SPD present
1013     fDetTypeSim->ProcessNoiseForFastOr();
1014   }
1015   // Add Fast-OR signals to event (only one object per event)
1016   if (all || det[0]) { // SPD present
1017     fDetTypeSim->WriteFOSignals();
1018   }
1019 }
1020
1021 //______________________________________________________________________
1022 void AliITS::ResetDigits(){
1023     // Reset number of digits and the digits array for the ITS detector.
1024     // Inputs:
1025     //      none.
1026     // Outputs:
1027     //      none.
1028     if(!fDetTypeSim) {
1029       Error("ResetDigits","fDetTypeSim is 0!");
1030       return;
1031     }
1032
1033     fDetTypeSim->ResetDigits();
1034
1035
1036 }
1037 //______________________________________________________________________
1038 void AliITS::ResetDigits(Int_t branch){
1039     // Reset number of digits and the digits array for this branch.
1040     // Inputs:
1041     //      none.
1042     // Outputs:
1043     //      none.
1044
1045     if(!fDetTypeSim) {
1046       Error("ResetDigits","fDetTypeSim is 0!");
1047       return;
1048     }
1049
1050     fDetTypeSim->ResetDigits(branch);
1051
1052 }
1053 //______________________________________________________________________
1054 void AliITS::AddSumDigit(AliITSpListItem &sdig){
1055     // Adds the a module full of summable digits to the summable digits tree.
1056     // Inputs:
1057     //      AliITSpListItem &sdig   SDigit to be added to SDigits tree.
1058     // Outputs:
1059     //      none.
1060     // Return:
1061     //      none.
1062
1063     if(!fDetTypeSim) {
1064       Error("AddSumDigit","fDetTypeSim is 0!");
1065       return;
1066     }
1067     fDetTypeSim->AddSumDigit(sdig);
1068
1069 }
1070 //______________________________________________________________________
1071 void AliITS::AddSimDigit(Int_t branch, AliITSdigit *d){
1072     //    Add a simulated digit.
1073     // Inputs:
1074     //      Int_t id        Detector type number.
1075     //      AliITSdigit *d  Digit to be added to the Digits Tree. See
1076     //                      AliITSdigit.h
1077     // Outputs:
1078     //      none.
1079     // Return:
1080     //      none.
1081
1082     if(!fDetTypeSim) {
1083       Error("AddSimDigit","fDetTypeSim is 0!");
1084       return;
1085     }
1086     fDetTypeSim->AddSimDigit(branch,d);
1087
1088 }
1089 //______________________________________________________________________
1090 void AliITS::AddSimDigit(Int_t branch,Float_t phys,Int_t *digits,Int_t *tracks,
1091                          Int_t *hits,Float_t *charges, Int_t sigexpanded){
1092   //   Add a simulated digit to the list.
1093   // Inputs:
1094   //      Int_t id        Detector type number.
1095   //      Float_t phys    Physics indicator. See AliITSdigits.h
1096   //      Int_t *digits   Integer array containing the digits info. See
1097   //                      AliITSdigit.h
1098   //      Int_t *tracks   Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()]
1099   //                      containing the track numbers that contributed to
1100   //                      this digit.
1101   //      Int_t *hits     Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()]
1102   //                      containing the hit numbers, from AliITSmodule, that
1103   //                      contributed to this digit.
1104   //      Float_t *charge Floating point array of the signals contributed
1105   //                      to this digit by each track.
1106   // Outputs:
1107   //      none.
1108   // Return:
1109   //      none.
1110
1111     if(!fDetTypeSim) {
1112       Error("AddSimDigit","fDetTypeSim is 0!");
1113       return;
1114     }
1115     fDetTypeSim->AddSimDigit(branch,phys,digits,tracks,hits,charges,sigexpanded);
1116
1117 }
1118 //______________________________________________________________________
1119 void AliITS::Digits2Raw(){
1120     // convert digits of the current event to raw data
1121
1122   if(!fDetTypeSim) {
1123     Error("Digits2Raw","fDetTypeSim is 0!");
1124     return;
1125   }
1126   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
1127   SetDefaults();
1128   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
1129   fDetTypeSim->GetLoader()->LoadDigits();
1130   TTree* digits = fDetTypeSim->GetLoader()->TreeD();
1131   if (!digits) {
1132       Error("Digits2Raw", "no digits tree");
1133       return;
1134   }
1135   fDetTypeSim->SetTreeAddressD(digits,(Char_t*)GetName());
1136
1137    // Get the FO signals for this event
1138   AliITSFOSignalsSPD* foSignals = NULL;
1139   AliRunLoader* runLoader = AliRunLoader::Instance();
1140   AliITSLoader* itsLoader = (AliITSLoader*) runLoader->GetLoader("ITSLoader");
1141   if (!itsLoader) {
1142     AliError("ITS loader is NULL.");
1143   }
1144    else {
1145       if(!itsLoader->TreeD()) AliError("   !!! No TreeD available !!!");
1146       foSignals = (AliITSFOSignalsSPD*)itsLoader->TreeD()->GetUserInfo()->FindObject("AliITSFOSignalsSPD");
1147       if(!foSignals) AliError("FO signals not retrieved");
1148      }
1149
1150   Bool_t deleteFOsignalsLater = kFALSE;
1151   if (!foSignals) {
1152     AliError("FO signals not available. No FO bits will be written.");
1153     foSignals = new AliITSFOSignalsSPD(); // make a temporary dummy signals object
1154     deleteFOsignalsLater = kTRUE;
1155   }
1156
1157
1158   AliITSDDLModuleMapSDD* ddlsdd=fDetTypeSim->GetDDLModuleMapSDD();
1159   Char_t rawSDD=fDetTypeSim->GetSimuParam()->GetSDDRawDataFormat();
1160   AliITSDDLRawData rawWriter;
1161
1162   rawWriter.SetSDDRawFormat(rawSDD);
1163   //Verbose level
1164   // 0: Silent
1165   // 1: cout messages
1166   // 2: txt files with digits
1167   //BE CAREFUL, verbose level 2 MUST be used only for debugging and
1168   //it is highly suggested to use this mode only for debugging digits files
1169   //reasonably small, because otherwise the size of the txt files can reach
1170   //quickly several MB wasting time and disk space.
1171   rawWriter.SetVerbose(0);
1172
1173   //SILICON PIXEL DETECTOR
1174   AliDebug(1,"Formatting raw data for SPD");
1175   rawWriter.RawDataSPD(digits->GetBranch("ITSDigitsSPD"),foSignals);
1176   if(deleteFOsignalsLater) delete foSignals;
1177
1178   //SILICON DRIFT DETECTOR
1179   AliDebug(1,Form("Formatting raw data for SDD - Format code =%d",rawSDD));
1180   rawWriter.RawDataSDD(digits->GetBranch("ITSDigitsSDD"),ddlsdd);
1181
1182   //SILICON STRIP DETECTOR
1183   AliDebug(1,"Formatting raw data for SSD");
1184   rawWriter.RawDataSSD(digits->GetBranch("ITSDigitsSSD"));
1185
1186   fLoader->UnloadDigits();
1187 }
1188 //______________________________________________________________________
1189 AliLoader* AliITS::MakeLoader(const char* topfoldername){
1190     //builds ITSgetter (AliLoader type)
1191     //if detector wants to use castomized getter, it must overload this method
1192
1193     AliDebug(1,Form("Creating AliITSLoader. Top folder is %s.",
1194          topfoldername));
1195     fLoader = new AliITSLoader(GetName(),topfoldername);
1196     return fLoader;
1197 }
1198 //______________________________________________________________________
1199 Bool_t AliITS::Raw2SDigits(AliRawReader* rawReader)
1200 {
1201   //
1202   // Converts RAW data to SDigits
1203   //
1204   // Get TreeS
1205   //
1206   Int_t last   = -1;
1207   Int_t size   = AliITSgeomTGeo::GetNModules();
1208   if(!fModA) {
1209     fModA = new TClonesArray*[size];
1210     for (Int_t mod = 0; mod < size; mod++) fModA[mod] = new TClonesArray("AliITSpListItem", 10000);
1211   }
1212   AliLoader* loader =  (AliRunLoader::Instance())->GetLoader("ITSLoader");
1213   if (!loader){
1214     Error("Open","Can not get ITS loader from Run Loader");
1215     return kFALSE;
1216   }
1217
1218   TTree* tree = 0;
1219   tree = loader->TreeS();
1220   if (!tree){
1221     loader->MakeTree("S");
1222     tree = loader->TreeS();
1223   }
1224   //
1225   // Array for SDigits
1226   //
1227   if(!fpSDigits){
1228     fpSDigits = new TClonesArray("AliITSpListItem",10000);
1229   }
1230   TClonesArray& aSDigits = *fpSDigits;
1231   Int_t bufsize = 32000;
1232   tree->Branch("ITS", &fpSDigits, bufsize);
1233   Int_t npx = 0;
1234   //
1235   // SPD
1236   //
1237   AliITSsegmentationSPD* segSPD = (AliITSsegmentationSPD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(0);
1238   if(!segSPD){
1239     AliWarning("Set AliITS defaults");
1240     SetDefaults();
1241     segSPD = (AliITSsegmentationSPD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(0);
1242   }
1243   npx = segSPD->Npx();
1244   Double_t thr, sigma;
1245
1246   AliITSRawStreamSPD inputSPD(rawReader);
1247   while(1){
1248     Bool_t next  = inputSPD.Next();
1249     if (!next) break;
1250
1251     Int_t module = inputSPD.GetModuleID();
1252     Int_t column = inputSPD.GetColumn();
1253     Int_t row    = inputSPD.GetRow();
1254     Int_t index  = npx * column + row;
1255
1256     if (module >= size) continue;
1257
1258     last = (fModA[module])->GetEntries();
1259     TClonesArray& dum = *fModA[module];
1260     fDetTypeSim->GetSimuParam()->SPDThresholds(module,thr,sigma);
1261     thr += 1.;
1262     new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, thr);
1263   }
1264   rawReader->Reset();
1265
1266   //
1267   // SDD
1268   //
1269   AliITSsegmentationSDD* segSDD = (AliITSsegmentationSDD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(1);
1270   npx = segSDD->Npx();
1271   Int_t scalef=AliITSsimulationSDD::ScaleFourier(segSDD);
1272   Int_t firstSDD=AliITSgeomTGeo::GetModuleIndex(3,1,1);
1273   Int_t firstSSD=AliITSgeomTGeo::GetModuleIndex(5,1,1);
1274
1275   AliITSRawStream* inputSDD=AliITSRawStreamSDD::CreateRawStreamSDD(rawReader);
1276   for(Int_t iMod=firstSDD; iMod<firstSSD; iMod++){
1277     AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)fDetTypeSim->GetCalibrationModel(iMod);
1278     Bool_t isZeroSupp=cal->GetZeroSupp();
1279     if(isZeroSupp){
1280       for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD->SetZeroSuppLowThreshold(iMod-firstSDD,iSid,cal->GetZSLowThreshold(iSid));
1281     }else{
1282       for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD->SetZeroSuppLowThreshold(iMod-firstSDD,iSid,0);
1283     }
1284   }
1285
1286   AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap=fDetTypeSim->GetDDLModuleMapSDD();
1287   inputSDD->SetDDLModuleMap(ddlmap);
1288   while(inputSDD->Next()){
1289     if(inputSDD->IsCompletedModule()==kFALSE &&
1290        inputSDD->IsCompletedDDL()==kFALSE){
1291
1292       Int_t module = inputSDD->GetModuleID();
1293       Int_t anode  = inputSDD->GetCoord1()+segSDD->NpzHalf()*inputSDD->GetChannel();
1294       Int_t time   = inputSDD->GetCoord2();
1295       Int_t signal10 = inputSDD->GetSignal();
1296       Int_t index = AliITSpList::GetIndex(anode,time,scalef*npx);
1297
1298       if (module >= size) continue;
1299       last = fModA[module]->GetEntries();
1300       TClonesArray& dum = *fModA[module];
1301       new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, Double_t(signal10));
1302       ((AliITSpListItem*) dum.At(last))->AddSignalAfterElect(module, index, Double_t(signal10));
1303     }
1304   }
1305   delete inputSDD;
1306   rawReader->Reset();
1307
1308   //
1309   // SSD
1310   //
1311   AliITSsegmentationSSD* segSSD = (AliITSsegmentationSSD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(2);
1312   npx = segSSD->Npx();
1313   AliITSRawStreamSSD inputSSD(rawReader);
1314   while(1){
1315     Bool_t next  = inputSSD.Next();
1316     if (!next) break;
1317
1318     Int_t module  = inputSSD.GetModuleID();
1319     if(module<0)AliError(Form("Invalid SSD  module %d \n",module));
1320     if(module<0)continue;
1321     Int_t side    = inputSSD.GetSideFlag();
1322     Int_t strip   = inputSSD.GetStrip();
1323     Int_t signal  = inputSSD.GetSignal();
1324     Int_t index  = npx * side + strip;
1325
1326     if (module >= size) continue;
1327
1328     last = fModA[module]->GetEntries();
1329     TClonesArray& dum = *fModA[module];
1330     new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, Double_t(signal));
1331   }
1332   rawReader->Reset();
1333   AliITSpListItem* sdig = 0;
1334
1335   Int_t firstssd = GetITSgeom()->GetStartDet(kSSD);
1336   Double_t adcToEv = 1.;
1337   for (Int_t mod = 0; mod < size; mod++)
1338     {
1339       if(mod>=firstssd) {
1340         AliITSCalibrationSSD* calssd = (AliITSCalibrationSSD*)fDetTypeSim->GetCalibrationModel(mod);
1341         adcToEv = 1./calssd->GetSSDDEvToADC(1.);
1342       }
1343       Int_t nsdig =  fModA[mod]->GetEntries();
1344       for (Int_t ie = 0; ie < nsdig; ie++) {
1345         sdig = (AliITSpListItem*) (fModA[mod]->At(ie));
1346         Double_t digsig = sdig->GetSignal();
1347         if(mod>=firstssd) digsig*=adcToEv; // for SSD: convert back charge from ADC to electron
1348         new (aSDigits[ie]) AliITSpListItem(-1, -1, mod, sdig->GetIndex(), digsig);
1349         Float_t sig = sdig->GetSignalAfterElect();
1350         if(mod>=firstssd) sig*=adcToEv;
1351         if (sig > 0.) {
1352           sdig = (AliITSpListItem*)aSDigits[ie];
1353           sdig->AddSignalAfterElect(mod, sdig->GetIndex(), Double_t(sig));
1354         }
1355       }
1356
1357       tree->Fill();
1358       aSDigits.Clear();
1359       fModA[mod]->Clear();
1360     }
1361   loader->WriteSDigits("OVERWRITE");
1362   return kTRUE;
1363 }
1364
1365 //______________________________________________________________________
1366 void AliITS::UpdateInternalGeometry(){
1367   //reads new geometry from TGeo
1368 //   AliDebug(1,"Delete ITSgeom and create a new one reading TGeo");
1369
1370   AliITSVersion_t version = (AliITSVersion_t)IsVersion();
1371   Int_t minor = 0;
1372   AliITSInitGeometry initgeom;
1373   AliITSgeom* geom = initgeom.CreateAliITSgeom(version,minor);
1374   SetITSgeom(geom);
1375 }
1376 //______________________________________________________________________
1377 AliTriggerDetector* AliITS::CreateTriggerDetector() const {
1378   // create an AliITSTrigger object (and set trigger conditions as input)
1379   return new AliITSTrigger(fDetTypeSim->GetTriggerConditions());
1380 }