PHOS/AliPHOSGetter.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 //_________________________________________________________________________
  19 //  A singleton. This class should be used in the analysis stage to get
  20 //  reconstructed objects: Digits, RecPoints, TrackSegments and RecParticles,
  21 //  instead of directly reading them from galice.root file. This container
  22 //  ensures, that one reads Digits, made of these particular digits, RecPoints,
  23 //  made of these particular RecPoints, TrackSegments and RecParticles.
  24 //  This becomes non trivial if there are several identical branches, produced with
  25 //  different set of parameters.
  26 //
  27 //  An example of how to use (see also class AliPHOSAnalyser):
  28 //  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance("galice.root","test") ;
  29 //  for(Int_t irecp = 0; irecp < gime->NRecParticles() ; irecp++)
  30 //     AliPHOSRecParticle * part = gime->RecParticle(1) ;
  31 //     ................
  32 //  gime->Event(event) ;    // reads new event from galice.root
  33 //
  34 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH) & Dmitri Peressounko (RRC KI & SUBATECH)
  35 //*--         Completely redesigned by Dmitri Peressounko March 2001
  36 //
  37 //*-- YS June 2001 : renamed the original AliPHOSIndexToObject and make
  38 //*--         systematic usage of TFolders without changing the interface
  39 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  40
  41 // --- ROOT system ---
  42
  43 #include <TFile.h>
  44 #include <TROOT.h>
  45 #include <TSystem.h>
  46 #include <TParticle.h>
  47 #include <TF1.h>
  48 #include <TGraph.h>
  49 #include <TCanvas.h>
  50 #include <TStyle.h>
  51 //#include <TFrame.h>
  52
  53 // --- Standard library ---
  54
  55 // --- AliRoot header files ---
  56 #include "AliESD.h"
  57 #include "AliHeader.h"
  58 #include "AliMC.h"
  59 #include "AliPHOS.h"
  60 #include "AliPHOSBeamTestEvent.h"
  61 #include "AliPHOSGetter.h"
  62 #include "AliPHOSLoader.h"
  63 #include "AliRunLoader.h"
  64 #include "AliStack.h"
  65 #include "AliPHOSRawStream.h"
  66 #include "AliRawReaderFile.h"
  67 #include "AliLog.h"
  68 #include "AliCDBLocal.h"
  69 #include "AliCDBStorage.h"
  70 #include "AliCDBManager.h"
  71
  72 ClassImp(AliPHOSGetter)
  73
  74 AliPHOSGetter   * AliPHOSGetter::fgObjGetter  = 0 ;
  75 AliPHOSLoader   * AliPHOSGetter::fgPhosLoader = 0;
  76 AliPHOSCalibData* AliPHOSGetter::fgCalibData  = 0;
  77 Int_t AliPHOSGetter::fgDebug = 0;
  78
  79 //  TFile * AliPHOSGetter::fgFile = 0 ;
  80
  81 AliPHOSGetter::AliPHOSGetter() :
  82   fBTE(0),
  83   fLoadingStatus(),
  84   fNPrimaries(0),
  85   fPrimaries(0),
  86   fESDFile(0),
  87   fESDFileName(),
  88   fESD(0),
  89   fESDTree(0),
  90   fRawDigits(kFALSE),
  91   fcdb(0)
  92 {
  93   // ctor: this is a singleton, the ctor should never be called but cint needs it as public
  94   Fatal("ctor", "AliPHOSGetter is a singleton default ctor not callable") ;
  95 }
  96
  97
  98 //____________________________________________________________________________
  99 AliPHOSGetter::AliPHOSGetter(const char* headerFile, const char* version, Option_t * openingOption) :
 100   fBTE(0),
 101   fLoadingStatus(),
 102   fNPrimaries(0),
 103   fPrimaries(0),
 104   fESDFile(0),
 105   fESDFileName(),
 106   fESD(0),
 107   fESDTree(0),
 108   fRawDigits(kFALSE),
 109   fcdb(0)
 110 {
 111   // ctor only called by Instance()
 112
 113   AliRunLoader* rl = AliRunLoader::GetRunLoader(version) ;
 114   if (!rl) {
 115     rl = AliRunLoader::Open(headerFile, version, openingOption);
 116     if (!rl) {
 117       Fatal("AliPHOSGetter", "Could not find the Run Loader for %s - %s",headerFile, version) ;
 118       return ;
 119     }
 120     if (rl->GetAliRun() == 0x0) {
 121       rl->LoadgAlice();
 122       gAlice = rl->GetAliRun(); // should be removed
 123       rl->LoadHeader();
 124     }
 125   }
 126   fgPhosLoader = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(rl->GetLoader("PHOSLoader"));
 127   if ( !fgPhosLoader )
 128     Error("AliPHOSGetter", "Could not find PHOSLoader") ;
 129   else
 130     fgPhosLoader->SetTitle(version);
 131
 132   // initialize data members
 133   SetDebug(0) ;
 134   fBTE = 0 ;
 135   fPrimaries = 0 ;
 136   fLoadingStatus = "" ;
 137
 138   fESDFileName = rl->GetFileName()  ; // this should be the galice.root file
 139   fESDFileName.ReplaceAll("galice.root", "AliESDs.root") ;
 140   fESDFile = 0 ;
 141   fESD = 0 ;
 142   fESDTree = 0 ;
 143   fRawDigits = kFALSE ;
 144
 145 }
 146
 147 AliPHOSGetter::AliPHOSGetter(const AliPHOSGetter & obj) :
 148   TObject(obj),
 149   fBTE(0),
 150   fLoadingStatus(),
 151   fNPrimaries(0),
 152   fPrimaries(0),
 153   fESDFile(0),
 154   fESDFileName(),
 155   fESD(0),
 156   fESDTree(0),
 157   fRawDigits(kFALSE),
 158   fcdb(0)
 159 {
 160   // cpy ctor requested by Coding Convention
 161   Fatal("cpy ctor", "not implemented") ;
 162 }
 163
 164 //____________________________________________________________________________
 165 AliPHOSGetter::AliPHOSGetter(Int_t /*i*/) :
 166   fBTE(0),
 167   fLoadingStatus(),
 168   fNPrimaries(0),
 169   fPrimaries(0),
 170   fESDFile(0),
 171   fESDFileName(),
 172   fESD(0),
 173   fESDTree(0),
 174   fRawDigits(kFALSE),
 175   fcdb(0)
 176 {
 177   // special constructor for onflight
 178 }
 179
 180
 181 //____________________________________________________________________________
 182 AliPHOSGetter::~AliPHOSGetter()
 183 {
 184   // dtor
 185   if(fgPhosLoader){
 186     delete fgPhosLoader ;
 187     fgPhosLoader = 0 ;
 188   }
 189   if(fBTE){
 190     delete fBTE ;
 191     fBTE = 0 ;
 192   }
 193   if(fPrimaries){
 194     fPrimaries->Delete() ;
 195     delete fPrimaries ;
 196   }
 197   if (fESD)
 198     delete fESD ;
 199   if (fESDTree)
 200     delete fESDTree ;
 201
 202   fgObjGetter = 0;
 203 }
 204
 205 //____________________________________________________________________________
 206 void AliPHOSGetter::Reset()
 207 {
 208   // resets things in case the getter is called consecutively with different files
 209   // the PHOS Loader is already deleted by the Run Loader
 210
 211   if (fPrimaries) {
 212     fPrimaries->Delete() ;
 213     delete fPrimaries ;
 214   }
 215   fgPhosLoader = 0;
 216   fgObjGetter = 0;
 217 }
 218
 219 //____________________________________________________________________________
 220 AliPHOSClusterizer * AliPHOSGetter::Clusterizer()
 221 {
 222   // Returns pointer to the Clusterizer task
 223   AliPHOSClusterizer * rv ;
 224   rv =  dynamic_cast<AliPHOSClusterizer *>(PhosLoader()->Reconstructioner()) ;
 225   if (!rv) {
 226     Event(0, "R") ;
 227     rv =  dynamic_cast<AliPHOSClusterizer*>(PhosLoader()->Reconstructioner()) ;
 228   }
 229   return rv ;
 230 }
 231
 232 //____________________________________________________________________________
 233 TObjArray * AliPHOSGetter::CpvRecPoints() const
 234 {
 235   // asks the Loader to return the CPV RecPoints container
 236
 237   TObjArray * rv = 0 ;
 238
 239   rv = PhosLoader()->CpvRecPoints() ;
 240   if (!rv) {
 241     PhosLoader()->MakeRecPointsArray() ;
 242     rv = PhosLoader()->CpvRecPoints() ;
 243   }
 244   return rv ;
 245 }
 246
 247 //____________________________________________________________________________
 248 TClonesArray * AliPHOSGetter::Digits() const
 249 {
 250   // asks the Loader to return the Digits container
 251
 252   TClonesArray * rv = 0 ;
 253   rv = PhosLoader()->Digits() ;
 254
 255   if( !rv ) {
 256     PhosLoader()->MakeDigitsArray() ;
 257     rv = PhosLoader()->Digits() ;
 258   }
 259   return rv ;
 260 }
 261
 262 //____________________________________________________________________________
 263 AliPHOSDigitizer * AliPHOSGetter::Digitizer()
 264 {
 265   // Returns pointer to the Digitizer task
 266   AliPHOSDigitizer * rv ;
 267   rv =  dynamic_cast<AliPHOSDigitizer *>(PhosLoader()->Digitizer()) ;
 268   if (!rv) {
 269     Event(0, "D") ;
 270     rv =  dynamic_cast<AliPHOSDigitizer *>(PhosLoader()->Digitizer()) ;
 271   }
 272   return rv ;
 273 }
 274
 275
 276 //____________________________________________________________________________
 277 TObjArray * AliPHOSGetter::EmcRecPoints() const
 278 {
 279   // asks the Loader to return the EMC RecPoints container
 280
 281   TObjArray * rv = 0 ;
 282
 283   rv = PhosLoader()->EmcRecPoints() ;
 284   if (!rv) {
 285     PhosLoader()->MakeRecPointsArray() ;
 286     rv = PhosLoader()->EmcRecPoints() ;
 287   }
 288   return rv ;
 289 }
 290
 291 //____________________________________________________________________________
 292 TClonesArray * AliPHOSGetter::TrackSegments() const
 293 {
 294   // asks the Loader to return the TrackSegments container
 295
 296   TClonesArray * rv = 0 ;
 297
 298   rv = PhosLoader()->TrackSegments() ;
 299   if (!rv) {
 300     PhosLoader()->MakeTrackSegmentsArray() ;
 301     rv = PhosLoader()->TrackSegments() ;
 302   }
 303   return rv ;
 304 }
 305
 306 //____________________________________________________________________________
 307 AliPHOSTrackSegmentMaker * AliPHOSGetter::TrackSegmentMaker()
 308 {
 309   // Returns pointer to the TrackSegmentMaker task
 310   AliPHOSTrackSegmentMaker * rv ;
 311   rv =  dynamic_cast<AliPHOSTrackSegmentMaker *>(PhosLoader()->TrackSegmentMaker()) ;
 312   if (!rv) {
 313     Event(0, "T") ;
 314     rv =  dynamic_cast<AliPHOSTrackSegmentMaker *>(PhosLoader()->TrackSegmentMaker()) ;
 315   }
 316   return rv ;
 317 }
 318
 319 //____________________________________________________________________________
 320 TClonesArray * AliPHOSGetter::RecParticles() const
 321 {
 322   // asks the Loader to return the TrackSegments container
 323
 324   TClonesArray * rv = 0 ;
 325
 326   rv = PhosLoader()->RecParticles() ;
 327   if (!rv) {
 328     PhosLoader()->MakeRecParticlesArray() ;
 329     rv = PhosLoader()->RecParticles() ;
 330   }
 331   return rv ;
 332 }
 333 //____________________________________________________________________________
 334 void AliPHOSGetter::Event(Int_t event, const char* opt)
 335 {
 336   // Reads the content of all Tree's S, D and R
 337
 338 //   if ( event >= MaxEvent() ) {
 339 //     Error("Event", "%d not found in TreeE !", event) ;
 340 //     return ;
 341 //   }
 342
 343   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
 344
 345 //   // checks if we are dealing with test-beam data
 346 //   TBranch * btb = rl->TreeE()->GetBranch("AliPHOSBeamTestEvent") ;
 347 //   if(btb){
 348 //     if(!fBTE)
 349 //       fBTE = new AliPHOSBeamTestEvent() ;
 350 //     btb->SetAddress(&fBTE) ;
 351 //     btb->GetEntry(event) ;
 352 //   }
 353 //   else{
 354 //     if(fBTE){
 355 //       delete fBTE ;
 356 //       fBTE = 0 ;
 357 //     }
 358 //   }
 359
 360   // Loads the type of object(s) requested
 361
 362   rl->GetEvent(event) ;
 363
 364   if(strstr(opt,"X") || (strcmp(opt,"")==0)){
 365     ReadPrimaries() ;
 366   }
 367
 368   if(strstr(opt,"H")  ){
 369     ReadTreeH();
 370   }
 371
 372   if(strstr(opt,"S")  ){
 373     ReadTreeS() ;
 374   }
 375
 376   if(strstr(opt,"D") ){
 377     ReadTreeD() ;
 378   }
 379
 380   if(strstr(opt,"R") ){
 381     ReadTreeR() ;
 382   }
 383
 384   if( strstr(opt,"T") ){
 385     ReadTreeT() ;
 386   }
 387
 388   if( strstr(opt,"P") ){
 389     ReadTreeP() ;
 390   }
 391
 392   if( strstr(opt,"E") ){
 393     ReadTreeE(event) ;
 394   }
 395
 396 }
 397
 398
 399 //____________________________________________________________________________
 400 void AliPHOSGetter::Event(AliRawReader *rawReader, const char* opt, Bool_t isOldRCUFormat)
 401 {
 402   // Reads the raw event from rawReader
 403   // isOldRCUFormat defines whenever to assume
 404   // the old RCU format or not
 405
 406   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
 407
 408   if( strstr(opt,"W")  ){
 409     rawReader->NextEvent();
 410     Int_t iEvent = rl->GetEventNumber();
 411     rl->GetEvent(iEvent);
 412     ReadRaw(rawReader,isOldRCUFormat) ;
 413   }
 414
 415 }
 416
 417
 418 //____________________________________________________________________________
 419 Int_t AliPHOSGetter::EventNumber() const
 420   {
 421   // return the current event number
 422   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
 423   return static_cast<Int_t>(rl->GetEventNumber()) ;
 424 }
 425
 426 //____________________________________________________________________________
 427   TClonesArray * AliPHOSGetter::Hits() const
 428 {
 429   // asks the loader to return  the Hits container
 430
 431   TClonesArray * rv = 0 ;
 432
 433   rv = PhosLoader()->Hits() ;
 434   if ( !rv ) {
 435     PhosLoader()->LoadHits("read");
 436     rv = PhosLoader()->Hits() ;
 437   }
 438   return rv ;
 439 }
 440
 441 //____________________________________________________________________________
 442 AliPHOSGetter * AliPHOSGetter::Instance(const char* alirunFileName, const char* version, Option_t * openingOption)
 443 {
 444   // Creates and returns the pointer of the unique instance
 445   // Must be called only when the environment has changed
 446
 447   if(!fgObjGetter){ // first time the getter is called
 448     fgObjGetter = new AliPHOSGetter(alirunFileName, version, openingOption) ;
 449   }
 450   else { // the getter has been called previously
 451     AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(fgPhosLoader->GetTitle());
 452     if ( rl->GetFileName() == alirunFileName ) {// the alirunFile has the same name
 453       // check if the file is already open
 454       TFile * galiceFile = dynamic_cast<TFile *>(gROOT->FindObject(rl->GetFileName()) ) ;
 455
 456       if ( !galiceFile )
 457         fgObjGetter = new AliPHOSGetter(alirunFileName, version, openingOption) ;
 458
 459       else {  // the file is already open check the version name
 460         TString currentVersionName = rl->GetEventFolder()->GetName() ;
 461         TString newVersionName(version) ;
 462         if (currentVersionName == newVersionName)
 463           if(fgDebug)
 464             ::Warning( "Instance", "Files with version %s already open", currentVersionName.Data() ) ;
 465         else {
 466           fgObjGetter = new AliPHOSGetter(alirunFileName, version, openingOption) ;
 467         }
 468       }
 469     }
 470     else {
 471       AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(fgPhosLoader->GetTitle()) ;
 472       if ( strstr(version, AliConfig::GetDefaultEventFolderName()) ) // false in case of merging
 473         delete rl ;
 474       fgObjGetter = new AliPHOSGetter(alirunFileName, version, openingOption) ;
 475     }
 476   }
 477   if (!fgObjGetter)
 478     ::Error("AliPHOSGetter::Instance", "Failed to create the PHOS Getter object") ;
 479   else
 480     if (fgDebug)
 481       Print() ;
 482
 483   return fgObjGetter ;
 484 }
 485
 486 //____________________________________________________________________________
 487 AliPHOSGetter *  AliPHOSGetter::Instance()
 488 {
 489   // Returns the pointer of the unique instance already defined
 490
 491   if(!fgObjGetter && fgDebug)
 492      ::Warning("AliPHOSGetter::Instance", "Getter not initialized") ;
 493
 494    return fgObjGetter ;
 495
 496 }
 497
 498 //____________________________________________________________________________
 499 Int_t AliPHOSGetter::MaxEvent() const
 500 {
 501   // returns the number of events in the run (from TE)
 502
 503   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
 504   return static_cast<Int_t>(rl->GetNumberOfEvents()) ;
 505 }
 506
 507 //____________________________________________________________________________
 508 TParticle * AliPHOSGetter::Primary(Int_t index) const
 509 {
 510   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
 511   return rl->Stack()->Particle(index) ;
 512 }
 513
 514 //____________________________________________________________________________
 515 AliPHOS * AliPHOSGetter:: PHOS() const
 516 {
 517   // returns the PHOS object
 518   AliPHOSLoader *    loader = 0;
 519   static AliPHOSLoader * oldloader = 0;
 520   static AliPHOS * phos = 0;
 521
 522   loader = PhosLoader();
 523
 524   if ( loader != oldloader) {
 525     phos = dynamic_cast<AliPHOS*>(loader->GetModulesFolder()->FindObject("PHOS")) ;
 526     oldloader = loader;
 527   }
 528   if (!phos)
 529     if (fgDebug)
 530       Warning("PHOS", "PHOS module not found in module folders: %s", PhosLoader()->GetModulesFolder()->GetName() ) ;
 531   return phos ;
 532 }
 533
 534
 535
 536 //____________________________________________________________________________
 537 AliPHOSPID * AliPHOSGetter::PID()
 538 {
 539   // Returns pointer to the PID task
 540   AliPHOSPID * rv ;
 541   rv =  dynamic_cast<AliPHOSPID *>(PhosLoader()->PIDTask()) ;
 542   if (!rv) {
 543     Event(0, "P") ;
 544     rv =  dynamic_cast<AliPHOSPID *>(PhosLoader()->PIDTask()) ;
 545   }
 546   return rv ;
 547 }
 548
 549 //____________________________________________________________________________
 550 AliPHOSGeometry * AliPHOSGetter::PHOSGeometry() const
 551 {
 552   // Returns PHOS geometry
 553
 554   AliPHOSGeometry * rv = 0 ;
 555   if (PHOS() )
 556     rv =  PHOS()->GetGeometry() ;
 557   else {
 558     rv = AliPHOSGeometry::GetInstance();
 559     if (!rv) {
 560       AliError("Could not find PHOS geometry! Loading the default one !");
 561       rv = AliPHOSGeometry::GetInstance("IHEP","");
 562     }
 563   }
 564   return rv ;
 565 }
 566
 567 //____________________________________________________________________________
 568 TClonesArray * AliPHOSGetter::Primaries()
 569 {
 570   // creates the Primaries container if needed
 571   if ( !fPrimaries ) {
 572     if (fgDebug)
 573       Info("Primaries", "Creating a new TClonesArray for primaries") ;
 574     fPrimaries = new TClonesArray("TParticle", 1000) ;
 575   }
 576   return fPrimaries ;
 577 }
 578
 579 //____________________________________________________________________________
 580 void  AliPHOSGetter::Print()
 581 {
 582   // Print usefull information about the getter
 583
 584   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(fgPhosLoader->GetTitle());
 585   ::Info( "Print", "gAlice file is %s -- version name is %s", (rl->GetFileName()).Data(), rl->GetEventFolder()->GetName() ) ;
 586 }
 587
 588 //____________________________________________________________________________
 589 void AliPHOSGetter::ReadPrimaries()
 590 {
 591   // Read Primaries from Kinematics.root
 592
 593   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
 594
 595   // gets kine tree from the root file (Kinematics.root)
 596   if ( ! rl->TreeK() ) { // load treeK the first time
 597     rl->LoadKinematics() ;
 598   }
 599
 600   fNPrimaries = (rl->GetHeader())->GetNtrack();
 601   if (fgDebug)
 602     Info( "ReadTreeK", "Found %d particles in event # %d", fNPrimaries, EventNumber() ) ;
 603
 604
 605   // first time creates the container
 606   if ( Primaries() )
 607     fPrimaries->Clear() ;
 608
 609   Int_t index = 0 ;
 610   for (index = 0 ; index < fNPrimaries; index++) {
 611     new ((*fPrimaries)[index]) TParticle(*(Primary(index)));
 612   }
 613 }
 614
 615 //____________________________________________________________________________
 616 Bool_t AliPHOSGetter::OpenESDFile()
 617 {
 618   //Open the ESD file
 619   Bool_t rv = kTRUE ;
 620   if (!fESDFile) {
 621     fESDFile = TFile::Open(fESDFileName) ;
 622     if (!fESDFile )
 623       return kFALSE ;
 624   }
 625   else if (fESDFile->IsOpen()) {
 626     fESDFile->Close() ;
 627     fESDFile = TFile::Open(fESDFileName) ;
 628   }
 629   if (!fESDFile->IsOpen())
 630     rv = kFALSE ;
 631   return rv ;
 632 }
 633
 634 //____________________________________________________________________________
 635 void AliPHOSGetter::FitRaw(Bool_t lowGainFlag, TGraph * gLowGain, TGraph * gHighGain, TF1* signalF, Double_t & energy, Double_t & time) const
 636 {
 637   // Fits the raw signal time distribution
 638
 639   const Int_t kNoiseThreshold = 0 ;
 640   Double_t timezero1 = 0., timezero2 = 0., timemax = 0. ;
 641   Double_t signal = 0., signalmax = 0. ;
 642   time   = 0. ;
 643   energy = 0. ;
 644
 645   if (lowGainFlag) {
 646     timezero1 = timezero2 = signalmax = timemax = 0. ;
 647     signalF->FixParameter(0, PHOS()->GetRawFormatLowCharge()) ;
 648     signalF->FixParameter(1, PHOS()->GetRawFormatLowGain()) ;
 649     Int_t index ;
 650     for (index = 0; index < PHOS()->GetRawFormatTimeBins(); index++) {
 651       gLowGain->GetPoint(index, time, signal) ;
 652       if (signal > kNoiseThreshold && timezero1 == 0.)
 653         timezero1 = time ;
 654       if (signal <= kNoiseThreshold && timezero1 > 0. && timezero2 == 0.)
 655         timezero2 = time ;
 656       if (signal > signalmax) {
 657         signalmax = signal ;
 658         timemax   = time ;
 659       }
 660     }
 661     signalmax /= PHOS()->RawResponseFunctionMax(PHOS()->GetRawFormatLowCharge(),
 662                                                 PHOS()->GetRawFormatLowGain()) ;
 663     if ( timezero1 + PHOS()->GetRawFormatTimePeak() < PHOS()->GetRawFormatTimeMax() * 0.4 ) { // else its noise
 664       signalF->SetParameter(2, signalmax) ;
 665       signalF->SetParameter(3, timezero1) ;
 666       gLowGain->Fit(signalF, "QRO", "", 0., timezero2); //, "QRON") ;
 667       energy = signalF->GetParameter(2) ;
 668       time   = signalF->GetMaximumX() - PHOS()->GetRawFormatTimePeak() - PHOS()->GetRawFormatTimeTrigger() ;
 669     }
 670   } else {
 671     timezero1 = timezero2 = signalmax = timemax = 0. ;
 672     signalF->FixParameter(0, PHOS()->GetRawFormatHighCharge()) ;
 673     signalF->FixParameter(1, PHOS()->GetRawFormatHighGain()) ;
 674     Int_t index ;
 675     for (index = 0; index < PHOS()->GetRawFormatTimeBins(); index++) {
 676       gHighGain->GetPoint(index, time, signal) ;
 677       if (signal > kNoiseThreshold && timezero1 == 0.)
 678         timezero1 = time ;
 679       if (signal <= kNoiseThreshold && timezero1 > 0. && timezero2 == 0.)
 680         timezero2 = time ;
 681       if (signal > signalmax) {
 682         signalmax = signal ;
 683         timemax   = time ;
 684       }
 685     }
 686     signalmax /= PHOS()->RawResponseFunctionMax(PHOS()->GetRawFormatHighCharge(),
 687                                                 PHOS()->GetRawFormatHighGain()) ;;
 688     if ( timezero1 + PHOS()->GetRawFormatTimePeak() < PHOS()->GetRawFormatTimeMax() * 0.4 ) { // else its noise
 689       signalF->SetParameter(2, signalmax) ;
 690       signalF->SetParameter(3, timezero1) ;
 691       gHighGain->Fit(signalF, "QRO", "", 0., timezero2) ;
 692       energy = signalF->GetParameter(2) ;
 693       time   = signalF->GetMaximumX() - PHOS()->GetRawFormatTimePeak() - PHOS()->GetRawFormatTimeTrigger() ;
 694     }
 695   }
 696   if (time == 0) energy = 0 ;
 697 }
 698
 699 //____________________________________________________________________________
 700 Int_t AliPHOSGetter::CalibrateRaw(Double_t energy, Int_t *relId)
 701 {
 702   // Convert energy into digitized amplitude for a cell relId
 703   // It is a user responsilibity to open CDB and set
 704   // AliPHOSCalibData object by the following operators:
 705   //
 706   // AliCDBLocal *loc = new AliCDBLocal("deCalibDB");
 707   // AliPHOSCalibData* clb = (AliPHOSCalibData*)AliCDBStorage::Instance()
 708   //    ->Get(path_to_calibdata,run_number);
 709   // AliPHOSGetter* gime = AliPHOSGetter::Instance("galice.root");
 710   // gime->SetCalibData(clb);
 711
 712   if (CalibData() == 0)
 713     Warning("CalibrateRaw","Calibration DB is not initiated!");
 714
 715   Int_t   module = relId[0];
 716   Int_t   column = relId[3];
 717   Int_t   row    = relId[2];
 718
 719   Float_t gainFactor = 0.0015; // width of one Emc ADC channel in GeV
 720   Float_t pedestal   = 0.005;  // Emc pedestals
 721
 722   if(CalibData()) {
 723     gainFactor = CalibData()->GetADCchannelEmc (module,column,row);
 724     pedestal   = CalibData()->GetADCpedestalEmc(module,column,row);
 725   }
 726
 727   Int_t   amp = static_cast<Int_t>( (energy - pedestal) / gainFactor + 0.5 ) ;
 728   return amp;
 729 }
 730 //____________________________________________________________________________
 731 Int_t AliPHOSGetter::ReadRaw(AliRawReader *rawReader,Bool_t isOldRCUFormat)
 732 {
 733   // reads the raw format data, converts it into digits format and store digits in Digits()
 734   // container.
 735   // isOldRCUFormat = kTRUE in case of the old RCU
 736   // format used in the raw data readout.
 737   // Reimplemented by Boris Polichtchouk (Jul 2006)
 738   // to make it working with the Jul-Aug 2006 beam test data.
 739
 740
 741   AliPHOSRawStream in(rawReader);
 742   in.SetOldRCUFormat(isOldRCUFormat);
 743
 744   TF1 * signalF = new TF1("signal", AliPHOS::RawResponseFunction, 0, PHOS()->GetRawFormatTimeMax(), 4);
 745   signalF->SetParNames("Charge", "Gain", "Amplitude", "TimeZero") ;
 746
 747   Int_t relId[4], id =0;
 748   Bool_t lowGainFlag = kFALSE ;
 749
 750   TClonesArray * digits = Digits() ;
 751   digits->Clear() ;
 752
 753   Int_t iBin = 0;
 754   Int_t idigit = 0 ;
 755   Double_t energy = 0. ;
 756   Double_t time   = 0. ;
 757
 758   Int_t iDigLow = 0;
 759   Int_t iDigHigh = 0;
 760
 761   TGraph* gLowGain = 0;
 762   TGraph* gHighGain = 0;
 763
 764   while ( in.Next() ) { // PHOS entries loop
 765
 766     if(!gHighGain) gHighGain = new TGraph(in.GetTimeLength());
 767     if(!gLowGain)  gLowGain = new TGraph(in.GetTimeLength());
 768
 769     lowGainFlag = in.IsLowGain();
 770
 771     if(lowGainFlag)
 772       gLowGain->SetPoint(in.GetTimeLength()-iBin-1,in.GetTime(),in.GetSignal());
 773     else
 774       gHighGain->SetPoint(in.GetTimeLength()-iBin-1,in.GetTime(),in.GetSignal());
 775
 776     iBin++;
 777
 778     if(iBin==in.GetTimeLength()) {
 779       iBin=0;
 780
 781       if(lowGainFlag) iDigLow++;
 782       else iDigHigh++;
 783
 784       // Temporarily we do not fit the sample graph, but
 785       // take the energy from the graph maximum, and the pedestal from the 0th point
 786       // 30 Aug 2006
 787
 788       //FitRaw(lowGainFlag, gLowGain, gHighGain, signalF, energy, time);
 789       if(!lowGainFlag) {
 790         energy = gHighGain->GetHistogram()->GetMaximum();
 791         energy -= gHighGain->Eval(0); // "pedestal subtraction"
 792       }
 793       else {
 794         energy = gLowGain->GetHistogram()->GetMaximum();
 795         energy -= gLowGain->Eval(0); // "pedestal subtraction"
 796       }
 797
 798       time = -1;
 799
 800       relId[0] = in.GetModule();
 801       relId[1] = 0;
 802       relId[2] = in.GetRow();
 803       relId[3] = in.GetColumn();
 804       if(!PHOSGeometry()) Fatal("ReadRaw","Couldn't find PHOSGeometry!");
 805       PHOSGeometry()->RelToAbsNumbering(relId, id);
 806
 807       if(!lowGainFlag) {
 808         new((*digits)[idigit]) AliPHOSDigit(-1,id,(Float_t)energy,time);
 809         idigit++;
 810       }
 811
 812     }
 813   }
 814
 815   // PHOS entries loop
 816
 817   digits->Sort() ;
 818 //   printf("\t\t\t------ %d Digits: %d LowGain + %d HighGain.\n",
 819 //       digits->GetEntriesFast(),iDigLow,iDigHigh);
 820
 821   delete signalF ;
 822   delete gHighGain;
 823   delete gLowGain;
 824
 825   return digits->GetEntriesFast() ;
 826 }
 827
 828 //____________________________________________________________________________
 829 Int_t AliPHOSGetter::ReadTreeD() const
 830 {
 831   // Read the Digits
 832
 833   PhosLoader()->CleanDigits() ;
 834   PhosLoader()->LoadDigits("UPDATE") ;
 835   PhosLoader()->LoadDigitizer("UPDATE") ;
 836   return Digits()->GetEntries() ;
 837 }
 838
 839 //____________________________________________________________________________
 840 Int_t AliPHOSGetter::ReadTreeH() const
 841 {
 842   // Read the Hits
 843   PhosLoader()->CleanHits() ;
 844   // gets TreeH from the root file (PHOS.Hit.root)
 845   //if ( !IsLoaded("H") ) {
 846     PhosLoader()->LoadHits("UPDATE") ;
 847   //  SetLoaded("H") ;
 848   //}
 849   return Hits()->GetEntries() ;
 850 }
 851
 852 //____________________________________________________________________________
 853 Int_t AliPHOSGetter::ReadTreeR() const
 854 {
 855   // Read the RecPoints
 856
 857   PhosLoader()->CleanRecPoints() ;
 858   // gets TreeR from the root file (PHOS.RecPoints.root)
 859   //if ( !IsLoaded("R") ) {
 860     PhosLoader()->LoadRecPoints("UPDATE") ;
 861     PhosLoader()->LoadClusterizer("UPDATE") ;
 862     //  SetLoaded("R") ;
 863     //}
 864
 865   return EmcRecPoints()->GetEntries() ;
 866 }
 867
 868 //____________________________________________________________________________
 869 Int_t AliPHOSGetter::ReadTreeT() const
 870 {
 871   // Read the TrackSegments
 872
 873   PhosLoader()->CleanTracks() ;
 874   // gets TreeT from the root file (PHOS.TrackSegments.root)
 875   //if ( !IsLoaded("T") ) {
 876     PhosLoader()->LoadTracks("UPDATE") ;
 877     PhosLoader()->LoadTrackSegmentMaker("UPDATE") ;
 878     //    SetLoaded("T") ;
 879     //}
 880
 881   return TrackSegments()->GetEntries() ;
 882 }
 883 //____________________________________________________________________________
 884 Int_t AliPHOSGetter::ReadTreeP() const
 885 {
 886   // Read the RecParticles
 887
 888   PhosLoader()->CleanRecParticles() ;
 889
 890   // gets TreeT from the root file (PHOS.TrackSegments.root)
 891   //  if ( !IsLoaded("P") ) {
 892     PhosLoader()->LoadRecParticles("UPDATE") ;
 893     PhosLoader()->LoadPID("UPDATE") ;
 894     //  SetLoaded("P") ;
 895     //}
 896
 897   return RecParticles()->GetEntries() ;
 898 }
 899 //____________________________________________________________________________
 900 Int_t AliPHOSGetter::ReadTreeS() const
 901 {
 902   // Read the SDigits
 903
 904   PhosLoader()->CleanSDigits() ;
 905   // gets TreeS from the root file (PHOS.SDigits.root)
 906   //if ( !IsLoaded("S") ) {
 907     PhosLoader()->LoadSDigits("READ") ;
 908     PhosLoader()->LoadSDigitizer("READ") ;
 909     //  SetLoaded("S") ;
 910     //}
 911
 912   return SDigits()->GetEntries() ;
 913 }
 914
 915 //____________________________________________________________________________
 916 Int_t AliPHOSGetter::ReadTreeE(Int_t event)
 917 {
 918   // Read the ESD
 919
 920   // gets esdTree from the root file (AliESDs.root)
 921   if (!fESDFile)
 922     if ( !OpenESDFile() )
 923       return -1 ;
 924
 925   fESDTree = static_cast<TTree*>(fESDFile->Get("esdTree")) ;
 926   fESD = new AliESD;
 927    if (!fESDTree) {
 928
 929      Error("ReadTreeE", "no ESD tree found");
 930      return -1;
 931    }
 932    fESDTree->SetBranchAddress("ESD", &fESD);
 933    fESDTree->GetEvent(event);
 934
 935    return event ;
 936 }
 937
 938 //____________________________________________________________________________
 939 TClonesArray * AliPHOSGetter::SDigits() const
 940 {
 941   // asks the Loader to return the Digits container
 942
 943   TClonesArray * rv = 0 ;
 944
 945   rv = PhosLoader()->SDigits() ;
 946   if (!rv) {
 947     PhosLoader()->MakeSDigitsArray() ;
 948     rv = PhosLoader()->SDigits() ;
 949   }
 950   return rv ;
 951 }
 952
 953 //____________________________________________________________________________
 954 AliPHOSSDigitizer * AliPHOSGetter::SDigitizer()
 955 {
 956   // Returns pointer to the SDigitizer task
 957   AliPHOSSDigitizer * rv ;
 958   rv =  dynamic_cast<AliPHOSSDigitizer *>(PhosLoader()->SDigitizer()) ;
 959   if (!rv) {
 960     Event(0, "S") ;
 961     rv =  dynamic_cast<AliPHOSSDigitizer *>(PhosLoader()->SDigitizer()) ;
 962   }
 963   return rv ;
 964 }
 965
 966 //____________________________________________________________________________
 967 TParticle * AliPHOSGetter::Secondary(const TParticle* p, Int_t index) const
 968 {
 969   // Return first (index=1) or second (index=2) secondary particle of primary particle p
 970
 971   if(index <= 0)
 972     return 0 ;
 973   if(index > 2)
 974     return 0 ;
 975
 976   if(p) {
 977   Int_t daughterIndex = p->GetDaughter(index-1) ;
 978   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
 979   return  rl->GetAliRun()->GetMCApp()->Particle(daughterIndex) ;
 980   }
 981   else
 982     return 0 ;
 983 }
 984
 985 //____________________________________________________________________________
 986 void AliPHOSGetter::Track(Int_t itrack)
 987 {
 988   // Read the first entry of PHOS branch in hit tree gAlice->TreeH()
 989
 990  AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
 991
 992   if( !TreeH() ) // load treeH the first time
 993     rl->LoadHits() ;
 994
 995   // first time create the container
 996   TClonesArray * hits = Hits() ;
 997   if ( hits )
 998     hits->Clear() ;
 999
1000   TBranch * phosbranch = dynamic_cast<TBranch*>(TreeH()->GetBranch("PHOS")) ;
1001   phosbranch->SetAddress(&hits) ;
1002   phosbranch->GetEntry(itrack) ;
1003 }
1004
1005 //____________________________________________________________________________
1006 TTree * AliPHOSGetter::TreeD() const
1007 {
1008   // Returns pointer to the Digits Tree
1009   TTree * rv = 0 ;
1010   rv = PhosLoader()->TreeD() ;
1011   if ( !rv ) {
1012     PhosLoader()->MakeTree("D");
1013     rv = PhosLoader()->TreeD() ;
1014   }
1015
1016   return rv ;
1017 }
1018
1019 //____________________________________________________________________________
1020 TTree * AliPHOSGetter::TreeH() const
1021 {
1022   // Returns pointer to the Hits Tree
1023   TTree * rv = 0 ;
1024   rv = PhosLoader()->TreeH() ;
1025   if ( !rv ) {
1026     PhosLoader()->MakeTree("H");
1027     rv = PhosLoader()->TreeH() ;
1028   }
1029
1030   return rv ;
1031 }
1032
1033 //____________________________________________________________________________
1034 TTree * AliPHOSGetter::TreeR() const
1035 {
1036   // Returns pointer to the RecPoints Tree
1037   TTree * rv = 0 ;
1038   rv = PhosLoader()->TreeR() ;
1039   if ( !rv ) {
1040     PhosLoader()->MakeTree("R");
1041     rv = PhosLoader()->TreeR() ;
1042   }
1043
1044   return rv ;
1045 }
1046
1047 //____________________________________________________________________________
1048 TTree * AliPHOSGetter::TreeT() const
1049 {
1050   // Returns pointer to the TrackSegments Tree
1051   TTree * rv = 0 ;
1052   rv = PhosLoader()->TreeT() ;
1053   if ( !rv ) {
1054     PhosLoader()->MakeTree("T");
1055     rv = PhosLoader()->TreeT() ;
1056   }
1057
1058   return rv ;
1059 }
1060 //____________________________________________________________________________
1061 TTree * AliPHOSGetter::TreeP() const
1062 {
1063   // Returns pointer to the RecParticles  Tree
1064   TTree * rv = 0 ;
1065   rv = PhosLoader()->TreeP() ;
1066   if ( !rv ) {
1067     PhosLoader()->MakeTree("P");
1068     rv = PhosLoader()->TreeP() ;
1069   }
1070
1071   return rv ;
1072 }
1073
1074 //____________________________________________________________________________
1075 TTree * AliPHOSGetter::TreeS() const
1076 {
1077  // Returns pointer to the SDigits Tree
1078   TTree * rv = 0 ;
1079   rv = PhosLoader()->TreeS() ;
1080   if ( !rv ) {
1081     PhosLoader()->MakeTree("S");
1082     rv = PhosLoader()->TreeS() ;
1083   }
1084
1085   return rv ;
1086 }
1087
1088 //____________________________________________________________________________
1089 Bool_t AliPHOSGetter::VersionExists(TString & opt) const
1090 {
1091   // checks if the version with the present name already exists in the same directory
1092
1093   Bool_t rv = kFALSE ;
1094
1095   AliRunLoader * rl = AliRunLoader::GetRunLoader(PhosLoader()->GetTitle());
1096   TString version( rl->GetEventFolder()->GetName() ) ;
1097
1098   opt.ToLower() ;
1099
1100   if ( opt == "sdigits") {
1101     // add the version name to the root file name
1102     TString fileName( PhosLoader()->GetSDigitsFileName() ) ;
1103     if (version != AliConfig::GetDefaultEventFolderName()) // only if not the default folder name
1104       fileName = fileName.ReplaceAll(".root", "") + "_" + version + ".root" ;
1105     if ( !(gSystem->AccessPathName(fileName)) ) {
1106       Warning("VersionExists", "The file %s already exists", fileName.Data()) ;
1107       rv = kTRUE ;
1108     }
1109     PhosLoader()->SetSDigitsFileName(fileName) ;
1110   }
1111
1112   if ( opt == "digits") {
1113     // add the version name to the root file name
1114     TString fileName( PhosLoader()->GetDigitsFileName() ) ;
1115     if (version != AliConfig::GetDefaultEventFolderName()) // only if not the default folder name
1116       fileName = fileName.ReplaceAll(".root", "") + "_" + version + ".root" ;
1117     if ( !(gSystem->AccessPathName(fileName)) ) {
1118       Warning("VersionExists", "The file %s already exists", fileName.Data()) ;
1119       rv = kTRUE ;
1120     }
1121   }
1122
1123   return rv ;
1124
1125 }
1126
1127 //____________________________________________________________________________
1128 UShort_t AliPHOSGetter::EventPattern(void) const
1129 {
1130   // Return the pattern (trigger bit register) of the beam-test event
1131   if(fBTE)
1132     return fBTE->GetPattern() ;
1133   else
1134     return 0 ;
1135 }
1136 //____________________________________________________________________________
1137 Float_t AliPHOSGetter::BeamEnergy(void) const
1138 {
1139   // Return the beam energy of the beam-test event
1140   if(fBTE)
1141     return fBTE->GetBeamEnergy() ;
1142   else
1143     return 0 ;
1144 }
1145 //____________________________________________________________________________
1146
1147 AliPHOSCalibData* AliPHOSGetter::CalibData()
1148 {
1149   // Check if the instance of AliPHOSCalibData exists, and return it
1150
1151   return fgCalibData;
1152 }