]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - ITS/AliITSClusterFinderV2SDD.cxx
In Open() and GotoEvent() try the ESD operations first, fallback to run-loader.
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSClusterFinderV2SDD.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-2003, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$*/
17
18 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
19 //            Implementation of the ITS clusterer V2 class                //
20 //                                                                        //
21 //          Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch            //
22 //                                                                        //
23 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
24
25
26
27 #include <TClonesArray.h>
28 #include "AliITSClusterFinderV2SDD.h"
29 #include "AliITSRecPoint.h"
30 #include "AliITSDetTypeRec.h"
31 #include "AliRawReader.h"
32 #include "AliITSRawStreamSDD.h"
33 #include "AliITSCalibrationSDD.h"
34 #include "AliITSresponseSDD.h"
35 #include "AliITSDetTypeRec.h"
36 #include "AliITSReconstructor.h"
37 #include "AliITSsegmentationSDD.h"
38 #include "AliITSdigitSDD.h"
39 #include "AliITSgeomTGeo.h"
40
41 ClassImp(AliITSClusterFinderV2SDD)
42
43 AliITSClusterFinderV2SDD::AliITSClusterFinderV2SDD(AliITSDetTypeRec* dettyp):AliITSClusterFinderV2(dettyp)
44 {
45
46   //Default constructor
47
48 }
49  
50
51 void AliITSClusterFinderV2SDD::FindRawClusters(Int_t mod){
52
53   //Find clusters V2
54   SetModule(mod);
55   FindClustersSDD(fDigits);
56
57 }
58
59 void AliITSClusterFinderV2SDD::FindClustersSDD(TClonesArray *digits) {
60   //------------------------------------------------------------
61   // Actual SDD cluster finder
62   //------------------------------------------------------------
63   Int_t nAnodes = GetSeg()->NpzHalf();
64   Int_t nzBins = nAnodes+2;
65   Int_t nTimeBins = GetSeg()->Npx();
66   Int_t nxBins = nTimeBins+2;
67   const Int_t kMaxBin=nzBins*nxBins;
68
69   AliBin *bins[2];
70   bins[0]=new AliBin[kMaxBin];
71   bins[1]=new AliBin[kMaxBin];
72   AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)GetResp(fModule);
73   if(cal==0){
74     AliError(Form("Calibration object not present for SDD module %d\n",fModule));
75     return;
76   }
77
78   AliITSdigitSDD *d=0;
79   Int_t i, ndigits=digits->GetEntriesFast();
80   for (i=0; i<ndigits; i++) {
81      d=(AliITSdigitSDD*)digits->UncheckedAt(i);
82      Int_t ian=d->GetCoord1();
83      Int_t itb=d->GetCoord2();
84      Int_t iSide=0;
85      if (ian >= nAnodes) iSide=1;    
86      Float_t gain=cal->GetChannelGain(ian);
87      Float_t charge=d->GetSignal(); // returns expanded signal 
88                                     // (10 bit, low threshold already added)
89      Float_t baseline = cal->GetBaseline(ian);
90      if(charge>baseline) charge-=baseline;
91      else charge=0;
92
93      if(gain>0.){ // Bad channels have gain=0.
94        charge/=gain;
95        if(charge<cal->GetThresholdAnode(ian)) continue;
96        Int_t q=(Int_t)(charge+0.5);
97        Int_t y=itb+1;   
98        Int_t z=ian+1;   
99        if (z <= nAnodes){
100          bins[0][y*nzBins+z].SetQ(q);
101          bins[0][y*nzBins+z].SetMask(1);
102          bins[0][y*nzBins+z].SetIndex(i);
103        } else {
104          z-=nAnodes;
105          bins[1][y*nzBins+z].SetQ(q);
106          bins[1][y*nzBins+z].SetMask(1);
107          bins[1][y*nzBins+z].SetIndex(i);
108        }
109      }
110   }
111   
112   FindClustersSDD(bins, kMaxBin, nzBins, digits);
113
114   delete[] bins[0];
115   delete[] bins[1];
116
117 }
118
119 void AliITSClusterFinderV2SDD::
120 FindClustersSDD(AliBin* bins[2], Int_t nMaxBin, Int_t nzBins, 
121                 TClonesArray *digits, TClonesArray *clusters) {
122   //------------------------------------------------------------
123   // Actual SDD cluster finder
124   //------------------------------------------------------------
125
126   static AliITSRecoParam *repa = NULL;
127   if(!repa){
128     repa = (AliITSRecoParam*) AliITSReconstructor::GetRecoParam();
129     if(!repa){
130       repa = AliITSRecoParam::GetHighFluxParam();
131       AliWarning("Using default AliITSRecoParam class");
132     }
133   }
134   const TGeoHMatrix *mT2L=AliITSgeomTGeo::GetTracking2LocalMatrix(fModule);
135   AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)GetResp(fModule);
136   if(cal==0){
137     AliError(Form("Calibration object not present for SDD module %d\n",fModule));
138     return;
139   }
140   Int_t ncl=0; 
141   TClonesArray &cl=*clusters;
142   for (Int_t s=0; s<2; s++)
143     for (Int_t i=0; i<nMaxBin; i++) {
144       NoiseSuppress(i,s,nzBins,bins[s],cal);
145       if (bins[s][i].IsUsed()) continue;
146       Int_t idx[32]; UInt_t msk[32]; Int_t npeaks=0;
147       FindPeaks(i, nzBins, bins[s], idx, msk, npeaks);
148
149       if (npeaks>30) continue;
150       if (npeaks==0) continue;
151
152       Int_t k,l;
153       for (k=0; k<npeaks-1; k++){//mark adjacent peaks
154         if (idx[k] < 0) continue; //this peak is already removed
155         for (l=k+1; l<npeaks; l++) {
156           if (idx[l] < 0) continue; //this peak is already removed
157           Int_t ki=idx[k]/nzBins, kj=idx[k] - ki*nzBins;
158           Int_t li=idx[l]/nzBins, lj=idx[l] - li*nzBins;
159           Int_t di=TMath::Abs(ki - li);
160           Int_t dj=TMath::Abs(kj - lj);
161           if (di>1 || dj>1) continue;
162           if (bins[s][idx[k]].GetQ() > bins[s][idx[l]].GetQ()) {
163             msk[l]=msk[k];
164             idx[l]*=-1;
165           } else {
166             msk[k]=msk[l];
167             idx[k]*=-1;
168             break;
169           } 
170         }
171       }
172
173       for (k=0; k<npeaks; k++) {
174         if(repa->GetUseUnfoldingInClusterFinderSDD()==kFALSE) msk[k]=msk[0];
175         MarkPeak(TMath::Abs(idx[k]), nzBins, bins[s], msk[k]);
176       }
177         
178       for (k=0; k<npeaks; k++) {
179         if (idx[k] < 0) continue; //removed peak
180         AliITSRecPoint c;
181         MakeCluster(idx[k], nzBins, bins[s], msk[k], c);
182         //mi change
183         Int_t milab[10];
184         for (Int_t ilab=0;ilab<10;ilab++){
185           milab[ilab]=-2;
186         }
187         Int_t maxi=0,mini=0,maxj=0,minj=0;
188         //AliBin *bmax=&bins[s][idx[k]];
189         //Float_t max = TMath::Max(TMath::Abs(bmax->GetQ())/5.,3.);
190         
191         for (Int_t di=-2; di<=2;di++){
192           for (Int_t dj=-3;dj<=3;dj++){
193             Int_t index = idx[k]+di+dj*nzBins;
194             if (index<0) continue;
195             if (index>=nMaxBin) continue;
196             AliBin *b=&bins[s][index];
197             Int_t nAnode=index%nzBins-1;
198             Int_t adcSignal=b->GetQ();
199             if(adcSignal>cal->GetThresholdAnode(nAnode)){
200               if (di>maxi) maxi=di;
201               if (di<mini) mini=di;
202               if (dj>maxj) maxj=dj;
203               if (dj<minj) minj=dj;
204             }
205             //
206             if(digits) {
207               if (TMath::Abs(di)<2&&TMath::Abs(dj)<2){
208                 AliITSdigitSDD* d=(AliITSdigitSDD*)digits->UncheckedAt(b->GetIndex());
209                 for (Int_t itrack=0;itrack<10;itrack++){
210                   Int_t track = (d->GetTracks())[itrack];
211                   if (track>=0) {
212                     AddLabel(milab, track); 
213                   }
214                 }
215               }
216             }
217           }
218         }
219
220
221         AliITSresponseSDD* rsdd = fDetTypeRec->GetResponseSDD();
222         Float_t y=c.GetY(),z=c.GetZ(), q=c.GetQ();
223         y/=q; z/=q;
224         Float_t zAnode=z-0.5;  // to have anode in range 0.-255. and centered on the mid of the pitch
225         Float_t timebin=y-0.5;  // to have time bin in range 0.-255. amd centered on the mid of the bin
226         if(s==1) zAnode += GetSeg()->NpzHalf();  // right side has anodes from 256. to 511.
227         Float_t zdet = GetSeg()->GetLocalZFromAnode(zAnode);
228         Float_t driftTime = GetSeg()->GetDriftTimeFromTb(timebin) - rsdd->GetTimeOffset();
229         Float_t driftPathMicron = cal->GetDriftPath(driftTime,zAnode);
230         const Double_t kMicronTocm = 1.0e-4; 
231         Float_t xdet=(driftPathMicron-GetSeg()->Dx())*kMicronTocm; // xdet is negative
232         if (s==0) xdet=-xdet; // left side has positive local x
233         
234         Float_t corrx=0, corrz=0;
235         cal->GetCorrections(zdet,xdet,corrz,corrx,GetSeg());
236         zdet+=corrz;
237         xdet+=corrx;
238
239         Double_t loc[3]={xdet,0.,zdet},trk[3]={0.,0.,0.};
240         mT2L->MasterToLocal(loc,trk);
241         y=trk[1];
242         z=trk[2]; 
243
244         q/=rsdd->GetADC2keV();  //to have MPV 1 MIP = 86.4 KeV
245         Float_t hit[5] = {y, z, 0.0030*0.0030, 0.0020*0.0020, q};
246         Int_t  info[3] = {maxj-minj+1, maxi-mini+1, fNlayer[fModule]};
247         if (digits) {     
248           //       AliBin *b=&bins[s][idx[k]];
249           //       AliITSdigitSDD* d=(AliITSdigitSDD*)digits->UncheckedAt(b->GetIndex());
250           {
251             //Int_t lab[3];
252             //lab[0]=(d->GetTracks())[0];
253             //lab[1]=(d->GetTracks())[1];
254             //lab[2]=(d->GetTracks())[2];
255             //CheckLabels(lab);
256             CheckLabels2(milab); 
257           }
258         }
259         milab[3]=fNdet[fModule];
260
261         AliITSRecPoint cc(milab,hit,info);
262         cc.SetType(npeaks);
263         if(clusters) new (cl[ncl]) AliITSRecPoint(cc); 
264         else {
265           fDetTypeRec->AddRecPoint(cc);
266         }
267         ncl++;
268       }
269     }
270   
271 }
272 //______________________________________________________________________
273 void AliITSClusterFinderV2SDD::RawdataToClusters(AliRawReader* rawReader,TClonesArray** clusters){
274     //------------------------------------------------------------
275   // This function creates ITS clusters from raw data
276   //------------------------------------------------------------
277   rawReader->Reset();
278   AliITSRawStreamSDD inputSDD(rawReader);
279   AliITSDDLModuleMapSDD *ddlmap=(AliITSDDLModuleMapSDD*)fDetTypeRec->GetDDLModuleMapSDD();
280   inputSDD.SetDDLModuleMap(ddlmap);
281   for(Int_t iddl=0; iddl<AliITSDDLModuleMapSDD::GetNDDLs(); iddl++){
282     for(Int_t icar=0; icar<AliITSDDLModuleMapSDD::GetNModPerDDL();icar++){
283       Int_t iMod=ddlmap->GetModuleNumber(iddl,icar);
284       if(iMod==-1) continue;
285       AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)GetResp(iMod);
286       if(cal==0){
287         AliError(Form("Calibration object not present for SDD module %d\n",iMod));
288         continue;
289       }
290       Bool_t isZeroSupp=cal->GetZeroSupp();
291       if(isZeroSupp){ 
292         for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD.SetZeroSuppLowThreshold(iMod-240,iSid,cal->GetZSLowThreshold(iSid));
293       }else{
294         for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD.SetZeroSuppLowThreshold(iMod-240,iSid,0);
295       }
296     }
297   }
298   FindClustersSDD(&inputSDD,clusters);
299
300 }
301
302 void AliITSClusterFinderV2SDD::FindClustersSDD(AliITSRawStream* input, 
303                                         TClonesArray** clusters) 
304 {
305   //------------------------------------------------------------
306   // Actual SDD cluster finder for raw data
307   //------------------------------------------------------------
308   Int_t nClustersSDD = 0;
309   Int_t nAnodes = GetSeg()->NpzHalf();
310   Int_t nzBins = nAnodes+2;
311   Int_t nTimeBins = GetSeg()->Npx();
312   Int_t nxBins = nTimeBins+2;
313   const Int_t kMaxBin=nzBins*nxBins;
314   AliBin *bins[2];
315   AliBin *ddlbins[kHybridsPerDDL]; // 12 modules (=24 hybrids) of 1 DDL read "in parallel"
316   for(Int_t iHyb=0;iHyb<kHybridsPerDDL;iHyb++) ddlbins[iHyb]=new AliBin[kMaxBin];
317   // read raw data input stream
318   while (input->Next()) {
319     Int_t iModule = input->GetModuleID();
320     if(iModule<0){
321       AliWarning(Form("Invalid SDD module number %d\n", iModule));
322       continue;
323     }
324
325     Int_t iCarlos =((AliITSRawStreamSDD*)input)->GetCarlosId();
326     Int_t iSide = ((AliITSRawStreamSDD*)input)->GetChannel();
327     Int_t iHybrid=iCarlos*2+iSide;
328     if (input->IsCompletedModule()) {
329       // when all data from a module was read, search for clusters
330       if(iCarlos<0){
331         AliWarning(Form("Invalid SDD carlos number %d on module %d\n", iCarlos,iModule));
332         continue;
333       }
334       clusters[iModule] = new TClonesArray("AliITSRecPoint");
335       fModule = iModule;
336       bins[0]=ddlbins[iCarlos*2];   // first hybrid of the completed module
337       bins[1]=ddlbins[iCarlos*2+1]; // second hybrid of the completed module
338       FindClustersSDD(bins, kMaxBin, nzBins, NULL, clusters[iModule]);
339       Int_t nClusters = clusters[iModule]->GetEntriesFast();
340       nClustersSDD += nClusters;
341       for(Int_t iBin=0;iBin<kMaxBin; iBin++){
342         ddlbins[iCarlos*2][iBin].Reset();
343         ddlbins[iCarlos*2+1][iBin].Reset();
344       }
345     }else{
346     // fill the current digit into the bins array
347       if(iHybrid<0 || iHybrid>=kHybridsPerDDL){ 
348         AliWarning(Form("Invalid SDD hybrid number %d on module %d\n", iHybrid,iModule));
349         continue;
350       }
351       AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)GetResp(iModule);    
352       if(cal==0){
353         AliError(Form("Calibration object not present for SDD module %d\n",iModule));
354         continue;
355       }
356       Float_t charge=input->GetSignal();
357       Int_t chan=input->GetCoord1()+nAnodes*iSide;
358       Float_t gain=cal->GetChannelGain(chan);
359       Float_t baseline = cal->GetBaseline(chan);
360       if(charge>baseline) charge-=baseline;
361       else charge=0;
362       if(gain>0.){ // Bad channels have gain=0
363         charge/=gain;
364         if(charge>=cal->GetThresholdAnode(chan)) {
365           Int_t q=(Int_t)(charge+0.5);
366           Int_t iz = input->GetCoord1();
367           Int_t itb = input->GetCoord2();
368           Int_t index = (itb+1) * nzBins + (iz+1);
369           if(index<kMaxBin){
370             ddlbins[iHybrid][index].SetQ(q);
371             ddlbins[iHybrid][index].SetMask(1);
372             ddlbins[iHybrid][index].SetIndex(index);
373           }else{
374             AliWarning(Form("Invalid SDD cell: Anode=%d   TimeBin=%d",iz,itb));   
375           }
376         }
377       }
378     }
379   }
380   for(Int_t iHyb=0;iHyb<kHybridsPerDDL;iHyb++) delete [] ddlbins[iHyb];
381   Info("FindClustersSDD", "found clusters in ITS SDD: %d", nClustersSDD);
382 }
383
384 //______________________________________________________________________
385 void AliITSClusterFinderV2SDD::NoiseSuppress(Int_t k, Int_t sid,Int_t nzBins, AliBin* bins, AliITSCalibrationSDD* cal) const {
386   // applies zero suppression using the measured noise of each anode
387   // threshold values from ALICE-INT-1999-28 V10
388   Float_t xfactL=2.2; 
389   Float_t xfactH=4.0;
390   //
391
392   Int_t iAn=(k%nzBins)-1;
393   if(iAn<0 || iAn>255) return;
394   if(sid==1) iAn+=256;
395   Int_t nLow=0, nHigh=0;
396   Float_t noise=cal->GetNoiseAfterElectronics(iAn);
397   Float_t noisem1=noise;
398   if(iAn>1) noisem1=cal->GetNoiseAfterElectronics(iAn-1);
399   Float_t noisep1=noise;
400   if(iAn<511) noisep1=cal->GetNoiseAfterElectronics(iAn+1);
401   Float_t tL=noise*xfactL;
402   Float_t tH=noise*xfactH;
403   Float_t tLp1=noisep1*xfactL;
404   Float_t tHp1=noisep1*xfactH;
405   Float_t tLm1=noisem1*xfactL;
406   Float_t tHm1=noisem1*xfactH;
407   Float_t cC=bins[k].GetQ();
408   if(cC<=tL){
409     bins[k].SetQ(0);
410     bins[k].SetMask(0xFFFFFFFE);
411     return;
412   }
413   nLow++; // cC is greater than tL
414   if(cC>tH) nHigh++;
415   Int_t sS=bins[k-1].GetQ();
416   if(sS>tLm1) nLow++;
417   if(sS>tHm1) nHigh++;
418   Int_t nN=bins[k+1].GetQ();
419   if(nN>tLp1) nLow++;
420   if(nN>tHp1) nHigh++;
421   Int_t eE=bins[k-nzBins].GetQ();
422   if(eE>tL) nLow++;
423   if(eE>tH) nHigh++;
424   Int_t wW=bins[k+nzBins].GetQ();
425   if(wW>tL) nLow++;
426   if(wW>tH) nHigh++;
427   if(nLow<3 || nHigh<1){
428     bins[k].SetQ(0);
429     bins[k].SetMask(0xFFFFFFFE);
430   }
431 }
432
433
434