MUON/AliMUON.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18
  19 ///////////////////////////////////////////////
  20 //  Manager and hits classes for set:MUON     //
  21 ////////////////////////////////////////////////
  22
  23 #include "Riostream.h"
  24
  25 #include <AliPDG.h>
  26 #include <TBRIK.h>
  27 #include <TCanvas.h>
  28 #include <TDirectory.h>
  29 #include <TFile.h>
  30 #include <TGeometry.h>
  31 #include <TMinuit.h>
  32 #include <TNode.h>
  33 #include <TNtuple.h>
  34 #include <TObjArray.h>
  35 #include <TObject.h>
  36 #include <TObjectTable.h>
  37 #include <TPad.h>
  38 #include <TParticle.h>
  39 #include <TROOT.h>
  40 #include <TRandom.h>
  41 #include <TRotMatrix.h>
  42 #include <TTUBE.h>
  43 #include <TTUBE.h>
  44 #include <TTree.h>
  45 #include <TVector.h>
  46 #include <TVirtualMC.h>
  47
  48 #include "AliConst.h"
  49 #include "AliHeader.h"
  50 #include "AliHitMap.h"
  51 #include "AliLoader.h"
  52 #include "AliMUON.h"
  53 #include "AliMUONChamberTrigger.h"
  54 #include "AliMUONClusterFinderVS.h"
  55 #include "AliMUONClusterInput.h"
  56 #include "AliMUONConstants.h"
  57 #include "AliMUONDigit.h"
  58 #include "AliMUONGlobalTrigger.h"
  59 #include "AliMUONHit.h"
  60 #include "AliMUONHitMapA1.h"
  61 #include "AliMUONLocalTrigger.h"
  62 #include "AliMUONMerger.h"
  63 #include "AliMUONPadHit.h"
  64 #include "AliMUONRawCluster.h"
  65 #include "AliMUONTransientDigit.h"
  66 #include "AliMUONTriggerCircuit.h"
  67 #include "AliMUONTriggerDecision.h"
  68 #include "AliRun.h"
  69
  70
  71 // Defaults parameters for Z positions of chambers
  72 // taken from values for "stations" in AliMUON::AliMUON
  73 //     const Float_t zch[7]={528, 690., 975., 1249., 1449., 1610, 1710.};
  74 // and from array "dstation" in AliMUONv1::CreateGeometry
  75 //          Float_t dstation[5]={20., 20., 20, 20., 20.};
  76 //     for tracking chambers,
  77 //          according to (Z1 = zch - dstation) and  (Z2 = zch + dstation)
  78 //          for the first and second chambers in the station, respectively,
  79 // and from "DTPLANES" in AliMUONv1::CreateGeometry
  80 //           const Float_t DTPLANES = 15.;
  81 //     for trigger chambers,
  82 //          according to (Z1 = zch) and  (Z2 = zch + DTPLANES)
  83 //          for the first and second chambers in the station, respectively
  84
  85 ClassImp(AliMUON)
  86 //___________________________________________
  87 AliMUON::AliMUON()
  88 {
  89 // Default Constructor
  90 //
  91     fNCh             = 0;
  92     fNTrackingCh     = 0;
  93     fIshunt          = 0;
  94     fPadHits         = 0;
  95     fNPadHits        = 0;
  96     fChambers        = 0;
  97     fDchambers       = 0;
  98     fTriggerCircuits = 0;
  99     fNdch            = 0;
 100     fRawClusters     = 0;
 101     fNrawch          = 0;
 102     fGlobalTrigger   = 0;
 103     fNLocalTrigger   = 0;
 104     fLocalTrigger    = 0;
 105     fNLocalTrigger   = 0;
 106     fAccMin          = 0.;
 107     fAccMax          = 0.;
 108     fAccCut          = kFALSE;
 109     fMerger          = 0;
 110     fFileName        = 0;
 111 }
 112
 113 //___________________________________________
 114 AliMUON::AliMUON(const char *name, const char *title)
 115        : AliDetector(name,title)
 116 {
 117 //Begin_Html
 118 /*
 119 <img src="gif/alimuon.gif">
 120 */
 121 //End_Html
 122
 123    fHits     = new TClonesArray("AliMUONHit",1000);
 124    gAlice->AddHitList(fHits);
 125    fPadHits = new TClonesArray("AliMUONPadHit",10000);
 126    fNPadHits  =  0;
 127    fIshunt     =  0;
 128
 129    fNCh             = AliMUONConstants::NCh();
 130    fNTrackingCh     = AliMUONConstants::NTrackingCh();
 131    fNdch            = new Int_t[fNCh];
 132
 133    fDchambers = new TObjArray(AliMUONConstants::NCh());
 134
 135    Int_t i;
 136
 137    for (i=0; i<AliMUONConstants::NCh() ;i++) {
 138        fDchambers->AddAt(new TClonesArray("AliMUONDigit",10000),i);
 139        fNdch[i]=0;
 140    }
 141
 142    fNrawch      = new Int_t[fNTrackingCh];
 143
 144    fRawClusters = new TObjArray(AliMUONConstants::NTrackingCh());
 145
 146    for (i=0; i<AliMUONConstants::NTrackingCh();i++) {
 147        fRawClusters->AddAt(new TClonesArray("AliMUONRawCluster",10000),i);
 148        fNrawch[i]=0;
 149    }
 150
 151    fGlobalTrigger = new TClonesArray("AliMUONGlobalTrigger",1);
 152    fNGlobalTrigger = 0;
 153    fLocalTrigger  = new TClonesArray("AliMUONLocalTrigger",234);
 154    fNLocalTrigger = 0;
 155
 156    SetMarkerColor(kRed);
 157 //
 158 //
 159 //
 160 //
 161
 162     Int_t ch;
 163
 164     fChambers = new TObjArray(AliMUONConstants::NCh());
 165
 166     // Loop over stations
 167     for (Int_t st = 0; st < AliMUONConstants::NCh() / 2; st++) {
 168       // Loop over 2 chambers in the station
 169         for (Int_t stCH = 0; stCH < 2; stCH++) {
 170 //
 171 //
 172 //    Default Parameters for Muon Tracking Stations
 173
 174
 175             ch = 2 * st + stCH;
 176 //
 177             if (ch < AliMUONConstants::NTrackingCh()) {
 178               fChambers->AddAt(new AliMUONChamber(ch),ch);
 179             } else {
 180               fChambers->AddAt(new AliMUONChamberTrigger(ch),ch);
 181             }
 182
 183         //PH        AliMUONChamber* chamber = (AliMUONChamber*) (*fChambers)[ch];
 184             AliMUONChamber* chamber = (AliMUONChamber*) fChambers->At(ch);
 185
 186             chamber->SetGid(0);
 187             // Default values for Z of chambers
 188             chamber->SetZ(AliMUONConstants::DefaultChamberZ(ch));
 189 //
 190             chamber->InitGeo(AliMUONConstants::DefaultChamberZ(ch));
 191 //          Set chamber inner and outer radius to default
 192             chamber->SetRInner(AliMUONConstants::Dmin(st)/2);
 193             chamber->SetROuter(AliMUONConstants::Dmax(st)/2);
 194 //
 195         } // Chamber stCH (0, 1) in
 196     }     // Station st (0...)
 197 //    fChambers->SetLast(AliMUONConstants::NCh());
 198     fMaxStepGas=0.01;
 199     fMaxStepAlu=0.1;
 200     fMaxDestepGas=-1;
 201     fMaxDestepAlu=-1;
 202 //
 203    fMaxIterPad   = 0;
 204    fCurIterPad   = 0;
 205 //
 206    fAccMin          = 0.;
 207    fAccMax          = 0.;
 208    fAccCut          = kFALSE;
 209
 210    // cp new design of AliMUONTriggerDecision
 211    fTriggerCircuits = new TObjArray(AliMUONConstants::NTriggerCircuit());
 212    for (Int_t circ=0; circ<AliMUONConstants::NTriggerCircuit(); circ++) {
 213      fTriggerCircuits->AddAt(new AliMUONTriggerCircuit(),circ);
 214
 215    }
 216      fMerger = 0;
 217 }
 218
 219 //___________________________________________
 220 AliMUON::AliMUON(const AliMUON& rMUON)
 221 {
 222 // Dummy copy constructor
 223     ;
 224
 225 }
 226
 227 AliMUON::~AliMUON()
 228 {
 229 // Destructor
 230     if(fDebug) printf("%s: Calling AliMUON destructor !!!\n",ClassName());
 231
 232     fIshunt  = 0;
 233
 234     // Delete TObjArrays
 235
 236     if (fChambers){
 237       fChambers->Delete();
 238       delete fChambers;
 239     }
 240
 241     if (fTriggerCircuits){
 242       fTriggerCircuits->Delete();
 243       delete fTriggerCircuits;
 244     }
 245
 246     if (fDchambers){
 247       fDchambers->Delete();
 248       delete fDchambers;
 249     }
 250
 251     if (fRawClusters){
 252       fRawClusters->Delete();
 253       delete fRawClusters;
 254     }
 255
 256     if (fNrawch) delete [] fNrawch;
 257
 258     // Delete TClonesArrays
 259
 260     if (fPadHits){
 261       fPadHits->Delete();
 262       delete fPadHits;
 263     }
 264
 265     if (fGlobalTrigger){
 266       fGlobalTrigger->Delete();
 267       delete fGlobalTrigger;
 268     }
 269     fNGlobalTrigger = 0;
 270
 271     if (fLocalTrigger){
 272       fLocalTrigger->Delete();
 273       delete fLocalTrigger;
 274     }
 275     fNLocalTrigger = 0;
 276
 277     if (fHits) {
 278       fHits->Delete();
 279       delete fHits;
 280     }
 281
 282     if (fMerger) delete fMerger;
 283     if (fNdch) delete [] fNdch;
 284
 285 }
 286
 287 //___________________________________________
 288 void AliMUON::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
 289 {
 290   TClonesArray &lhits = *fHits;
 291   new(lhits[fNhits++]) AliMUONHit(fIshunt,track,vol,hits);
 292 }
 293 //___________________________________________
 294 void AliMUON::AddHit(Int_t fIshunt, Int_t track, Int_t iChamber,
 295               Int_t idpart, Float_t X, Float_t Y, Float_t Z,
 296               Float_t tof, Float_t momentum, Float_t theta,
 297               Float_t phi, Float_t length, Float_t destep)
 298 {
 299   TClonesArray &lhits = *fHits;
 300   new(lhits[fNhits++]) AliMUONHit(fIshunt, track, iChamber,
 301                idpart, X, Y, Z,
 302                tof, momentum, theta,
 303                phi, length, destep);
 304 }
 305 //___________________________________________
 306 void AliMUON::AddPadHit(Int_t *clhits)  // To be removed
 307 {
 308    TClonesArray &lclusters = *fPadHits;
 309    new(lclusters[fNPadHits++]) AliMUONPadHit(clhits);
 310 }
 311 //_____________________________________________________________________________
 312 void AliMUON::AddDigits(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *charges, Int_t *digits)
 313 {
 314     //
 315     // Add a MUON digit to the list
 316     //
 317
 318   //PH    TClonesArray &ldigits = * ((TClonesArray*)(*fDchambers)[id]);
 319     TClonesArray &ldigits = * ( (TClonesArray*) fDchambers->At(id) );
 320     new(ldigits[fNdch[id]++]) AliMUONDigit(tracks,charges,digits);
 321 }
 322
 323 //_____________________________________________________________________________
 324 void AliMUON::AddRawCluster(Int_t id, const AliMUONRawCluster& c)
 325 {
 326     //
 327     // Add a MUON digit to the list
 328     //
 329
 330   //PH    TClonesArray &lrawcl = *((TClonesArray*)(*fRawClusters)[id]);
 331     TClonesArray &lrawcl = *((TClonesArray*)fRawClusters->At(id));
 332     new(lrawcl[fNrawch[id]++]) AliMUONRawCluster(c);
 333 }
 334
 335 //___________________________________________
 336 void AliMUON::AddGlobalTrigger(Int_t *singlePlus, Int_t *singleMinus,
 337                                Int_t *singleUndef,
 338                                Int_t *pairUnlike, Int_t *pairLike)
 339 {
 340 // add a MUON Global Trigger to the list (only one GlobalTrigger per event !)
 341   TClonesArray &globalTrigger = *fGlobalTrigger;
 342   new(globalTrigger[fNGlobalTrigger++])
 343     AliMUONGlobalTrigger(singlePlus, singleMinus,  singleUndef, pairUnlike,
 344                          pairLike);
 345 }
 346 //___________________________________________
 347 void AliMUON::AddLocalTrigger(Int_t *localtr)
 348 {
 349 // add a MUON Local Trigger to the list
 350   TClonesArray &localTrigger = *fLocalTrigger;
 351   new(localTrigger[fNLocalTrigger++]) AliMUONLocalTrigger(localtr);
 352 }
 353
 354 //___________________________________________
 355 void AliMUON::BuildGeometry()
 356 {
 357 // Geometry for event display
 358   for (Int_t i=0; i<7; i++) {
 359     for (Int_t j=0; j<2; j++) {
 360       Int_t id=2*i+j+1;
 361       this->Chamber(id-1).SegmentationModel(1)->Draw("eventdisplay");
 362     }
 363   }
 364 }
 365
 366 //___________________________________________
 367 Int_t AliMUON::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t )
 368 {
 369    return 9999;
 370 }
 371
 372 //___________________________________________
 373 void AliMUON::MakeBranch(Option_t* option)
 374 {
 375     //
 376     // Create Tree branches for the MUON.
 377     //
 378     const Int_t kBufferSize = 4000;
 379     char branchname[30];
 380     sprintf(branchname,"%sCluster",GetName());
 381
 382
 383     const char *cD = strstr(option,"D");
 384     const char *cR = strstr(option,"R");
 385     const char *cH = strstr(option,"H");
 386
 387     if (TreeH() && cH)
 388      {
 389       if (fPadHits == 0x0) fPadHits = new TClonesArray("AliMUONPadHit",10000);
 390       MakeBranchInTree(TreeH(), branchname, &fPadHits, kBufferSize, 0);
 391       if (fHits == 0x0) fHits     = new TClonesArray("AliMUONHit",1000);
 392      }
 393     //it must be under fHits creation
 394     AliDetector::MakeBranch(option);
 395
 396     if (cD  && fLoader->TreeD()) {
 397       //
 398       // one branch for digits per chamber
 399       //
 400       Int_t i;
 401       if (fDchambers  == 0x0)
 402         {
 403           fDchambers = new TObjArray(AliMUONConstants::NCh());
 404           for (Int_t i=0; i<AliMUONConstants::NCh() ;i++) {
 405               fDchambers->AddAt(new TClonesArray("AliMUONDigit",10000),i);
 406           }
 407         }
 408
 409       for (i=0; i<AliMUONConstants::NCh() ;i++)
 410        {
 411         sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
 412         MakeBranchInTree(fLoader->TreeD(), branchname, &((*fDchambers)[i]), kBufferSize, 0);
 413         printf("Making Branch %s for digits in chamber %d\n",branchname,i+1);
 414        }
 415     }
 416
 417     if (cR  && fLoader->TreeR()) {
 418       //
 419       // one branch for raw clusters per chamber
 420       //
 421       printf("Make Branch - TreeR address %p\n",fLoader->TreeR());
 422
 423       Int_t i;
 424       if (fRawClusters == 0x0)
 425       {
 426         fRawClusters = new TObjArray(AliMUONConstants::NTrackingCh());
 427         for (Int_t i=0; i<AliMUONConstants::NTrackingCh();i++) {
 428             fRawClusters->AddAt(new TClonesArray("AliMUONRawCluster",10000),i);
 429         }
 430       }
 431
 432       for (i=0; i<AliMUONConstants::NTrackingCh() ;i++)
 433        {
 434          sprintf(branchname,"%sRawClusters%d",GetName(),i+1);
 435          MakeBranchInTree(fLoader->TreeR(), branchname, &((*fRawClusters)[i]), kBufferSize, 0);
 436          printf("Making Branch %s for raw clusters in chamber %d\n",branchname,i+1);
 437       }
 438       //
 439       // one branch for global trigger
 440       //
 441       sprintf(branchname,"%sGlobalTrigger",GetName());
 442
 443       if (fGlobalTrigger == 0x0) {
 444         fGlobalTrigger = new TClonesArray("AliMUONGlobalTrigger",1);
 445       }
 446       MakeBranchInTree(fLoader->TreeR(), branchname, &fGlobalTrigger, kBufferSize, 0);
 447       printf("Making Branch %s for Global Trigger\n",branchname);
 448       //
 449       // one branch for local trigger
 450       //
 451       sprintf(branchname,"%sLocalTrigger",GetName());
 452
 453       if (fLocalTrigger == 0x0) {
 454         fLocalTrigger  = new TClonesArray("AliMUONLocalTrigger",234);
 455       }
 456
 457       MakeBranchInTree(fLoader->TreeR(), branchname, &fLocalTrigger, kBufferSize, 0);
 458       printf("Making Branch %s for Local Trigger\n",branchname);
 459    }
 460 }
 461
 462 //___________________________________________
 463 void AliMUON::SetTreeAddress()
 464 {
 465   // Set branch address for the Hits and Digits Tree.
 466   char branchname[30];
 467
 468   TBranch *branch;
 469   TTree *treeH = fLoader->TreeH();
 470   TTree *treeD = fLoader->TreeD();
 471   TTree *treeR = fLoader->TreeR();
 472
 473   if (treeH) {
 474     if (fPadHits == 0x0) fPadHits = new TClonesArray("AliMUONPadHit",10000);
 475     if (fPadHits) {
 476       branch = treeH->GetBranch("MUONCluster");
 477       if (branch) branch->SetAddress(&fPadHits);
 478     }
 479     if (fHits == 0x0) fHits     = new TClonesArray("AliMUONHit",1000);
 480   }
 481   //it must be under fHits creation
 482   AliDetector::SetTreeAddress();
 483
 484   if (treeD) {
 485       if (fDchambers == 0x0)
 486         {
 487           fDchambers = new TObjArray(AliMUONConstants::NCh());
 488           for (Int_t i=0; i<AliMUONConstants::NCh() ;i++) {
 489               fDchambers->AddAt(new TClonesArray("AliMUONDigit",10000),i);
 490           }
 491         }
 492       for (int i=0; i<AliMUONConstants::NCh(); i++) {
 493           sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
 494
 495                       if (fDchambers) {
 496               branch = treeD->GetBranch(branchname);
 497               if (branch) branch->SetAddress(&((*fDchambers)[i]));
 498           }
 499       }
 500   }
 501
 502   // printf("SetTreeAddress --- treeR address  %p \n",treeR);
 503
 504   if (treeR) {
 505       if (fRawClusters == 0x0)
 506       {
 507         fRawClusters = new TObjArray(AliMUONConstants::NTrackingCh());
 508         for (Int_t i=0; i<AliMUONConstants::NTrackingCh();i++) {
 509             fRawClusters->AddAt(new TClonesArray("AliMUONRawCluster",10000),i);
 510         }
 511       }
 512
 513       for (int i=0; i<AliMUONConstants::NTrackingCh(); i++) {
 514           sprintf(branchname,"%sRawClusters%d",GetName(),i+1);
 515           if (fRawClusters) {
 516               branch = treeR->GetBranch(branchname);
 517               if (branch) branch->SetAddress(&((*fRawClusters)[i]));
 518           }
 519       }
 520
 521       if (fLocalTrigger == 0x0) {
 522         fLocalTrigger  = new TClonesArray("AliMUONLocalTrigger",234);
 523       }
 524
 525       if (fLocalTrigger) {
 526         branch = treeR->GetBranch("MUONLocalTrigger");
 527         if (branch) branch->SetAddress(&fLocalTrigger);
 528       }
 529
 530       if (fGlobalTrigger == 0x0) {
 531         fGlobalTrigger = new TClonesArray("AliMUONGlobalTrigger",1);
 532       }
 533
 534       if (fGlobalTrigger) {
 535         branch = treeR->GetBranch("MUONGlobalTrigger");
 536         if (branch) branch->SetAddress(&fGlobalTrigger);
 537       }
 538   }
 539 }
 540 //___________________________________________
 541 void AliMUON::ResetHits()
 542 {
 543   // Reset number of clusters and the cluster array for this detector
 544   AliDetector::ResetHits();
 545   fNPadHits = 0;
 546   if (fPadHits) fPadHits->Clear();
 547 }
 548
 549 //____________________________________________
 550 void AliMUON::ResetDigits()
 551 {
 552     //
 553     // Reset number of digits and the digits array for this detector
 554     //
 555     for ( int i=0;i<AliMUONConstants::NCh();i++ ) {
 556       //PH      if ((*fDchambers)[i])    ((TClonesArray*)(*fDchambers)[i])->Clear();
 557         if ((*fDchambers)[i])    ((TClonesArray*)fDchambers->At(i))->Clear();
 558         if (fNdch)  fNdch[i]=0;
 559     }
 560 }
 561 //____________________________________________
 562 void AliMUON::ResetRawClusters()
 563 {
 564     //
 565     // Reset number of raw clusters and the raw clust array for this detector
 566     //
 567     for ( int i=0;i<AliMUONConstants::NTrackingCh();i++ ) {
 568       //PH      if ((*fRawClusters)[i])    ((TClonesArray*)(*fRawClusters)[i])->Clear();
 569         if ((*fRawClusters)[i])    ((TClonesArray*)fRawClusters->At(i))->Clear();
 570         if (fNrawch)  fNrawch[i]=0;
 571     }
 572 }
 573
 574 //____________________________________________
 575 void AliMUON::ResetTrigger()
 576 {
 577   //  Reset Local and Global Trigger
 578   fNGlobalTrigger = 0;
 579   if (fGlobalTrigger) fGlobalTrigger->Clear();
 580   fNLocalTrigger = 0;
 581   if (fLocalTrigger) fLocalTrigger->Clear();
 582 }
 583
 584 //____________________________________________
 585 void AliMUON::SetPadSize(Int_t id, Int_t isec, Float_t p1, Float_t p2)
 586 {
 587 // Set the pad size for chamber id and cathode isec
 588     Int_t i=2*(id-1);
 589     //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i])  ->SetPadSize(isec,p1,p2);
 590     //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i+1])->SetPadSize(isec,p1,p2);
 591     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i))  ->SetPadSize(isec,p1,p2);
 592     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i+1))->SetPadSize(isec,p1,p2);
 593 }
 594
 595 //___________________________________________
 596 void AliMUON::SetChambersZ(const Float_t *Z)
 597 {
 598   // Set Z values for all chambers (tracking and trigger)
 599   // from the array pointed to by "Z"
 600     for (Int_t ch = 0; ch < AliMUONConstants::NCh(); ch++)
 601       //PH      ((AliMUONChamber*) ((*fChambers)[ch]))->SetZ(Z[ch]);
 602         ((AliMUONChamber*) fChambers->At(ch))->SetZ(Z[ch]);
 603     return;
 604 }
 605
 606 //___________________________________________
 607 void AliMUON::SetChambersZToDefault()
 608 {
 609   // Set Z values for all chambers (tracking and trigger)
 610   // to default values
 611   SetChambersZ(AliMUONConstants::DefaultChamberZ());
 612   return;
 613 }
 614
 615 //___________________________________________
 616 void AliMUON::SetChargeSlope(Int_t id, Float_t p1)
 617 {
 618 // Set the inverse charge slope for chamber id
 619     Int_t i=2*(id-1);
 620     //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i])->SetChargeSlope(p1);
 621     //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i+1])->SetChargeSlope(p1);
 622     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i))->SetChargeSlope(p1);
 623     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i+1))->SetChargeSlope(p1);
 624 }
 625
 626 //___________________________________________
 627 void AliMUON::SetChargeSpread(Int_t id, Float_t p1, Float_t p2)
 628 {
 629 // Set sigma of charge spread for chamber id
 630     Int_t i=2*(id-1);
 631     //PH    ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i))->SetChargeSpread(p1,p2);
 632     //PH    ((AliMUONChamber*) fChambers->Ati+1])->SetChargeSpread(p1,p2);
 633     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i))->SetChargeSpread(p1,p2);
 634     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i+1))->SetChargeSpread(p1,p2);
 635 }
 636
 637 //___________________________________________
 638 void AliMUON::SetSigmaIntegration(Int_t id, Float_t p1)
 639 {
 640 // Set integration limits for charge spread
 641     Int_t i=2*(id-1);
 642     //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i])->SetSigmaIntegration(p1);
 643     //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i+1])->SetSigmaIntegration(p1);
 644     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i))->SetSigmaIntegration(p1);
 645     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i+1))->SetSigmaIntegration(p1);
 646 }
 647
 648 //___________________________________________
 649 void AliMUON::SetMaxAdc(Int_t id, Int_t p1)
 650 {
 651 // Set maximum number for ADCcounts (saturation)
 652     Int_t i=2*(id-1);
 653     //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i])->SetMaxAdc(p1);
 654     //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i+1])->SetMaxAdc(p1);
 655     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i))->SetMaxAdc(p1);
 656     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i+1))->SetMaxAdc(p1);
 657 }
 658
 659 //___________________________________________
 660 void AliMUON::SetMaxStepGas(Float_t p1)
 661 {
 662 // Set stepsize in gas
 663      fMaxStepGas=p1;
 664 }
 665
 666 //___________________________________________
 667 void AliMUON::SetMaxStepAlu(Float_t p1)
 668 {
 669 // Set step size in Alu
 670     fMaxStepAlu=p1;
 671 }
 672
 673 //___________________________________________
 674 void AliMUON::SetMaxDestepGas(Float_t p1)
 675 {
 676 // Set maximum step size in Gas
 677     fMaxDestepGas=p1;
 678 }
 679
 680 //___________________________________________
 681 void AliMUON::SetMaxDestepAlu(Float_t p1)
 682 {
 683 // Set maximum step size in Alu
 684     fMaxDestepAlu=p1;
 685 }
 686 //___________________________________________
 687 void AliMUON::SetAcceptance(Bool_t acc, Float_t angmin, Float_t angmax)
 688 {
 689 // Set acceptance cuts
 690    fAccCut=acc;
 691    fAccMin=angmin*TMath::Pi()/180;
 692    fAccMax=angmax*TMath::Pi()/180;
 693    Int_t ch;
 694    if (acc) {
 695        for (Int_t st = 0; st < AliMUONConstants::NCh() / 2; st++) {
 696            // Loop over 2 chambers in the station
 697            for (Int_t stCH = 0; stCH < 2; stCH++) {
 698                ch = 2 * st + stCH;
 699 //         Set chamber inner and outer radius according to acceptance cuts
 700                Chamber(ch).SetRInner(AliMUONConstants::DefaultChamberZ(ch)*TMath::Tan(fAccMin));
 701                Chamber(ch).SetROuter(AliMUONConstants::DefaultChamberZ(ch)*TMath::Tan(fAccMax));
 702            } // chamber loop
 703        } // station loop
 704    }
 705 }
 706 //___________________________________________
 707 void   AliMUON::SetSegmentationModel(Int_t id, Int_t isec, AliSegmentation *segmentation)
 708 {
 709 // Set the segmentation for chamber id cathode isec
 710   //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[id])->SetSegmentationModel(isec, segmentation);
 711     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(id))->SetSegmentationModel(isec, segmentation);
 712
 713 }
 714 //___________________________________________
 715 void   AliMUON::SetResponseModel(Int_t id, AliMUONResponse *response)
 716 {
 717 // Set the response for chamber id
 718   //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[id])->SetResponseModel(response);
 719     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(id))->SetResponseModel(response);
 720 }
 721
 722 void   AliMUON::SetReconstructionModel(Int_t id, AliMUONClusterFinderVS *reconst)
 723 {
 724 // Set ClusterFinder for chamber id
 725   //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[id])->SetReconstructionModel(reconst);
 726     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(id))->SetReconstructionModel(reconst);
 727 }
 728
 729 void   AliMUON::SetNsec(Int_t id, Int_t nsec)
 730 {
 731 // Set number of segmented cathods for chamber id
 732   //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[id])->SetNsec(nsec);
 733     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(id))->SetNsec(nsec);
 734 }
 735
 736 //___________________________________________
 737 void AliMUON::SDigits2Digits()
 738 {
 739
 740 // write TreeD here
 741
 742     if (!fMerger) {
 743       if (gAlice->GetDebug()>0) {
 744         cerr<<"AliMUON::SDigits2Digits: create default AliMUONMerger "<<endl;
 745         cerr<<" no merging, just digitization of 1 event will be done"<<endl;
 746       }
 747       fMerger = new AliMUONMerger();
 748     }
 749     fMerger->Init();
 750     fMerger->Digitise();
 751     char hname[30];
 752     //    sprintf(hname,"TreeD%d",fLoader->GetHeader()->GetEvent());
 753     fLoader->TreeD()->Write(hname,TObject::kOverwrite);
 754     fLoader->TreeD()->Reset();
 755 }
 756
 757 //___________________________________________
 758 // To be removed
 759 void AliMUON::MakePadHits(Float_t xhit,Float_t yhit, Float_t zhit,
 760                           Float_t eloss, Float_t tof,  Int_t idvol)
 761 {
 762 //
 763 //  Calls the charge disintegration method of the current chamber and adds
 764 //  the simulated cluster to the root treee
 765 //
 766     Int_t clhits[7];
 767     Float_t newclust[6][500];
 768     Int_t nnew;
 769
 770
 771 //
 772 //  Integrated pulse height on chamber
 773
 774
 775     clhits[0]=fNhits+1;
 776 //
 777 //
 778 //    if (idvol == 6) printf("\n ->Disintegration %f %f %f", xhit, yhit, eloss );
 779
 780
 781     //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[idvol])
 782     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(idvol))
 783         ->DisIntegration(eloss, tof, xhit, yhit, zhit, nnew, newclust);
 784     Int_t ic=0;
 785 //    if (idvol == 6) printf("\n nnew  %d \n", nnew);
 786 //
 787 //  Add new clusters
 788     for (Int_t i=0; i<nnew; i++) {
 789         if (Int_t(newclust[3][i]) > 0) {
 790             ic++;
 791 // Cathode plane
 792             clhits[1] = Int_t(newclust[5][i]);
 793 //  Cluster Charge
 794             clhits[2] = Int_t(newclust[0][i]);
 795 //  Pad: ix
 796             clhits[3] = Int_t(newclust[1][i]);
 797 //  Pad: iy
 798             clhits[4] = Int_t(newclust[2][i]);
 799 //  Pad: charge
 800             clhits[5] = Int_t(newclust[3][i]);
 801 //  Pad: chamber sector
 802             clhits[6] = Int_t(newclust[4][i]);
 803
 804             AddPadHit(clhits);
 805         }
 806     }
 807 }
 808
 809 //___________________________________________
 810 void AliMUON::Trigger(Int_t nev){
 811 // call the Trigger Algorithm and fill TreeR
 812
 813   Int_t singlePlus[3]  = {0,0,0};
 814   Int_t singleMinus[3] = {0,0,0};
 815   Int_t singleUndef[3] = {0,0,0};
 816   Int_t pairUnlike[3]  = {0,0,0};
 817   Int_t pairLike[3]    = {0,0,0};
 818
 819   ResetTrigger();
 820   AliMUONTriggerDecision* decision= new AliMUONTriggerDecision(1);
 821   decision->Trigger();
 822   decision->GetGlobalTrigger(singlePlus, singleMinus, singleUndef,
 823                              pairUnlike, pairLike);
 824
 825 // add a local trigger in the list
 826   AddGlobalTrigger(singlePlus, singleMinus, singleUndef, pairUnlike, pairLike);
 827   Int_t i;
 828
 829   for (Int_t icirc=0; icirc<AliMUONConstants::NTriggerCircuit(); icirc++) {
 830       if(decision->GetITrigger(icirc)==1) {
 831           Int_t localtr[7]={0,0,0,0,0,0,0};
 832           Int_t loLpt[2]={0,0}; Int_t loHpt[2]={0,0}; Int_t loApt[2]={0,0};
 833           decision->GetLutOutput(icirc, loLpt, loHpt, loApt);
 834           localtr[0] = icirc;
 835           localtr[1] = decision->GetStripX11(icirc);
 836           localtr[2] = decision->GetDev(icirc);
 837           localtr[3] = decision->GetStripY11(icirc);
 838           for (i=0; i<2; i++) {    // convert the Lut output in 1 digit
 839               localtr[4] = localtr[4]+Int_t(loLpt[i]*TMath::Power(2,i));
 840               localtr[5] = localtr[5]+Int_t(loHpt[i]*TMath::Power(2,i));
 841               localtr[6] = localtr[6]+Int_t(loApt[i]*TMath::Power(2,i));
 842           }
 843           AddLocalTrigger(localtr);  // add a local trigger in the list
 844       }
 845   }
 846
 847   delete decision;
 848
 849   fLoader->TreeR()->Fill();
 850 //  char hname[30];
 851 //  sprintf(hname,"TreeR%d",nev);
 852 //  fLoader->TreeR()->Write(hname,TObject::kOverwrite);
 853 //  fLoader->TreeR()->Reset();
 854   fLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 855   ResetTrigger();
 856
 857   printf("\n End of trigger for event %d", nev);
 858 }
 859
 860
 861 //____________________________________________
 862 void AliMUON::Digits2Reco()
 863 {
 864   FindClusters();
 865   Int_t nev = gAlice->GetHeader()->GetEvent();
 866   fLoader->TreeR()->Fill();
 867   // char hname[30];
 868   // sprintf(hname,"TreeR%d", nev);
 869   //fLoader->TreeR()->Write(hname);
 870   //fLoader->TreeR()->Reset();
 871   fLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 872   ResetRawClusters();
 873   printf("\n End of cluster finding for event %d", nev);
 874 }
 875
 876 void AliMUON::FindClusters()
 877 {
 878 //
 879 //  Perform cluster finding
 880 //
 881     TClonesArray *dig1, *dig2;
 882     Int_t ndig, k;
 883     dig1 = new TClonesArray("AliMUONDigit",1000);
 884     dig2 = new TClonesArray("AliMUONDigit",1000);
 885     AliMUONDigit *digit;
 886 // Loop on chambers and on cathode planes
 887 //
 888     ResetRawClusters();
 889     TClonesArray * muonDigits;
 890
 891     for (Int_t ich = 0; ich < 10; ich++) {
 892       //PH      AliMUONChamber* iChamber = (AliMUONChamber*) (*fChambers)[ich];
 893         AliMUONChamber* iChamber = (AliMUONChamber*) fChambers->At(ich);
 894         AliMUONClusterFinderVS* rec = iChamber->ReconstructionModel();
 895
 896         ResetDigits();
 897         fLoader->TreeD()->GetEvent(0);
 898         //TClonesArray *
 899         muonDigits = (TClonesArray *) Dchambers()->At(ich);
 900         ndig=muonDigits->GetEntriesFast();
 901         printf("\n 1 Found %d digits in %p chamber %d", ndig, muonDigits,ich);
 902         TClonesArray &lhits1 = *dig1;
 903         Int_t n = 0;
 904         for (k = 0; k < ndig; k++) {
 905             digit = (AliMUONDigit*) muonDigits->UncheckedAt(k);
 906             if (rec->TestTrack(digit->Track(0)))
 907                 new(lhits1[n++]) AliMUONDigit(*digit);
 908         }
 909         ResetDigits();
 910         fLoader->TreeD()->GetEvent(1);
 911         //muonDigits  = this->DigitsAddress(ich);
 912         muonDigits = (TClonesArray *) Dchambers()->At(ich);
 913         ndig=muonDigits->GetEntriesFast();
 914         printf("\n 2 Found %d digits in %p %d", ndig, muonDigits, ich);
 915         TClonesArray &lhits2 = *dig2;
 916         n=0;
 917
 918         for (k=0; k<ndig; k++) {
 919             digit= (AliMUONDigit*) muonDigits->UncheckedAt(k);
 920             if (rec->TestTrack(digit->Track(0)))
 921             new(lhits2[n++]) AliMUONDigit(*digit);
 922         }
 923
 924         if (rec) {
 925             AliMUONClusterInput::Instance()->SetDigits(ich, dig1, dig2);
 926             rec->FindRawClusters();
 927         }
 928         dig1->Delete();
 929         dig2->Delete();
 930     } // for ich
 931     delete dig1;
 932     delete dig2;
 933 }
 934
 935 #ifdef never
 936 void AliMUON::Streamer(TBuffer &R__b)
 937 {
 938    // Stream an object of class AliMUON.
 939       AliMUONChamber        *iChamber;
 940       AliMUONTriggerCircuit *iTriggerCircuit;
 941       AliSegmentation       *segmentation;
 942       AliMUONResponse       *response;
 943       TClonesArray          *digitsaddress;
 944       TClonesArray          *rawcladdress;
 945       Int_t i;
 946       if (R__b.IsReading()) {
 947           Version_t R__v = R__b.ReadVersion(); if (R__v) { }
 948           AliDetector::Streamer(R__b);
 949           R__b >> fNPadHits;
 950           R__b >> fPadHits; // diff
 951           R__b >> fNLocalTrigger;
 952           R__b >> fLocalTrigger;
 953           R__b >> fNGlobalTrigger;
 954           R__b >> fGlobalTrigger;
 955           R__b >> fDchambers;
 956           R__b >> fRawClusters;
 957           R__b.ReadArray(fNdch);
 958           R__b.ReadArray(fNrawch);
 959           R__b >> fAccCut;
 960           R__b >> fAccMin;
 961           R__b >> fAccMax;
 962           R__b >> fChambers;
 963           R__b >> fTriggerCircuits;
 964           for (i =0; i<AliMUONConstants::NTriggerCircuit(); i++) {
 965               iTriggerCircuit=(AliMUONTriggerCircuit*) (*fTriggerCircuits)[i];
 966               iTriggerCircuit->Streamer(R__b);
 967           }
 968 // Stream chamber related information
 969           for (i =0; i<AliMUONConstants::NCh(); i++) {
 970               iChamber=(AliMUONChamber*) (*fChambers)[i];
 971               iChamber->Streamer(R__b);
 972               if (iChamber->Nsec()==1) {
 973                   segmentation=iChamber->SegmentationModel(1);
 974                   if (segmentation)
 975                       segmentation->Streamer(R__b);
 976               } else {
 977                   segmentation=iChamber->SegmentationModel(1);
 978                   if (segmentation)
 979                       segmentation->Streamer(R__b);
 980                   if (segmentation)
 981                       segmentation=iChamber->SegmentationModel(2);
 982                   segmentation->Streamer(R__b);
 983               }
 984               response=iChamber->ResponseModel();
 985               if (response)
 986                   response->Streamer(R__b);
 987               digitsaddress=(TClonesArray*) (*fDchambers)[i];
 988               digitsaddress->Streamer(R__b);
 989               if (i < AliMUONConstants::NTrackingCh()) {
 990                   rawcladdress=(TClonesArray*) (*fRawClusters)[i];
 991                   rawcladdress->Streamer(R__b);
 992               }
 993           }
 994
 995       } else {
 996           R__b.WriteVersion(AliMUON::IsA());
 997           AliDetector::Streamer(R__b);
 998           R__b << fNPadHits;
 999           R__b << fPadHits; // diff
1000           R__b << fNLocalTrigger;
1001           R__b << fLocalTrigger;
1002           R__b << fNGlobalTrigger;
1003           R__b << fGlobalTrigger;
1004           R__b << fDchambers;
1005           R__b << fRawClusters;
1006           R__b.WriteArray(fNdch, AliMUONConstants::NCh());
1007           R__b.WriteArray(fNrawch, AliMUONConstants::NTrackingCh());
1008
1009           R__b << fAccCut;
1010           R__b << fAccMin;
1011           R__b << fAccMax;
1012
1013           R__b << fChambers;
1014           R__b << fTriggerCircuits;
1015           for (i =0; i<AliMUONConstants::NTriggerCircuit(); i++) {
1016               iTriggerCircuit=(AliMUONTriggerCircuit*) (*fTriggerCircuits)[i];
1017               iTriggerCircuit->Streamer(R__b);
1018           }
1019           for (i =0; i<AliMUONConstants::NCh(); i++) {
1020               iChamber=(AliMUONChamber*) (*fChambers)[i];
1021               iChamber->Streamer(R__b);
1022               if (iChamber->Nsec()==1) {
1023                   segmentation=iChamber->SegmentationModel(1);
1024                   if (segmentation)
1025                       segmentation->Streamer(R__b);
1026               } else {
1027                   segmentation=iChamber->SegmentationModel(1);
1028                   if (segmentation)
1029                       segmentation->Streamer(R__b);
1030                   segmentation=iChamber->SegmentationModel(2);
1031                   if (segmentation)
1032                       segmentation->Streamer(R__b);
1033               }
1034               response=iChamber->ResponseModel();
1035               if (response)
1036                   response->Streamer(R__b);
1037               digitsaddress=(TClonesArray*) (*fDchambers)[i];
1038               digitsaddress->Streamer(R__b);
1039               if (i < AliMUONConstants::NTrackingCh()) {
1040                   rawcladdress=(TClonesArray*) (*fRawClusters)[i];
1041                   rawcladdress->Streamer(R__b);
1042               }
1043           }
1044       }
1045 }
1046 #endif
1047
1048 AliMUONPadHit* AliMUON::FirstPad(AliMUONHit*  hit, TClonesArray *clusters)
1049 {
1050 // to be removed
1051     // Initialise the pad iterator
1052     // Return the address of the first padhit for hit
1053     TClonesArray *theClusters = clusters;
1054     Int_t nclust = theClusters->GetEntriesFast();
1055     if (nclust && hit->PHlast() > 0) {
1056         AliMUON::fMaxIterPad=hit->PHlast();
1057         AliMUON::fCurIterPad=hit->PHfirst();
1058         return (AliMUONPadHit*) clusters->UncheckedAt(AliMUON::fCurIterPad-1);
1059     } else {
1060         return 0;
1061     }
1062 }
1063
1064 AliMUONPadHit* AliMUON::NextPad(TClonesArray *clusters)
1065 {
1066   // To be removed
1067 // Get next pad (in iterator)
1068 //
1069     AliMUON::fCurIterPad++;
1070     if (AliMUON::fCurIterPad <= AliMUON::fMaxIterPad) {
1071         return (AliMUONPadHit*) clusters->UncheckedAt(AliMUON::fCurIterPad-1);
1072     } else {
1073         return 0;
1074     }
1075 }
1076
1077
1078 AliMUONRawCluster *AliMUON::RawCluster(Int_t ichamber, Int_t icathod, Int_t icluster)
1079 {
1080 //
1081 //  Return rawcluster (icluster) for chamber ichamber and cathode icathod
1082 //  Obsolete ??
1083     TClonesArray *muonRawCluster  = RawClustAddress(ichamber);
1084     ResetRawClusters();
1085     TTree *treeR = fLoader->TreeR();
1086     Int_t nent=(Int_t)treeR->GetEntries();
1087     treeR->GetEvent(nent-2+icathod-1);
1088     //treeR->GetEvent(icathod);
1089     //Int_t nrawcl = (Int_t)muonRawCluster->GetEntriesFast();
1090
1091     AliMUONRawCluster * mRaw = (AliMUONRawCluster*)muonRawCluster->UncheckedAt(icluster);
1092     //printf("RawCluster _ nent nrawcl icluster mRaw %d %d %d%p\n",nent,nrawcl,icluster,mRaw);
1093
1094     return  mRaw;
1095 }
1096
1097 void   AliMUON::SetMerger(AliMUONMerger* merger)
1098 {
1099 // Set pointer to merger
1100     fMerger = merger;
1101 }
1102
1103 AliMUONMerger*  AliMUON::Merger()
1104 {
1105 // Return pointer to merger
1106     return fMerger;
1107 }
1108
1109
1110
1111 AliMUON& AliMUON::operator = (const AliMUON& rhs)
1112 {
1113 // copy operator
1114 // dummy version
1115     return *this;
1116 }
1117
1118 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1119 void AliMUON::MakeBranchInTreeD(TTree *treeD, const char *file)
1120 {
1121     //
1122     // Create TreeD branches for the MUON.
1123     //
1124
1125   const Int_t kBufferSize = 4000;
1126   char branchname[30];
1127
1128   if (fDchambers  == 0x0)   {
1129     fDchambers = new TObjArray(AliMUONConstants::NCh());
1130     for (Int_t i=0; i<AliMUONConstants::NCh() ;i++) {
1131       fDchambers->AddAt(new TClonesArray("AliMUONDigit",10000),i);
1132     }
1133   }
1134   //
1135   // one branch for digits per chamber
1136   //
1137   for (Int_t i=0; i<AliMUONConstants::NCh() ;i++) {
1138     sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
1139     if (fDchambers && treeD) {
1140       MakeBranchInTree(treeD,
1141                        branchname, &((*fDchambers)[i]), kBufferSize, file);
1142 //      printf("Making Branch %s for digits in chamber %d\n",branchname,i+1);
1143     }
1144   }
1145 }
1146
1147 //___________________________________________
1148