TOF/AliTOFClusterFinder.cxx

   1 /***************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /*
  17 $Log: AliTOFClusterFinder.cxx,v $
  18 Revision 1.31  2007/11/24 14:53:19  zampolli
  19 Status flag implemented as UChar_t
  20
  21 Revision 1.30  2007/10/04 13:08:52  arcelli
  22 updates to comply with AliTOFGeometryV5 becoming AliTOFGeometry
  23
  24 Revision 1.29  2007/10/03 10:42:33  arcelli
  25 updates to handle new AliTOFcluster, inheriting form AliCluster3D
  26
  27 Revision 1.28  2007/05/31 16:06:05  arcelli
  28 move instance of AliRawStream outside loop on DDL
  29
  30 Revision 1.27  2007/05/02 16:31:49  arcelli
  31 Add methods to handle single event reconstruction.  retrieval of Calib
  32 info moved to AliTOFReconstructor ctor, and passed via a pointer to
  33 AliTOFcalib
  34
  35 Revision 1.26  2007/04/30 19:02:24  arcelli
  36 hopefully the last refinements for correct type conversion in calibration
  37
  38 Revision 1.25  2007/04/30 15:22:17  arcelli
  39 Change TOF digit Time, Tot etc to int type
  40
  41 Revision 1.24  2007/04/27 11:19:31  arcelli
  42 updates for the new decoder
  43
  44 Revision 1.23  2007/04/23 16:51:39  decaro
  45 Digits-to-raw_data conversion: correction for a more real description
  46 (A.De Caro, R.Preghenella)
  47
  48 Revision 1.22  2007/04/19 17:26:32  arcelli
  49 Fix a bug (add some debug printout
  50
  51 Revision 1.21  2007/04/18 17:28:12  arcelli
  52 Set the ToT bin width to the one actually used...
  53
  54 Revision 1.20  2007/03/09 09:57:23  arcelli
  55  Remove a forgotten include of Riostrem
  56
  57 Revision 1.19  2007/03/08 15:41:20  arcelli
  58 set uncorrected times when filling RecPoints
  59
  60 Revision 1.18  2007/03/06 16:31:20  arcelli
  61 Add Uncorrected TOF Time signal
  62
  63 Revision 1.17  2007/02/28 18:09:11  arcelli
  64 Add protection against failed retrieval of the CDB cal object,
  65 now Reconstruction exits with AliFatal
  66
  67 Revision 1.16  2007/02/20 15:57:00  decaro
  68 Raw data update: to read the TOF raw data defined in UNPACKED mode
  69
  70
  71 Revision 0.03  2005/07/28 A. De Caro
  72          Implement public method
  73          Raw2Digits(Int_t, AliRawReader *)
  74          to convert digits from raw data in MC digits
  75          (temporary solution)
  76
  77 Revision 0.02  2005/07/27 A. De Caro
  78          Implement public method
  79          Digits2RecPoint(Int_t)
  80          to convert digits in clusters
  81
  82 Revision 0.02  2005/07/26 A. De Caro
  83          Implement private methods
  84          InsertCluster(AliTOFcluster *)
  85          FindClusterIndex(Double_t)
  86          originally implemented in AliTOFtracker
  87          by S. Arcelli and C. Zampolli
  88
  89 Revision 0.01  2005/07/25 A. De Caro
  90          Implement public methods
  91          Digits2RecPoint(AliRawReader *, TTree *)
  92          Digits2RecPoint(Int_t, AliRawReader *)
  93          to convert raw data in clusters
  94  */
  95
  96 ////////////////////////////////////////////////////////////////
  97 //                                                            //
  98 //         Class for TOF cluster finder                       //
  99 //                                                            //
 100 // Starting from Raw Data, create rec points,                 //
 101 //                         fill TreeR for TOF,                //
 102 //                         write TOF.RecPoints.root file      //
 103 //                                                            //
 104 ////////////////////////////////////////////////////////////////
 105
 106 #include "Riostream.h"
 107
 108 #include "TClonesArray.h"
 109 #include "TStopwatch.h"
 110 #include "TTree.h"
 111 //#include <TGeoManager.h>
 112 #include <TGeoMatrix.h>
 113 //#include <TGeoPhysicalNode.h>
 114
 115 #include "AliDAQ.h"
 116 #include "AliLoader.h"
 117 #include "AliLog.h"
 118 #include "AliRawReader.h"
 119 #include "AliRunLoader.h"
 120 //#include "AliAlignObj.h"
 121 #include <AliGeomManager.h>
 122
 123 #include "AliTOFcalib.h"
 124 #include "AliTOFChannelOnlineArray.h"
 125 #include "AliTOFChannelOnlineStatusArray.h"
 126 #include "AliTOFChannelOffline.h"
 127 #include "AliTOFClusterFinder.h"
 128 #include "AliTOFcluster.h"
 129 #include "AliTOFdigit.h"
 130 #include "AliTOFGeometry.h"
 131 #include "AliTOFrawData.h"
 132 //#include "AliTOFRawStream.h"
 133
 134 //extern TFile *gFile;
 135
 136 ClassImp(AliTOFClusterFinder)
 137
 138 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(AliTOFcalib *calib):
 139   fRunLoader(0),
 140   fTOFLoader(0),
 141   fTreeD(0),
 142   fTreeR(0),
 143   fDigits(new TClonesArray("AliTOFdigit", 4000)),
 144   fRecPoints(new TClonesArray("AliTOFcluster", 4000)),
 145   fNumberOfTofClusters(0),
 146   fVerbose(0),
 147   fDecoderVersion(0),
 148   fTOFcalib(calib),
 149   fTOFRawStream(AliTOFRawStream())
 150 {
 151 //
 152 // Constructor
 153 //
 154
 155 }
 156
 157 //______________________________________________________________________________
 158
 159 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(AliRunLoader* runLoader, AliTOFcalib *calib):
 160   fRunLoader(runLoader),
 161   fTOFLoader(runLoader->GetLoader("TOFLoader")),
 162   fTreeD(0),
 163   fTreeR(0),
 164   fDigits(new TClonesArray("AliTOFdigit", 4000)),
 165   fRecPoints(new TClonesArray("AliTOFcluster", 4000)),
 166   fNumberOfTofClusters(0),
 167   fVerbose(0),
 168   fDecoderVersion(0),
 169   fTOFcalib(calib),
 170   fTOFRawStream(AliTOFRawStream())
 171 {
 172 //
 173 // Constructor
 174 //
 175
 176 }
 177
 178 //------------------------------------------------------------------------
 179 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(const AliTOFClusterFinder &source)
 180   :TObject(source),
 181   fRunLoader(0),
 182   fTOFLoader(0),
 183   fTreeD(0),
 184   fTreeR(0),
 185   fDigits(source.fDigits),
 186   fRecPoints(source.fRecPoints),
 187   fNumberOfTofClusters(0),
 188   fVerbose(0),
 189   fDecoderVersion(source.fDecoderVersion),
 190   fTOFcalib(source.fTOFcalib),
 191   fTOFRawStream(source.fTOFRawStream)
 192 {
 193   // copy constructor
 194 }
 195
 196 //------------------------------------------------------------------------
 197 AliTOFClusterFinder& AliTOFClusterFinder::operator=(const AliTOFClusterFinder &source)
 198 {
 199   // ass. op.
 200
 201   if (this == &source)
 202     return *this;
 203
 204   TObject::operator=(source);
 205   fDigits=source.fDigits;
 206   fRecPoints=source.fRecPoints;
 207   fVerbose=source.fVerbose;
 208   fDecoderVersion=source.fDecoderVersion;
 209   fTOFcalib=source.fTOFcalib;
 210   fTOFRawStream=source.fTOFRawStream;
 211   return *this;
 212
 213 }
 214 //______________________________________________________________________________
 215
 216 AliTOFClusterFinder::~AliTOFClusterFinder()
 217 {
 218
 219   //
 220   // Destructor
 221   //
 222
 223   if (fDigits)
 224     {
 225       fDigits->Delete();
 226       delete fDigits;
 227       fDigits=0;
 228     }
 229   if (fRecPoints)
 230     {
 231       fRecPoints->Delete();
 232       delete fRecPoints;
 233       fRecPoints=0;
 234     }
 235
 236 }
 237 //______________________________________________________________________________
 238
 239 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent)
 240 {
 241   //
 242   // Converts digits to recpoints for TOF
 243   //
 244
 245   TStopwatch stopwatch;
 246   stopwatch.Start();
 247
 248   Int_t inholes = 0;
 249
 250   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 251
 252   fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
 253   if (fTreeD == 0x0)
 254     {
 255       AliFatal("AliTOFClusterFinder: Can not get TreeD");
 256     }
 257
 258   TBranch *branch = fTreeD->GetBranch("TOF");
 259   if (!branch) {
 260     AliError("can't get the branch with the TOF digits !");
 261     return;
 262   }
 263
 264   TClonesArray staticdigits("AliTOFdigit",10000);
 265   staticdigits.Clear();
 266   TClonesArray *digits =&staticdigits;
 267   branch->SetAddress(&digits);
 268
 269   ResetRecpoint();
 270
 271   fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 272   if (fTreeR == 0x0)
 273     {
 274       fTOFLoader->MakeTree("R");
 275       fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 276     }
 277
 278   Int_t bufsize = 32000;
 279   fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 280
 281   fTreeD->GetEvent(0);
 282   Int_t nDigits = digits->GetEntriesFast();
 283   AliDebug(2,Form("Number of TOF digits: %d",nDigits));
 284
 285   Int_t ii;
 286   Int_t dig[5]; //cluster detector indeces
 287   Int_t  parTOF[5]; //The TOF signal parameters
 288   Bool_t status=kTRUE; // assume all sim channels ok in the beginning...
 289   for (ii=0; ii<nDigits; ii++) {
 290     AliTOFdigit *d = (AliTOFdigit*)digits->UncheckedAt(ii);
 291     dig[0]=d->GetSector();
 292     dig[1]=d->GetPlate();
 293     dig[2]=d->GetStrip();
 294     dig[3]=d->GetPadz();
 295     dig[4]=d->GetPadx();
 296
 297     // Do not reconstruct anything in the holes
 298     if (dig[0]==13 || dig[0]==14 || dig[0]==15 ) { // sectors with holes
 299       if (dig[1]==2) { // plate with holes
 300         inholes++;
 301         continue;
 302       }
 303     }
 304
 305     AliDebug(2,Form(" %2d  %1d  %2d  %1d  %2d ",dig[0],dig[1],dig[2],dig[3],dig[4]));
 306
 307     parTOF[0] = d->GetTdc(); //the TDC signal
 308     parTOF[1] = d->GetToT(); //the ToT signal
 309     parTOF[2] = d->GetAdc(); // the adc charge
 310     parTOF[3] = d->GetTdcND(); // non decalibrated sim time
 311     parTOF[4] = d->GetTdc(); // raw time, == Tdc time for the moment
 312     Double_t posClus[3];
 313     Double_t covClus[6];
 314     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(dig);
 315     GetClusterPars(dig, posClus,covClus);
 316     AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],d->GetTracks(),dig,parTOF,status,ii);
 317     InsertCluster(tofCluster);
 318
 319   }
 320
 321   AliInfo(Form("Number of found clusters: %d for event: %d", fNumberOfTofClusters, iEvent));
 322
 323   CalibrateRecPoint();
 324   FillRecPoint();
 325
 326   fTreeR->Fill();
 327   ResetRecpoint();
 328
 329   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
 330   fTOFLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 331
 332   AliInfo(Form("Execution time to read TOF digits and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 333                stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 334   if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 335
 336 }
 337
 338 //______________________________________________________________________________
 339
 340 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(TTree* digitsTree, TTree* clusterTree)
 341 {
 342   //
 343   // Converts digits to recpoints for TOF
 344   //
 345
 346   TStopwatch stopwatch;
 347   stopwatch.Start();
 348
 349   Int_t inholes = 0;
 350
 351   ///  fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 352
 353   if (digitsTree == 0x0)
 354     {
 355       AliFatal("AliTOFClusterFinder: Can not get TreeD");
 356     }
 357
 358   TBranch *branch = digitsTree->GetBranch("TOF");
 359   if (!branch) {
 360     AliError("can't get the branch with the TOF digits !");
 361     return;
 362   }
 363
 364   TClonesArray staticdigits("AliTOFdigit",10000);
 365   staticdigits.Clear();
 366   TClonesArray *digits = & staticdigits;
 367   branch->SetAddress(&digits);
 368
 369   ResetRecpoint();
 370
 371   fTreeR=clusterTree;
 372   Int_t bufsize = 32000;
 373   fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 374
 375   digitsTree->GetEvent(0);
 376   Int_t nDigits = digits->GetEntriesFast();
 377   AliDebug(2,Form("Number of TOF digits: %d",nDigits));
 378
 379   Int_t ii;
 380   Int_t dig[5]; //cluster detector indeces
 381   Int_t  parTOF[5]; //The TOF signal parameters
 382   Bool_t status=kTRUE; // assume all sim channels ok in the beginning...
 383   for (ii=0; ii<nDigits; ii++) {
 384     AliTOFdigit *d = (AliTOFdigit*)digits->UncheckedAt(ii);
 385     dig[0]=d->GetSector();
 386     dig[1]=d->GetPlate();
 387     dig[2]=d->GetStrip();
 388     dig[3]=d->GetPadz();
 389     dig[4]=d->GetPadx();
 390
 391     // Do not reconstruct anything in the holes
 392     if (dig[0]==13 || dig[0]==14 || dig[0]==15 ) { // sectors with holes
 393       if (dig[1]==2) { // plate with holes
 394         inholes++;
 395         continue;
 396       }
 397     }
 398
 399     //    AliDebug(2,Form(" %2d  %1d  %2d  %1d  %2d ",dig[0],dig[1],dig[2],dig[3],dig[4]));
 400
 401     parTOF[0] = d->GetTdc(); //the TDC signal
 402     parTOF[1] = d->GetToT(); //the ToT signal
 403     parTOF[2] = d->GetAdc(); // the adc charge
 404     parTOF[3] = d->GetTdcND(); // non decalibrated sim time
 405     parTOF[4] = d->GetTdc(); // raw time, == Tdc time for the moment
 406
 407     Double_t posClus[3];
 408     Double_t covClus[6];
 409     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(dig);
 410     GetClusterPars(dig,posClus,covClus);
 411     AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],d->GetTracks(),dig,parTOF,status,ii);
 412     InsertCluster(tofCluster);
 413
 414   }
 415
 416   AliInfo(Form("Number of found clusters: %d", fNumberOfTofClusters));
 417
 418   CalibrateRecPoint();
 419   FillRecPoint();
 420
 421   clusterTree->Fill();
 422   ResetRecpoint();
 423
 424   AliInfo(Form("Execution time to read TOF digits and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 425                stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 426   if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 427
 428 }
 429 //______________________________________________________________________________
 430
 431 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(AliRawReader *rawReader,
 432                                            TTree *clustersTree)
 433 {
 434   //
 435   // Converts RAW data to recpoints for TOF
 436   //
 437
 438   TStopwatch stopwatch;
 439   stopwatch.Start();
 440
 441   Int_t inholes = 0;
 442
 443   const Int_t kDDL = AliDAQ::NumberOfDdls("TOF");
 444
 445   ResetRecpoint();
 446
 447   Int_t bufsize = 32000;
 448   clustersTree->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 449
 450   TClonesArray * clonesRawData;
 451
 452   Int_t dummy = -1;
 453
 454   Int_t detectorIndex[5];
 455   Int_t parTOF[5];
 456
 457   ofstream ftxt;
 458   if (fVerbose==2) ftxt.open("TOFdigitsRead.txt",ios::app);
 459
 460   //AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 461   fTOFRawStream.Clear();
 462   fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
 463
 464   Int_t indexDDL = 0;
 465   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 466
 467     rawReader->Reset();
 468     if (fDecoderVersion) {
 469       AliInfo("Using New Decoder \n");
 470       fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 471     }
 472     else fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
 473
 474     clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 475
 476     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 477
 478       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 479
 480       //if (tofRawDatum->GetTOT()==-1 || tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 481       if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 482
 483       if (fVerbose==2) {
 484         if (indexDDL<10) ftxt << "  " << indexDDL;
 485         else         ftxt << " " << indexDDL;
 486         if (tofRawDatum->GetTRM()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRM();
 487         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTRM();
 488         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRMchain();
 489         if (tofRawDatum->GetTDC()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDC();
 490         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTDC();
 491         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDCchannel();
 492       }
 493
 494       fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 495                                          tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 496       dummy = detectorIndex[3];
 497       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 498       detectorIndex[4] = dummy;
 499
 500       if (fVerbose==2) {
 501         if (detectorIndex[0]<10) ftxt  << "  ->  " << detectorIndex[0];
 502         else              ftxt  << "  -> " << detectorIndex[0];
 503         ftxt << "  " << detectorIndex[1];
 504         if (detectorIndex[2]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[2];
 505         else              ftxt << " " << detectorIndex[2];
 506         ftxt << "  " << detectorIndex[3];
 507         if (detectorIndex[4]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[4];
 508         else              ftxt << " " << detectorIndex[4];
 509       }
 510
 511       // Do not reconstruct anything in the holes
 512       if (detectorIndex[0]==13 || detectorIndex[0]==14 || detectorIndex[0]==15 ) { // sectors with holes
 513         if (detectorIndex[1]==2) { // plate with holes
 514           inholes++;
 515           continue;
 516         }
 517       }
 518
 519       parTOF[0] = tofRawDatum->GetTOF(); //TDC
 520       parTOF[1] = tofRawDatum->GetTOT(); // TOT
 521       parTOF[2] = tofRawDatum->GetTOT(); //ADC==TOF
 522       parTOF[3] = -1;//raw data: no track of undecalib sim time
 523       parTOF[4] = tofRawDatum->GetTOF(); // RAW time
 524       Double_t posClus[3];
 525       Double_t covClus[6];
 526       UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
 527       Int_t lab[3]={-1,-1,-1};
 528       Bool_t status=kTRUE;
 529       GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
 530       AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],lab,detectorIndex,parTOF,status,-1);
 531       InsertCluster(tofCluster);
 532
 533       if (fVerbose==2) {
 534         if (parTOF[1]<10)ftxt << "        " << parTOF[1];
 535         else if (parTOF[1]>=10 && parTOF[1]<100) ftxt << "      " << parTOF[1];
 536         else ftxt << "      " << parTOF[1];
 537         if (parTOF[0]<10) ftxt << "      " << parTOF[0] << endl;
 538         else if (parTOF[0]>=10 && parTOF[0]<100)   ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 539         else if (parTOF[0]>=100 && parTOF[0]<1000) ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 540         else ftxt << "   " << parTOF[3] << endl;
 541       }
 542
 543     } // closed loop on TOF raw data per current DDL file
 544
 545     clonesRawData->Clear();
 546
 547   } // closed loop on DDL index
 548
 549   if (fVerbose==2) ftxt.close();
 550
 551   AliInfo(Form("Number of found clusters: %d", fNumberOfTofClusters));
 552
 553   CalibrateRecPoint();
 554   FillRecPoint();
 555
 556   clustersTree->Fill();
 557
 558   ResetRecpoint();
 559
 560   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 561                    stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 562   if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 563
 564 }
 565 //______________________________________________________________________________
 566
 567 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader)
 568 {
 569   //
 570   // Converts RAW data to recpoints for TOF
 571   //
 572
 573   TStopwatch stopwatch;
 574   stopwatch.Start();
 575
 576   Int_t inholes = 0;
 577
 578   const Int_t kDDL = AliDAQ::NumberOfDdls("TOF");
 579
 580   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 581
 582   AliDebug(2,Form(" Event number %2d ", iEvent));
 583
 584   fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 585
 586   if (fTreeR == 0x0){
 587     fTOFLoader->MakeTree("R");
 588     fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 589   }
 590
 591   Int_t bufsize = 32000;
 592   fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 593
 594   TClonesArray * clonesRawData;
 595
 596   Int_t dummy = -1;
 597
 598   Int_t detectorIndex[5] = {-1, -1, -1, -1, -1};
 599   Int_t parTOF[5];
 600   ofstream ftxt;
 601   if (fVerbose==2) ftxt.open("TOFdigitsRead.txt",ios::app);
 602
 603   //AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 604   fTOFRawStream.Clear();
 605   fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
 606
 607   Int_t indexDDL = 0;
 608   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 609
 610     rawReader->Reset();
 611     if (fDecoderVersion) {
 612       AliInfo("Using New Decoder \n");
 613       fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 614     }
 615     else fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
 616
 617     clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 618
 619     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 620
 621       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 622
 623       //if (tofRawDatum->GetTOT()==-1 || tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 624       if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 625
 626       if (fVerbose==2) {
 627         if (indexDDL<10) ftxt << "  " << indexDDL;
 628         else         ftxt << " " << indexDDL;
 629         if (tofRawDatum->GetTRM()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRM();
 630         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTRM();
 631         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRMchain();
 632         if (tofRawDatum->GetTDC()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDC();
 633         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTDC();
 634         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDCchannel();
 635       }
 636
 637       fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 638                                          tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 639       dummy = detectorIndex[3];
 640       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 641       detectorIndex[4] = dummy;
 642
 643       if (fVerbose==2) {
 644         if (detectorIndex[0]<10) ftxt  << "  ->  " << detectorIndex[0];
 645         else              ftxt  << "  -> " << detectorIndex[0];
 646         ftxt << "  " << detectorIndex[1];
 647         if (detectorIndex[2]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[2];
 648         else              ftxt << " " << detectorIndex[2];
 649         ftxt << "  " << detectorIndex[3];
 650         if (detectorIndex[4]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[4];
 651         else              ftxt << " " << detectorIndex[4];
 652       }
 653
 654       // Do not reconstruct anything in the holes
 655       if (detectorIndex[0]==13 || detectorIndex[0]==14 || detectorIndex[0]==15 ) { // sectors with holes
 656         if (detectorIndex[1]==2) { // plate with holes
 657           inholes++;
 658           continue;
 659         }
 660       }
 661
 662       parTOF[0] = tofRawDatum->GetTOF(); // TDC
 663       parTOF[1] = tofRawDatum->GetTOT(); // TOT
 664       parTOF[2] = tofRawDatum->GetTOT(); // raw data have ADC=TOT
 665       parTOF[3] = -1; //raw data: no track of the undecalib sim time
 666       parTOF[4] = tofRawDatum->GetTOF(); // Raw time == TDC
 667       Double_t posClus[3];
 668       Double_t covClus[6];
 669       UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
 670       Int_t lab[3]={-1,-1,-1};
 671       Bool_t status=kTRUE;
 672       GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
 673       AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],lab,detectorIndex,parTOF,status,-1);
 674       InsertCluster(tofCluster);
 675
 676       if (fVerbose==2) {
 677         if (parTOF[1]<10)ftxt << "        " << parTOF[1];
 678         else if (parTOF[1]>=10 && parTOF[1]<100) ftxt << "      " << parTOF[1];
 679         else ftxt << "      " << parTOF[1];
 680         if (parTOF[0]<10) ftxt << "      " << parTOF[0] << endl;
 681         else if (parTOF[0]>=10 && parTOF[0]<100)   ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 682         else if (parTOF[0]>=100 && parTOF[0]<1000) ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 683         else ftxt << "   " << parTOF[3] << endl;
 684       }
 685
 686     } // closed loop on TOF raw data per current DDL file
 687
 688     clonesRawData->Clear();
 689
 690   } // closed loop on DDL index
 691
 692   if (fVerbose==2) ftxt.close();
 693
 694   AliInfo(Form("Number of found clusters: %d for event: %d", fNumberOfTofClusters, iEvent));
 695
 696   CalibrateRecPoint();
 697   FillRecPoint();
 698
 699   fTreeR->Fill();
 700   ResetRecpoint();
 701
 702   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
 703   fTOFLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 704
 705   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 706                stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 707   if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 708
 709 }
 710 //______________________________________________________________________________
 711
 712 void AliTOFClusterFinder::Raw2Digits(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader)
 713 {
 714   //
 715   // Converts RAW data to MC digits for TOF
 716   //
 717   //             (temporary solution)
 718   //
 719
 720   TStopwatch stopwatch;
 721   stopwatch.Start();
 722
 723   const Int_t kDDL = AliTOFGeometry::NDDL()*AliTOFGeometry::NSectors();
 724
 725   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 726
 727   fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
 728   if (fTreeD)
 729     {
 730     AliInfo("TreeD re-creation");
 731     fTreeD = 0x0;
 732     fTOFLoader->MakeTree("D");
 733     fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
 734     }
 735
 736   TClonesArray *tofDigits = new TClonesArray("AliTOFdigit",10000);
 737   Int_t bufsize = 32000;
 738   fTreeD->Branch("TOF", &tofDigits, bufsize);
 739
 740   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 741
 742   AliDebug(2,Form(" Event number %2d ", iEvent));
 743
 744   TClonesArray * clonesRawData;
 745
 746   Int_t dummy = -1;
 747
 748   Int_t detectorIndex[5];
 749   Int_t digit[4];
 750
 751   //AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 752   fTOFRawStream.Clear();
 753   fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
 754
 755   Int_t indexDDL = 0;
 756   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 757
 758     rawReader->Reset();
 759     if (fDecoderVersion) {
 760       AliInfo("Using New Decoder \n");
 761       fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 762     }
 763     else fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
 764
 765     clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 766
 767     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 768
 769       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 770
 771       //if (!tofRawDatum->GetTOT() || !tofRawDatum->GetTOF()) continue;
 772       if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 773
 774       fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 775                                          tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 776       dummy = detectorIndex[3];
 777       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 778       detectorIndex[4] = dummy;
 779
 780       digit[0] = fTOFRawStream.GetTofBin();
 781       digit[1] = fTOFRawStream.GetToTbin();
 782       digit[2] = fTOFRawStream.GetToTbin();
 783       digit[3] = -1;
 784
 785       Int_t tracknum[3]={-1,-1,-1};
 786
 787       TClonesArray &aDigits = *tofDigits;
 788       Int_t last=tofDigits->GetEntriesFast();
 789       new (aDigits[last]) AliTOFdigit(tracknum, detectorIndex, digit);
 790
 791     } // while loop
 792
 793     clonesRawData->Clear();
 794
 795   } // DDL Loop
 796
 797   fTreeD->Fill();
 798
 799   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
 800   fTOFLoader->WriteDigits("OVERWRITE");
 801
 802   delete tofDigits;
 803
 804   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.2fs C:%.2fs",
 805                    stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 806
 807 }
 808
 809 //______________________________________________________________________________
 810
 811 void AliTOFClusterFinder::Raw2Digits(AliRawReader *rawReader, TTree* digitsTree)
 812 {
 813   //
 814   // Converts RAW data to MC digits for TOF for the current event
 815   //
 816   //
 817
 818   TStopwatch stopwatch;
 819   stopwatch.Start();
 820
 821   const Int_t kDDL = AliTOFGeometry::NDDL()*AliTOFGeometry::NSectors();
 822
 823   if (!digitsTree)
 824     {
 825     AliError("No input digits Tree");
 826     return;
 827     }
 828
 829   TClonesArray *tofDigits = new TClonesArray("AliTOFdigit",10000);
 830   Int_t bufsize = 32000;
 831   digitsTree->Branch("TOF", &tofDigits, bufsize);
 832
 833   TClonesArray * clonesRawData;
 834
 835   Int_t dummy = -1;
 836
 837   Int_t detectorIndex[5];
 838   Int_t digit[4];
 839
 840   //AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 841   fTOFRawStream.Clear();
 842   fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
 843
 844   Int_t indexDDL = 0;
 845   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 846
 847     rawReader->Reset();
 848     if (fDecoderVersion) {
 849       AliInfo("Using New Decoder \n");
 850       fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 851     }
 852     else fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
 853
 854     clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 855
 856     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 857
 858       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 859
 860       //if (!tofRawDatum->GetTOT() || !tofRawDatum->GetTOF()) continue;
 861       if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 862
 863       fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 864                                          tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 865       dummy = detectorIndex[3];
 866       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 867       detectorIndex[4] = dummy;
 868
 869       digit[0] = fTOFRawStream.GetTofBin();
 870       digit[1] = fTOFRawStream.GetToTbin();
 871       digit[2] = fTOFRawStream.GetToTbin();
 872       digit[3] = -1;
 873
 874       Int_t tracknum[3]={-1,-1,-1};
 875
 876       TClonesArray &aDigits = *tofDigits;
 877       Int_t last=tofDigits->GetEntriesFast();
 878       new (aDigits[last]) AliTOFdigit(tracknum, detectorIndex, digit);
 879
 880     } // while loop
 881
 882     clonesRawData->Clear();
 883
 884   } // DDL Loop
 885
 886   digitsTree->Fill();
 887
 888   delete tofDigits;
 889
 890   AliDebug(1, Form("Got %d digits: ", fDigits->GetEntries()));
 891   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and fill TOF digit tree : R:%.2fs C:%.2fs",
 892                    stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 893
 894 }
 895 //______________________________________________________________________________
 896
 897 Int_t AliTOFClusterFinder::InsertCluster(AliTOFcluster *tofCluster) {
 898   //---------------------------------------------------------------------------//
 899   // This function adds a TOF cluster to the array of TOF clusters sorted in Z //
 900   //---------------------------------------------------------------------------//
 901   if (fNumberOfTofClusters==kTofMaxCluster) {
 902     AliError("Too many clusters !");
 903     return 1;
 904   }
 905
 906   if (fNumberOfTofClusters==0) {
 907     fTofClusters[fNumberOfTofClusters++] = tofCluster;
 908     return 0;
 909   }
 910
 911   Int_t ii = FindClusterIndex(tofCluster->GetZ());
 912   memmove(fTofClusters+ii+1 ,fTofClusters+ii,(fNumberOfTofClusters-ii)*sizeof(AliTOFcluster*));
 913   fTofClusters[ii] = tofCluster;
 914   fNumberOfTofClusters++;
 915
 916   return 0;
 917
 918 }
 919 //_________________________________________________________________________
 920
 921 Int_t AliTOFClusterFinder::FindClusterIndex(Double_t z) const {
 922   //--------------------------------------------------------------------
 923   // This function returns the index of the nearest cluster in z
 924   //--------------------------------------------------------------------
 925   if (fNumberOfTofClusters==0) return 0;
 926   if (z <= fTofClusters[0]->GetZ()) return 0;
 927   if (z > fTofClusters[fNumberOfTofClusters-1]->GetZ()) return fNumberOfTofClusters;
 928   Int_t b = 0, e = fNumberOfTofClusters-1, m = (b+e)/2;
 929   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
 930     if (z > fTofClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
 931     else e=m;
 932   }
 933
 934   return m;
 935
 936 }
 937 //_________________________________________________________________________
 938
 939 void AliTOFClusterFinder::FillRecPoint()
 940 {
 941   //
 942   // Copy the global array of AliTOFcluster, i.e. fTofClusters (sorted
 943   // in Z) in the global TClonesArray of AliTOFcluster,
 944   // i.e. fRecPoints.
 945   //
 946
 947   Int_t ii, jj;
 948
 949   Int_t detectorIndex[5];
 950   Int_t parTOF[5];
 951   Int_t trackLabels[3];
 952   Int_t digitIndex = -1;
 953   Bool_t status=kTRUE;
 954
 955   TClonesArray &lRecPoints = *fRecPoints;
 956
 957   for (ii=0; ii<fNumberOfTofClusters; ii++) {
 958
 959     digitIndex = fTofClusters[ii]->GetIndex();
 960     for(jj=0; jj<5; jj++) detectorIndex[jj] = fTofClusters[ii]->GetDetInd(jj);
 961     for(jj=0; jj<3; jj++) trackLabels[jj] = fTofClusters[ii]->GetLabel(jj);
 962     parTOF[0] = fTofClusters[ii]->GetTDC(); // TDC
 963     parTOF[1] = fTofClusters[ii]->GetToT(); // TOT
 964     parTOF[2] = fTofClusters[ii]->GetADC(); // ADC=TOT
 965     parTOF[3] = fTofClusters[ii]->GetTDCND(); // TDCND
 966     parTOF[4] = fTofClusters[ii]->GetTDCRAW();//RAW
 967     status=fTofClusters[ii]->GetStatus();
 968     Double_t posClus[3];
 969     Double_t covClus[6];
 970     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
 971     GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
 972     new(lRecPoints[ii]) AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],trackLabels,detectorIndex, parTOF,status,digitIndex);
 973
 974     AliDebug(2, Form(" %4d  %4d  %f %f %f  %f %f %f %f %f %f  %3d %3d %3d  %2d %1d %2d %1d %2d  %4d %3d %3d %4d %4d  %1d  %4d",
 975                      ii, volIdClus, posClus[0], posClus[1], posClus[2],
 976                      fTofClusters[ii]->GetSigmaX2(),
 977                      fTofClusters[ii]->GetSigmaXY(),
 978                      fTofClusters[ii]->GetSigmaXZ(),
 979                      fTofClusters[ii]->GetSigmaY2(),
 980                      fTofClusters[ii]->GetSigmaYZ(),
 981                      fTofClusters[ii]->GetSigmaZ2(),
 982                      trackLabels[0], trackLabels[1], trackLabels[2],
 983                      detectorIndex[0], detectorIndex[1], detectorIndex[2], detectorIndex[3], detectorIndex[4],
 984                      parTOF[0], parTOF[1], parTOF[2], parTOF[3], parTOF[4],
 985                      status, digitIndex));
 986
 987   } // loop on clusters
 988
 989 }
 990
 991 //_________________________________________________________________________
 992 void AliTOFClusterFinder::CalibrateRecPoint()
 993 {
 994   //
 995   // Copy the global array of AliTOFcluster, i.e. fTofClusters (sorted
 996   // in Z) in the global TClonesArray of AliTOFcluster,
 997   // i.e. fRecPoints.
 998   //
 999
1000   Int_t ii, jj;
1001
1002   Int_t detectorIndex[5];
1003   Int_t digitIndex = -1;
1004   Double_t tToT;
1005   Double_t timeCorr;
1006   Int_t   tdcCorr;
1007   AliInfo(" Calibrating TOF Clusters: ")
1008
1009   AliTOFChannelOnlineArray *calDelay = fTOFcalib->GetTOFOnlineDelay();
1010   AliTOFChannelOnlineStatusArray *calStatus = fTOFcalib->GetTOFOnlineStatus();
1011   TObjArray *calTOFArrayOffline = fTOFcalib->GetTOFCalArrayOffline();
1012   TString validity = (TString)fTOFcalib->GetOfflineValidity();
1013   AliInfo(Form(" validity = %s",validity.Data()));
1014   Int_t calibration = -1;
1015   if (validity.CompareTo("valid")==0) {
1016     AliInfo(" Using offline calibration parameters");
1017     calibration = 1;
1018   }
1019   else {
1020     AliInfo(" Using online calibration parameters");
1021     calibration = 0 ;
1022   }
1023   for (ii=0; ii<fNumberOfTofClusters; ii++) {
1024     digitIndex = fTofClusters[ii]->GetIndex();
1025     for(jj=0; jj<5; jj++) detectorIndex[jj] = fTofClusters[ii]->GetDetInd(jj);
1026
1027     Int_t index = AliTOFGeometry::GetIndex(detectorIndex);
1028
1029     UChar_t statusPulser=calStatus->GetPulserStatus(index);
1030     UChar_t statusNoise=calStatus->GetNoiseStatus(index);
1031     UChar_t statusHW=calStatus->GetHWStatus(index);
1032     UChar_t status=calStatus->GetStatus(index);
1033
1034     //check the status, also unknown is fine!!!!!!!
1035
1036     AliDebug(2, Form(" Status for channel %d = %d",index, (Int_t)status));
1037     if((statusPulser & AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFPulserBad)==(AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFPulserBad)||(statusNoise & AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFNoiseBad)==(AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFNoiseBad)||(statusHW & AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFHWBad)==(AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFHWBad)){
1038       AliDebug(2, Form(" Bad Status for channel %d",index));
1039       fTofClusters[ii]->SetStatus(kFALSE); //odd convention, to avoid conflict with calibration objects currently in the db (temporary solution).
1040     }
1041     else {
1042       AliDebug(2, Form(" Good Status for channel %d",index));
1043     }
1044     // Get Rough channel online equalization
1045     Double_t roughDelay=(Double_t)calDelay->GetDelay(index);  // in ns
1046     AliDebug(2,Form(" channel delay (ns) = %f", roughDelay));
1047     // Get Refined channel offline calibration parameters
1048     if (calibration ==1){
1049       AliTOFChannelOffline * calChannelOffline = (AliTOFChannelOffline*)calTOFArrayOffline->At(index);
1050       Double_t par[6];
1051       for (Int_t j = 0; j<6; j++){
1052         par[j]=(Double_t)calChannelOffline->GetSlewPar(j);
1053      }
1054       AliDebug(2,Form(" Calib Pars = %f, %f, %f, %f, %f, %f ",par[0],par[1],par[2],par[3],par[4],par[5]));
1055       AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (counts) = %d , %d", fTofClusters[ii]->GetToT(),fTofClusters[ii]->GetTDC()));
1056       tToT = (Double_t)(fTofClusters[ii]->GetToT()*AliTOFGeometry::ToTBinWidth());
1057       tToT*=1.E-3; //ToT in ns
1058       AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (ns)= %e, %e",fTofClusters[ii]->GetTDC()*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3,tToT));
1059       timeCorr=par[0]+par[1]*tToT+par[2]*tToT*tToT+par[3]*tToT*tToT*tToT+par[4]*tToT*tToT*tToT*tToT+par[5]*tToT*tToT*tToT*tToT*tToT; // the time correction (ns)
1060     }
1061     else {
1062       timeCorr = roughDelay; // correction in ns
1063     }
1064     AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (ns)= %e, %e",fTofClusters[ii]->GetTDC()*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3,fTofClusters[ii]->GetToT()*AliTOFGeometry::ToTBinWidth()));
1065     AliDebug(2,Form(" The time correction (ns) = %f", timeCorr));
1066     timeCorr=(Double_t)(fTofClusters[ii]->GetTDC())*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3-timeCorr;//redefine the time
1067     timeCorr*=1.E3;
1068     AliDebug(2,Form(" The channel time, corr (ps)= %e",timeCorr ));
1069     tdcCorr=(Int_t)(timeCorr/AliTOFGeometry::TdcBinWidth()); //the corrected time (tdc counts)
1070     fTofClusters[ii]->SetTDC(tdcCorr);
1071   } // loop on clusters
1072
1073 }
1074 //______________________________________________________________________________
1075
1076 void AliTOFClusterFinder::ResetRecpoint()
1077 {
1078   //
1079   // Clear the list of reconstructed points
1080   //
1081
1082   fNumberOfTofClusters = 0;
1083   if (fRecPoints) fRecPoints->Clear();
1084
1085 }
1086 //______________________________________________________________________________
1087
1088 void AliTOFClusterFinder::Load()
1089 {
1090   //
1091   // Load TOF.Digits.root and TOF.RecPoints.root files
1092   //
1093
1094   fTOFLoader->LoadDigits("READ");
1095   fTOFLoader->LoadRecPoints("recreate");
1096
1097 }
1098 //______________________________________________________________________________
1099
1100 void AliTOFClusterFinder::LoadClusters()
1101 {
1102   //
1103   // Load TOF.RecPoints.root file
1104   //
1105
1106   fTOFLoader->LoadRecPoints("recreate");
1107
1108 }
1109 //______________________________________________________________________________
1110
1111 void AliTOFClusterFinder::UnLoad()
1112 {
1113   //
1114   // Unload TOF.Digits.root and TOF.RecPoints.root files
1115   //
1116
1117   fTOFLoader->UnloadDigits();
1118   fTOFLoader->UnloadRecPoints();
1119
1120 }
1121 //______________________________________________________________________________
1122
1123 void AliTOFClusterFinder::UnLoadClusters()
1124 {
1125   //
1126   // Unload TOF.RecPoints.root file
1127   //
1128
1129   fTOFLoader->UnloadRecPoints();
1130
1131 }
1132 //-------------------------------------------------------------------------
1133 UShort_t AliTOFClusterFinder::GetClusterVolIndex(Int_t *ind) const {
1134
1135   //First of all get the volume ID to retrieve the l2t transformation...
1136   //
1137   // Detector numbering scheme
1138   Int_t nSector = 18;
1139   Int_t nPlate  = 5;
1140   Int_t nStripA = 15;
1141   Int_t nStripB = 19;
1142   Int_t nStripC = 19;
1143
1144   Int_t isector =ind[0];
1145   if (isector >= nSector)
1146     AliError(Form("Wrong sector number in TOF (%d) !",isector));
1147   Int_t iplate = ind[1];
1148   if (iplate >= nPlate)
1149     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
1150   Int_t istrip = ind[2];
1151
1152   Int_t stripOffset = 0;
1153   switch (iplate) {
1154   case 0:
1155     stripOffset = 0;
1156     break;
1157   case 1:
1158     stripOffset = nStripC;
1159     break;
1160   case 2:
1161     stripOffset = nStripC+nStripB;
1162     break;
1163   case 3:
1164     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
1165     break;
1166   case 4:
1167     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
1168     break;
1169   default:
1170     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
1171     break;
1172   };
1173
1174   Int_t index= (2*(nStripC+nStripB)+nStripA)*isector +
1175                stripOffset +
1176                istrip;
1177
1178   UShort_t volIndex = AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kTOF,index);
1179   return volIndex;
1180 }
1181 //
1182 //-------------------------------------------------------------------------
1183 void AliTOFClusterFinder::GetClusterPars(Int_t *ind, Double_t* pos,Double_t* cov) const {
1184
1185   //First of all get the volume ID to retrieve the l2t transformation...
1186   //
1187   UShort_t volIndex = GetClusterVolIndex(ind);
1188   //
1189   //
1190   //we now go in the system of the strip: determine the local coordinates
1191   //
1192   //
1193   // 47---------------------------------------------------0  ^ z
1194   // | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | 1 |
1195   // -----------------------------------------------------   | y going outwards
1196   // | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | 0 |  par[0]=0;
1197
1198   // -----------------------------------------------------   |
1199   // x <-----------------------------------------------------
1200
1201   Float_t localX=(ind[4]-23.5)*AliTOFGeometry::XPad();
1202   Float_t localY=0;
1203   Float_t localZ=(ind[3]- 0.5)*AliTOFGeometry::ZPad();
1204
1205   //move to the tracking ref system
1206
1207   Double_t lpos[3];
1208   lpos[0]=localX;
1209   lpos[1]=localY;
1210   lpos[2]=localZ;
1211
1212   const TGeoHMatrix *l2t= AliGeomManager::GetTracking2LocalMatrix(volIndex);
1213   // Get The position in the track ref system
1214   Double_t tpos[3];
1215   l2t->MasterToLocal(lpos,tpos);
1216   pos[0]=tpos[0];
1217   pos[1]=tpos[1];
1218   pos[2]=tpos[2];
1219
1220   //Get The cluster covariance in the track ref system
1221   Double_t lcov[9];
1222
1223   //cluster covariance in the local system:
1224   // sx2   0   0
1225   // 0     0   0
1226   // 0     0   sz2
1227
1228   lcov[0]=AliTOFGeometry::XPad()*AliTOFGeometry::XPad()/12.;
1229   lcov[1]=0;
1230   lcov[2]=0;
1231   lcov[3]=0;
1232   lcov[4]=0;
1233   lcov[5]=0;
1234   lcov[6]=0;
1235   lcov[7]=0;
1236   lcov[8]=AliTOFGeometry::ZPad()*AliTOFGeometry::ZPad()/12.;
1237
1238   //cluster covariance in the tracking system:
1239   TGeoHMatrix m;
1240   m.SetRotation(lcov);
1241   m.Multiply(l2t);
1242   m.MultiplyLeft(&l2t->Inverse());
1243   Double_t *tcov = m.GetRotationMatrix();
1244   cov[0] = tcov[0]; cov[1] = tcov[1]; cov[2] = tcov[2];
1245   cov[3] = tcov[4]; cov[4] = tcov[5];
1246   cov[5] = tcov[8];
1247
1248   return;
1249
1250 }