TOF/AliTOFClusterFinder.cxx

   1 /***************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /*
  17 $Log: AliTOFClusterFinder.cxx,v $
  18 Revision 1.31  2007/11/24 14:53:19  zampolli
  19 Status flag implemented as UChar_t
  20
  21 Revision 1.30  2007/10/04 13:08:52  arcelli
  22 updates to comply with AliTOFGeometryV5 becoming AliTOFGeometry
  23
  24 Revision 1.29  2007/10/03 10:42:33  arcelli
  25 updates to handle new AliTOFcluster, inheriting form AliCluster3D
  26
  27 Revision 1.28  2007/05/31 16:06:05  arcelli
  28 move instance of AliRawStream outside loop on DDL
  29
  30 Revision 1.27  2007/05/02 16:31:49  arcelli
  31 Add methods to handle single event reconstruction.  retrieval of Calib
  32 info moved to AliTOFReconstructor ctor, and passed via a pointer to
  33 AliTOFcalib
  34
  35 Revision 1.26  2007/04/30 19:02:24  arcelli
  36 hopefully the last refinements for correct type conversion in calibration
  37
  38 Revision 1.25  2007/04/30 15:22:17  arcelli
  39 Change TOF digit Time, Tot etc to int type
  40
  41 Revision 1.24  2007/04/27 11:19:31  arcelli
  42 updates for the new decoder
  43
  44 Revision 1.23  2007/04/23 16:51:39  decaro
  45 Digits-to-raw_data conversion: correction for a more real description
  46 (A.De Caro, R.Preghenella)
  47
  48 Revision 1.22  2007/04/19 17:26:32  arcelli
  49 Fix a bug (add some debug printout
  50
  51 Revision 1.21  2007/04/18 17:28:12  arcelli
  52 Set the ToT bin width to the one actually used...
  53
  54 Revision 1.20  2007/03/09 09:57:23  arcelli
  55  Remove a forgotten include of Riostrem
  56
  57 Revision 1.19  2007/03/08 15:41:20  arcelli
  58 set uncorrected times when filling RecPoints
  59
  60 Revision 1.18  2007/03/06 16:31:20  arcelli
  61 Add Uncorrected TOF Time signal
  62
  63 Revision 1.17  2007/02/28 18:09:11  arcelli
  64 Add protection against failed retrieval of the CDB cal object,
  65 now Reconstruction exits with AliFatal
  66
  67 Revision 1.16  2007/02/20 15:57:00  decaro
  68 Raw data update: to read the TOF raw data defined in UNPACKED mode
  69
  70
  71 Revision 0.03  2005/07/28 A. De Caro
  72          Implement public method
  73          Raw2Digits(Int_t, AliRawReader *)
  74          to convert digits from raw data in MC digits
  75          (temporary solution)
  76
  77 Revision 0.02  2005/07/27 A. De Caro
  78          Implement public method
  79          Digits2RecPoint(Int_t)
  80          to convert digits in clusters
  81
  82 Revision 0.02  2005/07/26 A. De Caro
  83          Implement private methods
  84          InsertCluster(AliTOFcluster *)
  85          FindClusterIndex(Double_t)
  86          originally implemented in AliTOFtracker
  87          by S. Arcelli and C. Zampolli
  88
  89 Revision 0.01  2005/07/25 A. De Caro
  90          Implement public methods
  91          Digits2RecPoint(AliRawReader *, TTree *)
  92          Digits2RecPoint(Int_t, AliRawReader *)
  93          to convert raw data in clusters
  94  */
  95
  96 ////////////////////////////////////////////////////////////////
  97 //                                                            //
  98 //         Class for TOF cluster finder                       //
  99 //                                                            //
 100 // Starting from Raw Data, create rec points,                 //
 101 //                         fill TreeR for TOF,                //
 102 //                         write TOF.RecPoints.root file      //
 103 //                                                            //
 104 ////////////////////////////////////////////////////////////////
 105
 106 #include "Riostream.h"
 107
 108 #include "TClonesArray.h"
 109 #include "TStopwatch.h"
 110 #include "TTree.h"
 111 //#include <TGeoManager.h>
 112 #include <TGeoMatrix.h>
 113 //#include <TGeoPhysicalNode.h>
 114
 115 #include "AliDAQ.h"
 116 #include "AliLoader.h"
 117 #include "AliLog.h"
 118 #include "AliRawReader.h"
 119 #include "AliRunLoader.h"
 120 //#include "AliAlignObj.h"
 121 #include <AliGeomManager.h>
 122
 123 #include "AliTOFcalib.h"
 124 #include "AliTOFChannelOnlineArray.h"
 125 #include "AliTOFChannelOnlineStatusArray.h"
 126 #include "AliTOFChannelOffline.h"
 127 #include "AliTOFClusterFinder.h"
 128 #include "AliTOFcluster.h"
 129 #include "AliTOFdigit.h"
 130 #include "AliTOFGeometry.h"
 131 #include "AliTOFrawData.h"
 132 //#include "AliTOFRawStream.h"
 133
 134 #include "AliTOFDeltaBCOffset.h"
 135 #include "AliTOFCTPLatency.h"
 136 #include "AliTOFT0Fill.h"
 137
 138 //extern TFile *gFile;
 139
 140 ClassImp(AliTOFClusterFinder)
 141
 142 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(AliTOFcalib *calib):
 143   fRunLoader(0),
 144   fTOFLoader(0),
 145   fTreeD(0),
 146   fTreeR(0),
 147   fDigits(new TClonesArray("AliTOFdigit", 4000)),
 148   fRecPoints(new TClonesArray("AliTOFcluster", 4000)),
 149   fNumberOfTofClusters(0),
 150   fVerbose(0),
 151   fDecoderVersion(0),
 152   fTOFcalib(calib),
 153   fTOFRawStream(AliTOFRawStream())
 154 {
 155 //
 156 // Constructor
 157 //
 158
 159 }
 160
 161 //______________________________________________________________________________
 162
 163 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(AliRunLoader* runLoader, AliTOFcalib *calib):
 164   fRunLoader(runLoader),
 165   fTOFLoader(runLoader->GetLoader("TOFLoader")),
 166   fTreeD(0),
 167   fTreeR(0),
 168   fDigits(new TClonesArray("AliTOFdigit", 4000)),
 169   fRecPoints(new TClonesArray("AliTOFcluster", 4000)),
 170   fNumberOfTofClusters(0),
 171   fVerbose(0),
 172   fDecoderVersion(0),
 173   fTOFcalib(calib),
 174   fTOFRawStream(AliTOFRawStream())
 175 {
 176 //
 177 // Constructor
 178 //
 179
 180 }
 181
 182 //------------------------------------------------------------------------
 183 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(const AliTOFClusterFinder &source)
 184   :TObject(source),
 185   fRunLoader(0),
 186   fTOFLoader(0),
 187   fTreeD(0),
 188   fTreeR(0),
 189   fDigits(source.fDigits),
 190   fRecPoints(source.fRecPoints),
 191   fNumberOfTofClusters(0),
 192   fVerbose(0),
 193   fDecoderVersion(source.fDecoderVersion),
 194   fTOFcalib(source.fTOFcalib),
 195   fTOFRawStream(source.fTOFRawStream)
 196 {
 197   // copy constructor
 198 }
 199
 200 //------------------------------------------------------------------------
 201 AliTOFClusterFinder& AliTOFClusterFinder::operator=(const AliTOFClusterFinder &source)
 202 {
 203   // ass. op.
 204
 205   if (this == &source)
 206     return *this;
 207
 208   TObject::operator=(source);
 209   fDigits=source.fDigits;
 210   fRecPoints=source.fRecPoints;
 211   fVerbose=source.fVerbose;
 212   fDecoderVersion=source.fDecoderVersion;
 213   fTOFcalib=source.fTOFcalib;
 214   fTOFRawStream=source.fTOFRawStream;
 215   return *this;
 216
 217 }
 218 //______________________________________________________________________________
 219
 220 AliTOFClusterFinder::~AliTOFClusterFinder()
 221 {
 222
 223   //
 224   // Destructor
 225   //
 226
 227   if (fDigits)
 228     {
 229       fDigits->Delete();
 230       delete fDigits;
 231       fDigits=0;
 232     }
 233   if (fRecPoints)
 234     {
 235       fRecPoints->Delete();
 236       delete fRecPoints;
 237       fRecPoints=0;
 238     }
 239
 240 }
 241 //______________________________________________________________________________
 242
 243 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent)
 244 {
 245   //
 246   // Converts digits to recpoints for TOF
 247   //
 248
 249   TStopwatch stopwatch;
 250   stopwatch.Start();
 251
 252   Int_t inholes = 0;
 253
 254   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 255
 256   fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
 257   if (fTreeD == 0x0)
 258     {
 259       AliFatal("AliTOFClusterFinder: Can not get TreeD");
 260     }
 261
 262   TBranch *branch = fTreeD->GetBranch("TOF");
 263   if (!branch) {
 264     AliError("can't get the branch with the TOF digits !");
 265     return;
 266   }
 267
 268   TClonesArray staticdigits("AliTOFdigit",10000);
 269   staticdigits.Clear();
 270   TClonesArray *digits =&staticdigits;
 271   branch->SetAddress(&digits);
 272
 273   ResetRecpoint();
 274
 275   fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 276   if (fTreeR == 0x0)
 277     {
 278       fTOFLoader->MakeTree("R");
 279       fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 280     }
 281
 282   Int_t bufsize = 32000;
 283   fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 284
 285   fTreeD->GetEvent(0);
 286   Int_t nDigits = digits->GetEntriesFast();
 287   AliDebug(2,Form("Number of TOF digits: %d",nDigits));
 288
 289   Int_t ii;
 290   Int_t dig[5]; //cluster detector indeces
 291   Int_t  parTOF[7]; //The TOF signal parameters
 292   Bool_t status=kTRUE; // assume all sim channels ok in the beginning...
 293   for (ii=0; ii<nDigits; ii++) {
 294     AliTOFdigit *d = (AliTOFdigit*)digits->UncheckedAt(ii);
 295     dig[0]=d->GetSector();
 296     dig[1]=d->GetPlate();
 297     dig[2]=d->GetStrip();
 298     dig[3]=d->GetPadz();
 299     dig[4]=d->GetPadx();
 300
 301     /* check valid index */
 302     if (dig[0]==-1||dig[1]==-1||dig[2]==-1||dig[3]==-1||dig[4]==-1) continue;
 303
 304     // Do not reconstruct anything in the holes
 305     if (dig[0]==13 || dig[0]==14 || dig[0]==15 ) { // sectors with holes
 306       if (dig[1]==2) { // plate with holes
 307         inholes++;
 308         continue;
 309       }
 310     }
 311
 312     AliDebug(2,Form(" %2d  %1d  %2d  %1d  %2d ",dig[0],dig[1],dig[2],dig[3],dig[4]));
 313
 314     parTOF[0] = d->GetTdc(); //the TDC signal
 315     parTOF[1] = d->GetToT(); //the ToT signal
 316     parTOF[2] = d->GetAdc(); // the adc charge
 317     parTOF[3] = d->GetTdcND(); // non decalibrated sim time
 318     parTOF[4] = d->GetTdc(); // raw time, == Tdc time for the moment
 319     parTOF[5] = 0; // deltaBC
 320     parTOF[6] = 0; // L0-L1 latency
 321     Double_t posClus[3];
 322     Double_t covClus[6];
 323     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(dig);
 324     GetClusterPars(dig, posClus,covClus);
 325     AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],d->GetTracks(),dig,parTOF,status,ii);
 326     InsertCluster(tofCluster);
 327
 328   }
 329
 330   AliDebug(1,Form("Number of found clusters: %d for event: %d", fNumberOfTofClusters, iEvent));
 331
 332   CalibrateRecPoint();
 333   FillRecPoint();
 334
 335   fTreeR->Fill();
 336   ResetRecpoint();
 337
 338   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
 339   fTOFLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 340
 341   AliDebug(1,Form("Execution time to read TOF digits and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 342                   stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 343   if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 344
 345 }
 346
 347 //______________________________________________________________________________
 348
 349 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(TTree* digitsTree, TTree* clusterTree)
 350 {
 351   //
 352   // Converts digits to recpoints for TOF
 353   //
 354
 355   TStopwatch stopwatch;
 356   stopwatch.Start();
 357
 358   Int_t inholes = 0;
 359
 360   ///  fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 361
 362   if (digitsTree == 0x0)
 363     {
 364       AliFatal("AliTOFClusterFinder: Can not get TreeD");
 365     }
 366
 367   TBranch *branch = digitsTree->GetBranch("TOF");
 368   if (!branch) {
 369     AliError("can't get the branch with the TOF digits !");
 370     return;
 371   }
 372
 373   TClonesArray staticdigits("AliTOFdigit",10000);
 374   staticdigits.Clear();
 375   TClonesArray *digits = & staticdigits;
 376   branch->SetAddress(&digits);
 377
 378   ResetRecpoint();
 379
 380   fTreeR=clusterTree;
 381   Int_t bufsize = 32000;
 382   fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 383
 384   digitsTree->GetEvent(0);
 385   Int_t nDigits = digits->GetEntriesFast();
 386   AliDebug(2,Form("Number of TOF digits: %d",nDigits));
 387
 388   Int_t ii;
 389   Int_t dig[5]; //cluster detector indeces
 390   Int_t  parTOF[7]; //The TOF signal parameters
 391   Bool_t status=kTRUE; // assume all sim channels ok in the beginning...
 392   for (ii=0; ii<nDigits; ii++) {
 393     AliTOFdigit *d = (AliTOFdigit*)digits->UncheckedAt(ii);
 394     dig[0]=d->GetSector();
 395     dig[1]=d->GetPlate();
 396     dig[2]=d->GetStrip();
 397     dig[3]=d->GetPadz();
 398     dig[4]=d->GetPadx();
 399
 400     /* check valid index */
 401     if (dig[0]==-1||dig[1]==-1||dig[2]==-1||dig[3]==-1||dig[4]==-1) continue;
 402
 403     // Do not reconstruct anything in the holes
 404     if (dig[0]==13 || dig[0]==14 || dig[0]==15 ) { // sectors with holes
 405       if (dig[1]==2) { // plate with holes
 406         inholes++;
 407         continue;
 408       }
 409     }
 410
 411     //    AliDebug(2,Form(" %2d  %1d  %2d  %1d  %2d ",dig[0],dig[1],dig[2],dig[3],dig[4]));
 412
 413     parTOF[0] = d->GetTdc(); //the TDC signal
 414     parTOF[1] = d->GetToT(); //the ToT signal
 415     parTOF[2] = d->GetAdc(); // the adc charge
 416     parTOF[3] = d->GetTdcND(); // non decalibrated sim time
 417     parTOF[4] = d->GetTdc(); // raw time, == Tdc time for the moment
 418     parTOF[5] = 0; // deltaBC
 419     parTOF[6] = 0; // L0-L1 latency
 420
 421     Double_t posClus[3];
 422     Double_t covClus[6];
 423     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(dig);
 424     GetClusterPars(dig,posClus,covClus);
 425     AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],d->GetTracks(),dig,parTOF,status,ii);
 426     InsertCluster(tofCluster);
 427
 428   }
 429
 430   AliDebug(1,Form("Number of found clusters: %d", fNumberOfTofClusters));
 431
 432   CalibrateRecPoint();
 433   FillRecPoint();
 434
 435   clusterTree->Fill();
 436   ResetRecpoint();
 437
 438   AliDebug(1,Form("Execution time to read TOF digits and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 439                   stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 440   if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 441
 442 }
 443 //______________________________________________________________________________
 444
 445 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(AliRawReader *rawReader,
 446                                            TTree *clustersTree)
 447 {
 448   //
 449   // Converts RAW data to recpoints for TOF
 450   //
 451
 452   TStopwatch stopwatch;
 453   stopwatch.Start();
 454
 455   Int_t inholes = 0;
 456
 457   const Int_t kDDL = AliDAQ::NumberOfDdls("TOF");
 458
 459   ResetRecpoint();
 460
 461   Int_t bufsize = 32000;
 462   clustersTree->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 463
 464   TClonesArray * clonesRawData;
 465
 466   Int_t dummy = -1;
 467
 468   Int_t detectorIndex[5];
 469   Int_t parTOF[7];
 470
 471   ofstream ftxt;
 472   if (fVerbose==2) ftxt.open("TOFdigitsRead.txt",ios::app);
 473
 474   //AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 475   fTOFRawStream.Clear();
 476   fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
 477
 478   if (fDecoderVersion)
 479     AliInfo("Using New Decoder");
 480
 481   Int_t indexDDL = 0;
 482   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 483
 484     rawReader->Reset();
 485     if (fDecoderVersion)
 486       fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 487     else fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
 488
 489     clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 490
 491     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 492
 493       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 494
 495       //if (tofRawDatum->GetTOT()==-1 || tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 496       if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 497
 498       if (fVerbose==2) {
 499         if (indexDDL<10) ftxt << "  " << indexDDL;
 500         else         ftxt << " " << indexDDL;
 501         if (tofRawDatum->GetTRM()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRM();
 502         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTRM();
 503         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRMchain();
 504         if (tofRawDatum->GetTDC()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDC();
 505         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTDC();
 506         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDCchannel();
 507       }
 508
 509       fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 510                                          tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 511       dummy = detectorIndex[3];
 512       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 513       detectorIndex[4] = dummy;
 514
 515       if (fVerbose==2) {
 516         if (detectorIndex[0]<10) ftxt  << "  ->  " << detectorIndex[0];
 517         else              ftxt  << "  -> " << detectorIndex[0];
 518         ftxt << "  " << detectorIndex[1];
 519         if (detectorIndex[2]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[2];
 520         else              ftxt << " " << detectorIndex[2];
 521         ftxt << "  " << detectorIndex[3];
 522         if (detectorIndex[4]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[4];
 523         else              ftxt << " " << detectorIndex[4];
 524       }
 525
 526     /* check valid index */
 527     if (detectorIndex[0]==-1||detectorIndex[1]==-1||detectorIndex[2]==-1||detectorIndex[3]==-1||detectorIndex[4]==-1) continue;
 528
 529       // Do not reconstruct anything in the holes
 530       if (detectorIndex[0]==13 || detectorIndex[0]==14 || detectorIndex[0]==15 ) { // sectors with holes
 531         if (detectorIndex[1]==2) { // plate with holes
 532           inholes++;
 533           continue;
 534         }
 535       }
 536
 537       parTOF[0] = tofRawDatum->GetTOF(); //TDC
 538       parTOF[1] = tofRawDatum->GetTOT(); // TOT
 539       parTOF[2] = tofRawDatum->GetTOT(); //ADC==TOF
 540       parTOF[3] = -1;//raw data: no track of undecalib sim time
 541       parTOF[4] = tofRawDatum->GetTOF(); // RAW time
 542       parTOF[5] = tofRawDatum->GetDeltaBC(); // deltaBC
 543       parTOF[6] = tofRawDatum->GetL0L1Latency(); // L0-L1 latency
 544       Double_t posClus[3];
 545       Double_t covClus[6];
 546       UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
 547       Int_t lab[3]={-1,-1,-1};
 548       Bool_t status=kTRUE;
 549       GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
 550       AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],lab,detectorIndex,parTOF,status,-1);
 551       InsertCluster(tofCluster);
 552
 553       if (fVerbose==2) {
 554         if (parTOF[1]<10)ftxt << "        " << parTOF[1];
 555         else if (parTOF[1]>=10 && parTOF[1]<100) ftxt << "      " << parTOF[1];
 556         else ftxt << "      " << parTOF[1];
 557         if (parTOF[0]<10) ftxt << "      " << parTOF[0] << endl;
 558         else if (parTOF[0]>=10 && parTOF[0]<100)   ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 559         else if (parTOF[0]>=100 && parTOF[0]<1000) ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 560         else ftxt << "   " << parTOF[3] << endl;
 561       }
 562
 563     } // closed loop on TOF raw data per current DDL file
 564
 565     clonesRawData->Clear();
 566
 567   } // closed loop on DDL index
 568
 569   if (fVerbose==2) ftxt.close();
 570
 571   AliDebug(1,Form("Number of found clusters: %d", fNumberOfTofClusters));
 572
 573   CalibrateRecPoint();
 574   FillRecPoint();
 575
 576   clustersTree->Fill();
 577
 578   ResetRecpoint();
 579
 580   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 581                    stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 582   if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 583
 584 }
 585 //______________________________________________________________________________
 586
 587 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader)
 588 {
 589   //
 590   // Converts RAW data to recpoints for TOF
 591   //
 592
 593   TStopwatch stopwatch;
 594   stopwatch.Start();
 595
 596   Int_t inholes = 0;
 597
 598   const Int_t kDDL = AliDAQ::NumberOfDdls("TOF");
 599
 600   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 601
 602   AliDebug(2,Form(" Event number %2d ", iEvent));
 603
 604   fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 605
 606   if (fTreeR == 0x0){
 607     fTOFLoader->MakeTree("R");
 608     fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 609   }
 610
 611   Int_t bufsize = 32000;
 612   fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 613
 614   TClonesArray * clonesRawData;
 615
 616   Int_t dummy = -1;
 617
 618   Int_t detectorIndex[5] = {-1, -1, -1, -1, -1};
 619   Int_t parTOF[7];
 620   ofstream ftxt;
 621   if (fVerbose==2) ftxt.open("TOFdigitsRead.txt",ios::app);
 622
 623   //AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 624   fTOFRawStream.Clear();
 625   fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
 626
 627   if (fDecoderVersion)
 628     AliInfo("Using New Decoder");
 629
 630   Int_t indexDDL = 0;
 631   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 632
 633     rawReader->Reset();
 634     if (fDecoderVersion)
 635       fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 636     else fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
 637
 638     clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 639
 640     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 641
 642       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 643
 644       //if (tofRawDatum->GetTOT()==-1 || tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 645       if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 646
 647       if (fVerbose==2) {
 648         if (indexDDL<10) ftxt << "  " << indexDDL;
 649         else         ftxt << " " << indexDDL;
 650         if (tofRawDatum->GetTRM()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRM();
 651         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTRM();
 652         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRMchain();
 653         if (tofRawDatum->GetTDC()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDC();
 654         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTDC();
 655         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDCchannel();
 656       }
 657
 658       fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 659                                          tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 660       dummy = detectorIndex[3];
 661       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 662       detectorIndex[4] = dummy;
 663
 664       if (fVerbose==2) {
 665         if (detectorIndex[0]<10) ftxt  << "  ->  " << detectorIndex[0];
 666         else              ftxt  << "  -> " << detectorIndex[0];
 667         ftxt << "  " << detectorIndex[1];
 668         if (detectorIndex[2]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[2];
 669         else              ftxt << " " << detectorIndex[2];
 670         ftxt << "  " << detectorIndex[3];
 671         if (detectorIndex[4]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[4];
 672         else              ftxt << " " << detectorIndex[4];
 673       }
 674
 675     /* check valid index */
 676     if (detectorIndex[0]==-1||detectorIndex[1]==-1||detectorIndex[2]==-1||detectorIndex[3]==-1||detectorIndex[4]==-1) continue;
 677
 678       // Do not reconstruct anything in the holes
 679       if (detectorIndex[0]==13 || detectorIndex[0]==14 || detectorIndex[0]==15 ) { // sectors with holes
 680         if (detectorIndex[1]==2) { // plate with holes
 681           inholes++;
 682           continue;
 683         }
 684       }
 685
 686       parTOF[0] = tofRawDatum->GetTOF(); // TDC
 687       parTOF[1] = tofRawDatum->GetTOT(); // TOT
 688       parTOF[2] = tofRawDatum->GetTOT(); // raw data have ADC=TOT
 689       parTOF[3] = -1; //raw data: no track of the undecalib sim time
 690       parTOF[4] = tofRawDatum->GetTOF(); // Raw time == TDC
 691       parTOF[5] = tofRawDatum->GetDeltaBC(); // deltaBC
 692       parTOF[6] = tofRawDatum->GetL0L1Latency(); // L0-L1 latency
 693       Double_t posClus[3];
 694       Double_t covClus[6];
 695       UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
 696       Int_t lab[3]={-1,-1,-1};
 697       Bool_t status=kTRUE;
 698       GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
 699       AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],lab,detectorIndex,parTOF,status,-1);
 700       InsertCluster(tofCluster);
 701
 702       if (fVerbose==2) {
 703         if (parTOF[1]<10)ftxt << "        " << parTOF[1];
 704         else if (parTOF[1]>=10 && parTOF[1]<100) ftxt << "      " << parTOF[1];
 705         else ftxt << "      " << parTOF[1];
 706         if (parTOF[0]<10) ftxt << "      " << parTOF[0] << endl;
 707         else if (parTOF[0]>=10 && parTOF[0]<100)   ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 708         else if (parTOF[0]>=100 && parTOF[0]<1000) ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 709         else ftxt << "   " << parTOF[3] << endl;
 710       }
 711
 712     } // closed loop on TOF raw data per current DDL file
 713
 714     clonesRawData->Clear();
 715
 716   } // closed loop on DDL index
 717
 718   if (fVerbose==2) ftxt.close();
 719
 720   AliDebug(1,Form("Number of found clusters: %d for event: %d", fNumberOfTofClusters, iEvent));
 721
 722   CalibrateRecPoint();
 723   FillRecPoint();
 724
 725   fTreeR->Fill();
 726   ResetRecpoint();
 727
 728   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
 729   fTOFLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 730
 731   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 732                stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 733   if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 734
 735 }
 736 //______________________________________________________________________________
 737
 738 void AliTOFClusterFinder::Raw2Digits(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader)
 739 {
 740   //
 741   // Converts RAW data to MC digits for TOF
 742   //
 743   //             (temporary solution)
 744   //
 745
 746   TStopwatch stopwatch;
 747   stopwatch.Start();
 748
 749   const Int_t kDDL = AliTOFGeometry::NDDL()*AliTOFGeometry::NSectors();
 750
 751   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 752
 753   fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
 754   if (fTreeD)
 755     {
 756     AliInfo("TreeD re-creation");
 757     fTreeD = 0x0;
 758     fTOFLoader->MakeTree("D");
 759     fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
 760     }
 761
 762   TClonesArray *tofDigits = new TClonesArray("AliTOFdigit",10000);
 763   Int_t bufsize = 32000;
 764   fTreeD->Branch("TOF", &tofDigits, bufsize);
 765
 766   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 767
 768   AliDebug(2,Form(" Event number %2d ", iEvent));
 769
 770   TClonesArray * clonesRawData;
 771
 772   Int_t dummy = -1;
 773
 774   Int_t detectorIndex[5];
 775   Int_t digit[4];
 776
 777   //AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 778   fTOFRawStream.Clear();
 779   fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
 780
 781   if (fDecoderVersion)
 782     AliInfo("Using New Decoder");
 783
 784   Int_t indexDDL = 0;
 785   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 786
 787     rawReader->Reset();
 788     if (fDecoderVersion)
 789       fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 790     else fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
 791
 792     clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 793
 794     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 795
 796       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 797
 798       //if (!tofRawDatum->GetTOT() || !tofRawDatum->GetTOF()) continue;
 799       if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 800
 801       fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 802                                          tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 803       dummy = detectorIndex[3];
 804       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 805       detectorIndex[4] = dummy;
 806
 807       digit[0] = fTOFRawStream.GetTofBin();
 808       digit[1] = fTOFRawStream.GetToTbin();
 809       digit[2] = fTOFRawStream.GetToTbin();
 810       digit[3] = -1;
 811
 812       Int_t tracknum[3]={-1,-1,-1};
 813
 814       TClonesArray &aDigits = *tofDigits;
 815       Int_t last=tofDigits->GetEntriesFast();
 816       new (aDigits[last]) AliTOFdigit(tracknum, detectorIndex, digit);
 817
 818     } // while loop
 819
 820     clonesRawData->Clear();
 821
 822   } // DDL Loop
 823
 824   fTreeD->Fill();
 825
 826   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
 827   fTOFLoader->WriteDigits("OVERWRITE");
 828
 829   delete tofDigits;
 830
 831   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.2fs C:%.2fs",
 832                    stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 833
 834 }
 835
 836 //______________________________________________________________________________
 837
 838 void AliTOFClusterFinder::Raw2Digits(AliRawReader *rawReader, TTree* digitsTree)
 839 {
 840   //
 841   // Converts RAW data to MC digits for TOF for the current event
 842   //
 843   //
 844
 845   TStopwatch stopwatch;
 846   stopwatch.Start();
 847
 848   const Int_t kDDL = AliTOFGeometry::NDDL()*AliTOFGeometry::NSectors();
 849
 850   if (!digitsTree)
 851     {
 852     AliError("No input digits Tree");
 853     return;
 854     }
 855
 856   TClonesArray *tofDigits = new TClonesArray("AliTOFdigit",10000);
 857   Int_t bufsize = 32000;
 858   digitsTree->Branch("TOF", &tofDigits, bufsize);
 859
 860   TClonesArray * clonesRawData;
 861
 862   Int_t dummy = -1;
 863
 864   Int_t detectorIndex[5];
 865   Int_t digit[4];
 866
 867   //AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 868   fTOFRawStream.Clear();
 869   fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
 870
 871   if (fDecoderVersion)
 872     AliInfo("Using New Decoder");
 873
 874   Int_t indexDDL = 0;
 875   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 876
 877     rawReader->Reset();
 878     if (fDecoderVersion)
 879       fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 880     else fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
 881
 882     clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 883
 884     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 885
 886       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 887
 888       //if (!tofRawDatum->GetTOT() || !tofRawDatum->GetTOF()) continue;
 889       if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 890
 891       fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 892                                          tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 893       dummy = detectorIndex[3];
 894       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 895       detectorIndex[4] = dummy;
 896
 897       digit[0] = fTOFRawStream.GetTofBin();
 898       digit[1] = fTOFRawStream.GetToTbin();
 899       digit[2] = fTOFRawStream.GetToTbin();
 900       digit[3] = -1;
 901
 902       Int_t tracknum[3]={-1,-1,-1};
 903
 904       TClonesArray &aDigits = *tofDigits;
 905       Int_t last=tofDigits->GetEntriesFast();
 906       new (aDigits[last]) AliTOFdigit(tracknum, detectorIndex, digit);
 907
 908     } // while loop
 909
 910     clonesRawData->Clear();
 911
 912   } // DDL Loop
 913
 914   digitsTree->Fill();
 915
 916   delete tofDigits;
 917
 918   AliDebug(1, Form("Got %d digits: ", fDigits->GetEntries()));
 919   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and fill TOF digit tree : R:%.2fs C:%.2fs",
 920                    stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 921
 922 }
 923 //______________________________________________________________________________
 924
 925 Int_t AliTOFClusterFinder::InsertCluster(AliTOFcluster *tofCluster) {
 926   //---------------------------------------------------------------------------//
 927   // This function adds a TOF cluster to the array of TOF clusters sorted in Z //
 928   //---------------------------------------------------------------------------//
 929   if (fNumberOfTofClusters==kTofMaxCluster) {
 930     AliError("Too many clusters !");
 931     return 1;
 932   }
 933
 934   if (fNumberOfTofClusters==0) {
 935     fTofClusters[fNumberOfTofClusters++] = tofCluster;
 936     return 0;
 937   }
 938
 939   Int_t ii = FindClusterIndex(tofCluster->GetZ());
 940   memmove(fTofClusters+ii+1 ,fTofClusters+ii,(fNumberOfTofClusters-ii)*sizeof(AliTOFcluster*));
 941   fTofClusters[ii] = tofCluster;
 942   fNumberOfTofClusters++;
 943
 944   return 0;
 945
 946 }
 947 //_________________________________________________________________________
 948
 949 Int_t AliTOFClusterFinder::FindClusterIndex(Double_t z) const {
 950   //--------------------------------------------------------------------
 951   // This function returns the index of the nearest cluster in z
 952   //--------------------------------------------------------------------
 953   if (fNumberOfTofClusters==0) return 0;
 954   if (z <= fTofClusters[0]->GetZ()) return 0;
 955   if (z > fTofClusters[fNumberOfTofClusters-1]->GetZ()) return fNumberOfTofClusters;
 956   Int_t b = 0, e = fNumberOfTofClusters-1, m = (b+e)/2;
 957   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
 958     if (z > fTofClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
 959     else e=m;
 960   }
 961
 962   return m;
 963
 964 }
 965 //_________________________________________________________________________
 966
 967 void AliTOFClusterFinder::FillRecPoint()
 968 {
 969   //
 970   // Copy the global array of AliTOFcluster, i.e. fTofClusters (sorted
 971   // in Z) in the global TClonesArray of AliTOFcluster,
 972   // i.e. fRecPoints.
 973   //
 974
 975   Int_t ii, jj;
 976
 977   Int_t detectorIndex[5];
 978   Int_t parTOF[7];
 979   Int_t trackLabels[3];
 980   Int_t digitIndex = -1;
 981   Bool_t status=kTRUE;
 982
 983   TClonesArray &lRecPoints = *fRecPoints;
 984
 985   for (ii=0; ii<fNumberOfTofClusters; ii++) {
 986
 987     digitIndex = fTofClusters[ii]->GetIndex();
 988     for(jj=0; jj<5; jj++) detectorIndex[jj] = fTofClusters[ii]->GetDetInd(jj);
 989     for(jj=0; jj<3; jj++) trackLabels[jj] = fTofClusters[ii]->GetLabel(jj);
 990     parTOF[0] = fTofClusters[ii]->GetTDC(); // TDC
 991     parTOF[1] = fTofClusters[ii]->GetToT(); // TOT
 992     parTOF[2] = fTofClusters[ii]->GetADC(); // ADC=TOT
 993     parTOF[3] = fTofClusters[ii]->GetTDCND(); // TDCND
 994     parTOF[4] = fTofClusters[ii]->GetTDCRAW();//RAW
 995     parTOF[5] = fTofClusters[ii]->GetDeltaBC();//deltaBC
 996     parTOF[6] = fTofClusters[ii]->GetL0L1Latency();//L0-L1 latency
 997     status=fTofClusters[ii]->GetStatus();
 998     Double_t posClus[3];
 999     Double_t covClus[6];
1000     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
1001     GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
1002     new(lRecPoints[ii]) AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],trackLabels,detectorIndex, parTOF,status,digitIndex);
1003
1004     AliDebug(2, Form(" %4d  %4d  %f %f %f  %f %f %f %f %f %f  %3d %3d %3d  %2d %1d %2d %1d %2d  %4d %3d %3d %4d %4d  %1d  %4d",
1005                      ii, volIdClus, posClus[0], posClus[1], posClus[2],
1006                      fTofClusters[ii]->GetSigmaX2(),
1007                      fTofClusters[ii]->GetSigmaXY(),
1008                      fTofClusters[ii]->GetSigmaXZ(),
1009                      fTofClusters[ii]->GetSigmaY2(),
1010                      fTofClusters[ii]->GetSigmaYZ(),
1011                      fTofClusters[ii]->GetSigmaZ2(),
1012                      trackLabels[0], trackLabels[1], trackLabels[2],
1013                      detectorIndex[0], detectorIndex[1], detectorIndex[2], detectorIndex[3], detectorIndex[4],
1014                      parTOF[0], parTOF[1], parTOF[2], parTOF[3], parTOF[4],
1015                      status, digitIndex));
1016
1017   } // loop on clusters
1018
1019 }
1020
1021 //_________________________________________________________________________
1022 void AliTOFClusterFinder::CalibrateRecPoint()
1023 {
1024   //
1025   // Copy the global array of AliTOFcluster, i.e. fTofClusters (sorted
1026   // in Z) in the global TClonesArray of AliTOFcluster,
1027   // i.e. fRecPoints.
1028   //
1029
1030   Int_t ii, jj;
1031
1032   Int_t detectorIndex[5];
1033   Int_t digitIndex = -1;
1034   Double_t tToT;
1035   Double_t timeCorr;
1036   Int_t   tdcCorr;
1037   Float_t tdcLatencyWindow;
1038   AliDebug(1," Calibrating TOF Clusters");
1039
1040   AliTOFChannelOnlineArray *calDelay = fTOFcalib->GetTOFOnlineDelay();
1041   AliTOFChannelOnlineStatusArray *calStatus = fTOFcalib->GetTOFOnlineStatus();
1042   TObjArray *calTOFArrayOffline = fTOFcalib->GetTOFCalArrayOffline();
1043
1044   AliTOFDeltaBCOffset *deltaBCOffsetObj = fTOFcalib->GetDeltaBCOffset();
1045   Int_t deltaBCOffset = deltaBCOffsetObj->GetDeltaBCOffset();
1046   AliTOFCTPLatency *ctpLatencyObj = fTOFcalib->GetCTPLatency();
1047   Float_t ctpLatency = ctpLatencyObj->GetCTPLatency();
1048   AliTOFT0Fill *t0FillObj = fTOFcalib->GetT0Fill();
1049   Float_t t0Fill = t0FillObj->GetT0Fill();
1050
1051   TString validity = (TString)fTOFcalib->GetOfflineValidity();
1052   Int_t calibration = -1;
1053   if (validity.CompareTo("valid")==0) {
1054     AliInfo(Form(" validity = %s - Using offline calibration parameters",validity.Data()));
1055     calibration = 1;
1056   } else {
1057     AliInfo(Form(" validity = %s - Using online calibration parameters",validity.Data()));
1058     calibration = 0 ;
1059   }
1060
1061   for (ii=0; ii<fNumberOfTofClusters; ii++) {
1062     digitIndex = fTofClusters[ii]->GetIndex();
1063     for(jj=0; jj<5; jj++) detectorIndex[jj] = fTofClusters[ii]->GetDetInd(jj);
1064
1065     Int_t index = AliTOFGeometry::GetIndex(detectorIndex);
1066
1067     UChar_t statusPulser=calStatus->GetPulserStatus(index);
1068     UChar_t statusNoise=calStatus->GetNoiseStatus(index);
1069     UChar_t statusHW=calStatus->GetHWStatus(index);
1070     UChar_t status=calStatus->GetStatus(index);
1071     tdcLatencyWindow = calStatus->GetLatencyWindow(index) * 1.e3; /* ns -> ps */
1072
1073     //check the status, also unknown is fine!!!!!!!
1074
1075     AliDebug(2, Form(" Status for channel %d = %d",index, (Int_t)status));
1076     if((statusPulser & AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFPulserBad)==(AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFPulserBad)||(statusNoise & AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFNoiseBad)==(AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFNoiseBad)||(statusHW & AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFHWBad)==(AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFHWBad)){
1077       AliDebug(2, Form(" Bad Status for channel %d",index));
1078       fTofClusters[ii]->SetStatus(kFALSE); //odd convention, to avoid conflict with calibration objects currently in the db (temporary solution).
1079     }
1080     else {
1081       AliDebug(2, Form(" Good Status for channel %d",index));
1082     }
1083     // Get Rough channel online equalization
1084     Double_t roughDelay=(Double_t)calDelay->GetDelay(index);  // in ns
1085     AliDebug(2,Form(" channel delay (ns) = %f", roughDelay));
1086     // Get Refined channel offline calibration parameters
1087     if (calibration ==1){
1088       AliTOFChannelOffline * calChannelOffline = (AliTOFChannelOffline*)calTOFArrayOffline->At(index);
1089       Double_t par[6];
1090       for (Int_t j = 0; j<6; j++){
1091         par[j]=(Double_t)calChannelOffline->GetSlewPar(j);
1092      }
1093       AliDebug(2,Form(" Calib Pars = %f, %f, %f, %f, %f, %f ",par[0],par[1],par[2],par[3],par[4],par[5]));
1094       AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (counts) = %d , %d", fTofClusters[ii]->GetToT(),fTofClusters[ii]->GetTDC()));
1095       tToT = (Double_t)(fTofClusters[ii]->GetToT()*AliTOFGeometry::ToTBinWidth());
1096       tToT*=1.E-3; //ToT in ns
1097
1098       /* check TOT limits and set new TOT in case */
1099       if (tToT < AliTOFGeometry::SlewTOTMin()) tToT = AliTOFGeometry::SlewTOTMin();
1100       if (tToT > AliTOFGeometry::SlewTOTMax()) tToT = AliTOFGeometry::SlewTOTMax();
1101
1102       AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (ns)= %e, %e",fTofClusters[ii]->GetTDC()*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3,tToT));
1103       timeCorr=par[0]+par[1]*tToT+par[2]*tToT*tToT+par[3]*tToT*tToT*tToT+par[4]*tToT*tToT*tToT*tToT+par[5]*tToT*tToT*tToT*tToT*tToT; // the time correction (ns)
1104     }
1105     else {
1106       timeCorr = roughDelay; // correction in ns
1107     }
1108     AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (ns)= %e, %e",fTofClusters[ii]->GetTDC()*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3,fTofClusters[ii]->GetToT()*AliTOFGeometry::ToTBinWidth()));
1109     AliDebug(2,Form(" The time correction (ns) = %f", timeCorr));
1110     timeCorr=(Double_t)(fTofClusters[ii]->GetTDC())*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3-timeCorr;//redefine the time
1111     timeCorr*=1.E3;
1112     AliDebug(2,Form(" The channel time, corr (ps)= %e",timeCorr ));
1113
1114     /* here timeCorr should be already corrected for calibration.
1115      * we now go into further corrections keeping in mind that timeCorr
1116      * is in ps.
1117      *
1118      * the following corrections are performed in this way:
1119      *
1120      *    time = timeRaw - deltaBC + L0L1Latency + CTPLatency - TDCLatencyWindow - T0Fill
1121      *
1122      */
1123
1124     AliDebug(2, Form("applying further corrections (DeltaBC): DeltaBC=%d (BC bins), DeltaBCoffset=%d (BC bins)", fTofClusters[ii]->GetDeltaBC(), deltaBCOffset));
1125     AliDebug(2, Form("applying further corrections (L0L1Latency): L0L1Latency=%d (BC bins)", fTofClusters[ii]->GetL0L1Latency()));
1126     AliDebug(2, Form("applying further corrections (CTPLatency): CTPLatency=%f (ps)", ctpLatency));
1127     AliDebug(2, Form("applying further corrections (TDCLatencyWindow): TDCLatencyWindow=%f (ps)", tdcLatencyWindow));
1128     AliDebug(2, Form("applying further corrections (T0Fill): T0Fill=%f (ps)", t0Fill));
1129
1130     /* deltaBC correction */
1131     timeCorr -= (fTofClusters[ii]->GetDeltaBC() - deltaBCOffset) * AliTOFGeometry::BunchCrossingBinWidth();
1132     /* L0L1-latency correction */
1133     timeCorr += fTofClusters[ii]->GetL0L1Latency() * AliTOFGeometry::BunchCrossingBinWidth();
1134     /* CTP-latency correction (from OCDB) */
1135     timeCorr += ctpLatency;
1136     /* TDC latency-window correction (from OCDB) */
1137     timeCorr -= tdcLatencyWindow;
1138     /* T0Fill correction (from OCDB) */
1139     timeCorr -= t0Fill;
1140
1141     /*
1142      * end of furhter corrections
1143      */
1144
1145     tdcCorr=(Int_t)(timeCorr/AliTOFGeometry::TdcBinWidth()); //the corrected time (tdc counts)
1146     fTofClusters[ii]->SetTDC(tdcCorr);
1147   } // loop on clusters
1148
1149 }
1150 //______________________________________________________________________________
1151
1152 void AliTOFClusterFinder::ResetRecpoint()
1153 {
1154   //
1155   // Clear the list of reconstructed points
1156   //
1157
1158   fNumberOfTofClusters = 0;
1159   if (fRecPoints) fRecPoints->Clear();
1160
1161 }
1162 //______________________________________________________________________________
1163
1164 void AliTOFClusterFinder::Load()
1165 {
1166   //
1167   // Load TOF.Digits.root and TOF.RecPoints.root files
1168   //
1169
1170   fTOFLoader->LoadDigits("READ");
1171   fTOFLoader->LoadRecPoints("recreate");
1172
1173 }
1174 //______________________________________________________________________________
1175
1176 void AliTOFClusterFinder::LoadClusters()
1177 {
1178   //
1179   // Load TOF.RecPoints.root file
1180   //
1181
1182   fTOFLoader->LoadRecPoints("recreate");
1183
1184 }
1185 //______________________________________________________________________________
1186
1187 void AliTOFClusterFinder::UnLoad()
1188 {
1189   //
1190   // Unload TOF.Digits.root and TOF.RecPoints.root files
1191   //
1192
1193   fTOFLoader->UnloadDigits();
1194   fTOFLoader->UnloadRecPoints();
1195
1196 }
1197 //______________________________________________________________________________
1198
1199 void AliTOFClusterFinder::UnLoadClusters()
1200 {
1201   //
1202   // Unload TOF.RecPoints.root file
1203   //
1204
1205   fTOFLoader->UnloadRecPoints();
1206
1207 }
1208 //-------------------------------------------------------------------------
1209 UShort_t AliTOFClusterFinder::GetClusterVolIndex(const Int_t * const ind) const {
1210
1211   //First of all get the volume ID to retrieve the l2t transformation...
1212   //
1213   // Detector numbering scheme
1214   Int_t nSector = 18;
1215   Int_t nPlate  = 5;
1216   Int_t nStripA = 15;
1217   Int_t nStripB = 19;
1218   Int_t nStripC = 19;
1219
1220   Int_t isector =ind[0];
1221   if (isector >= nSector)
1222     AliError(Form("Wrong sector number in TOF (%d) !",isector));
1223   Int_t iplate = ind[1];
1224   if (iplate >= nPlate)
1225     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
1226   Int_t istrip = ind[2];
1227
1228   Int_t stripOffset = 0;
1229   switch (iplate) {
1230   case 0:
1231     stripOffset = 0;
1232     break;
1233   case 1:
1234     stripOffset = nStripC;
1235     break;
1236   case 2:
1237     stripOffset = nStripC+nStripB;
1238     break;
1239   case 3:
1240     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
1241     break;
1242   case 4:
1243     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
1244     break;
1245   default:
1246     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
1247     break;
1248   };
1249
1250   Int_t index= (2*(nStripC+nStripB)+nStripA)*isector +
1251                stripOffset +
1252                istrip;
1253
1254   UShort_t volIndex = AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kTOF,index);
1255   return volIndex;
1256 }
1257 //
1258 //-------------------------------------------------------------------------
1259 void AliTOFClusterFinder::GetClusterPars(Int_t *ind, Double_t* pos,Double_t* cov) const {
1260
1261   //First of all get the volume ID to retrieve the l2t transformation...
1262   //
1263   UShort_t volIndex = GetClusterVolIndex(ind);
1264   //
1265   //
1266   //we now go in the system of the strip: determine the local coordinates
1267   //
1268   //
1269   // 47---------------------------------------------------0  ^ z
1270   // | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | 1 |
1271   // -----------------------------------------------------   | y going outwards
1272   // | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | 0 |  par[0]=0;
1273
1274   // -----------------------------------------------------   |
1275   // x <-----------------------------------------------------
1276
1277   /*
1278   Float_t localX = (ind[4]-23.5)*AliTOFGeometry::XPad();
1279   Float_t localY = 0;
1280   Float_t localZ = (ind[3]- 0.5)*AliTOFGeometry::ZPad();
1281   */
1282   Float_t localX = (ind[4]-AliTOFGeometry::NpadX()/2)*AliTOFGeometry::XPad()+AliTOFGeometry::XPad()/2.;
1283   Float_t localY = 0;
1284   Float_t localZ = (ind[3]-AliTOFGeometry::NpadZ()/2)*AliTOFGeometry::ZPad()+AliTOFGeometry::ZPad()/2.;
1285   //move to the tracking ref system
1286
1287   Double_t lpos[3];
1288   lpos[0] = localX;
1289   lpos[1] = localY;
1290   lpos[2] = localZ;
1291
1292   const TGeoHMatrix *l2t= AliGeomManager::GetTracking2LocalMatrix(volIndex);
1293   // Get The position in the track ref system
1294   Double_t tpos[3];
1295   l2t->MasterToLocal(lpos,tpos);
1296   pos[0] = tpos[0];
1297   pos[1] = tpos[1];
1298   pos[2] = tpos[2];
1299
1300   //Get The cluster covariance in the track ref system
1301   Double_t lcov[9];
1302
1303   //cluster covariance in the local system:
1304   // sx2   0   0
1305   // 0     0   0
1306   // 0     0   sz2
1307
1308   lcov[0] = AliTOFGeometry::XPad()*AliTOFGeometry::XPad()/12.;
1309   lcov[1] = 0;
1310   lcov[2] = 0;
1311   lcov[3] = 0;
1312   lcov[4] = 0;
1313   lcov[5] = 0;
1314   lcov[6] = 0;
1315   lcov[7] = 0;
1316   lcov[8] = AliTOFGeometry::ZPad()*AliTOFGeometry::ZPad()/12.;
1317
1318   //cluster covariance in the tracking system:
1319   TGeoHMatrix m;
1320   m.SetRotation(lcov);
1321   m.Multiply(l2t);
1322   m.MultiplyLeft(&l2t->Inverse());
1323   Double_t *tcov = m.GetRotationMatrix();
1324   cov[0] = tcov[0]; cov[1] = tcov[1]; cov[2] = tcov[2];
1325   cov[3] = tcov[4]; cov[4] = tcov[5];
1326   cov[5] = tcov[8];
1327
1328   return;
1329
1330 }