STEER/AliStack.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
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   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
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  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
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  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  19 //                                                                           //
  20 //  Particles stack class                                                    //
  21 //  Implements the TMCVirtualStack of the Virtual Monte Carlo                //
  22 //  Holds the particles transported during simulation                        //
  23 //  Is used to compare results of reconstruction with simulation             //
  24 //  Author A.Morsch                                                          //
  25 //                                                                           //
  26 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  27
  28
  29 #include <TClonesArray.h>
  30 #include <TObjArray.h>
  31 #include <TPDGCode.h>
  32 #include <TParticle.h>
  33 #include <TParticlePDG.h>
  34 #include <TDatabasePDG.h>
  35 #include <TTree.h>
  36 #include <TDirectory.h>
  37
  38 #include "AliLog.h"
  39 #include "AliStack.h"
  40
  41 ClassImp(AliStack)
  42
  43 //_______________________________________________________________________
  44 AliStack::AliStack():
  45   fParticles("TParticle", 1000),
  46   fParticleMap(),
  47   fParticleFileMap(0),
  48   fParticleBuffer(0),
  49   fCurrentTrack(0),
  50   fTreeK(0),
  51   fNtrack(0),
  52   fNprimary(0),
  53   fCurrent(-1),
  54   fCurrentPrimary(-1),
  55   fHgwmk(0),
  56   fLoadPoint(0),
  57   fTrackLabelMap(0)
  58 {
  59   //
  60   // Default constructor
  61   //
  62 }
  63
  64 //_______________________________________________________________________
  65 AliStack::AliStack(Int_t size, const char* /*evfoldname*/):
  66   fParticles("TParticle",1000),
  67   fParticleMap(size),
  68   fParticleFileMap(0),
  69   fParticleBuffer(0),
  70   fCurrentTrack(0),
  71   fTreeK(0),
  72   fNtrack(0),
  73   fNprimary(0),
  74   fCurrent(-1),
  75   fCurrentPrimary(-1),
  76   fHgwmk(0),
  77   fLoadPoint(0),
  78   fTrackLabelMap(0)
  79 {
  80   //
  81   //  Constructor
  82   //
  83 }
  84
  85 //_______________________________________________________________________
  86 AliStack::AliStack(const AliStack& st):
  87     TVirtualMCStack(st),
  88     fParticles("TParticle",1000),
  89     fParticleMap(*(st.Particles())),
  90     fParticleFileMap(st.fParticleFileMap),
  91     fParticleBuffer(0),
  92     fCurrentTrack(0),
  93     fTreeK((TTree*)(st.fTreeK->Clone())),
  94     fNtrack(st.GetNtrack()),
  95     fNprimary(st.GetNprimary()),
  96     fCurrent(-1),
  97     fCurrentPrimary(-1),
  98     fHgwmk(0),
  99     fLoadPoint(0),
 100     fTrackLabelMap(0)
 101 {
 102     // Copy constructor
 103 }
 104
 105
 106 //_______________________________________________________________________
 107 void AliStack::Copy(TObject&) const
 108 {
 109   AliFatal("Not implemented!");
 110 }
 111
 112 //_______________________________________________________________________
 113 AliStack::~AliStack()
 114 {
 115   //
 116   // Destructor
 117   //
 118
 119     fParticles.Clear();
 120 }
 121
 122 //
 123 // public methods
 124 //
 125
 126 //_____________________________________________________________________________
 127 void AliStack::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg, const Float_t *pmom,
 128                         const Float_t *vpos, const Float_t *polar, Float_t tof,
 129                         TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is)
 130 {
 131   //
 132   // Load a track on the stack
 133   //
 134   // done     1 if the track has to be transported
 135   //          0 if not
 136   // parent   identifier of the parent track. -1 for a primary
 137   // pdg    particle code
 138   // pmom     momentum GeV/c
 139   // vpos     position
 140   // polar    polarisation
 141   // tof      time of flight in seconds
 142   // mecha    production mechanism
 143   // ntr      on output the number of the track stored
 144   //
 145
 146   //  const Float_t tlife=0;
 147
 148   //
 149   // Here we get the static mass
 150   // For MC is ok, but a more sophisticated method could be necessary
 151   // if the calculated mass is required
 152   // also, this method is potentially dangerous if the mass
 153   // used in the MC is not the same of the PDG database
 154   //
 155     TParticlePDG* pmc =  TDatabasePDG::Instance()->GetParticle(pdg);
 156     if (pmc) {
 157         Float_t mass = TDatabasePDG::Instance()->GetParticle(pdg)->Mass();
 158         Float_t e=TMath::Sqrt(mass*mass+pmom[0]*pmom[0]+
 159                               pmom[1]*pmom[1]+pmom[2]*pmom[2]);
 160
 161 //    printf("Loading  mass %f ene %f No %d ip %d parent %d done %d pos %f %f %f mom %f %f %f kS %d m \n",
 162 //         mass,e,fNtrack,pdg,parent,done,vpos[0],vpos[1],vpos[2],pmom[0],pmom[1],pmom[2],kS);
 163
 164
 165         PushTrack(done, parent, pdg, pmom[0], pmom[1], pmom[2], e,
 166                  vpos[0], vpos[1], vpos[2], tof, polar[0], polar[1], polar[2],
 167                  mech, ntr, weight, is);
 168     } else {
 169         AliWarning(Form("Particle type %d not defined in PDG Database !", pdg));
 170         AliWarning("Particle skipped !");
 171     }
 172 }
 173
 174 //_____________________________________________________________________________
 175 void AliStack::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg,
 176                       Double_t px, Double_t py, Double_t pz, Double_t e,
 177                       Double_t vx, Double_t vy, Double_t vz, Double_t tof,
 178                       Double_t polx, Double_t poly, Double_t polz,
 179                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Double_t weight, Int_t is)
 180 {
 181   //
 182   // Load a track on the stack
 183   //
 184   // done        1 if the track has to be transported
 185   //             0 if not
 186   // parent      identifier of the parent track. -1 for a primary
 187   // pdg         particle code
 188   // kS          generation status code
 189   // px, py, pz  momentum GeV/c
 190   // vx, vy, vz  position
 191   // polar       polarisation
 192   // tof         time of flight in seconds
 193   // mech        production mechanism
 194   // ntr         on output the number of the track stored
 195   //
 196   // New method interface:
 197   // arguments were changed to be in correspondence with TParticle
 198   // constructor.
 199   // Note: the energy is not calculated from the static mass but
 200   // it is passed by argument e.
 201
 202   const Int_t kFirstDaughter=-1;
 203   const Int_t kLastDaughter=-1;
 204
 205
 206   TParticle* particle
 207     = new(fParticles[fLoadPoint++])
 208       TParticle(pdg, is, parent, -1, kFirstDaughter, kLastDaughter,
 209                 px, py, pz, e, vx, vy, vz, tof);
 210
 211   particle->SetPolarisation(polx, poly, polz);
 212   particle->SetWeight(weight);
 213   particle->SetUniqueID(mech);
 214
 215
 216
 217   if(!done) {
 218       particle->SetBit(kDoneBit);
 219   } else {
 220       particle->SetBit(kTransportBit);
 221   }
 222
 223
 224
 225   //  Declare that the daughter information is valid
 226   particle->SetBit(kDaughtersBit);
 227   //  Add the particle to the stack
 228
 229
 230   fParticleMap.AddAtAndExpand(particle, fNtrack);//CHECK!!
 231
 232   if(parent>=0) {
 233       particle = GetParticleMapEntry(parent);
 234       if (particle) {
 235           particle->SetLastDaughter(fNtrack);
 236           if(particle->GetFirstDaughter()<0) particle->SetFirstDaughter(fNtrack);
 237       }
 238       else {
 239           AliError(Form("Parent %d does not exist",parent));
 240       }
 241   } else {
 242       //
 243       // This is a primary track. Set high water mark for this event
 244       fHgwmk = fNtrack;
 245       //
 246       // Set also number if primary tracks
 247       fNprimary = fHgwmk+1;
 248       fCurrentPrimary++;
 249   }
 250   ntr = fNtrack++;
 251 }
 252
 253 //_____________________________________________________________________________
 254 TParticle*  AliStack::PopNextTrack(Int_t& itrack)
 255 {
 256   //
 257   // Returns next track from stack of particles
 258   //
 259
 260
 261   TParticle* track = GetNextParticle();
 262
 263   if (track) {
 264     itrack = fCurrent;
 265     track->SetBit(kDoneBit);
 266   }
 267   else
 268     itrack = -1;
 269
 270   fCurrentTrack = track;
 271   return track;
 272 }
 273
 274 //_____________________________________________________________________________
 275 TParticle*  AliStack::PopPrimaryForTracking(Int_t i)
 276 {
 277   //
 278   // Returns i-th primary particle if it is flagged to be tracked,
 279   // 0 otherwise
 280   //
 281
 282   TParticle* particle = Particle(i);
 283
 284   if (!particle->TestBit(kDoneBit))
 285     return particle;
 286   else
 287     return 0;
 288 }
 289
 290 //_____________________________________________________________________________
 291 Bool_t AliStack::PurifyKine()
 292 {
 293   //
 294   // Compress kinematic tree keeping only flagged particles
 295   // and renaming the particle id's in all the hits
 296   //
 297
 298   int nkeep = fHgwmk + 1, parent, i;
 299   TParticle *part, *father;
 300   fTrackLabelMap.Set(fParticleMap.GetLast()+1);
 301
 302   // Save in Header total number of tracks before compression
 303   // If no tracks generated return now
 304   if(fHgwmk+1 == fNtrack) return kFALSE;
 305
 306   // First pass, invalid Daughter information
 307   for(i=0; i<fNtrack; i++) {
 308       // Preset map, to be removed later
 309       if(i<=fHgwmk) fTrackLabelMap[i]=i ;
 310       else {
 311           fTrackLabelMap[i] = -99;
 312           if((part=GetParticleMapEntry(i))) {
 313 //
 314 //        Check of this track should be kept for physics reasons
 315               if (KeepPhysics(part)) KeepTrack(i);
 316 //
 317               part->ResetBit(kDaughtersBit);
 318               part->SetFirstDaughter(-1);
 319               part->SetLastDaughter(-1);
 320           }
 321       }
 322   }
 323   // Invalid daughter information for the parent of the first particle
 324   // generated. This may or may not be the current primary according to
 325   // whether decays have been recorded among the primaries
 326   part = GetParticleMapEntry(fHgwmk+1);
 327   fParticleMap.At(part->GetFirstMother())->ResetBit(kDaughtersBit);
 328   // Second pass, build map between old and new numbering
 329   for(i=fHgwmk+1; i<fNtrack; i++) {
 330       if(fParticleMap.At(i)->TestBit(kKeepBit)) {
 331           // This particle has to be kept
 332           fTrackLabelMap[i]=nkeep;
 333           // If old and new are different, have to move the pointer
 334           if(i!=nkeep) fParticleMap[nkeep]=fParticleMap.At(i);
 335           part = GetParticleMapEntry(nkeep);
 336           // as the parent is always *before*, it must be already
 337           // in place. This is what we are checking anyway!
 338           if((parent=part->GetFirstMother())>fHgwmk) {
 339               if(fTrackLabelMap[parent]==-99) Fatal("PurifyKine","fTrackLabelMap[%d] = -99!\n",parent);
 340               else part->SetFirstMother(fTrackLabelMap[parent]);}
 341           nkeep++;
 342       }
 343   }
 344
 345   // Fix daughters information
 346   for (i=fHgwmk+1; i<nkeep; i++) {
 347       part = GetParticleMapEntry(i);
 348       parent = part->GetFirstMother();
 349       if(parent>=0) {
 350           father = GetParticleMapEntry(parent);
 351           if(father->TestBit(kDaughtersBit)) {
 352
 353               if(i<father->GetFirstDaughter()) father->SetFirstDaughter(i);
 354               if(i>father->GetLastDaughter())  father->SetLastDaughter(i);
 355           } else {
 356               // Initialise daughters info for first pass
 357               father->SetFirstDaughter(i);
 358               father->SetLastDaughter(i);
 359               father->SetBit(kDaughtersBit);
 360           }
 361       }
 362   }
 363   //
 364   // Now the output bit, from fHgwmk to nkeep we write everything and we erase
 365   if(nkeep > fParticleFileMap.GetSize()) fParticleFileMap.Set(Int_t (nkeep*1.5));
 366   for (i=fHgwmk+1; i<nkeep; ++i) {
 367       fParticleBuffer = GetParticleMapEntry(i);
 368       fParticleFileMap[i]=static_cast<Int_t>(TreeK()->GetEntries());
 369       TreeK()->Fill();
 370       fParticleMap[i]=fParticleBuffer=0;
 371   }
 372
 373   for (i = nkeep; i < fNtrack; ++i) fParticleMap[i]=0;
 374
 375   Int_t toshrink = fNtrack-fHgwmk-1;
 376   fLoadPoint-=toshrink;
 377
 378   for(i=fLoadPoint; i<fLoadPoint+toshrink; ++i) fParticles.RemoveAt(i);
 379   fNtrack=nkeep;
 380   fHgwmk=nkeep-1;
 381   return kTRUE;
 382 }
 383
 384
 385 Bool_t AliStack::ReorderKine()
 386 {
 387 //
 388 // In some transport code children might not come in a continuous sequence.
 389 // In this case the stack  has  to  be reordered in order to establish the
 390 // mother daughter relation using index ranges.
 391 //
 392   if(fHgwmk+1 == fNtrack) return kFALSE;
 393
 394   //
 395   // Howmany secondaries have been produced ?
 396   Int_t nNew = fNtrack - fHgwmk - 1;
 397
 398   if (nNew > 0) {
 399       Int_t i, j;
 400       TArrayI map1(nNew);
 401       //
 402       // Copy pointers to temporary array
 403       TParticle** tmp = new TParticle*[nNew];
 404
 405       for (i = 0; i < nNew; i++) {
 406           if (fParticleMap.At(fHgwmk + 1 + i)) {
 407               tmp[i] = GetParticleMapEntry(fHgwmk + 1 + i);
 408           } else {
 409               tmp[i] = 0x0;
 410           }
 411           map1[i] = -99;
 412       }
 413
 414
 415       //
 416       // Reset  LoadPoint
 417       //
 418       Int_t loadPoint = fHgwmk + 1;
 419       //
 420       // Re-Push particles into stack
 421       // The outer loop is over parents, the inner over children.
 422       // -1 refers to the primary particle
 423       //
 424       for (i = -1; i < nNew-1; i++) {
 425           Int_t ipa;
 426           TParticle* parP;
 427           if (i == -1) {
 428               ipa  = tmp[0]->GetFirstMother();
 429               parP = GetParticleMapEntry(ipa);
 430           } else {
 431               ipa = (fHgwmk + 1 + i);
 432               // Skip deleted particles
 433               if (!tmp[i])                          continue;
 434               // Skip particles without children
 435               if (tmp[i]->GetFirstDaughter() == -1) continue;
 436               parP = tmp[i];
 437           }
 438           // Reset daughter information
 439
 440           Int_t idaumin = parP->GetFirstDaughter() - fHgwmk - 1;
 441           Int_t idaumax = parP->GetLastDaughter()  - fHgwmk - 1;
 442           parP->SetFirstDaughter(-1);
 443           parP->SetLastDaughter(-1);
 444           for (j = idaumin; j <= idaumax; j++) {
 445               // Skip deleted particles
 446               if (!tmp[j])        continue;
 447               // Skip particles already handled
 448               if (map1[j] != -99) continue;
 449               Int_t jpa = tmp[j]->GetFirstMother();
 450               // Check if daughter of current parent
 451               if (jpa == ipa) {
 452                   fParticleMap[loadPoint] = tmp[j];
 453                   // Re-establish daughter information
 454                   parP->SetLastDaughter(loadPoint);
 455                   if (parP->GetFirstDaughter() == -1) parP->SetFirstDaughter(loadPoint);
 456                   // Set Mother information
 457                   if (i != -1) {
 458                       tmp[j]->SetFirstMother(map1[i]);
 459                   }
 460                   // Build the map
 461                   map1[j] = loadPoint;
 462                   // Increase load point
 463                   loadPoint++;
 464               }
 465           } // children
 466       } // parents
 467
 468       delete[] tmp;
 469
 470       //
 471       // Build map for remapping of hits
 472       //
 473       fTrackLabelMap.Set(fNtrack);
 474       for (i = 0; i < fNtrack; i ++) {
 475           if (i <= fHgwmk) {
 476               fTrackLabelMap[i] = i;
 477           } else{
 478               fTrackLabelMap[i] = map1[i - fHgwmk -1];
 479           }
 480       }
 481   } // new particles poduced
 482
 483   return kTRUE;
 484 }
 485
 486 Bool_t AliStack::KeepPhysics(const TParticle* part)
 487 {
 488     //
 489     // Some particles have to kept on the stack for reasons motivated
 490     // by physics analysis. Decision is put here.
 491     //
 492     Bool_t keep = kFALSE;
 493     //
 494     // Keep first-generation daughter from primaries with heavy flavor
 495     //
 496     Int_t parent = part->GetFirstMother();
 497     if (parent >= 0 && parent <= fHgwmk) {
 498         TParticle* father = GetParticleMapEntry(parent);
 499         Int_t kf = father->GetPdgCode();
 500         kf = TMath::Abs(kf);
 501         Int_t kfl = kf;
 502         // meson ?
 503         if  (kfl > 10) kfl/=100;
 504         // baryon
 505         if (kfl > 10) kfl/=10;
 506         if (kfl > 10) kfl/=10;
 507         if (kfl >= 4) {
 508             keep = kTRUE;
 509         }
 510     }
 511     return keep;
 512 }
 513
 514 //_____________________________________________________________________________
 515 void AliStack::FinishEvent()
 516 {
 517 //
 518 // Write out the kinematics that was not yet filled
 519 //
 520
 521 // Update event header
 522
 523   if (!TreeK()) {
 524 //    Fatal("FinishEvent", "No kinematics tree is defined.");
 525 //    Don't panic this is a probably a lego run
 526       return;
 527   }
 528
 529   CleanParents();
 530    if(TreeK()->GetEntries() ==0) {
 531     // set the fParticleFileMap size for the first time
 532     fParticleFileMap.Set(fHgwmk+1);
 533   }
 534
 535   Bool_t allFilled = kFALSE;
 536   TParticle *part;
 537   for(Int_t i=0; i<fHgwmk+1; ++i) {
 538     if((part=GetParticleMapEntry(i))) {
 539       fParticleBuffer = part;
 540       fParticleFileMap[i]= static_cast<Int_t>(TreeK()->GetEntries());
 541       TreeK()->Fill();
 542       fParticleBuffer=0;
 543       fParticleMap.AddAt(0,i);
 544
 545       // When all primaries were filled no particle!=0
 546       // should be left => to be removed later.
 547       if (allFilled) AliWarning(Form("Why != 0 part # %d?\n",i));
 548     }
 549     else
 550     {
 551       // // printf("Why = 0 part # %d?\n",i); => We know.
 552       // break;
 553       // we don't break now in order to be sure there is no
 554       // particle !=0 left.
 555       // To be removed later and replaced with break.
 556        if(!allFilled) allFilled = kTRUE;
 557     }
 558   }
 559 }
 560 //_____________________________________________________________________________
 561
 562 void AliStack::FlagTrack(Int_t track)
 563 {
 564   //
 565   // Flags a track and all its family tree to be kept
 566   //
 567
 568   TParticle *particle;
 569
 570   Int_t curr=track;
 571   while(1) {
 572     particle = GetParticleMapEntry(curr);
 573
 574     // If the particle is flagged the three from here upward is saved already
 575     if(particle->TestBit(kKeepBit)) return;
 576
 577     // Save this particle
 578     particle->SetBit(kKeepBit);
 579
 580     // Move to father if any
 581     if((curr=particle->GetFirstMother())==-1) return;
 582   }
 583 }
 584
 585 //_____________________________________________________________________________
 586 void AliStack::KeepTrack(Int_t track)
 587 {
 588   //
 589   // Flags a track to be kept
 590   //
 591
 592   fParticleMap.At(track)->SetBit(kKeepBit);
 593 }
 594
 595 //_____________________________________________________________________________
 596 void  AliStack::Clean(Int_t size)
 597 {
 598   //
 599   // Reset stack data except for fTreeK
 600   //
 601
 602   fNtrack=0;
 603   fNprimary=0;
 604   fHgwmk=0;
 605   fLoadPoint=0;
 606   fCurrent = -1;
 607   ResetArrays(size);
 608 }
 609
 610 //_____________________________________________________________________________
 611 void  AliStack::Reset(Int_t size)
 612 {
 613   //
 614   // Reset stack data including fTreeK
 615   //
 616
 617   Clean(size);
 618   delete fParticleBuffer; fParticleBuffer = 0;
 619   fTreeK = 0x0;
 620 }
 621
 622 //_____________________________________________________________________________
 623 void  AliStack::ResetArrays(Int_t size)
 624 {
 625   //
 626   // Resets stack arrays
 627   //
 628   fParticles.Clear();
 629   fParticleMap.Clear();
 630   if (size>0) fParticleMap.Expand(size);
 631 }
 632
 633 //_____________________________________________________________________________
 634 void AliStack::SetHighWaterMark(Int_t)
 635 {
 636   //
 637   // Set high water mark for last track in event
 638   //
 639
 640     fHgwmk = fNtrack-1;
 641     fCurrentPrimary=fHgwmk;
 642     // Set also number of primary tracks
 643     fNprimary = fHgwmk+1;
 644 }
 645
 646 //_____________________________________________________________________________
 647 TParticle* AliStack::Particle(Int_t i)
 648 {
 649   //
 650   // Return particle with specified ID
 651
 652   if(!fParticleMap.At(i)) {
 653     Int_t nentries = fParticles.GetEntriesFast();
 654     // algorithmic way of getting entry index
 655     // (primary particles are filled after secondaries)
 656     Int_t entry = TreeKEntry(i);
 657     // check whether algorithmic way and
 658     // and the fParticleFileMap[i] give the same;
 659     // give the fatal error if not
 660     if (entry != fParticleFileMap[i]) {
 661       AliFatal(Form(
 662         "!! The algorithmic way and map are different: !!\n entry: %d map: %d",
 663         entry, fParticleFileMap[i]));
 664     }
 665     // Load particle at entry into fParticleBuffer
 666     TreeK()->GetEntry(entry);
 667     // Add to the TClonesarray
 668     new (fParticles[nentries]) TParticle(*fParticleBuffer);
 669     // Store a pointer in the TObjArray
 670     fParticleMap.AddAt(fParticles[nentries],i);
 671   }
 672   return GetParticleMapEntry(i);
 673 }
 674
 675 //_____________________________________________________________________________
 676 TParticle* AliStack::ParticleFromTreeK(Int_t id) const
 677 {
 678 //
 679 // return pointer to TParticle with label id
 680 //
 681   Int_t entry;
 682   if ((entry = TreeKEntry(id)) < 0) return 0;
 683   if (fTreeK->GetEntry(entry)<=0) return 0;
 684   return fParticleBuffer;
 685 }
 686
 687 //_____________________________________________________________________________
 688 Int_t AliStack::TreeKEntry(Int_t id) const
 689 {
 690 //
 691 // Return entry number in the TreeK for particle with label id
 692 // Return negative number if label>fNtrack
 693 //
 694 // The order of particles in TreeK reflects the order of the transport of primaries and production of secondaries:
 695 //
 696 // Before transport there are fNprimary particles on the stack.
 697 // They are transported one by one and secondaries (fNtrack - fNprimary) are produced.
 698 // After the transport of each particles secondaries are written to the TreeK
 699 // They occupy the entries 0 ... fNtrack - fNprimary - 1
 700 // The primaries are written after they have been transported and occupy
 701 // fNtrack - fNprimary .. fNtrack - 1
 702
 703   Int_t entry;
 704   if (id<fNprimary)
 705     entry = id+fNtrack-fNprimary;
 706   else
 707     entry = id-fNprimary;
 708   return entry;
 709 }
 710
 711 //_____________________________________________________________________________
 712 Int_t AliStack::GetCurrentParentTrackNumber() const
 713 {
 714   //
 715   // Return number of the parent of the current track
 716   //
 717
 718   TParticle* current = GetParticleMapEntry(fCurrent);
 719
 720   if (current)
 721     return current->GetFirstMother();
 722   else {
 723     AliWarning("Current track not found in the stack");
 724     return -1;
 725   }
 726 }
 727
 728 //_____________________________________________________________________________
 729 Int_t AliStack::GetPrimary(Int_t id)
 730 {
 731   //
 732   // Return number of primary that has generated track
 733   //
 734
 735   int current, parent;
 736   //
 737   parent=id;
 738   while (1) {
 739     current=parent;
 740     parent=Particle(current)->GetFirstMother();
 741     if(parent<0) return current;
 742   }
 743 }
 744
 745 //_____________________________________________________________________________
 746 void AliStack::DumpPart (Int_t i) const
 747 {
 748   //
 749   // Dumps particle i in the stack
 750   //
 751   GetParticleMapEntry(i)->Print();
 752 }
 753
 754 //_____________________________________________________________________________
 755 void AliStack::DumpPStack ()
 756 {
 757   //
 758   // Dumps the particle stack
 759   //
 760
 761   Int_t i;
 762
 763   printf("\n\n=======================================================================\n");
 764   for (i=0;i<fNtrack;i++)
 765     {
 766       TParticle* particle = Particle(i);
 767       if (particle) {
 768         printf("-> %d ",i); particle->Print();
 769         printf("--------------------------------------------------------------\n");
 770       }
 771       else
 772         Warning("DumpPStack", "No particle with id %d.", i);
 773     }
 774
 775   printf("\n=======================================================================\n\n");
 776
 777   // print  particle file map
 778   // printf("\nParticle file map: \n");
 779   // for (i=0; i<fNtrack; i++)
 780   //     printf("   %d th entry: %d \n",i,fParticleFileMap[i]);
 781 }
 782
 783
 784 //_____________________________________________________________________________
 785 void AliStack::DumpLoadedStack() const
 786 {
 787   //
 788   // Dumps the particle in the stack
 789   // that are loaded in memory.
 790   //
 791
 792   printf(
 793          "\n\n=======================================================================\n");
 794   for (Int_t i=0;i<fNtrack;i++)
 795     {
 796       TParticle* particle = GetParticleMapEntry(i);
 797       if (particle) {
 798         printf("-> %d ",i); particle->Print();
 799         printf("--------------------------------------------------------------\n");
 800       }
 801       else {
 802         printf("-> %d  Particle not loaded.\n",i);
 803         printf("--------------------------------------------------------------\n");
 804       }
 805     }
 806   printf(
 807          "\n=======================================================================\n\n");
 808 }
 809
 810 //
 811 // protected methods
 812 //
 813
 814 //_____________________________________________________________________________
 815 void AliStack::CleanParents()
 816 {
 817   //
 818   // Clean particles stack
 819   // Set parent/daughter relations
 820   //
 821
 822   TParticle *part;
 823   int i;
 824   for(i=0; i<fHgwmk+1; i++) {
 825     part = GetParticleMapEntry(i);
 826     if(part) if(!part->TestBit(kDaughtersBit)) {
 827       part->SetFirstDaughter(-1);
 828       part->SetLastDaughter(-1);
 829     }
 830   }
 831 }
 832
 833 //_____________________________________________________________________________
 834 TParticle* AliStack::GetNextParticle()
 835 {
 836   //
 837   // Return next particle from stack of particles
 838   //
 839
 840   TParticle* particle = 0;
 841
 842   // search secondaries
 843   //for(Int_t i=fNtrack-1; i>=0; i--) {
 844   for(Int_t i=fNtrack-1; i>fHgwmk; i--) {
 845       particle = GetParticleMapEntry(i);
 846       if ((particle) && (!particle->TestBit(kDoneBit))) {
 847           fCurrent=i;
 848           return particle;
 849       }
 850   }
 851
 852   // take next primary if all secondaries were done
 853   while (fCurrentPrimary>=0) {
 854       fCurrent = fCurrentPrimary;
 855       particle = GetParticleMapEntry(fCurrentPrimary--);
 856       if ((particle) && (!particle->TestBit(kDoneBit))) {
 857           return particle;
 858       }
 859   }
 860
 861   // nothing to be tracked
 862   fCurrent = -1;
 863
 864
 865   return particle;
 866 }
 867 //__________________________________________________________________________________________
 868
 869 void AliStack::ConnectTree(TTree* tree)
 870 {
 871 //
 872 //  Creates branch for writing particles
 873 //
 874
 875   fTreeK = tree;
 876
 877   AliDebug(1, "Connecting TreeK");
 878   if (fTreeK == 0x0)
 879    {
 880     if (TreeK() == 0x0)
 881      {
 882       AliFatal("Parameter is NULL");//we don't like such a jokes
 883       return;
 884      }
 885     return;//in this case TreeK() calls back this method (ConnectTree)
 886            //tree after setting fTreeK, the rest was already executed
 887            //it is safe to return now
 888    }
 889
 890  //  Create a branch for particles
 891
 892   AliDebug(2, Form("Tree name is %s",fTreeK->GetName()));
 893
 894   if (fTreeK->GetDirectory())
 895    {
 896      AliDebug(2, Form("and dir is %s",fTreeK->GetDirectory()->GetName()));
 897    }
 898   else
 899     AliWarning("DIR IS NOT SET !!!");
 900
 901   TBranch *branch=fTreeK->GetBranch("Particles");
 902   if(branch == 0x0)
 903    {
 904     branch = fTreeK->Branch("Particles", "TParticle", &fParticleBuffer, 4000);
 905     AliDebug(2, "Creating Branch in Tree");
 906    }
 907   else
 908    {
 909     AliDebug(2, "Branch Found in Tree");
 910     branch->SetAddress(&fParticleBuffer);
 911    }
 912   if (branch->GetDirectory())
 913    {
 914     AliDebug(1, Form("Branch Dir Name is %s",branch->GetDirectory()->GetName()));
 915    }
 916   else
 917     AliWarning("Branch Dir is NOT SET");
 918 }
 919
 920 //_____________________________________________________________________________
 921
 922 Bool_t AliStack::GetEvent()
 923 {
 924 //
 925 // Get new event from TreeK
 926
 927     // Reset/Create the particle stack
 928     Int_t size = (Int_t)TreeK()->GetEntries();
 929     ResetArrays(size);
 930     return kTRUE;
 931 }
 932 //_____________________________________________________________________________
 933
 934 Bool_t AliStack::IsStable(Int_t pdg) const
 935 {
 936   //
 937   // Decide whether particle (pdg) is stable
 938   //
 939
 940
 941   // All ions/nucleons are considered as stable
 942   // Nuclear code is 10LZZZAAAI
 943   if(pdg>1000000000)return kTRUE;
 944
 945   const Int_t kNstable = 15;
 946   Int_t i;
 947
 948   Int_t pdgStable[kNstable] = {
 949     kGamma,             // Photon
 950     kElectron,          // Electron
 951     kMuonPlus,          // Muon
 952     kPiPlus,            // Pion
 953     kKPlus,             // Kaon
 954     kK0Short,           // K0s
 955     kK0Long,            // K0l
 956     kProton,            // Proton
 957     kNeutron,           // Neutron
 958     kLambda0,           // Lambda_0
 959     kSigmaMinus,        // Sigma Minus
 960     kSigmaPlus,         // Sigma Plus
 961     3312,               // Xsi Minus
 962     3322,               // Xsi
 963     3334,               // Omega
 964   };
 965
 966   Bool_t isStable = kFALSE;
 967   for (i = 0; i < kNstable; i++) {
 968     if (pdg == TMath::Abs(pdgStable[i])) {
 969       isStable = kTRUE;
 970       break;
 971     }
 972   }
 973
 974   return isStable;
 975 }
 976
 977 Bool_t AliStack::IsPhysicalPrimary(Int_t index)
 978 {
 979     //
 980     // Test if a particle is a physical primary according to the following definition:
 981     // Particles produced in the collision including products of strong and
 982     // electromagnetic decay and excluding feed-down from weak decays of strange
 983     // particles.
 984     //
 985     TParticle* p = Particle(index);
 986     Int_t ist = p->GetStatusCode();
 987
 988     //
 989     // Initial state particle
 990     if (ist > 1) return kFALSE;
 991
 992     Int_t pdg = TMath::Abs(p->GetPdgCode());
 993
 994     if (!IsStable(pdg)) return kFALSE;
 995
 996     if (index < GetNprimary()) {
 997 //
 998 // Particle produced by generator
 999         return kTRUE;
1000     } else {
1001 //
1002 // Particle produced during transport
1003 //
1004
1005         Int_t imo =  p->GetFirstMother();
1006         TParticle* pm  = Particle(imo);
1007         Int_t mpdg = TMath::Abs(pm->GetPdgCode());
1008 // Check if it comes from a pi0 decay
1009 //
1010 // What about the pi0 Dalitz ??
1011 //      if ((mpdg == kPi0) && (imo < GetNprimary())) return kTRUE;
1012
1013 // Check if this is a heavy flavor decay product
1014         Int_t mfl  = Int_t (mpdg / TMath::Power(10, Int_t(TMath::Log10(mpdg))));
1015         //
1016         // Light hadron
1017         if (mfl < 4) return kFALSE;
1018
1019         //
1020         // Heavy flavor hadron produced by generator
1021         if (imo <  GetNprimary()) {
1022             return kTRUE;
1023         }
1024
1025         // To be sure that heavy flavor has not been produced in a secondary interaction
1026         // Loop back to the generated mother
1027         while (imo >=  GetNprimary()) {
1028             imo = pm->GetFirstMother();
1029             pm  =  Particle(imo);
1030         }
1031         mpdg = TMath::Abs(pm->GetPdgCode());
1032         mfl  = Int_t (mpdg / TMath::Power(10, Int_t(TMath::Log10(mpdg))));
1033
1034         if (mfl < 4) {
1035             return kFALSE;
1036         } else {
1037             return kTRUE;
1038         }
1039     } // produced by generator ?
1040 }