PWG1/macros/RunAnalysisITS.C

   1 class AliAnalysisGrid;
   2
   3 void RunAnalysisITS() {
   4   //
   5   // Macro to analyze ESDs from raw data reconstruction
   6   // A.Dainese, andrea.dainese@pd.infn.it
   7   //
   8   //gSystem->Setenv("alien_CLOSE_SE","ALICE::CNAF::SE");
   9
  10   gSystem->SetIncludePath("-I. -I$ROOTSYS/include -I$ALICE_ROOT -I$ALICE_ROOT/include -I$ALICE_ROOT/ITS -I$ALICE_ROOT/TPC -I$ALICE_ROOT/CONTAINERS -I$ALICE_ROOT/STEER -I$ALICE_ROOT/TRD -I$ALICE_ROOT/macros -I$ALICE_ROOT/ANALYSIS -g");
  11
  12   //
  13   TString analysisMode = "local"; // "local", "grid", or "proof" (not yet)
  14
  15   Long64_t nentries=1000000000000000,firstentry=0;
  16   Bool_t useAlienPlugin=kFALSE;
  17   Bool_t uselibPWG1=kTRUE;
  18   TString pluginmode="full";
  19   TString loadMacroPath="./";
  20   Bool_t readHLT=kFALSE;
  21   //
  22
  23   if(analysisMode=="grid") {
  24     // Connect to AliEn
  25     TGrid::Connect("alien://");
  26   } else if(analysisMode=="proof") {
  27     // Connect to the PROOF cluster
  28     printf("PROOF mode not yet functional..\n");
  29     return;
  30     TProof::Open("alicecaf");
  31     //TProof::Reset("alicecaf");
  32   }
  33
  34   // Load analysis libraries
  35   gSystem->Load("libANALYSIS.so");
  36   gSystem->Load("libANALYSISalice.so");
  37   if(uselibPWG1) {gSystem->Load("libTENDER.so"); gSystem->Load("libPWG1.so");}
  38
  39   // Create Alien plugin, if requested
  40   if(useAlienPlugin) {
  41     AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(pluginmode,uselibPWG1);
  42     if(!alienHandler) return;
  43   }
  44
  45   TChain *chainESD = 0;
  46   if(!useAlienPlugin) {
  47     // Prepare input chain
  48     //    chainESD = CreateESDChain("/home/dainesea/alignData/RAWdata_CosmicsSum09/RecoSPD/chunk.",13,13);
  49     chainESD=new TChain("esdTree");
  50     //chainESD->Add("alien:///alice/cern.ch/user/s/sitta/output/000088361/ESDs/pass1/09000088361017.10/AliESDs.root");
  51     chainESD->Add("AliESDs.root");
  52   }
  53
  54   // Create the analysis manager
  55   AliAnalysisManager *mgr  = new AliAnalysisManager("My Manager","My Manager");
  56   // Enable debug printouts
  57   mgr->SetDebugLevel(10);
  58   // Connect plug-in to the analysis manager
  59   if(useAlienPlugin) mgr->SetGridHandler(alienHandler);
  60
  61   // Add ESD handler
  62   AliESDInputHandler *esdH = new AliESDInputHandler();
  63   if(readHLT) esdH->SetReadHLT();
  64   mgr->SetInputEventHandler(esdH);
  65
  66   //-------------------------------------------------------------------
  67
  68
  69   //-------------------------------------------------------------------
  70   // Analysis tasks (wagons of the train)
  71   //
  72   TString taskName;
  73
  74   if(!uselibPWG1) gROOT->LoadMacro("AliAlignmentDataFilterITS.cxx++g");
  75   taskName="AddTaskAlignmentDataFilterITS.C";
  76   taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());
  77   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());
  78   AliAlignmentDataFilterITS *itsTask = AddTaskAlignmentDataFilterITS();
  79
  80   if(!uselibPWG1) gROOT->LoadMacro("AliTrackMatchingTPCITSCosmics.cxx++g");
  81   taskName="AddTaskTrackMatchingTPCITS.C";
  82   taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());
  83   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());
  84   AliTrackMatchingTPCITSCosmics *tpcitsTask = AddTaskTrackMatchingTPCITS();
  85   if(readHLT) tpcitsTask->SetReadHLTESD(kTRUE);
  86   /*
  87   Bool_t readMC=kTRUE;
  88
  89   if(!uselibPWG1) gROOT->LoadMacro("AliAnalysisTaskVertexESD.cxx++g");
  90   taskName="AddTaskVertexESD.C";
  91   taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());
  92   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());
  93   AliAnalysisTaskVertexESD *vtxTask = AddTaskVertexESD(readMC);
  94
  95   if(!uselibPWG1) gROOT->LoadMacro("AliAnalysisTaskITSTrackingCheck.cxx++g");
  96   taskName="AddTaskPerformanceITS.C";
  97   taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());
  98   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());
  99   AliAnalysisTaskITSTrackingCheck *itsTask = AddTaskPerformanceITS(readMC);
 100
 101   if(readMC) {
 102     AliMCEventHandler  *mcH = new AliMCEventHandler();
 103     mgr->SetMCtruthEventHandler(mcH);
 104   }
 105   */
 106   //
 107   // Run the analysis
 108   //
 109   if(chainESD) printf("CHAIN HAS %d ENTRIES\n",(Int_t)chainESD->GetEntries());
 110
 111   if(!mgr->InitAnalysis()) return;
 112   mgr->PrintStatus();
 113   if(analysisMode=="grid" && !useAlienPlugin) analysisMode="local";
 114   mgr->StartAnalysis(analysisMode.Data(),chainESD,nentries,firstentry);
 115
 116   return;
 117 }
 118 //_____________________________________________________________________________
 119 //
 120 AliAnalysisGrid* CreateAlienHandler(TString pluginmode="test",
 121                                     Bool_t uselibPWG1=kFALSE)
 122 {
 123   // Check if user has a valid token, otherwise make one. This has limitations.
 124   // One can always follow the standard procedure of calling alien-token-init then
 125   //   source /tmp/gclient_env_$UID in the current shell.
 126    if (!AliAnalysisGrid::CreateToken()) return NULL;
 127    AliAnalysisAlien *plugin = new AliAnalysisAlien();
 128    // Set the run mode (can be "full", "test", "offline", "submit" or "terminate")
 129    plugin->SetRunMode(pluginmode.Data());
 130    plugin->SetUser("dainesea");
 131    plugin->SetNtestFiles(1);
 132    // Set versions of used packages
 133    plugin->SetAPIVersion("V2.4");
 134    plugin->SetROOTVersion("v5-24-00");
 135    plugin->SetAliROOTVersion("v4-18-07-AN");
 136    // Declare input data to be processed.
 137    // Method 1: Create automatically XML collections using alien 'find' command.
 138    // Define production directory LFN
 139    plugin->SetGridDataDir("/alice/data/2009/LHC09c");
 140    //plugin->SetGridDataDir("/alice/cern.ch/user/s/sitta/output/000088361/");
 141    // Set data search pattern
 142    //plugin->SetDataPattern("AliESDs.root");
 143    plugin->SetDataPattern("ESD.tag.root");
 144    Int_t n=0;
 145    n++; plugin->AddRunNumber("000080015");
 146    n++; plugin->AddRunNumber("000080261");
 147    plugin->SetNrunsPerMaster(n);
 148    // Method 2: Declare existing data files (raw collections, xml collections, root file)
 149    // If no path mentioned data is supposed to be in the work directory (see SetGridWorkingDir())
 150    // XML collections added via this method can be combined with the first method if
 151    // the content is compatible (using or not tags)
 152    // e.g.: find -z -x 80015 /alice/data/2009/LHC09c/000080015/ESDs/ ESD.tag.root > 80015.xml
 153    //plugin->AddDataFile("79876.xml");
 154    //plugin->AddDataFile("80015.xml");
 155    //plugin->AddDataFile("80261.xml");
 156    //   plugin->AddDataFile("/alice/data/2008/LHC08c/000057657/raw/Run57657.Merged.RAW.tag.root");
 157    // Define alien work directory where all files will be copied. Relative to alien $HOME.
 158    plugin->SetGridWorkingDir("analysisITS");
 159    // Declare alien output directory. Relative to working directory.
 160    plugin->SetGridOutputDir("output151009"); // In this case will be $HOME/work/output
 161    // Declare the analysis source files names separated by blancs. To be compiled runtime
 162    // using ACLiC on the worker nodes.
 163    if(!uselibPWG1) {
 164      plugin->SetAnalysisSource("AliAlignmentDataFilterITS.cxx");
 165      plugin->SetAnalysisSource("AliTrackMatchingTPCITSCosmics.cxx");
 166    }
 167    // Declare all libraries (other than the default ones for the framework. These will be
 168    // loaded by the generated analysis macro. Add all extra files (task .cxx/.h) here.
 169    //plugin->SetAdditionalLibs("AliAlignmentDataFilterITS.h AliAlignmentDataFilterITS.cxx libProof.so libRAWDatabase.so libRAWDatarec.so libCDB.so libSTEER.so libITSbase.so libITSrec.so");
 170    plugin->AddIncludePath("-I. -I$ROOTSYS/include -I$ALICE_ROOT -I$ALICE_ROOT/include -I$ALICE_ROOT/ITS -I$ALICE_ROOT/TPC -I$ALICE_ROOT/CONTAINERS -I$ALICE_ROOT/STEER -I$ALICE_ROOT/TRD -I$ALICE_ROOT/macros -I$ALICE_ROOT/ANALYSIS -g");
 171    if(!uselibPWG1) {
 172      plugin->SetAdditionalLibs("AliAlignmentDataFilterITS.h AliAlignmentDataFilterITS.cxx AliTrackMatchingTPCITSCosmics.h AliTrackMatchingTPCITSCosmics.cxx libProof.so libRAWDatabase.so libRAWDatarec.so libCDB.so libSTEER.so libITSbase.so libITSrec.so");
 173    } else {
 174      plugin->SetAdditionalLibs("libGui.so libProof.so libMinuit.so libRAWDatabase.so libRAWDatarec.so libCDB.so libSTEER.so libITSbase.so libITSrec.so libTPCbase.so libTPCrec.so libTRDbase.so libTRDrec.so libTENDER.so libPWG1.so");
 175    }
 176    // Declare the output file names separated by blancs.
 177    // (can be like: file.root or file.root@ALICE::Niham::File)
 178    plugin->SetDefaultOutputs(kTRUE);
 179    // Optionally define the files to be archived.
 180    //   plugin->SetOutputArchive("log_archive.zip:stdout,stderr@ALICE::NIHAM::File root_archive.zip:*.root@ALICE::NIHAM::File");
 181    plugin->SetOutputArchive("log_archive.zip:stdout,stderr");
 182    // Optionally set a name for the generated analysis macro (default MyAnalysis.C)
 183    plugin->SetAnalysisMacro("AnalysisITS.C");
 184    // Optionally set maximum number of input files/subjob (default 100, put 0 to ignore)
 185    plugin->SetSplitMaxInputFileNumber(1);
 186    // Optionally set number of failed jobs that will trigger killing waiting sub-jobs.
 187    //plugin->SetMaxInitFailed(5);
 188    // Optionally resubmit threshold.
 189    //plugin->SetMasterResubmitThreshold(90);
 190    // Optionally set time to live (default 30000 sec)
 191    //plugin->SetTTL(20000);
 192    // Optionally set input format (default xml-single)
 193    plugin->SetInputFormat("xml-single");
 194    // Optionally modify the name of the generated JDL (default analysis.jdl)
 195    plugin->SetJDLName("TaskAnalysisITS.jdl");
 196    // Optionally modify job price (default 1)
 197    //plugin->SetPrice(1);
 198    // Optionally modify split mode (default 'se')
 199    plugin->SetSplitMode("se");
 200    // Optionally set the preferred SE
 201    plugin->SetPreferedSE("ALICE::CNAF::SE");
 202
 203    return plugin;
 204 }
 205 //-----------------------------------------------------------------------------
 206 TChain *CreateESDChain(TString esdpath=".",Int_t ifirst=-1,Int_t ilast=-1) {
 207
 208
 209   TChain *chainESD = new TChain("esdTree");
 210
 211   if(ifirst<0) {
 212     chainESD->Add("AliESDs.root");
 213   } else {
 214     for(Int_t i=ifirst; i<=ilast; i++) {
 215       TString esdfile=esdpath; esdfile+=i; esdfile.Append("/AliESDs.root");
 216       chainESD->Add(esdfile.Data());
 217     }
 218   }
 219
 220   return chainESD;
 221 }