TRD/AliTRDseedV1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2 * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3 *                                                                        *
   4 * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5 * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6 *                                                                        *
   7 * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8 * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9 * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10 * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11 * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12 * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13 * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  19 ////
  20 //  The TRD offline tracklet
  21 //
  22 // The running horse of the TRD reconstruction. The following tasks are preformed:
  23 //   1. Clusters attachment to tracks based on prior information stored at tracklet level (see AttachClusters)
  24 //   2. Clusters position recalculation based on track information (see GetClusterXY and Fit)
  25 //   3. Cluster error parametrization recalculation (see Fit)
  26 //   4. Linear track approximation (Fit)
  27 //   5. Optimal position (including z estimate for pad row cross tracklets) and covariance matrix of the track fit inside one TRD chamber (Fit)
  28 //   6. Tilt pad correction and systematic effects (GetCovAt)
  29 //   7. dEdx calculation (CookdEdx)
  30 //   8. PID probabilities estimation (CookPID)
  31 //
  32 //  Authors:                                                              //
  33 //    Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>                                     //
  34 //    Markus Fasel <M.Fasel@gsi.de>                                       //
  35 //                                                                        //
  36 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  37
  38 #include "TMath.h"
  39 #include "TLinearFitter.h"
  40 #include "TClonesArray.h" // tmp
  41 #include <TTreeStream.h>
  42
  43 #include "AliLog.h"
  44 #include "AliMathBase.h"
  45 #include "AliCDBManager.h"
  46 #include "AliTracker.h"
  47
  48 #include "AliTRDpadPlane.h"
  49 #include "AliTRDcluster.h"
  50 #include "AliTRDseedV1.h"
  51 #include "AliTRDtrackV1.h"
  52 #include "AliTRDcalibDB.h"
  53 #include "AliTRDchamberTimeBin.h"
  54 #include "AliTRDtrackingChamber.h"
  55 #include "AliTRDtrackerV1.h"
  56 #include "AliTRDReconstructor.h"
  57 #include "AliTRDrecoParam.h"
  58 #include "AliTRDCommonParam.h"
  59
  60 #include "Cal/AliTRDCalPID.h"
  61 #include "Cal/AliTRDCalROC.h"
  62 #include "Cal/AliTRDCalDet.h"
  63
  64 ClassImp(AliTRDseedV1)
  65
  66 //____________________________________________________________________
  67 AliTRDseedV1::AliTRDseedV1(Int_t det)
  68   :AliTRDtrackletBase()
  69   ,fReconstructor(0x0)
  70   ,fClusterIter(0x0)
  71   ,fExB(0.)
  72   ,fVD(0.)
  73   ,fT0(0.)
  74   ,fS2PRF(0.)
  75   ,fDiffL(0.)
  76   ,fDiffT(0.)
  77   ,fClusterIdx(0)
  78   ,fN(0)
  79   ,fDet(det)
  80   ,fPt(0.)
  81   ,fdX(0.)
  82   ,fX0(0.)
  83   ,fX(0.)
  84   ,fY(0.)
  85   ,fZ(0.)
  86   ,fS2Y(0.)
  87   ,fS2Z(0.)
  88   ,fC(0.)
  89   ,fChi2(0.)
  90 {
  91   //
  92   // Constructor
  93   //
  94   for(Int_t ic=kNclusters; ic--;) fIndexes[ic] = -1;
  95   memset(fClusters, 0, kNclusters*sizeof(AliTRDcluster*));
  96   memset(fPad, 0, 3*sizeof(Float_t));
  97   fYref[0] = 0.; fYref[1] = 0.;
  98   fZref[0] = 0.; fZref[1] = 0.;
  99   fYfit[0] = 0.; fYfit[1] = 0.;
 100   fZfit[0] = 0.; fZfit[1] = 0.;
 101   memset(fdEdx, 0, kNslices*sizeof(Float_t));
 102   for(int ispec=0; ispec<AliPID::kSPECIES; ispec++) fProb[ispec]  = -1.;
 103   fLabels[0]=-1; fLabels[1]=-1; // most freq MC labels
 104   fLabels[2]=0;  // number of different labels for tracklet
 105   memset(fRefCov, 0, 3*sizeof(Double_t));
 106   // covariance matrix [diagonal]
 107   // default sy = 200um and sz = 2.3 cm
 108   fCov[0] = 4.e-4; fCov[1] = 0.; fCov[2] = 5.3;
 109   SetStandAlone(kFALSE);
 110 }
 111
 112 //____________________________________________________________________
 113 AliTRDseedV1::AliTRDseedV1(const AliTRDseedV1 &ref)
 114   :AliTRDtrackletBase((AliTRDtrackletBase&)ref)
 115   ,fReconstructor(0x0)
 116   ,fClusterIter(0x0)
 117   ,fExB(0.)
 118   ,fVD(0.)
 119   ,fT0(0.)
 120   ,fS2PRF(0.)
 121   ,fDiffL(0.)
 122   ,fDiffT(0.)
 123   ,fClusterIdx(0)
 124   ,fN(0)
 125   ,fDet(-1)
 126   ,fPt(0.)
 127   ,fdX(0.)
 128   ,fX0(0.)
 129   ,fX(0.)
 130   ,fY(0.)
 131   ,fZ(0.)
 132   ,fS2Y(0.)
 133   ,fS2Z(0.)
 134   ,fC(0.)
 135   ,fChi2(0.)
 136 {
 137   //
 138   // Copy Constructor performing a deep copy
 139   //
 140   if(this != &ref){
 141     ref.Copy(*this);
 142   }
 143   SetBit(kOwner, kFALSE);
 144   SetStandAlone(ref.IsStandAlone());
 145 }
 146
 147
 148 //____________________________________________________________________
 149 AliTRDseedV1& AliTRDseedV1::operator=(const AliTRDseedV1 &ref)
 150 {
 151   //
 152   // Assignment Operator using the copy function
 153   //
 154
 155   if(this != &ref){
 156     ref.Copy(*this);
 157   }
 158   SetBit(kOwner, kFALSE);
 159
 160   return *this;
 161 }
 162
 163 //____________________________________________________________________
 164 AliTRDseedV1::~AliTRDseedV1()
 165 {
 166   //
 167   // Destructor. The RecoParam object belongs to the underlying tracker.
 168   //
 169
 170   //printf("I-AliTRDseedV1::~AliTRDseedV1() : Owner[%s]\n", IsOwner()?"YES":"NO");
 171
 172   if(IsOwner()) {
 173     for(int itb=0; itb<kNclusters; itb++){
 174       if(!fClusters[itb]) continue;
 175       //AliInfo(Form("deleting c %p @ %d", fClusters[itb], itb));
 176       delete fClusters[itb];
 177       fClusters[itb] = 0x0;
 178     }
 179   }
 180 }
 181
 182 //____________________________________________________________________
 183 void AliTRDseedV1::Copy(TObject &ref) const
 184 {
 185   //
 186   // Copy function
 187   //
 188
 189   //AliInfo("");
 190   AliTRDseedV1 &target = (AliTRDseedV1 &)ref;
 191
 192   target.fReconstructor = fReconstructor;
 193   target.fClusterIter   = 0x0;
 194   target.fExB           = fExB;
 195   target.fVD            = fVD;
 196   target.fT0            = fT0;
 197   target.fS2PRF         = fS2PRF;
 198   target.fDiffL         = fDiffL;
 199   target.fDiffT         = fDiffT;
 200   target.fClusterIdx    = 0;
 201   target.fN             = fN;
 202   target.fDet           = fDet;
 203   target.fPt            = fPt;
 204   target.fdX            = fdX;
 205   target.fX0            = fX0;
 206   target.fX             = fX;
 207   target.fY             = fY;
 208   target.fZ             = fZ;
 209   target.fS2Y           = fS2Y;
 210   target.fS2Z           = fS2Z;
 211   target.fC             = fC;
 212   target.fChi2          = fChi2;
 213
 214   memcpy(target.fIndexes, fIndexes, kNclusters*sizeof(Int_t));
 215   memcpy(target.fClusters, fClusters, kNclusters*sizeof(AliTRDcluster*));
 216   memcpy(target.fPad, fPad, 3*sizeof(Float_t));
 217   target.fYref[0] = fYref[0]; target.fYref[1] = fYref[1];
 218   target.fZref[0] = fZref[0]; target.fZref[1] = fZref[1];
 219   target.fYfit[0] = fYfit[0]; target.fYfit[1] = fYfit[1];
 220   target.fZfit[0] = fZfit[0]; target.fZfit[1] = fZfit[1];
 221   memcpy(target.fdEdx, fdEdx, kNslices*sizeof(Float_t));
 222   memcpy(target.fProb, fProb, AliPID::kSPECIES*sizeof(Float_t));
 223   memcpy(target.fLabels, fLabels, 3*sizeof(Int_t));
 224   memcpy(target.fRefCov, fRefCov, 3*sizeof(Double_t));
 225   memcpy(target.fCov, fCov, 3*sizeof(Double_t));
 226
 227   TObject::Copy(ref);
 228 }
 229
 230
 231 //____________________________________________________________
 232 Bool_t AliTRDseedV1::Init(AliTRDtrackV1 *track)
 233 {
 234 // Initialize this tracklet using the track information
 235 //
 236 // Parameters:
 237 //   track - the TRD track used to initialize the tracklet
 238 //
 239 // Detailed description
 240 // The function sets the starting point and direction of the
 241 // tracklet according to the information from the TRD track.
 242 //
 243 // Caution
 244 // The TRD track has to be propagated to the beginning of the
 245 // chamber where the tracklet will be constructed
 246 //
 247
 248   Double_t y, z;
 249   if(!track->GetProlongation(fX0, y, z)) return kFALSE;
 250   UpDate(track);
 251   return kTRUE;
 252 }
 253
 254
 255 //_____________________________________________________________________________
 256 void AliTRDseedV1::Reset()
 257 {
 258   //
 259   // Reset seed
 260   //
 261   fExB=0.;fVD=0.;fT0=0.;fS2PRF=0.;
 262   fDiffL=0.;fDiffT=0.;
 263   fClusterIdx=0;
 264   fN=0;
 265   fDet=-1;
 266   fPt=0.;
 267   fdX=0.;fX0=0.; fX=0.; fY=0.; fZ=0.;
 268   fS2Y=0.; fS2Z=0.;
 269   fC=0.; fChi2 = 0.;
 270
 271   for(Int_t ic=kNclusters; ic--;) fIndexes[ic] = -1;
 272   memset(fClusters, 0, kNclusters*sizeof(AliTRDcluster*));
 273   memset(fPad, 0, 3*sizeof(Float_t));
 274   fYref[0] = 0.; fYref[1] = 0.;
 275   fZref[0] = 0.; fZref[1] = 0.;
 276   fYfit[0] = 0.; fYfit[1] = 0.;
 277   fZfit[0] = 0.; fZfit[1] = 0.;
 278   memset(fdEdx, 0, kNslices*sizeof(Float_t));
 279   for(int ispec=0; ispec<AliPID::kSPECIES; ispec++) fProb[ispec]  = -1.;
 280   fLabels[0]=-1; fLabels[1]=-1; // most freq MC labels
 281   fLabels[2]=0;  // number of different labels for tracklet
 282   memset(fRefCov, 0, 3*sizeof(Double_t));
 283   // covariance matrix [diagonal]
 284   // default sy = 200um and sz = 2.3 cm
 285   fCov[0] = 4.e-4; fCov[1] = 0.; fCov[2] = 5.3;
 286 }
 287
 288 //____________________________________________________________________
 289 void AliTRDseedV1::UpDate(const AliTRDtrackV1 *trk)
 290 {
 291   // update tracklet reference position from the TRD track
 292   // Funny name to avoid the clash with the function AliTRDseed::Update() (has to be made obselete)
 293
 294   Double_t fSnp = trk->GetSnp();
 295   Double_t fTgl = trk->GetTgl();
 296   fPt = trk->Pt();
 297   fYref[1] = fSnp/TMath::Sqrt(1. - fSnp*fSnp);
 298   fZref[1] = fTgl;
 299   SetCovRef(trk->GetCovariance());
 300
 301   Double_t dx = trk->GetX() - fX0;
 302   fYref[0] = trk->GetY() - dx*fYref[1];
 303   fZref[0] = trk->GetZ() - dx*fZref[1];
 304 }
 305
 306 //_____________________________________________________________________________
 307 void AliTRDseedV1::UpdateUsed()
 308 {
 309   //
 310   // Calculate number of used clusers in the tracklet
 311   //
 312
 313   Int_t nused = 0, nshared = 0;
 314   for (Int_t i = kNclusters; i--; ) {
 315     if (!fClusters[i]) continue;
 316     if(fClusters[i]->IsUsed()){
 317       nused++;
 318     } else if(fClusters[i]->IsShared()){
 319       if(IsStandAlone()) nused++;
 320       else nshared++;
 321     }
 322   }
 323   SetNUsed(nused);
 324   SetNShared(nshared);
 325 }
 326
 327 //_____________________________________________________________________________
 328 void AliTRDseedV1::UseClusters()
 329 {
 330   //
 331   // Use clusters
 332   //
 333   // In stand alone mode:
 334   // Clusters which are marked as used or shared from another track are
 335   // removed from the tracklet
 336   //
 337   // In barrel mode:
 338   // - Clusters which are used by another track become shared
 339   // - Clusters which are attached to a kink track become shared
 340   //
 341   AliTRDcluster **c = &fClusters[0];
 342   for (Int_t ic=kNclusters; ic--; c++) {
 343     if(!(*c)) continue;
 344     if(IsStandAlone()){
 345       if((*c)->IsShared() || (*c)->IsUsed()){
 346         if((*c)->IsShared()) SetNShared(GetNShared()-1);
 347         else SetNUsed(GetNUsed()-1);
 348         (*c) = 0x0;
 349         fIndexes[ic] = -1;
 350         SetN(GetN()-1);
 351         continue;
 352       }
 353     } else {
 354       if((*c)->IsUsed() || IsKink()){
 355         (*c)->SetShared();
 356         continue;
 357       }
 358     }
 359     (*c)->Use();
 360   }
 361 }
 362
 363
 364
 365 //____________________________________________________________________
 366 void AliTRDseedV1::CookdEdx(Int_t nslices)
 367 {
 368 // Calculates average dE/dx for all slices and store them in the internal array fdEdx.
 369 //
 370 // Parameters:
 371 //  nslices : number of slices for which dE/dx should be calculated
 372 // Output:
 373 //  store results in the internal array fdEdx. This can be accessed with the method
 374 //  AliTRDseedV1::GetdEdx()
 375 //
 376 // Detailed description
 377 // Calculates average dE/dx for all slices. Depending on the PID methode
 378 // the number of slices can be 3 (LQ) or 8(NN).
 379 // The calculation of dQ/dl are done using the tracklet fit results (see AliTRDseedV1::GetdQdl(Int_t))
 380 //
 381 // The following effects are included in the calculation:
 382 // 1. calibration values for t0 and vdrift (using x coordinate to calculate slice)
 383 // 2. cluster sharing (optional see AliTRDrecoParam::SetClusterSharing())
 384 // 3. cluster size
 385 //
 386
 387   Int_t nclusters[kNslices];
 388   memset(nclusters, 0, kNslices*sizeof(Int_t));
 389   memset(fdEdx, 0, kNslices*sizeof(Float_t));
 390
 391   const Double_t kDriftLength = (.5 * AliTRDgeometry::AmThick() + AliTRDgeometry::DrThick());
 392
 393   AliTRDcluster *c = 0x0;
 394   for(int ic=0; ic<AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); ic++){
 395     if(!(c = fClusters[ic]) && !(c = fClusters[ic+kNtb])) continue;
 396     Float_t dx = TMath::Abs(fX0 - c->GetX());
 397
 398     // Filter clusters for dE/dx calculation
 399
 400     // 1.consider calibration effects for slice determination
 401     Int_t slice;
 402     if(dx<kDriftLength){ // TODO should be replaced by c->IsInChamber()
 403       slice = Int_t(dx * nslices / kDriftLength);
 404     } else slice = c->GetX() < fX0 ? nslices-1 : 0;
 405
 406
 407     // 2. take sharing into account
 408     Float_t w = /*c->IsShared() ? .5 :*/ 1.;
 409
 410     // 3. take into account large clusters TODO
 411     //w *= c->GetNPads() > 3 ? .8 : 1.;
 412
 413     //CHECK !!!
 414     fdEdx[slice]   += w * GetdQdl(ic); //fdQdl[ic];
 415     nclusters[slice]++;
 416   } // End of loop over clusters
 417
 418   //if(fReconstructor->GetPIDMethod() == AliTRDReconstructor::kLQPID){
 419   if(nslices == AliTRDpidUtil::kLQslices){
 420   // calculate mean charge per slice (only LQ PID)
 421     for(int is=0; is<nslices; is++){
 422       if(nclusters[is]) fdEdx[is] /= nclusters[is];
 423     }
 424   }
 425 }
 426
 427 //_____________________________________________________________________________
 428 void AliTRDseedV1::CookLabels()
 429 {
 430   //
 431   // Cook 2 labels for seed
 432   //
 433
 434   Int_t labels[200];
 435   Int_t out[200];
 436   Int_t nlab = 0;
 437   for (Int_t i = 0; i < kNclusters; i++) {
 438     if (!fClusters[i]) continue;
 439     for (Int_t ilab = 0; ilab < 3; ilab++) {
 440       if (fClusters[i]->GetLabel(ilab) >= 0) {
 441         labels[nlab] = fClusters[i]->GetLabel(ilab);
 442         nlab++;
 443       }
 444     }
 445   }
 446
 447   fLabels[2] = AliMathBase::Freq(nlab,labels,out,kTRUE);
 448   fLabels[0] = out[0];
 449   if ((fLabels[2]  > 1) && (out[3] > 1)) fLabels[1] = out[2];
 450 }
 451
 452
 453 //____________________________________________________________________
 454 Float_t AliTRDseedV1::GetdQdl(Int_t ic) const
 455 {
 456 // Using the linear approximation of the track inside one TRD chamber (TRD tracklet)
 457 // the charge per unit length can be written as:
 458 // BEGIN_LATEX
 459 // #frac{dq}{dl} = #frac{q_{c}}{dx * #sqrt{1 + #(){#frac{dy}{dx}}^{2}_{fit} + #(){#frac{dy}{dx}}^{2}_{ref}}}
 460 // END_LATEX
 461 // where qc is the total charge collected in the current time bin and dx is the length
 462 // of the time bin. For the moment (Jan 20 2009) only pad row cross corrections are
 463 // considered for the charge but none are applied for drift velocity variations along
 464 // the drift region or assymetry of the TRF
 465 //
 466 // Author : Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
 467 //
 468   Float_t dq = 0.;
 469   if(fClusters[ic]) dq += TMath::Abs(fClusters[ic]->GetQ());
 470   if(fClusters[ic+kNtb]) dq += TMath::Abs(fClusters[ic+kNtb]->GetQ());
 471   if(dq<1.e-3 || fdX < 1.e-3) return 0.;
 472
 473   return dq/fdX/TMath::Sqrt(1. + fYfit[1]*fYfit[1] + fZref[1]*fZref[1]);
 474 }
 475
 476 //____________________________________________________________________
 477 Float_t* AliTRDseedV1::GetProbability(Bool_t force)
 478 {
 479   if(!force) return &fProb[0];
 480   if(!CookPID()) return 0x0;
 481   return &fProb[0];
 482 }
 483
 484 //____________________________________________________________
 485 Bool_t AliTRDseedV1::CookPID()
 486 {
 487 // Fill probability array for tracklet from the DB.
 488 //
 489 // Parameters
 490 //
 491 // Output
 492 //   returns pointer to the probability array and 0x0 if missing DB access
 493 //
 494 // Detailed description
 495
 496
 497   // retrive calibration db
 498   AliTRDcalibDB *calibration = AliTRDcalibDB::Instance();
 499   if (!calibration) {
 500     AliError("No access to calibration data");
 501     return kFALSE;
 502   }
 503
 504   if (!fReconstructor) {
 505     AliError("Reconstructor not set.");
 506     return kFALSE;
 507   }
 508
 509   // Retrieve the CDB container class with the parametric detector response
 510   const AliTRDCalPID *pd = calibration->GetPIDObject(fReconstructor->GetPIDMethod());
 511   if (!pd) {
 512     AliError("No access to AliTRDCalPID object");
 513     return kFALSE;
 514   }
 515   //AliInfo(Form("Method[%d] : %s", fReconstructor->GetRecoParam() ->GetPIDMethod(), pd->IsA()->GetName()));
 516
 517   // calculate tracklet length TO DO
 518   Float_t length = (AliTRDgeometry::AmThick() + AliTRDgeometry::DrThick());
 519   /// TMath::Sqrt((1.0 - fSnp[iPlane]*fSnp[iPlane]) / (1.0 + fTgl[iPlane]*fTgl[iPlane]));
 520
 521   //calculate dE/dx
 522   CookdEdx(fReconstructor->GetNdEdxSlices());
 523
 524   // Sets the a priori probabilities
 525   for(int ispec=0; ispec<AliPID::kSPECIES; ispec++) {
 526     fProb[ispec] = pd->GetProbability(ispec, GetMomentum(), &fdEdx[0], length, GetPlane());
 527   }
 528
 529   return kTRUE;
 530 }
 531
 532 //____________________________________________________________________
 533 Float_t AliTRDseedV1::GetQuality(Bool_t kZcorr) const
 534 {
 535   //
 536   // Returns a quality measurement of the current seed
 537   //
 538
 539   Float_t zcorr = kZcorr ? GetTilt() * (fZfit[0] - fZref[0]) : 0.;
 540   return
 541       .5 * TMath::Abs(18.0 - GetN())
 542     + 10.* TMath::Abs(fYfit[1] - fYref[1])
 543     + 5. * TMath::Abs(fYfit[0] - fYref[0] + zcorr)
 544     + 2. * TMath::Abs(fZfit[0] - fZref[0]) / GetPadLength();
 545 }
 546
 547 //____________________________________________________________________
 548 void AliTRDseedV1::GetCovAt(Double_t x, Double_t *cov) const
 549 {
 550 // Computes covariance in the y-z plane at radial point x (in tracking coordinates)
 551 // and returns the results in the preallocated array cov[3] as :
 552 //   cov[0] = Var(y)
 553 //   cov[1] = Cov(yz)
 554 //   cov[2] = Var(z)
 555 //
 556 // Details
 557 //
 558 // For the linear transformation
 559 // BEGIN_LATEX
 560 // Y = T_{x} X^{T}
 561 // END_LATEX
 562 //   The error propagation has the general form
 563 // BEGIN_LATEX
 564 // C_{Y} = T_{x} C_{X} T_{x}^{T}
 565 // END_LATEX
 566 //  We apply this formula 2 times. First to calculate the covariance of the tracklet
 567 // at point x we consider:
 568 // BEGIN_LATEX
 569 // T_{x} = (1 x); X=(y0 dy/dx); C_{X}=#(){#splitline{Var(y0) Cov(y0, dy/dx)}{Cov(y0, dy/dx) Var(dy/dx)}}
 570 // END_LATEX
 571 // and secondly to take into account the tilt angle
 572 // BEGIN_LATEX
 573 // T_{#alpha} = #(){#splitline{cos(#alpha) __ sin(#alpha)}{-sin(#alpha) __ cos(#alpha)}}; X=(y z); C_{X}=#(){#splitline{Var(y)    0}{0   Var(z)}}
 574 // END_LATEX
 575 //
 576 // using simple trigonometrics one can write for this last case
 577 // BEGIN_LATEX
 578 // C_{Y}=#frac{1}{1+tg^{2}#alpha} #(){#splitline{(#sigma_{y}^{2}+tg^{2}#alpha#sigma_{z}^{2}) __ tg#alpha(#sigma_{z}^{2}-#sigma_{y}^{2})}{tg#alpha(#sigma_{z}^{2}-#sigma_{y}^{2}) __ (#sigma_{z}^{2}+tg^{2}#alpha#sigma_{y}^{2})}}
 579 // END_LATEX
 580 // which can be aproximated for small alphas (2 deg) with
 581 // BEGIN_LATEX
 582 // C_{Y}=#(){#splitline{#sigma_{y}^{2} __ (#sigma_{z}^{2}-#sigma_{y}^{2})tg#alpha}{((#sigma_{z}^{2}-#sigma_{y}^{2})tg#alpha __ #sigma_{z}^{2}}}
 583 // END_LATEX
 584 //
 585 // before applying the tilt rotation we also apply systematic uncertainties to the tracklet
 586 // position which can be tunned from outside via the AliTRDrecoParam::SetSysCovMatrix(). They might
 587 // account for extra misalignment/miscalibration uncertainties.
 588 //
 589 // Author :
 590 // Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
 591 // Date : Jan 8th 2009
 592 //
 593
 594
 595   Double_t xr     = fX0-x;
 596   Double_t sy2    = fCov[0] +2.*xr*fCov[1] + xr*xr*fCov[2];
 597   Double_t sz2    = GetPadLength()*GetPadLength()/12.;
 598
 599   // insert systematic uncertainties
 600   if(fReconstructor){
 601     Double_t sys[15]; memset(sys, 0, 15*sizeof(Double_t));
 602     fReconstructor->GetRecoParam()->GetSysCovMatrix(sys);
 603     sy2 += sys[0];
 604     sz2 += sys[1];
 605   }
 606   // rotate covariance matrix
 607   Double_t t2 = GetTilt()*GetTilt();
 608   Double_t correction = 1./(1. + t2);
 609   cov[0] = (sy2+t2*sz2)*correction;
 610   cov[1] = GetTilt()*(sz2 - sy2)*correction;
 611   cov[2] = (t2*sy2+sz2)*correction;
 612 }
 613
 614 //____________________________________________________________
 615 Double_t AliTRDseedV1::GetCovSqrt(Double_t *c, Double_t *d)
 616 {
 617 // Helper function to calculate the square root of the covariance matrix.
 618 // The input matrix is stored in the vector c and the result in the vector d.
 619 // Both arrays have to be initialized by the user with at least 3 elements. Return negative in case of failure.
 620 //
 621 // For calculating the square root of the symmetric matrix c
 622 // the following relation is used:
 623 // BEGIN_LATEX
 624 // C^{1/2} = VD^{1/2}V^{-1}
 625 // END_LATEX
 626 // with V being the matrix with the n eigenvectors as columns.
 627 // In case C is symmetric the followings are true:
 628 //   - matrix D is diagonal with the diagonal given by the eigenvalues of C
 629 //   - V = V^{-1}
 630 //
 631 // Author A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
 632 // Date   Mar 19 2009
 633
 634   Double_t L[2], // eigenvalues
 635            V[3]; // eigenvectors
 636   // the secular equation and its solution :
 637   // (c[0]-L)(c[2]-L)-c[1]^2 = 0
 638   // L^2 - L*Tr(c)+DET(c) = 0
 639   // L12 = [Tr(c) +- sqrt(Tr(c)^2-4*DET(c))]/2
 640   Double_t Tr = c[0]+c[2],           // trace
 641           DET = c[0]*c[2]-c[1]*c[1]; // determinant
 642   if(TMath::Abs(DET)<1.e-20) return -1.;
 643   Double_t DD = TMath::Sqrt(Tr*Tr - 4*DET);
 644   L[0] = .5*(Tr + DD);
 645   L[1] = .5*(Tr - DD);
 646   if(L[0]<0. || L[1]<0.) return -1.;
 647
 648   // the sym V matrix
 649   // | v00   v10|
 650   // | v10   v11|
 651   Double_t tmp = (L[0]-c[0])/c[1];
 652   V[0] = TMath::Sqrt(1./(tmp*tmp+1));
 653   V[1] = tmp*V[0];
 654   V[2] = V[1]*c[1]/(L[1]-c[2]);
 655   // the VD^{1/2}V is:
 656   L[0] = TMath::Sqrt(L[0]); L[1] = TMath::Sqrt(L[1]);
 657   d[0] = V[0]*V[0]*L[0]+V[1]*V[1]*L[1];
 658   d[1] = V[0]*V[1]*L[0]+V[1]*V[2]*L[1];
 659   d[2] = V[1]*V[1]*L[0]+V[2]*V[2]*L[1];
 660
 661   return 1.;
 662 }
 663
 664 //____________________________________________________________
 665 Double_t AliTRDseedV1::GetCovInv(Double_t *c, Double_t *d)
 666 {
 667 // Helper function to calculate the inverse of the covariance matrix.
 668 // The input matrix is stored in the vector c and the result in the vector d.
 669 // Both arrays have to be initialized by the user with at least 3 elements
 670 // The return value is the determinant or 0 in case of singularity.
 671 //
 672 // Author A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
 673 // Date   Mar 19 2009
 674
 675   Double_t Det = c[0]*c[2] - c[1]*c[1];
 676   if(TMath::Abs(Det)<1.e-20) return 0.;
 677   Double_t InvDet = 1./Det;
 678   d[0] = c[2]*InvDet;
 679   d[1] =-c[1]*InvDet;
 680   d[2] = c[0]*InvDet;
 681   return Det;
 682 }
 683
 684 //____________________________________________________________________
 685 void AliTRDseedV1::Calibrate()
 686 {
 687 // Retrieve calibration and position parameters from OCDB.
 688 // The following information are used
 689 //  - detector index
 690 //  - column and row position of first attached cluster. If no clusters are attached
 691 // to the tracklet a random central chamber position (c=70, r=7) will be used.
 692 //
 693 // The following information is cached in the tracklet
 694 //   t0 (trigger delay)
 695 //   drift velocity
 696 //   PRF width
 697 //   omega*tau = tg(a_L)
 698 //   diffusion coefficients (longitudinal and transversal)
 699 //
 700 // Author :
 701 // Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
 702 // Date : Jan 8th 2009
 703 //
 704
 705   AliCDBManager *cdb = AliCDBManager::Instance();
 706   if(cdb->GetRun() < 0){
 707     AliError("OCDB manager not properly initialized");
 708     return;
 709   }
 710
 711   AliTRDcalibDB *calib = AliTRDcalibDB::Instance();
 712   AliTRDCalROC  *vdROC = calib->GetVdriftROC(fDet),
 713                 *t0ROC = calib->GetT0ROC(fDet);;
 714   const AliTRDCalDet *vdDet = calib->GetVdriftDet();
 715   const AliTRDCalDet *t0Det = calib->GetT0Det();
 716
 717   Int_t col = 70, row = 7;
 718   AliTRDcluster **c = &fClusters[0];
 719   if(GetN()){
 720     Int_t ic = 0;
 721     while (ic<kNclusters && !(*c)){ic++; c++;}
 722     if(*c){
 723       col = (*c)->GetPadCol();
 724       row = (*c)->GetPadRow();
 725     }
 726   }
 727
 728   fT0    = t0Det->GetValue(fDet) + t0ROC->GetValue(col,row);
 729   fVD    = vdDet->GetValue(fDet) * vdROC->GetValue(col, row);
 730   fS2PRF = calib->GetPRFWidth(fDet, col, row); fS2PRF *= fS2PRF;
 731   fExB   = AliTRDCommonParam::Instance()->GetOmegaTau(fVD);
 732   AliTRDCommonParam::Instance()->GetDiffCoeff(fDiffL,
 733   fDiffT, fVD);
 734   SetBit(kCalib, kTRUE);
 735 }
 736
 737 //____________________________________________________________________
 738 void AliTRDseedV1::SetOwner()
 739 {
 740   //AliInfo(Form("own [%s] fOwner[%s]", own?"YES":"NO", fOwner?"YES":"NO"));
 741
 742   if(TestBit(kOwner)) return;
 743   for(int ic=0; ic<kNclusters; ic++){
 744     if(!fClusters[ic]) continue;
 745     fClusters[ic] = new AliTRDcluster(*fClusters[ic]);
 746   }
 747   SetBit(kOwner);
 748 }
 749
 750 //____________________________________________________________
 751 void AliTRDseedV1::SetPadPlane(AliTRDpadPlane *p)
 752 {
 753 // Shortcut method to initialize pad geometry.
 754   if(!p) return;
 755   SetTilt(TMath::Tan(TMath::DegToRad()*p->GetTiltingAngle()));
 756   SetPadLength(p->GetLengthIPad());
 757   SetPadWidth(p->GetWidthIPad());
 758 }
 759
 760
 761 // //____________________________________________________________________
 762 // Bool_t       AliTRDseedV1::AttachClustersIter(AliTRDtrackingChamber *chamber, Float_t quality, Bool_t kZcorr, AliTRDcluster *c)
 763 // {
 764 //   //
 765 //   // Iterative process to register clusters to the seed.
 766 //   // In iteration 0 we try only one pad-row and if quality not
 767 //   // sufficient we try 2 pad-rows (about 5% of tracks cross 2 pad-rows)
 768 //   //
 769 //   // debug level 7
 770 //   //
 771 //
 772 //   if(!fReconstructor->GetRecoParam() ){
 773 //     AliError("Seed can not be used without a valid RecoParam.");
 774 //     return kFALSE;
 775 //   }
 776 //
 777 //   AliTRDchamberTimeBin *layer = 0x0;
 778 //   if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker)>=7){
 779 //     AliTRDtrackingChamber ch(*chamber);
 780 //     ch.SetOwner();
 781 //     TTreeSRedirector &cstreamer = *fReconstructor->GetDebugStream(AliTRDReconstructor::kTracker);
 782 //     cstreamer << "AttachClustersIter"
 783 //       << "chamber.="   << &ch
 784 //       << "tracklet.="  << this
 785 //       << "\n";
 786 //   }
 787 //
 788 //   Float_t  tquality;
 789 //   Double_t kroady = fReconstructor->GetRecoParam() ->GetRoad1y();
 790 //   Double_t kroadz = GetPadLength() * .5 + 1.;
 791 //
 792 //   // initialize configuration parameters
 793 //   Float_t zcorr = kZcorr ? GetTilt() * (fZfit[0] - fZref[0]) : 0.;
 794 //   Int_t   niter = kZcorr ? 1 : 2;
 795 //
 796 //   Double_t yexp, zexp;
 797 //   Int_t ncl = 0;
 798 //   // start seed update
 799 //   for (Int_t iter = 0; iter < niter; iter++) {
 800 //     ncl = 0;
 801 //     for (Int_t iTime = 0; iTime < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); iTime++) {
 802 //       if(!(layer = chamber->GetTB(iTime))) continue;
 803 //       if(!Int_t(*layer)) continue;
 804 //
 805 //       // define searching configuration
 806 //       Double_t dxlayer = layer->GetX() - fX0;
 807 //       if(c){
 808 //         zexp = c->GetZ();
 809 //         //Try 2 pad-rows in second iteration
 810 //         if (iter > 0) {
 811 //           zexp = fZref[0] + fZref[1] * dxlayer - zcorr;
 812 //           if (zexp > c->GetZ()) zexp = c->GetZ() + GetPadLength()*0.5;
 813 //           if (zexp < c->GetZ()) zexp = c->GetZ() - GetPadLength()*0.5;
 814 //         }
 815 //       } else zexp = fZref[0] + (kZcorr ? fZref[1] * dxlayer : 0.);
 816 //       yexp  = fYref[0] + fYref[1] * dxlayer - zcorr;
 817 //
 818 //       // Get and register cluster
 819 //       Int_t    index = layer->SearchNearestCluster(yexp, zexp, kroady, kroadz);
 820 //       if (index < 0) continue;
 821 //       AliTRDcluster *cl = (*layer)[index];
 822 //
 823 //       fIndexes[iTime]  = layer->GetGlobalIndex(index);
 824 //       fClusters[iTime] = cl;
 825 // //       fY[iTime]        = cl->GetY();
 826 // //       fZ[iTime]        = cl->GetZ();
 827 //       ncl++;
 828 //     }
 829 //     if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker)>=7) AliInfo(Form("iter = %d ncl [%d] = %d", iter, fDet, ncl));
 830 //
 831 //     if(ncl>1){
 832 //       // calculate length of the time bin (calibration aware)
 833 //       Int_t irp = 0; Float_t x[2]={0., 0.}; Int_t tb[2] = {0,0};
 834 //       for (Int_t iTime = 0; iTime < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); iTime++) {
 835 //         if(!fClusters[iTime]) continue;
 836 //         x[irp]  = fClusters[iTime]->GetX();
 837 //         tb[irp] = iTime;
 838 //         irp++;
 839 //         if(irp==2) break;
 840 //       }
 841 //       Int_t dtb = tb[1] - tb[0];
 842 //       fdX = dtb ? (x[0] - x[1]) / dtb : 0.15;
 843 //
 844 //       // update X0 from the clusters (calibration/alignment aware)
 845 //       for (Int_t iTime = 0; iTime < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); iTime++) {
 846 //         if(!(layer = chamber->GetTB(iTime))) continue;
 847 //         if(!layer->IsT0()) continue;
 848 //         if(fClusters[iTime]){
 849 //           fX0 = fClusters[iTime]->GetX();
 850 //           break;
 851 //         } else { // we have to infere the position of the anode wire from the other clusters
 852 //           for (Int_t jTime = iTime+1; jTime < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); jTime++) {
 853 //             if(!fClusters[jTime]) continue;
 854 //             fX0 = fClusters[jTime]->GetX() + fdX * (jTime - iTime);
 855 //             break;
 856 //           }
 857 //         }
 858 //       }
 859 //
 860 //       // update YZ reference point
 861 //       // TODO
 862 //
 863 //       // update x reference positions (calibration/alignment aware)
 864 // //       for (Int_t iTime = 0; iTime < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); iTime++) {
 865 // //         if(!fClusters[iTime]) continue;
 866 // //         fX[iTime] = fX0 - fClusters[iTime]->GetX();
 867 // //       }
 868 //
 869 //       FitMI();
 870 //     }
 871 //     if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker)>=7) AliInfo(Form("iter = %d nclFit [%d] = %d", iter, fDet, fN2));
 872 //
 873 //     if(IsOK()){
 874 //       tquality = GetQuality(kZcorr);
 875 //       if(tquality < quality) break;
 876 //       else quality = tquality;
 877 //     }
 878 //     kroadz *= 2.;
 879 //   } // Loop: iter
 880 //   if (!IsOK()) return kFALSE;
 881 //
 882 //   if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker)>=1) CookLabels();
 883 //
 884 //   // load calibration params
 885 //   Calibrate();
 886 //   UpdateUsed();
 887 //   return kTRUE;
 888 // }
 889
 890 //____________________________________________________________________
 891 Bool_t  AliTRDseedV1::AttachClusters(AliTRDtrackingChamber *chamber, Bool_t tilt)
 892 {
 893   //
 894   // Projective algorithm to attach clusters to seeding tracklets
 895   //
 896   // Parameters
 897   //
 898   // Output
 899   //
 900   // Detailed description
 901   // 1. Collapse x coordinate for the full detector plane
 902   // 2. truncated mean on y (r-phi) direction
 903   // 3. purge clusters
 904   // 4. truncated mean on z direction
 905   // 5. purge clusters
 906   // 6. fit tracklet
 907   //
 908   Bool_t kPRINT = kFALSE;
 909   if(!fReconstructor->GetRecoParam() ){
 910     AliError("Seed can not be used without a valid RecoParam.");
 911     return kFALSE;
 912   }
 913   // Initialize reco params for this tracklet
 914   // 1. first time bin in the drift region
 915   Int_t t0 = 4;
 916   Int_t kClmin = Int_t(fReconstructor->GetRecoParam() ->GetFindableClusters()*AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins());
 917
 918   Double_t syRef  = TMath::Sqrt(fRefCov[0]);
 919   //define roads
 920   Double_t kroady = 1.;
 921   //fReconstructor->GetRecoParam() ->GetRoad1y();
 922   Double_t kroadz = GetPadLength() * 1.5 + 1.;
 923   if(kPRINT) printf("AttachClusters() sy[%f] road[%f]\n", syRef, kroady);
 924
 925   // working variables
 926   const Int_t kNrows = 16;
 927   AliTRDcluster *clst[kNrows][kNclusters];
 928   Double_t cond[4], dx, dy, yt, zt,
 929     yres[kNrows][kNclusters];
 930   Int_t idxs[kNrows][kNclusters], ncl[kNrows], ncls = 0;
 931   memset(ncl, 0, kNrows*sizeof(Int_t));
 932   memset(clst, 0, kNrows*kNclusters*sizeof(AliTRDcluster*));
 933
 934   // Do cluster projection
 935   AliTRDcluster *c = 0x0;
 936   AliTRDchamberTimeBin *layer = 0x0;
 937   Bool_t kBUFFER = kFALSE;
 938   for (Int_t it = 0; it < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); it++) {
 939     if(!(layer = chamber->GetTB(it))) continue;
 940     if(!Int_t(*layer)) continue;
 941
 942     dx   = fX0 - layer->GetX();
 943     yt = fYref[0] - fYref[1] * dx;
 944     zt = fZref[0] - fZref[1] * dx;
 945     if(kPRINT) printf("\t%2d dx[%f] yt[%f] zt[%f]\n", it, dx, yt, zt);
 946
 947     // select clusters on a 5 sigmaKalman level
 948     cond[0] = yt; cond[2] = kroady;
 949     cond[1] = zt; cond[3] = kroadz;
 950     Int_t n=0, idx[6];
 951     layer->GetClusters(cond, idx, n, 6);
 952     for(Int_t ic = n; ic--;){
 953       c  = (*layer)[idx[ic]];
 954       dy = yt - c->GetY();
 955       dy += tilt ? GetTilt() * (c->GetZ() - zt) : 0.;
 956       // select clusters on a 3 sigmaKalman level
 957 /*      if(tilt && TMath::Abs(dy) > 3.*syRef){
 958         printf("too large !!!\n");
 959         continue;
 960       }*/
 961       Int_t r = c->GetPadRow();
 962       if(kPRINT) printf("\t\t%d dy[%f] yc[%f] r[%d]\n", ic, TMath::Abs(dy), c->GetY(), r);
 963       clst[r][ncl[r]] = c;
 964       idxs[r][ncl[r]] = idx[ic];
 965       yres[r][ncl[r]] = dy;
 966       ncl[r]++; ncls++;
 967
 968       if(ncl[r] >= kNclusters) {
 969         AliWarning(Form("Cluster candidates reached limit %d. Some may be lost.", kNclusters));
 970         kBUFFER = kTRUE;
 971         break;
 972       }
 973     }
 974     if(kBUFFER) break;
 975   }
 976   if(kPRINT) printf("Found %d clusters\n", ncls);
 977   if(ncls<kClmin) return kFALSE;
 978
 979   // analyze each row individualy
 980   Double_t mean, syDis;
 981   Int_t nrow[] = {0, 0, 0}, nr = 0, lr=-1;
 982   for(Int_t ir=kNrows; ir--;){
 983     if(!(ncl[ir])) continue;
 984     if(lr>0 && lr-ir != 1){
 985       if(kPRINT) printf("W - gap in rows attached !!\n");
 986     }
 987     if(kPRINT) printf("\tir[%d] lr[%d] n[%d]\n", ir, lr, ncl[ir]);
 988     // Evaluate truncated mean on the y direction
 989     if(ncl[ir] > 3) AliMathBase::EvaluateUni(ncl[ir], yres[ir], mean, syDis, Int_t(ncl[ir]*.8));
 990     else {
 991       mean = 0.; syDis = 0.;
 992     }
 993
 994     // TODO check mean and sigma agains cluster resolution !!
 995     if(kPRINT) printf("\tr[%2d] m[%f %5.3fsigma] s[%f]\n", ir, mean, TMath::Abs(mean/syRef), syDis);
 996     // select clusters on a 3 sigmaDistr level
 997     Bool_t kFOUND = kFALSE;
 998     for(Int_t ic = ncl[ir]; ic--;){
 999       if(yres[ir][ic] - mean > 3. * syDis){
1000         clst[ir][ic] = 0x0; continue;
1001       }
1002       nrow[nr]++; kFOUND = kTRUE;
1003     }
1004     // exit loop
1005     if(kFOUND) nr++;
1006     lr = ir; if(nr>=3) break;
1007   }
1008   if(kPRINT) printf("lr[%d] nr[%d] nrow[0]=%d nrow[1]=%d nrow[2]=%d\n", lr, nr, nrow[0], nrow[1], nrow[2]);
1009
1010   // classify cluster rows
1011   Int_t row = -1;
1012   switch(nr){
1013   case 1:
1014     row = lr;
1015     break;
1016   case 2:
1017     SetBit(kRowCross, kTRUE); // mark pad row crossing
1018     if(nrow[0] > nrow[1]){ row = lr+1; lr = -1;}
1019     else{
1020       row = lr; lr = 1;
1021       nrow[2] = nrow[1];
1022       nrow[1] = nrow[0];
1023       nrow[0] = nrow[2];
1024     }
1025     break;
1026   case 3:
1027     SetBit(kRowCross, kTRUE); // mark pad row crossing
1028     break;
1029   }
1030   if(kPRINT) printf("\trow[%d] n[%d]\n\n", row, nrow[0]);
1031   if(row<0) return kFALSE;
1032
1033   // Select and store clusters
1034   // We should consider here :
1035   //  1. How far is the chamber boundary
1036   //  2. How big is the mean
1037   Int_t n = 0;
1038   for (Int_t ir = 0; ir < nr; ir++) {
1039     Int_t jr = row + ir*lr;
1040     if(kPRINT) printf("\tattach %d clusters for row %d\n", ncl[jr], jr);
1041     for (Int_t ic = 0; ic < ncl[jr]; ic++) {
1042       if(!(c = clst[jr][ic])) continue;
1043       Int_t it = c->GetPadTime();
1044       // TODO proper indexing of clusters !!
1045       fIndexes[it+kNtb*ir]  = chamber->GetTB(it)->GetGlobalIndex(idxs[jr][ic]);
1046       fClusters[it+kNtb*ir] = c;
1047
1048       //printf("\tid[%2d] it[%d] idx[%d]\n", ic, it, fIndexes[it]);
1049
1050       n++;
1051     }
1052   }
1053
1054   // number of minimum numbers of clusters expected for the tracklet
1055   if (n < kClmin){
1056     //AliWarning(Form("Not enough clusters to fit the tracklet %d [%d].", n, kClmin));
1057     return kFALSE;
1058   }
1059   SetN(n);
1060
1061   // Load calibration parameters for this tracklet
1062   Calibrate();
1063
1064   // calculate dx for time bins in the drift region (calibration aware)
1065   Int_t irp = 0; Float_t x[2] = {0.,0.}; Int_t tb[2]={0,0};
1066   for (Int_t it = t0; it < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); it++) {
1067     if(!fClusters[it]) continue;
1068     x[irp]  = fClusters[it]->GetX();
1069     tb[irp] = it;
1070     irp++;
1071     if(irp==2) break;
1072   }
1073   Int_t dtb = tb[1] - tb[0];
1074   fdX = dtb ? (x[0] - x[1]) / dtb : 0.15;
1075
1076   return kTRUE;
1077 }
1078
1079 //____________________________________________________________
1080 void AliTRDseedV1::Bootstrap(const AliTRDReconstructor *rec)
1081 {
1082 //   Fill in all derived information. It has to be called after recovery from file or HLT.
1083 //   The primitive data are
1084 //   - list of clusters
1085 //   - detector (as the detector will be removed from clusters)
1086 //   - position of anode wire (fX0) - temporary
1087 //   - track reference position and direction
1088 //   - momentum of the track
1089 //   - time bin length [cm]
1090 //
1091 //   A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de> Oct 30th 2008
1092 //
1093   fReconstructor = rec;
1094   AliTRDgeometry g;
1095   AliTRDpadPlane *pp = g.GetPadPlane(fDet);
1096   fPad[0] = pp->GetLengthIPad();
1097   fPad[1] = pp->GetWidthIPad();
1098   fPad[3] = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*pp->GetTiltingAngle());
1099   //fSnp = fYref[1]/TMath::Sqrt(1+fYref[1]*fYref[1]);
1100   //fTgl = fZref[1];
1101   Int_t n = 0, nshare = 0, nused = 0;
1102   AliTRDcluster **cit = &fClusters[0];
1103   for(Int_t ic = kNclusters; ic--; cit++){
1104     if(!(*cit)) return;
1105     n++;
1106     if((*cit)->IsShared()) nshare++;
1107     if((*cit)->IsUsed()) nused++;
1108   }
1109   SetN(n); SetNUsed(nused); SetNShared(nshare);
1110   Fit();
1111   CookLabels();
1112   GetProbability();
1113 }
1114
1115
1116 //____________________________________________________________________
1117 Bool_t AliTRDseedV1::Fit(Bool_t tilt, Int_t errors)
1118 {
1119   //
1120   // Linear fit of the tracklet
1121   //
1122   // Parameters :
1123   //
1124   // Output :
1125   //  True if successful
1126   //
1127   // Detailed description
1128   // 2. Check if tracklet crosses pad row boundary
1129   // 1. Calculate residuals in the y (r-phi) direction
1130   // 3. Do a Least Square Fit to the data
1131   //
1132
1133   if(!IsCalibrated()){
1134     AliWarning("Tracklet fit failed. Call Calibrate().");
1135     return kFALSE;
1136   }
1137
1138   const Int_t kClmin = 8;
1139
1140
1141   // cluster error parametrization parameters
1142   // 1. sy total charge
1143   const Float_t sq0inv = 0.019962; // [1/q0]
1144   const Float_t sqb    = 1.0281564;    //[cm]
1145   // 2. sy for the PRF
1146   const Float_t scy[AliTRDgeometry::kNlayer][4] = {
1147     {2.827e-02, 9.600e-04, 4.296e-01, 2.271e-02},
1148     {2.952e-02,-2.198e-04, 4.146e-01, 2.339e-02},
1149     {3.090e-02, 1.514e-03, 4.020e-01, 2.402e-02},
1150     {3.260e-02,-2.037e-03, 3.946e-01, 2.509e-02},
1151     {3.439e-02,-3.601e-04, 3.883e-01, 2.623e-02},
1152     {3.510e-02, 2.066e-03, 3.651e-01, 2.588e-02},
1153   };
1154   // 3. sy parallel to the track
1155   const Float_t sy0 =  2.649e-02; // [cm]
1156   const Float_t sya = -8.864e-04; // [cm]
1157   const Float_t syb = -2.435e-01; // [cm]
1158
1159   // 4. sx parallel to the track
1160   const Float_t sxgc = 5.427e-02;
1161   const Float_t sxgm = 7.783e-01;
1162   const Float_t sxgs = 2.743e-01;
1163   const Float_t sxe0 =-2.065e+00;
1164   const Float_t sxe1 =-2.978e-02;
1165
1166   // 5. sx perpendicular to the track
1167 //   const Float_t sxd0 = 1.881e-02;
1168 //   const Float_t sxd1 =-4.101e-01;
1169 //   const Float_t sxd2 = 1.572e+00;
1170
1171   // get track direction
1172   Double_t y0   = fYref[0];
1173   Double_t dydx = fYref[1];
1174   Double_t z0   = fZref[0];
1175   Double_t dzdx = fZref[1];
1176   Double_t yt, zt;
1177
1178   // calculation of tg^2(phi - a_L) and tg^2(a_L)
1179   Double_t tgg = (dydx-fExB)/(1.+dydx*fExB); tgg *= tgg;
1180   //Double_t exb2= fExB*fExB;
1181
1182   //AliTRDtrackerV1::AliTRDLeastSquare fitterZ;
1183   TLinearFitter  fitterY(1, "pol1");
1184   // convertion factor from square to gauss distribution for sigma
1185   //Double_t convert = 1./TMath::Sqrt(12.);
1186
1187   // book cluster information
1188   Double_t qc[kNclusters], xc[kNclusters], yc[kNclusters], zc[kNclusters], sy[kNclusters];
1189
1190   Int_t ily = AliTRDgeometry::GetLayer(fDet);
1191   Int_t n = 0;
1192   AliTRDcluster *c=0x0, **jc = &fClusters[0];
1193   for (Int_t ic=0; ic<kNtb; ic++, ++jc) {
1194     //zRow[ic] = -1;
1195     xc[ic]  = -1.;
1196     yc[ic]  = 999.;
1197     zc[ic]  = 999.;
1198     sy[ic]  = 0.;
1199     //sz[ic]  = 0.;
1200     if(!(c = (*jc))) continue;
1201     if(!c->IsInChamber()) continue;
1202
1203     Float_t w = 1.;
1204     if(c->GetNPads()>4) w = .5;
1205     if(c->GetNPads()>5) w = .2;
1206
1207     //zRow[fN] = c->GetPadRow();
1208     qc[n]   = TMath::Abs(c->GetQ());
1209     // correct cluster position for PRF and v drift
1210     //Int_t jc = TMath::Max(fN-3, 0);
1211     //xc[fN]   = c->GetXloc(fT0, fVD, &qc[jc], &xc[jc]/*, z0 - c->GetX()*dzdx*/);
1212     //Double_t s2 = fS2PRF + fDiffL*fDiffL*xc[fN]/(1.+2.*exb2)+tgg*xc[fN]*xc[fN]*exb2/12.;
1213     //yc[fN]   = c->GetYloc(s2, GetPadWidth(), xc[fN], fExB);
1214
1215     // uncalibrated cluster correction
1216     // TODO remove
1217     Double_t x, y;
1218     //GetClusterXY(c, x, y);
1219     x = c->GetX(); y = c->GetY();
1220     xc[n]   = fX0 - x;
1221     yc[n]   = y;
1222     zc[n]   = c->GetZ();
1223
1224     // extrapolated y value for the track
1225     yt = y0 - xc[n]*dydx;
1226     // extrapolated z value for the track
1227     zt = z0 - xc[n]*dzdx;
1228     // tilt correction
1229     if(tilt) yc[n] -= GetTilt()*(zc[n] - zt);
1230
1231     // ELABORATE CLUSTER ERROR
1232     // TODO to be moved to AliTRDcluster
1233     // basic y error (|| to track).
1234     sy[n]  = xc[n] < AliTRDgeometry::CamHght() ? 2. : sy0 + sya*TMath::Exp(1./(xc[n]+syb));
1235     //printf("cluster[%d]\n\tsy[0] = %5.3e [um]\n", fN,  sy[fN]*1.e4);
1236     // y error due to total charge
1237     sy[n] += sqb*(1./qc[n] - sq0inv);
1238     //printf("\tsy[1] = %5.3e [um]\n", sy[fN]*1.e4);
1239     // y error due to PRF
1240     sy[n] += scy[ily][0]*TMath::Gaus(c->GetCenter(), scy[ily][1], scy[ily][2]) - scy[ily][3];
1241     //printf("\tsy[2] = %5.3e [um]\n", sy[fN]*1.e4);
1242
1243     sy[n] *= sy[n];
1244
1245     // ADD ERROR ON x
1246     // error of drift length parallel to the track
1247     Double_t sx = sxgc*TMath::Gaus(xc[n], sxgm, sxgs) + TMath::Exp(sxe0+sxe1*xc[n]); // [cm]
1248     //printf("\tsx[0] = %5.3e [um]\n", sx*1.e4);
1249     // error of drift length perpendicular to the track
1250     //sx += sxd0 + sxd1*d + sxd2*d*d;
1251     sx *= sx; // square sx
1252
1253     // add error from ExB
1254     if(errors>0) sy[n] += fExB*fExB*sx;
1255     //printf("\tsy[3] = %5.3e [um^2]\n", sy[fN]*1.e8);
1256
1257     // global radial error due to misalignment/miscalibration
1258     Double_t sx0  = 0.; sx0 *= sx0;
1259     // add sx contribution to sy due to track angle
1260     if(errors>1) sy[n] += tgg*(sx+sx0);
1261     // TODO we should add tilt pad correction here
1262     //printf("\tsy[4] = %5.3e [um^2]\n", sy[fN]*1.e8);
1263     c->SetSigmaY2(sy[n]);
1264
1265     sy[n]  = TMath::Sqrt(sy[n]);
1266     fitterY.AddPoint(&xc[n], yc[n], sy[n]);
1267     n++;
1268   }
1269   // to few clusters
1270   if (n < kClmin) return kFALSE;
1271
1272   // fit XY
1273   fitterY.Eval();
1274   fYfit[0] = fitterY.GetParameter(0);
1275   fYfit[1] = -fitterY.GetParameter(1);
1276   // store covariance
1277   Double_t *p = fitterY.GetCovarianceMatrix();
1278   fCov[0] = p[0]; // variance of y0
1279   fCov[1] = p[1]; // covariance of y0, dydx
1280   fCov[2] = p[3]; // variance of dydx
1281   // the ref radial position is set at the minimum of
1282   // the y variance of the tracklet
1283   fX   = -fCov[1]/fCov[2]; //fXref = fX0 - fXref;
1284   fS2Y = fCov[0] +2.*fX*fCov[1] + fX*fX*fCov[2];
1285
1286   // fit XZ
1287   if(IsRowCross()){
1288     // TODO pad row cross position estimation !!!
1289     //AliInfo(Form("Padrow cross in detector %d", fDet));
1290     fZfit[0] = .5*(zc[0]+zc[n-1]); fZfit[1] = 0.;
1291     fS2Z     = 0.02+1.55*fZref[1]; fS2Z *= fS2Z;
1292   } else {
1293     fZfit[0] = zc[0]; fZfit[1] = 0.;
1294     fS2Z     = GetPadLength()*GetPadLength()/12.;
1295   }
1296
1297
1298 //   // determine z offset of the fit
1299 //   Float_t zslope = 0.;
1300 //   Int_t nchanges = 0, nCross = 0;
1301 //   if(nz==2){ // tracklet is crossing pad row
1302 //     // Find the break time allowing one chage on pad-rows
1303 //     // with maximal number of accepted clusters
1304 //     Int_t padRef = zRow[0];
1305 //     for (Int_t ic=1; ic<fN; ic++) {
1306 //       if(zRow[ic] == padRef) continue;
1307 //
1308 //       // debug
1309 //       if(zRow[ic-1] == zRow[ic]){
1310 //         printf("ERROR in pad row change!!!\n");
1311 //       }
1312 //
1313 //       // evaluate parameters of the crossing point
1314 //       Float_t sx = (xc[ic-1] - xc[ic])*convert;
1315 //       fCross[0] = .5 * (xc[ic-1] + xc[ic]);
1316 //       fCross[2] = .5 * (zc[ic-1] + zc[ic]);
1317 //       fCross[3] = TMath::Max(dzdx * sx, .01);
1318 //       zslope    = zc[ic-1] > zc[ic] ? 1. : -1.;
1319 //       padRef    = zRow[ic];
1320 //       nCross    = ic;
1321 //       nchanges++;
1322 //     }
1323 //   }
1324 //
1325 //   // condition on nCross and reset nchanges TODO
1326 //
1327 //   if(nchanges==1){
1328 //     if(dzdx * zslope < 0.){
1329 //       AliInfo("Tracklet-Track mismatch in dzdx. TODO.");
1330 //     }
1331 //
1332 //
1333 //     //zc[nc] = fitterZ.GetFunctionParameter(0);
1334 //     fCross[1] = fYfit[0] - fCross[0] * fYfit[1];
1335 //     fCross[0] = fX0 - fCross[0];
1336 //   }
1337
1338   return kTRUE;
1339 }
1340
1341
1342 /*
1343 //_____________________________________________________________________________
1344 void AliTRDseedV1::FitMI()
1345 {
1346 //
1347 // Fit the seed.
1348 // Marian Ivanov's version
1349 //
1350 // linear fit on the y direction with respect to the reference direction.
1351 // The residuals for each x (x = xc - x0) are deduced from:
1352 // dy = y - yt             (1)
1353 // the tilting correction is written :
1354 // y = yc + h*(zc-zt)      (2)
1355 // yt = y0+dy/dx*x         (3)
1356 // zt = z0+dz/dx*x         (4)
1357 // from (1),(2),(3) and (4)
1358 // dy = yc - y0 - (dy/dx + h*dz/dx)*x + h*(zc-z0)
1359 // the last term introduces the correction on y direction due to tilting pads. There are 2 ways to account for this:
1360 // 1. use tilting correction for calculating the y
1361 // 2. neglect tilting correction here and account for it in the error parametrization of the tracklet.
1362   const Float_t kRatio  = 0.8;
1363   const Int_t   kClmin  = 5;
1364   const Float_t kmaxtan = 2;
1365
1366   if (TMath::Abs(fYref[1]) > kmaxtan){
1367                 //printf("Exit: Abs(fYref[1]) = %3.3f, kmaxtan = %3.3f\n", TMath::Abs(fYref[1]), kmaxtan);
1368                 return;              // Track inclined too much
1369         }
1370
1371   Float_t  sigmaexp  = 0.05 + TMath::Abs(fYref[1] * 0.25); // Expected r.m.s in y direction
1372   Float_t  ycrosscor = GetPadLength() * GetTilt() * 0.5;           // Y correction for crossing
1373   Int_t fNChange = 0;
1374
1375   Double_t sumw;
1376   Double_t sumwx;
1377   Double_t sumwx2;
1378   Double_t sumwy;
1379   Double_t sumwxy;
1380   Double_t sumwz;
1381   Double_t sumwxz;
1382
1383         // Buffering: Leave it constant fot Performance issues
1384   Int_t    zints[kNtb];            // Histograming of the z coordinate
1385                                          // Get 1 and second max probable coodinates in z
1386   Int_t    zouts[2*kNtb];
1387   Float_t  allowedz[kNtb];         // Allowed z for given time bin
1388   Float_t  yres[kNtb];             // Residuals from reference
1389   //Float_t  anglecor = GetTilt() * fZref[1];  // Correction to the angle
1390
1391   Float_t pos[3*kNtb]; memset(pos, 0, 3*kNtb*sizeof(Float_t));
1392   Float_t *fX = &pos[0], *fY = &pos[kNtb], *fZ = &pos[2*kNtb];
1393
1394   Int_t fN  = 0; AliTRDcluster *c = 0x0;
1395   fN2 = 0;
1396   for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); i++) {
1397     yres[i] = 10000.0;
1398     if (!(c = fClusters[i])) continue;
1399     if(!c->IsInChamber()) continue;
1400     // Residual y
1401     //yres[i] = fY[i] - fYref[0] - (fYref[1] + anglecor) * fX[i] + GetTilt()*(fZ[i] - fZref[0]);
1402     fX[i] = fX0 - c->GetX();
1403     fY[i] = c->GetY();
1404     fZ[i] = c->GetZ();
1405     yres[i] = fY[i] - GetTilt()*(fZ[i] - (fZref[0] - fX[i]*fZref[1]));
1406     zints[fN] = Int_t(fZ[i]);
1407     fN++;
1408   }
1409
1410   if (fN < kClmin){
1411     //printf("Exit fN < kClmin: fN = %d\n", fN);
1412     return;
1413   }
1414   Int_t nz = AliTRDtrackerV1::Freq(fN, zints, zouts, kFALSE);
1415   Float_t fZProb   = zouts[0];
1416   if (nz <= 1) zouts[3] = 0;
1417   if (zouts[1] + zouts[3] < kClmin) {
1418     //printf("Exit zouts[1] = %d, zouts[3] = %d\n",zouts[1],zouts[3]);
1419     return;
1420   }
1421
1422   // Z distance bigger than pad - length
1423   if (TMath::Abs(zouts[0]-zouts[2]) > 12.0) zouts[3] = 0;
1424
1425   Int_t  breaktime = -1;
1426   Bool_t mbefore   = kFALSE;
1427   Int_t  cumul[kNtb][2];
1428   Int_t  counts[2] = { 0, 0 };
1429
1430   if (zouts[3] >= 3) {
1431
1432     //
1433     // Find the break time allowing one chage on pad-rows
1434     // with maximal number of accepted clusters
1435     //
1436     fNChange = 1;
1437     for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); i++) {
1438       cumul[i][0] = counts[0];
1439       cumul[i][1] = counts[1];
1440       if (TMath::Abs(fZ[i]-zouts[0]) < 2) counts[0]++;
1441       if (TMath::Abs(fZ[i]-zouts[2]) < 2) counts[1]++;
1442     }
1443     Int_t  maxcount = 0;
1444     for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); i++) {
1445       Int_t after  = cumul[AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()][0] - cumul[i][0];
1446       Int_t before = cumul[i][1];
1447       if (after + before > maxcount) {
1448         maxcount  = after + before;
1449         breaktime = i;
1450         mbefore   = kFALSE;
1451       }
1452       after  = cumul[AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()-1][1] - cumul[i][1];
1453       before = cumul[i][0];
1454       if (after + before > maxcount) {
1455         maxcount  = after + before;
1456         breaktime = i;
1457         mbefore   = kTRUE;
1458       }
1459     }
1460     breaktime -= 1;
1461   }
1462
1463   for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1464     if (i >  breaktime) allowedz[i] =   mbefore  ? zouts[2] : zouts[0];
1465     if (i <= breaktime) allowedz[i] = (!mbefore) ? zouts[2] : zouts[0];
1466   }
1467
1468   if (((allowedz[0] > allowedz[AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()]) && (fZref[1] < 0)) ||
1469       ((allowedz[0] < allowedz[AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()]) && (fZref[1] > 0))) {
1470     //
1471     // Tracklet z-direction not in correspondance with track z direction
1472     //
1473     fNChange = 0;
1474     for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1475       allowedz[i] = zouts[0];  // Only longest taken
1476     }
1477   }
1478
1479   if (fNChange > 0) {
1480     //
1481     // Cross pad -row tracklet  - take the step change into account
1482     //
1483     for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1484       if (!fClusters[i]) continue;
1485       if(!fClusters[i]->IsInChamber()) continue;
1486       if (TMath::Abs(fZ[i] - allowedz[i]) > 2) continue;
1487       // Residual y
1488       //yres[i] = fY[i] - fYref[0] - (fYref[1] + anglecor) * fX[i] + GetTilt()*(fZ[i] - fZref[0]);
1489       yres[i] = fY[i] - GetTilt()*(fZ[i] - (fZref[0] - fX[i]*fZref[1]));
1490 //       if (TMath::Abs(fZ[i] - fZProb) > 2) {
1491 //         if (fZ[i] > fZProb) yres[i] += GetTilt() * GetPadLength();
1492 //         if (fZ[i] < fZProb) yres[i] -= GetTilt() * GetPadLength();
1493       }
1494     }
1495   }
1496
1497   Double_t yres2[kNtb];
1498   Double_t mean;
1499   Double_t sigma;
1500   for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1501     if (!fClusters[i]) continue;
1502     if(!fClusters[i]->IsInChamber()) continue;
1503     if (TMath::Abs(fZ[i] - allowedz[i]) > 2) continue;
1504     yres2[fN2] = yres[i];
1505     fN2++;
1506   }
1507   if (fN2 < kClmin) {
1508                 //printf("Exit fN2 < kClmin: fN2 = %d\n", fN2);
1509     fN2 = 0;
1510     return;
1511   }
1512   AliMathBase::EvaluateUni(fN2,yres2,mean,sigma, Int_t(fN2*kRatio-2.));
1513   if (sigma < sigmaexp * 0.8) {
1514     sigma = sigmaexp;
1515   }
1516   //Float_t fSigmaY = sigma;
1517
1518   // Reset sums
1519   sumw   = 0;
1520   sumwx  = 0;
1521   sumwx2 = 0;
1522   sumwy  = 0;
1523   sumwxy = 0;
1524   sumwz  = 0;
1525   sumwxz = 0;
1526
1527   fN2    = 0;
1528   Float_t fMeanz = 0;
1529   Float_t fMPads = 0;
1530   fUsable = 0;
1531   for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1532     if (!fClusters[i]) continue;
1533     if (!fClusters[i]->IsInChamber()) continue;
1534     if (TMath::Abs(fZ[i] - allowedz[i]) > 2){fClusters[i] = 0x0; continue;}
1535     if (TMath::Abs(yres[i] - mean) > 4.0 * sigma){fClusters[i] = 0x0;  continue;}
1536     SETBIT(fUsable,i);
1537     fN2++;
1538     fMPads += fClusters[i]->GetNPads();
1539     Float_t weight = 1.0;
1540     if (fClusters[i]->GetNPads() > 4) weight = 0.5;
1541     if (fClusters[i]->GetNPads() > 5) weight = 0.2;
1542
1543
1544     Double_t x = fX[i];
1545     //printf("x = %7.3f dy = %7.3f fit %7.3f\n", x, yres[i], fY[i]-yres[i]);
1546
1547     sumw   += weight;
1548     sumwx  += x * weight;
1549     sumwx2 += x*x * weight;
1550     sumwy  += weight * yres[i];
1551     sumwxy += weight * (yres[i]) * x;
1552     sumwz  += weight * fZ[i];
1553     sumwxz += weight * fZ[i] * x;
1554
1555   }
1556
1557   if (fN2 < kClmin){
1558                 //printf("Exit fN2 < kClmin(2): fN2 = %d\n",fN2);
1559     fN2 = 0;
1560     return;
1561   }
1562   fMeanz = sumwz / sumw;
1563   Float_t correction = 0;
1564   if (fNChange > 0) {
1565     // Tracklet on boundary
1566     if (fMeanz < fZProb) correction =  ycrosscor;
1567     if (fMeanz > fZProb) correction = -ycrosscor;
1568   }
1569
1570   Double_t det = sumw * sumwx2 - sumwx * sumwx;
1571   fYfit[0]    = (sumwx2 * sumwy  - sumwx * sumwxy) / det;
1572   fYfit[1]    = (sumw   * sumwxy - sumwx * sumwy)  / det;
1573
1574   fS2Y = 0;
1575   for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1576     if (!TESTBIT(fUsable,i)) continue;
1577     Float_t delta = yres[i] - fYfit[0] - fYfit[1] * fX[i];
1578     fS2Y += delta*delta;
1579   }
1580   fS2Y = TMath::Sqrt(fS2Y / Float_t(fN2-2));
1581         // TEMPORARY UNTIL covariance properly calculated
1582         fS2Y = TMath::Max(fS2Y, Float_t(.1));
1583
1584   fZfit[0]   = (sumwx2 * sumwz  - sumwx * sumwxz) / det;
1585   fZfit[1]   = (sumw   * sumwxz - sumwx * sumwz)  / det;
1586 //   fYfitR[0] += fYref[0] + correction;
1587 //   fYfitR[1] += fYref[1];
1588 //  fYfit[0]   = fYfitR[0];
1589   fYfit[1]   = -fYfit[1];
1590
1591   UpdateUsed();
1592 }*/
1593
1594 //___________________________________________________________________
1595 void AliTRDseedV1::Print(Option_t *o) const
1596 {
1597   //
1598   // Printing the seedstatus
1599   //
1600
1601   AliInfo(Form("Det[%3d] X0[%7.2f] Pad[L[%5.2f] W[%5.2f] Tilt[%+6.2f]]", fDet, fX0, GetPadLength(), GetPadWidth(), GetTilt()));
1602   AliInfo(Form("N[%2d] Nused[%2d] Nshared[%2d] [%d]", GetN(), GetNUsed(), GetNShared(), fN));
1603
1604   Double_t cov[3], x=GetX();
1605   GetCovAt(x, cov);
1606   AliInfo("    |  x[cm]  |      y[cm]       |      z[cm]      |  dydx |  dzdx |");
1607   AliInfo(Form("Fit | %7.2f | %7.2f+-%7.2f | %7.2f+-%7.2f| %5.2f | ----- |", x, GetY(), TMath::Sqrt(cov[0]), GetZ(), TMath::Sqrt(cov[2]), fYfit[1]));
1608   AliInfo(Form("Ref | %7.2f | %7.2f+-%7.2f | %7.2f+-%7.2f| %5.2f | %5.2f |", x, fYref[0]-fX*fYref[1], TMath::Sqrt(fRefCov[2]),  fZref[0]-fX*fYref[1], TMath::Sqrt(fRefCov[2]), fYref[1], fZref[1]))
1609
1610
1611   if(strcmp(o, "a")!=0) return;
1612
1613   AliTRDcluster* const* jc = &fClusters[0];
1614   for(int ic=0; ic<kNclusters; ic++, jc++) {
1615     if(!(*jc)) continue;
1616     (*jc)->Print(o);
1617   }
1618 }
1619
1620
1621 //___________________________________________________________________
1622 Bool_t AliTRDseedV1::IsEqual(const TObject *o) const
1623 {
1624   // Checks if current instance of the class has the same essential members
1625   // as the given one
1626
1627   if(!o) return kFALSE;
1628   const AliTRDseedV1 *inTracklet = dynamic_cast<const AliTRDseedV1*>(o);
1629   if(!inTracklet) return kFALSE;
1630
1631   for (Int_t i = 0; i < 2; i++){
1632     if ( fYref[i] != inTracklet->fYref[i] ) return kFALSE;
1633     if ( fZref[i] != inTracklet->fZref[i] ) return kFALSE;
1634   }
1635
1636   if ( fS2Y != inTracklet->fS2Y ) return kFALSE;
1637   if ( GetTilt() != inTracklet->GetTilt() ) return kFALSE;
1638   if ( GetPadLength() != inTracklet->GetPadLength() ) return kFALSE;
1639
1640   for (Int_t i = 0; i < kNclusters; i++){
1641 //     if ( fX[i] != inTracklet->GetX(i) ) return kFALSE;
1642 //     if ( fY[i] != inTracklet->GetY(i) ) return kFALSE;
1643 //     if ( fZ[i] != inTracklet->GetZ(i) ) return kFALSE;
1644     if ( fIndexes[i] != inTracklet->fIndexes[i] ) return kFALSE;
1645   }
1646 //   if ( fUsable != inTracklet->fUsable ) return kFALSE;
1647
1648   for (Int_t i=0; i < 2; i++){
1649     if ( fYfit[i] != inTracklet->fYfit[i] ) return kFALSE;
1650     if ( fZfit[i] != inTracklet->fZfit[i] ) return kFALSE;
1651     if ( fLabels[i] != inTracklet->fLabels[i] ) return kFALSE;
1652   }
1653
1654 /*  if ( fMeanz != inTracklet->GetMeanz() ) return kFALSE;
1655   if ( fZProb != inTracklet->GetZProb() ) return kFALSE;*/
1656   if ( fN != inTracklet->fN ) return kFALSE;
1657   //if ( fNUsed != inTracklet->fNUsed ) return kFALSE;
1658   //if ( fFreq != inTracklet->GetFreq() ) return kFALSE;
1659   //if ( fNChange != inTracklet->GetNChange() ) return kFALSE;
1660
1661   if ( fC != inTracklet->fC ) return kFALSE;
1662   //if ( fCC != inTracklet->GetCC() ) return kFALSE;
1663   if ( fChi2 != inTracklet->fChi2 ) return kFALSE;
1664   //  if ( fChi2Z != inTracklet->GetChi2Z() ) return kFALSE;
1665
1666   if ( fDet != inTracklet->fDet ) return kFALSE;
1667   if ( fPt != inTracklet->fPt ) return kFALSE;
1668   if ( fdX != inTracklet->fdX ) return kFALSE;
1669
1670   for (Int_t iCluster = 0; iCluster < kNclusters; iCluster++){
1671     AliTRDcluster *curCluster = fClusters[iCluster];
1672     AliTRDcluster *inCluster = inTracklet->fClusters[iCluster];
1673     if (curCluster && inCluster){
1674       if (! curCluster->IsEqual(inCluster) ) {
1675         curCluster->Print();
1676         inCluster->Print();
1677         return kFALSE;
1678       }
1679     } else {
1680       // if one cluster exists, and corresponding
1681       // in other tracklet doesn't - return kFALSE
1682       if(curCluster || inCluster) return kFALSE;
1683     }
1684   }
1685   return kTRUE;
1686 }