STEER/AliRun.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /*
  17 $Log$
  18 Revision 1.20  1999/10/04 18:08:49  fca
  19 Adding protection against inconsistent Euclid files
  20
  21 Revision 1.19  1999/09/29 07:50:40  fca
  22 Introduction of the Copyright and cvs Log
  23
  24 */
  25
  26 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  27 //                                                                           //
  28 //  Control class for Alice C++                                              //
  29 //  Only one single instance of this class exists.                           //
  30 //  The object is created in main program aliroot                            //
  31 //  and is pointed by the global gAlice.                                     //
  32 //                                                                           //
  33 //   -Supports the list of all Alice Detectors (fModules).                 //
  34 //   -Supports the list of particles (fParticles).                           //
  35 //   -Supports the Trees.                                                    //
  36 //   -Supports the geometry.                                                 //
  37 //   -Supports the event display.                                            //
  38 //Begin_Html
  39 /*
  40 <img src="picts/AliRunClass.gif">
  41 */
  42 //End_Html
  43 //Begin_Html
  44 /*
  45 <img src="picts/alirun.gif">
  46 */
  47 //End_Html
  48 //                                                                           //
  49 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  50
  51 #include <TFile.h>
  52 #include <TRandom.h>
  53 #include <TBRIK.h>
  54 #include <TNode.h>
  55 #include <TCint.h>
  56 #include <TSystem.h>
  57 #include <TObjectTable.h>
  58
  59 #include "TParticle.h"
  60 #include "AliRun.h"
  61 #include "AliDisplay.h"
  62
  63 #include "AliCallf77.h"
  64
  65 #include <stdlib.h>
  66 #include <stdio.h>
  67 #include <string.h>
  68
  69 AliRun *gAlice;
  70
  71 static AliHeader *header;
  72
  73 #ifndef WIN32
  74
  75 # define rxgtrak rxgtrak_
  76 # define rxstrak rxstrak_
  77 # define rxkeep  rxkeep_
  78 # define rxouth  rxouth_
  79 #else
  80
  81 # define rxgtrak RXGTRAK
  82 # define rxstrak RXSTRAK
  83 # define rxkeep  RXKEEP
  84 # define rxouth  RXOUTH
  85 #endif
  86
  87 static TArrayF sEventEnergy;
  88 static TArrayF sSummEnergy;
  89 static TArrayF sSum2Energy;
  90
  91 ClassImp(AliRun)
  92
  93 //_____________________________________________________________________________
  94 AliRun::AliRun()
  95 {
  96   //
  97   // Default constructor for AliRun
  98   //
  99   header=&fHeader;
 100   fRun       = 0;
 101   fEvent     = 0;
 102   fCurrent   = -1;
 103   fModules = 0;
 104   fGenerator = 0;
 105   fTreeD     = 0;
 106   fTreeK     = 0;
 107   fTreeH     = 0;
 108   fTreeE     = 0;
 109   fTreeR     = 0;
 110   fParticles = 0;
 111   fGeometry  = 0;
 112   fDisplay   = 0;
 113   fField     = 0;
 114   fMC        = 0;
 115   fNdets     = 0;
 116   fImedia    = 0;
 117   fTrRmax    = 1.e10;
 118   fTrZmax    = 1.e10;
 119   fInitDone  = kFALSE;
 120   fLego      = 0;
 121   fPDGDB     = 0;        //Particle factory object!
 122 }
 123
 124 //_____________________________________________________________________________
 125 AliRun::AliRun(const char *name, const char *title)
 126   : TNamed(name,title)
 127 {
 128   //
 129   //  Constructor for the main processor.
 130   //  Creates the geometry
 131   //  Creates the list of Detectors.
 132   //  Creates the list of particles.
 133   //
 134   Int_t i;
 135
 136   gAlice     = this;
 137   fTreeD     = 0;
 138   fTreeK     = 0;
 139   fTreeH     = 0;
 140   fTreeE     = 0;
 141   fTreeR     = 0;
 142   fTrRmax    = 1.e10;
 143   fTrZmax    = 1.e10;
 144   fGenerator = 0;
 145   fInitDone  = kFALSE;
 146   fLego      = 0;
 147   fField     = 0;
 148
 149   gROOT->GetListOfBrowsables()->Add(this,name);
 150   //
 151   // create the support list for the various Detectors
 152   fModules = new TObjArray(77);
 153   //
 154   // Create the TNode geometry for the event display
 155
 156   BuildSimpleGeometry();
 157
 158
 159   fNtrack=0;
 160   fHgwmk=0;
 161   fCurrent=-1;
 162   header=&fHeader;
 163   fRun       = 0;
 164   fEvent     = 0;
 165   //
 166   // Create the particle stack
 167   fParticles = new TClonesArray("TParticle",100);
 168
 169   fDisplay = 0;
 170   //
 171   // Create default mag field
 172   SetField();
 173   //
 174   fMC      = gMC;
 175   //
 176   // Prepare the tracking medium lists
 177   fImedia = new TArrayI(1000);
 178   for(i=0;i<1000;i++) (*fImedia)[i]=-99;
 179   //
 180   // Make particles
 181   fPDGDB     = TDatabasePDG::Instance();        //Particle factory object!
 182 }
 183
 184 //_____________________________________________________________________________
 185 AliRun::~AliRun()
 186 {
 187   //
 188   // Defaullt AliRun destructor
 189   //
 190   delete fImedia;
 191   delete fField;
 192   delete fMC;
 193   delete fGeometry;
 194   delete fDisplay;
 195   delete fGenerator;
 196   delete fLego;
 197   delete fTreeD;
 198   delete fTreeK;
 199   delete fTreeH;
 200   delete fTreeE;
 201   delete fTreeR;
 202   if (fModules) {
 203     fModules->Delete();
 204     delete fModules;
 205   }
 206   if (fParticles) {
 207     fParticles->Delete();
 208     delete fParticles;
 209   }
 210 }
 211
 212 //_____________________________________________________________________________
 213 void AliRun::AddHit(Int_t id, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits) const
 214 {
 215   //
 216   //  Add a hit to detector id
 217   //
 218   TObjArray &dets = *fModules;
 219   if(dets[id]) ((AliModule*) dets[id])->AddHit(track,vol,hits);
 220 }
 221
 222 //_____________________________________________________________________________
 223 void AliRun::AddDigit(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *digits) const
 224 {
 225   //
 226   // Add digit to detector id
 227   //
 228   TObjArray &dets = *fModules;
 229   if(dets[id]) ((AliModule*) dets[id])->AddDigit(tracks,digits);
 230 }
 231
 232 //_____________________________________________________________________________
 233 void AliRun::Browse(TBrowser *b)
 234 {
 235   //
 236   // Called when the item "Run" is clicked on the left pane
 237   // of the Root browser.
 238   // It displays the Root Trees and all detectors.
 239   //
 240   if (fTreeK) b->Add(fTreeK,fTreeK->GetName());
 241   if (fTreeH) b->Add(fTreeH,fTreeH->GetName());
 242   if (fTreeD) b->Add(fTreeD,fTreeD->GetName());
 243   if (fTreeE) b->Add(fTreeE,fTreeE->GetName());
 244   if (fTreeR) b->Add(fTreeR,fTreeR->GetName());
 245
 246   TIter next(fModules);
 247   AliModule *detector;
 248   while((detector = (AliModule*)next())) {
 249     b->Add(detector,detector->GetName());
 250   }
 251 }
 252
 253 //_____________________________________________________________________________
 254 void AliRun::Build()
 255 {
 256   //
 257   // Initialize Alice geometry
 258   // Dummy routine
 259   //
 260 }
 261
 262 //_____________________________________________________________________________
 263 void AliRun::BuildSimpleGeometry()
 264 {
 265   //
 266   // Create a simple TNode geometry used by Root display engine
 267   //
 268   // Initialise geometry
 269   //
 270   fGeometry = new TGeometry("AliceGeom","Galice Geometry for Hits");
 271   new TMaterial("void","Vacuum",0,0,0);  //Everything is void
 272   TBRIK *brik = new TBRIK("S_alice","alice volume","void",2000,2000,3000);
 273   brik->SetVisibility(0);
 274   new TNode("alice","alice","S_alice");
 275 }
 276
 277 //_____________________________________________________________________________
 278 void AliRun::CleanDetectors()
 279 {
 280   //
 281   // Clean Detectors at the end of event
 282   //
 283   TIter next(fModules);
 284   AliModule *detector;
 285   while((detector = (AliModule*)next())) {
 286     detector->FinishEvent();
 287   }
 288 }
 289
 290 //_____________________________________________________________________________
 291 void AliRun::CleanParents()
 292 {
 293   //
 294   // Clean Particles stack.
 295   // Set parent/daughter relations
 296   //
 297   TClonesArray &particles = *(gAlice->Particles());
 298   TParticle *part;
 299   int i;
 300   for(i=0; i<fNtrack; i++) {
 301     part = (TParticle *)particles.UncheckedAt(i);
 302     if(!part->TestBit(Daughters_Bit)) {
 303       part->SetFirstDaughter(-1);
 304       part->SetLastDaughter(-1);
 305     }
 306   }
 307 }
 308
 309 //_____________________________________________________________________________
 310 Int_t AliRun::DistancetoPrimitive(Int_t, Int_t)
 311 {
 312   //
 313   // Return the distance from the mouse to the AliRun object
 314   // Dummy routine
 315   //
 316   return 9999;
 317 }
 318
 319 //_____________________________________________________________________________
 320 void AliRun::DumpPart (Int_t i)
 321 {
 322   //
 323   // Dumps particle i in the stack
 324   //
 325   TClonesArray &particles = *fParticles;
 326   ((TParticle*) particles[i])->Print();
 327 }
 328
 329 //_____________________________________________________________________________
 330 void AliRun::DumpPStack ()
 331 {
 332   //
 333   // Dumps the particle stack
 334   //
 335   TClonesArray &particles = *fParticles;
 336   printf(
 337          "\n\n=======================================================================\n");
 338   for (Int_t i=0;i<fNtrack;i++)
 339     {
 340       printf("-> %d ",i); ((TParticle*) particles[i])->Print();
 341       printf("--------------------------------------------------------------\n");
 342     }
 343   printf(
 344          "\n=======================================================================\n\n");
 345 }
 346
 347 //_____________________________________________________________________________
 348 void AliRun::SetField(Int_t type, Int_t version, Float_t scale,
 349                       Float_t maxField, char* filename)
 350 {
 351   //
 352   //  Set magnetic field parameters
 353   //  type      Magnetic field transport flag 0=no field, 2=helix, 3=Runge Kutta
 354   //  version   Magnetic field map version (only 1 active now)
 355   //  scale     Scale factor for the magnetic field
 356   //  maxField  Maximum value for the magnetic field
 357
 358   //
 359   // --- Sanity check on mag field flags
 360   if(type<0 || type > 2) {
 361     Warning("SetField",
 362             "Invalid magnetic field flag: %5d; Helix tracking chosen instead\n"
 363            ,type);
 364     type=2;
 365   }
 366   if(fField) delete fField;
 367   if(version==1) {
 368     fField = new AliMagFC("Map1"," ",type,version,scale,maxField);
 369   } else if(version<=3) {
 370     fField = new AliMagFCM("Map2-3",filename,type,version,scale,maxField);
 371     fField->ReadField();
 372   } else {
 373     Warning("SetField","Invalid map %d\n",version);
 374   }
 375 }
 376
 377 //_____________________________________________________________________________
 378 void AliRun::FillTree()
 379 {
 380   //
 381   // Fills all AliRun TTrees
 382   //
 383   if (fTreeK) fTreeK->Fill();
 384   if (fTreeH) fTreeH->Fill();
 385   if (fTreeD) fTreeD->Fill();
 386   if (fTreeR) fTreeR->Fill();
 387 }
 388
 389 //_____________________________________________________________________________
 390 void AliRun::FinishPrimary()
 391 {
 392   //
 393   // Called  at the end of each primary track
 394   //
 395
 396   //  static Int_t count=0;
 397   //  const Int_t times=10;
 398   // This primary is finished, purify stack
 399   gAlice->PurifyKine();
 400
 401   // Write out hits if any
 402   if (gAlice->TreeH()) {
 403     gAlice->TreeH()->Fill();
 404   }
 405
 406   // Reset Hits info
 407   gAlice->ResetHits();
 408
 409   //
 410   //  if(++count%times==1) gObjectTable->Print();
 411 }
 412
 413 //_____________________________________________________________________________
 414 void AliRun::FinishEvent()
 415 {
 416   //
 417   // Called at the end of the event.
 418   //
 419
 420   //Update the energy deposit tables
 421   Int_t i;
 422   for(i=0;i<sEventEnergy.GetSize();i++) {
 423     sSummEnergy[i]+=sEventEnergy[i];
 424     sSum2Energy[i]+=sEventEnergy[i]*sEventEnergy[i];
 425   }
 426   sEventEnergy.Reset();
 427
 428   // Clean detector information
 429   CleanDetectors();
 430
 431   // Write out the kinematics
 432   if (fTreeK) {
 433     CleanParents();
 434     fTreeK->Fill();
 435   }
 436
 437   // Write out the digits
 438   if (fTreeD) {
 439     fTreeD->Fill();
 440     ResetDigits();
 441   }
 442
 443   // Write out reconstructed clusters
 444   if (fTreeR) {
 445     fTreeR->Fill();
 446   }
 447
 448   // Write out the event Header information
 449   if (fTreeE) fTreeE->Fill();
 450
 451   // Reset stack info
 452   ResetStack();
 453
 454   // Write Tree headers
 455   //  Int_t ievent = fHeader.GetEvent();
 456   //  char hname[30];
 457   //  sprintf(hname,"TreeK%d",ievent);
 458   if (fTreeK) fTreeK->Write();
 459   //  sprintf(hname,"TreeH%d",ievent);
 460   if (fTreeH) fTreeH->Write();
 461   //  sprintf(hname,"TreeD%d",ievent);
 462   if (fTreeD) fTreeD->Write();
 463   //  sprintf(hname,"TreeR%d",ievent);
 464   if (fTreeR) fTreeR->Write();
 465 }
 466
 467 //_____________________________________________________________________________
 468 void AliRun::FinishRun()
 469 {
 470   //
 471   // Called at the end of the run.
 472   //
 473
 474   // Clean detector information
 475   TIter next(fModules);
 476   AliModule *detector;
 477   while((detector = (AliModule*)next())) {
 478     detector->FinishRun();
 479   }
 480
 481   //Output energy summary tables
 482   EnergySummary();
 483
 484   // file is retrieved from whatever tree
 485   TFile *File = 0;
 486   if (fTreeK) File = fTreeK->GetCurrentFile();
 487   if ((!File) && (fTreeH)) File = fTreeH->GetCurrentFile();
 488   if ((!File) && (fTreeD)) File = fTreeD->GetCurrentFile();
 489   if ((!File) && (fTreeE)) File = fTreeE->GetCurrentFile();
 490   if( NULL==File ) {
 491     Error("FinishRun","There isn't root file!");
 492     exit(1);
 493   }
 494   File->cd();
 495   fTreeE->Write();
 496
 497   // Clean tree information
 498   delete fTreeK; fTreeK = 0;
 499   delete fTreeH; fTreeH = 0;
 500   delete fTreeD; fTreeD = 0;
 501   delete fTreeR; fTreeR = 0;
 502   delete fTreeE; fTreeE = 0;
 503
 504   // Write AliRun info and all detectors parameters
 505   Write();
 506
 507   // Close output file
 508   File->Write();
 509   File->Close();
 510 }
 511
 512 //_____________________________________________________________________________
 513 void AliRun::FlagTrack(Int_t track)
 514 {
 515   //
 516   // Flags a track and all its family tree to be kept
 517   //
 518   int curr;
 519   TParticle *particle;
 520
 521   curr=track;
 522   while(1) {
 523     particle=(TParticle*)fParticles->UncheckedAt(curr);
 524
 525     // If the particle is flagged the three from here upward is saved already
 526     if(particle->TestBit(Keep_Bit)) return;
 527
 528     // Save this particle
 529     particle->SetBit(Keep_Bit);
 530
 531     // Move to father if any
 532     if((curr=particle->GetFirstMother())==-1) return;
 533   }
 534 }
 535
 536 //_____________________________________________________________________________
 537 void AliRun::EnergySummary()
 538 {
 539   //
 540   // Print summary of deposited energy
 541   //
 542
 543   Int_t ndep=0;
 544   Float_t edtot=0;
 545   Float_t ed, ed2;
 546   Int_t kn, i, left, j, id;
 547   const Float_t zero=0;
 548   Int_t ievent=fHeader.GetEvent()+1;
 549   //
 550   // Energy loss information
 551   if(ievent) {
 552     printf("***************** Energy Loss Information per event (GEV) *****************\n");
 553     for(kn=1;kn<sEventEnergy.GetSize();kn++) {
 554       ed=sSummEnergy[kn];
 555       if(ed>0) {
 556         sEventEnergy[ndep]=kn;
 557         if(ievent>1) {
 558           ed=ed/ievent;
 559           ed2=sSum2Energy[kn];
 560           ed2=ed2/ievent;
 561           ed2=100*TMath::Sqrt(TMath::Max(ed2-ed*ed,zero))/ed;
 562         } else
 563           ed2=99;
 564         sSummEnergy[ndep]=ed;
 565         sSum2Energy[ndep]=TMath::Min((Float_t) 99.,TMath::Max(ed2,zero));
 566         edtot+=ed;
 567         ndep++;
 568       }
 569     }
 570     for(kn=0;kn<(ndep-1)/3+1;kn++) {
 571       left=ndep-kn*3;
 572       for(i=0;i<(3<left?3:left);i++) {
 573         j=kn*3+i;
 574         id=Int_t (sEventEnergy[j]+0.1);
 575         printf(" %s %10.3f +- %10.3f%%;",gMC->VolName(id),sSummEnergy[j],sSum2Energy[j]);
 576       }
 577       printf("\n");
 578     }
 579     //
 580     // Relative energy loss in different detectors
 581     printf("******************** Relative Energy Loss per event ********************\n");
 582     printf("Total energy loss per event %10.3f GeV\n",edtot);
 583     for(kn=0;kn<(ndep-1)/5+1;kn++) {
 584       left=ndep-kn*5;
 585       for(i=0;i<(5<left?5:left);i++) {
 586         j=kn*5+i;
 587         id=Int_t (sEventEnergy[j]+0.1);
 588         printf(" %s %10.3f%%;",gMC->VolName(id),100*sSummEnergy[j]/edtot);
 589       }
 590       printf("\n");
 591     }
 592     for(kn=0;kn<75;kn++) printf("*");
 593     printf("\n");
 594   }
 595   //
 596   // Reset the TArray's
 597   sEventEnergy.Set(0);
 598   sSummEnergy.Set(0);
 599   sSum2Energy.Set(0);
 600 }
 601
 602 //_____________________________________________________________________________
 603 AliModule *AliRun::GetModule(const char *name)
 604 {
 605   //
 606   // Return pointer to detector from name
 607   //
 608   return (AliModule*)fModules->FindObject(name);
 609 }
 610
 611 //_____________________________________________________________________________
 612 AliDetector *AliRun::GetDetector(const char *name)
 613 {
 614   //
 615   // Return pointer to detector from name
 616   //
 617   return (AliDetector*)fModules->FindObject(name);
 618 }
 619
 620 //_____________________________________________________________________________
 621 Int_t AliRun::GetModuleID(const char *name)
 622 {
 623   //
 624   // Return galice internal detector identifier from name
 625   //
 626   Int_t i=-1;
 627   TObject *mod=fModules->FindObject(name);
 628   if(mod) i=fModules->IndexOf(mod);
 629   return i;
 630 }
 631
 632 //_____________________________________________________________________________
 633 Int_t AliRun::GetEvent(Int_t event)
 634 {
 635   //
 636   // Connect the Trees Kinematics and Hits for event # event
 637   // Set branch addresses
 638   //
 639
 640   // Reset existing structures
 641   ResetStack();
 642   ResetHits();
 643   ResetDigits();
 644
 645   // Delete Trees already connected
 646   if (fTreeK) delete fTreeK;
 647   if (fTreeH) delete fTreeH;
 648   if (fTreeD) delete fTreeD;
 649   if (fTreeR) delete fTreeR;
 650
 651   // Get header from file
 652   if(fTreeE) fTreeE->GetEntry(event);
 653   else Error("GetEvent","Cannot file Header Tree\n");
 654
 655   // Get Kine Tree from file
 656   char treeName[20];
 657   sprintf(treeName,"TreeK%d",event);
 658   fTreeK = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 659   if (fTreeK) fTreeK->SetBranchAddress("Particles", &fParticles);
 660   else    Error("GetEvent","cannot find Kine Tree for event:%d\n",event);
 661
 662   // Get Hits Tree header from file
 663   sprintf(treeName,"TreeH%d",event);
 664   fTreeH = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 665   if (!fTreeH) {
 666     Error("GetEvent","cannot find Hits Tree for event:%d\n",event);
 667   }
 668
 669   // Get Digits Tree header from file
 670   sprintf(treeName,"TreeD%d",event);
 671   fTreeD = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 672   if (!fTreeD) {
 673     Warning("GetEvent","cannot find Digits Tree for event:%d\n",event);
 674   }
 675
 676
 677   // Get Reconstruct Tree header from file
 678   sprintf(treeName,"TreeR%d",event);
 679   fTreeR = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 680   if (!fTreeR) {
 681     //    printf("WARNING: cannot find Reconstructed Tree for event:%d\n",event);
 682   }
 683
 684   // Set Trees branch addresses
 685   TIter next(fModules);
 686   AliModule *detector;
 687   while((detector = (AliModule*)next())) {
 688     detector->SetTreeAddress();
 689   }
 690
 691   if (fTreeK) fTreeK->GetEvent(0);
 692   fNtrack = Int_t (fParticles->GetEntries());
 693   return fNtrack;
 694 }
 695
 696 //_____________________________________________________________________________
 697 TGeometry *AliRun::GetGeometry()
 698 {
 699   //
 700   // Import Alice geometry from current file
 701   // Return pointer to geometry object
 702   //
 703   if (!fGeometry) fGeometry = (TGeometry*)gDirectory->Get("AliceGeom");
 704   //
 705   // Unlink and relink nodes in detectors
 706   // This is bad and there must be a better way...
 707   //
 708
 709   TIter next(fModules);
 710   AliModule *detector;
 711   while((detector = (AliModule*)next())) {
 712     detector->SetTreeAddress();
 713     TList *dnodes=detector->Nodes();
 714     Int_t j;
 715     TNode *node, *node1;
 716     for ( j=0; j<dnodes->GetSize(); j++) {
 717       node = (TNode*) dnodes->At(j);
 718       node1 = fGeometry->GetNode(node->GetName());
 719       dnodes->Remove(node);
 720       dnodes->AddAt(node1,j);
 721     }
 722   }
 723   return fGeometry;
 724 }
 725
 726 //_____________________________________________________________________________
 727 void AliRun::GetNextTrack(Int_t &mtrack, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
 728                           Float_t &e, Float_t *vpos, Float_t *polar,
 729                           Float_t &tof)
 730 {
 731   //
 732   // Return next track from stack of particles
 733   //
 734   TVector3 pol;
 735   fCurrent=-1;
 736   TParticle *track;
 737   for(Int_t i=fNtrack-1; i>=0; i--) {
 738     track=(TParticle*) fParticles->UncheckedAt(i);
 739     if(!track->TestBit(Done_Bit)) {
 740       //
 741       // The track has not yet been processed
 742       fCurrent=i;
 743       ipart=track->GetPdgCode();
 744       pmom[0]=track->Px();
 745       pmom[1]=track->Py();
 746       pmom[2]=track->Pz();
 747       e     =track->Energy();
 748       vpos[0]=track->Vx();
 749       vpos[1]=track->Vy();
 750       vpos[2]=track->Vz();
 751       track->GetPolarisation(pol);
 752       polar[0]=pol.X();
 753       polar[1]=pol.Y();
 754       polar[2]=pol.Z();
 755       tof=track->T();
 756       track->SetBit(Done_Bit);
 757       break;
 758     }
 759   }
 760   mtrack=fCurrent;
 761   //
 762   // stop and start timer when we start a primary track
 763   Int_t nprimaries = fHeader.GetNprimary();
 764   if (fCurrent >= nprimaries) return;
 765   if (fCurrent < nprimaries-1) {
 766     fTimer.Stop();
 767     track=(TParticle*) fParticles->UncheckedAt(fCurrent+1);
 768     //    track->SetProcessTime(fTimer.CpuTime());
 769   }
 770   fTimer.Start();
 771 }
 772
 773 //_____________________________________________________________________________
 774 Int_t AliRun::GetPrimary(Int_t track)
 775 {
 776   //
 777   // return number of primary that has generated track
 778   //
 779   int current, parent;
 780   TParticle *part;
 781   //
 782   parent=track;
 783   while (1) {
 784     current=parent;
 785     part = (TParticle *)fParticles->UncheckedAt(current);
 786     parent=part->GetFirstMother();
 787     if(parent<0) return current;
 788   }
 789 }
 790
 791 //_____________________________________________________________________________
 792 void AliRun::Init(const char *setup)
 793 {
 794   //
 795   // Initialize the Alice setup
 796   //
 797
 798   gROOT->LoadMacro(setup);
 799   gInterpreter->ProcessLine("Config();");
 800
 801   gMC->DefineParticles();  //Create standard MC particles
 802
 803   TObject *objfirst, *objlast;
 804
 805   fNdets = fModules->GetLast()+1;
 806
 807   //
 808   //=================Create Materials, geometry, histograms, etc
 809    TIter next(fModules);
 810    AliModule *detector;
 811    while((detector = (AliModule*)next())) {
 812       detector->SetTreeAddress();
 813       objlast = gDirectory->GetList()->Last();
 814
 815       // Initialise detector materials, geometry, histograms,etc
 816       detector->CreateMaterials();
 817       detector->CreateGeometry();
 818       detector->BuildGeometry();
 819       detector->Init();
 820
 821       // Add Detector histograms in Detector list of histograms
 822       if (objlast) objfirst = gDirectory->GetList()->After(objlast);
 823       else         objfirst = gDirectory->GetList()->First();
 824       while (objfirst) {
 825         detector->Histograms()->Add(objfirst);
 826         objfirst = gDirectory->GetList()->After(objfirst);
 827       }
 828    }
 829    SetTransPar(); //Read the cuts for all materials
 830
 831    MediaTable(); //Build the special IMEDIA table
 832
 833    //Close the geometry structure
 834    gMC->Ggclos();
 835
 836    //Initialise geometry deposition table
 837    sEventEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 838    sSummEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 839    sSum2Energy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 840
 841    //Create the color table
 842    gMC->SetColors();
 843
 844    //Compute cross-sections
 845    gMC->Gphysi();
 846
 847    //Write Geometry object to current file.
 848    fGeometry->Write();
 849
 850    fInitDone = kTRUE;
 851 }
 852
 853 //_____________________________________________________________________________
 854 void AliRun::MediaTable()
 855 {
 856   //
 857   // Built media table to get from the media number to
 858   // the detector id
 859   //
 860   Int_t kz, nz, idt, lz, i, k, ind;
 861   //  Int_t ibeg;
 862   TObjArray &dets = *gAlice->Detectors();
 863   AliModule *det;
 864   //
 865   // For all detectors
 866   for (kz=0;kz<fNdets;kz++) {
 867     // If detector is defined
 868     if((det=(AliModule*) dets[kz])) {
 869         TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
 870         for(nz=0;nz<100;nz++) {
 871         // Find max and min material number
 872         if((idt=idtmed[nz])) {
 873           det->LoMedium() = det->LoMedium() < idt ? det->LoMedium() : idt;
 874           det->HiMedium() = det->HiMedium() > idt ? det->HiMedium() : idt;
 875         }
 876       }
 877       if(det->LoMedium() > det->HiMedium()) {
 878         det->LoMedium() = 0;
 879         det->HiMedium() = 0;
 880       } else {
 881         if(det->HiMedium() > fImedia->GetSize()) {
 882           Error("MediaTable","Increase fImedia from %d to %d",
 883                 fImedia->GetSize(),det->HiMedium());
 884           return;
 885         }
 886         // Tag all materials in rage as belonging to detector kz
 887         for(lz=det->LoMedium(); lz<= det->HiMedium(); lz++) {
 888           (*fImedia)[lz]=kz;
 889         }
 890       }
 891     }
 892   }
 893   //
 894   // Print summary table
 895   printf(" Traking media ranges:\n");
 896   for(i=0;i<(fNdets-1)/6+1;i++) {
 897     for(k=0;k< (6<fNdets-i*6?6:fNdets-i*6);k++) {
 898       ind=i*6+k;
 899       det=(AliModule*)dets[ind];
 900       if(det)
 901         printf(" %6s: %3d -> %3d;",det->GetName(),det->LoMedium(),
 902                det->HiMedium());
 903       else
 904         printf(" %6s: %3d -> %3d;","NULL",0,0);
 905     }
 906     printf("\n");
 907   }
 908 }
 909
 910 //____________________________________________________________________________
 911 void AliRun::SetGenerator(AliGenerator *generator)
 912 {
 913   //
 914   // Load the event generator
 915   //
 916   if(!fGenerator) fGenerator = generator;
 917 }
 918
 919 //____________________________________________________________________________
 920 void AliRun::SetTransPar(char* filename)
 921 {
 922   //
 923   // Read filename to set the transport parameters
 924   //
 925
 926
 927   const Int_t ncuts=10;
 928   const Int_t nflags=11;
 929   const Int_t npars=ncuts+nflags;
 930   const char pars[npars][7] = {"CUTGAM" ,"CUTELE","CUTNEU","CUTHAD","CUTMUO",
 931                                "BCUTE","BCUTM","DCUTE","DCUTM","PPCUTM","ANNI",
 932                                "BREM","COMP","DCAY","DRAY","HADR","LOSS",
 933                                "MULS","PAIR","PHOT","RAYL"};
 934   char line[256];
 935   char detName[7];
 936   char* filtmp;
 937   Float_t cut[ncuts];
 938   Int_t flag[nflags];
 939   Int_t i, itmed, iret, ktmed, kz;
 940   FILE *lun;
 941   //
 942   // See whether the file is there
 943   filtmp=gSystem->ExpandPathName(filename);
 944   lun=fopen(filtmp,"r");
 945   delete [] filtmp;
 946   if(!lun) {
 947     Warning("SetTransPar","File %s does not exist!\n",filename);
 948     return;
 949   }
 950   //
 951   printf(" "); for(i=0;i<60;i++) printf("*"); printf("\n");
 952   printf(" *%59s\n","*");
 953   printf(" *       Please check carefully what you are doing!%10s\n","*");
 954   printf(" *%59s\n","*");
 955   //
 956   while(1) {
 957     // Initialise cuts and flags
 958     for(i=0;i<ncuts;i++) cut[i]=-99;
 959     for(i=0;i<nflags;i++) flag[i]=-99;
 960     itmed=0;
 961     for(i=0;i<256;i++) line[i]='\0';
 962     // Read up to the end of line excluded
 963     iret=fscanf(lun,"%[^\n]",line);
 964     if(iret<0) {
 965       //End of file
 966       fclose(lun);
 967       printf(" *%59s\n","*");
 968       printf(" "); for(i=0;i<60;i++) printf("*"); printf("\n");
 969       return;
 970     }
 971     // Read the end of line
 972     fscanf(lun,"%*c");
 973     if(!iret) continue;
 974     if(line[0]=='*') continue;
 975     // Read the numbers
 976     iret=sscanf(line,"%s %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f %f %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d",
 977                 detName,&itmed,&cut[0],&cut[1],&cut[2],&cut[3],&cut[4],&cut[5],&cut[6],&cut[7],&cut[8],
 978                 &cut[9],&flag[0],&flag[1],&flag[2],&flag[3],&flag[4],&flag[5],&flag[6],&flag[7],
 979                 &flag[8],&flag[9],&flag[10]);
 980     if(!iret) continue;
 981     if(iret<0) {
 982       //reading error
 983       Warning("SetTransPar","Error reading file %s\n",filename);
 984       continue;
 985     }
 986     // Check that the module exist
 987     AliModule *mod = GetModule(detName);
 988     if(mod) {
 989       // Get the array of media numbers
 990       TArrayI &idtmed = *mod->GetIdtmed();
 991       // Check that the tracking medium code is valid
 992       if(0<=itmed && itmed < 100) {
 993         ktmed=idtmed[itmed];
 994         if(!ktmed) {
 995           Warning("SetTransPar","Invalid tracking medium code %d for %s\n",itmed,mod->GetName());
 996           continue;
 997         }
 998         // Set energy thresholds
 999         for(kz=0;kz<ncuts;kz++) {
1000           if(cut[kz]>=0) {
1001             printf(" *  %-6s set to %10.3E for tracking medium code %4d for %s\n",
1002                    pars[kz],cut[kz],itmed,mod->GetName());
1003             gMC->Gstpar(ktmed,pars[kz],cut[kz]);
1004           }
1005         }
1006         // Set transport mechanisms
1007         for(kz=0;kz<nflags;kz++) {
1008           if(flag[kz]>=0) {
1009             printf(" *  %-6s set to %10d for tracking medium code %4d for %s\n",
1010                    pars[ncuts+kz],flag[kz],itmed,mod->GetName());
1011             gMC->Gstpar(ktmed,pars[ncuts+kz],Float_t(flag[kz]));
1012           }
1013         }
1014       } else {
1015         Warning("SetTransPar","Invalid medium code %d *\n",itmed);
1016         continue;
1017       }
1018     } else {
1019       Warning("SetTransPar","Module %s not present\n",detName);
1020       continue;
1021     }
1022   }
1023 }
1024
1025 //_____________________________________________________________________________
1026 void AliRun::MakeTree(Option_t *option)
1027 {
1028   //
1029   //  Create the ROOT trees
1030   //  Loop on all detectors to create the Root branch (if any)
1031   //
1032
1033   //
1034   // Analyse options
1035   char *K = strstr(option,"K");
1036   char *H = strstr(option,"H");
1037   char *E = strstr(option,"E");
1038   char *D = strstr(option,"D");
1039   char *R = strstr(option,"R");
1040   //
1041   if (K && !fTreeK) fTreeK = new TTree("TreeK0","Kinematics");
1042   if (H && !fTreeH) fTreeH = new TTree("TreeH0","Hits");
1043   if (D && !fTreeD) fTreeD = new TTree("TreeD0","Digits");
1044   if (E && !fTreeE) fTreeE = new TTree("TE","Header");
1045   if (R && !fTreeR) fTreeR = new TTree("TreeR0","Reconstruction");
1046   if (fTreeH) fTreeH->SetAutoSave(1000000000); //no autosave
1047   //
1048   // Create a branch for hits/digits for each detector
1049   // Each branch is a TClonesArray. Each data member of the Hits classes
1050   // will be in turn a subbranch of the detector master branch
1051   TIter next(fModules);
1052   AliModule *detector;
1053   while((detector = (AliModule*)next())) {
1054      if (H || D || R) detector->MakeBranch(option);
1055   }
1056   //  Create a branch for particles
1057   if (fTreeK && K) fTreeK->Branch("Particles",&fParticles,4000);
1058
1059   //  Create a branch for Header
1060   if (fTreeE && E) fTreeE->Branch("Header","AliHeader",&header,4000);
1061 }
1062
1063 //_____________________________________________________________________________
1064 Int_t AliRun::PurifyKine(Int_t lastSavedTrack, Int_t nofTracks)
1065 {
1066   //
1067   // PurifyKine with external parameters
1068   //
1069   fHgwmk = lastSavedTrack;
1070   fNtrack = nofTracks;
1071   PurifyKine();
1072   return fHgwmk;
1073 }
1074
1075 //_____________________________________________________________________________
1076 void AliRun::PurifyKine()
1077 {
1078   //
1079   // Compress kinematic tree keeping only flagged particles
1080   // and renaming the particle id's in all the hits
1081   //
1082   TClonesArray &particles = *fParticles;
1083   int nkeep=fHgwmk+1, parent, i;
1084   TParticle *part, *partnew, *father;
1085   AliHit *OneHit;
1086   int *map = new int[particles.GetEntries()];
1087
1088   // Save in Header total number of tracks before compression
1089   fHeader.SetNtrack(fHeader.GetNtrack()+fNtrack-fHgwmk);
1090
1091   // Preset map, to be removed later
1092   for(i=0; i<fNtrack; i++) {
1093     if(i<=fHgwmk) map[i]=i ; else map[i] = -99 ;}
1094   // Second pass, build map between old and new numbering
1095   for(i=fHgwmk+1; i<fNtrack; i++) {
1096     part = (TParticle *)particles.UncheckedAt(i);
1097     if(part->TestBit(Keep_Bit)) {
1098
1099       // This particle has to be kept
1100       map[i]=nkeep;
1101       if(i!=nkeep) {
1102
1103         // Old and new are different, have to copy
1104         partnew = (TParticle *)particles.UncheckedAt(nkeep);
1105         *partnew = *part;
1106       } else partnew = part;
1107
1108       // as the parent is always *before*, it must be already
1109       // in place. This is what we are checking anyway!
1110       if((parent=partnew->GetFirstMother())>fHgwmk) {
1111         if(map[parent]==-99) printf("map[%d] = -99!\n",parent);
1112         partnew->SetFirstMother(map[parent]);
1113       }
1114       nkeep++;
1115     }
1116   }
1117   fNtrack=nkeep;
1118
1119   // Fix daughters information
1120   for (i=0; i<fNtrack; i++) {
1121     part = (TParticle *)particles.UncheckedAt(i);
1122     parent = part->GetFirstMother();
1123     if(parent>=0) {
1124       father = (TParticle *)particles.UncheckedAt(parent);
1125       if(father->TestBit(Daughters_Bit)) {
1126
1127         if(i<father->GetFirstDaughter()) father->SetFirstDaughter(i);
1128         if(i>father->GetLastDaughter())  father->SetLastDaughter(i);
1129       } else {
1130         // Iitialise daughters info for first pass
1131         father->SetFirstDaughter(i);
1132         father->SetLastDaughter(i);
1133         father->SetBit(Daughters_Bit);
1134       }
1135     }
1136   }
1137
1138   // Now loop on all detectors and reset the hits
1139   TIter next(fModules);
1140   AliModule *detector;
1141   while((detector = (AliModule*)next())) {
1142     if (!detector->Hits()) continue;
1143     TClonesArray &vHits=*(detector->Hits());
1144     if(vHits.GetEntries() != detector->GetNhits())
1145       printf("vHits.GetEntries()!=detector->GetNhits(): %d != %d\n",
1146              vHits.GetEntries(),detector->GetNhits());
1147     for (i=0; i<detector->GetNhits(); i++) {
1148       OneHit = (AliHit *)vHits.UncheckedAt(i);
1149       OneHit->SetTrack(map[OneHit->GetTrack()]);
1150     }
1151   }
1152
1153   fHgwmk=nkeep-1;
1154   particles.SetLast(fHgwmk);
1155   delete [] map;
1156 }
1157
1158 //_____________________________________________________________________________
1159 void AliRun::Reset(Int_t run, Int_t idevent)
1160 {
1161   //
1162   //  Reset all Detectors & kinematics & trees
1163   //
1164   char hname[30];
1165   //
1166   ResetStack();
1167   ResetHits();
1168   ResetDigits();
1169
1170   // Initialise event header
1171   fHeader.Reset(run,idevent);
1172
1173   if(fTreeK) {
1174     fTreeK->Reset();
1175     sprintf(hname,"TreeK%d",idevent);
1176     fTreeK->SetName(hname);
1177   }
1178   if(fTreeH) {
1179     fTreeH->Reset();
1180     sprintf(hname,"TreeH%d",idevent);
1181     fTreeH->SetName(hname);
1182   }
1183   if(fTreeD) {
1184     fTreeD->Reset();
1185     sprintf(hname,"TreeD%d",idevent);
1186     fTreeD->SetName(hname);
1187   }
1188   if(fTreeR) {
1189     fTreeR->Reset();
1190     sprintf(hname,"TreeR%d",idevent);
1191     fTreeR->SetName(hname);
1192   }
1193 }
1194
1195 //_____________________________________________________________________________
1196 void AliRun::ResetDigits()
1197 {
1198   //
1199   //  Reset all Detectors digits
1200   //
1201   TIter next(fModules);
1202   AliModule *detector;
1203   while((detector = (AliModule*)next())) {
1204      detector->ResetDigits();
1205   }
1206 }
1207
1208 //_____________________________________________________________________________
1209 void AliRun::ResetHits()
1210 {
1211   //
1212   //  Reset all Detectors hits
1213   //
1214   TIter next(fModules);
1215   AliModule *detector;
1216   while((detector = (AliModule*)next())) {
1217      detector->ResetHits();
1218   }
1219 }
1220
1221 //_____________________________________________________________________________
1222 void AliRun::ResetPoints()
1223 {
1224   //
1225   // Reset all Detectors points
1226   //
1227   TIter next(fModules);
1228   AliModule *detector;
1229   while((detector = (AliModule*)next())) {
1230      detector->ResetPoints();
1231   }
1232 }
1233
1234 //_____________________________________________________________________________
1235 void AliRun::Run(Int_t nevent, const char *setup)
1236 {
1237   //
1238   // Main function to be called to process a galice run
1239   // example
1240   //    Root > gAlice.Run();
1241   // a positive number of events will cause the finish routine
1242   // to be called
1243   //
1244
1245   Int_t i, todo;
1246   // check if initialisation has been done
1247   if (!fInitDone) Init(setup);
1248
1249   // Create the Root Tree with one branch per detector
1250   if(!fEvent) {
1251     gAlice->MakeTree("KHDER");
1252   }
1253
1254   todo = TMath::Abs(nevent);
1255   for (i=0; i<todo; i++) {
1256   // Process one run (one run = one event)
1257      gAlice->Reset(fRun, fEvent);
1258      gMC->Gtrigi();
1259      gMC->Gtrigc();
1260      gMC->Gtrig();
1261      gAlice->FinishEvent();
1262      fEvent++;
1263   }
1264
1265   // End of this run, close files
1266   if(nevent>0) gAlice->FinishRun();
1267 }
1268
1269 //_____________________________________________________________________________
1270 void AliRun::RunLego(const char *setup,Int_t ntheta,Float_t themin,
1271                      Float_t themax,Int_t nphi,Float_t phimin,Float_t phimax,
1272                      Float_t rmin,Float_t rmax,Float_t zmax)
1273 {
1274   //
1275   // Generates lego plots of:
1276   //    - radiation length map phi vs theta
1277   //    - radiation length map phi vs eta
1278   //    - interaction length map
1279   //    - g/cm2 length map
1280   //
1281   //  ntheta    bins in theta, eta
1282   //  themin    minimum angle in theta (degrees)
1283   //  themax    maximum angle in theta (degrees)
1284   //  nphi      bins in phi
1285   //  phimin    minimum angle in phi (degrees)
1286   //  phimax    maximum angle in phi (degrees)
1287   //  rmin      minimum radius
1288   //  rmax      maximum radius
1289   //
1290   //
1291   //  The number of events generated = ntheta*nphi
1292   //  run input parameters in macro setup (default="Config.C")
1293   //
1294   //  Use macro "lego.C" to visualize the 3 lego plots in spherical coordinates
1295   //Begin_Html
1296   /*
1297     <img src="picts/AliRunLego1.gif">
1298   */
1299   //End_Html
1300   //Begin_Html
1301   /*
1302     <img src="picts/AliRunLego2.gif">
1303   */
1304   //End_Html
1305   //Begin_Html
1306   /*
1307     <img src="picts/AliRunLego3.gif">
1308   */
1309   //End_Html
1310   //
1311
1312   // check if initialisation has been done
1313   if (!fInitDone) Init(setup);
1314
1315   fLego = new AliLego("lego","lego");
1316   fLego->Init(ntheta,themin,themax,nphi,phimin,phimax,rmin,rmax,zmax);
1317   fLego->Run();
1318
1319   // Create only the Root event Tree
1320   gAlice->MakeTree("E");
1321
1322   // End of this run, close files
1323   gAlice->FinishRun();
1324 }
1325
1326 //_____________________________________________________________________________
1327 void AliRun::SetCurrentTrack(Int_t track)
1328 {
1329   //
1330   // Set current track number
1331   //
1332   fCurrent = track;
1333 }
1334
1335 //_____________________________________________________________________________
1336 void AliRun::SetTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg, Float_t *pmom,
1337                       Float_t *vpos, Float_t *polar, Float_t tof,
1338                       const char *mecha, Int_t &ntr, Float_t weight)
1339 {
1340   //
1341   // Load a track on the stack
1342   //
1343   // done     0 if the track has to be transported
1344   //          1 if not
1345   // parent   identifier of the parent track. -1 for a primary
1346   // pdg    particle code
1347   // pmom     momentum GeV/c
1348   // vpos     position
1349   // polar    polarisation
1350   // tof      time of flight in seconds
1351   // mecha    production mechanism
1352   // ntr      on output the number of the track stored
1353   //
1354   TClonesArray &particles = *fParticles;
1355   TParticle *particle;
1356   Float_t mass;
1357   const Int_t firstdaughter=-1;
1358   const Int_t lastdaughter=-1;
1359   const Int_t KS=0;
1360   //  const Float_t tlife=0;
1361
1362   //
1363   // Here we get the static mass
1364   // For MC is ok, but a more sophisticated method could be necessary
1365   // if the calculated mass is required
1366   // also, this method is potentially dangerous if the mass
1367   // used in the MC is not the same of the PDG database
1368   //
1369   mass = TDatabasePDG::Instance()->GetParticle(pdg)->Mass();
1370   Float_t e=TMath::Sqrt(mass*mass+pmom[0]*pmom[0]+
1371                         pmom[1]*pmom[1]+pmom[2]*pmom[2]);
1372
1373   //printf("Loading particle %s mass %f ene %f No %d ip %d pos %f %f %f mom %f %f %f KS %d m %s\n",
1374   //pname,mass,e,fNtrack,pdg,vpos[0],vpos[1],vpos[2],pmom[0],pmom[1],pmom[2],KS,mecha);
1375
1376   particle=new(particles[fNtrack]) TParticle(pdg,KS,parent,-1,firstdaughter,
1377                                              lastdaughter,pmom[0],pmom[1],pmom[2],
1378                                              e,vpos[0],vpos[1],vpos[2],tof);
1379   //                                         polar[0],polar[1],polar[2],tof,
1380   //                                         mecha,weight);
1381   ((TParticle*)particles[fNtrack])->SetPolarisation(TVector3(polar[0],polar[1],polar[2]));
1382   ((TParticle*)particles[fNtrack])->SetWeight(weight);
1383   if(!done) particle->SetBit(Done_Bit);
1384
1385   if(parent>=0) {
1386     particle=(TParticle*) fParticles->UncheckedAt(parent);
1387     particle->SetLastDaughter(fNtrack);
1388     if(particle->GetFirstDaughter()<0) particle->SetFirstDaughter(fNtrack);
1389   } else {
1390     //
1391     // This is a primary track. Set high water mark for this event
1392     fHgwmk=fNtrack;
1393     //
1394     // Set also number if primary tracks
1395     fHeader.SetNprimary(fHgwmk+1);
1396     fHeader.SetNtrack(fHgwmk+1);
1397   }
1398   ntr = fNtrack++;
1399 }
1400
1401 //_____________________________________________________________________________
1402 void AliRun::KeepTrack(const Int_t track)
1403 {
1404   //
1405   // flags a track to be kept
1406   //
1407   TClonesArray &particles = *fParticles;
1408   ((TParticle*)particles[track])->SetBit(Keep_Bit);
1409 }
1410
1411 //_____________________________________________________________________________
1412 void AliRun::StepManager(Int_t id) const
1413 {
1414   //
1415   // Called at every step during transport
1416   //
1417
1418   Int_t copy;
1419   //
1420   // --- If lego option, do it and leave
1421   if (fLego) {
1422     fLego->StepManager();
1423     return;
1424   }
1425   //Update energy deposition tables
1426   sEventEnergy[gMC->CurrentVolID(copy)]+=gMC->Edep();
1427
1428   //Call the appropriate stepping routine;
1429   AliModule *det = (AliModule*)fModules->At(id);
1430   if(det) det->StepManager();
1431 }
1432
1433 //_____________________________________________________________________________
1434 void AliRun::ReadEuclid(const char* filnam, const AliModule *det, char* topvol)
1435 {
1436   //
1437   //       read in the geometry of the detector in euclid file format
1438   //
1439   //        id_det : the detector identification (2=its,...)
1440   //        topvol : return parameter describing the name of the top
1441   //        volume of geometry.
1442   //
1443   //            author : m. maire
1444   //
1445   //     28.07.98
1446   //     several changes have been made by miroslav helbich
1447   //     subroutine is rewrited to follow the new established way of memory
1448   //     booking for tracking medias and rotation matrices.
1449   //     all used tracking media have to be defined first, for this you can use
1450   //     subroutine  greutmed.
1451   //     top volume is searched as only volume not positioned into another
1452   //
1453
1454   Int_t i, nvol, iret, itmed, irot, numed, npar, ndiv, iaxe;
1455   Int_t ndvmx, nr, flag;
1456   char key[5], card[77], natmed[21];
1457   char name[5], mother[5], shape[5], konly[5], volst[7000][5];
1458   char *filtmp;
1459   Float_t par[50];
1460   Float_t teta1, phi1, teta2, phi2, teta3, phi3, orig, step;
1461   Float_t xo, yo, zo;
1462   const Int_t maxrot=5000;
1463   Int_t idrot[maxrot],istop[7000];
1464   FILE *lun;
1465   //
1466   // *** The input filnam name will be with extension '.euc'
1467   filtmp=gSystem->ExpandPathName(filnam);
1468   lun=fopen(filtmp,"r");
1469   delete [] filtmp;
1470   if(!lun) {
1471     Error("ReadEuclid","Could not open file %s\n",filnam);
1472     return;
1473   }
1474   //* --- definition of rotation matrix 0 ---
1475   TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
1476   for(i=1; i<maxrot; ++i) idrot[i]=-99;
1477   idrot[0]=0;
1478   nvol=0;
1479  L10:
1480   for(i=0;i<77;i++) card[i]=0;
1481   iret=fscanf(lun,"%77[^\n]",card);
1482   if(iret<=0) goto L20;
1483   fscanf(lun,"%*c");
1484   //*
1485   strncpy(key,card,4);
1486   key[4]='\0';
1487   if (!strcmp(key,"TMED")) {
1488     sscanf(&card[5],"%d '%[^']'",&itmed,natmed);
1489     if( itmed<0 || itmed>=100 ) {
1490       Error("ReadEuclid","TMED illegal medium number %d for %s\n",itmed,natmed);
1491       exit(1);
1492     }
1493     //Pad the string with blanks
1494     i=-1;
1495     while(natmed[++i]);
1496     while(i<20) natmed[i++]=' ';
1497     natmed[i]='\0';
1498     //
1499     if( idtmed[itmed]<=0 ) {
1500       Error("ReadEuclid","TMED undefined medium number %d for %s\n",itmed,natmed);
1501       exit(1);
1502     }
1503     gMC->Gckmat(idtmed[itmed],natmed);
1504     //*
1505   } else if (!strcmp(key,"ROTM")) {
1506     sscanf(&card[4],"%d %f %f %f %f %f %f",&irot,&teta1,&phi1,&teta2,&phi2,&teta3,&phi3);
1507     if( irot<=0 || irot>=maxrot ) {
1508       Error("ReadEuclid","ROTM rotation matrix number %d illegal\n",irot);
1509       exit(1);
1510     }
1511     det->AliMatrix(idrot[irot],teta1,phi1,teta2,phi2,teta3,phi3);
1512     //*
1513   } else if (!strcmp(key,"VOLU")) {
1514     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %d %d", name, shape, &numed, &npar);
1515     if (npar>0) {
1516       for(i=0;i<npar;i++) fscanf(lun,"%f",&par[i]);
1517       fscanf(lun,"%*c");
1518     }
1519     gMC->Gsvolu( name, shape, idtmed[numed], par, npar);
1520     //*     save the defined volumes
1521     strcpy(volst[++nvol],name);
1522     istop[nvol]=1;
1523     //*
1524   } else if (!strcmp(key,"DIVN")) {
1525     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %d %d", name, mother, &ndiv, &iaxe);
1526     gMC->Gsdvn  ( name, mother, ndiv, iaxe );
1527     //*
1528   } else if (!strcmp(key,"DVN2")) {
1529     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %d %d %f %d",name, mother, &ndiv, &iaxe, &orig, &numed);
1530     gMC->Gsdvn2( name, mother, ndiv, iaxe, orig,idtmed[numed]);
1531     //*
1532   } else if (!strcmp(key,"DIVT")) {
1533     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %f %d %d %d", name, mother, &step, &iaxe, &numed, &ndvmx);
1534     gMC->Gsdvt ( name, mother, step, iaxe, idtmed[numed], ndvmx);
1535     //*
1536   } else if (!strcmp(key,"DVT2")) {
1537     sscanf(&card[5],"'%[^']' '%[^']' %f %d %f %d %d", name, mother, &step, &iaxe, &orig, &numed, &ndvmx);
1538     gMC->Gsdvt2 ( name, mother, step, iaxe, orig, idtmed[numed], ndvmx );
1539     //*
1540   } else if (!strcmp(key,"POSI")) {
1541     sscanf(&card[5],"'%[^']' %d '%[^']' %f %f %f %d '%[^']'", name, &nr, mother, &xo, &yo, &zo, &irot, konly);
1542     if( irot<0 || irot>=maxrot ) {
1543       Error("ReadEuclid","POSI %s#%d rotation matrix number %d illegal\n",name,nr,irot);
1544       exit(1);
1545     }
1546     if( idrot[irot] == -99) {
1547       Error("ReadEuclid","POSI %s#%d undefined matrix number %d\n",name,nr,irot);
1548       exit(1);
1549     }
1550     //*** volume name cannot be the top volume
1551     for(i=1;i<=nvol;i++) {
1552       if (!strcmp(volst[i],name)) istop[i]=0;
1553     }
1554     //*
1555     gMC->Gspos  ( name, nr, mother, xo, yo, zo, idrot[irot], konly );
1556     //*
1557   } else if (!strcmp(key,"POSP")) {
1558     sscanf(&card[5],"'%[^']' %d '%[^']' %f %f %f %d '%[^']' %d", name, &nr, mother, &xo, &yo, &zo, &irot, konly, &npar);
1559     if( irot<0 || irot>=maxrot ) {
1560       Error("ReadEuclid","POSP %s#%d rotation matrix number %d illegal\n",name,nr,irot);
1561       exit(1);
1562     }
1563     if( idrot[irot] == -99) {
1564       Error("ReadEuclid","POSP %s#%d undefined matrix number %d\n",name,nr,irot);
1565       exit(1);
1566     }
1567     if (npar > 0) {
1568       for(i=0;i<npar;i++) fscanf(lun,"%f",&par[i]);
1569       fscanf(lun,"%*c");
1570     }
1571     //*** volume name cannot be the top volume
1572     for(i=1;i<=nvol;i++) {
1573       if (!strcmp(volst[i],name)) istop[i]=0;
1574     }
1575     //*
1576     gMC->Gsposp ( name, nr, mother, xo,yo,zo, idrot[irot], konly, par, npar);
1577   }
1578   //*
1579   if (strcmp(key,"END")) goto L10;
1580   //* find top volume in the geometry
1581   flag=0;
1582   for(i=1;i<=nvol;i++) {
1583     if (istop[i] && flag) {
1584       Warning("ReadEuclid"," %s is another possible top volume\n",volst[i]);
1585     }
1586     if (istop[i] && !flag) {
1587       strcpy(topvol,volst[i]);
1588       printf(" *** GREUCL *** volume %s taken as a top volume\n",topvol);
1589       flag=1;
1590     }
1591   }
1592   if (!flag) {
1593     Warning("ReadEuclid","top volume not found\n");
1594   }
1595   fclose (lun);
1596   //*
1597   //*     commented out only for the not cernlib version
1598   printf(" *** GREUCL *** file: %s is now read in\n",filnam);
1599   //
1600   return;
1601   //*
1602   L20:
1603   Error("ReadEuclid","reading error or premature end of file\n");
1604 }
1605
1606 //_____________________________________________________________________________
1607 void AliRun::ReadEuclidMedia(const char* filnam, const AliModule *det)
1608 {
1609   //
1610   //       read in the materials and tracking media for the detector
1611   //                   in euclid file format
1612   //
1613   //       filnam: name of the input file
1614   //       id_det: id_det is the detector identification (2=its,...)
1615   //
1616   //            author : miroslav helbich
1617   //
1618   Float_t sxmgmx = gAlice->Field()->Max();
1619   Int_t   isxfld = gAlice->Field()->Integ();
1620   Int_t end, i, iret, itmed;
1621   char key[5], card[130], natmed[21], namate[21];
1622   Float_t ubuf[50];
1623   char* filtmp;
1624   FILE *lun;
1625   Int_t imate;
1626   Int_t nwbuf, isvol, ifield, nmat;
1627   Float_t a, z, dens, radl, absl, fieldm, tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin;
1628   //
1629   end=strlen(filnam);
1630   for(i=0;i<end;i++) if(filnam[i]=='.') {
1631     end=i;
1632     break;
1633   }
1634   //
1635   // *** The input filnam name will be with extension '.euc'
1636   printf("The file name is %s\n",filnam); //Debug
1637   filtmp=gSystem->ExpandPathName(filnam);
1638   lun=fopen(filtmp,"r");
1639   delete [] filtmp;
1640   if(!lun) {
1641     Warning("ReadEuclidMedia","Could not open file %s\n",filnam);
1642     return;
1643   }
1644   //
1645   // Retrieve Mag Field parameters
1646   Int_t ISXFLD=gAlice->Field()->Integ();
1647   Float_t SXMGMX=gAlice->Field()->Max();
1648   //  TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
1649   //
1650  L10:
1651   for(i=0;i<130;i++) card[i]=0;
1652   iret=fscanf(lun,"%4s %[^\n]",key,card);
1653   if(iret<=0) goto L20;
1654   fscanf(lun,"%*c");
1655   //*
1656   //* read material
1657   if (!strcmp(key,"MATE")) {
1658     sscanf(card,"%d '%[^']' %f %f %f %f %f %d",&imate,namate,&a,&z,&dens,&radl,&absl,&nwbuf);
1659     if (nwbuf>0) for(i=0;i<nwbuf;i++) fscanf(lun,"%f",&ubuf[i]);
1660     //Pad the string with blanks
1661     i=-1;
1662     while(namate[++i]);
1663     while(i<20) namate[i++]=' ';
1664     namate[i]='\0';
1665     //
1666     det->AliMaterial(imate,namate,a,z,dens,radl,absl,ubuf,nwbuf);
1667     //* read tracking medium
1668   } else if (!strcmp(key,"TMED")) {
1669     sscanf(card,"%d '%[^']' %d %d %d %f %f %f %f %f %f %d",
1670            &itmed,natmed,&nmat,&isvol,&ifield,&fieldm,&tmaxfd,
1671            &stemax,&deemax,&epsil,&stmin,&nwbuf);
1672     if (nwbuf>0) for(i=0;i<nwbuf;i++) fscanf(lun,"%f",&ubuf[i]);
1673     if (ifield<0) ifield=isxfld;
1674     if (fieldm<0) fieldm=sxmgmx;
1675     //Pad the string with blanks
1676     i=-1;
1677     while(natmed[++i]);
1678     while(i<20) natmed[i++]=' ';
1679     natmed[i]='\0';
1680     //
1681     det->AliMedium(itmed,natmed,nmat,isvol,ISXFLD,SXMGMX,tmaxfd,
1682                    stemax,deemax,epsil,stmin,ubuf,nwbuf);
1683     //    (*fImedia)[idtmed[itmed]-1]=id_det;
1684     //*
1685   }
1686   //*
1687   if (strcmp(key,"END")) goto L10;
1688   fclose (lun);
1689   //*
1690   //*     commented out only for the not cernlib version
1691   Warning("ReadEuclidMedia","file: %s is now read in\n",filnam);
1692   //*
1693   return;
1694   //*
1695  L20:
1696   Warning("ReadEuclidMedia","reading error or premature end of file\n");
1697 }
1698
1699 //_____________________________________________________________________________
1700 void AliRun::Streamer(TBuffer &R__b)
1701 {
1702   //
1703   // Stream an object of class AliRun.
1704   //
1705   if (R__b.IsReading()) {
1706     Version_t R__v = R__b.ReadVersion(); if (R__v) { }
1707     TNamed::Streamer(R__b);
1708     if (!gAlice) gAlice = this;
1709     gROOT->GetListOfBrowsables()->Add(this,"Run");
1710     fTreeE = (TTree*)gDirectory->Get("TE");
1711     if (fTreeE) fTreeE->SetBranchAddress("Header", &header);
1712     else    Error("Streamer","cannot find Header Tree\n");
1713     R__b >> fNtrack;
1714     R__b >> fHgwmk;
1715     R__b >> fDebug;
1716     fHeader.Streamer(R__b);
1717     R__b >> fModules;
1718     R__b >> fParticles;
1719     R__b >> fField;
1720     //    R__b >> fMC;
1721     R__b >> fNdets;
1722     R__b >> fTrRmax;
1723     R__b >> fTrZmax;
1724     R__b >> fGenerator;
1725     if(R__v>1) {
1726       R__b >> fPDGDB;        //Particle factory object!
1727       fTreeE->GetEntry(0);
1728     } else {
1729       fHeader.SetEvent(0);
1730       fPDGDB     = TDatabasePDG::Instance();        //Particle factory object!
1731     }
1732   } else {
1733     R__b.WriteVersion(AliRun::IsA());
1734     TNamed::Streamer(R__b);
1735     R__b << fNtrack;
1736     R__b << fHgwmk;
1737     R__b << fDebug;
1738     fHeader.Streamer(R__b);
1739     R__b << fModules;
1740     R__b << fParticles;
1741     R__b << fField;
1742     //    R__b << fMC;
1743     R__b << fNdets;
1744     R__b << fTrRmax;
1745     R__b << fTrZmax;
1746     R__b << fGenerator;
1747     R__b << fPDGDB;        //Particle factory object!
1748   }
1749 }
1750
1751
1752 //_____________________________________________________________________________
1753 //
1754 //                 Interfaces to Fortran
1755 //
1756 //_____________________________________________________________________________
1757
1758 extern "C" void type_of_call  rxgtrak (Int_t &mtrack, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
1759                                        Float_t &e, Float_t *vpos, Float_t *polar,
1760                                        Float_t &tof)
1761 {
1762   //
1763   //     Fetches next track from the ROOT stack for transport. Called by the
1764   //     modified version of GTREVE.
1765   //
1766   //              Track number in the ROOT stack. If MTRACK=0 no
1767   //      mtrack  more tracks are left in the stack to be
1768   //              transported.
1769   //      ipart   Particle code in the GEANT conventions.
1770   //      pmom[3] Particle momentum in GeV/c
1771   //      e       Particle energy in GeV
1772   //      vpos[3] Particle position
1773   //      tof     Particle time of flight in seconds
1774   //
1775   Int_t pdg;
1776   gAlice->GetNextTrack(mtrack, pdg, pmom, e, vpos, polar, tof);
1777   ipart = gMC->IdFromPDG(pdg);
1778   mtrack++;
1779 }
1780
1781 //_____________________________________________________________________________
1782 extern "C" void type_of_call
1783 #ifndef WIN32
1784 rxstrak (Int_t &keep, Int_t &parent, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
1785                Float_t *vpos, Float_t &tof, const char* cmech, Int_t &ntr, const int cmlen)
1786 #else
1787 rxstrak (Int_t &keep, Int_t &parent, Int_t &ipart, Float_t *pmom,
1788          Float_t *vpos, Float_t &tof, const char* cmech, const int cmlen,
1789          Int_t &ntr)
1790 #endif
1791 {
1792   //
1793   //     Fetches next track from the ROOT stack for transport. Called by GUKINE
1794   //     and GUSTEP.
1795   //
1796   //              Status of the track. If keep=0 the track is put
1797   //      keep    on the ROOT stack but it is not fetched for
1798   //              transport.
1799   //      parent  Parent track. If parent=0 the track is a primary.
1800   //              In GUSTEP the routine is normally called to store
1801   //              secondaries generated by the current track whose
1802   //              ROOT stack number is MTRACK (common SCKINE.
1803   //      ipart   Particle code in the GEANT conventions.
1804   //      pmom[3] Particle momentum in GeV/c
1805   //      vpos[3] Particle position
1806   //      tof     Particle time of flight in seconds
1807   //
1808   //      cmech   (CHARACTER*10) Particle origin. This field is user
1809   //              defined and it is not used inside the GALICE code.
1810   //      ntr     Number assigned to the particle in the ROOT stack.
1811   //
1812   char mecha[11];
1813   Float_t polar[3]={0.,0.,0.};
1814   for(int i=0; i<10 && i<cmlen; i++) mecha[i]=cmech[i];
1815   mecha[10]=0;
1816   Int_t pdg=gMC->PDGFromId(ipart);
1817   gAlice->SetTrack(keep, parent-1, pdg, pmom, vpos, polar, tof, mecha, ntr);
1818   ntr++;
1819 }
1820
1821 //_____________________________________________________________________________
1822 extern "C" void type_of_call  rxkeep(const Int_t &n)
1823 {
1824   if( NULL==gAlice ) exit(1);
1825
1826   if( n<=0 || n>gAlice->Particles()->GetEntries() )
1827     {
1828       printf("  Bad index n=%d must be 0<n<=%d\n",
1829              n,gAlice->Particles()->GetEntries());
1830       exit(1);
1831     }
1832
1833   ((TParticle*)(gAlice->Particles()->UncheckedAt(n-1)))->SetBit(Keep_Bit);
1834 }
1835
1836 //_____________________________________________________________________________
1837 extern "C" void type_of_call  rxouth ()
1838 {
1839   //
1840   // Called by Gtreve at the end of each primary track
1841   //
1842   gAlice->FinishPrimary();
1843 }
1844