TRD/AliTRDseedV1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2 * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3 *                                                                        *
   4 * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5 * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6 *                                                                        *
   7 * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8 * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9 * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10 * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11 * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12 * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13 * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id: AliTRDseedV1.cxx 60233 2013-01-10 09:04:08Z abercuci $ */
  17
  18 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  19 ////
  20 //  The TRD offline tracklet
  21 //
  22 // The running horse of the TRD reconstruction. The following tasks are preformed:
  23 //   1. Clusters attachment to tracks based on prior information stored at tracklet level (see AttachClusters)
  24 //   2. Clusters position recalculation based on track information (see GetClusterXY and Fit)
  25 //   3. Cluster error parametrization recalculation (see Fit)
  26 //   4. Linear track approximation (Fit)
  27 //   5. Optimal position (including z estimate for pad row cross tracklets) and covariance matrix of the track fit inside one TRD chamber (Fit)
  28 //   6. Tilt pad correction and systematic effects (GetCovAt)
  29 //   7. dEdx calculation (CookdEdx)
  30 //   8. PID probabilities estimation (CookPID)
  31 //
  32 //  Authors:                                                              //
  33 //    Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>                                     //
  34 //    Markus Fasel <M.Fasel@gsi.de>                                       //
  35 //                                                                        //
  36 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  37
  38 #include "TMath.h"
  39 #include "TGeoManager.h"
  40 #include "TTreeStream.h"
  41 #include "TGraphErrors.h"
  42
  43 #include "AliLog.h"
  44 #include "AliMathBase.h"
  45 #include "AliRieman.h"
  46 #include "AliCDBManager.h"
  47
  48 #include "AliTRDReconstructor.h"
  49 #include "AliTRDpadPlane.h"
  50 #include "AliTRDtransform.h"
  51 #include "AliTRDcluster.h"
  52 #include "AliTRDseedV1.h"
  53 #include "AliTRDtrackV1.h"
  54 #include "AliTRDcalibDB.h"
  55 #include "AliTRDchamberTimeBin.h"
  56 #include "AliTRDtrackingChamber.h"
  57 #include "AliTRDtrackerV1.h"
  58 #include "AliTRDrecoParam.h"
  59 #include "AliTRDCommonParam.h"
  60 #include "AliTRDtrackletOflHelper.h"
  61
  62 #include "Cal/AliTRDCalTrkAttach.h"
  63 #include "Cal/AliTRDCalPID.h"
  64 #include "Cal/AliTRDCalROC.h"
  65 #include "Cal/AliTRDCalDet.h"
  66
  67 class AliTracker;
  68
  69 ClassImp(AliTRDseedV1)
  70
  71 //____________________________________________________________________
  72 AliTRDseedV1::AliTRDseedV1(Int_t det)
  73   :AliTRDtrackletBase()
  74   ,fkReconstructor(NULL)
  75   ,fClusterIter(NULL)
  76   ,fExB(0.)
  77   ,fVD(0.)
  78   ,fT0(0.)
  79   ,fS2PRF(0.)
  80   ,fDiffL(0.)
  81   ,fDiffT(0.)
  82   ,fClusterIdx(0)
  83   ,fErrorMsg(0)
  84   ,fN(0)
  85   ,fDet(det)
  86   ,fPt(0.)
  87   ,fdX(0.)
  88   ,fX0(0.)
  89   ,fX(0.)
  90   ,fY(0.)
  91   ,fZ(0.)
  92   ,fS2Y(0.)
  93   ,fS2Z(0.)
  94   ,fChi2(0.)
  95 {
  96   //
  97   // Constructor
  98   //
  99   memset(fIndexes,0xFF,kNclusters*sizeof(fIndexes[0]));
 100   memset(fClusters, 0, kNclusters*sizeof(AliTRDcluster*));
 101   memset(fPad, 0, 4*sizeof(Float_t));
 102   fYref[0] = 0.; fYref[1] = 0.;
 103   fZref[0] = 0.; fZref[1] = 0.;
 104   fYfit[0] = 0.; fYfit[1] = 0.;
 105   fZfit[0] = 0.; fZfit[1] = 0.;
 106   memset(fdEdx, 0, kNdEdxSlices*sizeof(Float_t));
 107   for(int ispec=0; ispec<AliPID::kSPECIES; ispec++) fProb[ispec]  = -1.;
 108   fLabels[0]=-1; fLabels[1]=-1; // most freq MC labels
 109   fLabels[2]=0;  // number of different labels for tracklet
 110   memset(fRefCov, 0, 7*sizeof(Double_t));
 111   // stand alone curvature
 112   fC[0] = 0.; fC[1] = 0.;
 113   // covariance matrix [diagonal]
 114   // default sy = 200um and sz = 2.3 cm
 115   fCov[0] = 4.e-4; fCov[1] = 0.; fCov[2] = 5.3;
 116   SetStandAlone(kFALSE);
 117 }
 118
 119 //____________________________________________________________________
 120 AliTRDseedV1::AliTRDseedV1(const AliTRDseedV1 &ref)
 121   :AliTRDtrackletBase((AliTRDtrackletBase&)ref)
 122   ,fkReconstructor(NULL)
 123   ,fClusterIter(NULL)
 124   ,fExB(0.)
 125   ,fVD(0.)
 126   ,fT0(0.)
 127   ,fS2PRF(0.)
 128   ,fDiffL(0.)
 129   ,fDiffT(0.)
 130   ,fClusterIdx(0)
 131   ,fErrorMsg(0)
 132   ,fN(0)
 133   ,fDet(-1)
 134   ,fPt(0.)
 135   ,fdX(0.)
 136   ,fX0(0.)
 137   ,fX(0.)
 138   ,fY(0.)
 139   ,fZ(0.)
 140   ,fS2Y(0.)
 141   ,fS2Z(0.)
 142   ,fChi2(0.)
 143 {
 144   //
 145   // Copy Constructor performing a deep copy
 146   //
 147   if(this != &ref){
 148     ref.Copy(*this);
 149   }
 150   SetBit(kOwner, kFALSE);
 151   SetStandAlone(ref.IsStandAlone());
 152 }
 153
 154
 155 //____________________________________________________________________
 156 AliTRDseedV1& AliTRDseedV1::operator=(const AliTRDseedV1 &ref)
 157 {
 158   //
 159   // Assignment Operator using the copy function
 160   //
 161
 162   if(this != &ref){
 163     ref.Copy(*this);
 164   }
 165   SetBit(kOwner, kFALSE);
 166
 167   return *this;
 168 }
 169
 170 //____________________________________________________________________
 171 AliTRDseedV1::~AliTRDseedV1()
 172 {
 173   //
 174   // Destructor. The RecoParam object belongs to the underlying tracker.
 175   //
 176
 177   //printf("I-AliTRDseedV1::~AliTRDseedV1() : Owner[%s]\n", IsOwner()?"YES":"NO");
 178
 179   if(IsOwner()) {
 180     for(int itb=0; itb<kNclusters; itb++){
 181       if(!fClusters[itb]) continue;
 182       //AliInfo(Form("deleting c %p @ %d", fClusters[itb], itb));
 183       delete fClusters[itb];
 184       fClusters[itb] = NULL;
 185     }
 186   }
 187 }
 188
 189 //____________________________________________________________________
 190 void AliTRDseedV1::Copy(TObject &ref) const
 191 {
 192   //
 193   // Copy function
 194   //
 195
 196   //AliInfo("");
 197   AliTRDseedV1 &target = (AliTRDseedV1 &)ref;
 198
 199   target.fkReconstructor = fkReconstructor;
 200   target.fClusterIter   = NULL;
 201   target.fExB           = fExB;
 202   target.fVD            = fVD;
 203   target.fT0            = fT0;
 204   target.fS2PRF         = fS2PRF;
 205   target.fDiffL         = fDiffL;
 206   target.fDiffT         = fDiffT;
 207   target.fClusterIdx    = 0;
 208   target.fErrorMsg      = fErrorMsg;
 209   target.fN             = fN;
 210   target.fDet           = fDet;
 211   target.fPt            = fPt;
 212   target.fdX            = fdX;
 213   target.fX0            = fX0;
 214   target.fX             = fX;
 215   target.fY             = fY;
 216   target.fZ             = fZ;
 217   target.fS2Y           = fS2Y;
 218   target.fS2Z           = fS2Z;
 219   target.fChi2          = fChi2;
 220
 221   memcpy(target.fIndexes, fIndexes, kNclusters*sizeof(Int_t));
 222   memcpy(target.fClusters, fClusters, kNclusters*sizeof(AliTRDcluster*));
 223   memcpy(target.fPad, fPad, 4*sizeof(Float_t));
 224   target.fYref[0] = fYref[0]; target.fYref[1] = fYref[1];
 225   target.fZref[0] = fZref[0]; target.fZref[1] = fZref[1];
 226   target.fYfit[0] = fYfit[0]; target.fYfit[1] = fYfit[1];
 227   target.fZfit[0] = fZfit[0]; target.fZfit[1] = fZfit[1];
 228   memcpy(target.fdEdx, fdEdx, kNdEdxSlices*sizeof(Float_t));
 229   memcpy(target.fProb, fProb, AliPID::kSPECIES*sizeof(Float_t));
 230   memcpy(target.fLabels, fLabels, 3*sizeof(Int_t));
 231   memcpy(target.fRefCov, fRefCov, 7*sizeof(Double_t));
 232   target.fC[0] = fC[0]; target.fC[1] = fC[1];
 233   memcpy(target.fCov, fCov, 3*sizeof(Double_t));
 234
 235   TObject::Copy(ref);
 236 }
 237
 238
 239 //____________________________________________________________
 240 void AliTRDseedV1::Init(const AliRieman *rieman)
 241 {
 242 // Initialize this tracklet using the riemann fit information
 243
 244
 245   fZref[0] = rieman->GetZat(fX0);
 246   fZref[1] = rieman->GetDZat(fX0);
 247   fYref[0] = rieman->GetYat(fX0);
 248   fYref[1] = rieman->GetDYat(fX0);
 249   if(fkReconstructor && fkReconstructor->IsHLT()){
 250     fRefCov[0] = 1;
 251     fRefCov[2] = 10;
 252   }else{
 253     fRefCov[0] = rieman->GetErrY(fX0);
 254     fRefCov[2] = rieman->GetErrZ(fX0);
 255   }
 256   fC[0]    = rieman->GetC();
 257   fChi2    = rieman->GetChi2();
 258 }
 259
 260
 261 //____________________________________________________________
 262 Bool_t AliTRDseedV1::Init(const AliTRDtrackV1 *track)
 263 {
 264 // Initialize this tracklet using the track information
 265 //
 266 // Parameters:
 267 //   track - the TRD track used to initialize the tracklet
 268 //
 269 // Detailed description
 270 // The function sets the starting point and direction of the
 271 // tracklet according to the information from the TRD track.
 272 //
 273 // Caution
 274 // The TRD track has to be propagated to the beginning of the
 275 // chamber where the tracklet will be constructed
 276 //
 277
 278   Double_t y, z;
 279   if(!track->GetProlongation(fX0, y, z)) return kFALSE;
 280   Update(track);
 281   return kTRUE;
 282 }
 283
 284
 285 //_____________________________________________________________________________
 286 void AliTRDseedV1::Reset(Option_t *opt)
 287 {
 288 //
 289 // Reset seed. If option opt="c" is given only cluster arrays are cleared.
 290 //
 291   for(Int_t ic=kNclusters; ic--;) fIndexes[ic] = -1;
 292   memset(fClusters, 0, kNclusters*sizeof(AliTRDcluster*));
 293   fN=0; SetBit(kRowCross, kFALSE);
 294   if(strcmp(opt, "c")==0) return;
 295
 296   fExB=0.;fVD=0.;fT0=0.;fS2PRF=0.;
 297   fDiffL=0.;fDiffT=0.;
 298   fClusterIdx=0;
 299   fErrorMsg = 0;
 300   fDet=-1;
 301   fPt=0.;
 302   fdX=0.;fX0=0.; fX=0.; fY=0.; fZ=0.;
 303   fS2Y=0.; fS2Z=0.;
 304   fC[0]=0.; fC[1]=0.;
 305   fChi2 = 0.;
 306
 307   memset(fPad, 0, 4*sizeof(Float_t));
 308   fYref[0] = 0.; fYref[1] = 0.;
 309   fZref[0] = 0.; fZref[1] = 0.;
 310   fYfit[0] = 0.; fYfit[1] = 0.;
 311   fZfit[0] = 0.; fZfit[1] = 0.;
 312   memset(fdEdx, 0, kNdEdxSlices*sizeof(Float_t));
 313   for(int ispec=0; ispec<AliPID::kSPECIES; ispec++) fProb[ispec]  = -1.;
 314   fLabels[0]=-1; fLabels[1]=-1; // most freq MC labels
 315   fLabels[2]=0;  // number of different labels for tracklet
 316   memset(fRefCov, 0, 7*sizeof(Double_t));
 317   // covariance matrix [diagonal]
 318   // default sy = 200um and sz = 2.3 cm
 319   fCov[0] = 4.e-4; fCov[1] = 0.; fCov[2] = 5.3;
 320 }
 321
 322 //____________________________________________________________________
 323 void AliTRDseedV1::Update(const AliTRDtrackV1 *trk)
 324 {
 325   // update tracklet reference position from the TRD track
 326
 327   Double_t fSnp = trk->GetSnp();
 328   Double_t fTgl = trk->GetTgl();
 329   fPt = trk->Pt();
 330   Double_t norm =1./TMath::Sqrt((1.-fSnp)*(1.+fSnp));
 331   fYref[1] = fSnp*norm;
 332   fZref[1] = fTgl*norm;
 333   SetCovRef(trk->GetCovariance());
 334
 335   Double_t dx = trk->GetX() - fX0;
 336   fYref[0] = trk->GetY() - dx*fYref[1];
 337   fZref[0] = trk->GetZ() - dx*fZref[1];
 338 }
 339
 340 //_____________________________________________________________________________
 341 void AliTRDseedV1::UpdateUsed()
 342 {
 343   //
 344   // Calculate number of used clusers in the tracklet
 345   //
 346
 347   Int_t nused = 0, nshared = 0;
 348   for (Int_t i = kNclusters; i--; ) {
 349     if (!fClusters[i]) continue;
 350     if(fClusters[i]->IsUsed()){
 351       nused++;
 352     } else if(fClusters[i]->IsShared()){
 353       if(IsStandAlone()) nused++;
 354       else nshared++;
 355     }
 356   }
 357   SetNUsed(nused);
 358   SetNShared(nshared);
 359 }
 360
 361 //_____________________________________________________________________________
 362 void AliTRDseedV1::UseClusters()
 363 {
 364   //
 365   // Use clusters
 366   //
 367   // In stand alone mode:
 368   // Clusters which are marked as used or shared from another track are
 369   // removed from the tracklet
 370   //
 371   // In barrel mode:
 372   // - Clusters which are used by another track become shared
 373   // - Clusters which are attached to a kink track become shared
 374   //
 375   AliTRDcluster **c = &fClusters[0];
 376   for (Int_t ic=kNclusters; ic--; c++) {
 377     if(!(*c)) continue;
 378     if(IsStandAlone()){
 379       if((*c)->IsShared() || (*c)->IsUsed()){
 380         if((*c)->IsShared()) SetNShared(GetNShared()-1);
 381         else SetNUsed(GetNUsed()-1);
 382         (*c) = NULL;
 383         fIndexes[ic] = -1;
 384         SetN(GetN()-1);
 385         continue;
 386       }
 387     } else {
 388       if((*c)->IsUsed() || IsKink()){
 389         (*c)->SetShared();
 390         continue;
 391       }
 392     }
 393     (*c)->Use();
 394   }
 395 }
 396
 397
 398
 399 //____________________________________________________________________
 400 void AliTRDseedV1::CookdEdx(Int_t nslices)
 401 {
 402 // Calculates average dE/dx for all slices and store them in the internal array fdEdx.
 403 //
 404 // Parameters:
 405 //  nslices : number of slices for which dE/dx should be calculated
 406 // Output:
 407 //  store results in the internal array fdEdx. This can be accessed with the method
 408 //  AliTRDseedV1::GetdEdx()
 409 //
 410 // Detailed description
 411 // Calculates average dE/dx for all slices. Depending on the PID methode
 412 // the number of slices can be 3 (LQ) or 8(NN).
 413 // The calculation of dQ/dl are done using the tracklet fit results (see AliTRDseedV1::GetdQdl(Int_t))
 414 //
 415 // The following effects are included in the calculation:
 416 // 1. calibration values for t0 and vdrift (using x coordinate to calculate slice)
 417 // 2. cluster sharing (optional see AliTRDrecoParam::SetClusterSharing())
 418 // 3. cluster size
 419 //
 420
 421   memset(fdEdx, 0, kNdEdxSlices*sizeof(Float_t));
 422   const Double_t kDriftLength = (.5 * AliTRDgeometry::AmThick() + AliTRDgeometry::DrThick());
 423
 424   AliTRDcluster *c(NULL);
 425   for(int ic=0; ic<AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); ic++){
 426     if(!(c = fClusters[ic]) && !(c = fClusters[ic+kNtb])) continue;
 427     Float_t dx = TMath::Abs(fX0 - c->GetX());
 428
 429     // Filter clusters for dE/dx calculation
 430
 431     // 1.consider calibration effects for slice determination
 432     Int_t slice;
 433     if(dx<kDriftLength){ // TODO should be replaced by c->IsInChamber()
 434       slice = Int_t(dx * nslices / kDriftLength);
 435     } else slice = c->GetX() < fX0 ? nslices-1 : 0;
 436
 437
 438     // 2. take sharing into account
 439     Float_t w = /*c->IsShared() ? .5 :*/ 1.;
 440
 441     // 3. take into account large clusters TODO
 442     //w *= c->GetNPads() > 3 ? .8 : 1.;
 443
 444     //CHECK !!!
 445     fdEdx[slice]   += w * GetdQdl(ic); //fdQdl[ic];
 446   } // End of loop over clusters
 447 }
 448
 449 //_____________________________________________________________________________
 450 void AliTRDseedV1::CookLabels()
 451 {
 452   //
 453   // Cook 2 labels for seed
 454   //
 455
 456   Int_t labels[200];
 457   Int_t out[200];
 458   Int_t nlab = 0;
 459   for (Int_t i = 0; i < kNclusters; i++) {
 460     if (!fClusters[i]) continue;
 461     for (Int_t ilab = 0; ilab < 3; ilab++) {
 462       if (fClusters[i]->GetLabel(ilab) >= 0) {
 463         labels[nlab] = fClusters[i]->GetLabel(ilab);
 464         nlab++;
 465       }
 466     }
 467   }
 468
 469   fLabels[2] = AliMathBase::Freq(nlab,labels,out,kTRUE);
 470   fLabels[0] = out[0];
 471   if ((fLabels[2]  > 1) && (out[3] > 1)) fLabels[1] = out[2];
 472 }
 473
 474 //____________________________________________________________
 475 Float_t AliTRDseedV1::GetAnodeWireOffset(Float_t zt)
 476 {
 477 // Find position inside the amplification cell for reading drift velocity map
 478
 479   Float_t d = fPad[3] - zt;
 480   if(d<0.){
 481     AliError(Form("Fail AnodeWireOffset calculation z0[%+7.2f] zt[%+7.2f] d[%+7.2f].", fPad[3], zt, d));
 482     return 0.125;
 483   }
 484   d -= ((Int_t)(2 * d)) / 2.0;
 485   if(d > 0.25) d = 0.5 - d;
 486   return d;
 487 }
 488
 489
 490 //____________________________________________________________________
 491 Float_t AliTRDseedV1::GetCharge(Bool_t useOutliers) const
 492 {
 493 // Computes total charge attached to tracklet. If "useOutliers" is set clusters
 494 // which are not in chamber are also used (default false)
 495
 496   AliTRDcluster *c(NULL); Float_t qt(0.);
 497   for(int ic=0; ic<kNclusters; ic++){
 498     if(!(c=fClusters[ic])) continue;
 499     if(!c->IsInChamber() && !useOutliers) continue;
 500     qt += TMath::Abs(c->GetQ());
 501   }
 502   return qt;
 503 }
 504
 505 //____________________________________________________________________
 506 Int_t AliTRDseedV1::GetChargeGaps(Float_t sz[kNtb], Float_t pos[kNtb], Int_t isz[kNtb]) const
 507 {
 508 // Find number, size and position of charge gaps (consecutive missing time bins).
 509 // Returns the number of gaps and fills their size in input array "sz" and position in array "pos"
 510
 511   Bool_t gap(kFALSE);
 512   Int_t n(0);
 513   Int_t ipos[kNtb]; memset(isz, 0, kNtb*sizeof(Int_t));memset(ipos, 0, kNtb*sizeof(Int_t));
 514   for(int ic(0); ic<kNtb; ic++){
 515     if(fClusters[ic] || fClusters[ic+kNtb]){
 516       if(gap) n++;
 517       continue;
 518     }
 519     gap = kTRUE;
 520     isz[n]++;
 521     ipos[n] = ic;
 522   }
 523   if(!n) return 0;
 524
 525   // write calibrated values
 526   AliTRDcluster fake;
 527   for(Int_t igap(0); igap<n; igap++){
 528     sz[igap] = isz[igap]*fVD/AliTRDCommonParam::Instance()->GetSamplingFrequency();
 529     fake.SetPadTime(ipos[igap]);
 530     pos[igap] = fake.GetXloc(fT0, fVD);
 531     if(isz[igap]>1){
 532       fake.SetPadTime(ipos[igap]-isz[igap]+1);
 533       pos[igap] += fake.GetXloc(fT0, fVD);
 534       pos[igap] /= 2.;
 535     }
 536   }
 537   return n;
 538 }
 539
 540
 541 //____________________________________________________________________
 542 Double_t AliTRDseedV1::EstimatedCrossPoint(AliTRDpadPlane *pp)
 543 {
 544 // Algorithm to estimate cross point in the x-z plane for pad row cross tracklets or the z coordinate of pad row without pad row cross in the local chamber coordinates.
 545 // Returns variance of the radial offset from anode wire in case of raw cross or 0 otherwise.
 546
 547   Int_t row[] = {-1, -1};
 548   Double_t zoff(0.5 * (pp->GetRow0() + pp->GetRowEnd())), sx(0.), mean(0.5*pp->GetNrows()-0.5);
 549   AliTRDcluster *c(NULL);
 550   fS2Y = 0.;
 551
 552   if(!IsRowCross()){
 553     for(int ic=0; ic<kNtb; ic++){
 554       if(!(c=fClusters[ic])) continue;
 555       if(!c->IsInChamber()) continue;
 556       row[0]   = c->GetPadRow();
 557       fZfit[0] = Int_t(mean-row[0])*pp->GetLengthIPad() +
 558                  0.5*(mean-row[0]>0.?1.:-1.)*(row[0]>0&&row[0]<pp->GetNrows()-1?pp->GetLengthIPad():pp->GetLengthOPad());
 559       break;
 560     }
 561   } else {
 562     Float_t tbm[2] = {0.}; // mean value of time bin in rows
 563     Int_t tb[kNtb]={0}, //array of time bins from first row
 564           nc[2] = {0},  // no. of clusters in rows
 565           mc(0);  // no. of common clusters
 566     Bool_t w[2] = {kFALSE, kFALSE};   // acceptance flag for rows
 567     // Find radial range for first row
 568     for(int ic(0); ic<kNtb; ic++){
 569       tb[ic]= -1;
 570       if(!(c=fClusters[ic]) || !c->IsInChamber()) continue;
 571       if(row[0]<0) row[0] = c->GetPadRow();
 572       tb[nc[0]++] = ic; tbm[0] += ic;
 573     }
 574     if(nc[0]>2){
 575       tbm[0] /= nc[0];
 576       w[0] = kTRUE;
 577     }
 578     // Find radial range for second row
 579     for(int ic(kNtb), jc(0); ic<kNclusters; ic++, jc++){
 580       if(!(c=fClusters[ic]) || !c->IsInChamber()) continue;
 581       if(row[1]<0) row[1] = c->GetPadRow();
 582       tbm[1] += jc; nc[1]++;
 583       for(Int_t kc(0); kc<nc[0]; kc++)
 584         if(tb[kc]==jc){
 585           tb[kc] += 100; // mark common cluster
 586           mc++;
 587           break;
 588         }
 589     }
 590     if(nc[1]>2){
 591       tbm[1] /= nc[1];
 592       w[1] = kTRUE;
 593     }
 594     //printf("0 : %f[%2d] 1 : %f[%2d] mc[%d]\n", tbm[0], nc[0], tbm[1], nc[1], mc);
 595     if(!w[0] && !w[1]){
 596       AliError("Too few clusters to estimate tracklet.");
 597       return -1;
 598     }
 599     if(!w[0] || !w[1]){
 600       SetBit(kRowCross, kFALSE); // reset RC bit
 601       if(w[1]) row[0] = row[1];
 602       fZfit[0] = Int_t(mean-row[0])*pp->GetLengthIPad() +
 603                  0.5*(mean-row[0]>0.?1.:-1.)*(row[0]>0&&row[0]<pp->GetNrows()-1?pp->GetLengthIPad():pp->GetLengthOPad());
 604     }else{ // find the best matching timebin
 605       fZfit[0] = Int_t(mean-0.5*(row[0]+row[1]))*pp->GetLengthIPad();
 606       Int_t itb(0), dtb(0);
 607       if(!mc) { // no common range
 608         itb = Int_t(0.5*(tbm[0] + tbm[1]));
 609         dtb = Int_t(0.5*TMath::Abs(tbm[0] - tbm[1])); // simple parameterization of the cluster gap
 610       } else {
 611         Double_t rmax(100.); Int_t itbStart(-1), itbStop(0);
 612         // compute distance from
 613         for(Int_t jc(0); jc<nc[0]; jc++){
 614           if(tb[jc] < 100) continue;
 615           Int_t ltb(tb[jc]-100);
 616           Double_t r = (1. - ltb/tbm[0])*(1. - ltb/tbm[1]);
 617           //printf("tb[%2d] dr[%f %f %f] rmax[%f]\n", ltb, r, 1. - ltb/tbm[0], 1. - ltb/tbm[1], rmax);
 618           if(TMath::Abs(r)<rmax){ rmax = TMath::Abs(r); itb = ltb; }
 619           if(itbStart<0) itbStart = ltb;
 620           itbStop = ltb;
 621         }
 622         dtb = itbStop-itbStart+1;
 623       }
 624       AliTRDCommonParam *cp = AliTRDCommonParam::Instance();
 625       Double_t freq(cp?cp->GetSamplingFrequency():10.);
 626       fS2Y = ((itb-0.5)/freq - fT0 - 0.189)*fVD; // xOff
 627       sx   = dtb*0.288675134594812921/freq; sx *= sx; sx += 1.56e-2; sx *= fVD*fVD;
 628     }
 629   }
 630
 631   // estimate dzdx
 632   Float_t dx(fX0-fS2Y);
 633   fZfit[1] = (fZfit[0]+zoff)/dx;
 634
 635   // correct dzdx for the bias
 636   if(!IsRowCross()) fZfit[1] *= 1.09;
 637   else{
 638     // correct dzdx for the bias
 639     fZfit[1] *= 1.05;
 640     if(fZfit[1]<0) fZfit[1] -= 0.012;
 641
 642     // correct x_cross/sigma(x_cross) for the bias in dzdx
 643     fS2Y += 0.14*TMath::Abs(fZfit[1]);
 644     sx   += 2.e-2*GetS2DZDX(fZfit[1]);
 645     // correct sigma(x_cross) for the width of the crossing area
 646     Double_t sxdz = TMath::Abs(fZfit[1])>0.05?(TMath::Exp(-1.58839-TMath::Abs(fZfit[1])*3.24116)):
 647                                               (0.957043   -TMath::Abs(fZfit[1])*12.4597);
 648     sx   += sxdz;
 649
 650     // estimate z and error @ anode wire
 651     fZfit[0] += fZfit[1]*fS2Y;
 652     fS2Z  = fZfit[1]*fZfit[1]*sx+fS2Y*fS2Y*GetS2DZDX(fZfit[1]);
 653   }
 654   return sx;
 655 }
 656
 657 //____________________________________________________________________
 658 Float_t AliTRDseedV1::GetQperTB(Int_t tb) const
 659 {
 660   //
 661   // Charge of the clusters at timebin
 662   //
 663   Float_t q = 0;
 664   if(fClusters[tb] /*&& fClusters[tb]->IsInChamber()*/)
 665     q += TMath::Abs(fClusters[tb]->GetQ());
 666   if(fClusters[tb+kNtb] /*&& fClusters[tb+kNtb]->IsInChamber()*/)
 667     q += TMath::Abs(fClusters[tb+kNtb]->GetQ());
 668   return q/TMath::Sqrt(1. + fYref[1]*fYref[1] + fZref[1]*fZref[1]);
 669 }
 670
 671 //____________________________________________________________________
 672 Float_t AliTRDseedV1::GetdQdl() const
 673 {
 674 // Calculate total charge / tracklet length for 1D PID
 675 //
 676   Float_t Q = GetCharge(kTRUE);
 677   return Q/TMath::Sqrt(1. + fYref[1]*fYref[1] + fZref[1]*fZref[1]);
 678 }
 679
 680 //____________________________________________________________________
 681 Float_t AliTRDseedV1::GetdQdl(Int_t ic, Float_t *dl) const
 682 {
 683 // Using the linear approximation of the track inside one TRD chamber (TRD tracklet)
 684 // the charge per unit length can be written as:
 685 // BEGIN_LATEX
 686 // #frac{dq}{dl} = #frac{q_{c}}{dx * #sqrt{1 + #(){#frac{dy}{dx}}^{2}_{fit} + #(){#frac{dz}{dx}}^{2}_{ref}}}
 687 // END_LATEX
 688 // where qc is the total charge collected in the current time bin and dx is the length
 689 // of the time bin.
 690 // The following correction are applied :
 691 //   - charge : pad row cross corrections
 692 //              [diffusion and TRF assymetry] TODO
 693 //   - dx     : anisochronity, track inclination - see Fit and AliTRDcluster::GetXloc()
 694 //              and AliTRDcluster::GetYloc() for the effects taken into account
 695 //
 696 //Begin_Html
 697 //<img src="TRD/trackletDQDT.gif">
 698 //End_Html
 699 // In the picture the energy loss measured on the tracklet as a function of drift time [left] and respectively
 700 // drift length [right] for different particle species is displayed.
 701 // Author : Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
 702 //
 703   Float_t dq = 0.;
 704   // check whether both clusters are inside the chamber
 705   Bool_t hasClusterInChamber = kFALSE;
 706   if(fClusters[ic] && fClusters[ic]->IsInChamber()){
 707     hasClusterInChamber = kTRUE;
 708     dq += TMath::Abs(fClusters[ic]->GetQ());
 709   }
 710   if(fClusters[ic+kNtb] && fClusters[ic+kNtb]->IsInChamber()){
 711     hasClusterInChamber = kTRUE;
 712     dq += TMath::Abs(fClusters[ic+kNtb]->GetQ());
 713   }
 714   if(!hasClusterInChamber) return 0.;
 715   if(dq<1.e-3) return 0.;
 716
 717   Double_t dx = fdX;
 718   if(ic-1>=0 && ic+1<kNtb){
 719     Float_t x2(0.), x1(0.);
 720     // try to estimate upper radial position (find the cluster which is inside the chamber)
 721     if(fClusters[ic-1] && fClusters[ic-1]->IsInChamber()) x2 = fClusters[ic-1]->GetX();
 722     else if(fClusters[ic-1+kNtb] && fClusters[ic-1+kNtb]->IsInChamber()) x2 = fClusters[ic-1+kNtb]->GetX();
 723     else if(fClusters[ic] && fClusters[ic]->IsInChamber()) x2 = fClusters[ic]->GetX()+fdX;
 724     else x2 = fClusters[ic+kNtb]->GetX()+fdX;
 725     // try to estimate lower radial position (find the cluster which is inside the chamber)
 726     if(fClusters[ic+1] && fClusters[ic+1]->IsInChamber()) x1 = fClusters[ic+1]->GetX();
 727     else if(fClusters[ic+1+kNtb] && fClusters[ic+1+kNtb]->IsInChamber()) x1 = fClusters[ic+1+kNtb]->GetX();
 728     else if(fClusters[ic] && fClusters[ic]->IsInChamber()) x1 = fClusters[ic]->GetX()-fdX;
 729     else x1 = fClusters[ic+kNtb]->GetX()-fdX;
 730
 731     dx = .5*(x2 - x1);
 732   }
 733   dx *= TMath::Sqrt(1. + fYfit[1]*fYfit[1] + fZref[1]*fZref[1]);
 734   if(dl) (*dl) = dx;
 735   if(dx>1.e-9) return dq/dx;
 736   else return 0.;
 737 }
 738
 739 //____________________________________________________________
 740 Float_t AliTRDseedV1::GetMomentum(Float_t *err) const
 741 {
 742 // Returns momentum of the track after update with the current tracklet as:
 743 // BEGIN_LATEX
 744 // p=#frac{1}{1/p_{t}} #sqrt{1+tgl^{2}}
 745 // END_LATEX
 746 // and optionally the momentum error (if err is not null).
 747 // The estimated variance of the momentum is given by:
 748 // BEGIN_LATEX
 749 // #sigma_{p}^{2} = (#frac{dp}{dp_{t}})^{2} #sigma_{p_{t}}^{2}+(#frac{dp}{dtgl})^{2} #sigma_{tgl}^{2}+2#frac{dp}{dp_{t}}#frac{dp}{dtgl} cov(tgl,1/p_{t})
 750 // END_LATEX
 751 // which can be simplified to
 752 // BEGIN_LATEX
 753 // #sigma_{p}^{2} = p^{2}p_{t}^{4}tgl^{2}#sigma_{tgl}^{2}-2p^{2}p_{t}^{3}tgl cov(tgl,1/p_{t})+p^{2}p_{t}^{2}#sigma_{1/p_{t}}^{2}
 754 // END_LATEX
 755 //
 756
 757   Double_t p = fPt*TMath::Sqrt(1.+fZref[1]*fZref[1]);
 758   if(err){
 759     Double_t p2 = p*p;
 760     Double_t tgl2 = fZref[1]*fZref[1];
 761     Double_t pt2 = fPt*fPt;
 762     Double_t s2 =
 763       p2*tgl2*pt2*pt2*fRefCov[4]
 764      -2.*p2*fZref[1]*fPt*pt2*fRefCov[5]
 765      +p2*pt2*fRefCov[6];
 766     (*err) = TMath::Sqrt(s2);
 767   }
 768   return p;
 769 }
 770
 771
 772 //____________________________________________________________________
 773 Int_t AliTRDseedV1::GetTBoccupancy() const
 774 {
 775 // Returns no. of TB occupied by clusters
 776
 777   Int_t n(0);
 778   for(int ic(0); ic<kNtb; ic++){
 779     if(!fClusters[ic] && !fClusters[ic+kNtb]) continue;
 780     n++;
 781   }
 782   return n;
 783 }
 784
 785 //____________________________________________________________________
 786 Int_t AliTRDseedV1::GetTBcross() const
 787 {
 788 // Returns no. of TB occupied by 2 clusters for pad row cross tracklets
 789
 790   if(!IsRowCross()) return 0;
 791   Int_t n(0);
 792   for(int ic(0); ic<kNtb; ic++){
 793     if(fClusters[ic] && fClusters[ic+kNtb]) n++;
 794   }
 795   return n;
 796 }
 797
 798 //____________________________________________________________________
 799 Float_t* AliTRDseedV1::GetProbability(Bool_t force)
 800 {
 801   if(!force) return &fProb[0];
 802   if(!CookPID()) return NULL;
 803   return &fProb[0];
 804 }
 805
 806 //____________________________________________________________
 807 Bool_t AliTRDseedV1::CookPID()
 808 {
 809 // Fill probability array for tracklet from the DB.
 810 //
 811 // Parameters
 812 //
 813 // Output
 814 //   returns pointer to the probability array and NULL if missing DB access
 815 //
 816 // Retrieve PID probabilities for e+-, mu+-, K+-, pi+- and p+- from the DB according to tracklet information:
 817 // - estimated momentum at tracklet reference point
 818 // - dE/dx measurements
 819 // - tracklet length
 820 // - TRD layer
 821 // According to the steering settings specified in the reconstruction one of the following methods are used
 822 // - Neural Network [default] - option "nn"
 823 // - 2D Likelihood - option "!nn"
 824
 825   AliWarning(Form("Obsolete function. Use AliTRDPIDResponse::GetResponse() instead."));
 826
 827   AliTRDcalibDB *calibration = AliTRDcalibDB::Instance();
 828   if (!calibration) {
 829     AliError("No access to calibration data");
 830     return kFALSE;
 831   }
 832
 833   if (!fkReconstructor) {
 834     AliError("Reconstructor not set.");
 835     return kFALSE;
 836   }
 837
 838   // Retrieve the CDB container class with the parametric detector response
 839   const AliTRDCalPID *pd = calibration->GetPIDObject(fkReconstructor->GetPIDMethod());
 840   if (!pd) {
 841     AliError("No access to AliTRDCalPID object");
 842     return kFALSE;
 843   }
 844
 845   // calculate tracklet length TO DO
 846   Float_t length = (AliTRDgeometry::AmThick() + AliTRDgeometry::DrThick())/ TMath::Sqrt((1.0 - GetSnp()*GetSnp()) / (1.0 + GetTgl()*GetTgl()));
 847
 848   //calculate dE/dx
 849   CookdEdx(AliTRDCalPID::kNSlicesNN);
 850   AliDebug(4, Form("p=%6.4f[GeV/c] dEdx{%7.2f %7.2f %7.2f %7.2f %7.2f %7.2f %7.2f %7.2f} l=%4.2f[cm]", GetMomentum(), fdEdx[0], fdEdx[1], fdEdx[2], fdEdx[3], fdEdx[4], fdEdx[5], fdEdx[6], fdEdx[7], length));
 851
 852   // Sets the a priori probabilities
 853   Bool_t kPIDNN(fkReconstructor->GetPIDMethod()==AliTRDpidUtil::kNN);
 854   for(int ispec=0; ispec<AliPID::kSPECIES; ispec++)
 855     fProb[ispec] = pd->GetProbability(ispec, GetMomentum(), &fdEdx[0], length, kPIDNN?GetPlane():fkReconstructor->GetRecoParam()->GetPIDLQslices());
 856
 857   return kTRUE;
 858 }
 859
 860 //____________________________________________________________________
 861 Float_t AliTRDseedV1::GetQuality(Bool_t kZcorr) const
 862 {
 863   //
 864   // Returns a quality measurement of the current seed
 865   //
 866
 867   Float_t zcorr = kZcorr ? GetTilt() * (fZfit[0] - fZref[0]) : 0.;
 868   return
 869       .5 * TMath::Abs(18.0 - GetN())
 870     + 10.* TMath::Abs(fYfit[1] - fYref[1])
 871     + 5. * TMath::Abs(fYfit[0] - fYref[0] + zcorr)
 872     + 2. * TMath::Abs(fZfit[0] - fZref[0]) / GetPadLength();
 873 }
 874
 875 //____________________________________________________________________
 876 void AliTRDseedV1::GetCovAt(Double_t /*x*/, Double_t *cov) const
 877 {
 878 // Computes covariance in the y-z plane at radial point x (in tracking coordinates)
 879 // and returns the results in the preallocated array cov[3] as :
 880 //   cov[0] = Var(y)
 881 //   cov[1] = Cov(yz)
 882 //   cov[2] = Var(z)
 883 //
 884 // Details
 885 //
 886 // For the linear transformation
 887 // BEGIN_LATEX
 888 // Y = T_{x} X^{T}
 889 // END_LATEX
 890 //   The error propagation has the general form
 891 // BEGIN_LATEX
 892 // C_{Y} = T_{x} C_{X} T_{x}^{T}
 893 // END_LATEX
 894 //  We apply this formula 2 times. First to calculate the covariance of the tracklet
 895 // at point x we consider:
 896 // BEGIN_LATEX
 897 // T_{x} = (1 x); X=(y0 dy/dx); C_{X}=#(){#splitline{Var(y0) Cov(y0, dy/dx)}{Cov(y0, dy/dx) Var(dy/dx)}}
 898 // END_LATEX
 899 // and secondly to take into account the tilt angle
 900 // BEGIN_LATEX
 901 // T_{#alpha} = #(){#splitline{cos(#alpha) __ sin(#alpha)}{-sin(#alpha) __ cos(#alpha)}}; X=(y z); C_{X}=#(){#splitline{Var(y)    0}{0   Var(z)}}
 902 // END_LATEX
 903 //
 904 // using simple trigonometrics one can write for this last case
 905 // BEGIN_LATEX
 906 // C_{Y}=#frac{1}{1+tg^{2}#alpha} #(){#splitline{(#sigma_{y}^{2}+tg^{2}#alpha#sigma_{z}^{2}) __ tg#alpha(#sigma_{z}^{2}-#sigma_{y}^{2})}{tg#alpha(#sigma_{z}^{2}-#sigma_{y}^{2}) __ (#sigma_{z}^{2}+tg^{2}#alpha#sigma_{y}^{2})}}
 907 // END_LATEX
 908 // which can be aproximated for small alphas (2 deg) with
 909 // BEGIN_LATEX
 910 // C_{Y}=#(){#splitline{#sigma_{y}^{2} __ (#sigma_{z}^{2}-#sigma_{y}^{2})tg#alpha}{((#sigma_{z}^{2}-#sigma_{y}^{2})tg#alpha __ #sigma_{z}^{2}}}
 911 // END_LATEX
 912 //
 913 // before applying the tilt rotation we also apply systematic uncertainties to the tracklet
 914 // position which can be tunned from outside via the AliTRDrecoParam::SetSysCovMatrix(). They might
 915 // account for extra misalignment/miscalibration uncertainties.
 916 //
 917 // Author :
 918 // Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
 919 // Date : Jan 8th 2009
 920 //
 921
 922
 923   //Double_t xr     = fX0-x;
 924   Double_t sy2    = fCov[0];// +2.*xr*fCov[1] + xr*xr*fCov[2];
 925   Double_t sz2    = fS2Z;
 926   //GetPadLength()*GetPadLength()/12.;
 927
 928   // insert systematic uncertainties
 929   if(fkReconstructor){
 930     Double_t sys[15]; memset(sys, 0, 15*sizeof(Double_t));
 931     fkReconstructor->GetRecoParam()->GetSysCovMatrix(sys);
 932 //    sy2 += sys[0];
 933 //    sz2 += sys[1];
 934   }
 935
 936   // rotate covariance matrix if no RC
 937   if(!IsRowCross()){
 938     Double_t t2 = GetTilt()*GetTilt();
 939     Double_t correction = 1./(1. + t2);
 940     cov[0] = (sy2+t2*sz2)*correction;
 941     cov[1] = GetTilt()*(sz2 - sy2)*correction;
 942     cov[2] = (t2*sy2+sz2)*correction;
 943    } else {
 944      cov[0] = sy2; cov[1] = 0.; cov[2] = sz2;
 945    }
 946
 947   AliDebug(4, Form("C(%6.1f %+6.3f %6.1f)  RC[%c]", 1.e4*TMath::Sqrt(cov[0]), cov[1], 1.e4*TMath::Sqrt(cov[2]), IsRowCross()?'y':'n'));
 948 }
 949
 950 //____________________________________________________________
 951 Int_t AliTRDseedV1::GetCovSqrt(const Double_t * const c, Double_t *d)
 952 {
 953 // Helper function to calculate the square root of the covariance matrix.
 954 // The input matrix is stored in the vector c and the result in the vector d.
 955 // Both arrays have to be initialized by the user with at least 3 elements. Return negative in case of failure.
 956 //
 957 // For calculating the square root of the symmetric matrix c
 958 // the following relation is used:
 959 // BEGIN_LATEX
 960 // C^{1/2} = VD^{1/2}V^{-1}
 961 // END_LATEX
 962 // with V being the matrix with the n eigenvectors as columns.
 963 // In case C is symmetric the followings are true:
 964 //   - matrix D is diagonal with the diagonal given by the eigenvalues of C
 965 //   - V = V^{-1}
 966 //
 967 // Author A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
 968 // Date   Mar 19 2009
 969
 970   const Double_t kZero(1.e-20);
 971   Double_t l[2], // eigenvalues
 972            v[3]; // eigenvectors
 973   // the secular equation and its solution :
 974   // (c[0]-L)(c[2]-L)-c[1]^2 = 0
 975   // L^2 - L*Tr(c)+DET(c) = 0
 976   // L12 = [Tr(c) +- sqrt(Tr(c)^2-4*DET(c))]/2
 977   Double_t tr = c[0]+c[2],           // trace
 978           det = c[0]*c[2]-c[1]*c[1]; // determinant
 979   if(TMath::Abs(det)<kZero) return 1;
 980   Double_t dd = TMath::Sqrt(tr*tr - 4*det);
 981   l[0] = .5*(tr + dd*(c[0]>c[2]?-1.:1.));
 982   l[1] = .5*(tr + dd*(c[0]>c[2]?1.:-1.));
 983   if(l[0]<kZero || l[1]<kZero) return 2;
 984   // the sym V matrix
 985   // | v00   v10|
 986   // | v10   v11|
 987   Double_t den = (l[0]-c[0])*(l[0]-c[0])+c[1]*c[1];
 988   if(den<kZero){ // almost diagonal
 989     v[0] = TMath::Sign(0., c[1]);
 990     v[1] = TMath::Sign(1., (l[0]-c[0]));
 991     v[2] = TMath::Sign(0., c[1]*(l[0]-c[0])*(l[1]-c[2]));
 992   } else {
 993     Double_t tmp = 1./TMath::Sqrt(den);
 994     v[0] = c[1]* tmp;
 995     v[1] = (l[0]-c[0])*tmp;
 996     if(TMath::Abs(l[1]-c[2])<kZero) v[2] = TMath::Sign(v[0]*(l[0]-c[0])/kZero, (l[1]-c[2]));
 997     else v[2] = v[0]*(l[0]-c[0])/(l[1]-c[2]);
 998   }
 999   // the VD^{1/2}V is:
1000   l[0] = TMath::Sqrt(l[0]); l[1] = TMath::Sqrt(l[1]);
1001   d[0] = v[0]*v[0]*l[0]+v[1]*v[1]*l[1];
1002   d[1] = v[0]*v[1]*l[0]+v[1]*v[2]*l[1];
1003   d[2] = v[1]*v[1]*l[0]+v[2]*v[2]*l[1];
1004
1005   return 0;
1006 }
1007
1008 //____________________________________________________________
1009 Double_t AliTRDseedV1::GetCovInv(const Double_t * const c, Double_t *d)
1010 {
1011 // Helper function to calculate the inverse of the covariance matrix.
1012 // The input matrix is stored in the vector c and the result in the vector d.
1013 // Both arrays have to be initialized by the user with at least 3 elements
1014 // The return value is the determinant or 0 in case of singularity.
1015 //
1016 // Author A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
1017 // Date   Mar 19 2009
1018
1019   Double_t det = c[0]*c[2] - c[1]*c[1];
1020   if(TMath::Abs(det)<1.e-20) return 0.;
1021   Double_t invDet = 1./det;
1022   d[0] = c[2]*invDet;
1023   d[1] =-c[1]*invDet;
1024   d[2] = c[0]*invDet;
1025   return det;
1026 }
1027
1028 //____________________________________________________________________
1029 UShort_t AliTRDseedV1::GetVolumeId() const
1030 {
1031 // Returns geometry volume id by delegation
1032
1033   for(Int_t ic(0);ic<kNclusters; ic++){
1034     if(fClusters[ic]) return fClusters[ic]->GetVolumeId();
1035   }
1036   return 0;
1037 }
1038
1039
1040 //____________________________________________________________________
1041 void AliTRDseedV1::Calibrate()
1042 {
1043 // Retrieve calibration and position parameters from OCDB.
1044 // The following information are used
1045 //  - detector index
1046 //  - column and row position of first attached cluster. If no clusters are attached
1047 // to the tracklet a random central chamber position (c=70, r=7) will be used.
1048 //
1049 // The following information is cached in the tracklet
1050 //   t0 (trigger delay)
1051 //   drift velocity
1052 //   PRF width
1053 //   omega*tau = tg(a_L)
1054 //   diffusion coefficients (longitudinal and transversal)
1055 //
1056 // Author :
1057 // Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
1058 // Date : Jan 8th 2009
1059 //
1060
1061   AliCDBManager *cdb = AliCDBManager::Instance();
1062   if(cdb->GetRun() < 0){
1063     AliError("OCDB manager not properly initialized");
1064     return;
1065   }
1066
1067   AliTRDcalibDB *calib = AliTRDcalibDB::Instance();
1068   AliTRDCalROC  *vdROC = calib->GetVdriftROC(fDet),
1069                 *t0ROC = calib->GetT0ROC(fDet);;
1070   const AliTRDCalDet *vdDet = calib->GetVdriftDet();
1071   const AliTRDCalDet *t0Det = calib->GetT0Det();
1072
1073   Int_t col = 70, row = 7;
1074   AliTRDcluster **c = &fClusters[0];
1075   if(GetN()){
1076     Int_t ic = 0;
1077     while (ic<kNclusters && !(*c)){ic++; c++;}
1078     if(*c){
1079       col = (*c)->GetPadCol();
1080       row = (*c)->GetPadRow();
1081     }
1082   }
1083
1084   fT0    = (t0Det->GetValue(fDet) + t0ROC->GetValue(col,row)) / AliTRDCommonParam::Instance()->GetSamplingFrequency();
1085   fVD    = vdDet->GetValue(fDet) * vdROC->GetValue(col, row);
1086   fS2PRF = calib->GetPRFWidth(fDet, col, row); fS2PRF *= fS2PRF;
1087   fExB   = AliTRDCommonParam::Instance()->GetOmegaTau(fVD);
1088   AliTRDCommonParam::Instance()->GetDiffCoeff(fDiffL,
1089   fDiffT, fVD);
1090   AliDebug(4, Form("Calibration params for Det[%3d] Col[%3d] Row[%2d]\n  t0[%f]  vd[%f]  s2PRF[%f]  ExB[%f]  Dl[%f]  Dt[%f]", fDet, col, row, fT0, fVD, fS2PRF, fExB, fDiffL, fDiffT));
1091
1092
1093   SetBit(kCalib, kTRUE);
1094 }
1095
1096 //____________________________________________________________________
1097 void AliTRDseedV1::SetOwner()
1098 {
1099   //AliInfo(Form("own [%s] fOwner[%s]", own?"YES":"NO", fOwner?"YES":"NO"));
1100
1101   if(TestBit(kOwner)) return;
1102   for(int ic=0; ic<kNclusters; ic++){
1103     if(!fClusters[ic]) continue;
1104     fClusters[ic] = new AliTRDcluster(*fClusters[ic]);
1105   }
1106   SetBit(kOwner);
1107 }
1108
1109 //____________________________________________________________
1110 void AliTRDseedV1::SetPadPlane(AliTRDpadPlane * const p)
1111 {
1112 // Shortcut method to initialize pad geometry.
1113   fPad[0] = p->GetLengthIPad();
1114   fPad[1] = p->GetWidthIPad();
1115   fPad[2] = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*p->GetTiltingAngle());
1116   fPad[3] = p->GetRow0() + p->GetAnodeWireOffset();
1117 }
1118
1119
1120
1121 //____________________________________________________________________
1122 Bool_t  AliTRDseedV1::AttachClusters(AliTRDtrackingChamber *const chamber, Bool_t tilt, Bool_t chgPos, Int_t ev)
1123 {
1124 //
1125 // Projective algorithm to attach clusters to seeding tracklets. The following steps are performed :
1126 // 1. Collapse x coordinate for the full detector plane
1127 // 2. truncated mean on y (r-phi) direction
1128 // 3. purge clusters
1129 // 4. truncated mean on z direction
1130 // 5. purge clusters
1131 //
1132 // Parameters
1133 //  - chamber : pointer to tracking chamber container used to search the tracklet
1134 //  - tilt    : switch for tilt correction during road building [default true]
1135 //  - chgPos  : mark same[kFALSE] and opposite[kTRUE] sign tracks with respect to Bz field sign [default true]
1136 //  - ev      : event number for debug purposes [default = -1]
1137 // Output
1138 //  - true    : if tracklet found successfully. Failure can happend because of the following:
1139 //      -
1140 // Detailed description
1141 //
1142 // We start up by defining the track direction in the xy plane and roads. The roads are calculated based
1143 // on tracking information (variance in the r-phi direction) and estimated variance of the standard
1144 // clusters (see AliTRDcluster::SetSigmaY2()) corrected for tilt (see GetCovAt()). From this the road is
1145 // BEGIN_LATEX
1146 // r_{y} = 3*#sqrt{12*(#sigma^{2}_{Trk}(y) + #frac{#sigma^{2}_{cl}(y) + tg^{2}(#alpha_{L})#sigma^{2}_{cl}(z)}{1+tg^{2}(#alpha_{L})})}
1147 // r_{z} = 1.5*L_{pad}
1148 // END_LATEX
1149 //
1150 // Author : Alexandru Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
1151 // Debug  : level = 2 for calibration
1152 //          level = 3 for visualization in the track SR
1153 //          level = 4 for full visualization including digit level
1154
1155   const AliTRDrecoParam* const recoParam = fkReconstructor->GetRecoParam(); //the dynamic cast in GetRecoParam is slow, so caching the pointer to it
1156
1157   if(!recoParam){
1158     AliError("Tracklets can not be used without a valid RecoParam.");
1159     return kFALSE;
1160   }
1161   AliTRDcalibDB *calibration = AliTRDcalibDB::Instance();
1162   if (!calibration) {
1163     AliError("No access to calibration data");
1164     return kFALSE;
1165   }
1166   // Retrieve the CDB container class with the parametric likelihood
1167   const AliTRDCalTrkAttach *attach = calibration->GetAttachObject();
1168   if (!attach) {
1169     AliError("No usable AttachClusters calib object.");
1170     return kFALSE;
1171   }
1172
1173   // Initialize reco params for this tracklet
1174   // 1. first time bin in the drift region
1175   Int_t t0 = 14;
1176   Int_t kClmin = Int_t(recoParam->GetFindableClusters()*AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins());
1177   Int_t kTBmin = 4;
1178
1179   Double_t sysCov[5]; recoParam->GetSysCovMatrix(sysCov);
1180   Double_t s2yTrk= fRefCov[0],
1181            s2yCl = 0.,
1182            s2zCl = GetPadLength()*GetPadLength()/12.,
1183            syRef = TMath::Sqrt(s2yTrk),
1184            t2    = GetTilt()*GetTilt();
1185   //define roads
1186   const Double_t kroady = 3.; //recoParam->GetRoad1y();
1187   const Double_t kroadz = GetPadLength() * recoParam->GetRoadzMultiplicator() + 1.;
1188   // define probing cluster (the perfect cluster) and default calibration
1189   Short_t sig[] = {0, 0, 10, 30, 10, 0,0};
1190   AliTRDcluster cp(fDet, 6, 75, 0, sig, 0);
1191   if(fkReconstructor->IsHLT()) cp.SetRPhiMethod(AliTRDcluster::kCOG);
1192   if(!IsCalibrated()) Calibrate();
1193
1194 /*  Int_t kroadyShift(0);
1195   Float_t bz(AliTrackerBase::GetBz());
1196   if(TMath::Abs(bz)>2.){
1197     if(bz<0.) kroadyShift = chgPos ? +1 : -1;
1198     else kroadyShift = chgPos ? -1 : +1;
1199   }*/
1200   AliDebug(4, Form("\n       syTrk[cm]=%4.2f dydxTrk[deg]=%+6.2f Chg[%c] rY[cm]=%4.2f rZ[cm]=%5.2f TC[%c]", syRef, TMath::ATan(fYref[1])*TMath::RadToDeg(), chgPos?'+':'-', kroady, kroadz, tilt?'y':'n'));
1201   Double_t phiTrk(TMath::ATan(fYref[1])),
1202            thtTrk(TMath::ATan(fZref[1]));
1203
1204   // working variables
1205   const Int_t kNrows = 16;
1206   const Int_t kNcls  = 3*kNclusters; // buffer size
1207   TObjArray clst[kNrows];
1208   Bool_t blst[kNrows][kNcls];
1209   Double_t cond[4],
1210            dx, dy, dz,
1211            yt, zt,
1212            zc[kNrows],
1213            xres[kNrows][kNcls], yres[kNrows][kNcls], zres[kNrows][kNcls], s2y[kNrows][kNcls];
1214   Int_t idxs[kNrows][kNcls], ncl[kNrows], ncls = 0;
1215   memset(ncl, 0, kNrows*sizeof(Int_t));
1216   memset(zc, 0, kNrows*sizeof(Double_t));
1217   memset(idxs, 0, kNrows*kNcls*sizeof(Int_t));
1218   memset(xres, 0, kNrows*kNcls*sizeof(Double_t));
1219   memset(yres, 0, kNrows*kNcls*sizeof(Double_t));
1220   memset(zres, 0, kNrows*kNcls*sizeof(Double_t));
1221   memset(s2y, 0, kNrows*kNcls*sizeof(Double_t));
1222   memset(blst, 0, kNrows*kNcls*sizeof(Bool_t));   //this is 8 times faster to memset than "memset(clst, 0, kNrows*kNcls*sizeof(AliTRDcluster*))"
1223
1224   Double_t roady(0.), s2Mean(0.); Int_t ns2Mean(0);
1225
1226   // Do cluster projection and pick up cluster candidates
1227   AliTRDcluster *c(NULL);
1228   AliTRDchamberTimeBin *layer(NULL);
1229   Bool_t kBUFFER = kFALSE;
1230   for (Int_t it = 0; it < kNtb; it++) {
1231     if(!(layer = chamber->GetTB(it))) continue;
1232     if(!Int_t(*layer)) continue;
1233     // get track projection at layers position
1234     dx   = fX0 - layer->GetX();
1235     yt = fYref[0] - fYref[1] * dx;
1236     zt = fZref[0] - fZref[1] * dx;
1237     // get standard cluster error corrected for tilt if selected
1238     cp.SetLocalTimeBin(it);
1239     cp.SetSigmaY2(0.02, fDiffT, fExB, dx, -1./*zt*/, fYref[1]);
1240     s2yCl = cp.GetSigmaY2() + sysCov[0]; if(!tilt) s2yCl = (s2yCl + t2*s2zCl)/(1.+t2);
1241     if(TMath::Abs(it-12)<7){ s2Mean += cp.GetSigmaY2(); ns2Mean++;}
1242     // get estimated road in r-phi direction
1243     roady = TMath::Min(3.*TMath::Sqrt(12.*(s2yTrk + s2yCl)), kroady);
1244
1245     AliDebug(5, Form("\n"
1246       "  %2d xd[cm]=%6.3f yt[cm]=%7.2f zt[cm]=%8.2f\n"
1247       "      syTrk[um]=%6.2f syCl[um]=%6.2f syClTlt[um]=%6.2f\n"
1248       "      Ry[mm]=%f"
1249       , it, dx, yt, zt
1250       , 1.e4*TMath::Sqrt(s2yTrk), 1.e4*TMath::Sqrt(cp.GetSigmaY2()+sysCov[0]), 1.e4*TMath::Sqrt(s2yCl)
1251       , 1.e1*roady));
1252
1253     // get clusters from layer
1254     cond[0] = yt/*+0.5*kroadyShift*kroady*/; cond[2] = roady;
1255     cond[1] = zt; cond[3] = kroadz;
1256     Int_t n=0, idx[6]; layer->GetClusters(cond, idx, n, 6);
1257     for(Int_t ic = n; ic--;){
1258       c  = (*layer)[idx[ic]];
1259       dx = fX0 - c->GetX();
1260       yt = fYref[0] - fYref[1] * dx;
1261       zt = fZref[0] - fZref[1] * dx;
1262       dz = zt - c->GetZ();
1263       dy = yt - (c->GetY() + (tilt ? (GetTilt() * dz) : 0.));
1264       Int_t r = c->GetPadRow();
1265       clst[r].AddAtAndExpand(c, ncl[r]);
1266       blst[r][ncl[r]] = kTRUE;
1267       idxs[r][ncl[r]] = idx[ic];
1268       zres[r][ncl[r]] = dz/GetPadLength();
1269       yres[r][ncl[r]] = dy;
1270       xres[r][ncl[r]] = dx;
1271       zc[r]           = c->GetZ();
1272       // TODO temporary solution to avoid divercences in error parametrization
1273       s2y[r][ncl[r]]  = TMath::Min(c->GetSigmaY2()+sysCov[0], 0.025);
1274       AliDebug(5, Form("   -> dy[cm]=%+7.4f yc[cm]=%7.2f row[%d] idx[%2d]", dy, c->GetY(), r, ncl[r]));
1275       ncl[r]++; ncls++;
1276
1277       if(ncl[r] >= kNcls) {
1278         AliWarning(Form("Cluster candidates row[%d] reached buffer limit[%d]. Some may be lost.", r, kNcls));
1279         kBUFFER = kTRUE;
1280         break;
1281       }
1282     }
1283     if(kBUFFER) break;
1284   }
1285   if(ncls<kClmin){
1286     AliDebug(1, Form("CLUSTERS FOUND %d LESS THAN THRESHOLD %d.", ncls, kClmin));
1287     SetErrorMsg(kAttachClFound);
1288     for(Int_t ir(kNrows);ir--;) clst[ir].Clear();
1289     return kFALSE;
1290   }
1291   if(ns2Mean<kTBmin){
1292     AliDebug(1, Form("CLUSTERS IN TimeBins %d LESS THAN THRESHOLD %d.", ns2Mean, kTBmin));
1293     SetErrorMsg(kAttachClFound);
1294     for(Int_t ir(kNrows);ir--;) clst[ir].Clear();
1295     return kFALSE;
1296   }
1297   s2Mean /= ns2Mean; //sMean = TMath::Sqrt(s2Mean);
1298   //Double_t sRef(TMath::Sqrt(s2Mean+s2yTrk)); // reference error parameterization
1299
1300   // organize row candidates
1301   Int_t idxRow[kNrows], nrc(0); Double_t zresRow[kNrows];
1302   for(Int_t ir(0); ir<kNrows; ir++){
1303     idxRow[ir]=-1; zresRow[ir] = 999.;
1304     if(!ncl[ir]) continue;
1305     // get mean z resolution
1306     dz = 0.; for(Int_t ic = ncl[ir]; ic--;) dz += zres[ir][ic]; dz/=ncl[ir];
1307     // insert row
1308     idxRow[nrc] = ir; zresRow[nrc] = TMath::Abs(dz); nrc++;
1309   }
1310   AliDebug(4, Form("Found %d clusters in %d rows. Sorting ...", ncls, nrc));
1311
1312   // sort row candidates
1313   if(nrc>=2){
1314     if(nrc==2){
1315       if(zresRow[0]>zresRow[1]){ // swap
1316         Int_t itmp=idxRow[1]; idxRow[1] = idxRow[0]; idxRow[0] = itmp;
1317         Double_t dtmp=zresRow[1]; zresRow[1] = zresRow[0]; zresRow[0] = dtmp;
1318       }
1319       if(TMath::Abs(idxRow[1] - idxRow[0]) != 1){
1320         SetErrorMsg(kAttachRowGap);
1321         AliDebug(2, Form("Rows attached not continuous. Select first candidate.\n"
1322                     "       row[%2d] Ncl[%2d] <dz>[cm]=%+8.2f row[%2d] Ncl[%2d] <dz>[cm]=%+8.2f",
1323                     idxRow[0], ncl[idxRow[0]], zresRow[0], idxRow[1], idxRow[1]<0?0:ncl[idxRow[1]], zresRow[1]));
1324         nrc=1; idxRow[1] = -1; zresRow[1] = 999.;
1325       }
1326     } else {
1327       Int_t idx0[kNrows];
1328       TMath::Sort(nrc, zresRow, idx0, kFALSE);
1329       nrc = 3; // select only maximum first 3 candidates
1330       Int_t iatmp[] = {-1, -1, -1}; Double_t datmp[] = {999., 999., 999.};
1331       for(Int_t irc(0); irc<nrc; irc++){
1332         iatmp[irc] = idxRow[idx0[irc]];
1333         datmp[irc] = zresRow[idx0[irc]];
1334       }
1335       idxRow[0] = iatmp[0]; zresRow[0] = datmp[0];
1336       idxRow[1] = iatmp[1]; zresRow[1] = datmp[1];
1337       idxRow[2] = iatmp[2]; zresRow[2] = datmp[2]; // temporary
1338       if(TMath::Abs(idxRow[1] - idxRow[0]) != 1){
1339         SetErrorMsg(kAttachRowGap);
1340         AliDebug(2, Form("Rows attached not continuous. Turn on selection.\n"
1341                     "row[%2d] Ncl[%2d] <dz>[cm]=%+8.2f\n"
1342                     "row[%2d] Ncl[%2d] <dz>[cm]=%+8.2f\n"
1343                     "row[%2d] Ncl[%2d] <dz>[cm]=%+8.2f",
1344                     idxRow[0], ncl[idxRow[0]], zresRow[0],
1345                     idxRow[1], ncl[idxRow[1]], zresRow[1],
1346                     idxRow[2], ncl[idxRow[2]], zresRow[2]));
1347         if(TMath::Abs(idxRow[0] - idxRow[2]) == 1){ // select second candidate
1348           AliDebug(2, "Solved ! Remove second candidate.");
1349           nrc = 2;
1350           idxRow[1] = idxRow[2]; zresRow[1] = zresRow[2]; // swap
1351           idxRow[2] = -1; zresRow[2] = 999.;              // remove
1352         } else if(TMath::Abs(idxRow[1] - idxRow[2]) == 1){
1353           if(ncl[idxRow[1]]+ncl[idxRow[2]] > ncl[idxRow[0]]){
1354             AliDebug(2, "Solved ! Remove first candidate.");
1355             nrc = 2;
1356             idxRow[0] = idxRow[1]; zresRow[0] = zresRow[1]; // swap
1357             idxRow[1] = idxRow[2]; zresRow[1] = zresRow[2]; // swap
1358           } else {
1359             AliDebug(2, "Solved ! Remove second and third candidate.");
1360             nrc = 1;
1361             idxRow[1] = -1; zresRow[1] = 999.; // remove
1362             idxRow[2] = -1; zresRow[2] = 999.; // remove
1363           }
1364         } else {
1365           AliDebug(2, "Unsolved !!! Remove second and third candidate.");
1366           nrc = 1;
1367           idxRow[1] = -1; zresRow[1] = 999.; // remove
1368           idxRow[2] = -1; zresRow[2] = 999.; // remove
1369         }
1370       } else { // remove temporary candidate
1371         nrc = 2;
1372         idxRow[2] = -1; zresRow[2] = 999.;
1373       }
1374     }
1375   }
1376   AliDebug(4, Form("Sorted row candidates:\n"
1377       "  row[%2d] Ncl[%2d] <dz>[cm]=%+8.2f row[%2d] Ncl[%2d] <dz>[cm]=%+8.2f"
1378       , idxRow[0], ncl[idxRow[0]], zresRow[0], idxRow[1], idxRow[1]<0?0:ncl[idxRow[1]], zresRow[1]));
1379
1380   // initialize debug streamer
1381   TTreeSRedirector *pstreamer(NULL);
1382   if((recoParam->GetStreamLevel(AliTRDrecoParam::kTracker) > 3 && fkReconstructor->IsDebugStreaming())||
1383      AliTRDReconstructor::GetStreamLevel()>30) pstreamer = fkReconstructor->GetDebugStream(AliTRDrecoParam::kTracker);
1384   if(pstreamer){
1385     // save config. for calibration
1386     TVectorD vdy[2], vdx[2], vs2[2];
1387     for(Int_t jr(0); jr<nrc; jr++){
1388       Int_t ir(idxRow[jr]);
1389       vdx[jr].ResizeTo(ncl[ir]); vdy[jr].ResizeTo(ncl[ir]); vs2[jr].ResizeTo(ncl[ir]);
1390       for(Int_t ic(ncl[ir]); ic--;){
1391         vdx[jr](ic) = xres[ir][ic];
1392         vdy[jr](ic) = yres[ir][ic];
1393         vs2[jr](ic) = s2y[ir][ic];
1394       }
1395     }
1396     (*pstreamer) << "AttachClusters4"
1397         << "r0="     << idxRow[0]
1398         << "dz0="    << zresRow[0]
1399         << "dx0="    << &vdx[0]
1400         << "dy0="    << &vdy[0]
1401         << "s20="    << &vs2[0]
1402         << "r1="     << idxRow[1]
1403         << "dz1="    << zresRow[1]
1404         << "dx1="    << &vdx[1]
1405         << "dy1="    << &vdy[1]
1406         << "s21="    << &vs2[1]
1407         << "\n";
1408     vdx[0].Clear(); vdy[0].Clear(); vs2[0].Clear();
1409     vdx[1].Clear(); vdy[1].Clear(); vs2[1].Clear();
1410     if(recoParam->GetStreamLevel(AliTRDrecoParam::kTracker) > 4 ||AliTRDReconstructor::GetStreamLevel()>4){
1411       Int_t idx(idxRow[1]);
1412       if(idx<0){
1413         for(Int_t ir(0); ir<kNrows; ir++){
1414           if(clst[ir].GetEntries()>0) continue;
1415           idx = ir;
1416           break;
1417         }
1418       }
1419       (*pstreamer) << "AttachClusters5"
1420           << "c0.="    << &clst[idxRow[0]]
1421           << "c1.="    << &clst[idx]
1422           << "\n";
1423     }
1424   }
1425
1426 //=======================================================================================
1427   // Analyse cluster topology
1428   Double_t f[kNcls],     // likelihood factors for segments
1429            r[2][kNcls],  // d(dydx) of tracklet candidate with respect to track
1430            xm[2][kNcls], // mean <x>
1431            ym[2][kNcls], // mean <y>
1432            sm[2][kNcls], // mean <s_y>
1433            s[2][kNcls],  // sigma_y
1434            p[2][kNcls],  // prob of Gauss
1435            q[2][kNcls];  // charge/segment
1436   memset(f, 0, kNcls*sizeof(Double_t));
1437   Int_t index[2][kNcls], n[2][kNcls];
1438   memset(n, 0, 2*kNcls*sizeof(Int_t));
1439   Int_t mts(0), nts[2] = {0, 0};   // no of tracklet segments in row
1440   AliTRDpadPlane *pp(AliTRDtransform::Geometry().GetPadPlane(fDet));
1441   AliTRDtrackletOflHelper helper;
1442   Int_t lyDet(AliTRDgeometry::GetLayer(fDet));
1443   for(Int_t jr(0), n0(0); jr<nrc; jr++){
1444     Int_t ir(idxRow[jr]);
1445     // cluster segmentation
1446     Bool_t kInit(kFALSE);
1447     if(jr==0){
1448       n0 = helper.Init(pp, &clst[ir]); kInit = kTRUE;
1449       if(!n0 || (helper.ClassifyTopology() == AliTRDtrackletOflHelper::kNormal)){
1450         nts[jr] = 1; memset(index[jr], 0, ncl[ir]*sizeof(Int_t));
1451         n[jr][0] = ncl[ir];
1452       }
1453     }
1454     if(!n[jr][0]){
1455       nts[jr] = AliTRDtrackletOflHelper::Segmentation(ncl[ir], xres[ir], yres[ir], index[jr]);
1456       for(Int_t ic(ncl[ir]);ic--;) n[jr][index[jr][ic]]++;
1457     }
1458     mts += nts[jr];
1459
1460     // tracklet segment processing
1461     for(Int_t its(0); its<nts[jr]; its++){
1462       if(n[jr][its]<=2) {   // don't touch small segments
1463         xm[jr][its] = 0.;ym[jr][its] = 0.;sm[jr][its] = 0.;
1464         for(Int_t ic(ncl[ir]); ic--;){
1465           if(its != index[jr][ic]) continue;
1466           ym[jr][its] += yres[ir][ic];
1467           xm[jr][its] += xres[ir][ic];
1468           sm[jr][its] += TMath::Sqrt(s2y[ir][ic]);
1469         }
1470         if(n[jr][its]==2){ xm[jr][its] *= 0.5; ym[jr][its] *= 0.5; sm[jr][its] *= 0.5;}
1471         xm[jr][its]= fX0 - xm[jr][its];
1472         r[jr][its] = 0.;
1473         s[jr][its] = 1.e-5;
1474         p[jr][its] = 1.;
1475         q[jr][its] = -1.;
1476         continue;
1477       }
1478
1479       // for longer tracklet segments
1480       if(!kInit) n0 = helper.Init(pp, &clst[ir], index[jr], its);
1481       Int_t n1 = helper.GetRMS(r[jr][its], ym[jr][its], s[jr][its], fX0/*xm[jr][its]*/);
1482       p[jr][its]  = Double_t(n1)/n0;
1483       sm[jr][its] = helper.GetSyMean();
1484       q[jr][its]  = helper.GetQ()/TMath::Sqrt(1. + fYref[1]*fYref[1] + fZref[1]*fZref[1]);
1485       xm[jr][its] = fX0;
1486       Double_t dxm= fX0 - xm[jr][its];
1487       yt = fYref[0] - fYref[1]*dxm;
1488       zt = fZref[0] - fZref[1]*dxm;
1489       // correct tracklet fit for tilt
1490       ym[jr][its]+= GetTilt()*(zt - zc[ir]);
1491       r[jr][its] += GetTilt() * fZref[1];
1492       // correct tracklet fit for track position/inclination
1493       ym[jr][its] = yt - ym[jr][its];
1494       r[jr][its]  = (r[jr][its] - fYref[1])/(1+r[jr][its]*fYref[1]);
1495       // report inclination in radians
1496       r[jr][its] = TMath::ATan(r[jr][its]);
1497       if(jr) continue; // calculate only for first row likelihoods
1498
1499       f[its] = attach->CookLikelihood(chgPos, lyDet, fPt, phiTrk, n[jr][its], ym[jr][its]/*sRef*/, r[jr][its]*TMath::RadToDeg(), s[jr][its]/sm[jr][its]);
1500     }
1501   }
1502   AliDebug(4, Form("   Tracklet candidates: row[%2d] = %2d row[%2d] = %2d:", idxRow[0], nts[0], idxRow[1], nts[1]));
1503   if(AliLog::GetDebugLevel("TRD", "AliTRDseedV1")>3){
1504     for(Int_t jr(0); jr<nrc; jr++){
1505       Int_t ir(idxRow[jr]);
1506       for(Int_t its(0); its<nts[jr]; its++){
1507         printf("  segId[%2d] row[%2d] Ncl[%2d] x[cm]=%7.2f dz[pu]=%4.2f dy[mm]=%+7.3f r[deg]=%+6.2f p[%%]=%6.2f s[um]=%7.2f\n",
1508             its, ir, n[jr][its], xm[jr][its], zresRow[jr], 1.e1*ym[jr][its], r[jr][its]*TMath::RadToDeg(), 100.*p[jr][its], 1.e4*s[jr][its]);
1509       }
1510     }
1511   }
1512   if(!pstreamer &&
1513      ( (recoParam->GetStreamLevel(AliTRDrecoParam::kTracker) > 2 && fkReconstructor->IsDebugStreaming()) ||
1514        AliTRDReconstructor::GetStreamLevel()>2 )
1515      ) pstreamer = fkReconstructor->GetDebugStream(AliTRDrecoParam::kTracker);
1516   if(pstreamer){
1517     // save config. for calibration
1518     TVectorD vidx, vn, vx, vy, vr, vs, vsm, vp, vf;
1519     vidx.ResizeTo(ncl[idxRow[0]]+(idxRow[1]<0?0:ncl[idxRow[1]]));
1520     vn.ResizeTo(mts);
1521     vx.ResizeTo(mts);
1522     vy.ResizeTo(mts);
1523     vr.ResizeTo(mts);
1524     vs.ResizeTo(mts);
1525     vsm.ResizeTo(mts);
1526     vp.ResizeTo(mts);
1527     vf.ResizeTo(mts);
1528     for(Int_t jr(0), jts(0), jc(0); jr<nrc; jr++){
1529        Int_t ir(idxRow[jr]);
1530        for(Int_t its(0); its<nts[jr]; its++, jts++){
1531         vn[jts] = n[jr][its];
1532         vx[jts] = xm[jr][its];
1533         vy[jts] = ym[jr][its];
1534         vr[jts] = r[jr][its];
1535         vs[jts] = s[jr][its];
1536         vsm[jts]= sm[jr][its];
1537         vp[jts] = p[jr][its];
1538         vf[jts] = jr?-1.:f[its];
1539       }
1540       for(Int_t ic(0); ic<ncl[ir]; ic++, jc++) vidx[jc] = index[jr][ic];
1541     }
1542     (*pstreamer) << "AttachClusters3"
1543         << "idx="    << &vidx
1544         << "n="      << &vn
1545         << "x="      << &vx
1546         << "y="      << &vy
1547         << "r="      << &vr
1548         << "s="      << &vs
1549         << "sm="     << &vsm
1550         << "p="      << &vp
1551         << "f="      << &vf
1552         << "\n";
1553   }
1554
1555 //=========================================================
1556   // Get seed tracklet segment
1557   Int_t idx2[kNcls]; memset(idx2, 0, kNcls*sizeof(Int_t)); // seeding indexing
1558   if(nts[0]>1) TMath::Sort(nts[0], f, idx2);
1559   Int_t is(idx2[0]); // seed index
1560   Int_t     idxTrklt[kNcls],
1561             kts(0),
1562             nTrklt(n[0][is]);
1563   Double_t  fTrklt(f[is]),
1564             rTrklt(r[0][is]),
1565             yTrklt(ym[0][is]),
1566             sTrklt(s[0][is]),
1567             smTrklt(sm[0][is]),
1568             xTrklt(xm[0][is]),
1569             pTrklt(p[0][is]),
1570             qTrklt(q[0][is]);
1571   memset(idxTrklt, 0, kNcls*sizeof(Int_t));
1572   // check seed idx2[0] exit if not found
1573   if(f[is]<1.e-2){
1574     AliDebug(1, Form("Seed   seg[%d] row[%2d] n[%2d] f[%f]<0.01.", is, idxRow[0], n[0][is], f[is]));
1575     SetErrorMsg(kAttachClAttach);
1576     if(!pstreamer &&
1577        ( (recoParam->GetStreamLevel(AliTRDrecoParam::kTracker) > 1 && fkReconstructor->IsDebugStreaming()) ||
1578          AliTRDReconstructor::GetStreamLevel()>1 )
1579        ) pstreamer = fkReconstructor->GetDebugStream(AliTRDrecoParam::kTracker);
1580     if(pstreamer){
1581       UChar_t stat(0);
1582       if(IsKink()) SETBIT(stat, 1);
1583       if(IsStandAlone()) SETBIT(stat, 2);
1584       if(IsRowCross()) SETBIT(stat, 3);
1585       SETBIT(stat, 4); // set error bit
1586       TVectorD vidx; vidx.ResizeTo(1); vidx[0] = is;
1587       (*pstreamer) << "AttachClusters2"
1588           << "stat="   << stat
1589           << "ev="     << ev
1590           << "chg="    << chgPos
1591           << "det="    << fDet
1592           << "x0="     << fX0
1593           << "y0="     << fYref[0]
1594           << "z0="     << fZref[0]
1595           << "phi="    << phiTrk
1596           << "tht="    << thtTrk
1597           << "pt="     << fPt
1598           << "s2Trk="  << s2yTrk
1599           << "s2Cl="   << s2Mean
1600           << "idx="    << &vidx
1601           << "n="      << nTrklt
1602           << "f="      << fTrklt
1603           << "x="      << xTrklt
1604           << "y="      << yTrklt
1605           << "r="      << rTrklt
1606           << "s="      << sTrklt
1607           << "sm="     << smTrklt
1608           << "p="      << pTrklt
1609           << "q="      << qTrklt
1610           << "\n";
1611     }
1612     return kFALSE;
1613   }
1614   AliDebug(2, Form("Seed   seg[%d] row[%2d] n[%2d] dy[%f] r[%+5.2f] s[%+5.2f] f[%5.3f] q[%6.2f]", is, idxRow[0], n[0][is], ym[0][is], r[0][is]*TMath::RadToDeg(), s[0][is]/sm[0][is], f[is], q[0][is]));
1615
1616   // save seeding segment in the helper
1617   idxTrklt[kts++] = is;
1618   helper.Init(pp, &clst[idxRow[0]], index[0], is);
1619   AliTRDtrackletOflHelper test; // helper to test segment expantion
1620   Float_t rcLikelihood(0.); SetBit(kRowCross, kFALSE);
1621   Double_t dyRez[kNcls]; Int_t idx3[kNcls];
1622
1623   //=========================================================
1624   // Define filter parameters from OCDB
1625   Int_t kNSgmDy[2]; attach->GetNsgmDy(kNSgmDy[0], kNSgmDy[1]);
1626   Float_t kLikeMinRelDecrease[2]; attach->GetLikeMinRelDecrease(kLikeMinRelDecrease[0], kLikeMinRelDecrease[1]);
1627   Float_t kRClikeLimit(attach->GetRClikeLimit());
1628
1629   //=========================================================
1630   // Try attaching next segments from first row (if any)
1631   if(nts[0]>1){
1632     Int_t jr(0), ir(idxRow[jr]);
1633     // organize  secondary sgms. in decreasing order of their distance from seed
1634     memset(dyRez, 0, nts[jr]*sizeof(Double_t));
1635     for(Int_t jts(1); jts<nts[jr]; jts++) {
1636       Int_t its(idx2[jts]);
1637       Double_t rot(TMath::Tan(r[0][is]));
1638       dyRez[its] = TMath::Abs(ym[0][is] - ym[jr][its] + rot*(xm[0][is]-xm[jr][its]));
1639     }
1640     TMath::Sort(nts[jr], dyRez, idx3, kFALSE);
1641     for (Int_t jts(1); jts<nts[jr]; jts++) {
1642       Int_t its(idx3[jts]);
1643       if(dyRez[its] > kNSgmDy[jr]*smTrklt){
1644         AliDebug(2, Form("Reject seg[%d] row[%2d] n[%2d] dy[%f] > %d*s[%f].", its, idxRow[jr], n[jr][its], dyRez[its], kNSgmDy[jr], kNSgmDy[jr]*smTrklt));
1645         continue;
1646       }
1647
1648       test = helper;
1649       Int_t n0 = test.Expand(&clst[ir], index[jr], its);
1650       Double_t rt, dyt, st, xt, smt, pt, qt, ft;
1651       Int_t n1 = test.GetRMS(rt, dyt, st, fX0/*xt*/);
1652       pt = Double_t(n1)/n0;
1653       smt = test.GetSyMean();
1654       qt  = test.GetQ()/TMath::Sqrt(1. + fYref[1]*fYref[1] + fZref[1]*fZref[1]);
1655       xt  = fX0;
1656       // correct position
1657       Double_t dxm= fX0 - xt;
1658       yt = fYref[0] - fYref[1]*dxm;
1659       zt = fZref[0] - fZref[1]*dxm;
1660       // correct tracklet fit for tilt
1661       dyt+= GetTilt()*(zt - zc[idxRow[0]]);
1662       rt += GetTilt() * fZref[1];
1663       // correct tracklet fit for track position/inclination
1664       dyt  = yt - dyt;
1665       rt   = (rt - fYref[1])/(1+rt*fYref[1]);
1666       // report inclination in radians
1667       rt = TMath::ATan(rt);
1668
1669       ft = (n0>=2) ? attach->CookLikelihood(chgPos, lyDet, fPt, phiTrk, n0,  dyt/*sRef*/, rt*TMath::RadToDeg(), st/smt) : 0.;
1670       Bool_t kAccept(ft>=fTrklt*(1.-kLikeMinRelDecrease[jr]));
1671
1672       AliDebug(2, Form("%s seg[%d] row[%2d] n[%2d] dy[%f] r[%+5.2f] s[%+5.2f] f[%f] < %4.2f*F[%f].",
1673         (kAccept?"Adding":"Reject"), its, idxRow[jr], n0, dyt, rt*TMath::RadToDeg(), st/smt, ft, 1.-kLikeMinRelDecrease[jr], fTrklt*(1.-kLikeMinRelDecrease[jr])));
1674       if(kAccept){
1675         idxTrklt[kts++] = its;
1676         nTrklt = n0;
1677         fTrklt = ft;
1678         rTrklt = rt;
1679         yTrklt = dyt;
1680         sTrklt = st;
1681         smTrklt= smt;
1682         xTrklt = xt;
1683         pTrklt = pt;
1684         qTrklt = qt;
1685         helper.Expand(&clst[ir], index[jr], its);
1686       }
1687     }
1688   }
1689
1690   //=========================================================
1691   // Try attaching next segments from second row (if any)
1692   if(nts[1] && (rcLikelihood = zresRow[0]/zresRow[1]) > kRClikeLimit){
1693     // organize  secondaries in decreasing order of their distance from seed
1694     Int_t jr(1), ir(idxRow[jr]);
1695     memset(dyRez, 0, nts[jr]*sizeof(Double_t));
1696     Double_t rot(TMath::Tan(r[0][is]));
1697     for(Int_t jts(0); jts<nts[jr]; jts++) {
1698       dyRez[jts] = TMath::Abs(ym[0][is] - ym[jr][jts] + rot*(xm[0][is]-xm[jr][jts]));
1699     }
1700     TMath::Sort(nts[jr], dyRez, idx3, kFALSE);
1701     for (Int_t jts(0); jts<nts[jr]; jts++) {
1702       Int_t its(idx3[jts]);
1703       if(dyRez[its] > kNSgmDy[jr]*smTrklt){
1704         AliDebug(2, Form("Reject seg[%d] row[%2d] n[%2d] dy[%f] > %d*s[%f].", its, idxRow[jr], n[jr][its], dyRez[its], kNSgmDy[jr], kNSgmDy[jr]*smTrklt));
1705         continue;
1706       }
1707
1708       test = helper;
1709       Int_t n0 = test.Expand(&clst[ir], index[jr], its);
1710       Double_t rt, dyt, st, xt, smt, pt, qt, ft;
1711       Int_t n1 = test.GetRMS(rt, dyt, st, fX0/*xt*/);
1712       pt = Double_t(n1)/n0;
1713       smt = test.GetSyMean();
1714       qt  = test.GetQ()/TMath::Sqrt(1. + fYref[1]*fYref[1] + fZref[1]*fZref[1]);
1715       xt  = fX0;
1716       // correct position
1717       Double_t dxm= fX0 - xt;
1718       yt = fYref[0] - fYref[1]*dxm;
1719       zt = fZref[0] - fZref[1]*dxm;
1720       // correct tracklet fit for tilt
1721       dyt+= GetTilt()*(zt - zc[idxRow[0]]);
1722       rt += GetTilt() * fZref[1];
1723       // correct tracklet fit for track position/inclination
1724       dyt  = yt - dyt;
1725       rt   = (rt - fYref[1])/(1+rt*fYref[1]);
1726       // report inclination in radians
1727       rt = TMath::ATan(rt);
1728
1729       ft = (n0>=2) ? attach->CookLikelihood(chgPos, lyDet, fPt, phiTrk, n0,  dyt/*sRef*/, rt*TMath::RadToDeg(), st/smt) : 0.;
1730       Bool_t kAccept(ft>=fTrklt*(1.-kLikeMinRelDecrease[jr]));
1731
1732       AliDebug(2, Form("%s seg[%d] row[%2d] n[%2d] dy[%f] r[%+5.2f] s[%+5.2f] f[%f] < %4.2f*F[%f].",
1733         (kAccept?"Adding":"Reject"), its, idxRow[jr], n0, dyt, rt*TMath::RadToDeg(), st/smt, ft, 1.-kLikeMinRelDecrease[jr], fTrklt*(1.-kLikeMinRelDecrease[jr])));
1734       if(kAccept){
1735         idxTrklt[kts++] = its;
1736         nTrklt = n0;
1737         fTrklt = ft;
1738         rTrklt = rt;
1739         yTrklt = dyt;
1740         sTrklt = st;
1741         smTrklt= smt;
1742         xTrklt = xt;
1743         pTrklt = pt;
1744         qTrklt = qt;
1745         helper.Expand(&clst[ir], index[jr], its);
1746         SetBit(kRowCross, kTRUE); // mark pad row crossing
1747       }
1748     }
1749   }
1750   // clear local copy of clusters
1751   for(Int_t ir(0); ir<kNrows; ir++) clst[ir].Clear();
1752
1753   if(!pstreamer &&
1754      ((recoParam->GetStreamLevel(AliTRDrecoParam::kTracker) > 1 && fkReconstructor->IsDebugStreaming()) ||
1755       AliTRDReconstructor::GetStreamLevel()>1 )
1756      ) pstreamer = fkReconstructor->GetDebugStream(AliTRDrecoParam::kTracker);
1757   if(pstreamer){
1758     UChar_t stat(0);
1759     if(IsKink()) SETBIT(stat, 1);
1760     if(IsStandAlone()) SETBIT(stat, 2);
1761     if(IsRowCross()) SETBIT(stat, 3);
1762     TVectorD vidx; vidx.ResizeTo(kts);
1763     for(Int_t its(0); its<kts; its++) vidx[its] = idxTrklt[its];
1764     (*pstreamer) << "AttachClusters2"
1765         << "stat="   << stat
1766         << "ev="     << ev
1767         << "chg="    << chgPos
1768         << "det="    << fDet
1769         << "x0="     << fX0
1770         << "y0="     << fYref[0]
1771         << "z0="     << fZref[0]
1772         << "phi="    << phiTrk
1773         << "tht="    << thtTrk
1774         << "pt="     << fPt
1775         << "s2Trk="  << s2yTrk
1776         << "s2Cl="   << s2Mean
1777         << "idx="    << &vidx
1778         << "n="      << nTrklt
1779         << "q="      << qTrklt
1780         << "f="      << fTrklt
1781         << "x="      << xTrklt
1782         << "y="      << yTrklt
1783         << "r="      << rTrklt
1784         << "s="      << sTrklt
1785         << "sm="     << smTrklt
1786         << "p="      << pTrklt
1787         << "\n";
1788   }
1789
1790
1791   //=========================================================
1792   // Store clusters
1793   Int_t nselected(0), nc(0);
1794   TObjArray *selected(helper.GetClusters());
1795   if(!selected || !(nselected = selected->GetEntriesFast())){
1796     AliError("Cluster candidates missing !!!");
1797     SetErrorMsg(kAttachClAttach);
1798     return kFALSE;
1799   }
1800   for(Int_t ic(0); ic<nselected; ic++){
1801     if(!(c = (AliTRDcluster*)selected->At(ic))) continue;
1802     Int_t it(c->GetPadTime()),
1803           jr(Int_t(helper.GetRow() != c->GetPadRow())),
1804           idx(it+kNtb*jr);
1805     if(fClusters[idx]){
1806       AliDebug(1, Form("Multiple clusters/tb for D[%03d] Tb[%02d] Row[%2d]", fDet, it, c->GetPadRow()));
1807       continue; // already booked
1808     }
1809     // TODO proper indexing of clusters !!
1810     fIndexes[idx]  = chamber->GetTB(it)->GetGlobalIndex(idxs[idxRow[jr]][ic]);
1811     fClusters[idx] = c;
1812     nc++;
1813   }
1814   AliDebug(2, Form("Clusters Found[%2d] Attached[%2d] RC[%c]", nselected, nc, IsRowCross()?'y':'n'));
1815
1816   // number of minimum numbers of clusters expected for the tracklet
1817   if (nc < kClmin){
1818     AliDebug(1, Form("NOT ENOUGH CLUSTERS %d ATTACHED TO THE TRACKLET [min %d] FROM FOUND %d.", nc, kClmin, ncls));
1819     SetErrorMsg(kAttachClAttach);
1820     return kFALSE;
1821   }
1822   SetN(nc);
1823
1824   // Load calibration parameters for this tracklet
1825   //Calibrate();
1826
1827   // calculate dx for time bins in the drift region (calibration aware)
1828   Float_t x[2] = {0.,0.}; Int_t tb[2]={0,0};
1829   for (Int_t it = t0, irp=0; irp<2 && it < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); it++) {
1830     if(!fClusters[it]) continue;
1831     x[irp]  = fClusters[it]->GetX();
1832     tb[irp] = fClusters[it]->GetLocalTimeBin();
1833     irp++;
1834   }
1835   Int_t dtb = tb[1] - tb[0];
1836   fdX = dtb ? (x[0] - x[1]) / dtb : 0.15;
1837   return kTRUE;
1838 }
1839
1840 //____________________________________________________________
1841 void AliTRDseedV1::Bootstrap(const AliTRDReconstructor *rec)
1842 {
1843 //   Fill in all derived information. It has to be called after recovery from file or HLT.
1844 //   The primitive data are
1845 //   - list of clusters
1846 //   - detector (as the detector will be removed from clusters)
1847 //   - position of anode wire (fX0) - temporary
1848 //   - track reference position and direction
1849 //   - momentum of the track
1850 //   - time bin length [cm]
1851 //
1852 //   A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de> Oct 30th 2008
1853 //
1854   fkReconstructor = rec;
1855   AliTRDgeometry g;
1856   SetPadPlane(g.GetPadPlane(fDet));
1857
1858   //fSnp = fYref[1]/TMath::Sqrt(1+fYref[1]*fYref[1]);
1859   //fTgl = fZref[1];
1860   Int_t n = 0, nshare = 0, nused = 0;
1861   AliTRDcluster **cit = &fClusters[0];
1862   for(Int_t ic = kNclusters; ic--; cit++){
1863     if(!(*cit)) return;
1864     n++;
1865     if((*cit)->IsShared()) nshare++;
1866     if((*cit)->IsUsed()) nused++;
1867   }
1868   SetN(n); SetNUsed(nused); SetNShared(nshare);
1869   Fit();
1870   CookLabels();
1871   GetProbability();
1872 }
1873
1874
1875 //____________________________________________________________________
1876 Bool_t AliTRDseedV1::Fit(UChar_t opt)
1877 {
1878 //
1879 // Linear fit of the clusters attached to the tracklet
1880 //
1881 // Parameters :
1882 //   - opt : switch for tilt pad correction of cluster y position. Options are
1883 //           0 no correction [default]
1884 //           1 full tilt correction [dz/dx and z0]
1885 //           2 pseudo tilt correction [dz/dx from pad-chamber geometry]
1886 //
1887 // Output :
1888 //  True if successful
1889 //
1890 // Detailed description
1891 //
1892 //            Fit in the xy plane
1893 //
1894 // The fit is performed to estimate the y position of the tracklet and the track
1895 // angle in the bending plane. The clusters are represented in the chamber coordinate
1896 // system (with respect to the anode wire - see AliTRDtrackerV1::FollowBackProlongation()
1897 // on how this is set). The x and y position of the cluster and also their variances
1898 // are known from clusterizer level (see AliTRDcluster::GetXloc(), AliTRDcluster::GetYloc(),
1899 // AliTRDcluster::GetSX() and AliTRDcluster::GetSY()).
1900 // If gaussian approximation is used to calculate y coordinate of the cluster the position
1901 // is recalculated taking into account the track angle. The general formula to calculate the
1902 // error of cluster position in the gaussian approximation taking into account diffusion and track
1903 // inclination is given for TRD by:
1904 // BEGIN_LATEX
1905 // #sigma^{2}_{y} = #sigma^{2}_{PRF} + #frac{x#delta_{t}^{2}}{(1+tg(#alpha_{L}))^{2}} + #frac{x^{2}tg^{2}(#phi-#alpha_{L})tg^{2}(#alpha_{L})}{12}
1906 // END_LATEX
1907 //
1908 // Since errors are calculated only in the y directions, radial errors (x direction) are mapped to y
1909 // by projection i.e.
1910 // BEGIN_LATEX
1911 // #sigma_{x|y} = tg(#phi) #sigma_{x}
1912 // END_LATEX
1913 // and also by the lorentz angle correction
1914 //
1915 //            Fit in the xz plane
1916 //
1917 // The "fit" is performed to estimate the radial position (x direction) where pad row cross happens.
1918 // If no pad row crossing the z position is taken from geometry and radial position is taken from the xy
1919 // fit (see below).
1920 //
1921 // There are two methods to estimate the radial position of the pad row cross:
1922 //   1. leading cluster radial position : Here the lower part of the tracklet is considered and the last
1923 // cluster registered (at radial x0) on this segment is chosen to mark the pad row crossing. The error
1924 // of the z estimate is given by :
1925 // BEGIN_LATEX
1926 // #sigma_{z} = tg(#theta) #Delta x_{x_{0}}/12
1927 // END_LATEX
1928 // The systematic errors for this estimation are generated by the following sources:
1929 //   - no charge sharing between pad rows is considered (sharp cross)
1930 //   - missing cluster at row cross (noise peak-up, under-threshold signal etc.).
1931 //
1932 //   2. charge fit over the crossing point : Here the full energy deposit along the tracklet is considered
1933 // to estimate the position of the crossing by a fit in the qx plane. The errors in the q directions are
1934 // parameterized as s_q = q^2. The systematic errors for this estimation are generated by the following sources:
1935 //   - no general model for the qx dependence
1936 //   - physical fluctuations of the charge deposit
1937 //   - gain calibration dependence
1938 //
1939 //            Estimation of the radial position of the tracklet
1940 //
1941 // For pad row cross the radial position is taken from the xz fit (see above). Otherwise it is taken as the
1942 // interpolation point of the tracklet i.e. the point where the error in y of the fit is minimum. The error
1943 // in the y direction of the tracklet is (see AliTRDseedV1::GetCovAt()):
1944 // BEGIN_LATEX
1945 // #sigma_{y} = #sigma^{2}_{y_{0}} + 2xcov(y_{0}, dy/dx) + #sigma^{2}_{dy/dx}
1946 // END_LATEX
1947 // and thus the radial position is:
1948 // BEGIN_LATEX
1949 // x = - cov(y_{0}, dy/dx)/#sigma^{2}_{dy/dx}
1950 // END_LATEX
1951 //
1952 //            Estimation of tracklet position error
1953 //
1954 // The error in y direction is the error of the linear fit at the radial position of the tracklet while in the z
1955 // direction is given by the cluster error or pad row cross error. In case of no pad row cross this is given by:
1956 // BEGIN_LATEX
1957 // #sigma_{y} = #sigma^{2}_{y_{0}} - 2cov^{2}(y_{0}, dy/dx)/#sigma^{2}_{dy/dx} + #sigma^{2}_{dy/dx}
1958 // #sigma_{z} = Pad_{length}/12
1959 // END_LATEX
1960 // For pad row cross the full error is calculated at the radial position of the crossing (see above) and the error
1961 // in z by the width of the crossing region - being a matter of parameterization.
1962 // BEGIN_LATEX
1963 // #sigma_{z} = tg(#theta) #Delta x_{x_{0}}/12
1964 // END_LATEX
1965 // In case of no tilt correction (default in the barrel tracking) the tilt is taken into account by the rotation of
1966 // the covariance matrix. See AliTRDseedV1::GetCovAt() for details.
1967 //
1968 // Author
1969 // A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
1970
1971   if(!fkReconstructor){
1972     AliError("The tracklet needs the reconstruction setup. Please initialize by SetReconstructor().");
1973     return kFALSE;
1974   }
1975   if(!IsCalibrated()) Calibrate();
1976   if(opt>2){
1977     AliWarning(Form("Option [%d] outside range [0, 2]. Using default",opt));
1978     opt=0;
1979   }
1980
1981   const Int_t kClmin = 8;
1982   const Float_t kScalePulls = 10.; // factor to scale y pulls - NOT UNDERSTOOD
1983   // get track direction
1984   Double_t y0   = fYref[0];
1985   Double_t dydx = fYref[1];
1986   Double_t z0   = fZref[0];
1987   Double_t dzdx = fZref[1];
1988
1989   AliTRDtrackerV1::AliTRDLeastSquare fitterY;
1990   AliTRDtrackerV1::AliTRDLeastSquare fitterZ;
1991
1992   // book cluster information
1993   Double_t qc[kNclusters], xc[kNclusters], yc[kNclusters], zc[kNclusters], sy[kNclusters];
1994
1995   Bool_t tilt(opt==1)       // full tilt correction
1996         ,pseudo(opt==2)     // pseudo tilt correction
1997         ,rc(IsRowCross())   // row cross candidate
1998         ,kDZDX(IsPrimary());// switch dzdx calculation for barrel primary tracks
1999   Int_t n(0);   // clusters used in fit
2000   AliTRDcluster *c(NULL), *cc(NULL), **jc = &fClusters[0];
2001   const AliTRDrecoParam* const recoParam = fkReconstructor->GetRecoParam(); //the dynamic cast in GetRecoParam is slow, so caching the pointer to it
2002
2003   const Char_t *tcName[]={"NONE", "FULL", "HALF"};
2004   AliDebug(2, Form("Options : TC[%s] dzdx[%c]", tcName[opt], kDZDX?'Y':'N'));
2005
2006
2007   for (Int_t ic=0; ic<kNclusters; ic++, ++jc) {
2008     xc[ic]  = -1.; yc[ic]  = 999.; zc[ic]  = 999.; sy[ic]  = 0.;
2009     if(!(c = (*jc))) continue;
2010     if(!c->IsInChamber()) continue;
2011     // compute pseudo tilt correction
2012     if(kDZDX){
2013       fZfit[0] = c->GetZ();
2014       if(rc){
2015         for(Int_t kc=AliTRDseedV1::kNtb; kc<AliTRDseedV1::kNclusters; kc++){
2016           if(!(cc=fClusters[kc])) continue;
2017           if(!cc->IsInChamber()) continue;
2018           fZfit[0] += cc->GetZ(); fZfit[0] *= 0.5;
2019           break;
2020         }
2021       }
2022       fZfit[1] = fZfit[0]/fX0;
2023       if(rc){
2024         fZfit[0] += fZfit[1]*0.5*AliTRDgeometry::CdrHght();
2025         fZfit[1] = fZfit[0]/fX0;
2026       }
2027       kDZDX=kFALSE;
2028     }
2029
2030 //   TODO use this information to adjust cluster error parameterization
2031 //     Float_t w = 1.;
2032 //     if(c->GetNPads()>4) w = .5;
2033 //     if(c->GetNPads()>5) w = .2;
2034
2035     // cluster charge
2036     qc[n]   = TMath::Abs(c->GetQ());
2037     // pad row of leading
2038
2039     xc[n]   = fX0 - c->GetX();
2040
2041     // Recalculate cluster error based on tracking information
2042     c->SetSigmaY2(fS2PRF, fDiffT, fExB, xc[n], -1./*zcorr?zt:-1.*/, dydx);
2043     c->SetSigmaZ2(fPad[0]*fPad[0]/12.); // for HLT
2044     sy[n]  = TMath::Sqrt(c->GetSigmaY2());
2045
2046     yc[n]  = recoParam->UseGAUS() ?
2047       c->GetYloc(y0, sy[n], GetPadWidth()): c->GetY();
2048     zc[n]   = c->GetZ();
2049
2050     //optional r-phi correction
2051     //printf("   n[%2d] yc[%7.5f] ", n, yc[n]);
2052     Float_t correction(0.);
2053     if(tilt) correction = fPad[2]*(xc[n]*dzdx + zc[n] - z0);
2054     else if(pseudo) correction = fPad[2]*(xc[n]*fZfit[1] + zc[n]-fZfit[0]);
2055     yc[n]-=correction;
2056     //printf("corr(%s%s)[%7.5f] yc1[%7.5f]\n", (tilt?"TC":""), (zcorr?"PC":""), correction, yc[n]);
2057
2058     AliDebug(5, Form("  tb[%2d] dx[%6.3f] y[%6.2f+-%6.3f]", c->GetLocalTimeBin(), xc[n], yc[n], sy[n]));
2059     fitterY.AddPoint(&xc[n], yc[n], sy[n]);
2060     if(rc) fitterZ.AddPoint(&xc[n], qc[n]*(ic<kNtb?1.:-1.), 1.);
2061     n++;
2062   }
2063
2064   // to few clusters
2065   if (n < kClmin){
2066     AliDebug(1, Form("Not enough clusters to fit. Clusters: Attached[%d] Fit[%d].", GetN(), n));
2067     SetErrorMsg(kFitCl);
2068     return kFALSE;
2069   }
2070   // fit XY
2071   if(!fitterY.Eval()){
2072     AliDebug(1, "Fit Y failed.");
2073     SetErrorMsg(kFitFailedY);
2074     return kFALSE;
2075   }
2076   fYfit[0] = fitterY.GetFunctionParameter(0);
2077   fYfit[1] = -fitterY.GetFunctionParameter(1);
2078   // store covariance
2079   Double_t p[3];
2080   fitterY.GetCovarianceMatrix(p);
2081   fCov[0] = kScalePulls*p[1]; // variance of y0
2082   fCov[1] = kScalePulls*p[2]; // covariance of y0, dydx
2083   fCov[2] = kScalePulls*p[0]; // variance of dydx
2084   // the ref radial position is set at the minimum of
2085   // the y variance of the tracklet
2086   fX   = -fCov[1]/fCov[2];
2087   fS2Y = fCov[0] +2.*fX*fCov[1] + fX*fX*fCov[2];
2088
2089   Float_t xs=fX+.5*AliTRDgeometry::CamHght();
2090   if(xs < 0. || xs > AliTRDgeometry::CamHght()+AliTRDgeometry::CdrHght()){
2091     AliDebug(1, Form("Ref radial position ouside chamber x[%5.2f].", fX));
2092     SetErrorMsg(kFitFailedY);
2093     return kFALSE;
2094   }
2095
2096 /*    // THE LEADING CLUSTER METHOD for z fit
2097     Float_t xMin = fX0;
2098     Int_t ic=n=kNclusters-1; jc = &fClusters[ic];
2099     AliTRDcluster *c0 =0x0, **kc = &fClusters[kNtb-1];
2100     for(; ic>kNtb; ic--, --jc, --kc){
2101       if((c0 = (*kc)) && c0->IsInChamber() && (xMin>c0->GetX())) xMin = c0->GetX();
2102       if(!(c = (*jc))) continue;
2103       if(!c->IsInChamber()) continue;
2104       zc[kNclusters-1] = c->GetZ();
2105       fX = fX0 - c->GetX();
2106     }
2107     fZfit[0] = .5*(zc[0]+zc[kNclusters-1]); fZfit[1] = 0.;
2108     // Error parameterization
2109     fS2Z     = fdX*fZref[1];
2110     fS2Z    *= fS2Z; fS2Z    *= 0.2887; //  1/sqrt(12)*/
2111
2112   // fit QZ
2113   if(opt!=1 && IsRowCross()){
2114     if(!fitterZ.Eval()) SetErrorMsg(kFitFailedZ);
2115     if(!HasError(kFitFailedZ) && TMath::Abs(fitterZ.GetFunctionParameter(1))>1.e-10){
2116       // TODO - one has to recalculate xy fit based on
2117       // better knowledge of z position
2118 //       Double_t x = -fitterZ.GetFunctionParameter(0)/fitterZ.GetFunctionParameter(1);
2119 //       Double_t z0 = .5*(zc[0]+zc[n-1]);
2120 //       fZfit[0] = z0 + fZfit[1]*x;
2121 //       fZfit[1] = fZfit[0]/fX0;
2122 //       redo fit on xy plane
2123     }
2124     // temporary external error parameterization
2125     fS2Z     = 0.05+0.4*TMath::Abs(fZref[1]); fS2Z *= fS2Z;
2126     // TODO correct formula
2127     //fS2Z     = sigma_x*TMath::Abs(fZref[1]);
2128   } else {
2129     //fZfit[0] = zc[0] + dzdx*0.5*AliTRDgeometry::CdrHght();
2130     fS2Z     = GetPadLength()*GetPadLength()/12.;
2131   }
2132   return kTRUE;
2133 }
2134
2135
2136 //____________________________________________________________________
2137 Bool_t AliTRDseedV1::FitRobust(AliTRDpadPlane *pp, Int_t opt)
2138 {
2139 //
2140 // Linear fit of the clusters attached to the tracklet
2141 //   The fit is performed in local chamber coordinates (27.11.2013) to take into account correctly the misalignment
2142 //   Also the pad row cross is checked here and some background is removed
2143 //
2144 // Author
2145 // A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
2146
2147   TTreeSRedirector *pstreamer(NULL);
2148   const AliTRDrecoParam* const recoParam = fkReconstructor->GetRecoParam();
2149   if( (recoParam->GetStreamLevel(AliTRDrecoParam::kTracker) > 3 && fkReconstructor->IsDebugStreaming()) ||
2150     AliTRDReconstructor::GetStreamLevel()>3 ) pstreamer = fkReconstructor->GetDebugStream(AliTRDrecoParam::kTracker);
2151
2152   // factor to scale y pulls.
2153   // ideally if error parametrization correct this is 1.
2154   //Float_t lyScaler = 1./(AliTRDgeometry::GetLayer(fDet)+1.);
2155   Float_t kScalePulls = 1.;
2156   AliTRDcalibDB *calibration = AliTRDcalibDB::Instance();
2157   if(!calibration){
2158     AliWarning("No access to calibration data");
2159   } else {
2160     // Retrieve the CDB container class with the parametric likelihood
2161     const AliTRDCalTrkAttach *attach = calibration->GetAttachObject();
2162     if(!attach){
2163       AliWarning("No usable AttachClusters calib object.");
2164     } else {
2165       //kScalePulls = attach->GetScaleCov();//*lyScaler;
2166     }
2167     // Retrieve chamber status
2168     SetChmbGood(calibration->IsChamberGood(fDet));
2169     if(!IsChmbGood()) kScalePulls*=10.;
2170   }
2171   AliTRDCommonParam *cp = AliTRDCommonParam::Instance();
2172   Double_t freq(cp?cp->GetSamplingFrequency():10.);
2173
2174   // evaluate locally z and dzdx from TRD only information
2175   if(EstimatedCrossPoint(pp)<0.) return kFALSE;
2176
2177   //printf("D%03d RC[%c] dzdx[%f %f] opt[%d]\n", fDet, IsRowCross()?'y':'n', fZref[1], fZfit[1], opt);
2178   Double_t //xchmb = 0.5 * AliTRDgeometry::AmThick() + AliTRDgeometry::DrThick(),
2179            //zchmb = 0.5 * (pp->GetRow0() + pp->GetRowEnd()),
2180            z0(0.5 * (pp->GetRow0() + pp->GetRowEnd()) + fZfit[0]),
2181            DZ(pp->GetRow0() - pp->GetRowEnd() - pp->GetAnodeWireOffset() + fZfit[0]),
2182            z, d(-1.);
2183   Double_t xc[kNclusters], yc[kNclusters], dz(0.), dzdx(0.),
2184            s2dz(0.), s2dzdx(0.), sy[kNclusters],
2185            s2x((8.33e-2/freq/freq+1.56e-2)*fVD*fVD),  // error of 1tb + error of mean time (TRF)
2186            t2(fPad[2]*fPad[2]),
2187            cs(0.);
2188   Int_t n(0),          // clusters used in fit
2189         row[]={-1, -1},// pad row spanned by the tracklet
2190         col(-1);       // pad column of current cluster
2191   Double_t ycorr(0.); Int_t chg(fYref[1]>0?1:-1);
2192   if(IsRowCross()) ycorr = 0.013 + 0.018*chg/fPt;
2193   else{
2194     if(chg<0 && 1./fPt > 1.5) ycorr = 0.04 + 0.027*chg/fPt;
2195     else if(chg>0)  ycorr = 0.027*chg/fPt;
2196   }
2197
2198   AliTRDcluster *c(NULL), **jc = &fClusters[0];
2199   for(Int_t ic=0; ic<kNtb; ic++, ++jc) {
2200     if(!(c = (*jc))) continue;
2201     if(!c->IsInChamber()) continue;
2202     if(row[0]<0){
2203       row[0] = c->GetPadRow();
2204       z      = pp->GetRowPos(row[0]) - 0.5*pp->GetRowSize(row[0]);
2205       switch(opt){
2206         case 0: // no dz correction (only for RC tracklet) and dzdx from chamber position assuming primary
2207           dzdx  = IsRowCross()?fZfit[1]:0.;
2208           s2dzdx= IsRowCross()?GetS2DZDX(dzdx):0.;
2209           dz    = IsRowCross()?(z - z0):0.;
2210           s2dz  = IsRowCross()?fS2Z:0.;
2211           break;
2212         case 1: // dz correction only for RC tracklet and dzdx from reference
2213           dzdx = fZref[1];
2214           dz   = IsRowCross()?(z - z0):0.;
2215           break;
2216         case 2: // full z correction (z0 & dzdx from reference)
2217           dzdx = fZref[1];
2218           dz   = c->GetZ()-fZref[0];
2219           break;
2220         default:
2221           AliError(Form("Wrong option fit %d !", opt));
2222           break;
2223       }
2224     }
2225     if(col != c->GetPadCol()){
2226       col = c->GetPadCol();
2227       cs  = pp->GetColSize(col);
2228     }
2229     //Use local cluster coordinates - the code should be identical with AliTRDtransform::Transform() !!!
2230     //A.Bercuci 27.11.13
2231     xc[n] = c->GetXloc(fT0, fVD); // c->GetX();
2232     yc[n] = c->GetYloc(pp->GetColPos(col) + .5*cs, fS2PRF, cs) - xc[n]*fExB; //c->GetY();
2233     yc[n]-= fPad[2]*(dz+xc[n]*dzdx);
2234     yc[n]-= ycorr;
2235     if(IsRowCross()){ // estimate closest distance to anode wire
2236       d = DZ-xc[n]*dzdx;
2237       d -= ((Int_t)(2 * d)) / 2.0;
2238       if (d > 0.25) d  = 0.5 - d;
2239     }
2240     // recalculate cluster error from knowledge of the track inclination in the bending plane
2241     // and eventually distance to anode wire
2242     c->SetSigmaY2(fS2PRF, fDiffT, fExB, xc[n], d, fYref[1]);
2243     s2x = c->GetSX(c->GetLocalTimeBin(), d); s2x*=s2x;
2244     sy[n] = c->GetSigmaY2()>0?(TMath::Min(Double_t(c->GetSigmaY2()), 6.4e-3)):6.4e-3;
2245     sy[n]+= t2*(s2dz+xc[n]*xc[n]*s2dzdx+dzdx*dzdx*s2x);
2246     sy[n] = TMath::Sqrt(sy[n]);
2247     n++;
2248   }
2249   for(Int_t ic=kNtb; ic<kNclusters; ic++, ++jc) {
2250     if(!(c = (*jc))) continue;
2251     if(!c->IsInChamber()) continue;
2252     if(row[1]<0){
2253       row[1] = c->GetPadRow();
2254       z      = pp->GetRowPos(row[1]) - 0.5*pp->GetRowSize(row[1]);
2255       switch(opt){
2256         case 0: // no dz correction (only for RC tracklet) and dzdx from chamber position assuming primary
2257           //dzdx = fZfit[1];
2258           dz   = z - z0;
2259           break;
2260         case 1: // dz correction only for RC tracklet and dzdx from reference
2261           //dzdx = fZref[1];
2262           dz   = z - z0;
2263           break;
2264         case 2: // full z correction (z0 & dzdx from reference)
2265           //dzdx = fZref[1];
2266           dz   = c->GetZ()-fZref[0];
2267           break;
2268         default:
2269           AliError(Form("Wrong option fit %d !", opt));
2270           break;
2271       }
2272     }
2273     if(col != c->GetPadCol()){
2274       col = c->GetPadCol();
2275       cs  = pp->GetColSize(col);
2276     }
2277     //Use local cluster coordinates - the code should be identical with AliTRDtransform::Transform() !!!
2278     //A.Bercuci 27.11.13
2279     xc[n] = c->GetXloc(fT0, fVD); // c->GetX();
2280     yc[n] = c->GetYloc(pp->GetColPos(col) + .5*cs, fS2PRF, cs) - xc[n]*fExB ;
2281     yc[n]-= fPad[2]*(dz+xc[n]*dzdx);
2282     yc[n]-= ycorr;
2283
2284     d = DZ-xc[n]*dzdx;
2285     d -= ((Int_t)(2 * d)) / 2.0;
2286     if (d > 0.25) d  = 0.5 - d;
2287     c->SetSigmaY2(fS2PRF, fDiffT, fExB, xc[n], d, fYref[1]);
2288     s2x = c->GetSX(c->GetLocalTimeBin(), d); s2x*=s2x;
2289     sy[n] = c->GetSigmaY2()>0?(TMath::Min(Double_t(c->GetSigmaY2()), 6.4e-3)):6.4e-3;
2290     sy[n]+= t2*(s2dz+xc[n]*xc[n]*s2dzdx+dzdx*dzdx*s2x);
2291     sy[n] = TMath::Sqrt(sy[n]);
2292     n++;
2293   }
2294
2295   UChar_t status(0);
2296   // the ref radial position is set close to the minimum of
2297   // the y variance of the tracklet
2298   fX   = 0.;//set reference to anode wire
2299   Double_t par[3] = {0.,0.,fX}, cov[3];
2300   if(!AliTRDtrackletOflHelper::Fit(n, xc, yc, sy, par, 1.5, cov)){
2301     AliDebug(1, Form("Tracklet fit failed D[%03d].", fDet));
2302     SetErrorMsg(kFitCl);
2303     return kFALSE;
2304   }
2305   fYfit[0] = par[0] - fX * par[1];
2306   fYfit[1] = -par[1];
2307   //printf(" yfit: %f [%f] x[%e] dydx[%f]\n", fYfit[0], par[0], fX, par[1]);
2308   // store covariance
2309   fCov[0] = (chg>0?5.:10.)*cov[0]; // variance of y0
2310   fCov[1] = kScalePulls*cov[2]; // covariance of y0, dydx
2311   fCov[2] = kScalePulls*cov[1]; // variance of dydx
2312   // check radial position
2313   Float_t xs=fX+.5*AliTRDgeometry::CamHght();
2314   if(xs < 0. || xs > AliTRDgeometry::CamHght()+AliTRDgeometry::CdrHght()){
2315     AliDebug(1, Form("Ref radial position x[%5.2f] ouside D[%3d].", fX, fDet));
2316     SetErrorMsg(kFitFailedY);
2317     return kFALSE;
2318   }
2319   if(!IsRowCross()){
2320     Double_t padEffLength(fPad[0] - TMath::Abs(dzdx));
2321     fS2Z = padEffLength*padEffLength/12.;
2322   }
2323   AliDebug(2, Form("[I]  x[cm]=%6.2f y[cm]=%+5.2f z[cm]=%+6.2f dydx[deg]=%+5.2f", GetX(), GetY(), GetZ(), TMath::ATan(fYfit[1])*TMath::RadToDeg()));
2324
2325   if(pstreamer){
2326     Float_t x= fX0 -fX,
2327             y = GetY(),
2328             yt = fYref[0]-fX*fYref[1];
2329     SETBIT(status, 2);
2330     TVectorD vcov(3); vcov[0]=cov[0];vcov[1]=cov[1];vcov[2]=cov[2];
2331     Double_t sm(0.), chi2(0.), tmp, dy[kNclusters];
2332     for(Int_t ic(0); ic<n; ic++){
2333       sm   += sy[ic];
2334       dy[ic] = yc[ic]-(fYfit[0]+(xc[ic]-fX0)*fYfit[1]); tmp = dy[ic]/sy[ic];
2335       chi2 += tmp*tmp;
2336     }
2337     sm /= n; chi2 = TMath::Sqrt(chi2);
2338     Double_t m(0.), s(0.);
2339     AliMathBase::EvaluateUni(n, dy, m, s, 0);
2340     (*pstreamer) << "FitRobust4"
2341       << "stat=" << status
2342       << "opt="  << opt
2343       << "ncl="  << n
2344       << "det="  << fDet
2345       << "x0="   << fX0
2346       << "y0="   << fYfit[0]
2347       << "x="    << x
2348       << "y="    << y
2349       << "dydx=" << fYfit[1]
2350       << "pt="   << fPt
2351       << "yt="   << yt
2352       << "dydxt="<< fYref[1]
2353       << "cov="  << &vcov
2354       << "chi2=" << chi2
2355       << "sm="   << sm
2356       << "ss="   << s
2357       << "\n";
2358   }
2359   return kTRUE;
2360 }
2361
2362 //___________________________________________________________________
2363 void AliTRDseedV1::SetXYZ(TGeoHMatrix *mDet)
2364 {
2365 // Apply alignment to the local position of tracklet
2366 // A.Bercuci @ 27.11.2013
2367
2368   Double_t loc[] = {AliTRDgeometry::AnodePos(), GetLocalY(), fZfit[0]}, trk[3]={0.};
2369   mDet->LocalToMaster(loc, trk);
2370   fX0 = trk[0];
2371   fY  = trk[1];
2372   fZ  = trk[2];
2373   return;
2374 //   if(!IsRowCross()){/*fZfit[1] *= 1.09;*/ return;}
2375 //   // recalculate local z coordinate assuming primary track for row cross tracklets
2376 //   Double_t zoff(fZ-fZfit[0]); // no alignment aware !
2377 //   //printf("SetXYZ : zoff[%f] zpp[%f]\n", zoff, zpp);
2378 //   fZfit[0] = fX0*fZfit[1] - zoff;
2379 //   // recalculate tracking coordinates based on the new z coordinate
2380 //   loc[2] = fZfit[0];
2381 //   mDet->LocalToMaster(loc, trk);
2382 //   fX0 = trk[0];
2383 //   fY  = trk[1];
2384 //   fZ  = trk[2];//-zcorr[stk];
2385   //fZfit[1] = /*(IsRowCross()?1.05:1.09)**/fZ/(fX0-fS2Y);
2386 }
2387
2388
2389 //___________________________________________________________________
2390 void AliTRDseedV1::Print(Option_t *o) const
2391 {
2392   //
2393   // Printing the seedstatus
2394   //
2395
2396   AliInfo(Form("Det[%3d] X0[%7.2f] Pad{L[%5.2f] W[%5.2f] Tilt[%+6.2f]}", fDet, fX0, GetPadLength(), GetPadWidth(), GetTilt()));
2397   AliInfo(Form("N[%2d] Nused[%2d] Nshared[%2d] [%d]", GetN(), GetNUsed(), GetNShared(), fN));
2398   AliInfo(Form("FLAGS : RC[%c] Kink[%c] SA[%c]", IsRowCross()?'y':'n', IsKink()?'y':'n', IsStandAlone()?'y':'n'));
2399   AliInfo(Form("CALIB PARAMS :  T0[%5.2f]  Vd[%5.2f]  s2PRF[%5.2f]  ExB[%5.2f]  Dl[%5.2f]  Dt[%5.2f]", fT0, fVD, fS2PRF, fExB, fDiffL, fDiffT));
2400
2401   Double_t cov[3], x=GetX();
2402   GetCovAt(x, cov);
2403   AliInfo("    |  x[cm]  |      y[cm]       |      z[cm]      |  dydx |  dzdx |");
2404   AliInfo(Form("Fit | %7.2f | %7.2f+-%7.2f | %7.2f+-%7.2f| %5.2f | ----- |", x, GetY(), TMath::Sqrt(cov[0]), GetZ(), TMath::Sqrt(cov[2]), fYfit[1]));
2405   AliInfo(Form("Ref | %7.2f | %7.2f+-%7.2f | %7.2f+-%7.2f| %5.2f | %5.2f |", x, fYref[0]-fX*fYref[1], TMath::Sqrt(fRefCov[0]), fZref[0]-fX*fYref[1], TMath::Sqrt(fRefCov[2]), fYref[1], fZref[1]));
2406   AliInfo(Form("P / Pt [GeV/c] = %f / %f", GetMomentum(), fPt));
2407   if(IsStandAlone()) AliInfo(Form("C Rieman / Vertex [1/cm] = %f / %f", fC[0], fC[1]));
2408   AliInfo(Form("dEdx [a.u.]    = %f / %f / %f / %f / %f/ %f / %f / %f", fdEdx[0], fdEdx[1], fdEdx[2], fdEdx[3], fdEdx[4], fdEdx[5], fdEdx[6], fdEdx[7]));
2409   AliInfo(Form("PID            = %5.3f / %5.3f / %5.3f / %5.3f / %5.3f", fProb[0], fProb[1], fProb[2], fProb[3], fProb[4]));
2410
2411   if(strcmp(o, "a")!=0) return;
2412
2413   AliTRDcluster* const* jc = &fClusters[0];
2414   for(int ic=0; ic<kNclusters; ic++, jc++) {
2415     if(!(*jc)) continue;
2416     (*jc)->Print(o);
2417   }
2418 }
2419
2420
2421 //___________________________________________________________________
2422 Bool_t AliTRDseedV1::IsEqual(const TObject *o) const
2423 {
2424   // Checks if current instance of the class has the same essential members
2425   // as the given one
2426
2427   if(!o) return kFALSE;
2428   const AliTRDseedV1 *inTracklet = dynamic_cast<const AliTRDseedV1*>(o);
2429   if(!inTracklet) return kFALSE;
2430
2431   for (Int_t i = 0; i < 2; i++){
2432     if ( fYref[i] != inTracklet->fYref[i] ) return kFALSE;
2433     if ( fZref[i] != inTracklet->fZref[i] ) return kFALSE;
2434   }
2435
2436   if ( TMath::Abs(fS2Y - inTracklet->fS2Y)>1.e-10 ) return kFALSE;
2437   if ( TMath::Abs(GetTilt() - inTracklet->GetTilt())>1.e-10 ) return kFALSE;
2438   if ( TMath::Abs(GetPadLength() - inTracklet->GetPadLength())>1.e-10 ) return kFALSE;
2439
2440   for (Int_t i = 0; i < kNclusters; i++){
2441 //     if ( fX[i] != inTracklet->GetX(i) ) return kFALSE;
2442 //     if ( fY[i] != inTracklet->GetY(i) ) return kFALSE;
2443 //     if ( fZ[i] != inTracklet->GetZ(i) ) return kFALSE;
2444     if ( fIndexes[i] != inTracklet->fIndexes[i] ) return kFALSE;
2445   }
2446 //   if ( fUsable != inTracklet->fUsable ) return kFALSE;
2447
2448   for (Int_t i=0; i < 2; i++){
2449     if ( fYfit[i] != inTracklet->fYfit[i] ) return kFALSE;
2450     if ( fZfit[i] != inTracklet->fZfit[i] ) return kFALSE;
2451     if ( fLabels[i] != inTracklet->fLabels[i] ) return kFALSE;
2452   }
2453
2454 /*  if ( fMeanz != inTracklet->GetMeanz() ) return kFALSE;
2455   if ( fZProb != inTracklet->GetZProb() ) return kFALSE;*/
2456   if ( fN != inTracklet->fN ) return kFALSE;
2457   //if ( fNUsed != inTracklet->fNUsed ) return kFALSE;
2458   //if ( fFreq != inTracklet->GetFreq() ) return kFALSE;
2459   //if ( fNChange != inTracklet->GetNChange() ) return kFALSE;
2460
2461   if ( TMath::Abs(fC[0] - inTracklet->fC[0])>1.e-10 ) return kFALSE;
2462   //if ( fCC != inTracklet->GetCC() ) return kFALSE;
2463   if ( TMath::Abs(fChi2 - inTracklet->fChi2)>1.e-10 ) return kFALSE;
2464   //  if ( fChi2Z != inTracklet->GetChi2Z() ) return kFALSE;
2465
2466   if ( fDet != inTracklet->fDet ) return kFALSE;
2467   if ( TMath::Abs(fPt - inTracklet->fPt)>1.e-10 ) return kFALSE;
2468   if ( TMath::Abs(fdX - inTracklet->fdX)>1.e-10 ) return kFALSE;
2469
2470   for (Int_t iCluster = 0; iCluster < kNclusters; iCluster++){
2471     AliTRDcluster *curCluster = fClusters[iCluster];
2472     AliTRDcluster *inCluster = inTracklet->fClusters[iCluster];
2473     if (curCluster && inCluster){
2474       if (! curCluster->IsEqual(inCluster) ) {
2475         curCluster->Print();
2476         inCluster->Print();
2477         return kFALSE;
2478       }
2479     } else {
2480       // if one cluster exists, and corresponding
2481       // in other tracklet doesn't - return kFALSE
2482       if(curCluster || inCluster) return kFALSE;
2483     }
2484   }
2485   return kTRUE;
2486 }
2487