STEER/STEER/AliMC.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 // This class is extracted from the AliRun class
  19 // and contains all the MC-related functionality
  20 // The number of dependencies has to be reduced...
  21 // Author: F.Carminati
  22 //         Federico.Carminati@cern.ch
  23
  24 #include <string.h>
  25
  26 #include <RVersion.h>
  27 #include <TArrayI.h>
  28 #include <TClonesArray.h>
  29 #include <TFile.h>
  30 #include <TGeoGlobalMagField.h>
  31 #include <TGeoManager.h>
  32 #include <TParticle.h>
  33 #include <TROOT.h>
  34 #include <TStopwatch.h>
  35 #include <TSystem.h>
  36 #include <TVirtualMC.h>
  37 #include <TMCVerbose.h>
  38 #include <TTree.h>
  39
  40 #include "AliCDBEntry.h"
  41 #include "AliCDBManager.h"
  42 #include "AliCDBStorage.h"
  43 #include "AliDetector.h"
  44 #include "AliGenerator.h"
  45 #include "AliGeomManager.h"
  46 #include "AliHeader.h"
  47 #include "AliHit.h"
  48 #include "AliLego.h"
  49 #include "AliLog.h"
  50 #include "AliMC.h"
  51 #include "AliMagF.h"
  52 #include "AliRun.h"
  53 #include "AliSimulation.h"
  54 #include "AliStack.h"
  55 #include "AliTrackReference.h"
  56 #include "AliTransportMonitor.h"
  57
  58 using std::endl;
  59 using std::cout;
  60 ClassImp(AliMC)
  61
  62 //_______________________________________________________________________
  63 AliMC::AliMC() :
  64   fGenerator(0),
  65   fSaveRndmStatus(kFALSE),
  66   fSaveRndmEventStatus(kFALSE),
  67   fReadRndmStatus(kFALSE),
  68   fUseMonitoring(kFALSE),
  69   fRndmFileName("random.root"),
  70   fEventEnergy(0),
  71   fSummEnergy(0),
  72   fSum2Energy(0),
  73   fTrRmax(1.e10),
  74   fTrZmax(1.e10),
  75   fRDecayMax(1.e10),
  76   fRDecayMin(-1.),
  77   fDecayPdg(0),
  78   fImedia(0),
  79   fTransParName("\0"),
  80   fMonitor(0),
  81   fHitLists(0),
  82   fTmpTreeTR(0),
  83   fTmpFileTR(0),
  84   fTrackReferences(),
  85   fTmpTrackReferences()
  86
  87 {
  88   //default constructor
  89   DecayLimits();
  90 }
  91
  92 //_______________________________________________________________________
  93 AliMC::AliMC(const char *name, const char *title) :
  94   TVirtualMCApplication(name, title),
  95   fGenerator(0),
  96   fSaveRndmStatus(kFALSE),
  97   fSaveRndmEventStatus(kFALSE),
  98   fReadRndmStatus(kFALSE),
  99   fUseMonitoring(kFALSE),
 100   fRndmFileName("random.root"),
 101   fEventEnergy(0),
 102   fSummEnergy(0),
 103   fSum2Energy(0),
 104   fTrRmax(1.e10),
 105   fTrZmax(1.e10),
 106   fRDecayMax(1.e10),
 107   fRDecayMin(-1.),
 108   fDecayPdg(0),
 109   fImedia(new TArrayI(1000)),
 110   fTransParName("\0"),
 111   fMonitor(0),
 112   fHitLists(new TList()),
 113   fTmpTreeTR(0),
 114   fTmpFileTR(0),
 115   fTrackReferences("AliTrackReference", 100),
 116   fTmpTrackReferences("AliTrackReference", 100)
 117 {
 118   //constructor
 119   // Set transport parameters
 120   SetTransPar();
 121   DecayLimits();
 122   // Prepare the tracking medium lists
 123   for(Int_t i=0;i<1000;i++) (*fImedia)[i]=-99;
 124 }
 125
 126 //_______________________________________________________________________
 127 AliMC::~AliMC()
 128 {
 129   //destructor
 130   delete fGenerator;
 131   delete fImedia;
 132   delete fHitLists;
 133   delete fMonitor;
 134   // Delete track references
 135 }
 136
 137 //_______________________________________________________________________
 138 void  AliMC::ConstructGeometry()
 139 {
 140   //
 141   // Either load geometry from file or create it through usual
 142   // loop on detectors. In the first case the method
 143   // AliModule::CreateMaterials() only builds fIdtmed and is postponed
 144   // at InitGeometry().
 145   //
 146
 147   if(AliSimulation::Instance()->IsGeometryFromFile()){ //load geometry either from CDB or from file
 148     if(IsGeometryFromCDB()){
 149       AliInfo("Loading geometry from CDB default storage");
 150       AliCDBPath path("GRP","Geometry","Data");
 151       AliCDBEntry *entry=AliCDBManager::Instance()->Get(path.GetPath());
 152       if(!entry) AliFatal("Unable to load geometry from CDB!");
 153       entry->SetOwner(0);
 154       gGeoManager = (TGeoManager*) entry->GetObject();
 155       if (!gGeoManager) AliFatal("TGeoManager object not found in the specified CDB entry!");
 156     }else{
 157       // Load geometry
 158       const char *geomfilename = AliSimulation::Instance()->GetGeometryFile();
 159       if(gSystem->ExpandPathName(geomfilename)){
 160         AliInfo(Form("Loading geometry from file:\n %40s",geomfilename));
 161         TGeoManager::Import(geomfilename);
 162       }else{
 163         AliInfo(Form("Geometry file %40s not found!\n",geomfilename));
 164         return;
 165       }
 166     }
 167     TVirtualMC::GetMC()->SetRootGeometry();
 168   }else{
 169     // Create modules, materials, geometry
 170     if (!gGeoManager) new TGeoManager("ALICE", "ALICE geometry");
 171     TStopwatch stw;
 172     TIter next(gAlice->Modules());
 173     AliModule *detector;
 174     AliDebug(1, "Geometry creation:");
 175     while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 176       stw.Start();
 177       // Initialise detector materials and geometry
 178       detector->CreateMaterials();
 179       detector->CreateGeometry();
 180       AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 181                    detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 182     }
 183   }
 184
 185 }
 186
 187 //_______________________________________________________________________
 188 Bool_t  AliMC::MisalignGeometry()
 189 {
 190   // Call misalignment code if AliSimulation object was defined.
 191
 192   if(!AliSimulation::Instance()->IsGeometryFromFile()){
 193     //Set alignable volumes for the whole geometry
 194     SetAllAlignableVolumes();
 195   }
 196   // Misalign geometry via AliSimulation instance
 197   if (!AliSimulation::Instance()) return kFALSE;
 198   AliGeomManager::SetGeometry(gGeoManager);
 199   if(!AliGeomManager::CheckSymNamesLUT("ALL"))
 200     AliFatal("Current loaded geometry differs in the definition of symbolic names!");
 201
 202   return AliSimulation::Instance()->MisalignGeometry(AliRunLoader::Instance());
 203 }
 204
 205 //_______________________________________________________________________
 206 void  AliMC::ConstructOpGeometry()
 207 {
 208   //
 209   // Loop all detector modules and call DefineOpticalProperties() method
 210   //
 211
 212   TIter next(gAlice->Modules());
 213   AliModule *detector;
 214   AliInfo("Optical properties definition");
 215   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 216     // Initialise detector geometry
 217     if(AliSimulation::Instance()->IsGeometryFromFile()) detector->CreateMaterials();
 218     // Initialise detector optical properties
 219     detector->DefineOpticalProperties();
 220   }
 221 }
 222
 223 #include <TPDGCode.h>
 224 //_______________________________________________________________________
 225 void  AliMC::AddParticles()
 226 {
 227   //
 228   // Add particles (not present in Geant3 or Geant4)
 229   //
 230
 231   cout << "########## AliMC::AddParticles"  << endl;
 232
 233   //Hypertriton
 234   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(1010010030, "HyperTriton", kPTHadron, 2.99131 , 1.0, 2.632e-10,"Ion", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 3, kFALSE);
 235   //Anti-Hypertriton
 236   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(-1010010030, "AntiHyperTriton", kPTHadron, 2.99131 , 1.0, 2.632e-10,"Ion", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 3, kFALSE);
 237
 238   //Hyper hydrogen 4
 239   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(1010010040, "Hyperhydrog4", kPTHadron, 3.931 , 1.0, 2.632e-10,"Ion", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 4, kFALSE);
 240   //Anti-Hyper hydrogen 4
 241   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(-1010010040, "AntiHyperhydrog4", kPTHadron, 3.931 , 1.0, 2.632e-10,"Ion", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 4, kFALSE);
 242
 243   //Hyper helium 4
 244   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(1010020040, "Hyperhelium4", kPTHadron, 3.929 , 2.0, 2.632e-10,"Ion", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 4, kFALSE);
 245   //Anti-Hyper helium 4
 246   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(-1010020040, "AntiHyperhelium4", kPTHadron, 3.929 , 2.0, 2.632e-10,"Ion", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 4, kFALSE);
 247
 248   //Lambda-Neutron
 249   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(1010000020, "LambdaNeutron", kPTNeutron, 2.054 , 0.0, 2.632e-10,"Hadron", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, kFALSE);
 250
 251   //Anti-Lambda-Neutron
 252   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(-1010000020, "AntiLambdaNeutron", kPTNeutron, 2.054 , 0.0, 2.632e-10,"Hadron", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, kFALSE);
 253
 254   //H-Dibaryon
 255   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(1020000020, "Hdibaryon", kPTNeutron, 2.23, 0.0, 2.632e-10,"Hadron", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, kFALSE);
 256   //Anti-H-Dibaryon
 257   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(-1020000020, "AntiHdibaryon", kPTNeutron, 2.23, 0.0, 2.632e-10,"Hadron", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, kFALSE);
 258
 259   //Xi-Proton
 260   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(1030000020, "Xi0Proton", kPTHadron, 2.248 , 1.0, 1.333e-10,"Ion", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, kFALSE);
 261
 262   //Anti-Xi-Proton
 263   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(-1030000020, "AntiXi0Proton", kPTHadron, 2.248 , 1.0, 1.333e-10,"Ion", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, kFALSE);
 264
 265   //Lambda-Neutron-Neutron
 266   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(1010000030, "LambdaNeutronNeutron", kPTNeutron, 2.982 , 0.0, 2.632e-10,"Hadron", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, kFALSE);
 267
 268   //Anti-Lambda-Neutron-Neutron
 269   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(-1010000030, "AntiLambdaNeutronNeutron", kPTNeutron, 2.982 , 0.0, 2.632e-10,"Hadron", 0.0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, kFALSE);
 270
 271   //Resonances not in Generators
 272   // f0(980) assume 70 MeV as width (PDG: 40 to 100 MeV)
 273   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(9010221, "f0_980", kPTNeutron, 0.98 , 0.0, 9.403e-24,"Hadron", 7e-2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, kTRUE);
 274
 275   // f2(1270) (PDG: width = 185 MeV)
 276   TVirtualMC::GetMC()->DefineParticle(225, "f2_1270", kPTNeutron, 1.275 , 0.0, 3.558e-24,"Hadron", 0.185, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, kTRUE);
 277
 278   // Define the 2- and 3-body phase space decay for the Hyper-Triton
 279   Int_t mode[6][3];
 280   Float_t bratio[6];
 281
 282   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
 283      bratio[kz] = 0.;
 284      mode[kz][0] = 0;
 285      mode[kz][1] = 0;
 286      mode[kz][2] = 0;
 287   }
 288   bratio[0] = 50.;
 289   mode[0][0] = 1000020030; // Helium3
 290   mode[0][1] = -211; // negative pion
 291
 292   bratio[1] = 50.;
 293   mode[1][0] = 1000010020; // deuteron
 294   mode[1][1] = 2212; // proton
 295   mode[1][2] = -211; // negative pion
 296
 297   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(1010010030,bratio,mode);
 298
 299
 300
 301   // Define the 2- and 3-body phase space decay for the Anti-Hyper-Triton
 302   Int_t amode[6][3];
 303   Float_t abratio[6];
 304
 305   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
 306      abratio[kz] = 0.;
 307      amode[kz][0] = 0;
 308      amode[kz][1] = 0;
 309      amode[kz][2] = 0;
 310   }
 311   abratio[0] = 50.;
 312   amode[0][0] = -1000020030; // anti- Helium3
 313   amode[0][1] = 211; // positive pion
 314   abratio[1] = 50.;
 315   amode[1][0] = -1000010020; // anti-deuteron
 316   amode[1][1] = -2212; // anti-proton
 317   amode[1][2] = 211; // positive pion
 318
 319   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(-1010010030,abratio,amode);
 320
 321   ////// ----------Hypernuclei with Mass=4 ----------- //////////
 322
 323    // Define the 2- and 3-body phase space decay for the Hyper Hydrogen 4
 324
 325   Int_t mode3[6][3];
 326   Float_t bratio3[6];
 327
 328   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
 329      bratio3[kz] = 0.;
 330      mode3[kz][0] = 0;
 331      mode3[kz][1] = 0;
 332      mode3[kz][2] = 0;
 333   }
 334   bratio3[0] = 50.;
 335   mode3[0][0] = 1000020040; // Helium4
 336   mode3[0][1] = -211; // negative pion
 337
 338   bratio3[1] = 50.;
 339   mode3[1][0] = 1000010030; // tritium
 340   mode3[1][1] = 2212; // proton
 341   mode3[1][2] = -211; // negative pion
 342
 343   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(1010010040,bratio3,mode3);
 344
 345
 346   // Define the 2- and 3-body phase space decay for the Hyper Hydrogen 4
 347   Int_t amode3[6][3];
 348   Float_t abratio3[6];
 349
 350   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
 351      abratio3[kz] = 0.;
 352      amode3[kz][0] = 0;
 353      amode3[kz][1] = 0;
 354      amode3[kz][2] = 0;
 355   }
 356   abratio3[0] = 50.;
 357   amode3[0][0] = -1000020040; // anti- Helium4
 358   amode3[0][1] = 211; // positive pion
 359   abratio3[1] = 50.;
 360   amode3[1][0] = -1000010030; // anti-tritium
 361   amode3[1][1] = -2212; // anti-proton
 362   amode3[1][2] = 211; // positive pion
 363
 364   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(-1010010040,abratio3,amode3);
 365
 366
 367    // Define the 3-body phase space decay for the Hyper Helium 4
 368   Int_t mode4[6][3];
 369   Float_t bratio4[6];
 370
 371   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
 372      bratio4[kz] = 0.;
 373      mode4[kz][0] = 0;
 374      mode4[kz][1] = 0;
 375      mode4[kz][2] = 0;
 376   }
 377   bratio4[0] = 100.;
 378   mode4[0][0] = 1000020030; // Helium3
 379   mode4[0][1] = -211; // negative pion
 380   mode4[0][2] = 2212; // proton
 381
 382   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(1010020040,bratio4,mode4);
 383
 384
 385   // Define the 2-body phase space decay for the Anti-Hyper Helium 4
 386   Int_t amode4[6][3];
 387   Float_t abratio4[6];
 388
 389   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
 390      abratio4[kz] = 0.;
 391      amode4[kz][0] = 0;
 392      amode4[kz][1] = 0;
 393      amode4[kz][2] = 0;
 394   }
 395   abratio4[0] = 100.;
 396   amode4[0][0] = -1000020030; // anti-Helium 3
 397   amode4[0][1] = 211; // positive pion
 398   amode4[0][2] = -2212; // anti proton
 399
 400   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(-1010020040,abratio4,amode4);
 401
 402
 403   // Define the 2-body phase space decay for the Lambda-neutron boundstate
 404   Int_t mode1[6][3];
 405   Float_t bratio1[6];
 406
 407   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
 408      bratio1[kz] = 0.;
 409      mode1[kz][0] = 0;
 410      mode1[kz][1] = 0;
 411      mode1[kz][2] = 0;
 412   }
 413   bratio1[0] = 100.;
 414   mode1[0][0] = 1000010020; // deuteron
 415   mode1[0][1] = -211; // negative pion
 416
 417   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(1010000020,bratio1,mode1);
 418
 419
 420   // Define the 2-body phase space decay for the Anti-Lambda-neutron boundstate
 421   Int_t amode1[6][3];
 422   Float_t abratio1[6];
 423
 424   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
 425      abratio1[kz] = 0.;
 426      amode1[kz][0] = 0;
 427      amode1[kz][1] = 0;
 428      amode1[kz][2] = 0;
 429   }
 430   abratio1[0] = 100.;
 431   amode1[0][0] = -1000010020; // anti-deuteron
 432   amode1[0][1] = 211; // positive pion
 433
 434   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(-1010000020,abratio1,amode1);
 435
 436   // Define the 2-body phase space decay for the H-Dibaryon
 437   Int_t mode2[6][3];
 438   Float_t bratio2[6];
 439
 440   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
 441      bratio2[kz] = 0.;
 442      mode2[kz][0] = 0;
 443      mode2[kz][1] = 0;
 444      mode2[kz][2] = 0;
 445   }
 446   bratio2[0] = 100.;
 447   mode2[0][0] = 3122; // Lambda
 448   mode2[0][1] = 2212; // proton
 449   mode2[0][2] = -211; // negative pion
 450
 451   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(1020000020,bratio2,mode2);
 452
 453   // Define the 2-body phase space decay for the Anti-H-Dibaryon
 454   Int_t amode2[6][3];
 455   Float_t abratio2[6];
 456
 457   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
 458      abratio2[kz] = 0.;
 459      amode2[kz][0] = 0;
 460      amode2[kz][1] = 0;
 461      amode2[kz][2] = 0;
 462   }
 463   abratio2[0] = 100.;
 464   amode2[0][0] = -3122; // anti-deuteron
 465   amode2[0][1] = -2212; // anti-proton
 466   amode2[0][2] = 211; // positive pion
 467
 468   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(-1020000020,abratio2,amode2);
 469
 470   // Define the 2-body phase space decay for the Xi0P
 471   Int_t mode5[6][3];
 472   Float_t bratio5[6];
 473
 474   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
 475     bratio5[kz] = 0.;
 476     mode5[kz][0] = 0;
 477     mode5[kz][1] = 0;
 478     mode5[kz][2] = 0;
 479   }
 480   bratio5[0] = 100.;
 481   mode5[0][0] = 3122; // Lambda
 482   mode5[0][1] = 2212; // proton
 483
 484   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(1030000020,bratio5,mode5);
 485
 486   // Define the 2-body phase space decay for the Anti-Xi0P
 487   Int_t amode5[6][3];
 488   Float_t abratio5[6];
 489
 490   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
 491     abratio5[kz] = 0.;
 492     amode5[kz][0] = 0;
 493     amode5[kz][1] = 0;
 494     amode5[kz][2] = 0;
 495   }
 496   abratio5[0] = 100.;
 497   amode5[0][0] = -3122; // anti-Lambda
 498   amode5[0][1] = -2212; // anti-proton
 499
 500   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(-1030000020,abratio5,amode5);
 501
 502   // Define the 2-body phase space decay for the Lambda-Neutron-Neutron
 503   Int_t mode6[6][3];
 504   Float_t bratio6[6];
 505
 506   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
 507     bratio6[kz] = 0.;
 508     mode6[kz][0] = 0;
 509     mode6[kz][1] = 0;
 510     mode6[kz][2] = 0;
 511   }
 512   bratio6[0] = 100.;
 513   mode6[0][0] = 1000010030; // triton
 514   mode6[0][1] = -211; // pion
 515
 516   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(1010000030,bratio6,mode6);
 517
 518   // Define the 2-body phase space decay for the Anti-Lambda-Neutron-Neutron
 519   Int_t amode6[6][3];
 520   Float_t abratio6[6];
 521
 522   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
 523     abratio6[kz] = 0.;
 524     amode6[kz][0] = 0;
 525     amode6[kz][1] = 0;
 526     amode6[kz][2] = 0;
 527   }
 528   abratio6[0] = 100.;
 529   amode6[0][0] = -1000010030; // anti-triton
 530   amode6[0][1] = 211; // pion
 531
 532   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(-1010000030,abratio6,amode6);
 533
 534   ///////////////////////////////////////////////////////////////////
 535
 536   // Define the 2-body phase space decay for the f0(980)
 537 //  Int_t mode[6][3];
 538 //  Float_t bratio[6];
 539
 540   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
 541     bratio[kz] = 0.;
 542     mode[kz][0] = 0;
 543     mode[kz][1] = 0;
 544     mode[kz][2] = 0;
 545   }
 546   bratio[0] = 100.;
 547   mode[0][0] = 211; // pion
 548   mode[0][1] = -211; // pion
 549
 550   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(9010221,bratio,mode);
 551
 552     // Define the 2-body phase space decay for the f2(1270)
 553 //  Int_t mode[6][3];
 554 //  Float_t bratio[6];
 555
 556   for (Int_t kz = 0; kz < 6; kz++) {
 557     bratio[kz] = 0.;
 558     mode[kz][0] = 0;
 559     mode[kz][1] = 0;
 560     mode[kz][2] = 0;
 561   }
 562   bratio[0] = 100.;
 563   mode[0][0] = 211; // pion
 564   mode[0][1] = -211; // pion
 565
 566   TVirtualMC::GetMC()->SetDecayMode(225,bratio,mode);
 567
 568
 569   // --------------------------------------------------------------------
 570 }
 571
 572 //_______________________________________________________________________
 573 void  AliMC::InitGeometry()
 574 {
 575   //
 576   // Initialize detectors
 577   //
 578
 579   AliInfo("Initialisation:");
 580   TStopwatch stw;
 581   TIter next(gAlice->Modules());
 582   AliModule *detector;
 583   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 584     stw.Start();
 585     detector->Init();
 586     AliInfo(Form("%10s R:%.2fs C:%.2fs",
 587                  detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime()));
 588   }
 589 }
 590
 591 //_______________________________________________________________________
 592 void AliMC::SetGeometryFromCDB()
 593 {
 594   // Set the loading of geometry from cdb instead of creating it
 595   // A default CDB storage needs to be set before this method is called
 596   if(AliCDBManager::Instance()->IsDefaultStorageSet() &&
 597      AliCDBManager::Instance()->GetRun() >= 0)
 598     AliSimulation::Instance()->SetGeometryFile("*OCDB*");
 599   else
 600     AliError("Loading of geometry from CDB ignored. First set a default CDB storage!");
 601 }
 602
 603 //_______________________________________________________________________
 604 Bool_t AliMC::IsGeometryFromCDB() const
 605 {
 606   return (strcmp(AliSimulation::Instance()->GetGeometryFile(),"*OCDB*")==0);
 607 }
 608
 609 //_______________________________________________________________________
 610 void  AliMC::SetAllAlignableVolumes()
 611 {
 612   //
 613   // Add alignable volumes (TGeoPNEntries) looping on all
 614   // active modules
 615   //
 616
 617   AliInfo(Form("Setting entries for all alignable volumes of active detectors"));
 618   AliModule *detector;
 619   TIter next(gAlice->Modules());
 620   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 621     detector->AddAlignableVolumes();
 622   }
 623 }
 624
 625 //_______________________________________________________________________
 626 void  AliMC::GeneratePrimaries()
 627 {
 628   //
 629   // Generate primary particles and fill them in the stack.
 630   //
 631
 632   Generator()->Generate();
 633 }
 634
 635 //_______________________________________________________________________
 636 void AliMC::SetGenerator(AliGenerator *generator)
 637 {
 638   //
 639   // Load the event generator
 640   //
 641   if(!fGenerator) fGenerator = generator;
 642 }
 643
 644 //_______________________________________________________________________
 645 void AliMC::ResetGenerator(AliGenerator *generator)
 646 {
 647   //
 648   // Load the event generator
 649   //
 650   if(fGenerator) {
 651     if(generator) {
 652       AliWarning(Form("Replacing generator %s with %s",
 653                       fGenerator->GetName(),generator->GetName()));
 654     }
 655     else {
 656       AliWarning(Form("Replacing generator %s with NULL",
 657                       fGenerator->GetName()));
 658     }
 659   }
 660   fGenerator = generator;
 661 }
 662
 663 //_______________________________________________________________________
 664 void AliMC::FinishRun()
 665 {
 666   // Clean generator information
 667   AliDebug(1, "fGenerator->FinishRun()");
 668   fGenerator->FinishRun();
 669
 670   // Monitoring information
 671   if (fMonitor) {
 672     fMonitor->Print();
 673     fMonitor->Export("timing.root");
 674   }
 675
 676   //Output energy summary tables
 677   AliDebug(1, "EnergySummary()");
 678   ToAliDebug(1, EnergySummary());
 679 }
 680
 681 //_______________________________________________________________________
 682 void AliMC::BeginPrimary()
 683 {
 684   //
 685   // Called  at the beginning of each primary track
 686   //
 687
 688   // Reset Hits info
 689   ResetHits();
 690   ResetTrackReferences();
 691 }
 692
 693 //_______________________________________________________________________
 694 void AliMC::PreTrack()
 695 {
 696   // Actions before the track's transport
 697
 698      //verbose.PreTrack();
 699
 700      TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 701      AliModule *module;
 702
 703      for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 704        if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 705          module->PreTrack();
 706 }
 707
 708 //_______________________________________________________________________
 709 void AliMC::Stepping()
 710 {
 711   //
 712   // Called at every step during transport
 713   //
 714   //verbose.Stepping();
 715
 716   Int_t id = DetFromMate(TVirtualMC::GetMC()->CurrentMedium());
 717   if (id < 0) return;
 718
 719
 720   if ( TVirtualMC::GetMC()->IsNewTrack()            &&
 721        TVirtualMC::GetMC()->TrackTime() == 0.       &&
 722        fRDecayMin >= 0.             &&
 723        fRDecayMax > fRDecayMin      &&
 724        TVirtualMC::GetMC()->TrackPid() == fDecayPdg )
 725   {
 726       FixParticleDecaytime();
 727   }
 728
 729   // --- If monitoring timing was requested, monitor the step
 730   if (fUseMonitoring) {
 731     if (!fMonitor) {
 732       fMonitor = new AliTransportMonitor(TVirtualMC::GetMC()->NofVolumes()+1);
 733       fMonitor->Start();
 734     }
 735     if (TVirtualMC::GetMC()->IsNewTrack() || TVirtualMC::GetMC()->TrackTime() == 0. || TVirtualMC::GetMC()->TrackStep()<1.1E-10) {
 736       fMonitor->DummyStep();
 737     } else {
 738     // Normal stepping
 739       Int_t copy;
 740       Int_t volId = TVirtualMC::GetMC()->CurrentVolID(copy);
 741       Int_t pdg = TVirtualMC::GetMC()->TrackPid();
 742       TLorentzVector xyz, pxpypz;
 743       TVirtualMC::GetMC()->TrackPosition(xyz);
 744       TVirtualMC::GetMC()->TrackMomentum(pxpypz);
 745       fMonitor->StepInfo(volId, pdg, pxpypz.E(), xyz.X(), xyz.Y(), xyz.Z());
 746     }
 747   }
 748   //
 749   // --- If lego option, do it and leave
 750   if (AliSimulation::Instance()->Lego())
 751     AliSimulation::Instance()->Lego()->StepManager();
 752   else {
 753     Int_t copy;
 754     //Update energy deposition tables
 755     AddEnergyDeposit(TVirtualMC::GetMC()->CurrentVolID(copy),TVirtualMC::GetMC()->Edep());
 756     //
 757     // write tracke reference for track which is dissapearing - MI
 758
 759     if (TVirtualMC::GetMC()->IsTrackDisappeared() && !(TVirtualMC::GetMC()->IsTrackAlive())) {
 760         if (TVirtualMC::GetMC()->Etot() > 0.05) AddTrackReference(GetCurrentTrackNumber(),
 761                                                 AliTrackReference::kDisappeared);
 762
 763
 764     }
 765
 766     //Call the appropriate stepping routine;
 767     AliModule *det = dynamic_cast<AliModule*>(gAlice->Modules()->At(id));
 768     if(det && det->StepManagerIsEnabled()) {
 769       det->StepManager();
 770     }
 771   }
 772 }
 773
 774 //_______________________________________________________________________
 775 void AliMC::EnergySummary()
 776 {
 777   //e
 778   // Print summary of deposited energy
 779   //
 780
 781   Int_t ndep=0;
 782   Float_t edtot=0;
 783   Float_t ed, ed2;
 784   Int_t kn, i, left, j, id;
 785   const Float_t kzero=0;
 786   Int_t ievent=AliRunLoader::Instance()->GetHeader()->GetEvent()+1;
 787   //
 788   // Energy loss information
 789   if(ievent) {
 790     printf("***************** Energy Loss Information per event (GEV) *****************\n");
 791     for(kn=1;kn<fEventEnergy.GetSize();kn++) {
 792       ed=fSummEnergy[kn];
 793       if(ed>0) {
 794         fEventEnergy[ndep]=kn;
 795         if(ievent>1) {
 796           ed=ed/ievent;
 797           ed2=fSum2Energy[kn];
 798           ed2=ed2/ievent;
 799           ed2=100*TMath::Sqrt(TMath::Max(ed2-ed*ed,kzero))/ed;
 800         } else
 801           ed2=99;
 802         fSummEnergy[ndep]=ed;
 803         fSum2Energy[ndep]=TMath::Min(static_cast<Float_t>(99.),TMath::Max(ed2,kzero));
 804         edtot+=ed;
 805         ndep++;
 806       }
 807     }
 808     for(kn=0;kn<(ndep-1)/3+1;kn++) {
 809       left=ndep-kn*3;
 810       for(i=0;i<(3<left?3:left);i++) {
 811         j=kn*3+i;
 812         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 813         printf(" %s %10.3f +- %10.3f%%;",TVirtualMC::GetMC()->VolName(id),fSummEnergy[j],fSum2Energy[j]);
 814       }
 815       printf("\n");
 816     }
 817     //
 818     // Relative energy loss in different detectors
 819     printf("******************** Relative Energy Loss per event ********************\n");
 820     printf("Total energy loss per event %10.3f GeV\n",edtot);
 821     for(kn=0;kn<(ndep-1)/5+1;kn++) {
 822       left=ndep-kn*5;
 823       for(i=0;i<(5<left?5:left);i++) {
 824         j=kn*5+i;
 825         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 826         printf(" %s %10.3f%%;",TVirtualMC::GetMC()->VolName(id),100*fSummEnergy[j]/edtot);
 827       }
 828       printf("\n");
 829     }
 830     for(kn=0;kn<75;kn++) printf("*");
 831     printf("\n");
 832   }
 833   //
 834   // Reset the TArray's
 835   //  fEventEnergy.Set(0);
 836   //  fSummEnergy.Set(0);
 837   //  fSum2Energy.Set(0);
 838 }
 839 #include <TFile.h>
 840 //_____________________________________________________________________________
 841 void AliMC::BeginEvent()
 842 {
 843   //
 844   // Clean-up previous event
 845   // Energy scores
 846   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 847   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 848   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 849   AliDebug(1, "          BEGINNING EVENT               ");
 850   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 851   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 852   AliDebug(1, ">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 853
 854   AliRunLoader *runloader=AliRunLoader::Instance();
 855
 856   /*******************************/
 857   /*   Clean after eventual      */
 858   /*   previous event            */
 859   /*******************************/
 860
 861
 862   //Set the next event in Run Loader -> Cleans trees (TreeK and all trees in detectors),
 863   gAlice->SetEventNrInRun(gAlice->GetEventNrInRun()+1);
 864   runloader->SetEventNumber(gAlice->GetEventNrInRun());// sets new files, cleans the previous event stuff, if necessary, etc.,
 865   AliDebug(1, Form("EventNr is %d",gAlice->GetEventNrInRun()));
 866
 867   fEventEnergy.Reset();
 868     // Clean detector information
 869
 870   if (runloader->Stack())
 871       runloader->Stack()->Reset();//clean stack -> tree is unloaded
 872   else
 873       runloader->MakeStack();//or make a new one
 874
 875   // Random engine status
 876   //
 877
 878   if ( fSaveRndmStatus || fSaveRndmEventStatus) {
 879     TString fileName="random";
 880     if ( fSaveRndmEventStatus ) {
 881       fileName += "Evt";
 882       fileName += gAlice->GetEventNrInRun();
 883     }
 884     fileName += ".root";
 885
 886     // write ROOT random engine status
 887     cout << "Saving random engine status in " << fileName.Data() << endl;
 888     TFile f(fileName.Data(),"RECREATE");
 889     gRandom->Write(fileName.Data());
 890   }
 891
 892   if ( fReadRndmStatus ) {
 893     //read ROOT random engine status
 894     cout << "Reading random engine status from " << fRndmFileName.Data() << endl;
 895     TFile f(fRndmFileName.Data());
 896     gRandom->Read(fRndmFileName.Data());
 897   }
 898
 899   if(AliSimulation::Instance()->Lego() == 0x0)
 900   {
 901       AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(K)");
 902       runloader->MakeTree("K");
 903   }
 904
 905   AliDebug(1, "TVirtualMC::GetMC()->SetStack(fRunLoader->Stack())");
 906   TVirtualMC::GetMC()->SetStack(runloader->Stack());//Was in InitMC - but was moved here
 907                                      //because we don't have guarantee that
 908                                      //stack pointer is not going to change from event to event
 909                          //since it bellobgs to header and is obtained via RunLoader
 910   //
 911   //  Reset all Detectors & kinematics & make/reset trees
 912   //
 913
 914   runloader->GetHeader()->Reset(AliCDBManager::Instance()->GetRun(),gAlice->GetEvNumber(),
 915                                 gAlice->GetEventNrInRun());
 916 //  fRunLoader->WriteKinematics("OVERWRITE");  is there any reason to rewrite here since MakeTree does so
 917
 918   if(AliSimulation::Instance()->Lego())
 919   {
 920       AliSimulation::Instance()->Lego()->BeginEvent();
 921       return;
 922   }
 923
 924
 925   AliDebug(1, "ResetHits()");
 926   ResetHits();
 927
 928   AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTree(H)");
 929   runloader->MakeTree("H");
 930
 931
 932
 933   MakeTmpTrackRefsTree();
 934   //create new branches and SetAdresses
 935   TIter next(gAlice->Modules());
 936   AliModule *detector;
 937   while((detector = (AliModule*)next()))
 938    {
 939        AliDebug(2, Form("%s->MakeBranch(H)",detector->GetName()));
 940        detector->MakeBranch("H");
 941    }
 942 }
 943
 944 //_______________________________________________________________________
 945 void AliMC::ResetHits()
 946 {
 947   //
 948   //  Reset all Detectors hits
 949   //
 950   TIter next(gAlice->Modules());
 951   AliModule *detector;
 952   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 953      detector->ResetHits();
 954   }
 955 }
 956
 957 //_______________________________________________________________________
 958 void AliMC::ResetDigits()
 959 {
 960   //
 961   //  Reset all Detectors digits
 962   //
 963   TIter next(gAlice->Modules());
 964   AliModule *detector;
 965   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 966      detector->ResetDigits();
 967   }
 968 }
 969
 970 //_______________________________________________________________________
 971 void AliMC::ResetSDigits()
 972 {
 973   //
 974   //  Reset all Detectors digits
 975   //
 976   TIter next(gAlice->Modules());
 977   AliModule *detector;
 978   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 979      detector->ResetSDigits();
 980   }
 981 }
 982
 983 //_______________________________________________________________________
 984 void AliMC::PostTrack()
 985 {
 986   // Posts tracks for each module
 987
 988   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 989   AliModule *module;
 990
 991   for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 992     if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 993       module->PostTrack();
 994 }
 995
 996 //_______________________________________________________________________
 997 void AliMC::FinishPrimary()
 998 {
 999   //
1000   // Called  at the end of each primary track
1001   //
1002
1003   AliRunLoader *runloader=AliRunLoader::Instance();
1004   //  static Int_t count=0;
1005   //  const Int_t times=10;
1006   // This primary is finished, purify stack
1007 #if ROOT_VERSION_CODE > 262152
1008   if (!(TVirtualMC::GetMC()->SecondariesAreOrdered())) {
1009       if (runloader->Stack()->ReorderKine()) RemapHits();
1010   }
1011 #endif
1012   if (runloader->Stack()->PurifyKine()) RemapHits();
1013
1014   TIter next(gAlice->Modules());
1015   AliModule *detector;
1016   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
1017     detector->FinishPrimary();
1018     AliLoader* loader = detector->GetLoader();
1019     if(loader)
1020      {
1021        TTree* treeH = loader->TreeH();
1022        if (treeH) treeH->Fill(); //can be Lego run and treeH can not exist
1023      }
1024   }
1025
1026   // Write out track references if any
1027   if (fTmpTreeTR) fTmpTreeTR->Fill();
1028 }
1029
1030 void AliMC::RemapHits()
1031 {
1032 //
1033 // Remaps the track labels of the hits
1034     AliRunLoader *runloader=AliRunLoader::Instance();
1035     AliStack* stack = runloader->Stack();
1036     TList* hitLists = GetHitLists();
1037     TIter next(hitLists);
1038     TCollection *hitList;
1039
1040     while((hitList = dynamic_cast<TCollection*>(next()))) {
1041         TIter nexthit(hitList);
1042         AliHit *hit;
1043         while((hit = dynamic_cast<AliHit*>(nexthit()))) {
1044             hit->SetTrack(stack->TrackLabel(hit->GetTrack()));
1045         }
1046     }
1047
1048     //
1049     // This for detectors which have a special mapping mechanism
1050     // for hits, such as TPC and TRD
1051     //
1052
1053
1054     TObjArray* modules = gAlice->Modules();
1055     TIter nextmod(modules);
1056     AliModule *module;
1057     while((module = (AliModule*) nextmod())) {
1058         AliDetector* det = dynamic_cast<AliDetector*> (module);
1059         if (det) det->RemapTrackHitIDs(stack->TrackLabelMap());
1060     }
1061     //
1062     RemapTrackReferencesIDs(stack->TrackLabelMap());
1063 }
1064
1065 //_______________________________________________________________________
1066 void AliMC::FinishEvent()
1067 {
1068   //
1069   // Called at the end of the event.
1070   //
1071
1072   if(AliSimulation::Instance()->Lego()) AliSimulation::Instance()->Lego()->FinishEvent();
1073
1074   TIter next(gAlice->Modules());
1075   AliModule *detector;
1076   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
1077     detector->FinishEvent();
1078   }
1079
1080   //Update the energy deposit tables
1081   Int_t i;
1082   for(i=0;i<fEventEnergy.GetSize();i++)
1083    {
1084     fSummEnergy[i]+=fEventEnergy[i];
1085     fSum2Energy[i]+=fEventEnergy[i]*fEventEnergy[i];
1086    }
1087
1088   AliRunLoader *runloader=AliRunLoader::Instance();
1089
1090   AliHeader* header = runloader->GetHeader();
1091   AliStack* stack = runloader->Stack();
1092   if ( (header == 0x0) || (stack == 0x0) )
1093    {//check if we got header and stack. If not cry and exit aliroot
1094     AliFatal("Can not get the stack or header from LOADER");
1095     return;//never reached
1096    }
1097   // Update Header information
1098   header->SetNprimary(stack->GetNprimary());
1099   header->SetNtrack(stack->GetNtrack());
1100   header->SetTimeStamp(AliSimulation::Instance()->GenerateTimeStamp());
1101
1102   // Write out the kinematics
1103   if (!AliSimulation::Instance()->Lego()) stack->FinishEvent();
1104
1105   // Synchronize the TreeTR with TreeK
1106   if (fTmpTreeTR) ReorderAndExpandTreeTR();
1107
1108   // Write out the event Header information
1109   TTree* treeE = runloader->TreeE();
1110   if (treeE)
1111    {
1112       header->SetStack(stack);
1113       treeE->Fill();
1114    }
1115   else
1116    {
1117     AliError("Can not get TreeE from RL");
1118    }
1119
1120   if(AliSimulation::Instance()->Lego() == 0x0)
1121    {
1122      runloader->WriteKinematics("OVERWRITE");
1123      runloader->WriteTrackRefs("OVERWRITE");
1124      runloader->WriteHits("OVERWRITE");
1125    }
1126
1127   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
1128   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
1129   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
1130   AliDebug(1, "          FINISHING EVENT               ");
1131   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
1132   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
1133   AliDebug(1, "<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
1134 }
1135
1136 //_______________________________________________________________________
1137 void AliMC::Init()
1138 {
1139   // MC initialization
1140
1141
1142    //=================Create Materials and geometry
1143    TVirtualMC::GetMC()->Init();
1144   // Set alignable volumes for the whole geometry (with old root)
1145 #if ROOT_VERSION_CODE < 331527
1146   SetAllAlignableVolumes();
1147 #endif
1148    //Read the cuts for all materials
1149    ReadTransPar();
1150    //Build the special IMEDIA table
1151    MediaTable();
1152
1153    //Compute cross-sections
1154    TVirtualMC::GetMC()->BuildPhysics();
1155
1156    //Initialise geometry deposition table
1157    fEventEnergy.Set(TVirtualMC::GetMC()->NofVolumes()+1);
1158    fSummEnergy.Set(TVirtualMC::GetMC()->NofVolumes()+1);
1159    fSum2Energy.Set(TVirtualMC::GetMC()->NofVolumes()+1);
1160
1161    // Register MC in configuration
1162    AliConfig::Instance()->Add(TVirtualMC::GetMC());
1163 }
1164
1165 //_______________________________________________________________________
1166 void AliMC::MediaTable()
1167 {
1168   //
1169   // Built media table to get from the media number to
1170   // the detector id
1171   //
1172
1173   Int_t kz, nz, idt, lz, i, k, ind;
1174   //  Int_t ibeg;
1175   TObjArray &dets = *gAlice->Detectors();
1176   AliModule *det;
1177   Int_t ndets=gAlice->GetNdets();
1178   //
1179   // For all detectors
1180   for (kz=0;kz<ndets;kz++) {
1181     // If detector is defined
1182     if((det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[kz]))) {
1183         TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
1184         for(nz=0;nz<100;nz++) {
1185
1186         // Find max and min material number
1187         if((idt=idtmed[nz])) {
1188           det->LoMedium() = det->LoMedium() < idt ? det->LoMedium() : idt;
1189           det->HiMedium() = det->HiMedium() > idt ? det->HiMedium() : idt;
1190         }
1191       }
1192       if(det->LoMedium() > det->HiMedium()) {
1193         det->LoMedium() = 0;
1194         det->HiMedium() = 0;
1195       } else {
1196         if(det->HiMedium() > fImedia->GetSize()) {
1197           AliError(Form("Increase fImedia from %d to %d",
1198                         fImedia->GetSize(),det->HiMedium()));
1199           return;
1200         }
1201         // Tag all materials in rage as belonging to detector kz
1202         for(lz=det->LoMedium(); lz<= det->HiMedium(); lz++) {
1203           (*fImedia)[lz]=kz;
1204         }
1205       }
1206     }
1207   }
1208   //
1209   // Print summary table
1210   AliInfo("Tracking media ranges:");
1211   ToAliInfo(
1212   for(i=0;i<(ndets-1)/6+1;i++) {
1213     for(k=0;k< (6<ndets-i*6?6:ndets-i*6);k++) {
1214       ind=i*6+k;
1215       det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[ind]);
1216       if(det)
1217         printf(" %6s: %3d -> %3d;",det->GetName(),det->LoMedium(),
1218                det->HiMedium());
1219       else
1220         printf(" %6s: %3d -> %3d;","NULL",0,0);
1221     }
1222     printf("\n");
1223   }
1224             );
1225 }
1226
1227 //_______________________________________________________________________
1228 void AliMC::ReadTransPar()
1229 {
1230   //
1231   // Read filename to set the transport parameters
1232   //
1233
1234
1235   const Int_t kncuts=10;
1236   const Int_t knflags=12;
1237   const Int_t knpars=kncuts+knflags;
1238   const char kpars[knpars][7] = {"CUTGAM" ,"CUTELE","CUTNEU","CUTHAD","CUTMUO",
1239                                "BCUTE","BCUTM","DCUTE","DCUTM","PPCUTM","ANNI",
1240                                "BREM","COMP","DCAY","DRAY","HADR","LOSS",
1241                                "MULS","PAIR","PHOT","RAYL","STRA"};
1242   char line[256];
1243   char detName[7];
1244   char* filtmp;
1245   Float_t cut[kncuts];
1246   Int_t flag[knflags];
1247   Int_t i, itmed, iret, jret, ktmed, kz;
1248   FILE *lun;
1249   //
1250   // See whether the file is there
1251   filtmp=gSystem->ExpandPathName(fTransParName.Data());
1252   lun=fopen(filtmp,"r");
1253   delete [] filtmp;
1254   if(!lun) {
1255     AliWarning(Form("File %s does not exist!",fTransParName.Data()));
1256     return;
1257   }
1258   //
1259   while(1) {
1260     // Initialise cuts and flags
1261     for(i=0;i<kncuts;i++) cut[i]=-99;
1262     for(i=0;i<knflags;i++) flag[i]=-99;
1263     itmed=0;
1264     memset(line,0,256);
1265     // Read up to the end of line excluded
1266     iret=fscanf(lun,"%255[^\n]",line);
1267     if(iret<0) {
1268       //End of file
1269       fclose(lun);
1270       return;
1271     }
1272     // Read the end of line
1273     jret = fscanf(lun,"%*c");
1274     if(!iret) continue;
1275     if(line[0]=='*') continue;
1276     // Read the numbers
1277     iret=sscanf(line,"%6s %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f %f %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d",
1278                 detName,&itmed,&cut[0],&cut[1],&cut[2],&cut[3],&cut[4],&cut[5],&cut[6],&cut[7],&cut[8],
1279                 &cut[9],&flag[0],&flag[1],&flag[2],&flag[3],&flag[4],&flag[5],&flag[6],&flag[7],
1280                 &flag[8],&flag[9],&flag[10],&flag[11]);
1281     if(!iret) continue;
1282     if(iret<0) {
1283       //reading error
1284       AliWarning(Form("Error reading file %s",fTransParName.Data()));
1285       continue;
1286     }
1287     // Check that the module exist
1288     AliModule *mod = gAlice->GetModule(detName);
1289     if(mod) {
1290       // Get the array of media numbers
1291       TArrayI &idtmed = *mod->GetIdtmed();
1292       // Check that the tracking medium code is valid
1293       if(0<=itmed && itmed < 100) {
1294         ktmed=idtmed[itmed];
1295         if(!ktmed) {
1296           AliWarning(Form("Invalid tracking medium code %d for %s",itmed,mod->GetName()));
1297           continue;
1298         }
1299         // Set energy thresholds
1300         for(kz=0;kz<kncuts;kz++) {
1301           if(cut[kz]>=0) {
1302             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10.3E for tracking medium code %4d for %s",
1303                              kpars[kz],cut[kz],itmed,mod->GetName()));
1304             TVirtualMC::GetMC()->Gstpar(ktmed,kpars[kz],cut[kz]);
1305           }
1306         }
1307         // Set transport mechanisms
1308         for(kz=0;kz<knflags;kz++) {
1309           if(flag[kz]>=0) {
1310             AliDebug(2, Form("%-6s set to %10d for tracking medium code %4d for %s",
1311                              kpars[kncuts+kz],flag[kz],itmed,mod->GetName()));
1312             TVirtualMC::GetMC()->Gstpar(ktmed,kpars[kncuts+kz],Float_t(flag[kz]));
1313           }
1314         }
1315       } else {
1316         AliWarning(Form("Invalid medium code %d",itmed));
1317         continue;
1318       }
1319     } else {
1320       AliDebug(1, Form("%s not present",detName));
1321       continue;
1322     }
1323   }
1324 }
1325
1326 //_______________________________________________________________________
1327 void AliMC::SetTransPar(const char *filename)
1328 {
1329   //
1330   // Sets the file name for transport parameters
1331   //
1332   fTransParName = filename;
1333 }
1334
1335 //_______________________________________________________________________
1336 void AliMC::AddHit(Int_t id, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits) const
1337 {
1338   //
1339   //  Add a hit to detector id
1340   //
1341   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
1342   if(dets[id]) static_cast<AliModule*>(dets[id])->AddHit(track,vol,hits);
1343 }
1344
1345 //_______________________________________________________________________
1346 void AliMC::AddDigit(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *digits) const
1347 {
1348   //
1349   // Add digit to detector id
1350   //
1351   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
1352   if(dets[id]) static_cast<AliModule*>(dets[id])->AddDigit(tracks,digits);
1353 }
1354
1355 //_______________________________________________________________________
1356 Int_t AliMC::GetCurrentTrackNumber() const {
1357   //
1358   // Returns current track
1359   //
1360   return AliRunLoader::Instance()->Stack()->GetCurrentTrackNumber();
1361 }
1362
1363 //_______________________________________________________________________
1364 void AliMC::DumpPart (Int_t i) const
1365 {
1366   //
1367   // Dumps particle i in the stack
1368   //
1369   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1370    if (runloader->Stack())
1371     runloader->Stack()->DumpPart(i);
1372 }
1373
1374 //_______________________________________________________________________
1375 void AliMC::DumpPStack () const
1376 {
1377   //
1378   // Dumps the particle stack
1379   //
1380   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1381    if (runloader->Stack())
1382     runloader->Stack()->DumpPStack();
1383 }
1384
1385 //_______________________________________________________________________
1386 Int_t AliMC::GetNtrack() const {
1387   //
1388   // Returns number of tracks in stack
1389   //
1390   Int_t ntracks = -1;
1391   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1392    if (runloader->Stack())
1393      ntracks = runloader->Stack()->GetNtrack();
1394    return ntracks;
1395 }
1396
1397 //_______________________________________________________________________
1398 Int_t AliMC::GetPrimary(Int_t track) const
1399 {
1400   //
1401   // return number of primary that has generated track
1402   //
1403   Int_t nprimary = -999;
1404   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1405   if (runloader->Stack())
1406     nprimary = runloader->Stack()->GetPrimary(track);
1407   return nprimary;
1408 }
1409
1410 //_______________________________________________________________________
1411 TParticle* AliMC::Particle(Int_t i) const
1412 {
1413   // Returns the i-th particle from the stack taking into account
1414   // the remaping done by PurifyKine
1415   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1416   if (runloader)
1417    if (runloader->Stack())
1418     return runloader->Stack()->Particle(i);
1419   return 0x0;
1420 }
1421
1422 //_______________________________________________________________________
1423 const TObjArray* AliMC::Particles() const {
1424   //
1425   // Returns pointer to Particles array
1426   //
1427   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1428   if (runloader)
1429    if (runloader->Stack())
1430     return runloader->Stack()->Particles();
1431   return 0x0;
1432 }
1433
1434 //_______________________________________________________________________
1435 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg, const Float_t *pmom,
1436                       const Float_t *vpos, const Float_t *polar, Float_t tof,
1437                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
1438 {
1439 // Delegate to stack
1440 //
1441   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1442   if (runloader)
1443     if (runloader->Stack())
1444       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, pmom, vpos, polar, tof,
1445                                     mech, ntr, weight, is);
1446 }
1447
1448 //_______________________________________________________________________
1449 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg,
1450                       Double_t px, Double_t py, Double_t pz, Double_t e,
1451                       Double_t vx, Double_t vy, Double_t vz, Double_t tof,
1452                       Double_t polx, Double_t poly, Double_t polz,
1453                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is) const
1454 {
1455   // Delegate to stack
1456   //
1457   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1458   if (runloader)
1459     if (runloader->Stack())
1460       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, px, py, pz, e, vx, vy, vz, tof,
1461                                     polx, poly, polz, mech, ntr, weight, is);
1462 }
1463
1464 //_______________________________________________________________________
1465 void AliMC::SetHighWaterMark(Int_t nt) const
1466 {
1467     //
1468     // Set high water mark for last track in event
1469   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1470   if (runloader)
1471     if (runloader->Stack())
1472       runloader->Stack()->SetHighWaterMark(nt);
1473 }
1474
1475 //_______________________________________________________________________
1476 void AliMC::KeepTrack(Int_t track) const
1477 {
1478   //
1479   // Delegate to stack
1480   //
1481   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1482   if (runloader)
1483     if (runloader->Stack())
1484       runloader->Stack()->KeepTrack(track);
1485 }
1486
1487 //_______________________________________________________________________
1488 void AliMC::FlagTrack(Int_t track) const
1489 {
1490   // Delegate to stack
1491   //
1492   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1493   if (runloader)
1494     if (runloader->Stack())
1495       runloader->Stack()->FlagTrack(track);
1496 }
1497
1498 //_______________________________________________________________________
1499 void AliMC::SetCurrentTrack(Int_t track) const
1500 {
1501   //
1502   // Set current track number
1503   //
1504   AliRunLoader * runloader = AliRunLoader::Instance();
1505   if (runloader)
1506     if (runloader->Stack())
1507       runloader->Stack()->SetCurrentTrack(track);
1508 }
1509
1510 //_______________________________________________________________________
1511 AliTrackReference*  AliMC::AddTrackReference(Int_t label, Int_t id)
1512 {
1513   //
1514   // add a trackrefernce to the list
1515   Int_t primary = GetPrimary(label);
1516   Particle(primary)->SetBit(kKeepBit);
1517
1518   Int_t nref = fTmpTrackReferences.GetEntriesFast();
1519   return new(fTmpTrackReferences[nref]) AliTrackReference(label, id);
1520 }
1521
1522
1523
1524 //_______________________________________________________________________
1525 void AliMC::ResetTrackReferences()
1526 {
1527   //
1528   //  Reset all  references
1529   //
1530     fTmpTrackReferences.Clear();
1531 }
1532
1533 //_______________________________________________________________________
1534 void AliMC::RemapTrackReferencesIDs(const Int_t *map)
1535 {
1536   //
1537   // Remapping track reference
1538   // Called at finish primary
1539   //
1540
1541   Int_t nEntries = fTmpTrackReferences.GetEntries();
1542   for (Int_t i=0; i < nEntries; i++){
1543       AliTrackReference * ref = dynamic_cast<AliTrackReference*>(fTmpTrackReferences.UncheckedAt(i));
1544       if (ref) {
1545           Int_t newID = map[ref->GetTrack()];
1546           if (newID>=0) ref->SetTrack(newID);
1547           else {
1548               ref->SetBit(kNotDeleted,kFALSE);
1549               fTmpTrackReferences.RemoveAt(i);
1550           }
1551       } // if ref
1552   }
1553   fTmpTrackReferences.Compress();
1554 }
1555
1556 //_______________________________________________________________________
1557 void AliMC::FixParticleDecaytime()
1558 {
1559     //
1560     // Fix the particle decay time according to rmin and rmax for decays
1561     //
1562
1563     TLorentzVector p;
1564     TVirtualMC::GetMC()->TrackMomentum(p);
1565     Double_t tmin, tmax;
1566     Double_t b;
1567
1568     // Transverse velocity
1569     Double_t vt    = p.Pt() / p.E();
1570
1571     if ((b = ((AliMagF*)TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField())->SolenoidField()) > 0.) {     // [kG]
1572
1573         // Radius of helix
1574
1575         Double_t rho   = p.Pt() / 0.0003 / b; // [cm]
1576
1577         // Revolution frequency
1578
1579         Double_t omega = vt / rho;
1580
1581         // Maximum and minimum decay time
1582         //
1583         // Check for curlers first
1584         const Double_t kOvRhoSqr2 = 1./(rho*TMath::Sqrt(2.));
1585         if (fRDecayMax * kOvRhoSqr2 > 1.) return;
1586
1587         //
1588
1589         tmax  = TMath::ACos((1.-fRDecayMax*kOvRhoSqr2)*(1.+fRDecayMax*kOvRhoSqr2)) / omega;   // [ct]
1590         tmin  = TMath::ACos((1.-fRDecayMin*kOvRhoSqr2)*(1.+fRDecayMin*kOvRhoSqr2)) / omega;   // [ct]
1591     } else {
1592         tmax =  fRDecayMax / vt;                                                      // [ct]
1593         tmin =  fRDecayMin / vt;                                                      // [ct]
1594     }
1595
1596     //
1597     // Dial t using the two limits
1598     Double_t t = tmin + (tmax - tmin) * gRandom->Rndm();                              // [ct]
1599     //
1600     //
1601     // Force decay time in transport code
1602     //
1603     TVirtualMC::GetMC()->ForceDecayTime(t / 2.99792458e10);
1604 }
1605
1606 void AliMC::MakeTmpTrackRefsTree()
1607 {
1608     // Make the temporary track reference tree
1609     fTmpFileTR = new TFile("TrackRefsTmp.root", "recreate");
1610     fTmpTreeTR = new TTree("TreeTR", "Track References");
1611     TClonesArray* pRef = &fTmpTrackReferences;
1612     fTmpTreeTR->Branch("TrackReferences", &pRef, 4000);
1613 }
1614
1615 //_______________________________________________________________________
1616 void AliMC::ReorderAndExpandTreeTR()
1617 {
1618 //
1619 //  Reorder and expand the temporary track reference tree in order to match the kinematics tree
1620 //
1621
1622     AliRunLoader *rl = AliRunLoader::Instance();
1623 //
1624 //  TreeTR
1625     AliDebug(1, "fRunLoader->MakeTrackRefsContainer()");
1626     rl->MakeTrackRefsContainer();
1627     TTree * treeTR = rl->TreeTR();
1628         // make branch for central track references
1629         TClonesArray* pRef = &fTrackReferences;
1630         treeTR->Branch("TrackReferences", &pRef);
1631
1632     AliStack* stack  = rl->Stack();
1633     Int_t np = stack->GetNprimary();
1634     Int_t nt = fTmpTreeTR->GetEntries();
1635     //
1636     // Loop over tracks and find the secondaries with the help of the kine tree
1637     Int_t ifills = 0;
1638     Int_t it = 0;
1639     for (Int_t ip = np - 1; ip > -1; ip--) {
1640         TParticle *part = stack->Particle(ip);
1641         //printf("Particle %5d %5d %5d %5d %5d \n", ip, part->GetPdgCode(), part->GetFirstMother(), part->GetFirstDaughter(), part->GetLastDaughter());
1642
1643         // Skip primaries that have not been transported
1644         Int_t dau1  = part->GetFirstDaughter();
1645         Int_t dau2  = -1;
1646         if (!part->TestBit(kTransportBit)) continue;
1647         //
1648         fTmpTreeTR->GetEntry(it++);
1649         Int_t nh = fTmpTrackReferences.GetEntries();
1650         // Determine range of secondaries produced by this primary
1651         if (dau1 > -1) {
1652             Int_t inext = ip - 1;
1653             while (dau2 < 0) {
1654                 if (inext >= 0) {
1655                     part = stack->Particle(inext);
1656                     dau2 =  part->GetFirstDaughter();
1657                     if (!(part->TestBit(kTransportBit)) || dau2 == -1 || dau2 < np) {
1658 //                  if (dau2 == -1 || dau2 < np) {
1659                         dau2 = -1;
1660                     } else {
1661                         dau2--;
1662                     }
1663                 } else {
1664                     dau2 = stack->GetNtrack() - 1;
1665                 }
1666                 inext--;
1667             } // find upper bound
1668         }  // dau2 < 0
1669 //      printf("Check (1) %5d %5d %5d %5d %5d \n", ip, np, it, dau1, dau2);
1670         //
1671         // Loop over reference hits and find secondary label
1672         for (Int_t id = dau1; (id <= dau2) && (dau1 > -1); id++) {
1673             for (Int_t ih = 0; ih < nh; ih++) {
1674                 AliTrackReference* tr = (AliTrackReference*) fTmpTrackReferences.At(ih);
1675                 Int_t label = tr->Label();
1676                 // Skip primaries
1677                 if (label == ip) continue;
1678                 if (label > dau2 || label < dau1)
1679                     AliWarning(Form("Track Reference Label out of range !: %5d %5d %5d \n", label, dau1, dau2));
1680                 if (label == id) {
1681                     // secondary found
1682                     Int_t nref =  fTrackReferences.GetEntriesFast();
1683                     new(fTrackReferences[nref]) AliTrackReference(*tr);
1684                 }
1685             } // hits
1686             treeTR->Fill();
1687             fTrackReferences.Clear();
1688             ifills++;
1689         } // daughters
1690     } // tracks
1691     //
1692     // Now loop again and write the primaries
1693     it = nt - 1;
1694     for (Int_t ip = 0; ip < np; ip++) {
1695         TParticle* part = stack->Particle(ip);
1696 //      if ((part->GetFirstDaughter() == -1 && part->GetStatusCode() <= 1) || part->GetFirstDaughter() >= np)
1697         if (part->TestBit(kTransportBit))
1698         {
1699             // Skip particles that have not been transported
1700             fTmpTreeTR->GetEntry(it--);
1701             Int_t nh = fTmpTrackReferences.GetEntries();
1702             //
1703             // Loop over reference hits and find primary labels
1704             for (Int_t ih = 0; ih < nh; ih++) {
1705                 AliTrackReference* tr = (AliTrackReference*)  fTmpTrackReferences.At(ih);
1706                 Int_t label = tr->Label();
1707                 if (label == ip) {
1708                     Int_t nref = fTrackReferences.GetEntriesFast();
1709                     new(fTrackReferences[nref]) AliTrackReference(*tr);
1710                 }
1711             }
1712         }
1713         treeTR->Fill();
1714         fTrackReferences.Clear();
1715         ifills++;
1716     } // tracks
1717     // Check
1718     if (ifills != stack->GetNtrack())
1719         AliWarning(Form("Number of entries in TreeTR (%5d) unequal to TreeK (%5d) \n", ifills, stack->GetNtrack()));
1720 //
1721 //  Clean-up
1722     delete fTmpTreeTR;
1723     fTmpFileTR->Close();
1724     delete fTmpFileTR;
1725     fTmpTrackReferences.Clear();
1726     gSystem->Exec("rm -rf TrackRefsTmp.root");
1727 }
1728