TOF/AliTOFClusterFinder.cxx

   1 /***************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /*
  17 $Log: AliTOFClusterFinder.cxx,v $
  18 Revision 1.31  2007/11/24 14:53:19  zampolli
  19 Status flag implemented as UChar_t
  20
  21 Revision 1.30  2007/10/04 13:08:52  arcelli
  22 updates to comply with AliTOFGeometryV5 becoming AliTOFGeometry
  23
  24 Revision 1.29  2007/10/03 10:42:33  arcelli
  25 updates to handle new AliTOFcluster, inheriting form AliCluster3D
  26
  27 Revision 1.28  2007/05/31 16:06:05  arcelli
  28 move instance of AliRawStream outside loop on DDL
  29
  30 Revision 1.27  2007/05/02 16:31:49  arcelli
  31 Add methods to handle single event reconstruction.  retrieval of Calib
  32 info moved to AliTOFReconstructor ctor, and passed via a pointer to
  33 AliTOFcalib
  34
  35 Revision 1.26  2007/04/30 19:02:24  arcelli
  36 hopefully the last refinements for correct type conversion in calibration
  37
  38 Revision 1.25  2007/04/30 15:22:17  arcelli
  39 Change TOF digit Time, Tot etc to int type
  40
  41 Revision 1.24  2007/04/27 11:19:31  arcelli
  42 updates for the new decoder
  43
  44 Revision 1.23  2007/04/23 16:51:39  decaro
  45 Digits-to-raw_data conversion: correction for a more real description
  46 (A.De Caro, R.Preghenella)
  47
  48 Revision 1.22  2007/04/19 17:26:32  arcelli
  49 Fix a bug (add some debug printout
  50
  51 Revision 1.21  2007/04/18 17:28:12  arcelli
  52 Set the ToT bin width to the one actually used...
  53
  54 Revision 1.20  2007/03/09 09:57:23  arcelli
  55  Remove a forgotten include of Riostrem
  56
  57 Revision 1.19  2007/03/08 15:41:20  arcelli
  58 set uncorrected times when filling RecPoints
  59
  60 Revision 1.18  2007/03/06 16:31:20  arcelli
  61 Add Uncorrected TOF Time signal
  62
  63 Revision 1.17  2007/02/28 18:09:11  arcelli
  64 Add protection against failed retrieval of the CDB cal object,
  65 now Reconstruction exits with AliFatal
  66
  67 Revision 1.16  2007/02/20 15:57:00  decaro
  68 Raw data update: to read the TOF raw data defined in UNPACKED mode
  69
  70
  71 Revision 0.03  2005/07/28 A. De Caro
  72          Implement public method
  73          Raw2Digits(Int_t, AliRawReader *)
  74          to convert digits from raw data in MC digits
  75          (temporary solution)
  76
  77 Revision 0.02  2005/07/27 A. De Caro
  78          Implement public method
  79          Digits2RecPoint(Int_t)
  80          to convert digits in clusters
  81
  82 Revision 0.02  2005/07/26 A. De Caro
  83          Implement private methods
  84          InsertCluster(AliTOFcluster *)
  85          FindClusterIndex(Double_t)
  86          originally implemented in AliTOFtracker
  87          by S. Arcelli and C. Zampolli
  88
  89 Revision 0.01  2005/07/25 A. De Caro
  90          Implement public methods
  91          Digits2RecPoint(AliRawReader *, TTree *)
  92          Digits2RecPoint(Int_t, AliRawReader *)
  93          to convert raw data in clusters
  94  */
  95
  96 ////////////////////////////////////////////////////////////////
  97 //                                                            //
  98 //         Class for TOF cluster finder                       //
  99 //                                                            //
 100 // Starting from Raw Data, create rec points,                 //
 101 //                         fill TreeR for TOF,                //
 102 //                         write TOF.RecPoints.root file      //
 103 //                                                            //
 104 ////////////////////////////////////////////////////////////////
 105
 106 #include "Riostream.h"
 107
 108 #include "TClonesArray.h"
 109 #include "TStopwatch.h"
 110 #include "TTree.h"
 111 //#include <TGeoManager.h>
 112 #include <TGeoMatrix.h>
 113 //#include <TGeoPhysicalNode.h>
 114
 115 #include "AliDAQ.h"
 116 #include "AliLoader.h"
 117 #include "AliLog.h"
 118 #include "AliRawReader.h"
 119 #include "AliRunLoader.h"
 120 //#include "AliAlignObj.h"
 121 #include <AliGeomManager.h>
 122
 123 #include "AliTOFcalib.h"
 124 #include "AliTOFChannelOnlineArray.h"
 125 #include "AliTOFChannelOnlineStatusArray.h"
 126 #include "AliTOFChannelOffline.h"
 127 #include "AliTOFClusterFinder.h"
 128 #include "AliTOFcluster.h"
 129 #include "AliTOFdigit.h"
 130 #include "AliTOFGeometry.h"
 131 #include "AliTOFrawData.h"
 132 //#include "AliTOFRawStream.h"
 133
 134 //extern TFile *gFile;
 135
 136 ClassImp(AliTOFClusterFinder)
 137
 138 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(AliTOFcalib *calib):
 139   fRunLoader(0),
 140   fTOFLoader(0),
 141   fTreeD(0),
 142   fTreeR(0),
 143   fDigits(new TClonesArray("AliTOFdigit", 4000)),
 144   fRecPoints(new TClonesArray("AliTOFcluster", 4000)),
 145   fNumberOfTofClusters(0),
 146   fVerbose(0),
 147   fDecoderVersion(0),
 148   fTOFcalib(calib),
 149   fTOFRawStream(AliTOFRawStream())
 150 {
 151 //
 152 // Constructor
 153 //
 154
 155 }
 156
 157 //______________________________________________________________________________
 158
 159 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(AliRunLoader* runLoader, AliTOFcalib *calib):
 160   fRunLoader(runLoader),
 161   fTOFLoader(runLoader->GetLoader("TOFLoader")),
 162   fTreeD(0),
 163   fTreeR(0),
 164   fDigits(new TClonesArray("AliTOFdigit", 4000)),
 165   fRecPoints(new TClonesArray("AliTOFcluster", 4000)),
 166   fNumberOfTofClusters(0),
 167   fVerbose(0),
 168   fDecoderVersion(0),
 169   fTOFcalib(calib),
 170   fTOFRawStream(AliTOFRawStream())
 171 {
 172 //
 173 // Constructor
 174 //
 175
 176 }
 177
 178 //------------------------------------------------------------------------
 179 AliTOFClusterFinder::AliTOFClusterFinder(const AliTOFClusterFinder &source)
 180   :TObject(source),
 181   fRunLoader(0),
 182   fTOFLoader(0),
 183   fTreeD(0),
 184   fTreeR(0),
 185   fDigits(source.fDigits),
 186   fRecPoints(source.fRecPoints),
 187   fNumberOfTofClusters(0),
 188   fVerbose(0),
 189   fDecoderVersion(source.fDecoderVersion),
 190   fTOFcalib(source.fTOFcalib),
 191   fTOFRawStream(source.fTOFRawStream)
 192 {
 193   // copy constructor
 194 }
 195
 196 //------------------------------------------------------------------------
 197 AliTOFClusterFinder& AliTOFClusterFinder::operator=(const AliTOFClusterFinder &source)
 198 {
 199   // ass. op.
 200
 201   if (this == &source)
 202     return *this;
 203
 204   TObject::operator=(source);
 205   fDigits=source.fDigits;
 206   fRecPoints=source.fRecPoints;
 207   fVerbose=source.fVerbose;
 208   fDecoderVersion=source.fDecoderVersion;
 209   fTOFcalib=source.fTOFcalib;
 210   fTOFRawStream=source.fTOFRawStream;
 211   return *this;
 212
 213 }
 214 //______________________________________________________________________________
 215
 216 AliTOFClusterFinder::~AliTOFClusterFinder()
 217 {
 218
 219   //
 220   // Destructor
 221   //
 222
 223   if (fDigits)
 224     {
 225       fDigits->Delete();
 226       delete fDigits;
 227       fDigits=0;
 228     }
 229   if (fRecPoints)
 230     {
 231       fRecPoints->Delete();
 232       delete fRecPoints;
 233       fRecPoints=0;
 234     }
 235
 236 }
 237 //______________________________________________________________________________
 238
 239 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent)
 240 {
 241   //
 242   // Converts digits to recpoints for TOF
 243   //
 244
 245   TStopwatch stopwatch;
 246   stopwatch.Start();
 247
 248   Int_t inholes = 0;
 249
 250   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 251
 252   fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
 253   if (fTreeD == 0x0)
 254     {
 255       AliFatal("AliTOFClusterFinder: Can not get TreeD");
 256     }
 257
 258   TBranch *branch = fTreeD->GetBranch("TOF");
 259   if (!branch) {
 260     AliError("can't get the branch with the TOF digits !");
 261     return;
 262   }
 263
 264   TClonesArray staticdigits("AliTOFdigit",10000);
 265   staticdigits.Clear();
 266   TClonesArray *digits =&staticdigits;
 267   branch->SetAddress(&digits);
 268
 269   ResetRecpoint();
 270
 271   fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 272   if (fTreeR == 0x0)
 273     {
 274       fTOFLoader->MakeTree("R");
 275       fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 276     }
 277
 278   Int_t bufsize = 32000;
 279   fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 280
 281   fTreeD->GetEvent(0);
 282   Int_t nDigits = digits->GetEntriesFast();
 283   AliDebug(2,Form("Number of TOF digits: %d",nDigits));
 284
 285   Int_t ii;
 286   Int_t dig[5]; //cluster detector indeces
 287   Int_t  parTOF[5]; //The TOF signal parameters
 288   Bool_t status=kTRUE; // assume all sim channels ok in the beginning...
 289   for (ii=0; ii<nDigits; ii++) {
 290     AliTOFdigit *d = (AliTOFdigit*)digits->UncheckedAt(ii);
 291     dig[0]=d->GetSector();
 292     dig[1]=d->GetPlate();
 293     dig[2]=d->GetStrip();
 294     dig[3]=d->GetPadz();
 295     dig[4]=d->GetPadx();
 296
 297     /* check valid index */
 298     if (dig[0]==-1||dig[1]==-1||dig[2]==-1||dig[3]==-1||dig[4]==-1) continue;
 299
 300     // Do not reconstruct anything in the holes
 301     if (dig[0]==13 || dig[0]==14 || dig[0]==15 ) { // sectors with holes
 302       if (dig[1]==2) { // plate with holes
 303         inholes++;
 304         continue;
 305       }
 306     }
 307
 308     AliDebug(2,Form(" %2d  %1d  %2d  %1d  %2d ",dig[0],dig[1],dig[2],dig[3],dig[4]));
 309
 310     parTOF[0] = d->GetTdc(); //the TDC signal
 311     parTOF[1] = d->GetToT(); //the ToT signal
 312     parTOF[2] = d->GetAdc(); // the adc charge
 313     parTOF[3] = d->GetTdcND(); // non decalibrated sim time
 314     parTOF[4] = d->GetTdc(); // raw time, == Tdc time for the moment
 315     Double_t posClus[3];
 316     Double_t covClus[6];
 317     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(dig);
 318     GetClusterPars(dig, posClus,covClus);
 319     AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],d->GetTracks(),dig,parTOF,status,ii);
 320     InsertCluster(tofCluster);
 321
 322   }
 323
 324   AliDebug(1,Form("Number of found clusters: %d for event: %d", fNumberOfTofClusters, iEvent));
 325
 326   CalibrateRecPoint();
 327   FillRecPoint();
 328
 329   fTreeR->Fill();
 330   ResetRecpoint();
 331
 332   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
 333   fTOFLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 334
 335   AliDebug(1,Form("Execution time to read TOF digits and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 336                   stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 337   if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 338
 339 }
 340
 341 //______________________________________________________________________________
 342
 343 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(TTree* digitsTree, TTree* clusterTree)
 344 {
 345   //
 346   // Converts digits to recpoints for TOF
 347   //
 348
 349   TStopwatch stopwatch;
 350   stopwatch.Start();
 351
 352   Int_t inholes = 0;
 353
 354   ///  fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 355
 356   if (digitsTree == 0x0)
 357     {
 358       AliFatal("AliTOFClusterFinder: Can not get TreeD");
 359     }
 360
 361   TBranch *branch = digitsTree->GetBranch("TOF");
 362   if (!branch) {
 363     AliError("can't get the branch with the TOF digits !");
 364     return;
 365   }
 366
 367   TClonesArray staticdigits("AliTOFdigit",10000);
 368   staticdigits.Clear();
 369   TClonesArray *digits = & staticdigits;
 370   branch->SetAddress(&digits);
 371
 372   ResetRecpoint();
 373
 374   fTreeR=clusterTree;
 375   Int_t bufsize = 32000;
 376   fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 377
 378   digitsTree->GetEvent(0);
 379   Int_t nDigits = digits->GetEntriesFast();
 380   AliDebug(2,Form("Number of TOF digits: %d",nDigits));
 381
 382   Int_t ii;
 383   Int_t dig[5]; //cluster detector indeces
 384   Int_t  parTOF[5]; //The TOF signal parameters
 385   Bool_t status=kTRUE; // assume all sim channels ok in the beginning...
 386   for (ii=0; ii<nDigits; ii++) {
 387     AliTOFdigit *d = (AliTOFdigit*)digits->UncheckedAt(ii);
 388     dig[0]=d->GetSector();
 389     dig[1]=d->GetPlate();
 390     dig[2]=d->GetStrip();
 391     dig[3]=d->GetPadz();
 392     dig[4]=d->GetPadx();
 393
 394     /* check valid index */
 395     if (dig[0]==-1||dig[1]==-1||dig[2]==-1||dig[3]==-1||dig[4]==-1) continue;
 396
 397     // Do not reconstruct anything in the holes
 398     if (dig[0]==13 || dig[0]==14 || dig[0]==15 ) { // sectors with holes
 399       if (dig[1]==2) { // plate with holes
 400         inholes++;
 401         continue;
 402       }
 403     }
 404
 405     //    AliDebug(2,Form(" %2d  %1d  %2d  %1d  %2d ",dig[0],dig[1],dig[2],dig[3],dig[4]));
 406
 407     parTOF[0] = d->GetTdc(); //the TDC signal
 408     parTOF[1] = d->GetToT(); //the ToT signal
 409     parTOF[2] = d->GetAdc(); // the adc charge
 410     parTOF[3] = d->GetTdcND(); // non decalibrated sim time
 411     parTOF[4] = d->GetTdc(); // raw time, == Tdc time for the moment
 412
 413     Double_t posClus[3];
 414     Double_t covClus[6];
 415     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(dig);
 416     GetClusterPars(dig,posClus,covClus);
 417     AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],d->GetTracks(),dig,parTOF,status,ii);
 418     InsertCluster(tofCluster);
 419
 420   }
 421
 422   AliDebug(1,Form("Number of found clusters: %d", fNumberOfTofClusters));
 423
 424   CalibrateRecPoint();
 425   FillRecPoint();
 426
 427   clusterTree->Fill();
 428   ResetRecpoint();
 429
 430   AliDebug(1,Form("Execution time to read TOF digits and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 431                   stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 432   if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 433
 434 }
 435 //______________________________________________________________________________
 436
 437 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(AliRawReader *rawReader,
 438                                            TTree *clustersTree)
 439 {
 440   //
 441   // Converts RAW data to recpoints for TOF
 442   //
 443
 444   TStopwatch stopwatch;
 445   stopwatch.Start();
 446
 447   Int_t inholes = 0;
 448
 449   const Int_t kDDL = AliDAQ::NumberOfDdls("TOF");
 450
 451   ResetRecpoint();
 452
 453   Int_t bufsize = 32000;
 454   clustersTree->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 455
 456   TClonesArray * clonesRawData;
 457
 458   Int_t dummy = -1;
 459
 460   Int_t detectorIndex[5];
 461   Int_t parTOF[5];
 462
 463   ofstream ftxt;
 464   if (fVerbose==2) ftxt.open("TOFdigitsRead.txt",ios::app);
 465
 466   //AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 467   fTOFRawStream.Clear();
 468   fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
 469
 470   if (fDecoderVersion)
 471     AliInfo("Using New Decoder");
 472
 473   Int_t indexDDL = 0;
 474   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 475
 476     rawReader->Reset();
 477     if (fDecoderVersion)
 478       fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 479     else fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
 480
 481     clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 482
 483     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 484
 485       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 486
 487       //if (tofRawDatum->GetTOT()==-1 || tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 488       if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 489
 490       if (fVerbose==2) {
 491         if (indexDDL<10) ftxt << "  " << indexDDL;
 492         else         ftxt << " " << indexDDL;
 493         if (tofRawDatum->GetTRM()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRM();
 494         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTRM();
 495         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRMchain();
 496         if (tofRawDatum->GetTDC()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDC();
 497         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTDC();
 498         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDCchannel();
 499       }
 500
 501       fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 502                                          tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 503       dummy = detectorIndex[3];
 504       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 505       detectorIndex[4] = dummy;
 506
 507       if (fVerbose==2) {
 508         if (detectorIndex[0]<10) ftxt  << "  ->  " << detectorIndex[0];
 509         else              ftxt  << "  -> " << detectorIndex[0];
 510         ftxt << "  " << detectorIndex[1];
 511         if (detectorIndex[2]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[2];
 512         else              ftxt << " " << detectorIndex[2];
 513         ftxt << "  " << detectorIndex[3];
 514         if (detectorIndex[4]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[4];
 515         else              ftxt << " " << detectorIndex[4];
 516       }
 517
 518     /* check valid index */
 519     if (detectorIndex[0]==-1||detectorIndex[1]==-1||detectorIndex[2]==-1||detectorIndex[3]==-1||detectorIndex[4]==-1) continue;
 520
 521       // Do not reconstruct anything in the holes
 522       if (detectorIndex[0]==13 || detectorIndex[0]==14 || detectorIndex[0]==15 ) { // sectors with holes
 523         if (detectorIndex[1]==2) { // plate with holes
 524           inholes++;
 525           continue;
 526         }
 527       }
 528
 529       parTOF[0] = tofRawDatum->GetTOF(); //TDC
 530       parTOF[1] = tofRawDatum->GetTOT(); // TOT
 531       parTOF[2] = tofRawDatum->GetTOT(); //ADC==TOF
 532       parTOF[3] = -1;//raw data: no track of undecalib sim time
 533       parTOF[4] = tofRawDatum->GetTOF(); // RAW time
 534       Double_t posClus[3];
 535       Double_t covClus[6];
 536       UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
 537       Int_t lab[3]={-1,-1,-1};
 538       Bool_t status=kTRUE;
 539       GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
 540       AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],lab,detectorIndex,parTOF,status,-1);
 541       InsertCluster(tofCluster);
 542
 543       if (fVerbose==2) {
 544         if (parTOF[1]<10)ftxt << "        " << parTOF[1];
 545         else if (parTOF[1]>=10 && parTOF[1]<100) ftxt << "      " << parTOF[1];
 546         else ftxt << "      " << parTOF[1];
 547         if (parTOF[0]<10) ftxt << "      " << parTOF[0] << endl;
 548         else if (parTOF[0]>=10 && parTOF[0]<100)   ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 549         else if (parTOF[0]>=100 && parTOF[0]<1000) ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 550         else ftxt << "   " << parTOF[3] << endl;
 551       }
 552
 553     } // closed loop on TOF raw data per current DDL file
 554
 555     clonesRawData->Clear();
 556
 557   } // closed loop on DDL index
 558
 559   if (fVerbose==2) ftxt.close();
 560
 561   AliDebug(1,Form("Number of found clusters: %d", fNumberOfTofClusters));
 562
 563   CalibrateRecPoint();
 564   FillRecPoint();
 565
 566   clustersTree->Fill();
 567
 568   ResetRecpoint();
 569
 570   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 571                    stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 572   if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 573
 574 }
 575 //______________________________________________________________________________
 576
 577 void AliTOFClusterFinder::Digits2RecPoints(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader)
 578 {
 579   //
 580   // Converts RAW data to recpoints for TOF
 581   //
 582
 583   TStopwatch stopwatch;
 584   stopwatch.Start();
 585
 586   Int_t inholes = 0;
 587
 588   const Int_t kDDL = AliDAQ::NumberOfDdls("TOF");
 589
 590   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 591
 592   AliDebug(2,Form(" Event number %2d ", iEvent));
 593
 594   fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 595
 596   if (fTreeR == 0x0){
 597     fTOFLoader->MakeTree("R");
 598     fTreeR = fTOFLoader->TreeR();
 599   }
 600
 601   Int_t bufsize = 32000;
 602   fTreeR->Branch("TOF", &fRecPoints, bufsize);
 603
 604   TClonesArray * clonesRawData;
 605
 606   Int_t dummy = -1;
 607
 608   Int_t detectorIndex[5] = {-1, -1, -1, -1, -1};
 609   Int_t parTOF[5];
 610   ofstream ftxt;
 611   if (fVerbose==2) ftxt.open("TOFdigitsRead.txt",ios::app);
 612
 613   //AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 614   fTOFRawStream.Clear();
 615   fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
 616
 617   if (fDecoderVersion)
 618     AliInfo("Using New Decoder");
 619
 620   Int_t indexDDL = 0;
 621   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 622
 623     rawReader->Reset();
 624     if (fDecoderVersion)
 625       fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 626     else fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
 627
 628     clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 629
 630     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 631
 632       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 633
 634       //if (tofRawDatum->GetTOT()==-1 || tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 635       if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 636
 637       if (fVerbose==2) {
 638         if (indexDDL<10) ftxt << "  " << indexDDL;
 639         else         ftxt << " " << indexDDL;
 640         if (tofRawDatum->GetTRM()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRM();
 641         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTRM();
 642         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTRMchain();
 643         if (tofRawDatum->GetTDC()<10) ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDC();
 644         else         ftxt << " " << tofRawDatum->GetTDC();
 645         ftxt << "  " << tofRawDatum->GetTDCchannel();
 646       }
 647
 648       fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 649                                          tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 650       dummy = detectorIndex[3];
 651       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 652       detectorIndex[4] = dummy;
 653
 654       if (fVerbose==2) {
 655         if (detectorIndex[0]<10) ftxt  << "  ->  " << detectorIndex[0];
 656         else              ftxt  << "  -> " << detectorIndex[0];
 657         ftxt << "  " << detectorIndex[1];
 658         if (detectorIndex[2]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[2];
 659         else              ftxt << " " << detectorIndex[2];
 660         ftxt << "  " << detectorIndex[3];
 661         if (detectorIndex[4]<10) ftxt << "  " << detectorIndex[4];
 662         else              ftxt << " " << detectorIndex[4];
 663       }
 664
 665     /* check valid index */
 666     if (detectorIndex[0]==-1||detectorIndex[1]==-1||detectorIndex[2]==-1||detectorIndex[3]==-1||detectorIndex[4]==-1) continue;
 667
 668       // Do not reconstruct anything in the holes
 669       if (detectorIndex[0]==13 || detectorIndex[0]==14 || detectorIndex[0]==15 ) { // sectors with holes
 670         if (detectorIndex[1]==2) { // plate with holes
 671           inholes++;
 672           continue;
 673         }
 674       }
 675
 676       parTOF[0] = tofRawDatum->GetTOF(); // TDC
 677       parTOF[1] = tofRawDatum->GetTOT(); // TOT
 678       parTOF[2] = tofRawDatum->GetTOT(); // raw data have ADC=TOT
 679       parTOF[3] = -1; //raw data: no track of the undecalib sim time
 680       parTOF[4] = tofRawDatum->GetTOF(); // Raw time == TDC
 681       Double_t posClus[3];
 682       Double_t covClus[6];
 683       UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
 684       Int_t lab[3]={-1,-1,-1};
 685       Bool_t status=kTRUE;
 686       GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
 687       AliTOFcluster *tofCluster = new AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],lab,detectorIndex,parTOF,status,-1);
 688       InsertCluster(tofCluster);
 689
 690       if (fVerbose==2) {
 691         if (parTOF[1]<10)ftxt << "        " << parTOF[1];
 692         else if (parTOF[1]>=10 && parTOF[1]<100) ftxt << "      " << parTOF[1];
 693         else ftxt << "      " << parTOF[1];
 694         if (parTOF[0]<10) ftxt << "      " << parTOF[0] << endl;
 695         else if (parTOF[0]>=10 && parTOF[0]<100)   ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 696         else if (parTOF[0]>=100 && parTOF[0]<1000) ftxt << "    " << parTOF[0] << endl;
 697         else ftxt << "   " << parTOF[3] << endl;
 698       }
 699
 700     } // closed loop on TOF raw data per current DDL file
 701
 702     clonesRawData->Clear();
 703
 704   } // closed loop on DDL index
 705
 706   if (fVerbose==2) ftxt.close();
 707
 708   AliDebug(1,Form("Number of found clusters: %d for event: %d", fNumberOfTofClusters, iEvent));
 709
 710   CalibrateRecPoint();
 711   FillRecPoint();
 712
 713   fTreeR->Fill();
 714   ResetRecpoint();
 715
 716   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
 717   fTOFLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 718
 719   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.4fs C:%.4fs",
 720                stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 721   if (inholes) AliWarning(Form("Clusters in the TOF holes: %d",inholes));
 722
 723 }
 724 //______________________________________________________________________________
 725
 726 void AliTOFClusterFinder::Raw2Digits(Int_t iEvent, AliRawReader *rawReader)
 727 {
 728   //
 729   // Converts RAW data to MC digits for TOF
 730   //
 731   //             (temporary solution)
 732   //
 733
 734   TStopwatch stopwatch;
 735   stopwatch.Start();
 736
 737   const Int_t kDDL = AliTOFGeometry::NDDL()*AliTOFGeometry::NSectors();
 738
 739   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 740
 741   fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
 742   if (fTreeD)
 743     {
 744     AliInfo("TreeD re-creation");
 745     fTreeD = 0x0;
 746     fTOFLoader->MakeTree("D");
 747     fTreeD = fTOFLoader->TreeD();
 748     }
 749
 750   TClonesArray *tofDigits = new TClonesArray("AliTOFdigit",10000);
 751   Int_t bufsize = 32000;
 752   fTreeD->Branch("TOF", &tofDigits, bufsize);
 753
 754   fRunLoader->GetEvent(iEvent);
 755
 756   AliDebug(2,Form(" Event number %2d ", iEvent));
 757
 758   TClonesArray * clonesRawData;
 759
 760   Int_t dummy = -1;
 761
 762   Int_t detectorIndex[5];
 763   Int_t digit[4];
 764
 765   //AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 766   fTOFRawStream.Clear();
 767   fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
 768
 769   if (fDecoderVersion)
 770     AliInfo("Using New Decoder");
 771
 772   Int_t indexDDL = 0;
 773   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 774
 775     rawReader->Reset();
 776     if (fDecoderVersion)
 777       fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 778     else fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
 779
 780     clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 781
 782     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 783
 784       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 785
 786       //if (!tofRawDatum->GetTOT() || !tofRawDatum->GetTOF()) continue;
 787       if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 788
 789       fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 790                                          tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 791       dummy = detectorIndex[3];
 792       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 793       detectorIndex[4] = dummy;
 794
 795       digit[0] = fTOFRawStream.GetTofBin();
 796       digit[1] = fTOFRawStream.GetToTbin();
 797       digit[2] = fTOFRawStream.GetToTbin();
 798       digit[3] = -1;
 799
 800       Int_t tracknum[3]={-1,-1,-1};
 801
 802       TClonesArray &aDigits = *tofDigits;
 803       Int_t last=tofDigits->GetEntriesFast();
 804       new (aDigits[last]) AliTOFdigit(tracknum, detectorIndex, digit);
 805
 806     } // while loop
 807
 808     clonesRawData->Clear();
 809
 810   } // DDL Loop
 811
 812   fTreeD->Fill();
 813
 814   fTOFLoader = fRunLoader->GetLoader("TOFLoader");
 815   fTOFLoader->WriteDigits("OVERWRITE");
 816
 817   delete tofDigits;
 818
 819   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and to write TOF clusters : R:%.2fs C:%.2fs",
 820                    stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 821
 822 }
 823
 824 //______________________________________________________________________________
 825
 826 void AliTOFClusterFinder::Raw2Digits(AliRawReader *rawReader, TTree* digitsTree)
 827 {
 828   //
 829   // Converts RAW data to MC digits for TOF for the current event
 830   //
 831   //
 832
 833   TStopwatch stopwatch;
 834   stopwatch.Start();
 835
 836   const Int_t kDDL = AliTOFGeometry::NDDL()*AliTOFGeometry::NSectors();
 837
 838   if (!digitsTree)
 839     {
 840     AliError("No input digits Tree");
 841     return;
 842     }
 843
 844   TClonesArray *tofDigits = new TClonesArray("AliTOFdigit",10000);
 845   Int_t bufsize = 32000;
 846   digitsTree->Branch("TOF", &tofDigits, bufsize);
 847
 848   TClonesArray * clonesRawData;
 849
 850   Int_t dummy = -1;
 851
 852   Int_t detectorIndex[5];
 853   Int_t digit[4];
 854
 855   //AliTOFRawStream tofInput(rawReader);
 856   fTOFRawStream.Clear();
 857   fTOFRawStream.SetRawReader(rawReader);
 858
 859   if (fDecoderVersion)
 860     AliInfo("Using New Decoder");
 861
 862   Int_t indexDDL = 0;
 863   for (indexDDL = 0; indexDDL < kDDL; indexDDL++) {
 864
 865     rawReader->Reset();
 866     if (fDecoderVersion)
 867       fTOFRawStream.LoadRawDataBuffers(indexDDL,fVerbose);
 868     else fTOFRawStream.LoadRawData(indexDDL);
 869
 870     clonesRawData = (TClonesArray*)fTOFRawStream.GetRawData();
 871
 872     for (Int_t iRawData = 0; iRawData<clonesRawData->GetEntriesFast(); iRawData++) {
 873
 874       AliTOFrawData *tofRawDatum = (AliTOFrawData*)clonesRawData->UncheckedAt(iRawData);
 875
 876       //if (!tofRawDatum->GetTOT() || !tofRawDatum->GetTOF()) continue;
 877       if (tofRawDatum->GetTOF()==-1) continue;
 878
 879       fTOFRawStream.EquipmentId2VolumeId(indexDDL, tofRawDatum->GetTRM(), tofRawDatum->GetTRMchain(),
 880                                          tofRawDatum->GetTDC(), tofRawDatum->GetTDCchannel(), detectorIndex);
 881       dummy = detectorIndex[3];
 882       detectorIndex[3] = detectorIndex[4];
 883       detectorIndex[4] = dummy;
 884
 885       digit[0] = fTOFRawStream.GetTofBin();
 886       digit[1] = fTOFRawStream.GetToTbin();
 887       digit[2] = fTOFRawStream.GetToTbin();
 888       digit[3] = -1;
 889
 890       Int_t tracknum[3]={-1,-1,-1};
 891
 892       TClonesArray &aDigits = *tofDigits;
 893       Int_t last=tofDigits->GetEntriesFast();
 894       new (aDigits[last]) AliTOFdigit(tracknum, detectorIndex, digit);
 895
 896     } // while loop
 897
 898     clonesRawData->Clear();
 899
 900   } // DDL Loop
 901
 902   digitsTree->Fill();
 903
 904   delete tofDigits;
 905
 906   AliDebug(1, Form("Got %d digits: ", fDigits->GetEntries()));
 907   AliDebug(1, Form("Execution time to read TOF raw data and fill TOF digit tree : R:%.2fs C:%.2fs",
 908                    stopwatch.RealTime(),stopwatch.CpuTime()));
 909
 910 }
 911 //______________________________________________________________________________
 912
 913 Int_t AliTOFClusterFinder::InsertCluster(AliTOFcluster *tofCluster) {
 914   //---------------------------------------------------------------------------//
 915   // This function adds a TOF cluster to the array of TOF clusters sorted in Z //
 916   //---------------------------------------------------------------------------//
 917   if (fNumberOfTofClusters==kTofMaxCluster) {
 918     AliError("Too many clusters !");
 919     return 1;
 920   }
 921
 922   if (fNumberOfTofClusters==0) {
 923     fTofClusters[fNumberOfTofClusters++] = tofCluster;
 924     return 0;
 925   }
 926
 927   Int_t ii = FindClusterIndex(tofCluster->GetZ());
 928   memmove(fTofClusters+ii+1 ,fTofClusters+ii,(fNumberOfTofClusters-ii)*sizeof(AliTOFcluster*));
 929   fTofClusters[ii] = tofCluster;
 930   fNumberOfTofClusters++;
 931
 932   return 0;
 933
 934 }
 935 //_________________________________________________________________________
 936
 937 Int_t AliTOFClusterFinder::FindClusterIndex(Double_t z) const {
 938   //--------------------------------------------------------------------
 939   // This function returns the index of the nearest cluster in z
 940   //--------------------------------------------------------------------
 941   if (fNumberOfTofClusters==0) return 0;
 942   if (z <= fTofClusters[0]->GetZ()) return 0;
 943   if (z > fTofClusters[fNumberOfTofClusters-1]->GetZ()) return fNumberOfTofClusters;
 944   Int_t b = 0, e = fNumberOfTofClusters-1, m = (b+e)/2;
 945   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
 946     if (z > fTofClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
 947     else e=m;
 948   }
 949
 950   return m;
 951
 952 }
 953 //_________________________________________________________________________
 954
 955 void AliTOFClusterFinder::FillRecPoint()
 956 {
 957   //
 958   // Copy the global array of AliTOFcluster, i.e. fTofClusters (sorted
 959   // in Z) in the global TClonesArray of AliTOFcluster,
 960   // i.e. fRecPoints.
 961   //
 962
 963   Int_t ii, jj;
 964
 965   Int_t detectorIndex[5];
 966   Int_t parTOF[5];
 967   Int_t trackLabels[3];
 968   Int_t digitIndex = -1;
 969   Bool_t status=kTRUE;
 970
 971   TClonesArray &lRecPoints = *fRecPoints;
 972
 973   for (ii=0; ii<fNumberOfTofClusters; ii++) {
 974
 975     digitIndex = fTofClusters[ii]->GetIndex();
 976     for(jj=0; jj<5; jj++) detectorIndex[jj] = fTofClusters[ii]->GetDetInd(jj);
 977     for(jj=0; jj<3; jj++) trackLabels[jj] = fTofClusters[ii]->GetLabel(jj);
 978     parTOF[0] = fTofClusters[ii]->GetTDC(); // TDC
 979     parTOF[1] = fTofClusters[ii]->GetToT(); // TOT
 980     parTOF[2] = fTofClusters[ii]->GetADC(); // ADC=TOT
 981     parTOF[3] = fTofClusters[ii]->GetTDCND(); // TDCND
 982     parTOF[4] = fTofClusters[ii]->GetTDCRAW();//RAW
 983     status=fTofClusters[ii]->GetStatus();
 984     Double_t posClus[3];
 985     Double_t covClus[6];
 986     UShort_t volIdClus=GetClusterVolIndex(detectorIndex);
 987     GetClusterPars(detectorIndex,posClus,covClus);
 988     new(lRecPoints[ii]) AliTOFcluster(volIdClus,posClus[0],posClus[1],posClus[2],covClus[0],covClus[1],covClus[2],covClus[3],covClus[4],covClus[5],trackLabels,detectorIndex, parTOF,status,digitIndex);
 989
 990     AliDebug(2, Form(" %4d  %4d  %f %f %f  %f %f %f %f %f %f  %3d %3d %3d  %2d %1d %2d %1d %2d  %4d %3d %3d %4d %4d  %1d  %4d",
 991                      ii, volIdClus, posClus[0], posClus[1], posClus[2],
 992                      fTofClusters[ii]->GetSigmaX2(),
 993                      fTofClusters[ii]->GetSigmaXY(),
 994                      fTofClusters[ii]->GetSigmaXZ(),
 995                      fTofClusters[ii]->GetSigmaY2(),
 996                      fTofClusters[ii]->GetSigmaYZ(),
 997                      fTofClusters[ii]->GetSigmaZ2(),
 998                      trackLabels[0], trackLabels[1], trackLabels[2],
 999                      detectorIndex[0], detectorIndex[1], detectorIndex[2], detectorIndex[3], detectorIndex[4],
1000                      parTOF[0], parTOF[1], parTOF[2], parTOF[3], parTOF[4],
1001                      status, digitIndex));
1002
1003   } // loop on clusters
1004
1005 }
1006
1007 //_________________________________________________________________________
1008 void AliTOFClusterFinder::CalibrateRecPoint()
1009 {
1010   //
1011   // Copy the global array of AliTOFcluster, i.e. fTofClusters (sorted
1012   // in Z) in the global TClonesArray of AliTOFcluster,
1013   // i.e. fRecPoints.
1014   //
1015
1016   Int_t ii, jj;
1017
1018   Int_t detectorIndex[5];
1019   Int_t digitIndex = -1;
1020   Double_t tToT;
1021   Double_t timeCorr;
1022   Int_t   tdcCorr;
1023   AliDebug(1," Calibrating TOF Clusters");
1024
1025   AliTOFChannelOnlineArray *calDelay = fTOFcalib->GetTOFOnlineDelay();
1026   AliTOFChannelOnlineStatusArray *calStatus = fTOFcalib->GetTOFOnlineStatus();
1027   TObjArray *calTOFArrayOffline = fTOFcalib->GetTOFCalArrayOffline();
1028
1029   TString validity = (TString)fTOFcalib->GetOfflineValidity();
1030   Int_t calibration = -1;
1031   if (validity.CompareTo("valid")==0) {
1032     AliInfo(Form(" validity = %s - Using offline calibration parameters",validity.Data()));
1033     calibration = 1;
1034   } else {
1035     AliInfo(Form(" validity = %s - Using online calibration parameters",validity.Data()));
1036     calibration = 0 ;
1037   }
1038
1039   for (ii=0; ii<fNumberOfTofClusters; ii++) {
1040     digitIndex = fTofClusters[ii]->GetIndex();
1041     for(jj=0; jj<5; jj++) detectorIndex[jj] = fTofClusters[ii]->GetDetInd(jj);
1042
1043     Int_t index = AliTOFGeometry::GetIndex(detectorIndex);
1044
1045     UChar_t statusPulser=calStatus->GetPulserStatus(index);
1046     UChar_t statusNoise=calStatus->GetNoiseStatus(index);
1047     UChar_t statusHW=calStatus->GetHWStatus(index);
1048     UChar_t status=calStatus->GetStatus(index);
1049
1050     //check the status, also unknown is fine!!!!!!!
1051
1052     AliDebug(2, Form(" Status for channel %d = %d",index, (Int_t)status));
1053     if((statusPulser & AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFPulserBad)==(AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFPulserBad)||(statusNoise & AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFNoiseBad)==(AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFNoiseBad)||(statusHW & AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFHWBad)==(AliTOFChannelOnlineStatusArray::kTOFHWBad)){
1054       AliDebug(2, Form(" Bad Status for channel %d",index));
1055       fTofClusters[ii]->SetStatus(kFALSE); //odd convention, to avoid conflict with calibration objects currently in the db (temporary solution).
1056     }
1057     else {
1058       AliDebug(2, Form(" Good Status for channel %d",index));
1059     }
1060     // Get Rough channel online equalization
1061     Double_t roughDelay=(Double_t)calDelay->GetDelay(index);  // in ns
1062     AliDebug(2,Form(" channel delay (ns) = %f", roughDelay));
1063     // Get Refined channel offline calibration parameters
1064     if (calibration ==1){
1065       AliTOFChannelOffline * calChannelOffline = (AliTOFChannelOffline*)calTOFArrayOffline->At(index);
1066       Double_t par[6];
1067       for (Int_t j = 0; j<6; j++){
1068         par[j]=(Double_t)calChannelOffline->GetSlewPar(j);
1069      }
1070       AliDebug(2,Form(" Calib Pars = %f, %f, %f, %f, %f, %f ",par[0],par[1],par[2],par[3],par[4],par[5]));
1071       AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (counts) = %d , %d", fTofClusters[ii]->GetToT(),fTofClusters[ii]->GetTDC()));
1072       tToT = (Double_t)(fTofClusters[ii]->GetToT()*AliTOFGeometry::ToTBinWidth());
1073       tToT*=1.E-3; //ToT in ns
1074       AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (ns)= %e, %e",fTofClusters[ii]->GetTDC()*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3,tToT));
1075       timeCorr=par[0]+par[1]*tToT+par[2]*tToT*tToT+par[3]*tToT*tToT*tToT+par[4]*tToT*tToT*tToT*tToT+par[5]*tToT*tToT*tToT*tToT*tToT; // the time correction (ns)
1076     }
1077     else {
1078       timeCorr = roughDelay; // correction in ns
1079     }
1080     AliDebug(2,Form(" The ToT and Time, uncorr (ns)= %e, %e",fTofClusters[ii]->GetTDC()*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3,fTofClusters[ii]->GetToT()*AliTOFGeometry::ToTBinWidth()));
1081     AliDebug(2,Form(" The time correction (ns) = %f", timeCorr));
1082     timeCorr=(Double_t)(fTofClusters[ii]->GetTDC())*AliTOFGeometry::TdcBinWidth()*1.E-3-timeCorr;//redefine the time
1083     timeCorr*=1.E3;
1084     AliDebug(2,Form(" The channel time, corr (ps)= %e",timeCorr ));
1085     tdcCorr=(Int_t)(timeCorr/AliTOFGeometry::TdcBinWidth()); //the corrected time (tdc counts)
1086     fTofClusters[ii]->SetTDC(tdcCorr);
1087   } // loop on clusters
1088
1089 }
1090 //______________________________________________________________________________
1091
1092 void AliTOFClusterFinder::ResetRecpoint()
1093 {
1094   //
1095   // Clear the list of reconstructed points
1096   //
1097
1098   fNumberOfTofClusters = 0;
1099   if (fRecPoints) fRecPoints->Clear();
1100
1101 }
1102 //______________________________________________________________________________
1103
1104 void AliTOFClusterFinder::Load()
1105 {
1106   //
1107   // Load TOF.Digits.root and TOF.RecPoints.root files
1108   //
1109
1110   fTOFLoader->LoadDigits("READ");
1111   fTOFLoader->LoadRecPoints("recreate");
1112
1113 }
1114 //______________________________________________________________________________
1115
1116 void AliTOFClusterFinder::LoadClusters()
1117 {
1118   //
1119   // Load TOF.RecPoints.root file
1120   //
1121
1122   fTOFLoader->LoadRecPoints("recreate");
1123
1124 }
1125 //______________________________________________________________________________
1126
1127 void AliTOFClusterFinder::UnLoad()
1128 {
1129   //
1130   // Unload TOF.Digits.root and TOF.RecPoints.root files
1131   //
1132
1133   fTOFLoader->UnloadDigits();
1134   fTOFLoader->UnloadRecPoints();
1135
1136 }
1137 //______________________________________________________________________________
1138
1139 void AliTOFClusterFinder::UnLoadClusters()
1140 {
1141   //
1142   // Unload TOF.RecPoints.root file
1143   //
1144
1145   fTOFLoader->UnloadRecPoints();
1146
1147 }
1148 //-------------------------------------------------------------------------
1149 UShort_t AliTOFClusterFinder::GetClusterVolIndex(Int_t *ind) const {
1150
1151   //First of all get the volume ID to retrieve the l2t transformation...
1152   //
1153   // Detector numbering scheme
1154   Int_t nSector = 18;
1155   Int_t nPlate  = 5;
1156   Int_t nStripA = 15;
1157   Int_t nStripB = 19;
1158   Int_t nStripC = 19;
1159
1160   Int_t isector =ind[0];
1161   if (isector >= nSector)
1162     AliError(Form("Wrong sector number in TOF (%d) !",isector));
1163   Int_t iplate = ind[1];
1164   if (iplate >= nPlate)
1165     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
1166   Int_t istrip = ind[2];
1167
1168   Int_t stripOffset = 0;
1169   switch (iplate) {
1170   case 0:
1171     stripOffset = 0;
1172     break;
1173   case 1:
1174     stripOffset = nStripC;
1175     break;
1176   case 2:
1177     stripOffset = nStripC+nStripB;
1178     break;
1179   case 3:
1180     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA;
1181     break;
1182   case 4:
1183     stripOffset = nStripC+nStripB+nStripA+nStripB;
1184     break;
1185   default:
1186     AliError(Form("Wrong plate number in TOF (%d) !",iplate));
1187     break;
1188   };
1189
1190   Int_t index= (2*(nStripC+nStripB)+nStripA)*isector +
1191                stripOffset +
1192                istrip;
1193
1194   UShort_t volIndex = AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kTOF,index);
1195   return volIndex;
1196 }
1197 //
1198 //-------------------------------------------------------------------------
1199 void AliTOFClusterFinder::GetClusterPars(Int_t *ind, Double_t* pos,Double_t* cov) const {
1200
1201   //First of all get the volume ID to retrieve the l2t transformation...
1202   //
1203   UShort_t volIndex = GetClusterVolIndex(ind);
1204   //
1205   //
1206   //we now go in the system of the strip: determine the local coordinates
1207   //
1208   //
1209   // 47---------------------------------------------------0  ^ z
1210   // | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | 1 |
1211   // -----------------------------------------------------   | y going outwards
1212   // | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | 0 |  par[0]=0;
1213
1214   // -----------------------------------------------------   |
1215   // x <-----------------------------------------------------
1216
1217   /*
1218   Float_t localX = (ind[4]-23.5)*AliTOFGeometry::XPad();
1219   Float_t localY = 0;
1220   Float_t localZ = (ind[3]- 0.5)*AliTOFGeometry::ZPad();
1221   */
1222   Float_t localX = (ind[4]-AliTOFGeometry::NpadX()/2)*AliTOFGeometry::XPad()+AliTOFGeometry::XPad()/2.;
1223   Float_t localY = 0;
1224   Float_t localZ = (ind[3]-AliTOFGeometry::NpadZ()/2)*AliTOFGeometry::ZPad()+AliTOFGeometry::ZPad()/2.;
1225   //move to the tracking ref system
1226
1227   Double_t lpos[3];
1228   lpos[0] = localX;
1229   lpos[1] = localY;
1230   lpos[2] = localZ;
1231
1232   const TGeoHMatrix *l2t= AliGeomManager::GetTracking2LocalMatrix(volIndex);
1233   // Get The position in the track ref system
1234   Double_t tpos[3];
1235   l2t->MasterToLocal(lpos,tpos);
1236   pos[0] = tpos[0];
1237   pos[1] = tpos[1];
1238   pos[2] = tpos[2];
1239
1240   //Get The cluster covariance in the track ref system
1241   Double_t lcov[9];
1242
1243   //cluster covariance in the local system:
1244   // sx2   0   0
1245   // 0     0   0
1246   // 0     0   sz2
1247
1248   lcov[0] = AliTOFGeometry::XPad()*AliTOFGeometry::XPad()/12.;
1249   lcov[1] = 0;
1250   lcov[2] = 0;
1251   lcov[3] = 0;
1252   lcov[4] = 0;
1253   lcov[5] = 0;
1254   lcov[6] = 0;
1255   lcov[7] = 0;
1256   lcov[8] = AliTOFGeometry::ZPad()*AliTOFGeometry::ZPad()/12.;
1257
1258   //cluster covariance in the tracking system:
1259   TGeoHMatrix m;
1260   m.SetRotation(lcov);
1261   m.Multiply(l2t);
1262   m.MultiplyLeft(&l2t->Inverse());
1263   Double_t *tcov = m.GetRotationMatrix();
1264   cov[0] = tcov[0]; cov[1] = tcov[1]; cov[2] = tcov[2];
1265   cov[3] = tcov[4]; cov[4] = tcov[5];
1266   cov[5] = tcov[8];
1267
1268   return;
1269
1270 }