PWG3/vertexingHF/RunAnalysisAODVertexingHF.C

   1 class AliAnalysisGrid;\r
   2 \r
   3 void RunAnalysisAODVertexingHF()\r
   4 {\r
   5   //\r
   6   // Test macro for AliAnalysisTaskSE's for heavy-flavour candidates\r
   7   // It has the structure of a Analysis Train:\r
   8   // - in this macro, change things related to running mode\r
   9   //   and input preparation \r
  10   // - add your task using a AddTaskXXX macro \r
  11   //\r
  12   // A.Dainese, andrea.dainese@lnl.infn.it\r
  13   // "grid" mode added by R.Bala, bala@to.infn.it\r
  14   //\r
  15 \r
  16   //\r
  17   TString analysisMode = "grid"; // "local", "grid", or "proof" (not yet)\r
  18   TString inputMode    = "list"; // "list", "xml", or "dataset" (not yet)\r
  19   Long64_t nentries=1234567890,firstentry=0;\r
  20   Bool_t useParFiles=kTRUE;\r
  21   Bool_t useAlienPlugin=kTRUE;\r
  22   TString pluginmode="full";\r
  23   TString loadMacroPath="$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/";\r
  24   //\r
  25 \r
  26   if(analysisMode=="grid") {\r
  27     // Connect to AliEn\r
  28     TGrid::Connect("alien://");\r
  29   } else if(analysisMode=="proof") {\r
  30     // Connect to the PROOF cluster\r
  31     printf("PROOF mode not yet functional..\n");\r
  32     return;\r
  33     TProof::Open("alicecaf");\r
  34     //TProof::Reset("alicecaf");\r
  35   }\r
  36 \r
  37 \r
  38   // AliRoot libraries\r
  39   if(analysisMode=="local" || analysisMode=="grid") {\r
  40     TString loadLibraries="LoadLibraries.C"; loadLibraries.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
  41     gROOT->LoadMacro(loadLibraries.Data());\r
  42     LoadLibraries(useParFiles);\r
  43   } else if (analysisMode=="proof") {\r
  44     gSystem->Load("libTree.so");\r
  45     gSystem->Load("libGeom.so");\r
  46     gSystem->Load("libPhysics.so");\r
  47     gSystem->Load("libVMC.so");    \r
  48     // Enable the needed packages\r
  49     //gProof->ClearPackages();\r
  50     if(!useParFiles) {\r
  51       gProof->UploadPackage("AF-v4-16");\r
  52       gProof->EnablePackage("AF-v4-16");\r
  53     } else {\r
  54       TString parDir="/afs/cern.ch/user/d/dainesea/code/";\r
  55       TString parFile;\r
  56       // --- Enable the STEERBase Package\r
  57       parFile="STEERBase.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  58       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  59       gProof->EnablePackage("STEERBase");\r
  60       // --- Enable the ESD Package\r
  61       parFile="ESD.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  62       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  63       gProof->EnablePackage("ESD");\r
  64       // --- Enable the AOD Package\r
  65       parFile="AOD.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  66       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  67       gProof->EnablePackage("AOD");\r
  68       // --- Enable the ANALYSIS Package\r
  69       parFile="ANALYSIS.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  70       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  71       gProof->EnablePackage("ANALYSIS");\r
  72       // --- Enable the ANALYSISalice Package\r
  73       parFile="ANALYSISalice.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  74       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  75       gProof->EnablePackage("ANALYSISalice");\r
  76       // --- Enable the CORRFW Package\r
  77       parFile="CORRFW.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  78       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  79       gProof->EnablePackage("CORRFW");\r
  80       // --- Enable the PWG3vertexingHF Package\r
  81       parFile="PWG3vertexingHF.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  82       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  83       gProof->EnablePackage("PWG3vertexingHF");\r
  84     }\r
  85     gProof->ShowEnabledPackages(); // show a list of enabled packages\r
  86   }\r
  87 \r
  88 \r
  89   // Create Alien plugin, if requested\r
  90   if(useAlienPlugin) {  \r
  91     AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(pluginmode,useParFiles);  \r
  92     if(!alienHandler) return;\r
  93   }\r
  94 \r
  95 \r
  96   //-------------------------------------------------------------------\r
  97   // Prepare input chain\r
  98   TChain *chainAOD = 0;\r
  99   TString dataset; // for proof\r
 100 \r
 101   if(!useAlienPlugin) {\r
 102     TString makeAODInputChain="MakeAODInputchain.C"; loadLibraries.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 103     gROOT->LoadMacro(makeAODInputChain.Data());\r
 104     if(inputMode=="list") {\r
 105       // Local files\r
 106       chainAOD = MakeAODInputChain();// with this it reads ./AliAOD.root and ./AliAOD.VertexingHF.root\r
 107       chainAOD = MakeAODInputChain("alien:///alice/cern.ch/user/r/rbala/newtrain/out_lhc08x/180100/",1,1);\r
 108     } else if(inputMode=="xml") {\r
 109       // xml\r
 110       chainAOD = MakeAODInputChain("collection_aod.xml","collection_aodHF.xml");\r
 111     } else if(inputMode=="dataset") {\r
 112       // CAF dataset\r
 113       //gProof->ShowDataSet();\r
 114       dataset="/ITS/dainesea/AODVertexingHF_LHC08x_180100_small";\r
 115       chainAOD = MakeAODInputChainCAF(dataset.Data());\r
 116     }\r
 117   }\r
 118 \r
 119   // Create the analysis manager\r
 120   AliAnalysisManager *mgr  = new AliAnalysisManager("My Manager","My Manager");\r
 121   mgr->SetDebugLevel(10);\r
 122   // Connect plug-in to the analysis manager\r
 123   if(useAlienPlugin) mgr->SetGridHandler(alienHandler);\r
 124 \r
 125 \r
 126   // Input\r
 127   AliAODInputHandler *inputHandler = new AliAODInputHandler();\r
 128   mgr->SetInputEventHandler(inputHandler);\r
 129   //-------------------------------------------------------------------\r
 130 \r
 131   \r
 132   //-------------------------------------------------------------------\r
 133   // Analysis tasks (wagons of the train)   \r
 134   //\r
 135   TString taskName;\r
 136 \r
 137   taskName="AddTaskCompareHF.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 138   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 139   AliAnalysisTaskSECompareHF *cmpTask = AddTaskCompareHF();\r
 140 \r
 141   //taskName="AddTaskSelectHF.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 142   //gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 143   //AliAnalysisTaskSESelectHF *seleTask = AddTaskSelectHF();\r
 144 \r
 145   //taskName="AddTaskBkgLikeSign.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 146   //gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 147   //AliAnalysisTaskSEBkgLikeSignJPSI *lsTask = AddTaskBkgLikeSign();\r
 148 \r
 149   //taskName="AddTaskBtoJPSItoEle.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 150   //gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 151   //AliAnalysisTaskSEBtoJPSItoEle *jpsiTask = AddTaskBtoJPSItoEle();\r
 152 \r
 153   //taskName="AddTaskCF.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 154   //gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 155   //AliCFHeavyFlavourTask *cfTask = AddTaskCF();\r
 156 \r
 157   //taskName="AddTaskCFMultiVar.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 158   //gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 159   //AliCFHeavyFlavourTaskMultiVar *cfmvTask = AddTaskCFMultiVar();\r
 160 \r
 161   //taskName="AddTaskMultiVarMultiStep.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 162   //gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 163   //AliCFHeavyFlavourTaskMultiVarMultiStep *cfmvmsTask = AddTaskCFMultiVarMultiStep();\r
 164 \r
 165 \r
 166   //-------------------------------------------------------------------\r
 167 \r
 168   //\r
 169   // Run the analysis\r
 170   //    \r
 171   if(chainAOD) printf("CHAIN HAS %d ENTRIES\n",(Int_t)chainAOD->GetEntries());\r
 172 \r
 173   if(!mgr->InitAnalysis()) return;\r
 174   mgr->PrintStatus();\r
 175   if(analysisMode=="grid" && !useAlienPlugin) analysisMode="local";\r
 176   mgr->StartAnalysis(analysisMode.Data(),chainAOD,nentries,firstentry);\r
 177 \r
 178   return;\r
 179 }\r
 180 //_____________________________________________________________________________\r
 181 //\r
 182 AliAnalysisGrid* CreateAlienHandler(TString pluginmode="test",Bool_t useParFiles=kFALSE)\r
 183 {\r
 184   // Check if user has a valid token, otherwise make one. This has limitations.\r
 185   // One can always follow the standard procedure of calling alien-token-init then\r
 186   //   source /tmp/gclient_env_$UID in the current shell.\r
 187    if (!AliAnalysisGrid::CreateToken()) return NULL;\r
 188    AliAnalysisAlien *plugin = new AliAnalysisAlien();\r
 189    // Set the run mode (can be "full", "test", "offline", "submit" or "terminate")\r
 190    plugin->SetRunMode(pluginmode.Data());\r
 191    plugin->SetUser("dainesea");\r
 192    plugin->SetNtestFiles(1);\r
 193    // Set versions of used packages\r
 194    plugin->SetAPIVersion("V2.4");\r
 195    plugin->SetROOTVersion("v5-23-02");\r
 196    plugin->SetAliROOTVersion("v4-17-00");\r
 197    // Declare input data to be processed.\r
 198    // Method 1: Create automatically XML collections using alien 'find' command.\r
 199    // Define production directory LFN\r
 200    plugin->SetGridDataDir("/alice/cern.ch/user/r/rbala/newtrain/out_lhc08x/");\r
 201    // Set data search pattern\r
 202    plugin->SetDataPattern("AliAOD.root");\r
 203    plugin->SetFriendChainName("AliAOD.VertexingHF.root");\r
 204    // ...then add run numbers to be considered\r
 205    plugin->AddRunNumber(180100);\r
 206    // Method 2: Declare existing data files (raw collections, xml collections, root file)\r
 207    // If no path mentioned data is supposed to be in the work directory (see SetGridWorkingDir())\r
 208    // XML collections added via this method can be combined with the first method if\r
 209    // the content is compatible (using or not tags)\r
 210    //plugin->AddDataFile("/alice/cern.ch/user/r/rbala/newtrain/collection/collection_aod_lhc08w.xml");\r
 211    //   plugin->AddDataFile("/alice/data/2008/LHC08c/000057657/raw/Run57657.Merged.RAW.tag.root");\r
 212    // Define alien work directory where all files will be copied. Relative to alien $HOME.\r
 213    plugin->SetGridWorkingDir("work");\r
 214    // Declare alien output directory. Relative to working directory.\r
 215    plugin->SetGridOutputDir("output"); // In this case will be $HOME/work/output\r
 216    // Declare the analysis source files names separated by blancs. To be compiled runtime\r
 217    // using ACLiC on the worker nodes.\r
 218    //plugin->SetAnalysisSource("$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/AliAnalysisTaskSECompareHF.cxx");\r
 219    // Declare all libraries (other than the default ones for the framework. These will be\r
 220    // loaded by the generated analysis macro. Add all extra files (task .cxx/.h) here.\r
 221    plugin->SetAdditionalLibs("libPWG3vertexingHF.so");\r
 222    // use par files\r
 223    if(useParFiles) {\r
 224      plugin->EnablePackage("STEERBase.par");\r
 225      plugin->EnablePackage("ESD.par");\r
 226      plugin->EnablePackage("AOD.par");\r
 227      plugin->EnablePackage("ANALYSIS.par");\r
 228      plugin->EnablePackage("ANALYSISalice.par");\r
 229      plugin->EnablePackage("CORRFW.par");\r
 230      plugin->EnablePackage("PWG3vertexingHF.par");\r
 231    }\r
 232    // Declare the output file names separated by blancs.\r
 233    // (can be like: file.root or file.root@ALICE::Niham::File)\r
 234    plugin->SetOutputFiles("CmpHF.root");\r
 235    // Optionally define the files to be archived.\r
 236    //   plugin->SetOutputArchive("log_archive.zip:stdout,stderr@ALICE::NIHAM::File root_archive.zip:*.root@ALICE::NIHAM::File");\r
 237    plugin->SetOutputArchive("log_archive.zip:stdout,stderr");\r
 238    // Optionally set a name for the generated analysis macro (default MyAnalysis.C)\r
 239    plugin->SetAnalysisMacro("AnalysisHF.C");\r
 240    // Optionally set maximum number of input files/subjob (default 100, put 0 to ignore)\r
 241    plugin->SetSplitMaxInputFileNumber(5);\r
 242    // Optionally set number of failed jobs that will trigger killing waiting sub-jobs.\r
 243    //plugin->SetMaxInitFailed(5);\r
 244    // Optionally resubmit threshold.\r
 245    //plugin->SetMasterResubmitThreshold(90);\r
 246    // Optionally set time to live (default 30000 sec)\r
 247    //plugin->SetTTL(20000);\r
 248    // Optionally set input format (default xml-single)\r
 249    plugin->SetInputFormat("xml-single");\r
 250    // Optionally modify the name of the generated JDL (default analysis.jdl)\r
 251    plugin->SetJDLName("TaskHF.jdl");\r
 252    // Optionally modify job price (default 1)\r
 253    //plugin->SetPrice(1);      \r
 254    // Optionally modify split mode (default 'se')    \r
 255    plugin->SetSplitMode("se");\r
 256    // Optionally set the preferred SE    \r
 257    plugin->SetPreferedSE("ALICE::Legnaro::SE");\r
 258    \r
 259    return plugin;\r
 260 }\r