PWG3/vertexingHF/RunAnalysisAODVertexingHF.C

   1 class AliAnalysisGrid;\r
   2 \r
   3 void RunAnalysisAODVertexingHF()\r
   4 {\r
   5   //\r
   6   // Test macro for AliAnalysisTaskSE's for heavy-flavour candidates\r
   7   // It has the structure of a Analysis Train:\r
   8   // - in this macro, change things related to running mode\r
   9   //   and input preparation \r
  10   // - add your task using a AddTaskXXX macro \r
  11   //\r
  12   // A.Dainese, andrea.dainese@lnl.infn.it\r
  13   // "grid" mode added by R.Bala, bala@to.infn.it\r
  14   //\r
  15 \r
  16   //\r
  17   TString analysisMode = "grid"; // "local", "grid", or "proof"\r
  18   TString inputMode    = "list"; // "list", "xml", or "dataset"\r
  19   Long64_t nentries=1234567890,firstentry=0;\r
  20   Bool_t useParFiles=kFALSE;\r
  21   Bool_t useAlienPlugin=kTRUE;\r
  22   TString pluginmode="full";\r
  23   TString loadMacroPath="$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/";\r
  24   //TString loadMacroPath="./"; // this is normally needed for CAF\r
  25   //\r
  26 \r
  27   if(analysisMode=="grid") {\r
  28     // Connect to AliEn\r
  29     TGrid::Connect("alien://");\r
  30   } else if(analysisMode=="proof") {\r
  31     // Connect to the PROOF cluster\r
  32     if(inputMode.Data()!="dataset") {printf("Input mode must be dataset, for proof analysis\n"); return;}\r
  33     gEnv->SetValue("XSec.GSI.DelegProxy","2");\r
  34     TProof::Open("alicecaf");\r
  35     //TProof::Reset("alicecaf");\r
  36   }\r
  37 \r
  38 \r
  39   // AliRoot libraries\r
  40   if(analysisMode=="local" || analysisMode=="grid") {\r
  41     TString loadLibraries="LoadLibraries.C"; loadLibraries.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
  42     gROOT->LoadMacro(loadLibraries.Data());\r
  43     LoadLibraries(useParFiles);\r
  44   } else if (analysisMode=="proof") {\r
  45     gSystem->Load("libTree.so");\r
  46     gSystem->Load("libGeom.so");\r
  47     gSystem->Load("libPhysics.so");\r
  48     gSystem->Load("libVMC.so");    \r
  49     // Enable the needed packages\r
  50     //gProof->ClearPackages();\r
  51     TString parDir="/afs/cern.ch/user/d/dainesea/code/";\r
  52     TString parFile;\r
  53     if(!useParFiles) {\r
  54       gProof->UploadPackage("AF-v4-17");\r
  55       gProof->EnablePackage("AF-v4-17");\r
  56       // --- Enable the PWG3vertexingHF Package\r
  57       parFile="PWG3vertexingHF.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  58       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  59       gProof->EnablePackage("PWG3vertexingHF");\r
  60     } else {\r
  61       // --- Enable the STEERBase Package\r
  62       parFile="STEERBase.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  63       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  64       gProof->EnablePackage("STEERBase");\r
  65       // --- Enable the ESD Package\r
  66       parFile="ESD.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  67       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  68       gProof->EnablePackage("ESD");\r
  69       // --- Enable the AOD Package\r
  70       parFile="AOD.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  71       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  72       gProof->EnablePackage("AOD");\r
  73       // --- Enable the ANALYSIS Package\r
  74       parFile="ANALYSIS.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  75       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  76       gProof->EnablePackage("ANALYSIS");\r
  77       // --- Enable the ANALYSISalice Package\r
  78       parFile="ANALYSISalice.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  79       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  80       gProof->EnablePackage("ANALYSISalice");\r
  81       // --- Enable the CORRFW Package\r
  82       parFile="CORRFW.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  83       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  84       gProof->EnablePackage("CORRFW");\r
  85       // --- Enable the PWG3base Package\r
  86       parFile="PWG3base.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  87       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  88       gProof->EnablePackage("PWG3base");\r
  89       // --- Enable the PWG3vertexingHF Package\r
  90       parFile="PWG3vertexingHF.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  91       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  92       gProof->EnablePackage("PWG3vertexingHF");\r
  93       // --- Enable the JETAN Package\r
  94       parFile="JETAN.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  95       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
  96       gProof->EnablePackage("JETAN");\r
  97       // --- Enable the PWG3muon Package\r
  98       parFile="PWG3muon.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
  99       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
 100       gProof->EnablePackage("PWG3muon");\r
 101       // --- Enable the PWG4PartCorrBase Package\r
 102       parFile="PWG4PartCorrBase.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
 103       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
 104       gProof->EnablePackage("PWG4PartCorrBase");\r
 105       // --- Enable the PWG4PartCorrDep Package\r
 106       parFile="PWG4PartCorrDep.par"; parFile.Prepend(parDir.Data());\r
 107       gProof->UploadPackage(parFile.Data());\r
 108       gProof->EnablePackage("PWG4PartCorrDep");\r
 109     }\r
 110     gProof->ShowEnabledPackages(); // show a list of enabled packages\r
 111   }\r
 112 \r
 113 \r
 114   // Create Alien plugin, if requested\r
 115   if(useAlienPlugin) {  \r
 116     if(analysisMode!="grid") {printf("Analysis mode must be grid, to use alien plugin\n"); return;}\r
 117     AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(pluginmode,useParFiles);  \r
 118     if(!alienHandler) return;\r
 119   }\r
 120 \r
 121 \r
 122   //-------------------------------------------------------------------\r
 123   // Prepare input\r
 124   TChain *chainAOD = 0;\r
 125   TString dataset; // for proof\r
 126 \r
 127   if(!useAlienPlugin) {\r
 128     TString makeAODInputChain="MakeAODInputChain.C"; makeAODInputChain.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 129     if(inputMode=="list") {\r
 130       // Local files\r
 131       gROOT->LoadMacro(makeAODInputChain.Data());\r
 132       chainAOD = MakeAODInputChain();// with this it reads ./AliAOD.root and ./AliAOD.VertexingHF.root\r
 133       //chainAOD = MakeAODInputChain("alien:///alice/cern.ch/user/r/rbala/newtrain/out_lhc08x/180100/",1,1);\r
 134     } else if(inputMode=="xml") {\r
 135       // xml\r
 136       gROOT->LoadMacro(makeAODInputChain.Data());\r
 137       chainAOD = MakeAODInputChain("collection_aod.xml","collection_aodHF.xml");\r
 138     } else if(inputMode=="dataset") {\r
 139       // CAF dataset\r
 140       //gProof->ShowDataSets();\r
 141       dataset="/ITS/dainesea/AODVertexingHF_LHC08x_180100";\r
 142     }\r
 143   }\r
 144 \r
 145   // Create the analysis manager\r
 146   AliAnalysisManager *mgr  = new AliAnalysisManager("My Manager","My Manager");\r
 147   mgr->SetDebugLevel(10);\r
 148   // Connect plug-in to the analysis manager\r
 149   if(useAlienPlugin) mgr->SetGridHandler(alienHandler);\r
 150 \r
 151 \r
 152   // Input\r
 153   AliAODInputHandler *inputHandler = new AliAODInputHandler();\r
 154   if(analysisMode=="proof") inputHandler->AddFriend("AliAOD.VertexingHF.root");\r
 155   mgr->SetInputEventHandler(inputHandler);\r
 156   //-------------------------------------------------------------------\r
 157 \r
 158   \r
 159   //-------------------------------------------------------------------\r
 160   // Analysis tasks (wagons of the train)   \r
 161   //\r
 162   TString taskName;\r
 163 \r
 164   taskName="AddTaskCompareHF.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 165   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 166   AliAnalysisTaskSECompareHF *cmpTask = AddTaskCompareHF();\r
 167   \r
 168   taskName="AddTaskD0Mass.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 169   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 170   AliAnalysisTaskSED0Mass *d0massTask = AddTaskD0Mass();\r
 171 \r
 172   \r
 173   taskName="AddTaskDplus.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 174   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 175   AliAnalysisTaskSEDplus *dplusTask = AddTaskDplus();\r
 176   \r
 177   //taskName="AddTaskSelectHF.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 178   //gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 179   //AliAnalysisTaskSESelectHF *seleTask = AddTaskSelectHF();\r
 180 \r
 181   taskName="AddTaskBkgLikeSignD0.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 182   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 183   AliAnalysisTaskSEBkgLikeSignD0 *lsD0Task = AddTaskBkgLikeSignD0();\r
 184 \r
 185   taskName="AddTaskBkgLikeSignJPSI.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 186   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 187   AliAnalysisTaskSEBkgLikeSignJPSI *lsJPSITask = AddTaskBkgLikeSignJPSI();\r
 188 \r
 189   taskName="AddTaskBtoJPSItoEle.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 190   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 191   AliAnalysisTaskSEBtoJPSItoEle *jpsiTask = AddTaskBtoJPSItoEle();\r
 192 \r
 193   taskName="AddTaskCFMultiVarMultiStep.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 194   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 195   AliCFHeavyFlavourTaskMultiVarMultiStep *cfmvmsTask = AddTaskCFMultiVarMultiStep();\r
 196 \r
 197   taskName="AddTaskCharmFraction.C"; taskName.Prepend(loadMacroPath.Data());\r
 198   gROOT->LoadMacro(taskName.Data());\r
 199   // The task is added several times with different settings:\r
 200   AliAnalysisTaskCharmFraction *cFractTaskSignal   = AddTaskCharmFraction("d0D0_Signal.root");\r
 201   AliAnalysisTaskCharmFraction *cFractTaskNoMCSel  = AddTaskCharmFraction("d0D0NoMCSel.root",kFALSE,kTRUE,kFALSE);\r
 202   AliAnalysisTaskCharmFraction *cFractTaskNoMCSel  = AddTaskCharmFraction("d0D0NoMCSel_SideBand.root",kTRUE,kTRUE,kFALSE);\r
 203   AliAnalysisTaskCharmFraction *cFractTaskPureBack = AddTaskCharmFraction("d0D0_PureBack.root",kFALSE,kTRUE,kTRUE,kTRUE,kFALSE,kTRUE,kTRUE,kTRUE,kTRUE);\r
 204   AliAnalysisTaskCharmFraction *cFractTaskFromB    = AddTaskCharmFraction("d0D0_FromB.root",kFALSE,kTRUE,kTRUE,kFALSE,kTRUE);\r
 205 \r
 206   // attach a private task (not committed)\r
 207   // (the files MyTask.h MyTask.cxx AddMyTask.C have to be declared in plugin\r
 208   // configuration, see below)\r
 209   /*\r
 210   if(analysisMode.Data()=="proof") {\r
 211     gProof->LoadMacro("MyTask.cxx++g");\r
 212   } else {\r
 213     gROOT->LoadMacro("MyTask.cxx++g");\r
 214   }\r
 215   gROOT->LoadMacro("AddMyTask.C");\r
 216   MyTask *myTask = AddMyTask();\r
 217   */\r
 218 \r
 219   //-------------------------------------------------------------------\r
 220 \r
 221   //\r
 222   // Run the analysis\r
 223   //    \r
 224   if(chainAOD) printf("CHAIN HAS %d ENTRIES\n",(Int_t)chainAOD->GetEntries());\r
 225 \r
 226   if(!mgr->InitAnalysis()) return;\r
 227   mgr->PrintStatus();\r
 228   if(analysisMode=="grid" && !useAlienPlugin) analysisMode="local";\r
 229   if(analysisMode!="proof") {\r
 230     mgr->StartAnalysis(analysisMode.Data(),chainAOD,nentries,firstentry);\r
 231   } else {\r
 232     // proof\r
 233     mgr->StartAnalysis(analysisMode.Data(),dataset.Data(),nentries,firstentry);\r
 234   }\r
 235 \r
 236   return;\r
 237 }\r
 238 //_____________________________________________________________________________\r
 239 //\r
 240 AliAnalysisGrid* CreateAlienHandler(TString pluginmode="test",Bool_t useParFiles=kFALSE)\r
 241 {\r
 242   // Check if user has a valid token, otherwise make one. This has limitations.\r
 243   // One can always follow the standard procedure of calling alien-token-init then\r
 244   //   source /tmp/gclient_env_$UID in the current shell.\r
 245    if (!AliAnalysisGrid::CreateToken()) return NULL;\r
 246    AliAnalysisAlien *plugin = new AliAnalysisAlien();\r
 247    // Set the run mode (can be "full", "test", "offline", "submit" or "terminate")\r
 248    plugin->SetRunMode(pluginmode.Data());\r
 249    plugin->SetUser("dainesea");\r
 250    plugin->SetNtestFiles(1);\r
 251    // Set versions of used packages\r
 252    plugin->SetAPIVersion("V2.4");\r
 253    plugin->SetROOTVersion("v5-23-02");\r
 254    plugin->SetAliROOTVersion("v4-17-00");\r
 255    // Declare input data to be processed.\r
 256    // Method 1: Create automatically XML collections using alien 'find' command.\r
 257    // Define production directory LFN\r
 258    //plugin->SetGridDataDir("/alice/cern.ch/user/r/rbala/newtrain/out_lhc08x/");\r
 259    plugin->SetGridDataDir("/alice/cern.ch/user/m/mgheata/analysisESD/output_train_default_28May2009_09h33/");\r
 260    // Set data search pattern\r
 261    plugin->SetDataPattern("AliAOD.root");\r
 262    plugin->SetFriendChainName("AliAOD.VertexingHF.root");\r
 263    // ...then add run numbers to be considered\r
 264    plugin->AddRunNumber(529007);\r
 265    //  or\r
 266    //plugin->SetRunRange(529000,529007);\r
 267    // Method 2: Declare existing data files (raw collections, xml collections, root file)\r
 268    // If no path mentioned data is supposed to be in the work directory (see SetGridWorkingDir())\r
 269    // XML collections added via this method can be combined with the first method if\r
 270    // the content is compatible (using or not tags)\r
 271    //plugin->AddDataFile("/alice/cern.ch/user/r/rbala/newtrain/collection/collection_aod_lhc08w.xml");\r
 272    //   plugin->AddDataFile("/alice/data/2008/LHC08c/000057657/raw/Run57657.Merged.RAW.tag.root");\r
 273    // Define alien work directory where all files will be copied. Relative to alien $HOME.\r
 274    plugin->SetGridWorkingDir("work");\r
 275    // Declare alien output directory. Relative to working directory.\r
 276    plugin->SetGridOutputDir("output"); // In this case will be $HOME/work/output\r
 277    // Declare the analysis source files names separated by blancs. To be compiled runtime\r
 278    // using ACLiC on the worker nodes.\r
 279    //plugin->SetAnalysisSource("MyTask.cxx");\r
 280    // Declare all libraries (other than the default ones for the framework. These will be\r
 281    // loaded by the generated analysis macro. Add all extra files (task .cxx/.h) here.\r
 282    plugin->SetAdditionalLibs("libPWG3vertexingHF.so libPWG3base.so libPWG3muon.so libPWG4PartCorrBase.so libPWG4PartCorrDep.so MakeAODInputChain.C"/* MyTask.cxx MyTask.h" */);\r
 283    // use par files\r
 284    if(useParFiles) {\r
 285      plugin->EnablePackage("STEERBase.par");\r
 286      plugin->EnablePackage("ESD.par");\r
 287      plugin->EnablePackage("AOD.par");\r
 288      plugin->EnablePackage("ANALYSIS.par");\r
 289      plugin->EnablePackage("ANALYSISalice.par");\r
 290      plugin->EnablePackage("CORRFW.par");\r
 291      plugin->EnablePackage("PWG3base.par");\r
 292      plugin->EnablePackage("PWG3vertexingHF.par");\r
 293      plugin->EnablePackage("PWG3muon.par");\r
 294      plugin->EnablePackage("PWG4PartCorrBase.par");\r
 295      plugin->EnablePackage("PWG4PartCorrDep.par");\r
 296    }\r
 297    // Declare the output file names separated by blancs.\r
 298    // (can be like: file.root or file.root@ALICE::Niham::File)\r
 299    plugin->SetOutputFiles("CmpHF.root");\r
 300    // Optionally define the files to be archived.\r
 301    //   plugin->SetOutputArchive("log_archive.zip:stdout,stderr@ALICE::NIHAM::File root_archive.zip:*.root@ALICE::NIHAM::File");\r
 302    plugin->SetOutputArchive("log_archive.zip:stdout,stderr");\r
 303    // Optionally set a name for the generated analysis macro (default MyAnalysis.C)\r
 304    plugin->SetAnalysisMacro("AnalysisHF.C");\r
 305    // Optionally set maximum number of input files/subjob (default 100, put 0 to ignore)\r
 306    plugin->SetSplitMaxInputFileNumber(5);\r
 307    // Optionally set number of failed jobs that will trigger killing waiting sub-jobs.\r
 308    //plugin->SetMaxInitFailed(5);\r
 309    // Optionally resubmit threshold.\r
 310    //plugin->SetMasterResubmitThreshold(90);\r
 311    // Optionally set time to live (default 30000 sec)\r
 312    //plugin->SetTTL(20000);\r
 313    // Optionally set input format (default xml-single)\r
 314    plugin->SetInputFormat("xml-single");\r
 315    // Optionally modify the name of the generated JDL (default analysis.jdl)\r
 316    plugin->SetJDLName("TaskHF.jdl");\r
 317    // Optionally modify job price (default 1)\r
 318    //plugin->SetPrice(1);      \r
 319    // Optionally modify split mode (default 'se')    \r
 320    plugin->SetSplitMode("se");\r
 321    // Optionally set the preferred SE    \r
 322    plugin->SetPreferedSE("ALICE::Legnaro::SE");\r
 323    \r
 324    return plugin;\r
 325 }\r