PWG3/vertexingHF/RunAnalysisAODVertexingHF.C

   1 class AliAnalysisGrid;\r
   2 \r
   3 void RunAnalysisAODVertexingHF()\r
   4 {\r
   5   //\r
   6   // Test macro for AliAnalysisTaskSE's for heavy-flavour candidates\r
   7   // It has the structure of a Analysis Train:\r
   8   // - in this macro, change things related to running mode\r
   9   //   and input preparation \r
  10   // - add your task using a AddTaskXXX macro \r
  11   //\r
  12   // A.Dainese, andrea.dainese@lnl.infn.it\r
  13   // "grid" mode added by R.Bala, bala@to.infn.it\r
  14   //\r
  15 \r
  16   //\r
  17   TString analysisMode = "grid"; // "local", "grid", or "proof" (not yet)\r
  18   TString inputMode    = "list"; // "list", "xml", or "dataset" (not yet)\r
  19   Long64_t nentries=1234567890,firstentry=0;\r
  20   Bool_t useParFiles=kFALSE;\r
  21   Bool_t useAlienPlugin=kTRUE;\r
  22   TString pluginmode="test";\r
  23   TString loadMacroPath="$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/";\r
  24   //\r
  25 \r
  26   if(analysisMode=="grid") {\r
  27     // Connect to AliEn\r
  28     TGrid::Connect("alien://");\r
  29   } else if(analysisMode=="proof") {\r
  30     // Connect to the PROOF cluster\r
  31     printf("PROOF mode not yet functional..\n");\r
  32     return;\r
  33     TProof::Open("alicecaf");\r
  34     //TProof::Reset("alicecaf");\r
  35   }\r
  36 \r
  37 \r
  38   // AliRoot libraries\r
  39   if(analysisMode=="local" || analysisMode=="grid") {\r
  40     TString loadLibraries="LoadLibraries.C"; loadLibraries.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
  41     gROOT->LoadMacro(loadLibraries.Data());\r
  42     LoadLibraries(useParFiles);\r
  43   } else if (analysisMode=="proof") {\r
  44     gSystem->Load("libTree.so");\r
  45     gSystem->Load("libGeom.so");\r
  46     gSystem->Load("libPhysics.so");\r
  47     gSystem->Load("libVMC.so");    \r
  48     // Enable the needed packages\r
  49     //gProof->ClearPackages();\r
  50     if(!useParFiles) {\r
  51       gProof->UploadPackage("AF-v4-16");\r
  52       gProof->EnablePackage("AF-v4-16");\r
  53     } else {\r
  54       TString parDir="/afs/cern.ch/user/d/dainesea/code/";\r
  55       TString parFile;\r
  56       // --- Enable the STEERBase Package\r
  57       parFile="STEERBase.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  58       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  59       gProof->EnablePackage("STEERBase");\r
  60       // --- Enable the ESD Package\r
  61       parFile="ESD.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  62       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  63       gProof->EnablePackage("ESD");\r
  64       // --- Enable the AOD Package\r
  65       parFile="AOD.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  66       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  67       gProof->EnablePackage("AOD");\r
  68       // --- Enable the ANALYSIS Package\r
  69       parFile="ANALYSIS.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  70       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  71       gProof->EnablePackage("ANALYSIS");\r
  72       // --- Enable the ANALYSISalice Package\r
  73       parFile="ANALYSISalice.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  74       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  75       gProof->EnablePackage("ANALYSISalice");\r
  76       // --- Enable the CORRFW Package\r
  77       parFile="CORRFW.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  78       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  79       gProof->EnablePackage("CORRFW");\r
  80       // --- Enable the PWG3base Package\r
  81       parFile="PWG3base.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  82       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  83       gProof->EnablePackage("PWG3base");\r
  84       // --- Enable the PWG3vertexingHF Package\r
  85       parFile="PWG3vertexingHF.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  86       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  87       gProof->EnablePackage("PWG3vertexingHF");\r
  88       // --- Enable the JETAN Package\r
  89       parFile="JETAN.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  90       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  91       gProof->EnablePackage("JETAN");\r
  92       // --- Enable the PWG3muon Package\r
  93       parFile="PWG3muon.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  94       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  95       gProof->EnablePackage("PWG3muon");\r
  96       // --- Enable the PWG4PartCorrBase Package\r
  97       parFile="PWG4PartCorrBase.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  98       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  99       gProof->EnablePackage("PWG4PartCorrBase");\r
 100       // --- Enable the PWG4PartCorrDep Package\r
 101       parFile="PWG4PartCorrDep.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
 102       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
 103       gProof->EnablePackage("PWG4PartCorrDep");\r
 104     }\r
 105     gProof->ShowEnabledPackages(); // show a list of enabled packages\r
 106   }\r
 107 \r
 108 \r
 109   // Create Alien plugin, if requested\r
 110   if(useAlienPlugin) {  \r
 111     AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(pluginmode,useParFiles);  \r
 112     if(!alienHandler) return;\r
 113   }\r
 114 \r
 115 \r
 116   //-------------------------------------------------------------------\r
 117   // Prepare input chain\r
 118   TChain *chainAOD = 0;\r
 119   TString dataset; // for proof\r
 120 \r
 121   if(!useAlienPlugin) {\r
 122     TString makeAODInputChain="MakeAODInputChain.C"; makeAODInputChain.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 123     gROOT->LoadMacro(makeAODInputChain.Data());\r
 124     if(inputMode=="list") {\r
 125       // Local files\r
 126       chainAOD = MakeAODInputChain();// with this it reads ./AliAOD.root and ./AliAOD.VertexingHF.root\r
 127       //chainAOD = MakeAODInputChain("alien:///alice/cern.ch/user/r/rbala/newtrain/out_lhc08x/180100/",1,1);\r
 128     } else if(inputMode=="xml") {\r
 129       // xml\r
 130       chainAOD = MakeAODInputChain("collection_aod.xml","collection_aodHF.xml");\r
 131     } else if(inputMode=="dataset") {\r
 132       // CAF dataset\r
 133       //gProof->ShowDataSet();\r
 134       dataset="/ITS/dainesea/AODVertexingHF_LHC08x_180100_small";\r
 135       chainAOD = MakeAODInputChainCAF(dataset.Data());\r
 136     }\r
 137   }\r
 138 \r
 139   // Create the analysis manager\r
 140   AliAnalysisManager *mgr  = new AliAnalysisManager("My Manager","My Manager");\r
 141   mgr->SetDebugLevel(10);\r
 142   // Connect plug-in to the analysis manager\r
 143   if(useAlienPlugin) mgr->SetGridHandler(alienHandler);\r
 144 \r
 145 \r
 146   // Input\r
 147   AliAODInputHandler *inputHandler = new AliAODInputHandler();\r
 148   mgr->SetInputEventHandler(inputHandler);\r
 149   //-------------------------------------------------------------------\r
 150 \r
 151   \r
 152   //-------------------------------------------------------------------\r
 153   // Analysis tasks (wagons of the train)   \r
 154   //\r
 155   TString taskName;\r
 156 \r
 157   taskName="AddTaskCompareHF.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 158   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 159   AliAnalysisTaskSECompareHF *cmpTask = AddTaskCompareHF();\r
 160 \r
 161   taskName="AddTaskD0Mass.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 162   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 163   AliAnalysisTaskSED0Mass *d0massTask = AddTaskD0Mass();\r
 164 \r
 165   \r
 166   taskName="AddTaskDplus.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 167   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 168   AliAnalysisTaskSEDplus *dplusTask = AddTaskDplus();\r
 169   /*\r
 170   //taskName="AddTaskSelectHF.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 171   //gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 172   //AliAnalysisTaskSESelectHF *seleTask = AddTaskSelectHF();\r
 173 \r
 174   taskName="AddTaskBkgLikeSignD0.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 175   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 176   AliAnalysisTaskSEBkgLikeSignD0 *lsD0Task = AddTaskBkgLikeSignD0();\r
 177 \r
 178   taskName="AddTaskBkgLikeSignJPSI.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 179   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 180   AliAnalysisTaskSEBkgLikeSignJPSI *lsJPSITask = AddTaskBkgLikeSignJPSI();\r
 181 \r
 182   taskName="AddTaskBtoJPSItoEle.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 183   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 184   AliAnalysisTaskSEBtoJPSItoEle *jpsiTask = AddTaskBtoJPSItoEle();\r
 185 \r
 186   //taskName="AddTaskCF.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 187   //gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 188   //AliCFHeavyFlavourTask *cfTask = AddTaskCF();\r
 189 \r
 190   //taskName="AddTaskCFMultiVar.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 191   //gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 192   //AliCFHeavyFlavourTaskMultiVar *cfmvTask = AddTaskCFMultiVar();\r
 193 \r
 194   taskName="AddTaskCFMultiVarMultiStep.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 195   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 196   AliCFHeavyFlavourTaskMultiVarMultiStep *cfmvmsTask = AddTaskCFMultiVarMultiStep();\r
 197 \r
 198   taskName="AddTaskCharmFraction.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 199   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 200   // The task is added several times with different settings:\r
 201   AliAnalysisTaskCharmFraction *cFractTaskSignal   = AddTaskCharmFraction("d0D0_Signal.root");\r
 202   AliAnalysisTaskCharmFraction *cFractTaskNoMCSel  = AddTaskCharmFraction("d0D0NoMCSel.root",kFALSE,kTRUE,kFALSE);\r
 203   AliAnalysisTaskCharmFraction *cFractTaskNoMCSel  = AddTaskCharmFraction("d0D0NoMCSel_SideBand.root",kTRUE,kTRUE,kFALSE);\r
 204   AliAnalysisTaskCharmFraction *cFractTaskPureBack = AddTaskCharmFraction("d0D0_PureBack.root",kFALSE,kTRUE,kTRUE,kTRUE,kFALSE,kTRUE,kTRUE,kTRUE,kTRUE);\r
 205   */\r
 206 \r
 207   //-------------------------------------------------------------------\r
 208 \r
 209   //\r
 210   // Run the analysis\r
 211   //    \r
 212   if(chainAOD) printf("CHAIN HAS %d ENTRIES\n",(Int_t)chainAOD->GetEntries());\r
 213 \r
 214   if(!mgr->InitAnalysis()) return;\r
 215   mgr->PrintStatus();\r
 216   if(analysisMode=="grid" && !useAlienPlugin) analysisMode="local";\r
 217   mgr->StartAnalysis(analysisMode.Data(),chainAOD,nentries,firstentry);\r
 218 \r
 219   return;\r
 220 }\r
 221 //_____________________________________________________________________________\r
 222 //\r
 223 AliAnalysisGrid* CreateAlienHandler(TString pluginmode="test",Bool_t useParFiles=kFALSE)\r
 224 {\r
 225   // Check if user has a valid token, otherwise make one. This has limitations.\r
 226   // One can always follow the standard procedure of calling alien-token-init then\r
 227   //   source /tmp/gclient_env_$UID in the current shell.\r
 228    if (!AliAnalysisGrid::CreateToken()) return NULL;\r
 229    AliAnalysisAlien *plugin = new AliAnalysisAlien();\r
 230    // Set the run mode (can be "full", "test", "offline", "submit" or "terminate")\r
 231    plugin->SetRunMode(pluginmode.Data());\r
 232    plugin->SetUser("dainesea");\r
 233    plugin->SetNtestFiles(1);\r
 234    // Set versions of used packages\r
 235    plugin->SetAPIVersion("V2.4");\r
 236    plugin->SetROOTVersion("v5-23-02");\r
 237    plugin->SetAliROOTVersion("v4-17-00");\r
 238    // Declare input data to be processed.\r
 239    // Method 1: Create automatically XML collections using alien 'find' command.\r
 240    // Define production directory LFN\r
 241    //plugin->SetGridDataDir("/alice/cern.ch/user/r/rbala/newtrain/out_lhc08x/");\r
 242    plugin->SetGridDataDir("/alice/cern.ch/user/m/mgheata/analysisESD/output_train_default_28May2009_09h33/");\r
 243    // Set data search pattern\r
 244    plugin->SetDataPattern("AliAOD.root");\r
 245    plugin->SetFriendChainName("AliAOD.VertexingHF.root");\r
 246    // ...then add run numbers to be considered\r
 247    plugin->AddRunNumber(529007);\r
 248    //  or\r
 249    //plugin->SetRunRange(529000,529007);\r
 250    // Method 2: Declare existing data files (raw collections, xml collections, root file)\r
 251    // If no path mentioned data is supposed to be in the work directory (see SetGridWorkingDir())\r
 252    // XML collections added via this method can be combined with the first method if\r
 253    // the content is compatible (using or not tags)\r
 254    //plugin->AddDataFile("/alice/cern.ch/user/r/rbala/newtrain/collection/collection_aod_lhc08w.xml");\r
 255    //   plugin->AddDataFile("/alice/data/2008/LHC08c/000057657/raw/Run57657.Merged.RAW.tag.root");\r
 256    // Define alien work directory where all files will be copied. Relative to alien $HOME.\r
 257    plugin->SetGridWorkingDir("work");\r
 258    // Declare alien output directory. Relative to working directory.\r
 259    plugin->SetGridOutputDir("output"); // In this case will be $HOME/work/output\r
 260    // Declare the analysis source files names separated by blancs. To be compiled runtime\r
 261    // using ACLiC on the worker nodes.\r
 262    //plugin->SetAnalysisSource("$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/AliAnalysisTaskSECompareHF.cxx");\r
 263    // Declare all libraries (other than the default ones for the framework. These will be\r
 264    // loaded by the generated analysis macro. Add all extra files (task .cxx/.h) here.\r
 265    plugin->SetAdditionalLibs("libPWG3vertexingHF.so libPWG3base.so libPWG3muon.so libPWG4PartCorrBase.so libPWG4PartCorrDep.so MakeAODInputChain.C");\r
 266    // use par files\r
 267    if(useParFiles) {\r
 268      plugin->EnablePackage("STEERBase.par");\r
 269      plugin->EnablePackage("ESD.par");\r
 270      plugin->EnablePackage("AOD.par");\r
 271      plugin->EnablePackage("ANALYSIS.par");\r
 272      plugin->EnablePackage("ANALYSISalice.par");\r
 273      plugin->EnablePackage("CORRFW.par");\r
 274      plugin->EnablePackage("PWG3base.par");\r
 275      plugin->EnablePackage("PWG3vertexingHF.par");\r
 276      plugin->EnablePackage("PWG3muon.par");\r
 277      plugin->EnablePackage("PWG4PartCorrBase.par");\r
 278      plugin->EnablePackage("PWG4PartCorrDep.par");\r
 279    }\r
 280    // Declare the output file names separated by blancs.\r
 281    // (can be like: file.root or file.root@ALICE::Niham::File)\r
 282    plugin->SetOutputFiles("CmpHF.root");\r
 283    // Optionally define the files to be archived.\r
 284    //   plugin->SetOutputArchive("log_archive.zip:stdout,stderr@ALICE::NIHAM::File root_archive.zip:*.root@ALICE::NIHAM::File");\r
 285    plugin->SetOutputArchive("log_archive.zip:stdout,stderr");\r
 286    // Optionally set a name for the generated analysis macro (default MyAnalysis.C)\r
 287    plugin->SetAnalysisMacro("AnalysisHF.C");\r
 288    // Optionally set maximum number of input files/subjob (default 100, put 0 to ignore)\r
 289    plugin->SetSplitMaxInputFileNumber(5);\r
 290    // Optionally set number of failed jobs that will trigger killing waiting sub-jobs.\r
 291    //plugin->SetMaxInitFailed(5);\r
 292    // Optionally resubmit threshold.\r
 293    //plugin->SetMasterResubmitThreshold(90);\r
 294    // Optionally set time to live (default 30000 sec)\r
 295    //plugin->SetTTL(20000);\r
 296    // Optionally set input format (default xml-single)\r
 297    plugin->SetInputFormat("xml-single");\r
 298    // Optionally modify the name of the generated JDL (default analysis.jdl)\r
 299    plugin->SetJDLName("TaskHF.jdl");\r
 300    // Optionally modify job price (default 1)\r
 301    //plugin->SetPrice(1);      \r
 302    // Optionally modify split mode (default 'se')    \r
 303    plugin->SetSplitMode("se");\r
 304    // Optionally set the preferred SE    \r
 305    plugin->SetPreferedSE("ALICE::Legnaro::SE");\r
 306    \r
 307    return plugin;\r
 308 }\r