PWGLF/FORWARD/analysis2/qa/RunQA.sh

   1 #!/bin/bash
   2 #
   3 # This is deprecated.  Use RunQAMT.sh instead
   4 #
   5 jobid=0
   6 top=.
   7 verb=0
   8 nodw=0
   9 notr=0
  10 norn=0
  11 maxf=-1
  12 last="unknown"
  13 lock=
  14
  15
  16 export PATH=$PATH:$ALICE_ROOT/PWGLF/FORWARD/analysis2/qa:../scripts
  17
  18 # --- Handle exit ----------------------------------------------------
  19 handle_exit()
  20 {
  21     echo "Removing $lock"
  22     rm -f $lock
  23 }
  24 trap handle_exit EXIT
  25
  26 # --- Usage information ----------------------------------------------
  27 usage()
  28 {
  29 cat <<EOF
  30 Usage: $0 -j JOBID [OPTIONS]
  31
  32 Options:
  33         -h.--help                  This help
  34         -j,--jobid      JOBID      Job id from MonALisa                [$jobid]
  35         -d,--nodownload            Do not download                     [$nodw]
  36         -t,--notrend               Do not make new trend tree          [$notr]
  37         -r,--no-run                Do not make per-run info            [$norn]
  38         -o,--output     DIRECTORY  Where to store the result           [$top]
  39         -v,--verbose               Be verbose                          [$verb]
  40         -m,--max        NUMBER     Maximum number of runs to get       [$maxf]
  41         -s,--skip-lines NUMBER     Number of lines to skip in job list [$skip]
  42 EOF
  43 }
  44
  45 # --- Messages -------------------------------------------------------
  46 mess()
  47 {
  48     if test $verb -lt 1 ; then return ; fi
  49     last="$@"
  50     echo $@
  51 }
  52
  53 # --- Get parts of the passed path -----------------------------------
  54 get_parts()
  55 {
  56     y=$1 ; shift
  57     p=$1 ; shift
  58     r=$1 ; shift
  59     e=$1 ; shift
  60     x=$1 ; shift
  61     r=$1
  62
  63     P=`echo $x | sed 's/.*pass\([0-9]*\).*/\1/'`
  64     R=`echo $x | sed -n "s/.*pass${P}_//p"`
  65     Q=`echo $x | sed -n 's/pass.*//p'`
  66     Y=`echo $p | sed 's/LHC\(..\).*/\1/'`
  67     L=`echo $p | sed "s/LHC${Y}\(.\).*/\1/"`
  68     S=`echo $p | sed "s/LHC${Y}${L}//"`
  69
  70     dprod=LHC${Y}${L}
  71     case x$S in
  72         x) ;;
  73         x_*) ;;
  74         *) dprod=${dprod}${S} ;;
  75     esac
  76
  77     case x$r in
  78         xQA*) q=`echo $r | sed 's/QA//'` ;;
  79         x) ;;
  80         *) ;;
  81     esac
  82
  83     opts="-p $p -P $P"
  84     if test "x$R" != "x" ; then opts="$opts -R $R" ; fi
  85     if test "x$q" != "x" ; then opts="$opts -q $q" ; fi
  86     if test "x$Q" != "x" ; then opts="$opts -Q $Q" ; fi
  87
  88     dest="${dprod}/${Q}pass${P}"
  89     if test "x$R" != "x" ; then dest="${dest}_${R}" ; fi
  90
  91 }
  92
  93 # --- Get the options ------------------------------------------------
  94 skip=1
  95 jobUrl="http://alimonitor.cern.ch/prod/jobs.jsp?t="
  96 get_opts() {
  97     wget -q ${jobUrl}${jobid} -O job.html
  98     p=`grep "/catalogue/index.jsp?path" job.html | head -n $skip | tail -n 1 | sed -e 's,.*/alice/data/\([^<]*\)<.*,\1,' | tr '/' ' '`
  99     rm -f job.html
 100
 101     get_parts $p
 102 }
 103
 104 # --- Trapping errors ------------------------------------------------
 105 handle_err()
 106 {
 107     echo "Got an error: $last"
 108     exit 1
 109 }
 110 enable_trap ()
 111 {
 112     # echo "Enabling trapping errors"
 113     trap handle_err ERR
 114     # trap -p ERR
 115 }
 116 disable_trap ()
 117 {
 118     # echo "Disabling trapping errors"
 119     trap - ERR
 120     # trap -p ERR
 121 }
 122
 123
 124 # --- Deprecated -----------------------------------------------------
 125 cat <<EOF
 126 This script is deprecated.  You should use the more advanced script RunQAMT.sh
 127 which process the runs in parallel and in general is more flexible
 128 EOF
 129 read -n 1 -i n -p "Do you want to continue [yN]? "
 130 case $REPLY in
 131     y|Y) echo "" ;;
 132     *) exit 0 ;;
 133 esac
 134
 135
 136 # --- comamnd line ---------------------------------------------------
 137 while test $# -gt 0 ; do
 138     case $1 in
 139         -h|--help)        usage   ; exit 0 ;;
 140         -j|--jobid)       jobid=$2; shift  ;;
 141         -o|--output)      top=$2  ; shift  ;;
 142         -d|--no-download) nodw=1  ;;
 143         -t|--no-trend)    notr=1  ;;
 144         -r|--no-run)      norn=1  ;;
 145         -v|--verbose)     verb=1  ;;
 146         -s|--skip-lines)  skip=$2 ; shift ;;
 147         -m|--max)         maxf=$2 ; shift ;;
 148         *) echo "Unknown option $1" > /dev/stderr ; exit 1 ;;
 149     esac
 150     shift
 151 done
 152
 153 # --- Sanity ---------------------------------------------------------
 154 if test $jobid -lt 1 ; then
 155     echo "No JOBID specified" > /dev/stderr
 156     exit 1
 157 fi
 158
 159 # --- Extract options -----------------------------------------------
 160 get_opts $jobid
 161 if test "x$opts" = "x" ; then
 162     echo "No options found"
 163     rm -f $lock
 164     exit 1
 165 fi
 166
 167 # --- Display job setting --------------------------------------------
 168 cat <<EOF
 169 ----------------------------------------------------------------------
 170 Job id:           $jobid
 171 Top directory:    $top
 172 Don't download:   $nodw
 173 Don't make tree:  $notr
 174 Download options: $opts
 175 Destination:      $dest
 176 Skip lines:       $skip
 177 Max # of runs:    $maxf
 178 ----------------------------------------------------------------------
 179 EOF
 180
 181 # --- Lock -----------------------------------------------------------
 182 lock=${top}/${dest}/.lock
 183 if test -f $lock ; then
 184     echo "Another QA process is already running:" > /dev/stderr
 185     echo "Content of ${top}/${dest}/.lock:" > /dev/stderr
 186     cat $lock > /dev/stderr
 187     trap - EXIT
 188     exit 1
 189 fi
 190
 191 now=`date`
 192 cat <<EOF > $lock
 193 Process: $$
 194 User:    $USER
 195 Start:   $now
 196 EOF
 197
 198
 199 # --- Download the files ---------------------------------------------
 200 if test $nodw -lt 1 ; then
 201     mess "Running getQAResults.sh $opts -d $top -n "
 202     getQAResults.sh $opts -d $top -T -v -v -i -m $maxf
 203 else
 204     mess "Not downloading"
 205 fi
 206
 207 # --- Now run the QA code -------------------------------------------
 208
 209 mess "Now running code"
 210 enable_trap
 211 savdir=`pwd`
 212 mess "Change directory to $top/$dest"
 213 cd $top/${dest}
 214
 215 disable_trap
 216 trap - ERR
 217 trap -p ERR
 218 mess "List of trend_<x>.html files"
 219 idx=`ls trend_*_*.html 2>/dev/null`
 220 mess "Removing indeces"
 221 rm -f index.html
 222 for i in $idx ; do
 223     if test -f $i ; then rm -f $i ; fi
 224 done
 225
 226 what=3
 227 if test $notr -gt 0 ; then let what=$what^0x2 ; fi
 228 if test $norn -gt 0 ; then let what=$what^0x1 ; fi
 229
 230 scr=$ALICE_ROOT/PWGLF/FORWARD/analysis2/qa/RunQA.C
 231 mess "Running root -l -b -q ${scr}\(\".\",1,-1,$what\)"
 232
 233 enable_trap
 234 root -l -b -q ${scr}\(\".\",1,-1,$what\)
 235 trap - ERR
 236 disable_trap
 237
 238 idx=`ls trend_*_*.html 2>/dev/null`
 239 rm -f index.html
 240 for i in $idx ; do
 241     echo "making index.html point to $i"
 242     cat $i | \
 243         sed -e "s,index.html,../index.html," \
 244             -e "s,!--JOBID--,a target='_blank' href='${jobUrl}${jobid}'>Job</a," \
 245         > index.html
 246     cp index.html $i
 247 done
 248 if test ! -f index.html ; then
 249     echo "No index file found"
 250     exit 1
 251 fi
 252 chmod g+rw  index.html
 253 chmod g+rw .  > /dev/null 2>&1
 254
 255 style=
 256 if test -f $ALICE_ROOT/PWGLF/FORWARD/analysis2/qa/style.css ; then
 257     style=$ALICE_ROOT/PWGLF/FORWARD/analysis2/qa/style.css
 258 elif test -f $savdir/style.css ; then
 259     style=$savdir/style.css
 260 fi
 261
 262 if test x$style != x ; then
 263     rm -f style.css
 264     cp $style .
 265     chmod g+rw style.css
 266 fi
 267
 268 cat <<EOF
 269
 270 Finished running QA for jobid $jobid.
 271 Output is stored in  $top/${dest}
 272
 273 EOF
 274
 275 # --- Make index.html ------------------------------------------------
 276 cd ..
 277 date=`date`
 278 period=`pwd`
 279 period=`basename $period`
 280 rm -f index.html
 281 cat <<EOF > index.html
 282 <html>
 283 <head>
 284 <title>$period</title>
 285 <LINK REL="stylesheet" href="style.css">
 286 </head>
 287 <body>
 288 <h1>$period</h1>
 289 <ul>
 290 EOF
 291 for i in * ; do
 292     if test ! -d $i ; then continue ; fi
 293     echo "<li><a href='$i'>$i</a></li>" >> index.html
 294 done
 295 cat <<EOF >> index.html
 296 </ul>
 297 <div class='jobid'>
 298
 299 </div>
 300 <div class='back'>
 301   <a href="../">Back</a>
 302 </div>
 303 <div class='change'>
 304   Last update: $date
 305 </div>
 306 </body>
 307 </html>
 308 EOF
 309 chmod g+rw index.html
 310 chmod g+rw .  > /dev/null 2>&1
 311 if test x$style != x ; then
 312     rm -f style.css
 313     cp $style .
 314     chmod g+rw style.css
 315 fi
 316
 317 # --- Make index.html ------------------------------------------------
 318 cd ..
 319 rm -f index.html
 320 cat <<EOF >index.html
 321 <html>
 322 <head>
 323 <title>QA for the FMD</title>
 324 <LINK REL="stylesheet" href="style.css">
 325 </head>
 326 <body>
 327 <h1>QA for the FMD</h1>
 328 <p>
 329 For more information, see <a href='https://twiki.cern.ch/twiki/bin/viewauth/ALICE/FMDQA'>TWiki pages</a>
 330 </p>
 331 <ul>
 332 EOF
 333 for i in * ; do
 334     if test ! -d $i ; then continue ; fi
 335     echo "<li><a href='$i'>$i</a></li>" >> index.html
 336 done
 337 cat <<EOF >> index.html
 338 </ul>
 339 <div class='change'>
 340 Last update: $date
 341 </div>
 342 </body>
 343 </html>
 344 EOF
 345 chmod g+rw index.html
 346 chmod g+rw .  > /dev/null 2>&1
 347 if test x$style != x ; then
 348     rm -f style.css
 349     cp $style .
 350     chmod g+rw style.css
 351 fi
 352
 353 cd $savdir
 354 rm -f $lock
 355
 356 #
 357 # EOF
 358 #
 359
 360
 361
 362