STEER/AliMC.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 // This class is extracted from the AliRun class
  19 // and contains all the MC-related functionality
  20 // The number of dependencies has to be reduced...
  21 // Author: F.Carminati
  22 //         Federico.Carminati@cern.ch
  23
  24 #include <RVersion.h>
  25 #include <TBrowser.h>
  26 #include <TStopwatch.h>
  27 #include <TSystem.h>
  28 #include <TVirtualMC.h>
  29 #include <TGeoManager.h>
  30 #include "TGeant3.h"
  31
  32
  33 #include "AliLog.h"
  34 #include "AliDetector.h"
  35 #include "AliGenerator.h"
  36 #include "AliHeader.h"
  37 #include "AliLego.h"
  38 #include "AliMC.h"
  39 #include "AliMCQA.h"
  40 #include "AliRun.h"
  41 #include "AliStack.h"
  42 #include "AliMagF.h"
  43 #include "AliTrackReference.h"
  44
  45
  46 ClassImp(AliMC)
  47
  48 //_______________________________________________________________________
  49 AliMC::AliMC() :
  50   fGenerator(0),
  51   fEventEnergy(0),
  52   fSummEnergy(0),
  53   fSum2Energy(0),
  54   fTrRmax(1.e10),
  55   fTrZmax(1.e10),
  56   fRDecayMax(1.e10),
  57   fRDecayMin(0),
  58   fDecayPdg(0),
  59   fImedia(0),
  60   fTransParName("\0"),
  61   fMCQA(0),
  62   fHitLists(0),
  63   fTrackReferences(0)
  64
  65 {
  66   //default constructor
  67   DecayLimits();
  68 }
  69
  70 //_______________________________________________________________________
  71 AliMC::AliMC(const char *name, const char *title) :
  72   TVirtualMCApplication(name, title),
  73   fGenerator(0),
  74   fEventEnergy(0),
  75   fSummEnergy(0),
  76   fSum2Energy(0),
  77   fTrRmax(1.e10),
  78   fTrZmax(1.e10),
  79   fRDecayMax(1.e10),
  80   fRDecayMin(0),
  81   fDecayPdg(0),
  82   fImedia(new TArrayI(1000)),
  83   fTransParName("\0"),
  84   fMCQA(0),
  85   fHitLists(new TList()),
  86   fTrackReferences(new TClonesArray("AliTrackReference", 100))
  87 {
  88   //constructor
  89   // Set transport parameters
  90   SetTransPar();
  91   DecayLimits();
  92   // Prepare the tracking medium lists
  93   for(Int_t i=0;i<1000;i++) (*fImedia)[i]=-99;
  94 }
  95
  96 //_______________________________________________________________________
  97 AliMC::AliMC(const AliMC &mc) :
  98   TVirtualMCApplication(mc),
  99   fGenerator(0),
 100   fEventEnergy(0),
 101   fSummEnergy(0),
 102   fSum2Energy(0),
 103   fTrRmax(1.e10),
 104   fTrZmax(1.e10),
 105   fRDecayMax(1.e10),
 106   fRDecayMin(0),
 107   fDecayPdg(0),
 108   fImedia(0),
 109   fTransParName("\0"),
 110   fMCQA(0),
 111   fHitLists(0),
 112   fTrackReferences(0)
 113 {
 114   //
 115   // Copy constructor for AliMC
 116   //
 117   mc.Copy(*this);
 118 }
 119
 120 //_______________________________________________________________________
 121 AliMC::~AliMC()
 122 {
 123   //destructor
 124   delete fGenerator;
 125   delete fImedia;
 126   delete fMCQA;
 127   delete fHitLists;
 128   // Delete track references
 129   if (fTrackReferences) {
 130     fTrackReferences->Delete();
 131     delete fTrackReferences;
 132     fTrackReferences     = 0;
 133   }
 134
 135 }
 136
 137 //_______________________________________________________________________
 138 void AliMC::Copy(TObject &) const
 139 {
 140   //dummy Copy function
 141   AliFatal("Not implemented!");
 142 }
 143
 144 //_______________________________________________________________________
 145 void  AliMC::ConstructGeometry()
 146 {
 147   //
 148   // Either load geometry from file or create it through usual
 149   // loop on detectors. In the first case the method
 150   // AliModule::CreateMaterials() only builds fIdtmed and is postponed
 151   // at InitGeometry().
 152   //
 153
 154   if(gAlice->IsRootGeometry()){
 155     // Load geometry
 156     const char *geomfilename = gAlice->GetGeometryFileName();
 157     if(gSystem->ExpandPathName(geomfilename)){
 158       AliInfo(Form("Loading geometry from file:\n %40s\n\n",geomfilename));
 159       TGeoManager::Import(geomfilename);
 160     }else{
 161       AliInfo(Form("Geometry file %40s not found!\n",geomfilename));
 162       return;
 163     }
 164   }else{
 165     // Create modules, materials, geometry
 166     TStopwatch stw;
 167     TIter next(gAlice->Modules());
 168     AliModule *detector;
 169     AliDebug(1, "Geometry creation:");
 170     while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 171       stw.Start();
 172       // Initialise detector materials and geometry
 173       detector->CreateMaterials();
 174       detector->CreateGeometry();
 175       AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 176                    detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 177     }
 178   }
 179
 180 }
 181
 182 //_______________________________________________________________________
 183 void  AliMC::InitGeometry()
 184 {
 185   //
 186   // Initialize detectors and display geometry
 187   //
 188
 189   AliInfo("Initialisation:");
 190   TStopwatch stw;
 191   TIter next(gAlice->Modules());
 192   AliModule *detector;
 193   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 194     stw.Start();
 195     // Initialise detector and display geometry
 196     if(gAlice->IsRootGeometry()) detector->CreateMaterials();
 197     detector->Init();
 198     detector->BuildGeometry();
 199     AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 200                  detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 201   }
 202
 203 }
 204
 205 //_______________________________________________________________________
 206 void  AliMC::GeneratePrimaries()
 207 {
 208   //
 209   // Generate primary particles and fill them in the stack.
 210   //
 211
 212   Generator()->Generate();
 213 }
 214
 215 //_______________________________________________________________________
 216 void AliMC::SetGenerator(AliGenerator *generator)
 217 {
 218   //
 219   // Load the event generator
 220   //
 221   if(!fGenerator) fGenerator = generator;
 222 }
 223
 224 //_______________________________________________________________________
 225 void AliMC::ResetGenerator(AliGenerator *generator)
 226 {
 227   //
 228   // Load the event generator
 229   //
 230   if(fGenerator)
 231     if(generator)
 232       AliWarning(Form("Replacing generator %s with %s",
 233                       fGenerator->GetName(),generator->GetName()))
 234     else
 235       AliWarning(Form("Replacing generator %s with NULL",
 236                       fGenerator->GetName()));
 237   fGenerator = generator;
 238 }
 239
 240 //_______________________________________________________________________
 241 void AliMC::FinishRun()
 242 {
 243   // Clean generator information
 244   AliDebug(1, "fGenerator->FinishRun()");
 245   fGenerator->FinishRun();
 246
 247   //Output energy summary tables
 248   AliDebug(1, "EnergySummary()");
 249   ToAliDebug(1, EnergySummary());
 250 }
 251
 252 //_______________________________________________________________________
 253 void AliMC::BeginPrimary()
 254 {
 255   //
 256   // Called  at the beginning of each primary track
 257   //
 258
 259   // Reset Hits info
 260   ResetHits();
 261   ResetTrackReferences();
 262
 263 }
 264
 265 //_______________________________________________________________________
 266 void AliMC::PreTrack()
 267 {
 268   // Actions before the track's transport
 269      TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 270      AliModule *module;
 271
 272      for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 273        if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 274          module->PreTrack();
 275
 276      fMCQA->PreTrack();
 277 }
 278
 279 //_______________________________________________________________________
 280 void AliMC::Stepping()
 281 {
 282   //
 283   // Called at every step during transport
 284   //
 285
 286   Int_t id = DetFromMate(gMC->GetMedium());
 287   if (id < 0) return;
 288
 289
 290   if ( gMC->IsNewTrack()            &&
 291        gMC->TrackTime() == 0.       &&
 292        fRDecayMin > 0.              &&
 293        fRDecayMax > fRDecayMin      &&
 294        gMC->TrackPid() == fDecayPdg )
 295   {
 296       FixParticleDecaytime();
 297   }
 298
 299
 300
 301   //
 302   // --- If lego option, do it and leave
 303   if (gAlice->Lego())
 304     gAlice->Lego()->StepManager();
 305   else {
 306     Int_t copy;
 307     //Update energy deposition tables
 308     AddEnergyDeposit(gMC->CurrentVolID(copy),gMC->Edep());
 309     //
 310     // write tracke reference for track which is dissapearing - MI
 311     if (gMC->IsTrackDisappeared()) {
 312         if (gMC->Etot()>0.05) AddTrackReference(GetCurrentTrackNumber());
 313     }
 314
 315     //Call the appropriate stepping routine;
 316     AliModule *det = dynamic_cast<AliModule*>(gAlice->Modules()->At(id));
 317     if(det && det->StepManagerIsEnabled()) {
 318       fMCQA->StepManager(id);
 319       det->StepManager();
 320     }
 321   }
 322 }
 323
 324 //_______________________________________________________________________
 325 void AliMC::EnergySummary()
 326 {
 327   //
 328   // Print summary of deposited energy
 329   //
 330
 331   Int_t ndep=0;
 332   Float_t edtot=0;
 333   Float_t ed, ed2;
 334   Int_t kn, i, left, j, id;
 335   const Float_t kzero=0;
 336   Int_t ievent=gAlice->GetRunLoader()->GetHeader()->GetEvent()+1;
 337   //
 338   // Energy loss information
 339   if(ievent) {
 340     printf("***************** Energy Loss Information per event (GEV) *****************\n");
 341     for(kn=1;kn<fEventEnergy.GetSize();kn++) {
 342       ed=fSummEnergy[kn];
 343       if(ed>0) {
 344         fEventEnergy[ndep]=kn;
 345         if(ievent>1) {
 346           ed=ed/ievent;
 347           ed2=fSum2Energy[kn];
 348           ed2=ed2/ievent;
 349           ed2=100*TMath::Sqrt(TMath::Max(ed2-ed*ed,kzero))/ed;
 350         } else
 351           ed2=99;
 352         fSummEnergy[ndep]=ed;
 353         fSum2Energy[ndep]=TMath::Min(static_cast<Float_t>(99.),TMath::Max(ed2,kzero));
 354         edtot+=ed;
 355         ndep++;
 356       }
 357     }
 358     for(kn=0;kn<(ndep-1)/3+1;kn++) {
 359       left=ndep-kn*3;
 360       for(i=0;i<(3<left?3:left);i++) {
 361         j=kn*3+i;
 362         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 363         printf(" %s %10.3f +- %10.3f%%;",gMC->VolName(id),fSummEnergy[j],fSum2Energy[j]);
 364       }
 365       printf("\n");
 366     }
 367     //
 368     // Relative energy loss in different detectors
 369     printf("******************** Relative Energy Loss per event ********************\n");
 370     printf("Total energy loss per event %10.3f GeV\n",edtot);
 371     for(kn=0;kn<(ndep-1)/5+1;kn++) {
 372       left=ndep-kn*5;
 373       for(i=0;i<(5<left?5:left);i++) {
 374         j=kn*5+i;
 375         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 376         printf(" %s %10.3f%%;",gMC->VolName(id),100*fSummEnergy[j]/edtot);
 377       }
 378       printf("\n");
 379     }
 380     for(kn=0;kn<75;kn++) printf("*");
 381     printf("\n");
 382   }
 383   //
 384   // Reset the TArray's
 385   //  fEventEnergy.Set(0);
 386   //  fSummEnergy.Set(0);
 387   //  fSum2Energy.Set(0);
 388 }
 389
 390 //_____________________________________________________________________________
 391 void AliMC::BeginEvent()
 392 {
 393   //
 394   // Clean-up previous event
 395   // Energy scores
 396   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 397   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 398   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 399   AliDebug(1, "          BEGINNING EVENT               ");
 400   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 401   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 402   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 403
 404     AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 405
 406   /*******************************/
 407   /*   Clean after eventual      */
 408   /*   previous event            */
 409   /*******************************/
 410
 411
 412   //Set the next event in Run Loader -> Cleans trees (TreeK and all trees in detectors),
 413   gAlice->SetEventNrInRun(gAlice->GetEventNrInRun()+1);
 414   runloader->SetEventNumber(gAlice->GetEventNrInRun());// sets new files, cleans the previous event stuff, if necessary, etc.,
 415   AliDebug(1, Form("EventNr is %d",gAlice->GetEventNrInRun()));
 416
 417   fEventEnergy.Reset();
 418     // Clean detector information
 419
 420   if (runloader->Stack())
 421     runloader->Stack()->Reset();//clean stack -> tree is unloaded
 422   else
 423     runloader->MakeStack();//or make a new one
 424
 425   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 426    {
 427      AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(K)");
 428      runloader->MakeTree("K");
 429    }
 430
 431   AliDebug(1, "gMC->SetStack(fRunLoader->Stack())");
 432   gMC->SetStack(gAlice->GetRunLoader()->Stack());//Was in InitMC - but was moved here
 433                                      //because we don't have guarantee that
 434                                      //stack pointer is not going to change from event to event
 435                          //since it bellobgs to header and is obtained via RunLoader
 436   //
 437   //  Reset all Detectors & kinematics & make/reset trees
 438   //
 439
 440   runloader->GetHeader()->Reset(gAlice->GetRunNumber(),gAlice->GetEvNumber(),
 441     gAlice->GetEventNrInRun());
 442 //  fRunLoader->WriteKinematics("OVERWRITE");  is there any reason to rewrite here since MakeTree does so
 443
 444   if(gAlice->Lego())
 445    {
 446     gAlice->Lego()->BeginEvent();
 447     return;
 448    }
 449
 450
 451   AliDebug(1, "ResetHits()");
 452   ResetHits();
 453
 454   AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(H)");
 455   runloader->MakeTree("H");
 456
 457   AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTrackRefsContainer()");
 458   runloader->MakeTrackRefsContainer();//for insurance
 459
 460
 461   //create new branches and SetAdresses
 462   TIter next(gAlice->Modules());
 463   AliModule *detector;
 464   while((detector = (AliModule*)next()))
 465    {
 466     AliDebug(2, Form("%s->MakeBranch(H)",detector->GetName()));
 467     detector->MakeBranch("H");
 468     AliDebug(2, Form("%s->MakeBranchTR()",detector->GetName()));
 469     detector->MakeBranchTR();
 470     AliDebug(2, Form("%s->SetTreeAddress()",detector->GetName()));
 471     detector->SetTreeAddress();
 472    }
 473   // make branch for AliRun track References
 474   TTree * treeTR = runloader->TreeTR();
 475   if (treeTR){
 476     // make branch for central track references
 477     if (!fTrackReferences) fTrackReferences = new TClonesArray("AliTrackReference",0);
 478     TBranch *branch;
 479     branch = treeTR->Branch("AliRun",&fTrackReferences);
 480     branch->SetAddress(&fTrackReferences);
 481   }
 482   //
 483 }
 484
 485 //_______________________________________________________________________
 486 void AliMC::ResetHits()
 487 {
 488   //
 489   //  Reset all Detectors hits
 490   //
 491   TIter next(gAlice->Modules());
 492   AliModule *detector;
 493   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 494      detector->ResetHits();
 495   }
 496 }
 497
 498 //_______________________________________________________________________
 499 void AliMC::PostTrack()
 500 {
 501   // Posts tracks for each module
 502   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 503   AliModule *module;
 504
 505   for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 506     if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 507       module->PostTrack();
 508 }
 509
 510 //_______________________________________________________________________
 511 void AliMC::FinishPrimary()
 512 {
 513   //
 514   // Called  at the end of each primary track
 515   //
 516   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 517   //  static Int_t count=0;
 518   //  const Int_t times=10;
 519   // This primary is finished, purify stack
 520 #if ROOT_VERSION_CODE > 262152
 521   if (!(gMC->SecondariesAreOrdered()))
 522        runloader->Stack()->ReorderKine();
 523 #endif
 524   runloader->Stack()->PurifyKine();
 525
 526   TIter next(gAlice->Modules());
 527   AliModule *detector;
 528   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 529     detector->FinishPrimary();
 530     AliLoader* loader = detector->GetLoader();
 531     if(loader)
 532      {
 533        TTree* treeH = loader->TreeH();
 534        if (treeH) treeH->Fill(); //can be Lego run and treeH can not exist
 535      }
 536   }
 537
 538   // Write out track references if any
 539   if (runloader->TreeTR()) runloader->TreeTR()->Fill();
 540 }
 541
 542 //_______________________________________________________________________
 543 void AliMC::FinishEvent()
 544 {
 545   //
 546   // Called at the end of the event.
 547   //
 548
 549   //
 550   if(gAlice->Lego()) gAlice->Lego()->FinishEvent();
 551
 552   TIter next(gAlice->Modules());
 553   AliModule *detector;
 554   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 555     detector->FinishEvent();
 556   }
 557
 558   //Update the energy deposit tables
 559   Int_t i;
 560   for(i=0;i<fEventEnergy.GetSize();i++)
 561    {
 562     fSummEnergy[i]+=fEventEnergy[i];
 563     fSum2Energy[i]+=fEventEnergy[i]*fEventEnergy[i];
 564    }
 565
 566   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 567
 568   AliHeader* header = runloader->GetHeader();
 569   AliStack* stack = runloader->Stack();
 570   if ( (header == 0x0) || (stack == 0x0) )
 571    {//check if we got header and stack. If not cry and exit aliroot
 572     AliFatal("Can not get the stack or header from LOADER");
 573     return;//never reached
 574    }
 575   // Update Header information
 576   header->SetNprimary(stack->GetNprimary());
 577   header->SetNtrack(stack->GetNtrack());
 578
 579
 580   // Write out the kinematics
 581   stack->FinishEvent();
 582
 583   // Write out the event Header information
 584   TTree* treeE = runloader->TreeE();
 585   if (treeE)
 586    {
 587       header->SetStack(stack);
 588       treeE->Fill();
 589    }
 590   else
 591    {
 592     AliError("Can not get TreeE from RL");
 593    }
 594
 595   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 596    {
 597      runloader->WriteKinematics("OVERWRITE");
 598      runloader->WriteTrackRefs("OVERWRITE");
 599      runloader->WriteHits("OVERWRITE");
 600    }
 601
 602   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 603   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 604   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 605   AliDebug(1, "          FINISHING EVENT               ");
 606   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 607   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 608   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 609 }
 610
 611 //_______________________________________________________________________
 612 void AliMC::Field(const Double_t* x, Double_t* b) const
 613 {
 614   // Calculates field "b" at point "x"
 615     gAlice->Field(x,b);
 616 }
 617
 618 //_______________________________________________________________________
 619 void AliMC::Init()
 620 {
 621   // MC initialization
 622
 623    //=================Create Materials and geometry
 624    gMC->Init();
 625    //Read the cuts for all materials
 626    ReadTransPar();
 627    //Build the special IMEDIA table
 628    MediaTable();
 629
 630    //Compute cross-sections
 631    gMC->BuildPhysics();
 632
 633    //Write Geometry object to current file.
 634    gAlice->GetRunLoader()->WriteGeometry();
 635
 636    //Initialise geometry deposition table
 637    fEventEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 638    fSummEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 639    fSum2Energy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 640
 641    //
 642    fMCQA = new AliMCQA(gAlice->GetNdets());
 643
 644    // Register MC in configuration
 645    AliConfig::Instance()->Add(gMC);
 646
 647 }
 648
 649 //_______________________________________________________________________
 650 void AliMC::MediaTable()
 651 {
 652   //
 653   // Built media table to get from the media number to
 654   // the detector id
 655   //
 656
 657   Int_t kz, nz, idt, lz, i, k, ind;
 658   //  Int_t ibeg;
 659   TObjArray &dets = *gAlice->Detectors();
 660   AliModule *det;
 661   Int_t ndets=gAlice->GetNdets();
 662   //
 663   // For all detectors
 664   for (kz=0;kz<ndets;kz++) {
 665     // If detector is defined
 666     if((det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[kz]))) {
 667         TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
 668         for(nz=0;nz<100;nz++) {
 669
 670         // Find max and min material number
 671         if((idt=idtmed[nz])) {
 672           det->LoMedium() = det->LoMedium() < idt ? det->LoMedium() : idt;
 673           det->HiMedium() = det->HiMedium() > idt ? det->HiMedium() : idt;
 674         }
 675       }
 676       if(det->LoMedium() > det->HiMedium()) {
 677         det->LoMedium() = 0;
 678         det->HiMedium() = 0;
 679       } else {
 680         if(det->HiMedium() > fImedia->GetSize()) {
 681           AliError(Form("Increase fImedia from %d to %d",
 682                         fImedia->GetSize(),det->HiMedium()));
 683           return;
 684         }
 685         // Tag all materials in rage as belonging to detector kz
 686         for(lz=det->LoMedium(); lz<= det->HiMedium(); lz++) {
 687           (*fImedia)[lz]=kz;
 688         }
 689       }
 690     }
 691   }
 692   //
 693   // Print summary table
 694   AliInfo("Tracking media ranges:");
 695   ToAliInfo(
 696   for(i=0;i<(ndets-1)/6+1;i++) {
 697     for(k=0;k< (6<ndets-i*6?6:ndets-i*6);k++) {
 698       ind=i*6+k;
 699       det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[ind]);
 700       if(det)
 701         printf(" %6s: %3d -> %3d;",det->GetName(),det->LoMedium(),
 702                det->HiMedium());
 703       else
 704         printf(" %6s: %3d -> %3d;","NULL",0,0);
 705     }
 706     printf("\n");
 707   }
 708   )
 709 }
 710
 711 //_______________________________________________________________________
 712 void AliMC::ReadTransPar()
 713 {
 714   //
 715   // Read filename to set the transport parameters
 716   //
 717
 718
 719   const Int_t kncuts=10;
 720   const Int_t knflags=11;
 721   const Int_t knpars=kncuts+knflags;
 722   const char kpars[knpars][7] = {"CUTGAM" ,"CUTELE","CUTNEU","CUTHAD","CUTMUO",
 723                                "BCUTE","BCUTM","DCUTE","DCUTM","PPCUTM","ANNI",
 724                                "BREM","COMP","DCAY","DRAY","HADR","LOSS",
 725                                "MULS","PAIR","PHOT","RAYL"};
 726   char line[256];
 727   char detName[7];
 728   char* filtmp;
 729   Float_t cut[kncuts];
 730   Int_t flag[knflags];
 731   Int_t i, itmed, iret, ktmed, kz;
 732   FILE *lun;
 733   //
 734   // See whether the file is there
 735   filtmp=gSystem->ExpandPathName(fTransParName.Data());
 736   lun=fopen(filtmp,"r");
 737   delete [] filtmp;
 738   if(!lun) {
 739     AliWarning(Form("File %s does not exist!",fTransParName.Data()));
 740     return;
 741   }
 742   //
 743   while(1) {
 744     // Initialise cuts and flags
 745     for(i=0;i<kncuts;i++) cut[i]=-99;
 746     for(i=0;i<knflags;i++) flag[i]=-99;
 747     itmed=0;
 748     for(i=0;i<256;i++) line[i]='\0';
 749     // Read up to the end of line excluded
 750     iret=fscanf(lun,"%[^\n]",line);
 751     if(iret<0) {
 752       //End of file
 753       fclose(lun);
 754       return;
 755     }
 756     // Read the end of line
 757     fscanf(lun,"%*c");
 758     if(!iret) continue;
 759     if(line[0]=='*') continue;
 760     // Read the numbers
 761     iret=sscanf(line,"%s %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f %f %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d",
 762                 detName,&itmed,&cut[0],&cut[1],&cut[2],&cut[3],&cut[4],&cut[5],&cut[6],&cut[7],&cut[8],
 763                 &cut[9],&flag[0],&flag[1],&flag[2],&flag[3],&flag[4],&flag[5],&flag[6],&flag[7],
 764                 &flag[8],&flag[9],&flag[10]);
 765     if(!iret) continue;
 766     if(iret<0) {
 767       //reading error
 768       AliWarning(Form("Error reading file %s",fTransParName.Data()));
 769       continue;
 770     }
 771     // Check that the module exist
 772     AliModule *mod = gAlice->GetModule(detName);
 773     if(mod) {
 774       // Get the array of media numbers
 775       TArrayI &idtmed = *mod->GetIdtmed();
 776       // Check that the tracking medium code is valid
 777       if(0<=itmed && itmed < 100) {
 778         ktmed=idtmed[itmed];
 779         if(!ktmed) {
 780           AliWarning(Form("Invalid tracking medium code %d for %s",itmed,mod->GetName()));
 781           continue;
 782         }
 783         // Set energy thresholds
 784         for(kz=0;kz<kncuts;kz++) {
 785           if(cut[kz]>=0) {
 786             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10.3E for tracking medium code %4d for %s",
 787                              kpars[kz],cut[kz],itmed,mod->GetName()));
 788             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kz],cut[kz]);
 789           }
 790         }
 791         // Set transport mechanisms
 792         for(kz=0;kz<knflags;kz++) {
 793           if(flag[kz]>=0) {
 794             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10d for tracking medium code %4d for %s",
 795                              kpars[kncuts+kz],flag[kz],itmed,mod->GetName()));
 796             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kncuts+kz],Float_t(flag[kz]));
 797           }
 798         }
 799       } else {
 800         AliWarning(Form("Invalid medium code %d",itmed));
 801         continue;
 802       }
 803     } else {
 804       AliDebug(1, Form("%s not present",detName));
 805       continue;
 806     }
 807   }
 808 }
 809
 810 //_______________________________________________________________________
 811 void AliMC::SetTransPar(const char *filename)
 812 {
 813   //
 814   // Sets the file name for transport parameters
 815   //
 816   fTransParName = filename;
 817 }
 818
 819 //_______________________________________________________________________
 820 void AliMC::Browse(TBrowser *b)
 821 {
 822   //
 823   // Called when the item "Run" is clicked on the left pane
 824   // of the Root browser.
 825   // It displays the Root Trees and all detectors.
 826   //
 827   //detectors are in folders anyway
 828   b->Add(fMCQA,"AliMCQA");
 829 }
 830
 831 //PH
 832 //_______________________________________________________________________
 833 void AliMC::AddHit(Int_t id, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits) const
 834 {
 835   //
 836   //  Add a hit to detector id
 837   //
 838   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 839   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddHit(track,vol,hits);
 840 }
 841
 842 //_______________________________________________________________________
 843 void AliMC::AddDigit(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *digits) const
 844 {
 845   //
 846   // Add digit to detector id
 847   //
 848   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 849   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddDigit(tracks,digits);
 850 }
 851
 852 //_______________________________________________________________________
 853 Int_t AliMC::GetCurrentTrackNumber() const {
 854   //
 855   // Returns current track
 856   //
 857   return gAlice->GetRunLoader()->Stack()->GetCurrentTrackNumber();
 858 }
 859
 860 //_______________________________________________________________________
 861 void AliMC::DumpPart (Int_t i) const
 862 {
 863   //
 864   // Dumps particle i in the stack
 865   //
 866   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 867    if (runloader->Stack())
 868     runloader->Stack()->DumpPart(i);
 869 }
 870
 871 //_______________________________________________________________________
 872 void AliMC::DumpPStack () const
 873 {
 874   //
 875   // Dumps the particle stack
 876   //
 877   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 878    if (runloader->Stack())
 879     runloader->Stack()->DumpPStack();
 880 }
 881
 882 //_______________________________________________________________________
 883 Int_t AliMC::GetNtrack() const {
 884   //
 885   // Returns number of tracks in stack
 886   //
 887   Int_t ntracks = -1;
 888   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 889    if (runloader->Stack())
 890      ntracks = runloader->Stack()->GetNtrack();
 891    return ntracks;
 892 }
 893
 894 //_______________________________________________________________________
 895 Int_t AliMC::GetPrimary(Int_t track) const
 896 {
 897   //
 898   // return number of primary that has generated track
 899   //
 900   Int_t nprimary = -999;
 901   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 902   if (runloader->Stack())
 903     nprimary = runloader->Stack()->GetPrimary(track);
 904   return nprimary;
 905 }
 906
 907 //_______________________________________________________________________
 908 TParticle* AliMC::Particle(Int_t i) const
 909 {
 910   // Returns the i-th particle from the stack taking into account
 911   // the remaping done by PurifyKine
 912   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 913   if (runloader)
 914    if (runloader->Stack())
 915     return runloader->Stack()->Particle(i);
 916   return 0x0;
 917 }
 918
 919 //_______________________________________________________________________
 920 TObjArray* AliMC::Particles() const {
 921   //
 922   // Returns pointer to Particles array
 923   //
 924   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 925   if (runloader)
 926    if (runloader->Stack())
 927     return runloader->Stack()->Particles();
 928   return 0x0;
 929 }
 930
 931 //_______________________________________________________________________
 932 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg, Float_t *pmom,
 933                       Float_t *vpos, Float_t *polar, Float_t tof,
 934                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
 935 {
 936 // Delegate to stack
 937 //
 938   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 939   if (runloader)
 940     if (runloader->Stack())
 941       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, pmom, vpos, polar, tof,
 942                                     mech, ntr, weight, is);
 943 }
 944
 945 //_______________________________________________________________________
 946 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg,
 947                       Double_t px, Double_t py, Double_t pz, Double_t e,
 948                       Double_t vx, Double_t vy, Double_t vz, Double_t tof,
 949                       Double_t polx, Double_t poly, Double_t polz,
 950                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
 951 {
 952   // Delegate to stack
 953   //
 954   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 955   if (runloader)
 956     if (runloader->Stack())
 957       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, px, py, pz, e, vx, vy, vz, tof,
 958                                     polx, poly, polz, mech, ntr, weight, is);
 959 }
 960
 961 //_______________________________________________________________________
 962 void AliMC::SetHighWaterMark(Int_t nt) const
 963 {
 964     //
 965     // Set high water mark for last track in event
 966   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 967   if (runloader)
 968     if (runloader->Stack())
 969       runloader->Stack()->SetHighWaterMark(nt);
 970 }
 971
 972 //_______________________________________________________________________
 973 void AliMC::KeepTrack(Int_t track) const
 974 {
 975   //
 976   // Delegate to stack
 977   //
 978   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 979   if (runloader)
 980     if (runloader->Stack())
 981       runloader->Stack()->KeepTrack(track);
 982 }
 983
 984 //_______________________________________________________________________
 985 void AliMC::FlagTrack(Int_t track) const
 986 {
 987   // Delegate to stack
 988   //
 989   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 990   if (runloader)
 991     if (runloader->Stack())
 992       runloader->Stack()->FlagTrack(track);
 993 }
 994
 995 //_______________________________________________________________________
 996 void AliMC::SetCurrentTrack(Int_t track) const
 997 {
 998   //
 999   // Set current track number
1000   //
1001   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
1002   if (runloader)
1003     if (runloader->Stack())
1004       runloader->Stack()->SetCurrentTrack(track);
1005 }
1006
1007 //_______________________________________________________________________
1008 void  AliMC::AddTrackReference(Int_t label){
1009   //
1010   // add a trackrefernce to the list
1011   if (!fTrackReferences) {
1012     AliError("Container trackrefernce not active");
1013     return;
1014   }
1015   Int_t nref = fTrackReferences->GetEntriesFast();
1016   TClonesArray &lref = *fTrackReferences;
1017   new(lref[nref]) AliTrackReference(label);
1018 }
1019
1020
1021
1022 //_______________________________________________________________________
1023 void AliMC::ResetTrackReferences()
1024 {
1025   //
1026   //  Reset all  references
1027   //
1028   if (fTrackReferences)   fTrackReferences->Clear();
1029
1030   TIter next(gAlice->Modules());
1031   AliModule *detector;
1032   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
1033      detector->ResetTrackReferences();
1034   }
1035 }
1036
1037 void AliMC::RemapTrackReferencesIDs(Int_t *map)
1038 {
1039   //
1040   // Remapping track reference
1041   // Called at finish primary
1042   //
1043   if (!fTrackReferences) return;
1044   for (Int_t i=0;i<fTrackReferences->GetEntries();i++){
1045     AliTrackReference * ref = dynamic_cast<AliTrackReference*>(fTrackReferences->UncheckedAt(i));
1046     if (ref) {
1047       Int_t newID = map[ref->GetTrack()];
1048       if (newID>=0) ref->SetTrack(newID);
1049       else {
1050         //ref->SetTrack(-1);
1051         ref->SetBit(kNotDeleted,kFALSE);
1052         fTrackReferences->RemoveAt(i);
1053       }
1054     }
1055   }
1056   fTrackReferences->Compress();
1057 }
1058
1059 void AliMC::FixParticleDecaytime()
1060 {
1061     //
1062     // Fix the particle decay time according to rmin and rmax for decays
1063     //
1064
1065     TLorentzVector p;
1066     gMC->TrackMomentum(p);
1067     Double_t tmin, tmax;
1068     Double_t b;
1069
1070     // Transverse velocity
1071     Double_t vt    = p.Pt() / p.E();
1072
1073     if ((b = gAlice->Field()->SolenoidField()) > 0.) {     // [kG]
1074
1075         // Radius of helix
1076
1077         Double_t rho   = p.Pt() / 0.0003 / b; // [cm]
1078
1079         // Revolution frequency
1080
1081         Double_t omega = vt / rho;
1082
1083         // Maximum and minimum decay time
1084         //
1085         // Check for curlers first
1086         if (fRDecayMax * fRDecayMax / rho / rho / 2. > 1.) return;
1087
1088         //
1089
1090         tmax  = TMath::ACos(1. - fRDecayMax * fRDecayMax / rho / rho / 2.) / omega;   // [ct]
1091         tmin  = TMath::ACos(1. - fRDecayMin * fRDecayMin / rho / rho / 2.) / omega;   // [ct]
1092     } else {
1093         tmax =  fRDecayMax / vt;                                                      // [ct]
1094         tmin =  fRDecayMin / vt;                                                      // [ct]
1095     }
1096
1097     //
1098     // Dial t using the two limits
1099     Double_t t = tmin + (tmax - tmin) * gRandom->Rndm();                              // [ct]
1100     //
1101     //
1102     // Force decay time in transport code
1103     //
1104     TGeant3 * geant = (TGeant3*) gMC;
1105     geant->Gcphys()->sumlif = t / p.Beta() / p.Gamma();
1106 }