TPC/AliTPCseed.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17
  18
  19 //-----------------------------------------------------------------
  20 //           Implementation of the TPC seed class
  21 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
  22 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
  23 //-----------------------------------------------------------------
  24 #include "TClonesArray.h"
  25 #include "AliTPCseed.h"
  26 #include "AliTPCReconstructor.h"
  27
  28 ClassImp(AliTPCseed)
  29
  30
  31
  32 AliTPCseed::AliTPCseed():
  33   AliTPCtrack(),
  34   fEsd(0x0),
  35   fClusterOwner(kFALSE),
  36   fPoints(0x0),
  37   fEPoints(0x0),
  38   fRow(0),
  39   fSector(-1),
  40   fRelativeSector(-1),
  41   fCurrentSigmaY2(1e10),
  42   fCurrentSigmaZ2(1e10),
  43   fErrorY2(1e10),
  44   fErrorZ2(1e10),
  45   fCurrentCluster(0x0),
  46   fCurrentClusterIndex1(-1),
  47   fInDead(kFALSE),
  48   fIsSeeding(kFALSE),
  49   fNoCluster(0),
  50   fSort(0),
  51   fBSigned(kFALSE),
  52   fSeedType(0),
  53   fSeed1(-1),
  54   fSeed2(-1),
  55   fMAngular(0),
  56   fCircular(0)
  57 {
  58   //
  59   for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
  60   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
  61   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
  62   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
  63   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
  64     fDEDX[i] = 0.;
  65     fSDEDX[i] = 1e10;
  66     fNCDEDX[i] = 0;
  67   }
  68   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
  69 }
  70
  71 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
  72   AliTPCtrack(s),
  73   fEsd(0x0),
  74   fClusterOwner(clusterOwner),
  75   fPoints(0x0),
  76   fEPoints(0x0),
  77   fRow(0),
  78   fSector(-1),
  79   fRelativeSector(-1),
  80   fCurrentSigmaY2(1e10),
  81   fCurrentSigmaZ2(1e10),
  82   fErrorY2(1e10),
  83   fErrorZ2(1e10),
  84   fCurrentCluster(0x0),
  85   fCurrentClusterIndex1(-1),
  86   fInDead(kFALSE),
  87   fIsSeeding(kFALSE),
  88   fNoCluster(0),
  89   fSort(0),
  90   fBSigned(kFALSE),
  91   fSeedType(0),
  92   fSeed1(-1),
  93   fSeed2(-1),
  94   fMAngular(0),
  95   fCircular(0)
  96 {
  97   //---------------------
  98   // dummy copy constructor
  99   //-------------------------
 100   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 101     fClusterPointer[i]=0;
 102     if (fClusterOwner){
 103       if (s.fClusterPointer[i])
 104         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
 105     }else{
 106       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
 107     }
 108     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
 109   }
 110   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
 111 }
 112 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
 113   AliTPCtrack(t),
 114   fEsd(0x0),
 115   fClusterOwner(kFALSE),
 116   fPoints(0x0),
 117   fEPoints(0x0),
 118   fRow(0),
 119   fSector(-1),
 120   fRelativeSector(-1),
 121   fCurrentSigmaY2(1e10),
 122   fCurrentSigmaZ2(1e10),
 123   fErrorY2(1e10),
 124   fErrorZ2(1e10),
 125   fCurrentCluster(0x0),
 126   fCurrentClusterIndex1(-1),
 127   fInDead(kFALSE),
 128   fIsSeeding(kFALSE),
 129   fNoCluster(0),
 130   fSort(0),
 131   fBSigned(kFALSE),
 132   fSeedType(0),
 133   fSeed1(-1),
 134   fSeed2(-1),
 135   fMAngular(0),
 136   fCircular(0)
 137 {
 138   //
 139   // Constructor from AliTPCtrack
 140   //
 141   fFirstPoint =0;
 142   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=t.GetKinkIndex(i);
 143   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 144   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 145     fClusterPointer[i] = 0;
 146     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
 147     if (index>=-1){
 148       SetClusterIndex2(i,index);
 149     }
 150     else{
 151       SetClusterIndex2(i,-3);
 152     }
 153   }
 154   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 155     fDEDX[i] = 0.;
 156     fSDEDX[i] = 1e10;
 157     fNCDEDX[i] = 0;
 158   }
 159   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 160 }
 161
 162 AliTPCseed::AliTPCseed(UInt_t index,  const Double_t xx[5],
 163                        const Double_t cc[15],
 164                        Double_t xr, Double_t alpha):
 165   AliTPCtrack(index, xx, cc, xr, alpha),
 166   fEsd(0x0),
 167   fClusterOwner(kFALSE),
 168   fPoints(0x0),
 169   fEPoints(0x0),
 170   fRow(0),
 171   fSector(-1),
 172   fRelativeSector(-1),
 173   fCurrentSigmaY2(1e10),
 174   fCurrentSigmaZ2(1e10),
 175   fErrorY2(1e10),
 176   fErrorZ2(1e10),
 177   fCurrentCluster(0x0),
 178   fCurrentClusterIndex1(-1),
 179   fInDead(kFALSE),
 180   fIsSeeding(kFALSE),
 181   fNoCluster(0),
 182   fSort(0),
 183   fBSigned(kFALSE),
 184   fSeedType(0),
 185   fSeed1(-1),
 186   fSeed2(-1),
 187   fMAngular(0),
 188   fCircular(0)
 189 {
 190   //
 191   // Constructor
 192   //
 193   fFirstPoint =0;
 194   for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 195   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 196   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
 197   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 198   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 199     fDEDX[i] = 0.;
 200     fSDEDX[i] = 1e10;
 201     fNCDEDX[i] = 0;
 202   }
 203   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 204 }
 205
 206 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
 207   //
 208   // destructor
 209   if (fPoints) delete fPoints;
 210   fPoints =0;
 211   if (fEPoints) delete fEPoints;
 212   fEPoints = 0;
 213   fNoCluster =0;
 214   if (fClusterOwner){
 215     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
 216       delete fClusterPointer[icluster];
 217     }
 218   }
 219 }
 220
 221 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
 222 {
 223   //
 224   //
 225   return &fTrackPoints[i];
 226 }
 227
 228 void AliTPCseed::RebuildSeed()
 229 {
 230   //
 231   // rebuild seed to be ready for storing
 232   AliTPCclusterMI cldummy;
 233   cldummy.SetQ(0);
 234   AliTPCTrackPoint pdummy;
 235   pdummy.GetTPoint().fIsShared = 10;
 236   for (Int_t i=0;i<160;i++){
 237     AliTPCclusterMI * cl0 = fClusterPointer[i];
 238     AliTPCTrackPoint *trpoint = (AliTPCTrackPoint*)fPoints->UncheckedAt(i);
 239     if (cl0){
 240       trpoint->GetTPoint() = *(GetTrackPoint(i));
 241       trpoint->GetCPoint() = *cl0;
 242       trpoint->GetCPoint().SetQ(TMath::Abs(cl0->GetQ()));
 243     }
 244     else{
 245       *trpoint = pdummy;
 246       trpoint->GetCPoint()= cldummy;
 247     }
 248
 249   }
 250
 251 }
 252
 253
 254 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
 255 {
 256   //
 257   //
 258   // return cluster for n rows bellow first point
 259   Int_t nfoundable = 1;
 260   Int_t nfound      = 1;
 261   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
 262     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 263     if (index!=-1) nfoundable++;
 264     if (index>0) nfound++;
 265   }
 266   if (nfoundable<n) return 0;
 267   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
 268
 269 }
 270
 271
 272 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
 273 {
 274   // get cluster stat.  on given region
 275   //
 276   found       = 0;
 277   foundable   = 0;
 278   shared      =0;
 279   for (Int_t i=first;i<last; i++){
 280     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 281     if (index!=-1) foundable++;
 282     if (fClusterPointer[i]) {
 283       found++;
 284     }
 285     else
 286       continue;
 287
 288     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
 289       shared++;
 290       continue;
 291     }
 292     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
 293     //
 294     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
 295       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
 296         shared++;
 297         continue;
 298       }
 299     }
 300     if ( fClusterPointer[i+1]){
 301       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
 302         shared++;
 303         continue;
 304       }
 305     }
 306
 307   }
 308   //if (shared>found){
 309     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
 310   //}
 311 }
 312
 313
 314
 315
 316
 317 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
 318 {
 319   //
 320   //
 321   SetNumberOfClusters(0);
 322   fNFoundable = 0;
 323   SetChi2(0);
 324   ResetCovariance();
 325   /*
 326   if (fTrackPoints){
 327     for (Int_t i=0;i<8;i++){
 328       delete [] fTrackPoints[i];
 329     }
 330     delete fTrackPoints;
 331     fTrackPoints =0;
 332   }
 333   */
 334
 335   if (all){
 336     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 337     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 338   }
 339
 340 }
 341
 342
 343 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
 344 {
 345
 346   //------------------------------------------------------------------
 347   //This function makes a track forget its history :)
 348   //------------------------------------------------------------------
 349   if (factor<=0) {
 350     ResetCovariance();
 351     return;
 352   }
 353   fC00*=factor;
 354   fC10*=0;  fC11*=factor;
 355   fC20*=0;  fC21*=0;  fC22*=factor;
 356   fC30*=0;  fC31*=0;  fC32*=0;  fC33*=factor;
 357   fC40*=0;  fC41*=0;  fC42*=0;  fC43*=0;  fC44*=factor;
 358   SetNumberOfClusters(0);
 359   fNFoundable =0;
 360   SetChi2(0);
 361   fRemoval = 0;
 362   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
 363   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
 364   fNoCluster     = 0;
 365   //fFirstPoint = 160;
 366   //fLastPoint  = 0;
 367 }
 368
 369
 370
 371
 372 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
 373 {
 374   //-----------------------------------------------------------------
 375   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
 376   // doesn't change internal state of the track
 377   //-----------------------------------------------------------------
 378
 379   Double_t x1=fX, x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
 380
 381   if (TMath::Abs(fP4*xk - fP2) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {
 382     return 0;
 383   }
 384
 385   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
 386   Double_t c1=fP4*x1 - fP2, r1=sqrt(1.- c1*c1);
 387   Double_t c2=fP4*x2 - fP2, r2=sqrt(1.- c2*c2);
 388
 389   y = fP0;
 390   z = fP1;
 391   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 392   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
 393
 394   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 395   Double_t dz = 0;
 396   //
 397   Double_t delta = fP4*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 398   /*
 399   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
 400     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
 401   }else{
 402     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 403   }
 404   */
 405   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
 406   dz =  fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
 407   //
 408   y+=dy;
 409   z+=dz;
 410
 411
 412   return 1;
 413 }
 414
 415
 416 //_____________________________________________________________________________
 417 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const
 418 {
 419   //-----------------------------------------------------------------
 420   // This function calculates a predicted chi2 increment.
 421   //-----------------------------------------------------------------
 422   //Double_t r00=c->GetSigmaY2(), r01=0., r11=c->GetSigmaZ2();
 423   Double_t r00=fErrorY2, r01=0., r11=fErrorZ2;
 424   r00+=fC00; r01+=fC10; r11+=fC11;
 425
 426   Double_t det=r00*r11 - r01*r01;
 427   if (TMath::Abs(det) < 1.e-10) {
 428     //Int_t n=GetNumberOfClusters();
 429     //if (n>4) cerr<<n<<" AliKalmanTrack warning: Singular matrix !\n";
 430     return 1e10;
 431   }
 432   Double_t tmp=r00; r00=r11; r11=tmp; r01=-r01;
 433
 434   Double_t dy=c->GetY() - fP0, dz=c->GetZ() - fP1;
 435
 436   return (dy*r00*dy + 2*r01*dy*dz + dz*r11*dz)/det;
 437 }
 438
 439
 440 //_________________________________________________________________________________________
 441
 442
 443 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
 444   //-----------------------------------------------------------------
 445   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
 446   //-----------------------------------------------------------------
 447   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
 448
 449   if (fSort == 0){
 450     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
 451     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
 452     Double_t z2 = t->GetZ();
 453     Double_t z1 = GetZ();
 454     if (z2>z1) return 1;
 455     if (z2<z1) return -1;
 456     return 0;
 457   }
 458   else {
 459     Float_t f2 =1;
 460     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->fC44)/(TMath::Abs(t->GetC())+0.0066);
 461     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
 462
 463     Float_t f1 =1;
 464     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(fC44)/(TMath::Abs(GetC())+0.0066);
 465
 466     if (fBConstrain)   f1=1.2;
 467
 468     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
 469     else return +1;
 470   }
 471 }
 472
 473
 474
 475
 476 //_____________________________________________________________________________
 477 Int_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, UInt_t /*index*/) {
 478   //-----------------------------------------------------------------
 479   // This function associates a cluster with this track.
 480   //-----------------------------------------------------------------
 481   Double_t r00=fErrorY2, r01=0., r11=fErrorZ2;
 482
 483   r00+=fC00; r01+=fC10; r11+=fC11;
 484   Double_t det=r00*r11 - r01*r01;
 485   Double_t tmp=r00; r00=r11/det; r11=tmp/det; r01=-r01/det;
 486
 487   Double_t k00=fC00*r00+fC10*r01, k01=fC00*r01+fC10*r11;
 488   Double_t k10=fC10*r00+fC11*r01, k11=fC10*r01+fC11*r11;
 489   Double_t k20=fC20*r00+fC21*r01, k21=fC20*r01+fC21*r11;
 490   Double_t k30=fC30*r00+fC31*r01, k31=fC30*r01+fC31*r11;
 491   Double_t k40=fC40*r00+fC41*r01, k41=fC40*r01+fC41*r11;
 492
 493   Double_t dy=c->GetY() - fP0, dz=c->GetZ() - fP1;
 494   Double_t cur=fP4 + k40*dy + k41*dz, eta=fP2 + k20*dy + k21*dz;
 495   if (TMath::Abs(cur*fX-eta) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {
 496     return 0;
 497   }
 498
 499   fP0 += k00*dy + k01*dz;
 500   fP1 += k10*dy + k11*dz;
 501   fP2  = eta;
 502   fP3 += k30*dy + k31*dz;
 503   fP4  = cur;
 504
 505   Double_t c01=fC10, c02=fC20, c03=fC30, c04=fC40;
 506   Double_t c12=fC21, c13=fC31, c14=fC41;
 507
 508   fC00-=k00*fC00+k01*fC10; fC10-=k00*c01+k01*fC11;
 509   fC20-=k00*c02+k01*c12;   fC30-=k00*c03+k01*c13;
 510   fC40-=k00*c04+k01*c14;
 511
 512   fC11-=k10*c01+k11*fC11;
 513   fC21-=k10*c02+k11*c12;   fC31-=k10*c03+k11*c13;
 514   fC41-=k10*c04+k11*c14;
 515
 516   fC22-=k20*c02+k21*c12;   fC32-=k20*c03+k21*c13;
 517   fC42-=k20*c04+k21*c14;
 518
 519   fC33-=k30*c03+k31*c13;
 520   fC43-=k40*c03+k41*c13;
 521
 522   fC44-=k40*c04+k41*c14;
 523
 524   Int_t n=GetNumberOfClusters();
 525   //  fIndex[n]=index;
 526   SetNumberOfClusters(n+1);
 527   SetChi2(GetChi2()+chisq);
 528
 529   return 1;
 530 }
 531
 532
 533
 534 //_____________________________________________________________________________
 535 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t onlyused) {
 536   //-----------------------------------------------------------------
 537   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 538   //-----------------------------------------------------------------
 539
 540   Float_t amp[200];
 541   Float_t angular[200];
 542   Float_t weight[200];
 543   Int_t index[200];
 544   //Int_t nc = 0;
 545   //  TClonesArray & arr = *fPoints;
 546   Float_t meanlog = 100.;
 547
 548   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 549   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 550   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 551   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 552   //
 553   //
 554   fNShared =0;
 555
 556   for (Int_t of =0; of<4; of++){
 557     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
 558       {
 559         Int_t index = fIndex[i];
 560         if (index<0||index&0x8000) continue;
 561
 562         //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
 563         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
 564         //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
 565         //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
 566         //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
 567
 568         if (point==0) continue;
 569         AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
 570         if (cl==0) continue;
 571         if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
 572         if (cl->IsUsed(11)) {
 573           fNShared++;
 574           continue;
 575         }
 576         Int_t   type   = cl->GetType();
 577         //if (point->fIsShared){
 578         //  fNShared++;
 579         //  continue;
 580         //}
 581         //if (pointm)
 582         //  if (pointm->fIsShared) continue;
 583         //if (pointp)
 584         //  if (pointp->fIsShared) continue;
 585
 586         if (type<0) continue;
 587         //if (type>10) continue;
 588         //if (point->GetErrY()==0) continue;
 589         //if (point->GetErrZ()==0) continue;
 590
 591         //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
 592         //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
 593         //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue;
 594
 595
 596         //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 597         if (cl->GetMax()<5) continue;
 598         Float_t angley = point->GetAngleY();
 599         Float_t anglez = point->GetAngleZ();
 600
 601         Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
 602         Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
 603         /*
 604         Float_t ns = 1.;
 605         if (pointm){
 606           rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
 607           rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
 608           ns+=1.;
 609         }
 610         if (pointp){
 611           rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
 612           rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
 613           ns+=1.;
 614         }
 615         rsigmay/=ns;
 616         rsigmaz/=ns;
 617         */
 618
 619         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
 620
 621         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 622         if (i>64){
 623           //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
 624           ampc = 1.*cl->GetMax();
 625           //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();
 626           //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 627           //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
 628           // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 629           //Float_t dz =
 630           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 631           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 632           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 633           //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 634           //ampc               *=zfactor;
 635         }
 636         else{
 637           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax();
 638           ampc = 1.0*cl->GetMax();
 639           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ();
 640           //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 641           // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
 642           //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 643           //Float_t dz =
 644           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 645
 646           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 647           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 648           //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 649           //ampc               *=zfactor;
 650
 651         }
 652         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 653         //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
 654         Float_t w      =  1.;
 655         //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5);
 656         //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
 657         if (i<64) {
 658           ampc /= 0.6;
 659           //ampc /= (1+0.0008*z);
 660         } else
 661           if (i>128){
 662             ampc /=1.5;
 663             //ampc /= (1+0.0008*z);
 664           }else{
 665             //ampc /= (1+0.0008*z);
 666           }
 667
 668         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 669           // w*= 2.;
 670
 671           continue;
 672         }
 673         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 674         amp[nc[of]]        = ampc;
 675         angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 676         weight[nc[of]]     = w;
 677         nc[of]++;
 678       }
 679
 680     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
 681     Float_t sumamp=0;
 682     Float_t sumamp2=0;
 683     Float_t sumw=0;
 684     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
 685     meanlog = 50;
 686     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
 687       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
 688       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 689       //
 690       sumw    += weight[index[i]];
 691       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
 692       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
 693       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
 694     }
 695     if (sumw<1){
 696       SetdEdx(0);
 697     }
 698     else {
 699       norm[of] /= sumw;
 700       mean[of]  = sumamp/sumw;
 701       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 702       if (sigma[of]>0.1)
 703         sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 704       else
 705         sigma[of] = 1000;
 706
 707     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 708     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
 709     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
 710     }
 711   }
 712
 713   Float_t dedx =0;
 714   fSdEdx =0;
 715   fMAngular =0;
 716   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
 717   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
 718
 719
 720   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/
 721   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
 722
 723   Int_t norm2 = 0;
 724   Int_t norm3 = 0;
 725   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 726     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 727       dedx      += mean[i] *nc[i];
 728       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
 729       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 730       norm2     += nc[i];
 731       norm3     += nc[i]-2;
 732     }
 733     fDEDX[i]  = mean[i];
 734     fSDEDX[i] = sigma[i];
 735     fNCDEDX[i]= nc[i];
 736   }
 737
 738   if (norm3>0){
 739     dedx   /=norm2;
 740     fSdEdx /=norm3;
 741     fMAngular/=norm2;
 742   }
 743   else{
 744     SetdEdx(0);
 745     return 0;
 746   }
 747   //  Float_t dedx1 =dedx;
 748   /*
 749   dedx =0;
 750   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 751     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 752       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 753       dedx      += mean[i] *nc[i];
 754     }
 755     fDEDX[i]  = mean[i];
 756   }
 757   dedx /= norm2;
 758   */
 759
 760
 761   SetdEdx(dedx);
 762   return dedx;
 763 }
 764 Double_t AliTPCseed::Bethe(Double_t bg){
 765   //
 766   // This is the Bethe-Bloch function normalised to 1 at the minimum
 767   //
 768   Double_t bg2=bg*bg;
 769   Double_t bethe;
 770   if (bg<3.5e1)
 771     bethe=(1.+ bg2)/bg2*(log(5940*bg2) - bg2/(1.+ bg2));
 772   else // Density effect ( approximately :)
 773     bethe=1.15*(1.+ bg2)/bg2*(log(3.5*5940*bg) - bg2/(1.+ bg2));
 774   return bethe/11.091;
 775 }
 776
 777 void AliTPCseed::CookPID()
 778 {
 779   //
 780   // cook PID information according dEdx
 781   //
 782   Double_t fRange = 10.;
 783   Double_t fRes   = 0.1;
 784   Double_t fMIP   = 47.;
 785   //
 786   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
 787   Double_t sumr =0;
 788   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 789     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
 790     Double_t mom=P();
 791     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
 792     Double_t bethe=Bethe(mom/mass);
 793     Double_t sigma=fRes*bethe;
 794     if (sigma>0.001){
 795       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
 796         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
 797         sumr+=fTPCr[j];
 798         continue;
 799       }
 800       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
 801       sumr+=fTPCr[j];
 802     }
 803     else{
 804       fTPCr[j]=1.;
 805       sumr+=fTPCr[j];
 806     }
 807   }
 808   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 809     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
 810   }
 811 }
 812
 813 /*
 814 void AliTPCseed::CookdEdx2(Double_t low, Double_t up) {
 815   //-----------------------------------------------------------------
 816   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 817   //-----------------------------------------------------------------
 818
 819   Float_t amp[200];
 820   Float_t angular[200];
 821   Float_t weight[200];
 822   Int_t index[200];
 823   Bool_t inlimit[200];
 824   for (Int_t i=0;i<200;i++) inlimit[i]=kFALSE;
 825   for (Int_t i=0;i<200;i++) amp[i]=10000;
 826   for (Int_t i=0;i<200;i++) angular[i]= 1;;
 827
 828
 829   //
 830   Float_t meanlog = 100.;
 831   Int_t indexde[4]={0,64,128,160};
 832
 833   Float_t amean     =0;
 834   Float_t asigma    =0;
 835   Float_t anc       =0;
 836   Float_t anorm     =0;
 837
 838   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 839   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 840   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 841   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 842   //
 843   //
 844   fNShared =0;
 845
 846   //  for (Int_t of =0; of<3; of++){
 847   //  for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
 848   for (Int_t i =0; i<160;i++)
 849     {
 850         AliTPCTrackPoint * point = GetTrackPoint(i);
 851         if (point==0) continue;
 852         if (point->fIsShared){
 853           fNShared++;
 854           continue;
 855         }
 856         Int_t   type   = point->GetCPoint().GetType();
 857         if (type<0) continue;
 858         if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 859         Float_t angley = point->GetTPoint().GetAngleY();
 860         Float_t anglez = point->GetTPoint().GetAngleZ();
 861         Float_t rsigmay =  point->GetCPoint().GetSigmaY();
 862         Float_t rsigmaz =  point->GetCPoint().GetSigmaZ();
 863         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay*rsigmaz);
 864
 865         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 866         if (i>64){
 867           ampc =  point->GetCPoint().GetMax();
 868         }
 869         else{
 870           ampc = point->GetCPoint().GetMax();
 871         }
 872         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 873         //      ampc *= 0.565;     // put mean value to channel 50
 874
 875         Float_t w      =  1.;
 876         Float_t z = TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ());
 877         if (i<64) {
 878           ampc /= 0.63;
 879         } else
 880           if (i>128){
 881             ampc /=1.51;
 882           }
 883         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 884           continue;
 885         }
 886         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 887         angular[i]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 888         amp[i]        = ampc/angular[i];
 889         weight[i]     = w;
 890         anc++;
 891     }
 892
 893   TMath::Sort(159,amp,index,kFALSE);
 894   for (Int_t i=int(anc*low+0.5);i<int(anc*up+0.5);i++){
 895     inlimit[index[i]] = kTRUE;  // take all clusters
 896   }
 897
 898   //  meanlog = amp[index[Int_t(anc*0.3)]];
 899   meanlog =10000.;
 900   for (Int_t of =0; of<3; of++){
 901     Float_t sumamp=0;
 902     Float_t sumamp2=0;
 903     Float_t sumw=0;
 904    for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
 905       {
 906         if (inlimit[i]==kFALSE) continue;
 907         Float_t ampl      = amp[i];
 908         ///angular[i];
 909         ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 910         //
 911         sumw    += weight[i];
 912         sumamp  += weight[i]*ampl;
 913         sumamp2 += weight[i]*ampl*ampl;
 914         norm[of]    += angular[i]*weight[i];
 915         nc[of]++;
 916       }
 917    if (sumw<1){
 918      SetdEdx(0);
 919    }
 920    else {
 921      norm[of] /= sumw;
 922      mean[of]  = sumamp/sumw;
 923      sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 924      if (sigma[of]>0.1)
 925        sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 926      else
 927        sigma[of] = 1000;
 928      mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 929    }
 930   }
 931
 932   Float_t dedx =0;
 933   fSdEdx =0;
 934   fMAngular =0;
 935   //
 936   Int_t norm2 = 0;
 937   Int_t norm3 = 0;
 938   Float_t www[3] = {12.,14.,17.};
 939   //Float_t www[3] = {1.,1.,1.};
 940
 941   for (Int_t i =0;i<3;i++){
 942     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 943       dedx      += mean[i] *nc[i]*www[i]/sigma[i];
 944       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
 945       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 946       norm2     += nc[i]*www[i]/sigma[i];
 947       norm3     += (nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
 948     }
 949     fDEDX[i]  = mean[i];
 950     fSDEDX[i] = sigma[i];
 951     fNCDEDX[i]= nc[i];
 952   }
 953
 954   if (norm3>0){
 955     dedx   /=norm2;
 956     fSdEdx /=norm3;
 957     fMAngular/=norm2;
 958   }
 959   else{
 960     SetdEdx(0);
 961     return;
 962   }
 963   //  Float_t dedx1 =dedx;
 964
 965   dedx =0;
 966   Float_t norm4 = 0;
 967   for (Int_t i =0;i<3;i++){
 968     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000&&sigma[i]>3){
 969       //mean[i]   = mean[i]*(1+0.08*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 970       dedx      += mean[i] *(nc[i])/(sigma[i]);
 971       norm4     += (nc[i])/(sigma[i]);
 972     }
 973     fDEDX[i]  = mean[i];
 974   }
 975   if (norm4>0) dedx /= norm4;
 976
 977
 978
 979   SetdEdx(dedx);
 980
 981   //mi deDX
 982
 983 }
 984 */