]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - RALICE/AliSignal.cxx
10-may-2006 NvE Distance determination between tracks and/or jets introduced in
[u/mrichter/AliRoot.git] / RALICE / AliSignal.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 // $Id$
17
18 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
19 // Class AliSignal
20 // Generic handling of (extrapolated) detector signals.
21 //
22 // The user can decide to store either calibrated or uncalibrated signals.
23 // Via the specification of a gain and offset or/and an explicit
24 // (de)calibration function both calibrated and uncalibrated signals
25 // can always be obtained. For details see the documentation of the
26 // memberfunction GetSignal() and the class AliAttrib.
27 // The explicit specification of a (de)calibration function offers the
28 // maximum flexibility and also allows automatic indication whether
29 // calibrated or uncalibrated data has been stored.
30 // The latter can be achieved by only specifying a calibration function
31 // (and no de-calibration function) in case uncalibrated data is stored,
32 // whereas in case of stored calibrated data the user should only
33 // provide a de-calibration function (and no calibration function).
34 //
35 // Note :
36 // ------
37 // Signal positions (r) and reference frames (f) are specified via
38 // SetPosition(r,f) under the following conventions :
39 //
40 // f="car" ==> r is Cartesian   (x,y,z)
41 // f="sph" ==> r is Spherical   (r,theta,phi)
42 // f="cyl" ==> r is Cylindrical (rho,phi,z)
43 //
44 // The same holds for SetPositionErrors().
45 //
46 // All angles are in radians.
47 //
48 // Example :
49 // ---------
50 //
51 // AliSignal s;
52 // s.SetName("Start counter");
53 // Float_t pos[3]={-1,25,7};
54 // Float_t err[3]={0.03,0.7,0.18};
55 // Float_t signal=120.8;
56 // Float_t error=1.73;
57 // Float_t offset=-12.78;
58 // Float_t gain=250;
59 // s.SetPosition(pos,"car");
60 // s.SetPositionErrors(err,"car");
61 // s.SetSignal(signal);
62 // s.SetSignalError(error);
63 // s.SetOffset(offset);
64 // s.SetGain(gain);
65 // Float_t loc[3],dr[3],sigma;
66 // s.GetPosition(loc,"sph");
67 // s.GetPositionErrors(dr,"sph");
68 // Float_t adc=s.GetSignal();
69 // Float_t sigma=s.GetSignalError();
70 //
71 // AliSignal q;    // In the example below a signal contains the
72 //                 // following data : timing, ADC and dE/dx
73 // q.SetNameTitle("Hybrid","Test for multiple signal data");
74 // q.SetPosition(pos,"car");
75 // q.SetPositionErrors(err,"car");
76 // signal=82.5; // e.g. signal time in ns
77 // error=2.01;
78 // offset=0.003;
79 // q.SetSlotName("TOF",1);
80 // q.SetSignal(signal,1);
81 // q.SetSignalError(error,1);
82 // q.SetOffset(offset,1);
83 // signal=268.1; // e.g. ADC value of signal
84 // error=3.75;
85 // gain=120.78;
86 // offset=1.5732;
87 // // Addressing via name specification instead of index 
88 // q.SetSlotName("ADC",2);
89 // q.SetSignal(signal,"ADC");
90 // q.SetSignalError(error,"ADC");
91 // q.SetGain(gain,"ADC");
92 // q.SetOffset(offset,"ADC");
93 // signal=23.7; // e.g. corresponding dE/dx value
94 // error=0.48;
95 // TF1 f=("calib","[0]*pow(x,2)+[1]"); // dE/dx calib. function
96 // f.SetParameter(0,3.285);
97 // f.SetParameter(1,-18.67);
98 // q.SetSlotName("dE/dx",3);
99 // q.SetCalFunction(&f,"dE/dx");
100 // q.SetSignal(signal,"dE/dx");
101 // q.SetSignalError(error,"dE/dx");
102 //
103 // // Signal retrieval with various (de)calibration modes
104 // Float_t tof=q.GetSignal("TOF");
105 // Float_t adc=q.GetSignal("ADC",1);
106 // Float_t dedx=q.GetSignal("dE/dx",3);
107 //
108 //--- Author: Nick van Eijndhoven 23-jan-1999 UU-SAP Utrecht
109 //- Modified: NvE $Date$ UU-SAP Utrecht
110 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
111
112 #include "AliSignal.h"
113 #include "AliTrack.h"
114 #include "Riostream.h"
115  
116 ClassImp(AliSignal) // Class implementation to enable ROOT I/O
117  
118 AliSignal::AliSignal() : TNamed(),AliPosition(),AliAttrib()
119 {
120 // Creation of an AliSignal object and initialisation of parameters.
121 // Several signal values (with errors) can be stored in different slots.
122 // If needed, the storage for values (and errors) will be expanded automatically
123 // when entering values and/or errors.
124  fSignals=0;
125  fDsignals=0;
126  fWaveforms=0;
127  fLinks=0;
128  fDevice=0;
129 }
130 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
131 AliSignal::~AliSignal()
132 {
133 // Destructor to delete dynamically allocated memory
134  if (fSignals)
135  {
136   delete fSignals;
137   fSignals=0;
138  }
139  if (fDsignals)
140  {
141   delete fDsignals;
142   fDsignals=0;
143  }
144  if (fWaveforms)
145  {
146   delete fWaveforms;
147   fWaveforms=0;
148  }
149  if (fLinks)
150  {
151   // Remove this signal from all related tracks
152   for (Int_t i=1; i<=fLinks->GetNobjects(); i++)
153   {
154    TObject* obj=fLinks->GetObject(i);
155    if (!obj) continue;
156    if (obj->InheritsFrom("AliTrack"))
157    {
158     AliTrack* tx=(AliTrack*)obj;
159     tx->RemoveSignal(*this);
160    }
161   }
162   delete fLinks;
163   fLinks=0;
164  }
165 }
166 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
167 AliSignal::AliSignal(const AliSignal& s) : TNamed(s),AliPosition(s),AliAttrib(s)
168 {
169 // Copy constructor
170  fSignals=0;
171  fDsignals=0;
172  fWaveforms=0;
173  fLinks=0;
174
175  // Don't copy the owning device pointer for the copy
176  fDevice=0;
177
178  Int_t n=s.GetNvalues();
179  Double_t val;
180  for (Int_t i=1; i<=n; i++)
181  {
182   val=s.GetSignal(i);
183   SetSignal(val,i);
184  } 
185
186  n=s.GetNerrors();
187  for (Int_t j=1; j<=n; j++)
188  {
189   val=s.GetSignalError(j);
190   SetSignalError(val,j);
191  }
192
193  n=s.GetNwaveforms();
194  for (Int_t k=1; k<=n; k++)
195  {
196   TH1F* hist=s.GetWaveform(k);
197   if (hist) SetWaveform(hist,k); 
198  }
199
200  TArrayI slotarr;
201  TArrayI posarr;
202  TObject* dum=0;
203  n=s.GetIndices(dum,slotarr,posarr);
204  Int_t slot,pos;
205  for (Int_t idx=0; idx<n; idx++)
206  {
207   slot=slotarr.At(idx);
208   pos=posarr.At(idx);
209   TObject* obj=s.GetLink(slot,pos);
210   if (obj) SetLink(obj,slot,pos); 
211  }
212 }
213 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
214 void AliSignal::Reset(Int_t mode)
215 {
216 // Reset all signal and position values and errors to 0.
217 //
218 // mode = 0 Reset position and all signal values and their errors to 0.
219 //          The waveform histograms are reset, but the calibration
220 //          constants (i.e. gains and offsets) are kept.
221 //        1 Reset position and delete the signal and error storage arrays.
222 //          Also the waveform histograms, gains and offset arrays are deleted.
223 //
224 // The default when invoking Reset() corresponds to mode=0.
225 //
226 // Note : In all cases the storage of the various links will be reset.
227 //        The UniqueID, name and title will NOT be reset.
228 //        In case the user wants to reset these attributes, this has to
229 //        be done explicitly via the SET facilities. 
230 //
231 // The usage of mode=0 allows to re-use the allocated memory for new
232 // signal (and error) values. This behaviour is preferable (i.e. faster)
233 // in case the various signals always contain the same number of values
234 // and have the same calibration constants.
235 // The usage of mode=1 is slower, but allows a more efficient memory
236 // occupation (and smaller output file size) in case the different
237 // signals have a variable number of values.
238 //
239 // For more specific actions see ResetPosition(), ResetSignals(),
240 // DeleteSignals(), ResetGain(), ResetOffset(), ResetLink(), ResetWaveform(),
241 // DeleteWaveform() and DeleteCalibrations().
242 //
243
244  if (mode<0 || mode>1)
245  {
246   cout << " *AliSignal::Reset* Invalid argument mode = " << mode << endl;
247   cout << " Default mode=0 will be used." << endl;
248   mode=0;
249  }
250
251  ResetPosition();
252  if (!mode)
253  {
254   ResetSignals();
255  }
256  else
257  {
258   DeleteSignals();
259   DeleteCalibrations();
260  }
261
262  if (fLinks) fLinks->Reset();
263  fDevice=0;
264 }
265 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
266 void AliSignal::ResetSignals(Int_t mode)
267 {
268 // Reset various signal data according to user selection.
269 //
270 // mode = 0 Reset all signal values and their errors to 0.
271 //        1 Reset only signal values
272 //        2 Reset only signal errors
273 //
274 // The default when invoking ResetSignals() corresponds to mode=0.
275 //
276 // Irrespective of the mode, the waveform histograms are reset.
277
278  if (mode<0 || mode>2)
279  {
280   cout << " *AliSignal::ResetSignals* Invalid argument mode = " << mode << endl;
281   cout << " Default mode=0 will be used." << endl;
282   mode=0;
283  }
284
285  if (fSignals && (mode==0 || mode==1))
286  {
287   for (Int_t i=0; i<fSignals->GetSize(); i++)
288   {
289    fSignals->AddAt(0,i);
290   }
291  }
292
293  if (fDsignals && (mode==0 || mode==2))
294  {
295   for (Int_t j=0; j<fDsignals->GetSize(); j++)
296   {
297    fDsignals->AddAt(0,j);
298   }
299  }
300
301  ResetWaveform(0);
302 }
303 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
304 void AliSignal::DeleteSignals(Int_t mode)
305 {
306 // Delete storage arrays of various signal data according to user selection.
307 //
308 // mode = 0 Delete arrays of both signal values and their errors.
309 //        1 Delete only signal values array
310 //        2 Delete only signal errors array
311 //
312 // The default when invoking DeleteSignals() corresponds to mode=0.
313 //
314 // Irrespective of the mode, the waveform histograms are deleted.
315
316  if (mode<0 || mode>2)
317  {
318   cout << " *AliSignal::DeleteSignals* Invalid argument mode = " << mode << endl;
319   cout << " Default mode=0 will be used." << endl;
320   mode=0;
321  }
322
323  if (fSignals && (mode==0 || mode==1))
324  {
325   delete fSignals;
326   fSignals=0;
327  }
328
329  if (fDsignals && (mode==0 || mode==2))
330  {
331   delete fDsignals;
332   fDsignals=0;
333  }
334
335  DeleteWaveform(0);
336 }
337 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
338 void AliSignal::SetSignal(Double_t sig,Int_t j)
339 {
340 // Store signal value for the j-th (default j=1) slot.
341 // Note : The first signal slot is at j=1.
342 // In case the value of the index j exceeds the maximum number of reserved
343 // slots for signal values, the number of reserved slots for the
344 // signal values is increased automatically.
345
346  if (!fSignals)
347  {
348   fSignals=new TArrayF(j);
349   ResetSignals(1);
350  }
351
352  Int_t size=fSignals->GetSize();
353
354  if (j>size)
355  {
356   fSignals->Set(j);
357  }
358
359  fSignals->AddAt(float(sig),j-1);
360 }
361 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
362 void AliSignal::SetSignal(Double_t sig,TString name)
363 {
364 // Store signal value for the name-specified slot.
365 //
366 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
367 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
368 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
369 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
370 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
371
372  Int_t j=GetSlotIndex(name);
373  if (j>0) SetSignal(sig,j);
374 }
375 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
376 void AliSignal::AddSignal(Double_t sig,Int_t j)
377 {
378 // Add value to the signal of the j-th (default j=1) slot.
379 // Note : The first signal slot is at j=1.
380 // In case the value of the index j exceeds the maximum number of reserved
381 // slots for signal values, the number of reserved slots for the
382 // signal values is increased automatically.
383
384  if (!fSignals)
385  {
386   fSignals=new TArrayF(j);
387   ResetSignals(1);
388  }
389
390  Int_t size=fSignals->GetSize();
391
392  if (j>size)
393  {
394   fSignals->Set(j);
395  }
396
397  Float_t sum=(fSignals->At(j-1))+sig;
398  fSignals->AddAt(sum,j-1);
399 }
400 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
401 void AliSignal::AddSignal(Double_t sig,TString name)
402 {
403 // Add value to the signal of the name-specified slot.
404 //
405 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
406 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
407 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
408 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
409 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
410
411  Int_t j=GetSlotIndex(name);
412  if (j>0) AddSignal(sig,j);
413 }
414 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
415 Float_t AliSignal::GetSignal(Int_t j,Int_t mode) const
416 {
417 // Provide signal value of the j-th (default j=1) slot.
418 // Note : The first signal slot is at j=1.
419 // In case no signal is present or the input argument "j" or "mode" is invalid,
420 // the value 0 is returned.
421 // The parameter "mode" allows for automatic (de)calibration of the signal
422 // (e.g. gain etc... correction or via explicit (de)calibration functions).
423 //
424 // mode = 0 : Just the j-th signal is returned.
425 //        1 : The j-th signal is corrected for the gain, offset, dead flag etc...
426 //            In case the j-th slot was marked dead, 0 is returned.
427 //            In case the gain value was not set, gain=1 will be assumed.
428 //            In case the gain value was 0, a signal value of 0 is returned.
429 //            In case the offset value was not set, offset=0 will be assumed.
430 //        2 : Same as mode=1 but gain, offset dead flag etc... are taken from
431 //            the AliDevice which owns this AliSignal object.
432 //            The corresponding AliDevice slot is obtained via matching of
433 //            the slotnames. In case this fails, the slotindex "j" of the
434 //            input argument will be used. 
435 //            In case this AliSignal object has no parent AliDevice, just
436 //            the j-th signal is returned (like with mode=0).
437 //        3 : The j-th signal is corrected using the corresponding calibration
438 //            function.
439 //            In case the j-th slot was marked dead, 0 is returned.
440 //            In case no calibration function is present, just the j-th signal
441 //            is returned (like with mode=0).
442 //        4 : Same as mode=3 but the calibration function and dead flag are
443 //            taken from the AliDevice which owns this AliSignal object.
444 //            The corresponding AliDevice slot is obtained via matching of
445 //            the slotnames. In case this fails, the slotindex "j" of the
446 //            input argument will be used. 
447 //        5 : Same as mode=2 but in case no parent AliDevice is present
448 //            an automatic switch to mode=1 will be made.
449 //        6 : Same as mode=4 but in case no parent AliDevice is present
450 //            an automatic switch to mode=3 will be made.
451 //        7 : Same as mode=3 but in case no calibration function is present
452 //            an automatic switch to mode=4 will be made.
453 //        8 : Same as mode=7 but also the corresponding dead flag of the
454 //            parent device (if any) will be checked.
455 //            If either the dead flag of the requested signal slot of this
456 //            AliSignal object or the corresponding parent device slot is
457 //            set, 0 is returned.
458 //
459 //       <0 : The corresponding de-correction or de-calibration is performed
460 //
461 // The corrected signal (sigc) is determined as follows :
462 //
463 //              sigc=(signal/gain)-offset 
464 //
465 // The de-corrected signal is determined as follows :
466 //
467 //              signal=(sigc+offset)*gain 
468 //
469 // The default is mode=0.
470
471  if (abs(mode)>8) return 0;
472
473  Int_t jcal=j;
474  Float_t sig=0;
475  Float_t gain=1;
476  Float_t offset=0;
477
478  // Get the corresponding slot index (and dead flag) of the parent device
479  Int_t pj=0;
480  Int_t pdead=0;
481  AliSignal* parent=(AliSignal*)GetDevice();
482  if ((abs(mode)==2 || abs(mode)>=4) && parent)
483  {
484    TString name=GetSlotName(j);
485    if (strlen(name.Data())) pj=parent->GetSlotIndex(name);
486    if (abs(mode)==8 && pj) pdead=parent->GetDeadValue(pj);
487  }
488  if (mode==8) mode=7;
489  if (mode==-8) mode=-7;
490
491  AliSignal* sx=(AliSignal*)this;
492
493  TF1* f=0;
494  if (mode==7)
495  {
496   f=sx->GetCalFunction(jcal);
497   if (f)
498   {
499    mode=3;
500   }
501   else
502   {
503    mode=4;
504   } 
505  }
506  if (mode==-7)
507  {
508   f=sx->GetDecalFunction(jcal);
509   if (f)
510   {
511    mode=-3;
512   }
513   else
514   {
515    mode=-4;
516   } 
517  }
518
519  if (abs(mode)==2 || abs(mode)>=4)
520  {
521   sx=(AliSignal*)GetDevice();
522   if (pj) jcal=pj;
523  }
524  if (!sx && abs(mode)>=5) sx=(AliSignal*)this;
525  if (mode==5) mode=2;
526  if (mode==-5) mode=-2;
527  if (mode==6) mode=3;
528  if (mode==-6) mode=-3;
529
530  if (fSignals)
531  {
532   if (j>0 && j<=(fSignals->GetSize()))
533   {
534    sig=fSignals->At(j-1);
535
536    if (mode==0 || !sx) return sig;
537
538    // Check for the dead flag setting
539    if (sx->GetDeadValue(jcal) || pdead) return 0;
540
541    // (De)correct the signal for the gain and offset
542    if (abs(mode)==1 || abs(mode)==2)
543    {
544     if (sx->GetGainFlag(jcal)) gain=sx->GetGain(jcal);
545     if (sx->GetOffsetFlag(jcal)) offset=sx->GetOffset(jcal);
546
547     if (fabs(gain)>0.)
548     {
549      if (mode>0) sig=(sig/gain)-offset; // Gain and offset correction
550      if (mode<0) sig=(sig+offset)*gain; // Gain and offset de-correction
551     }
552     else
553     {
554      sig=0;
555     }
556     return sig;
557    }
558
559    // (De)calibrate the signal with the corresponding (de)calibration function
560    if (abs(mode)==3 || abs(mode)==4)
561    {
562     f=sx->GetCalFunction(jcal);
563     if (mode<0) f=sx->GetDecalFunction(jcal);
564     if (f) sig=f->Eval(sig);
565     return sig;
566    }
567   }
568   else
569   {
570    cout << " *AliSignal::GetSignal* Index j = " << j << " invalid." << endl;
571   } 
572  }
573  return sig;
574 }
575 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
576 Float_t AliSignal::GetSignal(TString name,Int_t mode) const
577 {
578 // Provide signal value of the name-specified slot.
579 // In case no signal is present, 0 is returned.
580 // The parameter "mode" allows for automatic (de)calibration of the signal
581 // (e.g. gain etc... correction or via explicit (de)calibration functions).
582 // For further details about the (de)calibration modes, please refer to the
583 // corresponding slot-index based memberfunction. 
584 //
585 // The default is mode=0.
586 //
587 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
588 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
589 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
590 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
591 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
592
593  Int_t j=GetSlotIndex(name);
594  Float_t val=0;
595  if (j>0) val=GetSignal(j,mode);
596  return val;
597 }
598 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
599 void AliSignal::SetSignalError(Double_t dsig,Int_t j)
600 {
601 // Store error on the signal for the j-th (default j=1) slot.
602 // Note : The first signal slot is at j=1.
603 // In case the value of the index j exceeds the maximum number of reserved
604 // slots for signal error values, the number of reserved slots for the
605 // signal errors is increased automatically.
606
607  if (!fDsignals)
608  {
609   fDsignals=new TArrayF(j);
610   ResetSignals(2);
611  }
612
613  Int_t size=fDsignals->GetSize();
614
615  if (j>size)
616  {
617   fDsignals->Set(j);
618  }
619
620  fDsignals->AddAt(float(dsig),j-1);
621 }
622 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
623 void AliSignal::SetSignalError(Double_t dsig,TString name)
624 {
625 // Store error on the signal for the name-specified slot.
626 //
627 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
628 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
629 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
630 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
631 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
632
633  Int_t j=GetSlotIndex(name);
634  if (j>0) SetSignalError(dsig,j);
635 }
636 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
637 Float_t AliSignal::GetSignalError(Int_t j) const
638 {
639 // Provide error on the signal of the j-th (default j=1) slot.
640 // Note : The first signal slot is at j=1.
641 // In case no signal is present or the argument j is invalid, 0 is returned.
642  Float_t err=0;
643  if (fDsignals)
644  {
645   if (j>0 && j<=(fDsignals->GetSize()))
646   {
647    err=fDsignals->At(j-1);
648   }
649   else
650   {
651    cout << " *AliSignal::GetSignalError* Index j = " << j << " invalid." << endl;
652   } 
653  }
654  return err;
655 }
656 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
657 Float_t AliSignal::GetSignalError(TString name) const
658 {
659 // Provide error on the signal of the name-specified slot.
660 //
661 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
662 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
663 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
664 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
665 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
666
667  Int_t j=GetSlotIndex(name);
668  Float_t val=0;
669  if (j>0) val=GetSignalError(j);
670  return val;
671 }
672 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
673 void AliSignal::Data(TString f,TString u) const
674 {
675 // Provide all signal information within the coordinate frame f.
676 //
677 // The string argument "u" allows to choose between different angular units
678 // in case e.g. a spherical frame is selected.
679 // u = "rad" : angles provided in radians
680 //     "deg" : angles provided in degrees
681 //
682 // The defaults are f="car" and u="rad".
683
684  const char* name=GetName();
685  const char* title=GetTitle();
686
687  cout << " *" << ClassName() << "::Data* Id : " << GetUniqueID();
688  if (strlen(name))  cout << " Name : " << name;
689  if (strlen(title)) cout << " Title : " << title;
690  cout << endl;
691  cout << "   Position";
692  AliPosition::Data(f,u);
693  if (fDevice)
694  {
695   const char* devname=fDevice->GetName();
696   const char* devtitle=fDevice->GetTitle();
697   cout << "   Owned by device : " << fDevice->ClassName()
698        << " Id : " << fDevice->GetUniqueID();
699   if (strlen(devname))  cout << " Name : " << devname;
700   if (strlen(devtitle)) cout << " Title : " << devtitle;
701   cout << endl;
702  }
703
704  // Provide an overview of the stored waveforms
705  ListWaveform(-1);
706
707  // Provide an overview of all the data and attribute slots
708  List(-1);
709
710 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
711 void AliSignal::List(Int_t j) const
712 {
713 // Provide signal information for the j-th slot.
714 // The first slot is at j=1.
715 // In case j=0 (default) the data of all slots will be listed.
716 // In case j=-1 the data of all slots will be listed, but the header
717 // information will be suppressed.
718
719  if (j<-1) 
720  {
721   cout << " *AliSignal::List* Invalid argument j = " << j << endl;
722   return;
723  }
724
725  if (j != -1)
726  {
727   const char* name=GetName();
728   const char* title=GetTitle();
729
730   cout << " *" << ClassName() << "::Data* Id :" << GetUniqueID();
731   if (strlen(name))  cout << " Name : " << name;
732   if (strlen(title)) cout << " Title : " << title;
733   cout << endl;
734   if (fDevice)
735   {
736    const char* devname=fDevice->GetName();
737    const char* devtitle=fDevice->GetTitle();
738    cout << "   Owned by device : " << fDevice->ClassName();
739    if (strlen(devname))  cout << " Name : " << devname;
740    if (strlen(devtitle)) cout << " Title : " << devtitle;
741    cout << endl;
742   }
743  }
744
745  Int_t nvalues=GetNvalues();
746  Int_t nerrors=GetNerrors();
747  Int_t nlinkslots=0;
748  if (fLinks) nlinkslots=fLinks->GetMaxColumn();
749  Int_t ncalibs=GetNcalflags();
750  Int_t ncalfuncs=GetNcalfuncs();
751  Int_t ndecalfuncs=GetNdecalfuncs();
752
753  Int_t n=nvalues;
754  if (nerrors>n) n=nerrors;
755  if (nlinkslots>n) n=nlinkslots;
756  if (InheritsFrom("AliDevice"))
757  {
758   if (ncalibs>n) n=ncalibs;
759   if (ncalfuncs>n) n=ncalfuncs;
760   if (ndecalfuncs>n) n=ndecalfuncs;
761  }
762  
763  TObject* obj=0;
764  Int_t nrefs=0;
765  TArrayI posarr;
766  Int_t pos;
767
768  if (j<=0)
769  {
770   for (Int_t i=1; i<=n; i++)
771   {
772    cout << "   Slot : " << i;
773    if (i<=nvalues) cout << " Signal value : " << GetSignal(i);
774    if (i<=nerrors) cout << " error : " << GetSignalError(i);
775    AliAttrib::List(i);
776    cout << endl;
777    obj=0;
778    nrefs=GetIndices(obj,i,posarr);
779    for (Int_t k=0; k<nrefs; k++)
780    {
781     pos=posarr.At(k);
782     obj=GetLink(i,pos);
783     if (obj)
784     {
785      cout << "    Link at position " << pos << " to : " << obj->ClassName();
786      if (obj->InheritsFrom("TNamed"))
787      {
788       const char* lname=obj->GetName();
789       const char* ltitle=obj->GetTitle();
790       if (strlen(lname))  cout << " Name : " << lname;
791       if (strlen(ltitle)) cout << " Title : " << ltitle;
792      }
793      cout << endl;
794     }
795    }
796   }
797  }
798  else
799  {
800   if (j<=n)
801   {
802    cout << "   Slot : " << j;
803    if (j<=nvalues) cout << " Signal value : " << GetSignal(j);
804    if (j<=nerrors) cout << " error : " << GetSignalError(j);
805    AliAttrib::List(j);
806    cout << endl;
807    obj=0;
808    nrefs=GetIndices(obj,j,posarr);
809    for (Int_t kj=0; kj<nrefs; kj++)
810    {
811     pos=posarr.At(kj);
812     obj=GetLink(j,pos);
813     if (obj)
814     {
815      cout << "    Link at position " << pos << " to : " << obj->ClassName();
816      if (obj->InheritsFrom("TNamed"))
817      {
818       const char* lnamej=obj->GetName();
819       const char* ltitlej=obj->GetTitle();
820       if (strlen(lnamej))  cout << " Name : " << lnamej;
821       if (strlen(ltitlej)) cout << " Title : " << ltitlej;
822      }
823      cout << endl;
824     }
825    }
826   }
827  }
828
829 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
830 void AliSignal::List(TString name) const
831 {
832 // Provide signal information for the name-specified slot.
833 //
834 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
835 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
836 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
837 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
838 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
839
840  Int_t j=GetSlotIndex(name);
841  if (j>0) List(j);
842 }
843 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
844 void AliSignal::ListWaveform(Int_t j) const
845 {
846 // Provide information for the j-th waveform.
847 // The first waveform is at j=1.
848 // In case j=0 (default) the info of all waveforms will be listed.
849 // In case j=-1 the info of all waveforms will be listed, but the header
850 // information will be suppressed.
851
852  if (j<-1) 
853  {
854   cout << " *AliSignal::ListWaveform* Invalid argument j = " << j << endl;
855   return;
856  }
857
858  if (j != -1)
859  {
860   const char* name=GetName();
861   const char* title=GetTitle();
862
863   cout << " *" << ClassName() << "::Data* Id :" << GetUniqueID();
864   if (strlen(name))  cout << " Name : " << name;
865   if (strlen(title)) cout << " Title : " << title;
866   cout << endl;
867   if (fDevice)
868   {
869    const char* devname=fDevice->GetName();
870    const char* devtitle=fDevice->GetTitle();
871    cout << "   Owned by device : " << fDevice->ClassName();
872    if (strlen(devname))  cout << " Name : " << devname;
873    if (strlen(devtitle)) cout << " Title : " << devtitle;
874    cout << endl;
875   }
876  }
877
878  Int_t n=GetNwaveforms();
879  TObject* obj=0;
880
881  if (j<=0)
882  {
883   for (Int_t i=1; i<=n; i++)
884   {
885    obj=GetWaveform(i);
886    if (obj)
887    {
888     const char* wfname=obj->GetName();
889     const char* wftitle=obj->GetTitle();
890     cout << "    Waveform " << i << " : " << obj->ClassName();
891     if (strlen(wfname))  cout << " Name : " << wfname;
892     if (strlen(wftitle)) cout << " Title : " << wftitle;
893     cout << endl;
894    }
895   }
896  }
897  else
898  {
899   if (j<=n)
900   {
901    obj=GetWaveform(j);
902    if (obj)
903    {
904     const char* wfnamej=obj->GetName();
905     const char* wftitlej=obj->GetTitle();
906     cout << "    Waveform " << j << " : " << obj->ClassName();
907     if (strlen(wfnamej))  cout << " Name : " << wfnamej;
908     if (strlen(wftitlej)) cout << " Title : " << wftitlej;
909     cout << endl;
910    }
911   }
912  }
913 }
914 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
915 Int_t AliSignal::GetNvalues() const
916 {
917 // Provide the number of values for this signal.
918  Int_t n=0;
919  if (fSignals) n=fSignals->GetSize();
920  return n;
921 }
922 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
923 Int_t AliSignal::GetNerrors() const
924 {
925 // Provide the number specified errors on the values for this signal.
926  Int_t n=0;
927  if (fDsignals) n=fDsignals->GetSize();
928  return n;
929 }
930 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
931 Int_t AliSignal::GetNwaveforms() const
932 {
933 // Provide the number of specified waveforms for this signal.
934 // Actually the return value is the highest index of the stored waveforms.
935 // This allows an index dependent meaning of waveform info (e.g. waveforms
936 // with various gain values).
937 // So, when all waveforms are stored in consequetive positions (e.g. 1,2,3),
938 // this memberfunction returns 3, being both the highest filled position
939 // and the actual number of waveforms.
940 // In case only waveforms are stored at positions 1,2,5,7 this memberfunction
941 // returns a value 7 whereas only 4 actual waveforms are present.
942 // This implies that when looping over the various waveform slots, one
943 // always has to check whether the returned pointer value is non-zero
944 // (which is a good practice anyhow).
945  Int_t n=-1;
946  if (fWaveforms) n=fWaveforms->GetLast();
947  return (n+1);
948 }
949 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
950 TH1F* AliSignal::GetWaveform(Int_t j) const
951 {
952 // Provide pointer to the j-th waveform histogram.
953  TH1F* waveform=0;
954  if (j <= GetNwaveforms()) waveform=(TH1F*)fWaveforms->At(j-1);
955  return waveform;
956 }
957 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
958 TH1F* AliSignal::GetWaveform(TString name) const
959 {
960 // Provide pointer to the waveform histogram with the specified name.
961 // In case no match is found, zero is returned.
962  Int_t n=GetNwaveforms();
963  TString str;
964  for (Int_t i=1; i<=n; i++)
965  {
966   TH1F* waveform=GetWaveform(i);
967   if (waveform)
968   {
969    str=waveform->GetName();
970    if (str == name) return waveform;
971   }
972  }
973  return 0; // No match found
974 }
975 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
976 Int_t AliSignal::GetWaveformIndex(TString name) const
977 {
978 // Provide index to the waveform histogram with the specified name.
979 // In case no match is found, zero is returned.
980  Int_t n=GetNwaveforms();
981  TString str;
982  for (Int_t i=1; i<=n; i++)
983  {
984   TH1F* waveform=GetWaveform(i);
985   if (waveform)
986   {
987    str=waveform->GetName();
988    if (str == name) return i;
989   }
990  }
991  return 0; // No match found
992 }
993 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
994 void AliSignal::SetWaveform(TH1F* waveform,Int_t j)
995 {
996 // Set the 1D waveform histogram for the j-th waveform.
997 //
998 // Notes :
999 //  The first waveform position at j=1.
1000 //  j=1 is the default value.
1001 //
1002 // In case the value of the index j exceeds the maximum number of reserved
1003 // positions for the waveforms, the number of reserved positions for the waveforms
1004 // is increased automatically.
1005 //
1006 // In case the histo pointer argument has the same value as the current waveform
1007 // histogram pointer value, no action is taken since the user has already
1008 // modified the actual histogram.
1009 //
1010 // In case the histo pointer argument is zero, the current waveform histogram
1011 // is deleted and the pointer set to zero.
1012 //
1013 // In all other cases the current waveform histogram is deleted and a new
1014 // copy of the input histogram is created which becomes the current waveform
1015 // histogram.
1016
1017  if (j<1) return;
1018
1019  if (!fWaveforms)
1020  {
1021   fWaveforms=new TObjArray(j);
1022   fWaveforms->SetOwner();
1023  }
1024
1025  if (j > fWaveforms->GetSize()) fWaveforms->Expand(j);
1026
1027  TH1F* hcur=(TH1F*)fWaveforms->At(j-1);
1028  if (waveform != hcur)
1029  {
1030   if (hcur)
1031   {
1032    fWaveforms->Remove(hcur);
1033    delete hcur;
1034    hcur=0;
1035   }
1036   if (waveform)
1037   {
1038    hcur=new TH1F(*waveform);
1039    fWaveforms->AddAt(hcur,j-1);
1040   }
1041  } 
1042 }
1043 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1044 void AliSignal::ResetWaveform(Int_t j)
1045 {
1046 // Reset the histogram of the j-th (default j=1) waveform.
1047 // This memberfunction invokes TH1F::Reset() for the corresponding waveform(s).
1048 // To actually delete the histograms from memory, use DeleteWaveform().
1049 // Notes : The first position is at j=1.
1050 //         j=0 ==> All waveforms will be reset.
1051  
1052  if (!fWaveforms) return;
1053
1054  Int_t size=fWaveforms->GetSize();
1055
1056  if ((j>=0) && (j<=size))
1057  {
1058   if (j)
1059   {
1060    TH1F* hwave=(TH1F*)fWaveforms->At(j-1);
1061    if (hwave) hwave->Reset();
1062   }
1063   else
1064   {
1065    for (Int_t i=0; i<size; i++)
1066    {
1067     TH1F* hwave=(TH1F*)fWaveforms->At(i);
1068     if (hwave) hwave->Reset();
1069    }
1070   }
1071  }
1072  else
1073  {
1074   cout << " *AliSignal::ResetWaveform* Index j = " << j << " invalid." << endl;
1075   return;
1076  }
1077 }
1078 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1079 void AliSignal::ResetWaveform(TString name)
1080 {
1081 // Reset the waveform with the specified name.
1082  Int_t j=GetWaveformIndex(name);
1083  if (j>0) ResetWaveform(j);
1084 }
1085 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1086 void AliSignal::DeleteWaveform(Int_t j)
1087 {
1088 // Delete the histogram of the j-th (default j=1) waveform.
1089 // Notes : The first position is at j=1.
1090 //         j=0 ==> All waveforms will be deleted.
1091  
1092  if (!fWaveforms) return;
1093
1094  Int_t size=fWaveforms->GetSize();
1095
1096  if ((j>=0) && (j<=size))
1097  {
1098   if (j)
1099   {
1100    TH1F* hwave=(TH1F*)fWaveforms->At(j-1);
1101    if (hwave)
1102    {
1103     fWaveforms->Remove(hwave);
1104     delete hwave;
1105    }
1106   }
1107   else
1108   {
1109    delete fWaveforms;
1110    fWaveforms=0;
1111   }
1112  }
1113  else
1114  {
1115   cout << " *AliSignal::DeleteWaveform* Index j = " << j << " invalid." << endl;
1116   return;
1117  }
1118 }
1119 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1120 void AliSignal::DeleteWaveform(TString name)
1121 {
1122 // Delete the waveform with the specified name.
1123  Int_t j=GetWaveformIndex(name);
1124  if (j>0) DeleteWaveform(j);
1125 }
1126 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1127 Int_t AliSignal::GetNlinks(TObject* obj,Int_t j) const
1128 {
1129 // Provide the number of links to the specified object for the j-th slot.
1130 // If j=0 (default) all slots will be scanned for the specified object.
1131 // If obj=0 (default) all encountered objects for the specified slot will be counted.
1132 // So, invokation of the default GetNlinks() will return the total number of
1133 // all references to all sorts of stored objects.
1134  if (j<0)
1135  {
1136   cout << " *AliSignal::GetNlinks* Index j = " << j << " invalid." << endl;
1137   return 0;
1138  }
1139
1140  Int_t n=0;
1141  if (!j)
1142  {
1143   if (fLinks) n=fLinks->GetNrefs(obj);
1144  }
1145  else
1146  {
1147   TArrayI posarr;
1148   n=GetIndices(obj,j,posarr);
1149  }
1150  return n;
1151 }
1152 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1153 Int_t AliSignal::GetNlinks(TObject* obj,TString name) const
1154 {
1155 // Provide the number of links to the specified object for the name-spec. slot.
1156 // If obj=0 all encountered objects for the specified slot will be counted.
1157 //
1158 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
1159 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
1160 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
1161 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
1162 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
1163
1164  Int_t j=GetSlotIndex(name);
1165  Int_t n=0;
1166  if (j>0) n=GetNlinks(obj,j);
1167  return n;
1168 }
1169 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1170 TObject* AliSignal::GetLink(Int_t j,Int_t k) const
1171 {
1172 // Provide pointer of the object linked to the j-th slot at position k.
1173
1174  TObject* obj=0;
1175  // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
1176  if (fLinks) obj=fLinks->GetObject(k,j);
1177  return obj;
1178 }
1179 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1180 TObject* AliSignal::GetLink(TString name,Int_t k) const
1181 {
1182 // Provide pointer of the object linked to the name-spec. slot at position k.
1183 //
1184 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
1185 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
1186 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
1187 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
1188 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
1189
1190  Int_t j=GetSlotIndex(name);
1191  TObject* obj=0;
1192  if (j>0) obj=GetLink(j,k);
1193  return obj;
1194 }
1195 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1196 void AliSignal::SetLink(TObject* obj,Int_t j,Int_t k)
1197 {
1198 // Introduce a link (=pointer) to an object for the j-th slot at position k.
1199 // Only the pointer values are stored for (backward) reference, meaning
1200 // that the objects of which the pointers are stored are NOT owned
1201 // by the AliSignal object.
1202 //
1203 // Notes :
1204 //  The first slot is at j=1 and the first position is at k=1.
1205 //  j=1 and k=1 are the default values.
1206 //
1207 // If needed, the storage area for the links is increased automatically.
1208 //
1209 // In case the pointer argument is zero, indeed a value of zero will be
1210 // stored at the specified position (k) for the specified slot (j).
1211 //
1212 // In principle any object derived from TObject can be referred to by this
1213 // mechanism.
1214 // However, this "linking back" facility was introduced to enable AliSignal slots
1215 // to refer directly to the various AliTracks to which the AliSignal object itself
1216 // is related (see AliTrack::AddSignal).
1217 // Therefore, in case the input argument "obj" points to an AliTrack (or derived)
1218 // object, the current signal is automatically related to this AliTrack
1219 // (or derived) object.
1220 // 
1221 // Please also have a look at the docs of the memberfunction ResetLink()
1222 // to prevent the situation of stored pointers to non-existent object. 
1223
1224  if (!fLinks && obj) fLinks=new AliObjMatrix();
1225
1226  if (!fLinks) return;
1227
1228  // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
1229  fLinks->EnterObject(k,j,obj);
1230  if (obj) 
1231  {
1232   if (obj->InheritsFrom("AliTrack"))
1233   {
1234    AliTrack* t=(AliTrack*)obj;
1235    t->AddSignal(*this);
1236   }
1237  }
1238 }
1239 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1240 void AliSignal::SetLink(TObject* obj,TString name,Int_t k)
1241 {
1242 // Introduce a link (=pointer) to an object for the name-spec. slot at position k.
1243 // Only the pointer values are stored for (backward) reference, meaning
1244 // that the objects of which the pointers are stored are NOT owned
1245 // by the AliSignal object.
1246 //
1247 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
1248 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
1249 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
1250 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
1251 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
1252
1253  Int_t j=GetSlotIndex(name);
1254  if (j>0) SetLink(obj,j,k);
1255 }
1256 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1257 void AliSignal::AddLink(TObject* obj,Int_t j)
1258 {
1259 // Introduce a link (=pointer) to an object for the j-th slot at the first
1260 // free position.
1261 // Only the pointer values are stored for (backward) reference, meaning
1262 // that the objects of which the pointers are stored are NOT owned
1263 // by the AliSignal object.
1264 //
1265 // Notes :
1266 //  The first slot is at j=1 and the first position is at k=1.
1267 //  j=1 is the default value.
1268 //
1269 // If needed, the storage area for the links is increased automatically.
1270 //
1271 // In case the pointer argument is zero, no link will be added.
1272 //
1273 // In principle any object derived from TObject can be referred to by this
1274 // mechanism.
1275 // However, this "linking back" facility was introduced to enable AliSignal slots
1276 // to refer directly to the various AliTracks to which the AliSignal object itself
1277 // is related (see AliTrack::AddSignal).
1278 // Therefore, in case the input argument "obj" points to an AliTrack (or derived)
1279 // object, the current signal is automatically related to this AliTrack
1280 // (or derived) object.
1281 // 
1282 // Please also have a look at the docs of the memberfunction ResetLink()
1283 // to prevent the situation of stored pointers to non-existent object. 
1284
1285  if (!obj || j<=0) return;
1286
1287  if (!fLinks) fLinks=new AliObjMatrix();
1288
1289  TObject* dum=0;
1290  Int_t n=GetNlinks(dum,j);
1291  Int_t pos=1;
1292  for (Int_t k=1; k<=n; k++)
1293  {
1294   dum=GetLink(j,k);
1295   if (!dum) break;
1296   pos++;
1297  }
1298
1299  SetLink(obj,j,pos);
1300 }
1301 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1302 void AliSignal::AddLink(TObject* obj,TString name)
1303 {
1304 // Introduce a link (=pointer) to an object for the name-spec slot at the first
1305 // free position.
1306 // Only the pointer values are stored for (backward) reference, meaning
1307 // that the objects of which the pointers are stored are NOT owned
1308 // by the AliSignal object.
1309 //
1310 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
1311 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
1312 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
1313 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
1314 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
1315
1316  Int_t j=GetSlotIndex(name);
1317  if (j>0) AddLink(obj,j);
1318 }
1319 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1320 void AliSignal::ResetLink(Int_t j,Int_t k)
1321 {
1322 // Reset the link of the j-th slot at position k.
1323 //
1324 // Notes :
1325 //  The first slot is at j=1 and the first position is at k=1.
1326 //  j=1 and k=1 are the default values.
1327 //
1328 //  This memberfunction is intended to reset only 1 specified link location.
1329 //  For extended functionality, please refer to the memberfuction ResetLinks().
1330 //
1331 // In general the user should take care of properly clearing the corresponding
1332 // pointer here when the referred object is deleted.
1333 // However, this "linking back" facility was introduced to enable AliSignal slots
1334 // to refer directly to the various AliTracks to which the AliSignal object itself
1335 // is related (see AliTrack::AddSignal).
1336 // As such, the AliTrack destructor already takes care of clearing the corresponding
1337 // links from the various AliSignal slots for all the AliSignal objects that were
1338 // related to that AliTrack. 
1339 // So, in case the link introduced via SetLink() is the pointer of an AliTrack object,
1340 // the user doesn't have to worry about clearing the corresponding AliTrack link from
1341 // the AliSignal object when the corresponding AliTrack object is deleted.
1342  
1343  // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
1344  if (fLinks) fLinks->RemoveObject(k,j);
1345 }
1346 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1347 void AliSignal::ResetLink(TString name,Int_t k)
1348 {
1349 // Reset the link of the name-specified slot at position k.
1350 //
1351 // This memberfunction is intended to reset only 1 specified link location.
1352 // For extended functionality, please refer to the memberfuction ResetLinks().
1353 //
1354 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
1355 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
1356 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
1357 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
1358 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
1359
1360  Int_t j=GetSlotIndex(name);
1361  if (j>0) ResetLink(j,k);
1362 }
1363 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1364 void AliSignal::ResetLinks(TObject* obj,Int_t j,Int_t k)
1365 {
1366 // Reset single or multiple link(s) according to user specified selections.
1367 //
1368 // A link is only reset if the stored reference matches the argument "obj".
1369 // In case obj=0 no check on the matching of the stored reference is performed
1370 // and the stored link is always reset in accordance with the other
1371 // selection criteria.
1372 //
1373 // In case the slot argument "j" is specified, only the links from that
1374 // specified slot will be deleted.
1375 // In case j=0 (default) no checking on the slot index is performed.
1376 //
1377 // In case the position argument "k" is specified, only the links from that
1378 // specified position will be deleted.
1379 // In case k=0 (default) no checking on the position index is performed.
1380 //
1381 // So, invokation of ResetLinks(obj) will remove all references to the
1382 // object "obj" from the total AliSignal, whereas ResetLinks(obj,j)
1383 // will remove all references to the object "obj" only from slot "j".
1384 //
1385 // Notes :
1386 // -------
1387 // The first slot is indicated as j=1, whereas the first position is at k=1.
1388 //
1389 // Invokation of ResetLinks(0,row,col) is equivalent to invoking the
1390 // memberfunction ResetLink(row,col).
1391 // Invoking the latter directly is slightly faster.
1392 //
1393 // Invokation of ResetLinks(0) will reset all stored references in this AliSignal.
1394 //
1395 // In general the user should take care of properly clearing the corresponding
1396 // pointer here when the referred object is deleted.
1397 // However, this "linking back" facility was introduced to enable AliSignal slots
1398 // to refer directly to the various AliTracks to which the AliSignal object itself
1399 // is related (see AliTrack::AddSignal).
1400 // As such, the AliTrack destructor already takes care of clearing the corresponding
1401 // links from the various AliSignal slots for all the AliSignal objects that were
1402 // related to that AliTrack. 
1403 // So, in case the link introduced via SetLink() is the pointer of an AliTrack object,
1404 // the user doesn't have to worry about clearing the corresponding AliTrack link from
1405 // the AliSignal object when the corresponding AliTrack object is deleted.
1406  
1407  if (!fLinks) return;
1408
1409  if (!obj && !j && !k)
1410  {
1411   fLinks->Reset();
1412  }
1413  else
1414  {
1415   // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
1416   fLinks->RemoveObjects(obj,k,j);
1417  }
1418 }
1419 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1420 void AliSignal::ResetLinks(TObject* obj,TString name,Int_t k)
1421 {
1422 // Reset single or multiple link(s) according to user specified selections.
1423 //
1424 // A link is only reset if the stored reference matches the argument "obj".
1425 // In case obj=0 no check on the matching of the stored reference is performed
1426 // and the stored link is always reset in accordance with the other
1427 // selection criteria.
1428 //
1429 // In case the position argument "k" is specified, only the links from that
1430 // specified position will be deleted.
1431 // In case k=0 (default) no checking on the position index is performed.
1432 //
1433 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
1434 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
1435 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
1436 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
1437 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
1438
1439  Int_t j=GetSlotIndex(name);
1440  if (j>0) ResetLinks(obj,j,k);
1441 }
1442 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1443 Int_t AliSignal::GetIndices(TObject* obj,TArrayI& js,TArrayI& ks) const
1444 {
1445 // Provide the slot and position indices of all the storage locations
1446 // of the specified object.
1447 // The slot (j) and pos. (k) indices are returned in the two separate TArrayI arrays
1448 // from which the (j,k) pairs can be obtained from the corresponding
1449 // array indices like (j,k)=(js.At(i),ks.At(i)).
1450 // The integer return argument represents the number of (j,k) pairs which
1451 // were encountered for the specified object.
1452 //
1453 // If obj=0 no object selection is performed and all (j,k) indices
1454 // of the stored references for all objects are returned.
1455 //
1456 // Notes :
1457 // -------
1458 // As usual the convention is that slot and position numbering starts at 1.
1459 // 
1460 // This memberfunction always resets the two TArrayI arrays at the start.
1461 //
1462 // This memberfunction can only be used to obtain the (j,k) indices
1463 // of the object as stored via the SetLink() or AddLink() memberfunction.
1464 // This means that in case the user has entered a TObjArray as object
1465 // (to increase the dimension of the resulting structure), the (j,k)
1466 // indices of that TObjArray are obtained and NOT the indices of the
1467 // actual objects contained in that TObjArray structure.
1468 //
1469  Int_t nrefs=0;
1470  js.Reset();
1471  ks.Reset();
1472  // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
1473  if (fLinks) nrefs=fLinks->GetIndices(obj,ks,js);
1474  return nrefs;
1475 }
1476 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1477 Int_t AliSignal::GetIndices(TObject* obj,Int_t j,TArrayI& ks) const
1478 {
1479 // Provide the position indices of all the storage locations of the
1480 // specified object in the j-th slot of this AliSignal.
1481 // The position indices are returned in the TArrayI array.
1482 // The integer return argument represents the number of storage locations which
1483 // were encountered for the specified object in the j-th slot.
1484 //
1485 // If obj=0 no object selection is performed and all position indices
1486 // of the stored references for all objects of the j-th slot are returned.
1487 //
1488 // If j=0 all slots will be scanned and all position indices matching the
1489 // object selection are returned.
1490 // Note that in this case multiple appearances of the same position index
1491 // will only be recorded once in the returned TArrayI array.
1492 //
1493 // Notes :
1494 // -------
1495 // As usual the convention is that slot and position numbering starts at 1.
1496 // 
1497 // This memberfunction always resets the TArrayI array at the start.
1498 //
1499 // This memberfunction can only be used to obtain the position indices
1500 // of the object as stored via the SetLink() or AddLink() memberfunction.
1501 // This means that in case the user has entered a TObjArray as object
1502 // (to increase the dimension of the resulting structure), the position
1503 // indices of that TObjArray are obtained and NOT the indices of the
1504 // actual objects contained in that TObjArray structure.
1505 //
1506  Int_t nrefs=0;
1507  ks.Reset();
1508  // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
1509  if (fLinks) nrefs=fLinks->GetIndices(obj,ks,j);
1510  return nrefs;
1511 }
1512 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1513 Int_t AliSignal::GetIndices(TObject* obj,TString name,TArrayI& ks) const
1514 {
1515 // Provide the position indices of all the storage locations of the
1516 // specified object in the name-specified slot of this AliSignal.
1517 // The position indices are returned in the TArrayI array.
1518 // The integer return argument represents the number of storage locations which
1519 // were encountered for the specified object in the j-th slot.
1520 //
1521 // If obj=0 no object selection is performed and all position indices
1522 // of the stored references for all objects of the j-th slot are returned.
1523 //
1524 // This procedure involves a slot-index search based on the specified name
1525 // at each invokation. This may become slow in case many slots have been
1526 // defined and/or when this procedure is invoked many times.
1527 // In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
1528 // either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
1529
1530  Int_t j=GetSlotIndex(name);
1531  Int_t n=0;
1532  if (j>0) n=GetIndices(obj,j,ks);
1533  return n;
1534 }
1535 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1536 Int_t AliSignal::GetIndices(TObject* obj,TArrayI& js,Int_t k) const
1537 {
1538 // Provide the slot indices of all the storage locations of the
1539 // specified object for the k-th position in this AliSignal.
1540 // The slot indices are returned in the TArrayI array.
1541 // The integer return argument represents the number of storage locations which
1542 // were encountered for the specified object in the k-th position.
1543 //
1544 // If obj=0 no object selection is performed and all slot indices
1545 // of the stored references for all objects in the k-th position are returned.
1546 //
1547 // If k=0 all positions will be scanned and all slot indices matching the
1548 // object selection are returned.
1549 // Note that in this case multiple appearances of the same slot index
1550 // will only be recorded once in the returned TArrayI array.
1551 //
1552 // Notes :
1553 // -------
1554 // As usual the convention is that slot and position numbering starts at 1.
1555 // 
1556 // This memberfunction always resets the TArrayI array at the start.
1557 //
1558 // This memberfunction can only be used to obtain the slot indices
1559 // of the object as stored via the SetLink() or AddLink() memberfunction.
1560 // This means that in case the user has entered a TObjArray as object
1561 // (to increase the dimension of the resulting structure), the slot
1562 // indices of that TObjArray are obtained and NOT the indices of the
1563 // actual objects contained in that TObjArray structure.
1564 //
1565  Int_t nrefs=0;
1566  js.Reset();
1567  // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
1568  if (fLinks) nrefs=fLinks->GetIndices(obj,k,js);
1569  return nrefs;
1570 }
1571 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1572 void AliSignal::SetSwapMode(Int_t swap)
1573 {
1574 // Set swapmode flag for the internal link storage.
1575 // In case for the stored links the maximum slot number differs considerably
1576 // from the maximum position number, it might be more efficient
1577 // (w.r.t. memory usage and/or output file size) to internally store the
1578 // link reference matrix with the rows and colums swapped.
1579 // This swapping is only related with the internal storage and as such
1580 // is completely hidden for the user.
1581 // At invokation of this memberfunction the default argument is swap=1.
1582 //
1583 // Note : The swap mode can only be set as long as no links are
1584 //        stored in the AliSignal (i.e. a new instance of AliSignal
1585 //        or after invokation of the Reset() or ResetLinks() function).
1586  
1587  if (!fLinks) fLinks=new AliObjMatrix();
1588  fLinks->SetSwapMode(swap);
1589 }
1590 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1591 Int_t AliSignal::GetSwapMode() const
1592 {
1593 // Provide swapmode flag of the link storage.
1594  Int_t swap=0; 
1595  if (fLinks) swap=fLinks->GetSwapMode();
1596  return swap;
1597 }
1598 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1599 void AliSignal::SetDevice(TObject* dev)
1600 {
1601 // Store the pointer to the device which owns this AliSignal object.
1602 // This memberfunction is meant for internal use in AliDevice.
1603  fDevice=dev;
1604 }
1605 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1606 AliDevice* AliSignal::GetDevice() const
1607 {
1608 // Provide the pointer to the device which owns this AliSignal object.
1609  return (AliDevice*)fDevice;
1610 }
1611 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1612 TObject* AliSignal::Clone(const char* name) const
1613 {
1614 // Make a deep copy of the current object and provide the pointer to the copy.
1615 // This memberfunction enables automatic creation of new objects of the
1616 // correct type depending on the object type, a feature which may be very useful
1617 // for containers when adding objects in case the container owns the objects.
1618 // This feature allows e.g. AliTrack to store either AliSignal objects or
1619 // objects derived from AliSignal via the AddSignal memberfunction, provided
1620 // these derived classes also have a proper Clone memberfunction. 
1621
1622  AliSignal* sig=new AliSignal(*this);
1623  if (name)
1624  {
1625   if (strlen(name)) sig->SetName(name);
1626  }
1627  return sig;
1628 }
1629 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////