PWGGA/CaloTasks/AliAnalysisTaskCaloFilter.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
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  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 //////////////////////////////////////////////////////////
  17 // Filter the ESDCaloClusters and ESDCaloCells of EMCAL,
  18 // PHOS or both, creating the corresponing AODCaloClusters
  19 // and AODCaloCells.
  20 // Keep also the AODHeader information and the vertex.
  21 // Keep tracks, v0s, VZERO if requested
  22 // Select events containing a cluster or track avobe a given threshold
  23 // Copy of AliAnalysisTaskESDfilter.
  24 // Author: Gustavo Conesa Balbastre (INFN - Frascati)
  25 //////////////////////////////////////////////////////////
  26
  27 //Root
  28 #include "TGeoManager.h"
  29 #include "TFile.h"
  30 #include "TROOT.h"
  31 #include "TInterpreter.h"
  32
  33 //STEER
  34 #include "AliESDEvent.h"
  35 #include "AliAODEvent.h"
  36 #include "AliLog.h"
  37 #include "AliVCluster.h"
  38 #include "AliVCaloCells.h"
  39 #include "AliVEventHandler.h"
  40 #include "AliAODHandler.h"
  41 #include "AliAnalysisManager.h"
  42 #include "AliInputEventHandler.h"
  43
  44 //EMCAL
  45 #include "AliEMCALRecoUtils.h"
  46 #include "AliEMCALGeometry.h"
  47
  48 #include "AliAnalysisTaskCaloFilter.h"
  49
  50 ClassImp(AliAnalysisTaskCaloFilter)
  51
  52 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  53
  54 AliAnalysisTaskCaloFilter::AliAnalysisTaskCaloFilter():
  55 AliAnalysisTaskSE("CaloFilterTask"),
  56 fCaloFilter(0),           fEventSelection(),
  57 fAcceptAllMBEvent(kFALSE),fMBTriggerMask(AliVEvent::kMB),
  58 fCorrect(kFALSE),
  59 fEMCALGeo(0x0),           fEMCALGeoName("EMCAL_COMPLETE12SMV1"),
  60 fEMCALRecoUtils(new AliEMCALRecoUtils),
  61 fLoadEMCALMatrices(kFALSE), //fLoadPHOSMatrices(kFALSE),
  62 fGeoMatrixSet(kFALSE),
  63 fConfigName(""),          fFillAODFile(kTRUE),
  64 fFillMCParticles(kFALSE),
  65 fFillTracks(kFALSE),      fFillHybridTracks(kFALSE),
  66 fFillAllVertices(kFALSE), fFillv0s(kFALSE),
  67 fFillVZERO(kFALSE),
  68 fEMCALEnergyCut(0.),      fEMCALNcellsCut (0),
  69 fPHOSEnergyCut(0.),       fPHOSNcellsCut (0),
  70 fTrackPtCut(-1),
  71 fVzCut(100.),             fCheckEventVertex(kTRUE),
  72 fEvent(0x0),
  73 fESDEvent(0x0),           fAODEvent(0x0)
  74 {
  75   // Default constructor
  76
  77   fEventSelection[0] = kFALSE;
  78   fEventSelection[1] = kFALSE;
  79   fEventSelection[2] = kFALSE;
  80
  81   for(Int_t i = 0; i < 12; i++) fEMCALMatrix[i] = 0 ;
  82   //for(Int_t i = 0; i < 5 ; i++) fPHOSMatrix[i]  = 0 ;
  83
  84 }
  85
  86 //__________________________________________________
  87 AliAnalysisTaskCaloFilter::AliAnalysisTaskCaloFilter(const char* name):
  88 AliAnalysisTaskSE(name),
  89 fCaloFilter(0),           fEventSelection(),
  90 fAcceptAllMBEvent(kFALSE),fMBTriggerMask(AliVEvent::kMB),
  91 fCorrect(kFALSE),
  92 fEMCALGeo(0x0),           fEMCALGeoName("EMCAL_COMPLETE12SMV1"),
  93 fEMCALRecoUtils(new AliEMCALRecoUtils),
  94 fLoadEMCALMatrices(kFALSE), //fLoadPHOSMatrices(kFALSE),
  95 fGeoMatrixSet(kFALSE),
  96 fConfigName(""),          fFillAODFile(kTRUE),
  97 fFillMCParticles(kFALSE),
  98 fFillTracks(kFALSE),      fFillHybridTracks(kFALSE),
  99 fFillAllVertices(kFALSE), fFillv0s(kFALSE),
 100 fFillVZERO(kFALSE),
 101 fEMCALEnergyCut(0.),      fEMCALNcellsCut(0),
 102 fPHOSEnergyCut(0.),       fPHOSNcellsCut(0),
 103 fTrackPtCut(-1),
 104 fVzCut(100.),             fCheckEventVertex(kTRUE),
 105 fEvent(0x0),
 106 fESDEvent(0x0),           fAODEvent(0x0)
 107 {
 108   // Constructor
 109
 110   fEventSelection[0] = kFALSE;
 111   fEventSelection[1] = kFALSE;
 112   fEventSelection[2] = kFALSE;
 113
 114   for(Int_t i = 0; i < 12; i++) fEMCALMatrix[i] = 0 ;
 115   //for(Int_t i = 0; i < 5 ; i++) fPHOSMatrix[i]  = 0 ;
 116
 117 }
 118
 119 //__________________________________________________
 120 AliAnalysisTaskCaloFilter::~AliAnalysisTaskCaloFilter()
 121 {
 122   //Destructor.
 123
 124   if(fEMCALGeo)        delete fEMCALGeo;
 125   if(fEMCALRecoUtils)  delete fEMCALRecoUtils;
 126
 127 }
 128
 129 //_____________________________________________
 130 Bool_t AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEvent()
 131 {
 132   // Define conditions to accept the event to be filtered
 133
 134   if(!AcceptEventVertex()) return kFALSE;
 135
 136   Bool_t eventSel = kFALSE;
 137
 138   Bool_t isMB = (((AliInputEventHandler*)(AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->GetInputEventHandler()))->IsEventSelected() & fMBTriggerMask);
 139
 140   if     ( isMB && fAcceptAllMBEvent )                eventSel = kTRUE; // accept any MB event
 141
 142   else if( fEventSelection[0] && AcceptEventEMCAL() ) eventSel = kTRUE; // accept event depending on EMCAL activity
 143
 144   else if( fEventSelection[1] && AcceptEventPHOS () ) eventSel = kTRUE; // accept event depending on PHOS  activity
 145
 146   else if( fEventSelection[2] && AcceptEventTrack() ) eventSel = kTRUE; // accept event depending on Track activity
 147
 148   return eventSel ;
 149
 150 }
 151
 152 //__________________________________________________
 153 Bool_t AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEventEMCAL()
 154 {
 155   // Accept event given there is a EMCAL cluster with enough energy, and not noisy, exotic
 156
 157   if(fCaloFilter==kPHOS)   return kTRUE; // accept
 158
 159   if(fEMCALEnergyCut <= 0) return kTRUE; // accept
 160
 161   Int_t           nCluster = InputEvent() -> GetNumberOfCaloClusters();
 162   AliVCaloCells * caloCell = InputEvent() -> GetEMCALCells();
 163   Int_t           bc       = InputEvent() -> GetBunchCrossNumber();
 164
 165   for(Int_t icalo = 0; icalo < nCluster; icalo++)
 166   {
 167     AliVCluster *clus = (AliVCluster*) (InputEvent()->GetCaloCluster(icalo));
 168
 169     if( ( clus->IsEMCAL() ) && ( clus->GetNCells() > fEMCALNcellsCut ) && ( clus->E() > fEMCALEnergyCut ) &&
 170        fEMCALRecoUtils->IsGoodCluster(clus,fEMCALGeo,caloCell,bc))
 171     {
 172
 173       AliDebug(1,Form("Accept :  E %2.2f > %2.2f, nCells %d > %d",
 174                       clus->E(), fEMCALEnergyCut, clus->GetNCells(), fEMCALNcellsCut));
 175
 176       return kTRUE;
 177     }
 178
 179   }// loop
 180
 181   AliDebug(1,"Reject");
 182
 183   //printf("Fired %s\n",((AliESDEvent*)InputEvent())->GetFiredTriggerClasses().Data());
 184
 185   return kFALSE;
 186
 187 }
 188
 189 //_________________________________________________
 190 Bool_t AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEventPHOS()
 191 {
 192   // Accept event given there is a PHOS cluster with enough energy and not noisy/exotic
 193
 194   if(fCaloFilter==kEMCAL) return kTRUE; // accept
 195
 196   if(fPHOSEnergyCut <= 0) return kTRUE; // accept
 197
 198   Int_t nCluster = InputEvent() -> GetNumberOfCaloClusters();
 199
 200   for(Int_t icalo = 0; icalo < nCluster; icalo++)
 201   {
 202     AliVCluster *clus = (AliVCluster*) (InputEvent()->GetCaloCluster(icalo));
 203
 204     if( ( clus->IsPHOS() ) && ( clus->GetNCells() > fPHOSNcellsCut ) && ( clus->E() > fPHOSEnergyCut ))
 205     {
 206
 207       AliDebug(1,Form("Accept :  E %2.2f > %2.2f, nCells %d > %d",
 208                       clus->E(), fPHOSEnergyCut, clus->GetNCells(), fPHOSNcellsCut));
 209
 210       return kTRUE;
 211     }
 212
 213   }// loop
 214
 215   AliDebug(1,"Reject");
 216
 217   return kFALSE;
 218
 219 }
 220
 221 //__________________________________________________
 222 Bool_t AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEventTrack()
 223 {
 224   // Accept event if there is a track avobe a certain pT
 225
 226   if(fTrackPtCut <= 0) return kTRUE; // accept
 227
 228   Double_t pTrack[3] = {0,0,0};
 229
 230   for (Int_t nTrack = 0; nTrack < fEvent->GetNumberOfTracks(); ++nTrack)
 231   {
 232     AliVTrack *track = (AliVTrack*) fEvent->GetTrack(nTrack);
 233
 234     // Select only hybrid tracks?
 235     if(fAODEvent && fFillHybridTracks && !((AliAODTrack*)track)->IsHybridGlobalConstrainedGlobal()) continue;
 236
 237     track->GetPxPyPz(pTrack) ;
 238
 239     TLorentzVector momentum(pTrack[0],pTrack[1],pTrack[2],0);
 240
 241     if(momentum.Pt() > fTrackPtCut)
 242     {
 243       AliDebug(1,Form("Accept :  pT %2.2f > %2.2f",momentum.Pt(), fTrackPtCut));
 244
 245       return kTRUE;
 246     }
 247
 248   }
 249
 250   AliDebug(1,"Reject");
 251
 252   return kFALSE;
 253
 254 }
 255
 256 //___________________________________________________
 257 Bool_t AliAnalysisTaskCaloFilter::AcceptEventVertex()
 258 {
 259   // Accept event with good vertex
 260
 261   Double_t v[3];
 262   InputEvent()->GetPrimaryVertex()->GetXYZ(v) ;
 263
 264   if(TMath::Abs(v[2]) > fVzCut)
 265   {
 266     AliDebug(1,Form("Vz Reject : vz %2.2f > %2.2f",v[2],fVzCut));
 267
 268     return kFALSE ;
 269   }
 270
 271   return CheckForPrimaryVertex();
 272 }
 273
 274 //_______________________________________________________
 275 Bool_t AliAnalysisTaskCaloFilter::CheckForPrimaryVertex()
 276 {
 277   //Check if the vertex was well reconstructed, copy from v0Reader of conversion group
 278   //It only works for ESDs
 279
 280   if(!fCheckEventVertex) return kTRUE;
 281
 282   // AODs
 283   if(!fESDEvent)
 284   {
 285     // Check that the vertex is not (0,0,0)
 286     Double_t v[3];
 287     InputEvent()->GetPrimaryVertex()->GetXYZ(v) ;
 288
 289     if(TMath::Abs(v[2]) < 1e-6 &&
 290        TMath::Abs(v[1]) < 1e-6 &&
 291        TMath::Abs(v[0]) < 1e-6 )
 292     {
 293       AliDebug(1,"Reject v(0,0,0)");
 294
 295       return kFALSE ;
 296     }
 297
 298     return kTRUE;
 299   }
 300
 301   // ESDs
 302   if(fESDEvent->GetPrimaryVertexTracks()->GetNContributors() > 0)
 303   {
 304     return kTRUE;
 305   }
 306
 307   if(fESDEvent->GetPrimaryVertexTracks()->GetNContributors() < 1)
 308   {
 309     // SPD vertex
 310     if(fESDEvent->GetPrimaryVertexSPD()->GetNContributors() > 0)
 311     {
 312       //cout<<"spd vertex type::"<< fESDEvent->GetPrimaryVertex()->GetName() << endl;
 313       return kTRUE;
 314
 315     }
 316     if(fESDEvent->GetPrimaryVertexSPD()->GetNContributors() < 1)
 317     {
 318       //      cout<<"bad vertex type::"<< fESDEvent->GetPrimaryVertex()->GetName() << endl;
 319       AliDebug(1,"Reject, GetPrimaryVertexSPD()->GetNContributors() < 1");
 320
 321       return kFALSE;
 322     }
 323   }
 324
 325   AliDebug(1,"Reject, GetPrimaryVertexTracks()->GetNContributors() > 1");
 326
 327   return kFALSE;
 328
 329 }
 330
 331 //__________________________________________________
 332 void AliAnalysisTaskCaloFilter::CorrectionsInEMCAL()
 333 {
 334   //If EMCAL, and requested, correct energy, position ...
 335
 336   //Need to do this in a separate loop before filling the ESDs because of the track matching recalculations
 337
 338   if(fCorrect && (fCaloFilter==kEMCAL || fCaloFilter==kBoth) )
 339   {
 340     if(!fGeoMatrixSet)
 341     {
 342       if(fLoadEMCALMatrices)
 343       {
 344         AliInfo("Load user defined EMCAL geometry matrices");
 345         for(Int_t mod=0; mod < (fEMCALGeo->GetEMCGeometry())->GetNumberOfSuperModules(); mod++)
 346         {
 347           if(fEMCALMatrix[mod])
 348           {
 349             if(DebugLevel() > 1)
 350               fEMCALMatrix[mod]->Print();
 351             fEMCALGeo->SetMisalMatrix(fEMCALMatrix[mod],mod) ;
 352           }
 353           fGeoMatrixSet=kTRUE;
 354         }//SM loop
 355       }//Load matrices
 356       else if(!gGeoManager)
 357       {
 358         AliInfo("Get geo matrices from data");
 359         //Still not implemented in AOD, just a workaround to be able to work at least with ESDs
 360         if(!strcmp(InputEvent()->GetName(),"AliAODEvent"))
 361         {
 362           AliDebug(1,"Use ideal geometry, values geometry matrix not kept in AODs");
 363         }//AOD
 364         else
 365         {
 366           AliDebug(1,"Load Misaligned matrices");
 367           AliESDEvent* esd = dynamic_cast<AliESDEvent*>(InputEvent()) ;
 368           if(!esd)
 369           {
 370             AliInfo("This event does not contain ESDs?");
 371             return;
 372           }
 373           for(Int_t mod=0; mod < (fEMCALGeo->GetEMCGeometry())->GetNumberOfSuperModules(); mod++)
 374           {
 375             if(DebugLevel() > 1)
 376               esd->GetEMCALMatrix(mod)->Print();
 377             if(esd->GetEMCALMatrix(mod)) fEMCALGeo->SetMisalMatrix(esd->GetEMCALMatrix(mod),mod) ;
 378           }
 379           fGeoMatrixSet=kTRUE;
 380         }//ESD
 381       }//Load matrices from Data
 382
 383     }//first event
 384
 385     //Cluster Loop
 386     Int_t nCaloClus = InputEvent()->GetNumberOfCaloClusters();
 387
 388     for (Int_t iClust=0; iClust<nCaloClus; ++iClust)
 389     {
 390       AliVCluster * cluster = InputEvent()->GetCaloCluster(iClust);
 391
 392       if(cluster->IsPHOS()) continue ;
 393
 394       Float_t position[]={0,0,0};
 395
 396       AliDebug(1,Form("Check cluster %d for bad channels and close to border",cluster->GetID()));
 397
 398       if(fEMCALRecoUtils->ClusterContainsBadChannel(fEMCALGeo,cluster->GetCellsAbsId(), cluster->GetNCells())) continue;
 399
 400       AliDebug(2,Form("Filter, before  : i %d, E %f, dispersion %f, m02 %f, m20 %f, distToBad %f",iClust,cluster->E(),
 401                       cluster->GetDispersion(),cluster->GetM02(),cluster->GetM20(), cluster->GetDistanceToBadChannel()));
 402       cluster->GetPosition(position);
 403       AliDebug(2,Form("Filter, before  : i %d, x %f, y %f, z %f",cluster->GetID(), position[0], position[1], position[2]));
 404
 405       //Recalculate distance to bad channels, if new list of bad channels provided
 406       fEMCALRecoUtils->RecalculateClusterDistanceToBadChannel(fEMCALGeo, InputEvent()->GetEMCALCells(), cluster);
 407
 408       if(fEMCALRecoUtils->IsRecalibrationOn())
 409       {
 410         fEMCALRecoUtils->RecalibrateClusterEnergy(fEMCALGeo, cluster, InputEvent()->GetEMCALCells());
 411         fEMCALRecoUtils->RecalculateClusterShowerShapeParameters(fEMCALGeo, InputEvent()->GetEMCALCells(),cluster);
 412         fEMCALRecoUtils->RecalculateClusterPID(cluster);
 413       }
 414
 415       fEMCALRecoUtils->RecalculateClusterPosition(fEMCALGeo, InputEvent()->GetEMCALCells(),cluster);
 416
 417       AliDebug(2,Form("Filter, after   : i %d, E %f, dispersion %f, m02 %f, m20 %f, distToBad %f",cluster->GetID(),cluster->E(),
 418                       cluster->GetDispersion(),cluster->GetM02(),cluster->GetM20(), cluster->GetDistanceToBadChannel()));
 419       cluster->GetPosition(position);
 420       AliDebug(1,Form("Filter, after   : i %d, x %f, y %f, z %f",cluster->GetID(), position[0], position[1], position[2]));
 421
 422       cluster->SetE(fEMCALRecoUtils->CorrectClusterEnergyLinearity(cluster));
 423
 424     }
 425
 426     //Recalculate track-matching
 427     fEMCALRecoUtils->FindMatches(InputEvent(),0,fEMCALGeo);
 428
 429   } // corrections in EMCAL
 430 }
 431
 432 //________________________________________________
 433 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODCaloCells()
 434 {
 435   // Fill EMCAL/PHOS cell info
 436
 437   // EMCAL
 438   if ((fCaloFilter==kBoth ||  fCaloFilter==kEMCAL) && fEvent->GetEMCALCells())
 439   { // protection against missing ESD information
 440     AliVCaloCells &eventEMcells = *(fEvent->GetEMCALCells());
 441     Int_t nEMcell = eventEMcells.GetNumberOfCells() ;
 442
 443     AliAODCaloCells &aodEMcells = *(AODEvent()->GetEMCALCells());
 444     aodEMcells.CreateContainer(nEMcell);
 445     aodEMcells.SetType(AliVCaloCells::kEMCALCell);
 446     Double_t calibFactor = 1.;
 447     for (Int_t iCell = 0; iCell < nEMcell; iCell++)
 448     {
 449       Int_t imod = -1, iphi =-1, ieta=-1,iTower = -1, iIphi = -1, iIeta = -1;
 450       fEMCALGeo->GetCellIndex(eventEMcells.GetCellNumber(iCell),imod,iTower,iIphi,iIeta);
 451       fEMCALGeo->GetCellPhiEtaIndexInSModule(imod,iTower,iIphi, iIeta,iphi,ieta);
 452
 453       if(fCorrect && fEMCALRecoUtils->IsRecalibrationOn())
 454       {
 455         calibFactor = fEMCALRecoUtils->GetEMCALChannelRecalibrationFactor(imod,ieta,iphi);
 456       }
 457
 458       if(!fEMCALRecoUtils->GetEMCALChannelStatus(imod, ieta, iphi))
 459       { //Channel is not declared as bad
 460         aodEMcells.SetCell(iCell,eventEMcells.GetCellNumber(iCell),eventEMcells.GetAmplitude(iCell)*calibFactor,
 461                            eventEMcells.GetTime(iCell),eventEMcells.GetMCLabel(iCell),eventEMcells.GetEFraction(iCell));
 462         //printf("GOOD channel\n");
 463       }
 464       else
 465       {
 466         aodEMcells.SetCell(iCell,eventEMcells.GetCellNumber(iCell),0,-1,-1,0);
 467         //printf("BAD channel\n");
 468       }
 469     }
 470     aodEMcells.Sort();
 471   }
 472
 473   // PHOS
 474   if ((fCaloFilter==kBoth ||  fCaloFilter==kPHOS) && fEvent->GetPHOSCells())
 475   { // protection against missing ESD information
 476     AliVCaloCells &eventPHcells = *(fEvent->GetPHOSCells());
 477     Int_t nPHcell = eventPHcells.GetNumberOfCells() ;
 478
 479     AliAODCaloCells &aodPHcells = *(AODEvent()->GetPHOSCells());
 480     aodPHcells.CreateContainer(nPHcell);
 481     aodPHcells.SetType(AliVCaloCells::kPHOSCell);
 482
 483     for (Int_t iCell = 0; iCell < nPHcell; iCell++)
 484     {
 485       aodPHcells.SetCell(iCell,eventPHcells.GetCellNumber(iCell),eventPHcells.GetAmplitude(iCell),
 486                          eventPHcells.GetTime(iCell),eventPHcells.GetMCLabel(iCell),eventPHcells.GetEFraction(iCell));
 487     }
 488
 489     aodPHcells.Sort();
 490   }
 491 }
 492
 493
 494 //___________________________________________________
 495 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODCaloClusters()
 496 {
 497   // Fill the AOD with caloclusters
 498
 499   // Access to the AOD container of clusters
 500
 501   TClonesArray &caloClusters = *(AODEvent()->GetCaloClusters());
 502   Int_t jClusters=0;
 503   Float_t  posF[3]  ;
 504
 505   Int_t nCaloClus = fEvent->GetNumberOfCaloClusters();
 506   for (Int_t iClust=0; iClust<nCaloClus; ++iClust)
 507   {
 508
 509     AliVCluster * cluster = fEvent->GetCaloCluster(iClust);
 510
 511     //Check which calorimeter information we want to keep.
 512
 513     if(fCaloFilter!=kBoth)
 514     {
 515       if     (fCaloFilter==kPHOS  && cluster->IsEMCAL()) continue ;
 516       else if(fCaloFilter==kEMCAL && cluster->IsPHOS())  continue ;
 517     }
 518
 519     // Get original residuals, in case of previous recalculation, reset them
 520     Float_t dR = cluster->GetTrackDx();
 521     Float_t dZ = cluster->GetTrackDz();
 522
 523     AliDebug(2,Form("Original residuals : dZ %f, dR %f",dZ, dR));
 524
 525     //--------------------------------------------------------------
 526     //If EMCAL and corrections done, get the new matching parameters, do not copy noisy clusters
 527     if(cluster->IsEMCAL() && fCorrect)
 528     {
 529       AliDebug(2,Form("Check cluster %d for bad channels and close to border",cluster->GetID()));
 530
 531       if(fEMCALRecoUtils->ClusterContainsBadChannel(fEMCALGeo,cluster->GetCellsAbsId(), cluster->GetNCells())) continue;
 532
 533       if(fEMCALRecoUtils->IsExoticCluster(cluster, InputEvent()->GetEMCALCells(),InputEvent()->GetBunchCrossNumber())) continue;
 534
 535       fEMCALRecoUtils->GetMatchedResiduals(cluster->GetID(),dR,dZ);
 536       cluster->SetTrackDistance(dR,dZ);
 537     }
 538
 539     AliDebug(2,Form("EMCAL? %d, PHOS? %d Track-Cluster Residuals : dZ %f, dR %f",cluster->IsEMCAL(), cluster->IsPHOS(),dZ, dR));
 540
 541     //--------------------------------------------------------------
 542
 543     //Now fill AODs
 544
 545     Int_t id       = cluster->GetID();
 546     Float_t energy = cluster->E();
 547     cluster->GetPosition(posF);
 548
 549     AliAODCaloCluster *caloCluster = new(caloClusters[jClusters++])
 550     AliAODCaloCluster(id,
 551                       cluster->GetNLabels(),
 552                       cluster->GetLabels(),
 553                       energy,
 554                       posF,
 555                       NULL,
 556                       cluster->GetType());
 557
 558     caloCluster->SetCaloCluster(cluster->GetDistanceToBadChannel(),
 559                                 cluster->GetDispersion(),
 560                                 cluster->GetM20(), cluster->GetM02(),
 561                                 -1,
 562                                 cluster->GetNExMax(),cluster->GetTOF()) ;
 563
 564     caloCluster->SetPIDFromESD(cluster->GetPID());
 565     caloCluster->SetNCells(cluster->GetNCells());
 566     caloCluster->SetCellsAbsId(cluster->GetCellsAbsId());
 567     caloCluster->SetCellsAmplitudeFraction(cluster->GetCellsAmplitudeFraction());
 568     caloCluster->SetTrackDistance(dR, dZ);
 569
 570     AliDebug(2,Form("Filter, aod     : i %d, E %f, dispersion %f, m02 %f, m20 %f",caloCluster->GetID(),caloCluster->E(),
 571                     caloCluster->GetDispersion(),caloCluster->GetM02(),caloCluster->GetM20()));
 572     caloCluster->GetPosition(posF);
 573     AliDebug(2,Form("Filter, aod     : i %d, x %f, y %f, z %f",caloCluster->GetID(), posF[0], posF[1], posF[2]));
 574
 575     //Matched tracks, just to know if there was any match, the track pointer is useless if tracks not stored
 576     if(TMath::Abs(dR) < 990 && TMath::Abs(dZ) < 990)
 577     { //Default value in PHOS 999, in EMCAL 1024, why?
 578       caloCluster->AddTrackMatched(new AliAODTrack);
 579     }
 580     // TO DO, in case Tracks available, think how to put the matched track in AOD
 581   }
 582
 583   caloClusters.Expand(jClusters); // resize TObjArray to 'remove' slots
 584
 585 }
 586
 587 //__________________________________________________
 588 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODCaloTrigger()
 589 {
 590   // AOD CaloTrigger copy
 591
 592   if( !AODEvent() || !fAODEvent ) return;
 593
 594   AliAODCaloTrigger* triggerEM   = AODEvent()->GetCaloTrigger("EMCAL");
 595   AliAODCaloTrigger* triggerPH   = AODEvent()->GetCaloTrigger("PHOS");
 596
 597   // Copy from AODs
 598
 599   AliAODCaloTrigger* inTriggerEM = fAODEvent ->GetCaloTrigger("EMCAL");
 600   AliAODCaloTrigger* inTriggerPH = fAODEvent ->GetCaloTrigger("PHOS");
 601
 602   if(inTriggerPH && (fCaloFilter==kBoth || fCaloFilter==kPHOS))  *triggerPH = *inTriggerPH;
 603
 604   if(inTriggerEM && (fCaloFilter==kBoth || fCaloFilter==kEMCAL)) *triggerEM = *inTriggerEM;
 605 }
 606
 607 //______________________________________________
 608 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODHeader()
 609 {
 610   // AOD header copy
 611
 612   AliAODHeader* header = dynamic_cast<AliAODHeader*>(AODEvent()->GetHeader());
 613   if(!header)
 614   {
 615     AliFatal("Not a standard AOD");
 616     return; // not needed but coverity complains
 617   }
 618
 619   // Copy from AODs
 620   if(fAODEvent)
 621   {
 622     *header = *((AliAODHeader*)fAODEvent->GetHeader());
 623     return;
 624   }
 625
 626   if(!fESDEvent) return;
 627
 628   // Copy from ESDs
 629
 630   header->SetRunNumber(fEvent->GetRunNumber());
 631
 632   TTree* tree = fInputHandler->GetTree();
 633   if (tree)
 634   {
 635     TFile* file = tree->GetCurrentFile();
 636     if (file) header->SetESDFileName(file->GetName());
 637   }
 638
 639   header->SetBunchCrossNumber(fEvent->GetBunchCrossNumber());
 640   header->SetOrbitNumber(fEvent->GetOrbitNumber());
 641   header->SetPeriodNumber(fEvent->GetPeriodNumber());
 642   header->SetEventType(fEvent->GetEventType());
 643
 644   //Centrality
 645   if(fEvent->GetCentrality())
 646   {
 647     header->SetCentrality(new AliCentrality(*(fEvent->GetCentrality())));
 648   }
 649   else
 650   {
 651     header->SetCentrality(0);
 652   }
 653
 654   //Trigger
 655   header->SetOfflineTrigger(fInputHandler->IsEventSelected()); // propagate the decision of the physics selection
 656   header->SetFiredTriggerClasses(fESDEvent->GetFiredTriggerClasses());
 657   header->SetTriggerMask(fEvent->GetTriggerMask());
 658   header->SetTriggerCluster(fEvent->GetTriggerCluster());
 659   header->SetL0TriggerInputs(fESDEvent->GetHeader()->GetL0TriggerInputs());
 660   header->SetL1TriggerInputs(fESDEvent->GetHeader()->GetL1TriggerInputs());
 661   header->SetL2TriggerInputs(fESDEvent->GetHeader()->GetL2TriggerInputs());
 662
 663   header->SetMagneticField(fEvent->GetMagneticField());
 664   header->SetMuonMagFieldScale(fESDEvent->GetCurrentDip()/6000.);
 665
 666   header->SetZDCN1Energy(fEvent->GetZDCN1Energy());
 667   header->SetZDCP1Energy(fEvent->GetZDCP1Energy());
 668   header->SetZDCN2Energy(fEvent->GetZDCN2Energy());
 669   header->SetZDCP2Energy(fEvent->GetZDCP2Energy());
 670   header->SetZDCEMEnergy(fEvent->GetZDCEMEnergy(0),fEvent->GetZDCEMEnergy(1));
 671
 672   Float_t diamxy[2]={(Float_t)fEvent->GetDiamondX(),(Float_t)fEvent->GetDiamondY()};
 673   Float_t diamcov[3];
 674   fEvent->GetDiamondCovXY(diamcov);
 675   header->SetDiamond(diamxy,diamcov);
 676   header->SetDiamondZ(fESDEvent->GetDiamondZ(),fESDEvent->GetSigma2DiamondZ());
 677
 678 }
 679
 680
 681 //__________________________________________________
 682 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODMCParticles()
 683 {
 684   // Copy MC particles
 685
 686   if(!fFillMCParticles) return;
 687
 688   TClonesArray* inMCParticles = (TClonesArray*) (fAODEvent  ->FindListObject("mcparticles"));
 689   TClonesArray* ouMCParticles = (TClonesArray*) ( AODEvent()->FindListObject("mcparticles"));
 690
 691   if( inMCParticles &&  ouMCParticles ) new (ouMCParticles) TClonesArray(*inMCParticles);
 692
 693 }
 694
 695 //_____________________________________________
 696 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODTracks()
 697 {
 698   // AOD track copy
 699
 700   if(!fFillTracks) return;
 701
 702   AliAODTrack* aodTrack(0x0);
 703
 704   Double_t pos[3]   = { 0. };
 705   Double_t covTr[21]= { 0. };
 706   //Double_t pid[10]  = { 0. };
 707   Double_t p[3]     = { 0. };
 708
 709   // Copy from AODs
 710   if(fAODEvent)
 711   {
 712     //TClonesArray* inTracks = fAODEvent  ->GetTracks();
 713     TClonesArray* ouTracks = AODEvent()->GetTracks();
 714                 //new (ouTracks) TClonesArray(*inTracks);
 715
 716     //printf("N tracks %d\n",fAODEvent->GetNumberOfTracks());
 717     Int_t nCopyTrack = 0;
 718     for (Int_t nTrack = 0; nTrack < fAODEvent->GetNumberOfTracks(); ++nTrack)
 719     {
 720       AliAODTrack *track = dynamic_cast<AliAODTrack*>(fAODEvent->GetTrack(nTrack));
 721       if(!track) AliFatal("Not a standard AOD");
 722
 723       // Select only hybrid tracks?
 724       if(fFillHybridTracks && !track->IsHybridGlobalConstrainedGlobal()) continue;
 725
 726       // Remove PID object to save space
 727       //track->SetDetPID(0x0);
 728
 729       //new((*ouTracks)[nCopyTrack++]) AliAODTrack(*track);
 730
 731       track->GetPxPyPz(p);
 732       Bool_t isDCA  = track->GetPosition(pos);
 733       track->GetCovMatrix(covTr);
 734       //track->GetPID(pid);
 735
 736       AliAODVertex* primVertex = (AliAODVertex*) AODEvent()->GetVertices()->At(0); // primary vertex, copied previously!!!
 737
 738       aodTrack = new((*ouTracks)[nCopyTrack++]) AliAODTrack(
 739                                                             track->GetID(),
 740                                                             track->GetLabel(),
 741                                                             p,
 742                                                             kTRUE,
 743                                                             pos,
 744                                                             isDCA,
 745                                                             covTr,
 746                                                             track->Charge(),
 747                                                             track->GetITSClusterMap(),
 748                                                             // pid,
 749                                                             primVertex,
 750                                                             track->GetUsedForVtxFit(),
 751                                                             track->GetUsedForPrimVtxFit(),
 752                                                             (AliAODTrack::AODTrk_t) track->GetType(),
 753                                                             track->GetFilterMap());
 754
 755
 756       aodTrack->SetPIDForTracking(track->GetPIDForTracking());
 757       aodTrack->SetIsHybridGlobalConstrainedGlobal(track->IsHybridGlobalConstrainedGlobal());
 758       aodTrack->SetIsHybridTPCConstrainedGlobal   (track->IsHybridTPCConstrainedGlobal());
 759       aodTrack->SetIsGlobalConstrained            (track->IsGlobalConstrained());
 760       aodTrack->SetIsTPCConstrained               (track->IsTPCConstrained());
 761
 762       aodTrack->SetTPCFitMap    (track->GetTPCFitMap());
 763       aodTrack->SetTPCClusterMap(track->GetTPCClusterMap());
 764       aodTrack->SetTPCSharedMap (track->GetTPCSharedMap());
 765
 766       aodTrack->SetChi2MatchTrigger(track->GetChi2MatchTrigger());
 767
 768       // set the DCA values to the AOD track
 769
 770       aodTrack->SetPxPyPzAtDCA(track->PxAtDCA(),track->PyAtDCA(),track->PzAtDCA());
 771       aodTrack->SetXYAtDCA    (track->XAtDCA() ,track->YAtDCA());
 772
 773       aodTrack->SetFlags      (track->GetFlags());
 774       aodTrack->SetTPCPointsF (track->GetTPCNclsF());
 775
 776       // Calo
 777
 778       if(track->IsEMCAL()) aodTrack->SetEMCALcluster(track->GetEMCALcluster());
 779       if(track->IsPHOS())  aodTrack->SetPHOScluster (track->GetPHOScluster());
 780       aodTrack->SetTrackPhiEtaPtOnEMCal( track->GetTrackPhiOnEMCal(),  track->GetTrackPhiOnEMCal(),  track->GetTrackPtOnEMCal() );
 781
 782     }
 783
 784     //printf("Final N tracks %d\n",nCopyTrack);
 785
 786     return;
 787   }
 788
 789 }
 790
 791 //_________________________________________
 792 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODv0s()
 793 {
 794   // Copy v0s (use if you know what you do, use quite a lot of memory)
 795
 796   if(!fFillv0s) return;
 797
 798   // Copy from AODs
 799   if(fAODEvent)
 800   {
 801     TClonesArray* inv0 = fAODEvent  ->GetV0s();
 802     TClonesArray* ouv0 =  AODEvent()->GetV0s();
 803
 804                 //new (ouv0s) TClonesArray(*inv0s);
 805
 806     Int_t allv0s = inv0->GetEntriesFast();
 807
 808     for (Int_t nv0s = 0; nv0s < allv0s; ++nv0s)
 809     {
 810       AliAODv0 *v0 = (AliAODv0*)inv0->At(nv0s);
 811
 812       new((*ouv0)[nv0s]) AliAODv0(*v0);
 813     }
 814
 815     return;
 816   }
 817
 818 }
 819
 820 //____________________________________________
 821 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODVZERO()
 822 {
 823   // Copy VZERO
 824
 825   if(!fFillVZERO) return;
 826
 827   AliAODVZERO* vzeroData = AODEvent()->GetVZEROData();
 828
 829   if(fESDEvent) *vzeroData = *(fESDEvent->GetVZEROData());
 830   else          *vzeroData = *(fAODEvent->GetVZEROData());
 831
 832 }
 833
 834 //_______________________________________________
 835 void AliAnalysisTaskCaloFilter::FillAODVertices()
 836 {
 837   // Copy vertices
 838
 839   // set arrays and pointers
 840   Double_t pos[3]   ;
 841   Double_t covVtx[6];
 842   for (Int_t i = 0; i < 6; i++)  covVtx[i] = 0.;
 843
 844   // Copy from AODs
 845   if(fAODEvent)
 846   {
 847     TClonesArray* inVertices = fAODEvent  ->GetVertices();
 848     TClonesArray* ouVertices = AODEvent()->GetVertices();
 849
 850                 //new (ouVertices) TClonesArray(*inVertices);
 851
 852     //Keep only the first 3 vertices if not requested
 853     Int_t allVertices = inVertices->GetEntriesFast();
 854
 855     //printf("n Vertices %d\n",allVertices);
 856
 857     if(!fFillAllVertices)
 858     {
 859       if(allVertices >  3) allVertices = 3;
 860     }
 861
 862     //printf("Final n Vertices %d\n",allVertices);
 863
 864     for (Int_t nVertices = 0; nVertices < allVertices; ++nVertices)
 865     {
 866       AliAODVertex *vertex = (AliAODVertex*)inVertices->At(nVertices);
 867
 868       new((*ouVertices)[nVertices]) AliAODVertex(*vertex);
 869     }
 870
 871     return;
 872   }
 873
 874   if(!fESDEvent) return;
 875
 876   // Copy from ESDs
 877
 878   // Access to the AOD container of vertices
 879   Int_t jVertices=0;
 880   TClonesArray &vertices = *(AODEvent()->GetVertices());
 881
 882   // Add primary vertex. The primary tracks will be defined
 883   // after the loops on the composite objects (v0, cascades, kinks)
 884   fEvent   ->GetPrimaryVertex()->GetXYZ(pos);
 885   fESDEvent->GetPrimaryVertex()->GetCovMatrix(covVtx);
 886   Float_t chi = fESDEvent->GetPrimaryVertex()->GetChi2toNDF();
 887
 888   AliAODVertex * primary = new(vertices[jVertices++])
 889   AliAODVertex(pos, covVtx, chi, NULL, -1, AliAODVertex::kPrimary);
 890   primary->SetName(fEvent->GetPrimaryVertex()->GetName());
 891   primary->SetTitle(fEvent->GetPrimaryVertex()->GetTitle());
 892
 893 }
 894
 895 //____________________________________
 896 void AliAnalysisTaskCaloFilter::Init()
 897 {
 898   //Init analysis with configuration macro if available
 899
 900   if(gROOT->LoadMacro(fConfigName) >=0)
 901   {
 902     AliInfo(Form("Configure analysis with %s",fConfigName.Data()));
 903
 904     AliAnalysisTaskCaloFilter *filter = (AliAnalysisTaskCaloFilter*)gInterpreter->ProcessLine("ConfigCaloFilter()");
 905
 906     fEMCALGeoName      = filter->fEMCALGeoName;
 907     fLoadEMCALMatrices = filter->fLoadEMCALMatrices;
 908     fFillAODFile       = filter->fFillAODFile;
 909     fFillTracks        = filter->fFillTracks;
 910     fFillHybridTracks  = filter->fFillHybridTracks;
 911     fFillv0s           = filter->fFillv0s;
 912     fFillVZERO         = filter->fFillVZERO;
 913     fFillAllVertices   = filter->fFillAllVertices;
 914     fEMCALRecoUtils    = filter->fEMCALRecoUtils;
 915     fConfigName        = filter->fConfigName;
 916     fCaloFilter        = filter->fCaloFilter;
 917     fEventSelection[0] = filter->fEventSelection[0];
 918     fEventSelection[1] = filter->fEventSelection[1];
 919     fEventSelection[2] = filter->fEventSelection[2];
 920     fAcceptAllMBEvent  = filter->fAcceptAllMBEvent;
 921     fMBTriggerMask     = filter->fMBTriggerMask;
 922     fCorrect           = filter->fCorrect;
 923     fEMCALEnergyCut    = filter->fEMCALEnergyCut;
 924     fEMCALNcellsCut    = filter->fEMCALNcellsCut;
 925     fPHOSEnergyCut     = filter->fPHOSEnergyCut;
 926     fPHOSNcellsCut     = filter->fPHOSNcellsCut;
 927     fTrackPtCut        = filter->fTrackPtCut;
 928     fVzCut             = filter->fVzCut;
 929     fCheckEventVertex  = filter->fCheckEventVertex;
 930
 931     for(Int_t i = 0; i < 12; i++) fEMCALMatrix[i] = filter->fEMCALMatrix[i] ;
 932   }
 933 }
 934
 935 //_________________________________________
 936 void AliAnalysisTaskCaloFilter::PrintInfo()
 937 {
 938   //Print settings
 939
 940   printf("AnalysisCaloFilter::PrintInfo() \n");
 941
 942   printf("\t Not only filter, correct Clusters? %d\n",fCorrect);
 943   printf("\t Calorimeter Filtering Option     ? %d\n",fCaloFilter);
 944
 945   //printf("\t Use handmade geo matrices?   EMCAL %d, PHOS %d\n",fLoadEMCALMatrices, fLoadPHOSMatrices);
 946   printf("\t Use handmade geo matrices?   EMCAL %d, PHOS 0\n",fLoadEMCALMatrices);
 947
 948   printf("\t Fill: AOD file? %d Tracks? %d; all Vertex? %d; v0s? %d; VZERO ? %d\n",
 949          fFillAODFile,fFillTracks,fFillAllVertices, fFillv0s, fFillVZERO);
 950
 951   printf("\t Event Selection based : EMCAL?  %d, PHOS?  %d Tracks? %d - Accept all MB with mask %d? %d\n",
 952          fEventSelection[0],fEventSelection[1],fEventSelection[2],fMBTriggerMask, fAcceptAllMBEvent);
 953
 954   printf("\t \t EMCAL E > %2.2f, EMCAL nCells >= %d, PHOS E > %2.2f, PHOS nCells >= %d, Track pT > %2.2f, |vz| < %2.2f\n",
 955          fEMCALEnergyCut,fEMCALNcellsCut,fPHOSEnergyCut,fPHOSNcellsCut, fTrackPtCut,fVzCut);
 956 }
 957
 958 //_______________________________________________________
 959 void AliAnalysisTaskCaloFilter::UserCreateOutputObjects()
 960 {
 961   // Init geometry
 962
 963   fEMCALGeo =  AliEMCALGeometry::GetInstance(fEMCALGeoName) ;
 964
 965   if(fFillMCParticles)
 966   {
 967     TClonesArray * aodMCParticles = new TClonesArray("AliAODMCParticle",500);
 968                 aodMCParticles->SetName("mcparticles");
 969                 ((AliAODHandler*)AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->GetOutputEventHandler())->AddBranch("TClonesArray", &aodMCParticles);
 970   }
 971
 972 }
 973
 974 //____________________________________________________________
 975 void AliAnalysisTaskCaloFilter::UserExec(Option_t */*option*/)
 976 {
 977   // Execute analysis for current event
 978   // Copy input ESD or AOD header, vertex, CaloClusters and CaloCells to output AOD
 979
 980   AliDebug(1,Form("Analysing event # %d", (Int_t)Entry()));
 981
 982   fEvent    = InputEvent();
 983   fAODEvent = dynamic_cast<AliAODEvent*> (fEvent);
 984   fESDEvent = dynamic_cast<AliESDEvent*> (fEvent);
 985
 986   if(!fEvent)
 987   {
 988     AliInfo("This event does not contain Input?");
 989     return;
 990   }
 991
 992   // printf("Start processing : %s\n",fAODEvent->GetFiredTriggerClasses().Data());
 993
 994   // Select the event
 995
 996   if(!AcceptEvent()) return ;
 997
 998   //Magic line to write events to file
 999
1000   AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->GetOutputEventHandler()->SetFillAOD(fFillAODFile);
1001
1002   // Reset output AOD
1003
1004   Int_t nVertices = 0;
1005   if(fFillv0s) nVertices = fEvent->GetNumberOfV0s();
1006   Int_t nCaloClus = fEvent->GetNumberOfCaloClusters();
1007   Int_t nTracks   = fEvent->GetNumberOfTracks();
1008
1009   AODEvent()->ResetStd(nTracks, nVertices, 0, 0, 0, nCaloClus, 0, 0);
1010
1011   // Copy
1012
1013   FillAODHeader();
1014
1015   //
1016   FillAODv0s();
1017
1018   //
1019   FillAODVertices(); // Do it before the track filtering to have the reference to the vertex
1020
1021   //
1022   FillAODVZERO();
1023
1024   //
1025   FillAODTracks();
1026
1027   //
1028   CorrectionsInEMCAL();
1029
1030   //
1031   FillAODCaloClusters();
1032
1033   //
1034   FillAODCaloCells();
1035
1036   //
1037   FillAODCaloTrigger();
1038
1039   //
1040   FillAODMCParticles();
1041
1042   //printf("Filtered event, end processing : %s\n",fAODEvent->GetFiredTriggerClasses().Data());
1043
1044 }
1045