TOF/AliTOFClusterFinder.cxx

   1 /***************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /*
  17 $Log: AliTOFClusterFinder.cxx,v $
  18 Revision 1.31  2007/11/24 14:53:19  zampolli
  19 Status flag implemented as UChar_t
  20
  21 Revision 1.30  2007/10/04 13:08:52  arcelli
  22 updates to comply with AliTOFGeometryV5 becoming AliTOFGeometry
  23
  24 Revision 1.29  2007/10/03 10:42:33  arcelli
  25 updates to handle new AliTOFcluster, inheriting form AliCluster3D
  26
  27 Revision 1.28  2007/05/31 16:06:05  arcelli
  28 move instance of AliRawStream outside loop on DDL
  29
  30 Revision 1.27  2007/05/02 16:31:49  arcelli
  31 Add methods to handle single event reconstruction. retrieval of Calib info moved to AliTOFReconstructor ctor, and passed via a pointer to AliTOFcalib
  32
  33 Revision 1.26  2007/04/30 19:02:24  arcelli
  34 hopefully the last refinements for correct type conversion in calibration
  35
  36 Revision 1.25  2007/04/30 15:22:17  arcelli
  37 Change TOF digit Time, Tot etc to int type
  38
  39 Revision 1.24  2007/04/27 11:19:31  arcelli
  40 updates for the new decoder
  41
  42 Revision 1.23  2007/04/23 16:51:39  decaro
  43 Digits-to-raw_data conversion: correction for a more real description (A.De Caro, R.Preghenella)
  44
  45 Revision 1.22  2007/04/19 17:26:32  arcelli
  46 Fix a bug (add some debug printout
  47
  48 Revision 1.21  2007/04/18 17:28:12  arcelli
  49 Set the ToT bin width to the one actually used...
  50
  51 Revision 1.20  2007/03/09 09:57:23  arcelli
  52  Remove a forgotten include of Riostrem
  53
  54 Revision 1.19  2007/03/08 15:41:20  arcelli
  55 set uncorrected times when filling RecPoints
  56
  57 Revision 1.18  2007/03/06 16:31:20  arcelli
  58 Add Uncorrected TOF Time signal
  59
  60 Revision 1.17  2007/02/28 18:09:11  arcelli
  61 Add protection against failed retrieval of the CDB cal object, now Reconstruction exits with AliFatal
  62
  63 Revision 1.16  2007/02/20 15:57:00  decaro
  64 Raw data update: to read the TOF raw data defined in UNPACKED mode
  65
  66
  67 Revision 0.03  2005/07/28 A. De Caro
  68          Implement public method
  69          Raw2Digits(Int_t, AliRawReader *)
  70          to convert digits from raw data in MC digits
  71          (temporary solution)
  72
  73 Revision 0.02  2005/07/27 A. De Caro
  74          Implement public method
  75          Digits2RecPoint(Int_t)
  76          to convert digits in clusters
  77
  78 Revision 0.02  2005/07/26 A. De Caro
  79          Implement private methods
  80          InsertCluster(AliTOFcluster *)
  81          FindClusterIndex(Double_t)
  82          originally implemented in AliTOFtracker
  83          by S. Arcelli and C. Zampolli
  84
  85 Revision 0.01  2005/07/25 A. De Caro
  86          Implement public methods
  87          Digits2RecPoint(AliRawReader *, TTree *)
  88          Digits2RecPoint(Int_t, AliRawReader *)
  89          to convert raw data in clusters
  90  */
  91
  92 ////////////////////////////////////////////////////////////////
  93 //                                                            //
  94 //         Class for TOF cluster finder                       //
  95 //                                                            //
  96 // Starting from Raw Data, create rec points,                 //
  97 //                         fill TreeR for TOF,                //
  98 //                         write TOF.RecPoints.root file      //
  99 //                                                            //
 100 ////////////////////////////////////////////////////////////////
 101
 102 #include "Riostream.h"
 103
 104 #include "TClonesArray.h"
 105 #include "TStopwatch.h"
 106 #include "TTree.h"
 107 //#include <TGeoManager.h>
 108 #include <TGeoMatrix.h>
 109 //#include <TGeoPhysicalNode.h>
 110
 111 #include "AliDAQ.h"
 112 #include "AliLoader.h"
 113 #include "AliLog.h"
 114 #include "AliRawReader.h"
 115 #include "AliRunLoader.h"
 116 //#include "AliAlignObj.h"
 117 #include <AliGeomManager.h>
 118
 119 #include "AliTOFcalib.h"
 120 #include "AliTOFChannelOnline.h"
 121 #include "AliTOFChannelOnlineStatus.h"
 122 #include "AliTOFChannelOffline.h"
 123 #include "AliTOFClusterFinder.h"
 124 #include "AliTOFcluster.h"
 125 #include "AliTOFdigit.h"
 126 #include "AliTOFGeometry.h"
 127 #include "AliTOFrawData.h"
 128 #include "AliTOFRawStream.h"
 129
 130 //extern TFile *gFile;
 131
 132 ClassImp(AliTOFClusterFinder)
 133
 134 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(AliTOFcalib *calib):
 135   fRunLoader(0),
 136   fTOFLoader(0),
 137   fTreeD(0),
 138   fTreeR(0),
 139   fDigits(new TClonesArray("AliTOFdigit", 4000)),
 140   fRecPoints(new TClonesArray("AliTOFcluster", 4000)),
 141   fNumberOfTofClusters(0),
 142   fVerbose(0),
 143   fDecoderVersion(0),
 144   fTOFcalib(calib)
 145 {
 146 //
 147 // Constructor
 148 //
 149
 150 }
 151 //______________________________________________________________________________
 152
 153 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(AliRunLoader* runLoader, AliTOFcalib *calib):
 154   fRunLoader(runLoader),
 155   fTOFLoader(runLoader->GetLoader("TOFLoader")),
 156   fTreeD(0),
 157   fTreeR(0),
 158   fDigits(new TClonesArray("AliTOFdigit", 4000)),
 159   fRecPoints(new TClonesArray("AliTOFcluster", 4000)),
 160   fNumberOfTofClusters(0),
 161   fVerbose(0),
 162   fDecoderVersion(0),
 163   fTOFcalib(calib)
 164 {
 165 //
 166 // Constructor
 167 //
 168
 169 }
 170
 171 //------------------------------------------------------------------------
 172 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(const AliTOFClusterFinder &source)
 173   :TObject(),
 174   fRunLoader(0),
 175   fTOFLoader(0),
 176   fTreeD(0),
 177   fTreeR(0),
 178   fDigits(new TClonesArray("AliTOFdigit", 4000)),
 179   fRecPoints(new TClonesArray("AliTOFcluster", 4000)),
 180   fNumberOfTofClusters(0),
 181   fVerbose(0),
 182   fDecoderVersion(0),
 183   fTOFcalib(0)
 184 {
 185   // copy constructor
 186   this->fDigits=source.fDigits;
 187   this->fRecPoints=source.fRecPoints;
 188   this->fDecoderVersion=source.fDecoderVersion;
 189   this->fTOFcalib=source.fTOFcalib;
 190
 191 }
 192
 193 //------------------------------------------------------------------------
 194 AliTOFClusterFinder& AliTOFClusterFinder::operator=(const AliTOFClusterFinder &source)
 195 {
 196   // ass. op.
 197   this->fDigits=source.fDigits;
 198   this->fRecPoints=source.fRecPoints;
 199   this->fVerbose=source.fVerbose;
 200   this->fDecoderVersion=source.fDecoderVersion;
 201   this->fTOFcalib=source.fTOFcalib;
 202   return *this;
 203
 204 }
 205 //______________________________________________________________________________
 206
 207 AliTOFClusterFinder::~AliTOFClusterFinder()
 208 {
 209
 210   //
 211   // Destructor
 212   //
 213
 214   if (fDigits)
 215     {
 216       fDigits->Delete();
 217       delete fDigits;
 218       fDigits=0;
 219     }
 220   if (fRecPoints)
 221     {
 222       fRecPoints->Delete();
 223       delete fRecPoints;
 224       fRecPoints=0;
 225     }
 226
 227 }
 228 //______________________________________________________________________________
 229
 230 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent)
 231 {
 232   //
 233   // Converts digits to recpoints for TOF
 234   //
 235
 236   TStopwatch stopwatch;
 237   stopwatch.Start();
 238
 239   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 240
 241   fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
 242   if (fTreeD == 0x0)
 243     {
 244       AliFatal("AliTOFClusterFinder: Can not get TreeD");
 245     }
 246
 247   TBranch *branch = fTreeD->GetBranch("TOF");
 248   if (!branch) {
 249     AliError("can't get the branch with the TOF digits !");
 250     return;
 251   }
 252
 253   TClonesArray *digits = new TClonesArray("AliTOFdigit",10000);
 254   branch->SetAddress(&digits);
 255
 256   ResetRecpoint();
 257
 258   fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 259   if (fTreeR == 0x0)
 260     {
 261       fTOFLoader->MakeTree("R");
 262       fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 263     }
 264
 265   Int_t bufsize = 32000;
 266   fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 267
 268   fTreeD->GetEvent(0);
 269   Int_t nDigits = digits->GetEntriesFast();
 270   AliDebug(2,Form("Number of TOF digits: %d",nDigits));
 271
 272   Int_t ii;
 273   Int_t dig[5]; //cluster detector indeces
 274   Int_t  parTOF[5]; //The TOF signal parameters
 275   Bool_t status=kTRUE; // assume all sim channels ok in the beginning...
 276   for (ii=0; ii<nDigits; ii++) {
 277     AliTOFdigit *d = (AliTOFdigit*)digits->UncheckedAt(ii);
 278     dig[0]=d->GetSector();
 279     dig[1]=d->GetPlate();
 280     dig[2]=d->GetStrip();
 281     dig[3]=d->GetPadz();
 282     dig[4]=d->GetPadx();
 283
 284     //    AliDebug(2,Form(" %2i  %1i  %2i  %1i  %2i ",dig[0],dig[1],dig[2],dig[3],dig[4]));
 285
 286     parTOF[0] = d->GetTdc(); //the TDC signal
 287     parTOF[1] = d->GetToT(); //the ToT signal
 288     parTOF[2] = d->GetAdc(); // the adc charge
 289     parTOF[3] = d->GetTdcND(); // non decalibrated sim time
 290     parTOF[4] = d->GetTdc(); // raw time, == Tdc time for the moment
 291     Double_t posClus[3];
 292     Double_t covClus[6];
 293     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(dig);
 294     GetClusterPars(dig, posClus,covClus);
 295     AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],d->GetTracks(),dig,parTOF,status,ii);
 296     InsertCluster(tofCluster);
 297
 298   }
 299
 300   AliInfo(Form("Number of found clusters: %i for event: %i", fNumberOfTofClusters, iEvent));
 301
 302   CalibrateRecPoint();
 303   FillRecPoint();
 304
 305   fTreeR->Fill();
 306   ResetRecpoint();
 307
 308   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
 309   fTOFLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 310
 311   AliInfo(Form("Execution time to read TOF digits and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 312                stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 313
 314   digits->Delete();
 315   delete digits;
 316 }
 317
 318 //______________________________________________________________________________
 319
 320 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(TTree* digitsTree, TTree* clusterTree)
 321 {
 322   //
 323   // Converts digits to recpoints for TOF
 324   //
 325
 326   TStopwatch stopwatch;
 327   stopwatch.Start();
 328
 329   ///  fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 330
 331   if (digitsTree == 0x0)
 332     {
 333       AliFatal("AliTOFClusterFinder: Can not get TreeD");
 334     }
 335
 336   TBranch *branch = digitsTree->GetBranch("TOF");
 337   if (!branch) {
 338     AliError("can't get the branch with the TOF digits !");
 339     return;
 340   }
 341
 342   TClonesArray *digits = new TClonesArray("AliTOFdigit",10000);
 343   branch->SetAddress(&digits);
 344
 345   ResetRecpoint();
 346
 347   fTreeR=clusterTree;
 348   Int_t bufsize = 32000;
 349   fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 350
 351   digitsTree->GetEvent(0);
 352   Int_t nDigits = digits->GetEntriesFast();
 353   AliDebug(2,Form("Number of TOF digits: %d",nDigits));
 354
 355   Int_t ii;
 356   Int_t dig[5]; //cluster detector indeces
 357   Int_t  parTOF[5]; //The TOF signal parameters
 358   Bool_t status=kTRUE; // assume all sim channels ok in the beginning...
 359   for (ii=0; ii<nDigits; ii++) {
 360     AliTOFdigit *d = (AliTOFdigit*)digits->UncheckedAt(ii);
 361     dig[0]=d->GetSector();
 362     dig[1]=d->GetPlate();
 363     dig[2]=d->GetStrip();
 364     dig[3]=d->GetPadz();
 365     dig[4]=d->GetPadx();
 366
 367     //    AliDebug(2,Form(" %2i  %1i  %2i  %1i  %2i ",dig[0],dig[1],dig[2],dig[3],dig[4]));
 368
 369     parTOF[0] = d->GetTdc(); //the TDC signal
 370     parTOF[1] = d->GetToT(); //the ToT signal
 371     parTOF[2] = d->GetAdc(); // the adc charge
 372     parTOF[3] = d->GetTdcND(); // non decalibrated sim time
 373     parTOF[4] = d->GetTdc(); // raw time, == Tdc time for the moment
 374
 375     Double_t posClus[3];
 376     Double_t covClus[6];
 377     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(dig);
 378     GetClusterPars(dig,posClus,covClus);
 379    AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],d->GetTracks(),dig,parTOF,status,ii);
 380     InsertCluster(tofCluster);
 381
 382   }
 383
 384   AliInfo(Form("Number of found clusters: %i", fNumberOfTofClusters));
 385
 386   CalibrateRecPoint();
 387   FillRecPoint();
 388
 389   clusterTree->Fill();
 390   ResetRecpoint();
 391
 392   AliInfo(Form("Execution time to read TOF digits and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 393                stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 394
 395   digits->Delete();
 396   delete digits;
 397 }
 398 //______________________________________________________________________________
 399
 400 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(AliRawReader *rawReader,
 401                                            TTree *clustersTree)
 402 {
 403   //
 404   // Converts RAW data to recpoints for TOF
 405   //
 406
 407   TStopwatch stopwatch;
 408   stopwatch.Start();
 409
 410   //const Int_t kDDL = fTOFGeometry->NDDL()*fTOFGeometry->NSectors();
 411   const Int_t kDDL = AliDAQ::NumberOfDdls("TOF");
 412
 413   ResetRecpoint();
 414
 415   Int_t bufsize = 32000;
 416   clustersTree->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 417
 418   TClonesArray * clonesRawData;
 419
 420   Int_t dummy = -1;
 421
 422   Int_t detectorIndex[5];
 423   Int_t parTOF[5];
 424
 425   ofstream ftxt;
 426   if (fVerbose==2) ftxt.open("TOFdigitsRead.txt",ios::app);
 427
 428   AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 429
 430   Int_t indexDDL = 0;
 431   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 432
 433     rawReader->Reset();
 434     if (fDecoderVersion) {
 435       AliInfo("Using New Decoder \n");
 436       tofInput.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 437     }
 438     else tofInput.LoadRawData(indexDDL);
 439
 440     clonesRawData = (TClonesArray*)tofInput.GetRawData();
 441
 442     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 443
 444       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 445
 446       if (tofRawDatum->GetTOT()==-1 || tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 447
 448       if (fVerbose==2) {
 449         if (indexDDL<10) ftxt << "  " << indexDDL;
 450         else         ftxt << " " << indexDDL;
 451         if (tofRawDatum->GetTRM()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRM();
 452         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTRM();
 453         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRMchain();
 454         if (tofRawDatum->GetTDC()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDC();
 455         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTDC();
 456         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDCchannel();
 457       }
 458
 459       tofInput.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 460                                     tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 461       dummy = detectorIndex[3];
 462       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 463       detectorIndex[4] = dummy;
 464
 465       if (fVerbose==2) {
 466         if (detectorIndex[0]<10) ftxt  << "  ->  " << detectorIndex[0];
 467         else              ftxt  << "  -> " << detectorIndex[0];
 468         ftxt << "  " << detectorIndex[1];
 469         if (detectorIndex[2]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[2];
 470         else              ftxt << " " << detectorIndex[2];
 471         ftxt << "  " << detectorIndex[3];
 472         if (detectorIndex[4]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[4];
 473         else              ftxt << " " << detectorIndex[4];
 474       }
 475
 476       parTOF[0] = tofRawDatum->GetTOF(); //TDC
 477       parTOF[1] = tofRawDatum->GetTOT(); // TOT
 478       parTOF[2] = tofRawDatum->GetTOT(); //ADC==TOF
 479       parTOF[3] = -1;//raw data: no track of undecalib sim time
 480       parTOF[4] = tofRawDatum->GetTOF(); // RAW time
 481       Double_t posClus[3];
 482       Double_t covClus[6];
 483       UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
 484       Int_t lab[3]={-1,-1,-1};
 485       Bool_t status=kTRUE;
 486       GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
 487      AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],lab,detectorIndex,parTOF,status,-1);
 488       InsertCluster(tofCluster);
 489
 490       if (fVerbose==2) {
 491         if (parTOF[1]<10)ftxt << "        " << parTOF[1];
 492         else if (parTOF[1]>=10 && parTOF[1]<100) ftxt << "      " << parTOF[1];
 493         else ftxt << "      " << parTOF[1];
 494         if (parTOF[0]<10) ftxt << "      " << parTOF[0] << endl;
 495         else if (parTOF[0]>=10 && parTOF[0]<100)   ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 496         else if (parTOF[0]>=100 && parTOF[0]<1000) ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 497         else ftxt << "   " << parTOF[3] << endl;
 498       }
 499
 500     } // closed loop on TOF raw data per current DDL file
 501
 502     clonesRawData->Clear();
 503
 504   } // closed loop on DDL index
 505
 506   if (fVerbose==2) ftxt.close();
 507
 508   AliInfo(Form("Number of found clusters: %i", fNumberOfTofClusters));
 509
 510   CalibrateRecPoint();
 511   FillRecPoint();
 512
 513   clustersTree->Fill();
 514
 515   ResetRecpoint();
 516
 517   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 518                    stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 519
 520 }
 521 //______________________________________________________________________________
 522
 523 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader)
 524 {
 525   //
 526   // Converts RAW data to recpoints for TOF
 527   //
 528
 529   TStopwatch stopwatch;
 530   stopwatch.Start();
 531
 532   //const Int_t kDDL = fTOFGeometry->NDDL()*fTOFGeometry->NSectors();
 533   const Int_t kDDL = AliDAQ::NumberOfDdls("TOF");
 534
 535   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 536
 537   AliDebug(2,Form(" Event number %2i ", iEvent));
 538
 539   fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 540
 541   if (fTreeR == 0x0){
 542     fTOFLoader->MakeTree("R");
 543     fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 544   }
 545
 546   Int_t bufsize = 32000;
 547   fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 548
 549   TClonesArray * clonesRawData;
 550
 551   Int_t dummy = -1;
 552
 553   Int_t detectorIndex[5] = {-1, -1, -1, -1, -1};
 554   Int_t parTOF[5];
 555   ofstream ftxt;
 556   if (fVerbose==2) ftxt.open("TOFdigitsRead.txt",ios::app);
 557
 558   AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 559
 560   Int_t indexDDL = 0;
 561   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 562
 563     rawReader->Reset();
 564     if (fDecoderVersion) {
 565       AliInfo("Using New Decoder \n");
 566       tofInput.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 567     }
 568     else tofInput.LoadRawData(indexDDL);
 569
 570     clonesRawData = (TClonesArray*)tofInput.GetRawData();
 571
 572     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 573
 574       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 575
 576       if (tofRawDatum->GetTOT()==-1 || tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 577
 578       if (fVerbose==2) {
 579         if (indexDDL<10) ftxt << "  " << indexDDL;
 580         else         ftxt << " " << indexDDL;
 581         if (tofRawDatum->GetTRM()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRM();
 582         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTRM();
 583         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRMchain();
 584         if (tofRawDatum->GetTDC()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDC();
 585         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTDC();
 586         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDCchannel();
 587       }
 588
 589       tofInput.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 590                                     tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 591       dummy = detectorIndex[3];
 592       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 593       detectorIndex[4] = dummy;
 594
 595       if (fVerbose==2) {
 596         if (detectorIndex[0]<10) ftxt  << "  ->  " << detectorIndex[0];
 597         else              ftxt  << "  -> " << detectorIndex[0];
 598         ftxt << "  " << detectorIndex[1];
 599         if (detectorIndex[2]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[2];
 600         else              ftxt << " " << detectorIndex[2];
 601         ftxt << "  " << detectorIndex[3];
 602         if (detectorIndex[4]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[4];
 603         else              ftxt << " " << detectorIndex[4];
 604       }
 605
 606       parTOF[0] = tofRawDatum->GetTOF(); // TDC
 607       parTOF[1] = tofRawDatum->GetTOT(); // TOT
 608       parTOF[2] = tofRawDatum->GetTOT(); // raw data have ADC=TOT
 609       parTOF[3] = -1; //raw data: no track of the undecalib sim time
 610       parTOF[4] = tofRawDatum->GetTOF(); // Raw time == TDC
 611       Double_t posClus[3];
 612       Double_t covClus[6];
 613       UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
 614       Int_t lab[3]={-1,-1,-1};
 615       Bool_t status=kTRUE;
 616       GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
 617       AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],lab,detectorIndex,parTOF,status,-1);
 618       InsertCluster(tofCluster);
 619
 620       if (fVerbose==2) {
 621         if (parTOF[1]<10)ftxt << "        " << parTOF[1];
 622         else if (parTOF[1]>=10 && parTOF[1]<100) ftxt << "      " << parTOF[1];
 623         else ftxt << "      " << parTOF[1];
 624         if (parTOF[0]<10) ftxt << "      " << parTOF[0] << endl;
 625         else if (parTOF[0]>=10 && parTOF[0]<100)   ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 626         else if (parTOF[0]>=100 && parTOF[0]<1000) ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 627         else ftxt << "   " << parTOF[3] << endl;
 628       }
 629
 630     } // closed loop on TOF raw data per current DDL file
 631
 632     clonesRawData->Clear();
 633
 634   } // closed loop on DDL index
 635
 636   if (fVerbose==2) ftxt.close();
 637
 638   AliInfo(Form("Number of found clusters: %i for event: %i", fNumberOfTofClusters, iEvent));
 639
 640   CalibrateRecPoint();
 641   FillRecPoint();
 642
 643   fTreeR->Fill();
 644   ResetRecpoint();
 645
 646   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
 647   fTOFLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 648
 649   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 650                stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 651
 652 }
 653 //______________________________________________________________________________
 654
 655 void AliTOFClusterFinder::Raw2Digits(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader)
 656 {
 657   //
 658   // Converts RAW data to MC digits for TOF
 659   //
 660   //             (temporary solution)
 661   //
 662
 663   TStopwatch stopwatch;
 664   stopwatch.Start();
 665
 666   //const Int_t kDDL = fTOFGeometry->NDDL()*fTOFGeometry->NSectors();
 667   const Int_t kDDL = AliTOFGeometry::NDDL()*AliTOFGeometry::NSectors();
 668
 669   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 670
 671   fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
 672   if (fTreeD)
 673     {
 674     AliInfo("TreeD re-creation");
 675     fTreeD = 0x0;
 676     fTOFLoader->MakeTree("D");
 677     fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
 678     }
 679
 680   TClonesArray *tofDigits = new TClonesArray("AliTOFdigit",10000);
 681   Int_t bufsize = 32000;
 682   fTreeD->Branch("TOF", &tofDigits, bufsize);
 683
 684   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 685
 686   AliDebug(2,Form(" Event number %2i ", iEvent));
 687
 688   TClonesArray * clonesRawData;
 689
 690   Int_t dummy = -1;
 691
 692   Int_t detectorIndex[5];
 693   Int_t digit[4];
 694
 695   AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 696
 697   Int_t indexDDL = 0;
 698   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 699
 700     rawReader->Reset();
 701     if (fDecoderVersion) {
 702       AliInfo("Using New Decoder \n");
 703       tofInput.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 704     }
 705     else tofInput.LoadRawData(indexDDL);
 706
 707     clonesRawData = (TClonesArray*)tofInput.GetRawData();
 708
 709     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 710
 711       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 712
 713       if (!tofRawDatum->GetTOT() || !tofRawDatum->GetTOF()) continue;
 714
 715       tofInput.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 716                                     tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 717       dummy = detectorIndex[3];
 718       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 719       detectorIndex[4] = dummy;
 720
 721       digit[0] = tofInput.GetTofBin();
 722       digit[1] = tofInput.GetToTbin();
 723       digit[2] = tofInput.GetToTbin();
 724       digit[3] = -1;
 725
 726       Int_t tracknum[3]={-1,-1,-1};
 727
 728       TClonesArray &aDigits = *tofDigits;
 729       Int_t last=tofDigits->GetEntriesFast();
 730       new (aDigits[last]) AliTOFdigit(tracknum, detectorIndex, digit);
 731
 732     } // while loop
 733
 734     clonesRawData->Clear();
 735
 736   } // DDL Loop
 737
 738   fTreeD->Fill();
 739
 740   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
 741   fTOFLoader->WriteDigits("OVERWRITE");
 742
 743   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.2fs C:%.2fs",
 744                    stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 745
 746 }
 747
 748 //______________________________________________________________________________
 749
 750 void AliTOFClusterFinder::Raw2Digits(AliRawReader *rawReader, TTree* digitsTree)
 751 {
 752   //
 753   // Converts RAW data to MC digits for TOF for the current event
 754   //
 755   //
 756
 757   TStopwatch stopwatch;
 758   stopwatch.Start();
 759
 760   const Int_t kDDL = AliTOFGeometry::NDDL()*AliTOFGeometry::NSectors();
 761
 762   if (!digitsTree)
 763     {
 764     AliError("No input digits Tree");
 765     return;
 766     }
 767
 768   TClonesArray *tofDigits = new TClonesArray("AliTOFdigit",10000);
 769   Int_t bufsize = 32000;
 770   digitsTree->Branch("TOF", &tofDigits, bufsize);
 771
 772   ///  fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 773
 774   ///  AliDebug(2,Form(" Event number %2i ", iEvent));
 775
 776   TClonesArray * clonesRawData;
 777
 778   Int_t dummy = -1;
 779
 780   Int_t detectorIndex[5];
 781   Int_t digit[4];
 782
 783   AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 784
 785   Int_t indexDDL = 0;
 786   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 787
 788     rawReader->Reset();
 789     if (fDecoderVersion) {
 790       AliInfo("Using New Decoder \n");
 791       tofInput.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 792     }
 793     else tofInput.LoadRawData(indexDDL);
 794
 795     clonesRawData = (TClonesArray*)tofInput.GetRawData();
 796
 797     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 798
 799       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 800
 801       if (!tofRawDatum->GetTOT() || !tofRawDatum->GetTOF()) continue;
 802
 803       tofInput.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 804                                     tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 805       dummy = detectorIndex[3];
 806       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 807       detectorIndex[4] = dummy;
 808
 809       digit[0] = tofInput.GetTofBin();
 810       digit[1] = tofInput.GetToTbin();
 811       digit[2] = tofInput.GetToTbin();
 812       digit[3] = -1;
 813
 814       Int_t tracknum[3]={-1,-1,-1};
 815
 816       TClonesArray &aDigits = *tofDigits;
 817       Int_t last=tofDigits->GetEntriesFast();
 818       new (aDigits[last]) AliTOFdigit(tracknum, detectorIndex, digit);
 819
 820     } // while loop
 821
 822     clonesRawData->Clear();
 823
 824   } // DDL Loop
 825
 826   digitsTree->Fill();
 827
 828   AliDebug(1, Form("Got %d digits: ", tofDigits->GetEntries()));
 829   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and fill TOF digit tree : R:%.2fs C:%.2fs",
 830                    stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 831
 832 }
 833 //______________________________________________________________________________
 834
 835 Int_t AliTOFClusterFinder::InsertCluster(AliTOFcluster *tofCluster) {
 836   //---------------------------------------------------------------------------//
 837   // This function adds a TOF cluster to the array of TOF clusters sorted in Z //
 838   //---------------------------------------------------------------------------//
 839   if (fNumberOfTofClusters==kTofMaxCluster) {
 840     AliError("Too many clusters !");
 841     return 1;
 842   }
 843
 844   if (fNumberOfTofClusters==0) {
 845     fTofClusters[fNumberOfTofClusters++] = tofCluster;
 846     return 0;
 847   }
 848
 849   Int_t ii = FindClusterIndex(tofCluster->GetZ());
 850   memmove(fTofClusters+ii+1 ,fTofClusters+ii,(fNumberOfTofClusters-ii)*sizeof(AliTOFcluster*));
 851   fTofClusters[ii] = tofCluster;
 852   fNumberOfTofClusters++;
 853
 854   return 0;
 855
 856 }
 857 //_________________________________________________________________________
 858
 859 Int_t AliTOFClusterFinder::FindClusterIndex(Double_t z) const {
 860   //--------------------------------------------------------------------
 861   // This function returns the index of the nearest cluster in z
 862   //--------------------------------------------------------------------
 863   if (fNumberOfTofClusters==0) return 0;
 864   if (z <= fTofClusters[0]->GetZ()) return 0;
 865   if (z > fTofClusters[fNumberOfTofClusters-1]->GetZ()) return fNumberOfTofClusters;
 866   Int_t b = 0, e = fNumberOfTofClusters-1, m = (b+e)/2;
 867   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
 868     if (z > fTofClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
 869     else e=m;
 870   }
 871
 872   return m;
 873
 874 }
 875 //_________________________________________________________________________
 876
 877 void AliTOFClusterFinder::FillRecPoint()
 878 {
 879   //
 880   // Copy the global array of AliTOFcluster, i.e. fTofClusters (sorted
 881   // in Z) in the global TClonesArray of AliTOFcluster,
 882   // i.e. fRecPoints.
 883   //
 884
 885   Int_t ii, jj;
 886
 887   Int_t detectorIndex[5];
 888   Int_t parTOF[5];
 889   Int_t trackLabels[3];
 890   Int_t digitIndex = -1;
 891   Bool_t status=kTRUE;
 892
 893   TClonesArray &lRecPoints = *fRecPoints;
 894
 895   for (ii=0; ii<fNumberOfTofClusters; ii++) {
 896
 897     digitIndex = fTofClusters[ii]->GetIndex();
 898     for(jj=0; jj<5; jj++) detectorIndex[jj] = fTofClusters[ii]->GetDetInd(jj);
 899     for(jj=0; jj<3; jj++) trackLabels[jj] = fTofClusters[ii]->GetLabel(jj);
 900     parTOF[0] = fTofClusters[ii]->GetTDC(); // TDC
 901     parTOF[1] = fTofClusters[ii]->GetToT(); // TOT
 902     parTOF[2] = fTofClusters[ii]->GetADC(); // ADC=TOT
 903     parTOF[3] = fTofClusters[ii]->GetTDCND(); // TDCND
 904     parTOF[4] = fTofClusters[ii]->GetTDCRAW();//RAW
 905     status=fTofClusters[ii]->GetStatus();
 906     Double_t posClus[3];
 907     Double_t covClus[6];
 908     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
 909     GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
 910     new(lRecPoints[ii]) AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],trackLabels,detectorIndex, parTOF,status,digitIndex);
 911
 912   } // loop on clusters
 913
 914 }
 915
 916 //_________________________________________________________________________
 917 void AliTOFClusterFinder::CalibrateRecPoint()
 918 {
 919   //
 920   // Copy the global array of AliTOFcluster, i.e. fTofClusters (sorted
 921   // in Z) in the global TClonesArray of AliTOFcluster,
 922   // i.e. fRecPoints.
 923   //
 924
 925   Int_t ii, jj;
 926
 927   Int_t detectorIndex[5];
 928   Int_t digitIndex = -1;
 929   Double_t tToT;
 930   Double_t timeCorr;
 931   Int_t   tdcCorr;
 932   AliInfo(" Calibrating TOF Clusters: ")
 933
 934   TObjArray *calTOFArrayOnline = fTOFcalib->GetTOFCalArrayOnline();
 935   TObjArray *calTOFArrayOnlinePulser = fTOFcalib->GetTOFCalArrayOnlinePulser();
 936   TObjArray *calTOFArrayOnlineNoise = fTOFcalib->GetTOFCalArrayOnlineNoise();
 937   TObjArray *calTOFArrayOnlineHW = fTOFcalib->GetTOFCalArrayOnlineHW();
 938   TObjArray *calTOFArrayOffline = fTOFcalib->GetTOFCalArrayOffline();
 939   TString validity = (TString)fTOFcalib->GetOfflineValidity();
 940   AliInfo(Form(" validity = %s",validity.Data()));
 941   Int_t calibration = -1;
 942   if (validity.CompareTo("valid")==0) {
 943     AliInfo(" Using offline calibration parameters");
 944     calibration = 1;
 945   }
 946   else {
 947     AliInfo(" Using online calibration parameters");
 948     calibration = 0 ;
 949   }
 950   for (ii=0; ii<fNumberOfTofClusters; ii++) {
 951     digitIndex = fTofClusters[ii]->GetIndex();
 952     for(jj=0; jj<5; jj++) detectorIndex[jj] = fTofClusters[ii]->GetDetInd(jj);
 953
 954     Int_t index = AliTOFGeometry::GetIndex(detectorIndex);
 955
 956     AliTOFChannelOnlineStatus * calChannelOnlineStPulser = (AliTOFChannelOnlineStatus* )calTOFArrayOnlinePulser->At(index);
 957     AliTOFChannelOnlineStatus * calChannelOnlineStNoise = (AliTOFChannelOnlineStatus* )calTOFArrayOnlineNoise->At(index);
 958     AliTOFChannelOnlineStatus * calChannelOnlineStHW = (AliTOFChannelOnlineStatus* )calTOFArrayOnlineHW->At(index);
 959
 960     // Get channel status
 961     UChar_t statusPulser=calChannelOnlineStPulser->GetStatus();
 962     UChar_t statusNoise=calChannelOnlineStNoise->GetStatus();
 963     UChar_t statusHW=calChannelOnlineStHW->GetStatus();
 964
 965     //check the status, also unknow is fine!!!!!!!
 966
 967     UChar_t status = 0x0;
 968     status |= statusPulser;
 969     status |= statusNoise;
 970     status |= statusHW;
 971     // set status of the cluster to false if at least one of the three status (Pulser/Noise/HW) is bad
 972     if((statusPulser & AliTOFChannelOnlineStatus::kTOFPulserBad)==(AliTOFChannelOnlineStatus::kTOFPulserBad)||(statusNoise & AliTOFChannelOnlineStatus::kTOFNoiseBad)==(AliTOFChannelOnlineStatus::kTOFNoiseBad)||(statusHW & AliTOFChannelOnlineStatus::kTOFHWBad)==(AliTOFChannelOnlineStatus::kTOFHWBad)){
 973       AliDebug(2, Form(" Bad Status for channel %i",index));
 974       fTofClusters[ii]->SetStatus(kFALSE); //odd convention, to avoid conflict with calibration objects currently in the db (temporary solution).
 975     }
 976     else {
 977       AliDebug(2, Form(" Good Status for channel %i",index));
 978     }
 979     //    if((status & AliTOFChannelOnlineStatus::kTOFOnlineOk)!=(AliTOFChannelOnline::kTOFOnlineOk))fTofClusters[ii]->SetStatus(kFALSE); //odd convention, to avoid conflict with calibration objects currently in the db (temporary solution).
 980     // Get Rough channel online equalization
 981     AliTOFChannelOnline * calChannelOnline = (AliTOFChannelOnline* )calTOFArrayOnline->At(index);
 982     Double_t roughDelay=(Double_t)calChannelOnline->GetDelay();  // in ns
 983     AliDebug(2,Form(" channel delay (ns) = %f", roughDelay));
 984     // Get Refined channel offline calibration parameters
 985     if (calibration ==1){
 986       AliTOFChannelOffline * calChannelOffline = (AliTOFChannelOffline*)calTOFArrayOffline->At(index);
 987       Double_t par[6];
 988       for (Int_t j = 0; j<6; j++){
 989         par[j]=(Double_t)calChannelOffline->GetSlewPar(j);
 990      }
 991       AliDebug(2,Form(" Calib Pars = %f, %f, %f, %f, %f, %f ",par[0],par[1],par[2],par[3],par[4],par[5]));
 992       AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (counts) = %i , %i", fTofClusters[ii]->GetToT(),fTofClusters[ii]->GetTDC()));
 993       tToT = (Double_t)(fTofClusters[ii]->GetToT()*AliTOFGeometry::ToTBinWidth());
 994       tToT*=1.E-3; //ToT in ns
 995       AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (ns)= %e, %e",fTofClusters[ii]->GetTDC()*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3,tToT));
 996       timeCorr=par[0]+par[1]*tToT+par[2]*tToT*tToT+par[3]*tToT*tToT*tToT+par[4]*tToT*tToT*tToT*tToT+par[5]*tToT*tToT*tToT*tToT*tToT; // the time correction (ns)
 997     }
 998     else {
 999       timeCorr = roughDelay; // correction in ns
1000     }
1001     AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (ns)= %e, %e",fTofClusters[ii]->GetTDC()*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3,fTofClusters[ii]->GetToT()*AliTOFGeometry::ToTBinWidth()));
1002     AliDebug(2,Form(" The time correction (ns) = %f", timeCorr));
1003     timeCorr=(Double_t)(fTofClusters[ii]->GetTDC())*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3-timeCorr;//redefine the time
1004     timeCorr*=1.E3;
1005     AliDebug(2,Form(" The channel time, corr (ps)= %e",timeCorr ));
1006     tdcCorr=(Int_t)(timeCorr/AliTOFGeometry::TdcBinWidth()); //the corrected time (tdc counts)
1007     fTofClusters[ii]->SetTDC(tdcCorr);
1008   } // loop on clusters
1009
1010 }
1011 //______________________________________________________________________________
1012
1013 void AliTOFClusterFinder::ResetRecpoint()
1014 {
1015   //
1016   // Clear the list of reconstructed points
1017   //
1018
1019   fNumberOfTofClusters = 0;
1020   if (fRecPoints) fRecPoints->Clear();
1021
1022 }
1023 //______________________________________________________________________________
1024
1025 void AliTOFClusterFinder::Load()
1026 {
1027   //
1028   // Load TOF.Digits.root and TOF.RecPoints.root files
1029   //
1030
1031   fTOFLoader->LoadDigits("READ");
1032   fTOFLoader->LoadRecPoints("recreate");
1033
1034 }
1035 //______________________________________________________________________________
1036
1037 void AliTOFClusterFinder::LoadClusters()
1038 {
1039   //
1040   // Load TOF.RecPoints.root file
1041   //
1042
1043   fTOFLoader->LoadRecPoints("recreate");
1044
1045 }
1046 //______________________________________________________________________________
1047
1048 void AliTOFClusterFinder::UnLoad()
1049 {
1050   //
1051   // Unload TOF.Digits.root and TOF.RecPoints.root files
1052   //
1053
1054   fTOFLoader->UnloadDigits();
1055   fTOFLoader->UnloadRecPoints();
1056
1057 }
1058 //______________________________________________________________________________
1059
1060 void AliTOFClusterFinder::UnLoadClusters()
1061 {
1062   //
1063   // Unload TOF.RecPoints.root file
1064   //
1065
1066   fTOFLoader->UnloadRecPoints();
1067
1068 }
1069 //-------------------------------------------------------------------------
1070 UShort_t AliTOFClusterFinder::GetClusterVolIndex(Int_t *ind) const {
1071
1072   //First of all get the volume ID to retrieve the l2t transformation...
1073   //
1074   // Detector numbering scheme
1075   Int_t nSector = 18;
1076   Int_t nPlate  = 5;
1077   Int_t nStripA = 15;
1078   Int_t nStripB = 19;
1079   Int_t nStripC = 19;
1080
1081   Int_t isector =ind[0];
1082   if (isector >= nSector)
1083     AliError(Form("Wrong sector number in TOF (%d) !",isector));
1084   Int_t iplate = ind[1];
1085   if (iplate >= nPlate)
1086     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
1087   Int_t istrip = ind[2];
1088
1089   Int_t stripOffset = 0;
1090   switch (iplate) {
1091   case 0:
1092     stripOffset = 0;
1093     break;
1094   case 1:
1095     stripOffset = nStripC;
1096     break;
1097   case 2:
1098     stripOffset = nStripC+nStripB;
1099     break;
1100   case 3:
1101     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
1102     break;
1103   case 4:
1104     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
1105     break;
1106   default:
1107     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
1108     break;
1109   };
1110
1111   Int_t index= (2*(nStripC+nStripB)+nStripA)*isector +
1112                stripOffset +
1113                istrip;
1114
1115   UShort_t volIndex = AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kTOF,index);
1116   return volIndex;
1117 }
1118 //
1119 //-------------------------------------------------------------------------
1120 void AliTOFClusterFinder::GetClusterPars(Int_t *ind, Double_t* pos,Double_t* cov) const {
1121
1122   //First of all get the volume ID to retrieve the l2t transformation...
1123   //
1124   UShort_t volIndex = GetClusterVolIndex(ind);
1125   //
1126   //
1127   //we now go in the system of the strip: determine the local coordinates
1128   //
1129   //
1130   // 47---------------------------------------------------0  ^ z
1131   // | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | 1 |
1132   // -----------------------------------------------------   | y going outwards
1133   // | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | 0 |  par[0]=0;
1134
1135   // -----------------------------------------------------   |
1136   // x <-----------------------------------------------------
1137
1138   Float_t localX=(ind[4]-23.5)*2.5;
1139   Float_t localY=0;
1140   Float_t localZ=(ind[3]-0.5)*3.5;
1141
1142   //move to the tracking ref system
1143
1144   Double_t lpos[3];
1145   lpos[0]=localX;
1146   lpos[1]=localY;
1147   lpos[2]=localZ;
1148
1149   const TGeoHMatrix *l2t= AliGeomManager::GetTracking2LocalMatrix(volIndex);
1150   // Get The position in the track ref system
1151   Double_t tpos[3];
1152   l2t->MasterToLocal(lpos,tpos);
1153   pos[0]=tpos[0];
1154   pos[1]=tpos[1];
1155   pos[2]=tpos[2];
1156
1157   //Get The cluster covariance in the track ref system
1158   Double_t lcov[9];
1159
1160   //cluster covariance in the local system:
1161   // sx2   0   0
1162   // 0     0   0
1163   // 0     0   sz2
1164
1165   lcov[0]=2.5*2.5/12.;
1166   lcov[1]=0;
1167   lcov[2]=0;
1168   lcov[3]=0;
1169   lcov[4]=0;
1170   lcov[5]=0;
1171   lcov[6]=0;
1172   lcov[7]=0;
1173   lcov[8]=3.5*3.5/12.;
1174
1175   //cluster covariance in the tracking system:
1176   TGeoHMatrix m;
1177   m.SetRotation(lcov);
1178   m.Multiply(l2t);
1179   m.MultiplyLeft(&l2t->Inverse());
1180   Double_t *tcov = m.GetRotationMatrix();
1181   cov[0] = tcov[0]; cov[1] = tcov[1]; cov[2] = tcov[2];
1182   cov[3] = tcov[4]; cov[4] = tcov[5];
1183   cov[5] = tcov[8];
1184
1185   return;
1186
1187 }