TRD/AliTRDtracker.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  19 //                                                                           //
  20 //  The standard TRD tracker                                                 //
  21 //                                                                           //
  22 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  23
  24 #include <Riostream.h>
  25 #include <TFile.h>
  26 #include <TBranch.h>
  27 #include <TTree.h>
  28 #include <TObjArray.h>
  29
  30 #include "AliTRDgeometry.h"
  31 #include "AliTRDparameter.h"
  32 #include "AliTRDgeometryHole.h"
  33 #include "AliTRDcluster.h"
  34 #include "AliTRDtrack.h"
  35 #include "AliBarrelTrack.h"
  36 #include "AliESD.h"
  37
  38 #include "AliTRDtracker.h"
  39
  40 ClassImp(AliTRDtracker)
  41
  42   const  Float_t     AliTRDtracker::fgkSeedDepth          = 0.5;
  43   const  Float_t     AliTRDtracker::fgkSeedStep           = 0.10;
  44   const  Float_t     AliTRDtracker::fgkSeedGap            = 0.25;
  45
  46   const  Float_t     AliTRDtracker::fgkMaxSeedDeltaZ12    = 40.;
  47   const  Float_t     AliTRDtracker::fgkMaxSeedDeltaZ      = 25.;
  48   const  Float_t     AliTRDtracker::fgkMaxSeedC           = 0.0052;
  49   const  Float_t     AliTRDtracker::fgkMaxSeedTan         = 1.2;
  50   const  Float_t     AliTRDtracker::fgkMaxSeedVertexZ     = 150.;
  51
  52   const  Double_t    AliTRDtracker::fgkSeedErrorSY        = 0.2;
  53   const  Double_t    AliTRDtracker::fgkSeedErrorSY3       = 2.5;
  54   const  Double_t    AliTRDtracker::fgkSeedErrorSZ        = 0.1;
  55
  56   const  Float_t     AliTRDtracker::fgkMinClustersInSeed  = 0.7;
  57
  58   const  Float_t     AliTRDtracker::fgkMinClustersInTrack = 0.5;
  59   const  Float_t     AliTRDtracker::fgkMinFractionOfFoundClusters = 0.8;
  60
  61   const  Float_t     AliTRDtracker::fgkSkipDepth          = 0.3;
  62   const  Float_t     AliTRDtracker::fgkLabelFraction      = 0.8;
  63   const  Float_t     AliTRDtracker::fgkWideRoad           = 20.;
  64
  65   const  Double_t    AliTRDtracker::fgkMaxChi2            = 12.;
  66
  67 const Int_t AliTRDtracker::fgkFirstPlane = 5;
  68 const Int_t AliTRDtracker::fgkLastPlane = 17;
  69
  70
  71 //____________________________________________________________________
  72 AliTRDtracker::AliTRDtracker():AliTracker(),
  73                                fGeom(0),
  74                                fPar(0),
  75                                fNclusters(0),
  76                                fClusters(0),
  77                                fNseeds(0),
  78                                fSeeds(0),
  79                                fNtracks(0),
  80                                fTracks(0),
  81                                fSY2corr(0),
  82                                fSZ2corr(0),
  83                                fTimeBinsPerPlane(0),
  84                                fMaxGap(0),
  85                                fVocal(kFALSE),
  86                                fAddTRDseeds(kFALSE),
  87                                fNoTilt(kFALSE)
  88 {
  89   // Default constructor
  90
  91   for(Int_t i=0;i<kTrackingSectors;i++) fTrSec[i]=0;
  92   for(Int_t j=0;j<5;j++)
  93     for(Int_t k=0;k<18;k++) fHoles[j][k]=kFALSE;
  94 }
  95 //____________________________________________________________________
  96 AliTRDtracker::AliTRDtracker(const TFile *geomfile):AliTracker()
  97 {
  98   //
  99   //  Main constructor
 100   //
 101
 102   //Float_t fTzero = 0;
 103
 104   fAddTRDseeds = kFALSE;
 105   fGeom = NULL;
 106   fNoTilt = kFALSE;
 107
 108   TDirectory *savedir=gDirectory;
 109   TFile *in=(TFile*)geomfile;
 110   if (!in->IsOpen()) {
 111     printf("AliTRDtracker::AliTRDtracker(): geometry file is not open!\n");
 112     printf("    DETAIL TRD geometry and DEFAULT TRD parameter will be used\n");
 113   }
 114   else {
 115     in->cd();
 116 //    in->ls();
 117     fGeom = (AliTRDgeometry*) in->Get("TRDgeometry");
 118     fPar  = (AliTRDparameter*) in->Get("TRDparameter");
 119 //    fGeom->Dump();
 120   }
 121
 122   if(fGeom) {
 123     //    fTzero = geo->GetT0();
 124     printf("Found geometry version %d on file \n", fGeom->IsVersion());
 125   }
 126   else {
 127     printf("AliTRDtracker::AliTRDtracker(): can't find TRD geometry!\n");
 128     //printf("The DETAIL TRD geometry will be used\n");
 129     //fGeom = new AliTRDgeometryDetail();
 130     fGeom = new AliTRDgeometryHole();
 131     fGeom->SetPHOShole();
 132     fGeom->SetRICHhole();
 133   }
 134
 135   if (!fPar) {
 136     printf("AliTRDtracker::AliTRDtracker(): can't find TRD parameter!\n");
 137     printf("The DEFAULT TRD parameter will be used\n");
 138     fPar = new AliTRDparameter();
 139   }
 140   fPar->ReInit();
 141
 142   savedir->cd();
 143
 144
 145   //  fGeom->SetT0(fTzero);
 146
 147   fNclusters = 0;
 148   fClusters  = new TObjArray(2000);
 149   fNseeds    = 0;
 150   fSeeds     = new TObjArray(2000);
 151   fNtracks   = 0;
 152   fTracks    = new TObjArray(1000);
 153
 154   for(Int_t geomS = 0; geomS < kTrackingSectors; geomS++) {
 155     Int_t trS = CookSectorIndex(geomS);
 156     fTrSec[trS] = new AliTRDtrackingSector(fGeom, geomS, fPar);
 157     for (Int_t icham=0;icham<AliTRDgeometry::kNcham; icham++){
 158       fHoles[icham][trS]=fGeom->IsHole(0,icham,geomS);
 159     }
 160   }
 161
 162   Float_t tiltAngle = TMath::Abs(fPar->GetTiltingAngle());
 163   if(tiltAngle < 0.1) {
 164     fNoTilt = kTRUE;
 165   }
 166
 167   fSY2corr = 0.2;
 168   fSZ2corr = 120.;
 169
 170   if(fNoTilt && (tiltAngle > 0.1)) fSY2corr = fSY2corr + tiltAngle * 0.05;
 171
 172
 173   // calculate max gap on track
 174
 175   Double_t dxAmp = (Double_t) fGeom->CamHght();   // Amplification region
 176   Double_t dxDrift = (Double_t) fGeom->CdrHght(); // Drift region
 177
 178   Double_t dx = (Double_t) fPar->GetTimeBinSize();
 179   Int_t tbAmp = fPar->GetTimeBefore();
 180   Int_t maxAmp = (Int_t) ((dxAmp+0.000001)/dx);
 181   if(kTRUE) maxAmp = 0;  // intentional until we change the parameter class
 182   Int_t tbDrift = fPar->GetTimeMax();
 183   Int_t maxDrift = (Int_t) ((dxDrift+0.000001)/dx);
 184
 185   tbDrift = TMath::Min(tbDrift,maxDrift);
 186   tbAmp = TMath::Min(tbAmp,maxAmp);
 187
 188   fTimeBinsPerPlane = tbAmp + tbDrift;
 189   fMaxGap = (Int_t) (fTimeBinsPerPlane * fGeom->Nplan() * fgkSkipDepth);
 190
 191   fVocal = kFALSE;
 192
 193
 194   // Barrel Tracks [SR, 03.04.2003]
 195
 196   fBarrelFile = 0;
 197   fBarrelTree = 0;
 198   fBarrelArray = 0;
 199   fBarrelTrack = 0;
 200
 201   savedir->cd();
 202 }
 203
 204 //___________________________________________________________________
 205 AliTRDtracker::~AliTRDtracker()
 206 {
 207   //
 208   // Destructor of AliTRDtracker
 209   //
 210
 211   if (fClusters) {
 212     fClusters->Delete();
 213     delete fClusters;
 214   }
 215   if (fTracks) {
 216     fTracks->Delete();
 217     delete fTracks;
 218   }
 219   if (fSeeds) {
 220     fSeeds->Delete();
 221     delete fSeeds;
 222   }
 223   delete fGeom;
 224   delete fPar;
 225
 226   for(Int_t geomS = 0; geomS < kTrackingSectors; geomS++) {
 227     delete fTrSec[geomS];
 228   }
 229 }
 230
 231 //_____________________________________________________________________
 232
 233 void AliTRDtracker::SetBarrelTree(const char *mode) {
 234   //
 235   //
 236   //
 237
 238   if (!IsStoringBarrel()) return;
 239
 240   TDirectory *sav = gDirectory;
 241   if (!fBarrelFile) fBarrelFile = new TFile("AliBarrelTracks.root", "UPDATE");
 242
 243   char buff[40];
 244   sprintf(buff,  "BarrelTRD_%d_%s", GetEventNumber(), mode);
 245
 246   fBarrelFile->cd();
 247   fBarrelTree = new TTree(buff, "Barrel TPC tracks");
 248
 249   Int_t nRefs = fgkLastPlane - fgkFirstPlane + 1;
 250
 251   if (!fBarrelArray) fBarrelArray = new TClonesArray("AliBarrelTrack", nRefs);
 252   for(Int_t i=0; i<nRefs; i++) new((*fBarrelArray)[i]) AliBarrelTrack();
 253
 254   fBarrelTree->Branch("tracks", &fBarrelArray);
 255   sav->cd();
 256 }
 257
 258 //_____________________________________________________________________
 259
 260 void AliTRDtracker::StoreBarrelTrack(AliTRDtrack *ps, Int_t refPlane, Int_t isIn) {
 261   //
 262   //
 263   //
 264
 265   if (!IsStoringBarrel()) return;
 266
 267   static Int_t nClusters;
 268   static Int_t nWrong;
 269   static Double_t chi2;
 270   static Int_t index;
 271   static Bool_t wasLast = kTRUE;
 272
 273   Int_t newClusters, newWrong;
 274   Double_t newChi2;
 275
 276   if (wasLast) {
 277
 278     fBarrelArray->Clear();
 279     nClusters = nWrong = 0;
 280     chi2 = 0.0;
 281     index = 0;
 282     wasLast = kFALSE;
 283   }
 284
 285   fBarrelTrack = (AliBarrelTrack*)(*fBarrelArray)[index++];
 286   ps->GetBarrelTrack(fBarrelTrack);
 287
 288   newClusters = ps->GetNumberOfClusters() - nClusters;
 289   newWrong = ps->GetNWrong() - nWrong;
 290   newChi2 = ps->GetChi2() - chi2;
 291
 292   nClusters =  ps->GetNumberOfClusters();
 293   nWrong = ps->GetNWrong();
 294   chi2 = ps->GetChi2();
 295
 296   if (refPlane != fgkLastPlane) {
 297     fBarrelTrack->SetNClusters(newClusters, newChi2);
 298     fBarrelTrack->SetNWrongClusters(newWrong);
 299   } else {
 300     wasLast = kTRUE;
 301   }
 302
 303   fBarrelTrack->SetRefPlane(refPlane, isIn);
 304 }
 305
 306 //_____________________________________________________________________
 307
 308 Bool_t AliTRDtracker::AdjustSector(AliTRDtrack *track) {
 309   //
 310   // Rotates the track when necessary
 311   //
 312
 313   Double_t alpha = AliTRDgeometry::GetAlpha();
 314   Double_t y = track->GetY();
 315   Double_t ymax = track->GetX()*TMath::Tan(0.5*alpha);
 316
 317   //Int_t ns = AliTRDgeometry::kNsect;
 318   //Int_t s=Int_t(track->GetAlpha()/alpha)%ns;
 319
 320   if (y > ymax) {
 321     //s = (s+1) % ns;
 322     if (!track->Rotate(alpha)) return kFALSE;
 323   } else if (y <-ymax) {
 324     //s = (s-1+ns) % ns;
 325     if (!track->Rotate(-alpha)) return kFALSE;
 326   }
 327
 328   return kTRUE;
 329 }
 330
 331 //_____________________________________________________________________
 332 inline Double_t f1trd(Double_t x1,Double_t y1,
 333                       Double_t x2,Double_t y2,
 334                       Double_t x3,Double_t y3)
 335 {
 336   //
 337   // Initial approximation of the track curvature
 338   //
 339   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
 340   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
 341                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
 342   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
 343                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
 344
 345   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
 346
 347   return -xr*yr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
 348 }
 349
 350 //_____________________________________________________________________
 351 inline Double_t f2trd(Double_t x1,Double_t y1,
 352                       Double_t x2,Double_t y2,
 353                       Double_t x3,Double_t y3)
 354 {
 355   //
 356   // Initial approximation of the track curvature times X coordinate
 357   // of the center of curvature
 358   //
 359
 360   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
 361   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
 362                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
 363   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
 364                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
 365
 366   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
 367
 368   return -a/(d*y1-b)*xr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
 369 }
 370
 371 //_____________________________________________________________________
 372 inline Double_t f3trd(Double_t x1,Double_t y1,
 373                       Double_t x2,Double_t y2,
 374                       Double_t z1,Double_t z2)
 375 {
 376   //
 377   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
 378   //
 379
 380   return (z1 - z2)/sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
 381 }
 382
 383
 384 AliTRDcluster * AliTRDtracker::GetCluster(AliTRDtrack * track, Int_t plane, Int_t timebin){
 385   //
 386   //try to find cluster in the backup list
 387   //
 388   AliTRDcluster * cl =0;
 389   UInt_t *indexes = track->GetBackupIndexes();
 390   for (UInt_t i=0;i<kMaxTimeBinIndex;i++){
 391     if (indexes[i]==0) break;
 392     AliTRDcluster * cli = (AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(indexes[i]);
 393     if (!cli) break;
 394     if (cli->GetLocalTimeBin()!=timebin) continue;
 395     Int_t iplane = fGeom->GetPlane(cli->GetDetector());
 396     if (iplane==plane) {
 397       cl = cli;
 398       break;
 399     }
 400   }
 401   return cl;
 402 }
 403
 404
 405 Int_t  AliTRDtracker::GetLastPlane(AliTRDtrack * track){
 406   //
 407   //return last updated plane
 408   Int_t lastplane=0;
 409   UInt_t *indexes = track->GetBackupIndexes();
 410   for (UInt_t i=0;i<kMaxTimeBinIndex;i++){
 411     AliTRDcluster * cli = (AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(indexes[i]);
 412     if (!cli) break;
 413     Int_t iplane = fGeom->GetPlane(cli->GetDetector());
 414     if (iplane>lastplane) {
 415       lastplane = iplane;
 416     }
 417   }
 418   return lastplane;
 419 }
 420 //___________________________________________________________________
 421 Int_t AliTRDtracker::Clusters2Tracks(AliESD* event)
 422 {
 423   //
 424   // Finds tracks within the TRD. The ESD event is expected to contain seeds
 425   // at the outer part of the TRD. The seeds
 426   // are found within the TRD if fAddTRDseeds is TRUE.
 427   // The tracks are propagated to the innermost time bin
 428   // of the TRD and the ESD event is updated
 429   //
 430
 431   Int_t timeBins = fTrSec[0]->GetNumberOfTimeBins();
 432   Float_t foundMin = fgkMinClustersInTrack * timeBins;
 433   Int_t nseed = 0;
 434   Int_t found = 0;
 435   Int_t innerTB = fTrSec[0]->GetInnerTimeBin();
 436
 437   Int_t n = event->GetNumberOfTracks();
 438   for (Int_t i=0; i<n; i++) {
 439     AliESDtrack* seed=event->GetTrack(i);
 440     ULong_t status=seed->GetStatus();
 441     if ( (status & AliESDtrack::kTRDout ) == 0 ) continue;
 442     if ( (status & AliESDtrack::kTRDin) != 0 ) continue;
 443     nseed++;
 444
 445     AliTRDtrack* seed2 = new AliTRDtrack(*seed);
 446     //seed2->ResetCovariance();
 447     AliTRDtrack *pt = new AliTRDtrack(*seed2,seed2->GetAlpha());
 448     AliTRDtrack &t=*pt;
 449     FollowProlongation(t, innerTB);
 450     if (t.GetNumberOfClusters() >= foundMin) {
 451       UseClusters(&t);
 452       CookLabel(pt, 1-fgkLabelFraction);
 453       //      t.CookdEdx();
 454     }
 455     found++;
 456 //    cout<<found<<'\r';
 457
 458     if(PropagateToTPC(t)) {
 459       seed->UpdateTrackParams(pt, AliESDtrack::kTRDin);
 460     }
 461     delete seed2;
 462     delete pt;
 463   }
 464
 465   cout<<"Number of loaded seeds: "<<nseed<<endl;
 466   cout<<"Number of found tracks from loaded seeds: "<<found<<endl;
 467
 468   // after tracks from loaded seeds are found and the corresponding
 469   // clusters are used, look for additional seeds from TRD
 470
 471   if(fAddTRDseeds) {
 472     // Find tracks for the seeds in the TRD
 473     Int_t timeBins = fTrSec[0]->GetNumberOfTimeBins();
 474
 475     Int_t nSteps = (Int_t) (fgkSeedDepth / fgkSeedStep);
 476     Int_t gap = (Int_t) (timeBins * fgkSeedGap);
 477     Int_t step = (Int_t) (timeBins * fgkSeedStep);
 478
 479     // make a first turn with tight cut on initial curvature
 480     for(Int_t turn = 1; turn <= 2; turn++) {
 481       if(turn == 2) {
 482         nSteps = (Int_t) (fgkSeedDepth / (3*fgkSeedStep));
 483         step = (Int_t) (timeBins * (3*fgkSeedStep));
 484       }
 485       for(Int_t i=0; i<nSteps; i++) {
 486         Int_t outer=timeBins-1-i*step;
 487         Int_t inner=outer-gap;
 488
 489         nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
 490
 491         MakeSeeds(inner, outer, turn);
 492
 493         nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
 494         //        printf("\n turn %d, step %d: number of seeds for TRD inward %d\n",
 495         //               turn, i, nseed);
 496
 497         for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 498           AliTRDtrack *pt=(AliTRDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i), &t=*pt;
 499           FollowProlongation(t,innerTB);
 500           if (t.GetNumberOfClusters() >= foundMin) {
 501             UseClusters(&t);
 502             CookLabel(pt, 1-fgkLabelFraction);
 503             t.CookdEdx();
 504             found++;
 505 //            cout<<found<<'\r';
 506             if(PropagateToTPC(t)) {
 507               AliESDtrack track;
 508               track.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTRDin);
 509               event->AddTrack(&track);
 510               //              track.SetTRDtrack(new AliTRDtrack(*pt));
 511             }
 512           }
 513           delete fSeeds->RemoveAt(i);
 514           fNseeds--;
 515         }
 516       }
 517     }
 518   }
 519
 520   cout<<"Total number of found tracks: "<<found<<endl;
 521
 522   return 0;
 523 }
 524
 525
 526
 527 //_____________________________________________________________________________
 528 Int_t AliTRDtracker::PropagateBack(AliESD* event) {
 529   //
 530   // Gets seeds from ESD event. The seeds are AliTPCtrack's found and
 531   // backpropagated by the TPC tracker. Each seed is first propagated
 532   // to the TRD, and then its prolongation is searched in the TRD.
 533   // If sufficiently long continuation of the track is found in the TRD
 534   // the track is updated, otherwise it's stored as originaly defined
 535   // by the TPC tracker.
 536   //
 537
 538   Int_t found=0;
 539   Float_t foundMin = 20;
 540
 541   Int_t n = event->GetNumberOfTracks();
 542   for (Int_t i=0; i<n; i++) {
 543     AliESDtrack* seed=event->GetTrack(i);
 544     ULong_t status=seed->GetStatus();
 545     if ( (status & AliESDtrack::kTPCout ) == 0 ) continue;
 546     if ( (status & AliESDtrack::kTRDout) != 0 ) continue;
 547
 548     Int_t lbl = seed->GetLabel();
 549     AliTRDtrack *track = new AliTRDtrack(*seed);
 550     track->SetSeedLabel(lbl);
 551     fNseeds++;
 552     Float_t p4 = track->GetC();
 553     //
 554     Int_t expectedClr = FollowBackProlongation(*track);
 555     if (track->GetNumberOfClusters()<expectedClr/3){
 556       AliTRDtrack *track1 = new AliTRDtrack(*seed);
 557       track1->SetSeedLabel(lbl);
 558       FollowBackProlongation(*track1);
 559       AliTRDtrack *track2= new AliTRDtrack(*seed);
 560       track->SetSeedLabel(lbl);
 561       FollowBackProlongation(*track2);
 562       delete track1;
 563       delete track2;
 564     }
 565     if (TMath::Abs(track->GetC()-p4)/TMath::Abs(p4)>0.2) {
 566       delete track;
 567       continue; //too big change of curvature - to be checked
 568     }
 569     Int_t foundClr = track->GetNumberOfClusters();
 570     if (foundClr >= foundMin) {
 571       if(foundClr >= 2) {
 572         track->CookdEdx();
 573         CookLabel(track, 1-fgkLabelFraction);
 574         UseClusters(track);
 575       }
 576
 577       // Propagate to outer reference plane [SR, GSI, 18.02.2003]
 578       //      track->PropagateTo(364.8);  why?
 579
 580       //seed->UpdateTrackParams(track, AliESDtrack::kTRDout);
 581       //found++;
 582       if (track->GetNCross()==0) seed->UpdateTrackParams(track, AliESDtrack::kTRDbackup);
 583       else{
 584         if (track->GetBackupTrack()) seed->UpdateTrackParams(track->GetBackupTrack(), AliESDtrack::kTRDbackup);
 585       }
 586     }
 587
 588     //Propagation to the TOF (I.Belikov)
 589
 590     if (track->GetStop()==kFALSE){
 591
 592       Double_t xtof=371.;
 593       Double_t c2=track->GetC()*xtof - track->GetEta();
 594       if (TMath::Abs(c2)>=0.85) {
 595         delete track;
 596         continue;
 597       }
 598       Double_t xTOF0 = 371. ;
 599       PropagateToOuterPlane(*track,xTOF0);
 600       //
 601       Double_t ymax=xtof*TMath::Tan(0.5*AliTRDgeometry::GetAlpha());
 602       Double_t y=track->GetYat(xtof);
 603       if (y > ymax) {
 604         if (!track->Rotate(AliTRDgeometry::GetAlpha())) {
 605           delete track;
 606           continue;
 607         }
 608       } else if (y <-ymax) {
 609         if (!track->Rotate(-AliTRDgeometry::GetAlpha())) {
 610           delete track;
 611           continue;
 612         }
 613       }
 614
 615       if (track->PropagateTo(xtof)) {
 616         seed->UpdateTrackParams(track, AliESDtrack::kTRDout);
 617         seed->SetTRDtrack(new AliTRDtrack(*track));
 618         if (track->GetNumberOfClusters()>foundMin) found++;
 619       }
 620     }else{
 621       if (track->GetNumberOfClusters()>15&&track->GetNumberOfClusters()>0.5*expectedClr){
 622         seed->UpdateTrackParams(track, AliESDtrack::kTRDout);
 623         //seed->SetStatus(AliESDtrack::kTRDStop);
 624         seed->SetTRDtrack(new AliTRDtrack(*track));
 625         found++;
 626       }
 627     }
 628
 629     delete track;
 630
 631     //End of propagation to the TOF
 632     //if (foundClr>foundMin)
 633     //  seed->UpdateTrackParams(track, AliESDtrack::kTRDout);
 634
 635
 636   }
 637
 638   cerr<<"Number of seeds: "<<fNseeds<<endl;
 639   cerr<<"Number of back propagated TRD tracks: "<<found<<endl;
 640
 641   fSeeds->Clear(); fNseeds=0;
 642
 643   return 0;
 644
 645 }
 646
 647 //_____________________________________________________________________________
 648 Int_t AliTRDtracker::RefitInward(AliESD* event)
 649 {
 650   //
 651   // Refits tracks within the TRD. The ESD event is expected to contain seeds
 652   // at the outer part of the TRD.
 653   // The tracks are propagated to the innermost time bin
 654   // of the TRD and the ESD event is updated
 655   // Origin: Thomas KUHR (Thomas.Kuhr@cern.ch)
 656   //
 657
 658   Int_t timeBins = fTrSec[0]->GetNumberOfTimeBins();
 659   Float_t foundMin = fgkMinClustersInTrack * timeBins;
 660   Int_t nseed = 0;
 661   Int_t found = 0;
 662   Int_t innerTB = fTrSec[0]->GetInnerTimeBin();
 663
 664   Int_t n = event->GetNumberOfTracks();
 665   for (Int_t i=0; i<n; i++) {
 666     AliESDtrack* seed=event->GetTrack(i);
 667     ULong_t status=seed->GetStatus();
 668     if ( (status & AliESDtrack::kTRDout ) == 0 ) continue;
 669     if ( (status & AliESDtrack::kTRDin) != 0 ) continue;
 670     nseed++;
 671
 672     AliTRDtrack* seed2 = new AliTRDtrack(*seed);
 673     seed2->ResetCovariance(5.);
 674     AliTRDtrack *pt = new AliTRDtrack(*seed2,seed2->GetAlpha());
 675     UInt_t * indexes2 = seed2->GetIndexes();
 676     UInt_t * indexes3 = pt->GetBackupIndexes();
 677     for (Int_t i=0;i<200;i++) {
 678       if (indexes2[i]==0) break;
 679       indexes3[i] = indexes2[i];
 680     }
 681     //AliTRDtrack *pt = seed2;
 682     AliTRDtrack &t=*pt;
 683     FollowProlongation(t, innerTB);
 684     /*
 685     if (t.GetNumberOfClusters()<seed->GetTRDclusters(indexes3)*0.5){
 686       // debug  - why we dont go back?
 687       AliTRDtrack *pt2 = new AliTRDtrack(*seed2,seed2->GetAlpha());
 688       UInt_t * indexes2 = seed2->GetIndexes();
 689       UInt_t * indexes3 = pt2->GetBackupIndexes();
 690       for (Int_t i=0;i<200;i++) {
 691         if (indexes2[i]==0) break;
 692         indexes3[i] = indexes2[i];
 693       }
 694       FollowProlongation(*pt2, innerTB);
 695       delete pt2;
 696     }
 697     */
 698     if (t.GetNumberOfClusters() >= foundMin) {
 699       //      UseClusters(&t);
 700       //CookLabel(pt, 1-fgkLabelFraction);
 701       //      t.CookdEdx();
 702     }
 703     found++;
 704 //    cout<<found<<'\r';
 705
 706     if(PropagateToTPC(t)) {
 707       seed->UpdateTrackParams(pt, AliESDtrack::kTRDrefit);
 708     }else{
 709       //if not prolongation to TPC - propagate without update
 710       AliTRDtrack* seed2 = new AliTRDtrack(*seed);
 711       seed2->ResetCovariance(5.);
 712       AliTRDtrack *pt2 = new AliTRDtrack(*seed2,seed2->GetAlpha());
 713       delete seed2;
 714       if (PropagateToTPC(*pt2))
 715         seed->UpdateTrackParams(pt2, AliESDtrack::kTRDrefit);
 716       delete pt2;
 717     }
 718
 719     delete seed2;
 720     delete pt;
 721   }
 722
 723   cout<<"Number of loaded seeds: "<<nseed<<endl;
 724   cout<<"Number of found tracks from loaded seeds: "<<found<<endl;
 725
 726   return 0;
 727
 728 }
 729
 730
 731 //---------------------------------------------------------------------------
 732 Int_t AliTRDtracker::FollowProlongation(AliTRDtrack& t, Int_t rf)
 733 {
 734   // Starting from current position on track=t this function tries
 735   // to extrapolate the track up to timeBin=0 and to confirm prolongation
 736   // if a close cluster is found. Returns the number of clusters
 737   // expected to be found in sensitive layers
 738
 739   Float_t  wIndex, wTB, wChi2;
 740   Float_t  wYrt, wYclosest, wYcorrect, wYwindow;
 741   Float_t  wZrt, wZclosest, wZcorrect, wZwindow;
 742   Float_t  wPx, wPy, wPz, wC;
 743   Double_t px, py, pz;
 744   Float_t  wSigmaC2, wSigmaTgl2, wSigmaY2, wSigmaZ2;
 745   Int_t lastplane = GetLastPlane(&t);
 746
 747   Int_t trackIndex = t.GetLabel();
 748
 749   Int_t ns=Int_t(2*TMath::Pi()/AliTRDgeometry::GetAlpha()+0.5);
 750
 751   Int_t tryAgain=fMaxGap;
 752
 753   Double_t alpha=t.GetAlpha();
 754   alpha = TVector2::Phi_0_2pi(alpha);
 755
 756   Int_t s=Int_t(alpha/AliTRDgeometry::GetAlpha())%AliTRDgeometry::kNsect;
 757   Double_t radLength, rho, x, dx, y, ymax, z;
 758
 759   Int_t expectedNumberOfClusters = 0;
 760   Bool_t lookForCluster;
 761
 762   alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();  // note: change in meaning
 763
 764
 765   for (Int_t nr=fTrSec[0]->GetLayerNumber(t.GetX()); nr>rf; nr--) {
 766
 767     y = t.GetY(); z = t.GetZ();
 768
 769     // first propagate to the inner surface of the current time bin
 770     fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
 771     x = fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetX()-dx/2; y = t.GetY(); z = t.GetZ();
 772     if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
 773     y = t.GetY();
 774     ymax = x*TMath::Tan(0.5*alpha);
 775     if (y > ymax) {
 776       s = (s+1) % ns;
 777       if (!t.Rotate(alpha)) break;
 778       if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
 779     } else if (y <-ymax) {
 780       s = (s-1+ns) % ns;
 781       if (!t.Rotate(-alpha)) break;
 782       if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
 783     }
 784
 785     y = t.GetY(); z = t.GetZ();
 786
 787     // now propagate to the middle plane of the next time bin
 788     fTrSec[s]->GetLayer(nr-1)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
 789     x = fTrSec[s]->GetLayer(nr-1)->GetX(); y = t.GetY(); z = t.GetZ();
 790     if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
 791     y = t.GetY();
 792     ymax = x*TMath::Tan(0.5*alpha);
 793     if (y > ymax) {
 794       s = (s+1) % ns;
 795       if (!t.Rotate(alpha)) break;
 796       if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
 797     } else if (y <-ymax) {
 798       s = (s-1+ns) % ns;
 799       if (!t.Rotate(-alpha)) break;
 800       if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
 801     }
 802
 803
 804     if(lookForCluster) {
 805
 806       expectedNumberOfClusters++;
 807       wIndex = (Float_t) t.GetLabel();
 808       wTB = nr;
 809
 810       AliTRDpropagationLayer& timeBin=*(fTrSec[s]->GetLayer(nr-1));
 811
 812       Double_t sy2=ExpectedSigmaY2(x,t.GetTgl(),t.GetPt());
 813       Double_t sz2=ExpectedSigmaZ2(x,t.GetTgl());
 814
 815       Double_t road;
 816       if((t.GetSigmaY2() + sy2) > 0) road=10.*sqrt(t.GetSigmaY2() + sy2);
 817       else return expectedNumberOfClusters;
 818
 819       wYrt = (Float_t) y;
 820       wZrt = (Float_t) z;
 821       wYwindow = (Float_t) road;
 822       t.GetPxPyPz(px,py,pz);
 823       wPx = (Float_t) px;
 824       wPy = (Float_t) py;
 825       wPz = (Float_t) pz;
 826       wC  = (Float_t) t.GetC();
 827       wSigmaC2 = (Float_t) t.GetSigmaC2();
 828       wSigmaTgl2    = (Float_t) t.GetSigmaTgl2();
 829       wSigmaY2 = (Float_t) t.GetSigmaY2();
 830       wSigmaZ2 = (Float_t) t.GetSigmaZ2();
 831       wChi2 = -1;
 832
 833
 834       AliTRDcluster *cl=0;
 835       UInt_t index=0;
 836
 837       Double_t maxChi2=fgkMaxChi2;
 838
 839       wYclosest = 12345678;
 840       wYcorrect = 12345678;
 841       wZclosest = 12345678;
 842       wZcorrect = 12345678;
 843       wZwindow  = TMath::Sqrt(2.25 * 12 * sz2);
 844
 845       // Find the closest correct cluster for debugging purposes
 846       if (timeBin) {
 847         Float_t minDY = 1000000;
 848         for (Int_t i=0; i<timeBin; i++) {
 849           AliTRDcluster* c=(AliTRDcluster*)(timeBin[i]);
 850           if((c->GetLabel(0) != trackIndex) &&
 851              (c->GetLabel(1) != trackIndex) &&
 852              (c->GetLabel(2) != trackIndex)) continue;
 853           if(TMath::Abs(c->GetY() - y) > minDY) continue;
 854           minDY = TMath::Abs(c->GetY() - y);
 855           wYcorrect = c->GetY();
 856           wZcorrect = c->GetZ();
 857
 858           Double_t h01 = GetTiltFactor(c);
 859           wChi2 = t.GetPredictedChi2(c, h01);
 860         }
 861       }
 862
 863       // Now go for the real cluster search
 864
 865       if (timeBin) {
 866         //
 867         //find cluster in history
 868         cl =0;
 869
 870         AliTRDcluster * cl0 = timeBin[0];
 871         if (!cl0) {
 872           continue;
 873         }
 874         Int_t plane = fGeom->GetPlane(cl0->GetDetector());
 875         if (plane>lastplane) continue;
 876         Int_t timebin = cl0->GetLocalTimeBin();
 877         AliTRDcluster * cl2= GetCluster(&t,plane, timebin);
 878         if (cl2) {
 879           cl =cl2;
 880           Double_t h01 = GetTiltFactor(cl);
 881           maxChi2=t.GetPredictedChi2(cl,h01);
 882         }
 883         if ((!cl) && road>fgkWideRoad) {
 884           //if (t.GetNumberOfClusters()>4)
 885           //  cerr<<t.GetNumberOfClusters()
 886           //    <<"FindProlongation warning: Too broad road !\n";
 887           continue;
 888         }
 889
 890
 891         if(!cl){
 892
 893           for (Int_t i=timeBin.Find(y-road); i<timeBin; i++) {
 894             AliTRDcluster* c=(AliTRDcluster*)(timeBin[i]);
 895             if (c->GetY() > y+road) break;
 896             if (c->IsUsed() > 0) continue;
 897             if((c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z) > 3 * sz2) continue;
 898
 899             Double_t h01 = GetTiltFactor(c);
 900             Double_t chi2=t.GetPredictedChi2(c,h01);
 901
 902             if (chi2 > maxChi2) continue;
 903             maxChi2=chi2;
 904             cl=c;
 905             index=timeBin.GetIndex(i);
 906           }
 907         }
 908
 909         if(!cl) {
 910
 911           for (Int_t i=timeBin.Find(y-road); i<timeBin; i++) {
 912             AliTRDcluster* c=(AliTRDcluster*)(timeBin[i]);
 913
 914             if (c->GetY() > y+road) break;
 915             if (c->IsUsed() > 0) continue;
 916             if((c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z) > 12 * sz2) continue;
 917
 918             Double_t h01 = GetTiltFactor(c);
 919             Double_t chi2=t.GetPredictedChi2(c, h01);
 920
 921             if (chi2 > maxChi2) continue;
 922             maxChi2=chi2;
 923             cl=c;
 924             index=timeBin.GetIndex(i);
 925           }
 926         }
 927         if (cl) {
 928           wYclosest = cl->GetY();
 929           wZclosest = cl->GetZ();
 930           Double_t h01 = GetTiltFactor(cl);
 931
 932           t.SetSampledEdx(cl->GetQ()/dx,t.GetNumberOfClusters());
 933           //printf("Track   position\t%f\t%f\t%f\n",t.GetX(),t.GetY(),t.GetZ());
 934           //printf("Cluster position\t%d\t%f\t%f\n",cl->GetLocalTimeBin(),cl->GetY(),cl->GetZ());
 935           Int_t det = cl->GetDetector();
 936           Int_t plane = fGeom->GetPlane(det);
 937
 938           if(!t.UpdateMI(cl,maxChi2,index,h01,plane)) {
 939             //if(!t.Update(cl,maxChi2,index,h01)) {
 940             //if(!tryAgain--) return 0;
 941           }
 942           else tryAgain=fMaxGap;
 943         }
 944         else {
 945           //if (tryAgain==0) break;
 946           tryAgain--;
 947         }
 948
 949         /*
 950         if((((Int_t) wTB)%15 == 0) || (((Int_t) wTB)%15 == 14)) {
 951
 952           printf(" %f", wIndex);       //1
 953           printf(" %f", wTB);          //2
 954           printf(" %f", wYrt);         //3
 955           printf(" %f", wYclosest);    //4
 956           printf(" %f", wYcorrect);    //5
 957           printf(" %f", wYwindow);     //6
 958           printf(" %f", wZrt);         //7
 959           printf(" %f", wZclosest);    //8
 960           printf(" %f", wZcorrect);    //9
 961           printf(" %f", wZwindow);     //10
 962           printf(" %f", wPx);          //11
 963           printf(" %f", wPy);          //12
 964           printf(" %f", wPz);          //13
 965           printf(" %f", wSigmaC2*1000000);  //14
 966           printf(" %f", wSigmaTgl2*1000);   //15
 967           printf(" %f", wSigmaY2);     //16
 968           //      printf(" %f", wSigmaZ2);     //17
 969           printf(" %f", wChi2);     //17
 970           printf(" %f", wC);           //18
 971           printf("\n");
 972         }
 973         */
 974       }
 975     }
 976   }
 977   return expectedNumberOfClusters;
 978
 979
 980 }
 981
 982 //___________________________________________________________________
 983
 984 Int_t AliTRDtracker::FollowBackProlongation(AliTRDtrack& t)
 985 {
 986   // Starting from current radial position of track <t> this function
 987   // extrapolates the track up to outer timebin and in the sensitive
 988   // layers confirms prolongation if a close cluster is found.
 989   // Returns the number of clusters expected to be found in sensitive layers
 990
 991
 992   Float_t  wIndex, wTB, wChi2;
 993   Float_t  wYrt, wYclosest, wYcorrect, wYwindow;
 994   Float_t  wZrt, wZclosest, wZcorrect, wZwindow;
 995   Float_t  wPx, wPy, wPz, wC;
 996   Double_t px, py, pz;
 997   Float_t  wSigmaC2, wSigmaTgl2, wSigmaY2, wSigmaZ2;
 998
 999   Int_t trackIndex = t.GetLabel();
1000   Int_t tryAgain=fMaxGap;
1001
1002   Double_t alpha=t.GetAlpha();
1003   TVector2::Phi_0_2pi(alpha);
1004
1005   Int_t s;
1006
1007   Int_t outerTB = fTrSec[0]->GetOuterTimeBin();
1008   Double_t radLength, rho, x, dx, y, ymax = 0, z;
1009   Bool_t lookForCluster;
1010
1011   Int_t expectedNumberOfClusters = 0;
1012   x = t.GetX();
1013
1014   alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();  // note: change in meaning
1015
1016   Int_t nRefPlane = fgkFirstPlane;
1017   Bool_t isNewLayer = kFALSE;
1018
1019   Double_t chi2;
1020   Double_t minDY;
1021   Int_t zone =-10;
1022   Int_t nr;
1023   for (nr=fTrSec[0]->GetLayerNumber(t.GetX()); nr<outerTB+1; nr++) {
1024
1025     y = t.GetY();
1026     z = t.GetZ();
1027
1028     // first propagate to the outer surface of the current time bin
1029
1030     s = t.GetSector();
1031     fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
1032     x = fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetX()+dx/2;
1033     y = t.GetY();
1034     z = t.GetZ();
1035
1036     if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
1037     //    if (!AdjustSector(&t)) break;
1038     //
1039     // MI -fix untill correct material desription will be implemented
1040     //
1041     Float_t angle =  t.GetAlpha();  // MI - if rotation - we go through the material
1042     if (!AdjustSector(&t)) break;
1043     Int_t cross = kFALSE;
1044
1045     if (TMath::Abs(angle -  t.GetAlpha())>0.000001) cross = kTRUE; //better to stop track
1046     Int_t currentzone = fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetZone(z);
1047     if (currentzone==-10) cross = kTRUE;  // we are in the frame
1048     if (currentzone>-10){   // layer knows where we are
1049       if (zone==-10) zone = currentzone;
1050       if (zone!=currentzone) cross=kTRUE;
1051     }
1052     if (cross) {
1053       t.IncCross();
1054       if (t.GetNCross()==1) t.MakeBackupTrack();
1055       if (t.GetNCross()>2) break;
1056     }
1057
1058     //
1059     //
1060     s = t.GetSector();
1061     if (!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
1062
1063     y = t.GetY();
1064     z = t.GetZ();
1065
1066     // Barrel Tracks [SR, 04.04.2003]
1067
1068     s = t.GetSector();
1069     if (fTrSec[s]->GetLayer(nr)->IsSensitive() !=
1070         fTrSec[s]->GetLayer(nr+1)->IsSensitive() ) {
1071
1072 //      if (IsStoringBarrel()) StoreBarrelTrack(&t, nRefPlane++, kTrackBack);
1073     }
1074
1075     if (fTrSec[s]->GetLayer(nr-1)->IsSensitive() &&
1076           ! fTrSec[s]->GetLayer(nr)->IsSensitive()) {
1077       isNewLayer = kTRUE;
1078     } else {isNewLayer = kFALSE;}
1079
1080     y = t.GetY();
1081     z = t.GetZ();
1082
1083     // now propagate to the middle plane of the next time bin
1084     fTrSec[s]->GetLayer(nr+1)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
1085
1086     x = fTrSec[s]->GetLayer(nr+1)->GetX();
1087       if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
1088     if (!AdjustSector(&t)) break;
1089     s = t.GetSector();
1090       if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
1091
1092     y = t.GetY();
1093     z = t.GetZ();
1094
1095     if(fVocal) printf("nr+1=%d, x %f, z %f, y %f, ymax %f\n",nr+1,x,z,y,ymax);
1096     //    printf("label %d, pl %d, lookForCluster %d \n",
1097     //     trackIndex, nr+1, lookForCluster);
1098
1099     if(lookForCluster) {
1100       expectedNumberOfClusters++;
1101
1102       wIndex = (Float_t) t.GetLabel();
1103       wTB = fTrSec[s]->GetLayer(nr+1)->GetTimeBinIndex();
1104
1105       AliTRDpropagationLayer& timeBin=*(fTrSec[s]->GetLayer(nr+1));
1106       Double_t sy2=ExpectedSigmaY2(t.GetX(),t.GetTgl(),t.GetPt());
1107       Double_t sz2=ExpectedSigmaZ2(t.GetX(),t.GetTgl());
1108       if((t.GetSigmaY2() + sy2) < 0) break;
1109       Double_t road = 10.*sqrt(t.GetSigmaY2() + sy2);
1110       Double_t y=t.GetY(), z=t.GetZ();
1111
1112       wYrt = (Float_t) y;
1113       wZrt = (Float_t) z;
1114       wYwindow = (Float_t) road;
1115       t.GetPxPyPz(px,py,pz);
1116       wPx = (Float_t) px;
1117       wPy = (Float_t) py;
1118       wPz = (Float_t) pz;
1119       wC  = (Float_t) t.GetC();
1120       wSigmaC2 = (Float_t) t.GetSigmaC2();
1121       wSigmaTgl2    = (Float_t) t.GetSigmaTgl2();
1122       wSigmaY2 = (Float_t) t.GetSigmaY2();
1123       wSigmaZ2 = (Float_t) t.GetSigmaZ2();
1124       wChi2 = -1;
1125
1126       if (road>fgkWideRoad) {
1127         if (t.GetNumberOfClusters()>4)
1128           cerr<<t.GetNumberOfClusters()
1129               <<"FindProlongation warning: Too broad road !\n";
1130         return 0;
1131       }
1132
1133       AliTRDcluster *cl=0;
1134       UInt_t index=0;
1135
1136       Double_t maxChi2=fgkMaxChi2;
1137
1138       if (isNewLayer) {
1139         road = 3 * road;
1140         //sz2 = 3 * sz2;
1141         maxChi2 = 10 * fgkMaxChi2;
1142       }
1143
1144       if (nRefPlane == fgkFirstPlane) maxChi2 = 20 * fgkMaxChi2;
1145       if (nRefPlane == fgkFirstPlane+2) maxChi2 = 15 * fgkMaxChi2;
1146       if (t.GetNRotate() > 0) maxChi2 = 3 * maxChi2;
1147
1148
1149       wYclosest = 12345678;
1150       wYcorrect = 12345678;
1151       wZclosest = 12345678;
1152       wZcorrect = 12345678;
1153       wZwindow  = TMath::Sqrt(2.25 * 12 * sz2);
1154
1155       // Find the closest correct cluster for debugging purposes
1156       if (timeBin) {
1157         minDY = 1000000;
1158         for (Int_t i=0; i<timeBin; i++) {
1159           AliTRDcluster* c=(AliTRDcluster*)(timeBin[i]);
1160           if((c->GetLabel(0) != trackIndex) &&
1161              (c->GetLabel(1) != trackIndex) &&
1162              (c->GetLabel(2) != trackIndex)) continue;
1163           if(TMath::Abs(c->GetY() - y) > minDY) continue;
1164           //minDY = TMath::Abs(c->GetY() - y);
1165           minDY = c->GetY() - y;
1166           wYcorrect = c->GetY();
1167           wZcorrect = c->GetZ();
1168
1169           Double_t h01 = GetTiltFactor(c);
1170           wChi2 = t.GetPredictedChi2(c, h01);
1171         }
1172       }
1173
1174       // Now go for the real cluster search
1175
1176       if (timeBin) {
1177
1178         for (Int_t i=timeBin.Find(y-road); i<timeBin; i++) {
1179           AliTRDcluster* c=(AliTRDcluster*)(timeBin[i]);
1180           if (c->GetY() > y+road) break;
1181           if (c->IsUsed() > 0) continue;
1182           if((c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z) > 3 * sz2) continue;
1183
1184           Double_t h01 = GetTiltFactor(c);
1185           chi2=t.GetPredictedChi2(c,h01);
1186
1187           if (chi2 > maxChi2) continue;
1188           maxChi2=chi2;
1189           cl=c;
1190           index=timeBin.GetIndex(i);
1191
1192           //check is correct
1193           if((c->GetLabel(0) != trackIndex) &&
1194              (c->GetLabel(1) != trackIndex) &&
1195              (c->GetLabel(2) != trackIndex)) t.AddNWrong();
1196         }
1197
1198         if(!cl) {
1199
1200           for (Int_t i=timeBin.Find(y-road); i<timeBin; i++) {
1201             AliTRDcluster* c=(AliTRDcluster*)(timeBin[i]);
1202
1203             if (c->GetY() > y+road) break;
1204             if (c->IsUsed() > 0) continue;
1205             if((c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z) > 2.25 * 12 * sz2) continue;
1206
1207             Double_t h01 = GetTiltFactor(c);
1208             chi2=t.GetPredictedChi2(c,h01);
1209
1210             if (chi2 > maxChi2) continue;
1211             maxChi2=chi2;
1212             cl=c;
1213             index=timeBin.GetIndex(i);
1214           }
1215         }
1216
1217         if (cl) {
1218           wYclosest = cl->GetY();
1219           wZclosest = cl->GetZ();
1220
1221           t.SetSampledEdx(cl->GetQ()/dx,t.GetNumberOfClusters());
1222           Double_t h01 = GetTiltFactor(cl);
1223           Int_t det = cl->GetDetector();
1224           Int_t plane = fGeom->GetPlane(det);
1225
1226           if(!t.UpdateMI(cl,maxChi2,index,h01,plane)) {
1227           //if(!t.Update(cl,maxChi2,index,h01)) {
1228             if(!tryAgain--) return 0;
1229           }
1230           else tryAgain=fMaxGap;
1231         }
1232         else {
1233           if (tryAgain==0) break;
1234           tryAgain--;
1235
1236           //if (minDY < 1000000 && isNewLayer)
1237             //cout << "\t" << nRefPlane << "\t" << "\t" << t.GetNRotate() <<  "\t" <<
1238             //  road << "\t" << minDY << "\t" << chi2 << "\t" << wChi2 << "\t" << maxChi2 << endl;
1239
1240         }
1241
1242         isNewLayer = kFALSE;
1243
1244         /*
1245         if((((Int_t) wTB)%15 == 0) || (((Int_t) wTB)%15 == 14)) {
1246
1247           printf(" %f", wIndex);       //1
1248           printf(" %f", wTB);          //2
1249           printf(" %f", wYrt);         //3
1250           printf(" %f", wYclosest);    //4
1251           printf(" %f", wYcorrect);    //5
1252           printf(" %f", wYwindow);     //6
1253           printf(" %f", wZrt);         //7
1254           printf(" %f", wZclosest);    //8
1255           printf(" %f", wZcorrect);    //9
1256           printf(" %f", wZwindow);     //10
1257           printf(" %f", wPx);          //11
1258           printf(" %f", wPy);          //12
1259           printf(" %f", wPz);          //13
1260           printf(" %f", wSigmaC2*1000000);  //14
1261           printf(" %f", wSigmaTgl2*1000);   //15
1262           printf(" %f", wSigmaY2);     //16
1263           //      printf(" %f", wSigmaZ2);     //17
1264           printf(" %f", wChi2);     //17
1265           printf(" %f", wC);           //18
1266           printf("\n");
1267         }
1268         */
1269       }
1270     }
1271   }
1272   if (nr<outerTB)
1273     t.SetStop(kTRUE);
1274   else
1275     t.SetStop(kFALSE);
1276   return expectedNumberOfClusters;
1277
1278
1279 }
1280
1281 //---------------------------------------------------------------------------
1282 Int_t AliTRDtracker::Refit(AliTRDtrack& t, Int_t rf)
1283 {
1284   // Starting from current position on track=t this function tries
1285   // to extrapolate the track up to timeBin=0 and to reuse already
1286   // assigned clusters. Returns the number of clusters
1287   // expected to be found in sensitive layers
1288   // get indices of assigned clusters for each layer
1289   // Origin: Thomas KUHR (Thomas.Kuhr@cern.ch)
1290
1291   Int_t iCluster[90];
1292   for (Int_t i = 0; i < 90; i++) iCluster[i] = 0;
1293   for (Int_t i = 0; i < t.GetNumberOfClusters(); i++) {
1294     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
1295     AliTRDcluster *cl=(AliTRDcluster*) GetCluster(index);
1296     if (!cl) continue;
1297     Int_t detector=cl->GetDetector();
1298     Int_t localTimeBin=cl->GetLocalTimeBin();
1299     Int_t sector=fGeom->GetSector(detector);
1300     Int_t plane=fGeom->GetPlane(detector);
1301
1302     Int_t trackingSector = CookSectorIndex(sector);
1303
1304     Int_t gtb = fTrSec[trackingSector]->CookTimeBinIndex(plane,localTimeBin);
1305     if(gtb < 0) continue;
1306     Int_t layer = fTrSec[trackingSector]->GetLayerNumber(gtb);
1307     iCluster[layer] = index;
1308   }
1309   t.ResetClusters();
1310
1311   Int_t ns=Int_t(2*TMath::Pi()/AliTRDgeometry::GetAlpha()+0.5);
1312
1313   Double_t alpha=t.GetAlpha();
1314   alpha = TVector2::Phi_0_2pi(alpha);
1315
1316   Int_t s=Int_t(alpha/AliTRDgeometry::GetAlpha())%AliTRDgeometry::kNsect;
1317   Double_t radLength, rho, x, dx, y, ymax, z;
1318
1319   Int_t expectedNumberOfClusters = 0;
1320   Bool_t lookForCluster;
1321
1322   alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();  // note: change in meaning
1323
1324
1325   for (Int_t nr=fTrSec[0]->GetLayerNumber(t.GetX()); nr>rf; nr--) {
1326
1327     y = t.GetY(); z = t.GetZ();
1328
1329     // first propagate to the inner surface of the current time bin
1330     fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
1331     x = fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetX()-dx/2; y = t.GetY(); z = t.GetZ();
1332     if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
1333     y = t.GetY();
1334     ymax = x*TMath::Tan(0.5*alpha);
1335     if (y > ymax) {
1336       s = (s+1) % ns;
1337       if (!t.Rotate(alpha)) break;
1338       if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
1339     } else if (y <-ymax) {
1340       s = (s-1+ns) % ns;
1341       if (!t.Rotate(-alpha)) break;
1342       if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
1343     }
1344
1345     y = t.GetY(); z = t.GetZ();
1346
1347     // now propagate to the middle plane of the next time bin
1348     fTrSec[s]->GetLayer(nr-1)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
1349     x = fTrSec[s]->GetLayer(nr-1)->GetX(); y = t.GetY(); z = t.GetZ();
1350     if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
1351     y = t.GetY();
1352     ymax = x*TMath::Tan(0.5*alpha);
1353     if (y > ymax) {
1354       s = (s+1) % ns;
1355       if (!t.Rotate(alpha)) break;
1356       if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
1357     } else if (y <-ymax) {
1358       s = (s-1+ns) % ns;
1359       if (!t.Rotate(-alpha)) break;
1360       if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
1361     }
1362
1363     if(lookForCluster) expectedNumberOfClusters++;
1364
1365     // use assigned cluster
1366     if (!iCluster[nr-1]) continue;
1367     AliTRDcluster *cl=(AliTRDcluster*)GetCluster(iCluster[nr-1]);
1368     Double_t h01 = GetTiltFactor(cl);
1369     Double_t chi2=t.GetPredictedChi2(cl, h01);
1370     t.SetSampledEdx(cl->GetQ()/dx,t.GetNumberOfClusters());
1371     t.Update(cl,chi2,iCluster[nr-1],h01);
1372   }
1373
1374   return expectedNumberOfClusters;
1375 }
1376
1377 //___________________________________________________________________
1378
1379 Int_t AliTRDtracker::PropagateToOuterPlane(AliTRDtrack& t, Double_t xToGo)
1380 {
1381   // Starting from current radial position of track <t> this function
1382   // extrapolates the track up to radial position <xToGo>.
1383   // Returns 1 if track reaches the plane, and 0 otherwise
1384
1385   Int_t ns=Int_t(2*TMath::Pi()/AliTRDgeometry::GetAlpha()+0.5);
1386
1387   Double_t alpha=t.GetAlpha();
1388
1389   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
1390   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
1391
1392   Int_t s=Int_t(alpha/AliTRDgeometry::GetAlpha())%AliTRDgeometry::kNsect;
1393
1394   Bool_t lookForCluster;
1395   Double_t radLength, rho, x, dx, y, ymax, z;
1396
1397   x = t.GetX();
1398
1399   alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();  // note: change in meaning
1400
1401   Int_t plToGo = fTrSec[0]->GetLayerNumber(xToGo);
1402
1403   for (Int_t nr=fTrSec[0]->GetLayerNumber(x); nr<plToGo; nr++) {
1404
1405     y = t.GetY(); z = t.GetZ();
1406
1407     // first propagate to the outer surface of the current time bin
1408     fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
1409     x = fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetX()+dx/2; y = t.GetY(); z = t.GetZ();
1410     if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) return 0;
1411     y = t.GetY();
1412     ymax = x*TMath::Tan(0.5*alpha);
1413     if (y > ymax) {
1414       s = (s+1) % ns;
1415       if (!t.Rotate(alpha)) return 0;
1416     } else if (y <-ymax) {
1417       s = (s-1+ns) % ns;
1418       if (!t.Rotate(-alpha)) return 0;
1419     }
1420     if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) return 0;
1421
1422     y = t.GetY(); z = t.GetZ();
1423
1424     // now propagate to the middle plane of the next time bin
1425     fTrSec[s]->GetLayer(nr+1)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
1426     x = fTrSec[s]->GetLayer(nr+1)->GetX(); y = t.GetY(); z = t.GetZ();
1427     if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) return 0;
1428     y = t.GetY();
1429     ymax = x*TMath::Tan(0.5*alpha);
1430     if (y > ymax) {
1431       s = (s+1) % ns;
1432       if (!t.Rotate(alpha)) return 0;
1433     } else if (y <-ymax) {
1434       s = (s-1+ns) % ns;
1435       if (!t.Rotate(-alpha)) return 0;
1436     }
1437     if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) return 0;
1438   }
1439   return 1;
1440 }
1441
1442 //___________________________________________________________________
1443
1444 Int_t AliTRDtracker::PropagateToTPC(AliTRDtrack& t)
1445 {
1446   // Starting from current radial position of track <t> this function
1447   // extrapolates the track up to radial position of the outermost
1448   // padrow of the TPC.
1449   // Returns 1 if track reaches the TPC, and 0 otherwise
1450
1451   //Int_t ns=Int_t(2*TMath::Pi()/AliTRDgeometry::GetAlpha()+0.5);
1452
1453   Double_t alpha=t.GetAlpha();
1454   alpha = TVector2::Phi_0_2pi(alpha);
1455
1456   Int_t s=Int_t(alpha/AliTRDgeometry::GetAlpha())%AliTRDgeometry::kNsect;
1457
1458   Bool_t lookForCluster;
1459   Double_t radLength, rho, x, dx, y, /*ymax,*/ z;
1460
1461   x = t.GetX();
1462
1463   alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();  // note: change in meaning
1464   Int_t plTPC = fTrSec[0]->GetLayerNumber(246.055);
1465
1466   for (Int_t nr=fTrSec[0]->GetLayerNumber(x); nr>plTPC; nr--) {
1467
1468     y = t.GetY();
1469     z = t.GetZ();
1470
1471     // first propagate to the outer surface of the current time bin
1472     fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
1473     x = fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetX()-dx/2;
1474
1475     if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) return 0;
1476     AdjustSector(&t);
1477     if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) return 0;
1478
1479     y = t.GetY();
1480     z = t.GetZ();
1481
1482     // now propagate to the middle plane of the next time bin
1483     fTrSec[s]->GetLayer(nr-1)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
1484     x = fTrSec[s]->GetLayer(nr-1)->GetX();
1485
1486     if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) return 0;
1487     AdjustSector(&t);
1488     if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) return 0;
1489   }
1490   return 1;
1491 }
1492
1493 //_____________________________________________________________________________
1494 Int_t AliTRDtracker::LoadClusters(TTree *cTree)
1495 {
1496   // Fills clusters into TRD tracking_sectors
1497   // Note that the numbering scheme for the TRD tracking_sectors
1498   // differs from that of TRD sectors
1499
1500   if (ReadClusters(fClusters,cTree)) {
1501      Error("LoadClusters","Problem with reading the clusters !");
1502      return 1;
1503   }
1504   Int_t ncl=fClusters->GetEntriesFast();
1505   fNclusters=ncl;
1506   cout<<"\n LoadSectors: sorting "<<ncl<<" clusters"<<endl;
1507
1508   UInt_t index;
1509   for (Int_t ichamber=0;ichamber<5;ichamber++)
1510     for (Int_t isector=0;isector<18;isector++){
1511       fHoles[ichamber][isector]=kTRUE;
1512     }
1513
1514
1515   while (ncl--) {
1516 //    printf("\r %d left  ",ncl);
1517     AliTRDcluster *c=(AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(ncl);
1518     Int_t detector=c->GetDetector();
1519     Int_t localTimeBin=c->GetLocalTimeBin();
1520     Int_t sector=fGeom->GetSector(detector);
1521     Int_t plane=fGeom->GetPlane(detector);
1522
1523     Int_t trackingSector = CookSectorIndex(sector);
1524     if (c->GetLabel(0)>0){
1525       Int_t chamber = fGeom->GetChamber(detector);
1526       fHoles[chamber][trackingSector]=kFALSE;
1527     }
1528
1529     Int_t gtb = fTrSec[trackingSector]->CookTimeBinIndex(plane,localTimeBin);
1530     if(gtb < 0) continue;
1531     Int_t layer = fTrSec[trackingSector]->GetLayerNumber(gtb);
1532
1533     index=ncl;
1534     fTrSec[trackingSector]->GetLayer(layer)->InsertCluster(c,index);
1535   }
1536   //  printf("\r\n");
1537   //
1538   //
1539   /*
1540   for (Int_t isector=0;isector<18;isector++){
1541     for (Int_t ichamber=0;ichamber<5;ichamber++)
1542       if (fHoles[ichamber][isector]!=fGeom->IsHole(0,ichamber,17-isector))
1543         printf("Problem \t%d\t%d\t%d\t%d\n",isector,ichamber,fHoles[ichamber][isector],
1544              fGeom->IsHole(0,ichamber,17-isector));
1545   }
1546   */
1547   return 0;
1548 }
1549
1550 //_____________________________________________________________________________
1551 void AliTRDtracker::UnloadClusters()
1552 {
1553   //
1554   // Clears the arrays of clusters and tracks. Resets sectors and timebins
1555   //
1556
1557   Int_t i, nentr;
1558
1559   nentr = fClusters->GetEntriesFast();
1560   for (i = 0; i < nentr; i++) delete fClusters->RemoveAt(i);
1561   fNclusters = 0;
1562
1563   nentr = fSeeds->GetEntriesFast();
1564   for (i = 0; i < nentr; i++) delete fSeeds->RemoveAt(i);
1565
1566   nentr = fTracks->GetEntriesFast();
1567   for (i = 0; i < nentr; i++) delete fTracks->RemoveAt(i);
1568
1569   Int_t nsec = AliTRDgeometry::kNsect;
1570
1571   for (i = 0; i < nsec; i++) {
1572     for(Int_t pl = 0; pl < fTrSec[i]->GetNumberOfLayers(); pl++) {
1573       fTrSec[i]->GetLayer(pl)->Clear();
1574     }
1575   }
1576
1577 }
1578
1579 //__________________________________________________________________________
1580 void AliTRDtracker::MakeSeeds(Int_t inner, Int_t outer, Int_t turn)
1581 {
1582   // Creates track seeds using clusters in timeBins=i1,i2
1583
1584   if(turn > 2) {
1585     cerr<<"MakeSeeds: turn "<<turn<<" exceeds the limit of 2"<<endl;
1586     return;
1587   }
1588
1589   Double_t x[5], c[15];
1590   Int_t maxSec=AliTRDgeometry::kNsect;
1591
1592   Double_t alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();
1593   Double_t shift=AliTRDgeometry::GetAlpha()/2.;
1594   Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
1595   Double_t cs2=cos(2.*alpha), sn2=sin(2.*alpha);
1596
1597
1598   Int_t i2 = fTrSec[0]->GetLayerNumber(inner);
1599   Int_t i1 = fTrSec[0]->GetLayerNumber(outer);
1600
1601   Double_t x1 =fTrSec[0]->GetX(i1);
1602   Double_t xx2=fTrSec[0]->GetX(i2);
1603
1604   for (Int_t ns=0; ns<maxSec; ns++) {
1605
1606     Int_t nl2 = *(fTrSec[(ns-2+maxSec)%maxSec]->GetLayer(i2));
1607     Int_t nl=(*fTrSec[(ns-1+maxSec)%maxSec]->GetLayer(i2));
1608     Int_t nm=(*fTrSec[ns]->GetLayer(i2));
1609     Int_t nu=(*fTrSec[(ns+1)%maxSec]->GetLayer(i2));
1610     Int_t nu2=(*fTrSec[(ns+2)%maxSec]->GetLayer(i2));
1611
1612     AliTRDpropagationLayer& r1=*(fTrSec[ns]->GetLayer(i1));
1613
1614     for (Int_t is=0; is < r1; is++) {
1615       Double_t y1=r1[is]->GetY(), z1=r1[is]->GetZ();
1616
1617       for (Int_t js=0; js < nl2+nl+nm+nu+nu2; js++) {
1618
1619         const AliTRDcluster *cl;
1620         Double_t x2,   y2,   z2;
1621         Double_t x3=0., y3=0.;
1622
1623         if (js<nl2) {
1624           if(turn != 2) continue;
1625           AliTRDpropagationLayer& r2=*(fTrSec[(ns-2+maxSec)%maxSec]->GetLayer(i2));
1626           cl=r2[js];
1627           y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
1628
1629           x2= xx2*cs2+y2*sn2;
1630           y2=-xx2*sn2+y2*cs2;
1631         }
1632         else if (js<nl2+nl) {
1633           if(turn != 1) continue;
1634           AliTRDpropagationLayer& r2=*(fTrSec[(ns-1+maxSec)%maxSec]->GetLayer(i2));
1635           cl=r2[js-nl2];
1636           y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
1637
1638           x2= xx2*cs+y2*sn;
1639           y2=-xx2*sn+y2*cs;
1640         }
1641         else if (js<nl2+nl+nm) {
1642           if(turn != 1) continue;
1643           AliTRDpropagationLayer& r2=*(fTrSec[ns]->GetLayer(i2));
1644           cl=r2[js-nl2-nl];
1645           x2=xx2; y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
1646         }
1647         else if (js<nl2+nl+nm+nu) {
1648           if(turn != 1) continue;
1649           AliTRDpropagationLayer& r2=*(fTrSec[(ns+1)%maxSec]->GetLayer(i2));
1650           cl=r2[js-nl2-nl-nm];
1651           y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
1652
1653           x2=xx2*cs-y2*sn;
1654           y2=xx2*sn+y2*cs;
1655         }
1656         else {
1657           if(turn != 2) continue;
1658           AliTRDpropagationLayer& r2=*(fTrSec[(ns+2)%maxSec]->GetLayer(i2));
1659           cl=r2[js-nl2-nl-nm-nu];
1660           y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
1661
1662           x2=xx2*cs2-y2*sn2;
1663           y2=xx2*sn2+y2*cs2;
1664         }
1665
1666         if(TMath::Abs(z1-z2) > fgkMaxSeedDeltaZ12) continue;
1667
1668         Double_t zz=z1 - z1/x1*(x1-x2);
1669
1670         if (TMath::Abs(zz-z2)>fgkMaxSeedDeltaZ) continue;
1671
1672         Double_t d=(x2-x1)*(0.-y2)-(0.-x2)*(y2-y1);
1673         if (d==0.) {cerr<<"TRD MakeSeeds: Straight seed !\n"; continue;}
1674
1675         x[0]=y1;
1676         x[1]=z1;
1677         x[4]=f1trd(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
1678
1679         if (TMath::Abs(x[4]) > fgkMaxSeedC) continue;
1680
1681         x[2]=f2trd(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
1682
1683         if (TMath::Abs(x[4]*x1-x[2]) >= 0.99999) continue;
1684
1685         x[3]=f3trd(x1,y1,x2,y2,z1,z2);
1686
1687         if (TMath::Abs(x[3]) > fgkMaxSeedTan) continue;
1688
1689         Double_t a=asin(x[2]);
1690         Double_t zv=z1 - x[3]/x[4]*(a+asin(x[4]*x1-x[2]));
1691
1692         if (TMath::Abs(zv)>fgkMaxSeedVertexZ) continue;
1693
1694         Double_t sy1=r1[is]->GetSigmaY2(), sz1=r1[is]->GetSigmaZ2();
1695         Double_t sy2=cl->GetSigmaY2(),     sz2=cl->GetSigmaZ2();
1696         Double_t sy3=fgkSeedErrorSY3, sy=fgkSeedErrorSY, sz=fgkSeedErrorSZ;
1697
1698         // Tilt changes
1699         Double_t h01 = GetTiltFactor(r1[is]);
1700         Double_t xuFactor = 100.;
1701         if(fNoTilt) {
1702           h01 = 0;
1703           xuFactor = 1;
1704         }
1705
1706         sy1=sy1+sz1*h01*h01;
1707         Double_t syz=sz1*(-h01);
1708         // end of tilt changes
1709
1710         Double_t f40=(f1trd(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
1711         Double_t f42=(f1trd(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
1712         Double_t f43=(f1trd(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
1713         Double_t f20=(f2trd(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
1714         Double_t f22=(f2trd(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
1715         Double_t f23=(f2trd(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
1716         Double_t f30=(f3trd(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[3])/sy;
1717         Double_t f31=(f3trd(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[3])/sz;
1718         Double_t f32=(f3trd(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[3])/sy;
1719         Double_t f34=(f3trd(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[3])/sz;
1720
1721
1722         c[0]=sy1;
1723         //        c[1]=0.;       c[2]=sz1;
1724         c[1]=syz;       c[2]=sz1*xuFactor;
1725         c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
1726         c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
1727                        c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
1728         c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
1729         c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
1730         c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
1731
1732         UInt_t index=r1.GetIndex(is);
1733
1734         AliTRDtrack *track=new AliTRDtrack(r1[is],index,x,c,x1,ns*alpha+shift);
1735
1736         Int_t rc=FollowProlongation(*track, i2);
1737
1738         if ((rc < 1) ||
1739             (track->GetNumberOfClusters() <
1740              (outer-inner)*fgkMinClustersInSeed)) delete track;
1741         else {
1742           fSeeds->AddLast(track); fNseeds++;
1743 //          cerr<<"\r found seed "<<fNseeds;
1744         }
1745       }
1746     }
1747   }
1748 }
1749
1750 //_____________________________________________________________________________
1751 Int_t AliTRDtracker::ReadClusters(TObjArray *array, TTree *ClusterTree) const
1752 {
1753   //
1754   // Reads AliTRDclusters (option >= 0) or AliTRDrecPoints (option < 0)
1755   // from the file. The names of the cluster tree and branches
1756   // should match the ones used in AliTRDclusterizer::WriteClusters()
1757   //
1758   TObjArray *clusterArray = new TObjArray(400);
1759
1760   TBranch *branch=ClusterTree->GetBranch("TRDcluster");
1761   if (!branch) {
1762     Error("ReadClusters","Can't get the branch !");
1763     return 1;
1764   }
1765   branch->SetAddress(&clusterArray);
1766
1767   Int_t nEntries = (Int_t) ClusterTree->GetEntries();
1768   //  printf("found %d entries in %s.\n",nEntries,ClusterTree->GetName());
1769
1770   // Loop through all entries in the tree
1771   Int_t nbytes = 0;
1772   AliTRDcluster *c = 0;
1773   //  printf("\n");
1774
1775   for (Int_t iEntry = 0; iEntry < nEntries; iEntry++) {
1776
1777     // Import the tree
1778     nbytes += ClusterTree->GetEvent(iEntry);
1779
1780     // Get the number of points in the detector
1781     Int_t nCluster = clusterArray->GetEntriesFast();
1782 //    printf("\r Read %d clusters from entry %d", nCluster, iEntry);
1783
1784     // Loop through all TRD digits
1785     for (Int_t iCluster = 0; iCluster < nCluster; iCluster++) {
1786       c = (AliTRDcluster*)clusterArray->UncheckedAt(iCluster);
1787       AliTRDcluster *co = new AliTRDcluster(*c);
1788       co->SetSigmaY2(c->GetSigmaY2() * fSY2corr);
1789       Int_t ltb = co->GetLocalTimeBin();
1790       if(ltb == 19) co->SetSigmaZ2(c->GetSigmaZ2());
1791       else if(fNoTilt) co->SetSigmaZ2(c->GetSigmaZ2() * fSZ2corr);
1792       array->AddLast(co);
1793       delete clusterArray->RemoveAt(iCluster);
1794     }
1795   }
1796
1797   delete clusterArray;
1798
1799   return 0;
1800 }
1801
1802 //__________________________________________________________________
1803 void AliTRDtracker::CookLabel(AliKalmanTrack* pt, Float_t wrong) const
1804 {
1805   //
1806   // This cooks a label. Mmmmh, smells good...
1807   //
1808
1809   Int_t label=123456789, index, i, j;
1810   Int_t ncl=pt->GetNumberOfClusters();
1811   const Int_t kRange = fTrSec[0]->GetOuterTimeBin()+1;
1812
1813   Bool_t labelAdded;
1814
1815   //  Int_t s[kRange][2];
1816   Int_t **s = new Int_t* [kRange];
1817   for (i=0; i<kRange; i++) {
1818     s[i] = new Int_t[2];
1819   }
1820   for (i=0; i<kRange; i++) {
1821     s[i][0]=-1;
1822     s[i][1]=0;
1823   }
1824
1825   Int_t t0,t1,t2;
1826   for (i=0; i<ncl; i++) {
1827     index=pt->GetClusterIndex(i);
1828     AliTRDcluster *c=(AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(index);
1829     t0=c->GetLabel(0);
1830     t1=c->GetLabel(1);
1831     t2=c->GetLabel(2);
1832   }
1833
1834   for (i=0; i<ncl; i++) {
1835     index=pt->GetClusterIndex(i);
1836     AliTRDcluster *c=(AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(index);
1837     for (Int_t k=0; k<3; k++) {
1838       label=c->GetLabel(k);
1839       labelAdded=kFALSE; j=0;
1840       if (label >= 0) {
1841         while ( (!labelAdded) && ( j < kRange ) ) {
1842           if (s[j][0]==label || s[j][1]==0) {
1843             s[j][0]=label;
1844             s[j][1]=s[j][1]+1;
1845             labelAdded=kTRUE;
1846           }
1847           j++;
1848         }
1849       }
1850     }
1851   }
1852
1853   Int_t max=0;
1854   label = -123456789;
1855
1856   for (i=0; i<kRange; i++) {
1857     if (s[i][1]>max) {
1858       max=s[i][1]; label=s[i][0];
1859     }
1860   }
1861
1862   for (i=0; i<kRange; i++) {
1863     delete []s[i];
1864   }
1865
1866   delete []s;
1867
1868   if ((1.- Float_t(max)/ncl) > wrong) label=-label;
1869
1870   pt->SetLabel(label);
1871
1872 }
1873
1874
1875 //__________________________________________________________________
1876 void AliTRDtracker::UseClusters(const AliKalmanTrack* t, Int_t from) const
1877 {
1878   //
1879   // Use clusters, but don't abuse them!
1880   //
1881
1882   Int_t ncl=t->GetNumberOfClusters();
1883   for (Int_t i=from; i<ncl; i++) {
1884     Int_t index = t->GetClusterIndex(i);
1885     AliTRDcluster *c=(AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(index);
1886     c->Use();
1887   }
1888 }
1889
1890
1891 //_____________________________________________________________________
1892 Double_t AliTRDtracker::ExpectedSigmaY2(Double_t , Double_t , Double_t ) const
1893 {
1894   // Parametrised "expected" error of the cluster reconstruction in Y
1895
1896   Double_t s = 0.08 * 0.08;
1897   return s;
1898 }
1899
1900 //_____________________________________________________________________
1901 Double_t AliTRDtracker::ExpectedSigmaZ2(Double_t , Double_t ) const
1902 {
1903   // Parametrised "expected" error of the cluster reconstruction in Z
1904
1905   Double_t s = 9 * 9 /12.;
1906   return s;
1907 }
1908
1909 //_____________________________________________________________________
1910 Double_t AliTRDtracker::GetX(Int_t sector, Int_t plane, Int_t localTB) const
1911 {
1912   //
1913   // Returns radial position which corresponds to time bin <localTB>
1914   // in tracking sector <sector> and plane <plane>
1915   //
1916
1917   Int_t index = fTrSec[sector]->CookTimeBinIndex(plane, localTB);
1918   Int_t pl = fTrSec[sector]->GetLayerNumber(index);
1919   return fTrSec[sector]->GetLayer(pl)->GetX();
1920
1921 }
1922
1923
1924 //_______________________________________________________
1925 AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::AliTRDpropagationLayer(Double_t x,
1926                Double_t dx, Double_t rho, Double_t radLength, Int_t tbIndex)
1927 {
1928   //
1929   // AliTRDpropagationLayer constructor
1930   //
1931
1932   fN = 0; fX = x; fdX = dx; fRho = rho; fX0 = radLength;
1933   fClusters = NULL; fIndex = NULL; fTimeBinIndex = tbIndex;
1934
1935
1936   for(Int_t i=0; i < (Int_t) kZones; i++) {
1937     fZc[i]=0; fZmax[i] = 0;
1938   }
1939
1940   fYmax = 0;
1941
1942   if(fTimeBinIndex >= 0) {
1943     fClusters = new AliTRDcluster*[kMaxClusterPerTimeBin];
1944     fIndex = new UInt_t[kMaxClusterPerTimeBin];
1945   }
1946
1947   for (Int_t i=0;i<5;i++) fIsHole[i] = kFALSE;
1948   fHole = kFALSE;
1949   fHoleZc = 0;
1950   fHoleZmax = 0;
1951   fHoleYc = 0;
1952   fHoleYmax = 0;
1953   fHoleRho = 0;
1954   fHoleX0 = 0;
1955
1956 }
1957
1958 //_______________________________________________________
1959 void AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::SetHole(
1960           Double_t Zmax, Double_t Ymax, Double_t rho,
1961           Double_t radLength, Double_t Yc, Double_t Zc)
1962 {
1963   //
1964   // Sets hole in the layer
1965   //
1966   fHole = kTRUE;
1967   fHoleZc = Zc;
1968   fHoleZmax = Zmax;
1969   fHoleYc = Yc;
1970   fHoleYmax = Ymax;
1971   fHoleRho = rho;
1972   fHoleX0 = radLength;
1973 }
1974
1975
1976 //_______________________________________________________
1977 AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::AliTRDtrackingSector(AliTRDgeometry* geo, Int_t gs, AliTRDparameter* par)
1978 {
1979   //
1980   // AliTRDtrackingSector Constructor
1981   //
1982
1983   fGeom = geo;
1984   fPar = par;
1985   fGeomSector = gs;
1986   fTzeroShift = 0.13;
1987   fN = 0;
1988   //
1989   // get holes description from geometry
1990   Bool_t holes[AliTRDgeometry::kNcham];
1991   //printf("sector\t%d\t",gs);
1992   for (Int_t icham=0; icham<AliTRDgeometry::kNcham;icham++){
1993     holes[icham] = fGeom->IsHole(0,icham,gs);
1994     //printf("%d",holes[icham]);
1995   }
1996   //printf("\n");
1997
1998   for(UInt_t i=0; i < kMaxTimeBinIndex; i++) fTimeBinIndex[i] = -1;
1999
2000
2001   AliTRDpropagationLayer* ppl;
2002
2003   Double_t x, xin, xout, dx, rho, radLength;
2004   Int_t    steps;
2005
2006   // set time bins in the gas of the TPC
2007
2008   xin = 246.055; xout = 254.055; steps = 20; dx = (xout-xin)/steps;
2009   rho = 0.9e-3;  radLength = 28.94;
2010
2011   for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
2012     x = xin + i*dx + dx/2;
2013     ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
2014     InsertLayer(ppl);
2015   }
2016
2017   // set time bins in the outer field cage vessel
2018
2019   dx = 50e-4; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.71; radLength = 44.77; // Tedlar
2020   ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
2021   InsertLayer(ppl);
2022
2023   dx = 0.02; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.45; radLength = 44.86; // prepreg
2024   ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
2025   InsertLayer(ppl);
2026
2027   dx = 2.; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.45*0.02; radLength = 41.28; // Nomex
2028   steps = 5; dx = (xout - xin)/steps;
2029   for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
2030     x = xin + i*dx + dx/2;
2031     ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
2032     InsertLayer(ppl);
2033   }
2034
2035   dx = 0.02; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.45; radLength = 44.86; // prepreg
2036   ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
2037   InsertLayer(ppl);
2038
2039   dx = 50e-4; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.71; radLength = 44.77; // Tedlar
2040   ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
2041   InsertLayer(ppl);
2042
2043
2044   // set time bins in CO2
2045
2046   xin = xout; xout = 275.0;
2047   steps = 50; dx = (xout - xin)/steps;
2048   rho = 1.977e-3;  radLength = 36.2;
2049
2050   for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
2051     x = xin + i*dx + dx/2;
2052     ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
2053     InsertLayer(ppl);
2054   }
2055
2056   // set time bins in the outer containment vessel
2057
2058   dx = 50e-4; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 2.7; radLength = 24.01; // Al
2059   ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
2060   InsertLayer(ppl);
2061
2062   dx = 50e-4; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.71; radLength = 44.77; // Tedlar
2063   ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
2064   InsertLayer(ppl);
2065
2066   dx = 0.06; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.45; radLength = 44.86; // prepreg
2067   ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
2068   InsertLayer(ppl);
2069
2070   dx = 3.; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.45*0.02; radLength = 41.28; // Nomex
2071   steps = 10; dx = (xout - xin)/steps;
2072   for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
2073     x = xin + i*dx + dx/2;
2074     ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
2075     InsertLayer(ppl);
2076   }
2077
2078   dx = 0.06; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.45; radLength = 44.86; // prepreg
2079   ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
2080   InsertLayer(ppl);
2081
2082   dx = 50e-4; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.71; radLength = 44.77; // Tedlar
2083   ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
2084   InsertLayer(ppl);
2085
2086   dx = 50e-4; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 2.7; radLength = 24.01; // Al
2087   ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
2088   InsertLayer(ppl);
2089
2090   Double_t xtrd = (Double_t) fGeom->Rmin();
2091
2092   // add layers between TPC and TRD (Air temporarily)
2093   xin = xout; xout = xtrd;
2094   steps = 50; dx = (xout - xin)/steps;
2095   rho = 1.2e-3;  radLength = 36.66;
2096
2097   for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
2098     x = xin + i*dx + dx/2;
2099     ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
2100     InsertLayer(ppl);
2101   }
2102
2103
2104   //  Double_t alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();
2105
2106   // add layers for each of the planes
2107
2108   Double_t dxRo = (Double_t) fGeom->CroHght();    // Rohacell
2109   Double_t dxSpace = (Double_t) fGeom->Cspace();  // Spacing between planes
2110   Double_t dxAmp = (Double_t) fGeom->CamHght();   // Amplification region
2111   Double_t dxDrift = (Double_t) fGeom->CdrHght(); // Drift region
2112   Double_t dxRad = (Double_t) fGeom->CraHght();   // Radiator
2113   Double_t dxTEC = dxRad + dxDrift + dxAmp + dxRo;
2114   Double_t dxPlane = dxTEC + dxSpace;
2115
2116   Int_t tb, tbIndex;
2117   const Int_t  kNchambers = AliTRDgeometry::Ncham();
2118   Double_t  ymax = 0;
2119   //, holeYmax = 0;
2120   Double_t ymaxsensitive=0;
2121   Double_t *zc = new Double_t[kNchambers];
2122   Double_t *zmax = new Double_t[kNchambers];
2123   Double_t *zmaxsensitive = new Double_t[kNchambers];
2124   //  Double_t  holeZmax = 1000.;   // the whole sector is missing
2125
2126   for(Int_t plane = 0; plane < AliTRDgeometry::Nplan(); plane++) {
2127     //
2128     // Radiator
2129     xin = xtrd + plane * dxPlane; xout = xin + dxRad;
2130     steps = 12; dx = (xout - xin)/steps; rho = 0.074; radLength = 40.6;
2131     for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
2132       x = xin + i*dx + dx/2;
2133       ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
2134       InsertLayer(ppl);
2135     }
2136
2137     ymax          = fGeom->GetChamberWidth(plane)/2.;
2138     ymaxsensitive = (fPar->GetColPadSize(plane)*fPar->GetColMax(plane)-4)/2.;
2139
2140     for(Int_t ch = 0; ch < kNchambers; ch++) {
2141       zmax[ch] = fGeom->GetChamberLength(plane,ch)/2;
2142       Float_t pad = fPar->GetRowPadSize(plane,ch,0);
2143       Float_t row0 = fPar->GetRow0(plane,ch,0);
2144       Int_t nPads = fPar->GetRowMax(plane,ch,0);
2145       zmaxsensitive[ch] = Float_t(nPads)*pad/2.;
2146       //      zc[ch] = (pad * nPads)/2 + row0 - pad/2;
2147       zc[ch] = (pad * nPads)/2 + row0;
2148       //zc[ch] = row0+zmax[ch]-AliTRDgeometry::RpadW();
2149
2150     }
2151
2152     dx = fPar->GetTimeBinSize();
2153     rho = 0.00295 * 0.85; radLength = 11.0;
2154
2155     Double_t x0 = (Double_t) fPar->GetTime0(plane);
2156     Double_t xbottom = x0 - dxDrift;
2157     Double_t xtop = x0 + dxAmp;
2158     //
2159     // Amplification region
2160     steps = (Int_t) (dxAmp/dx);
2161
2162     for(tb = 0; tb < steps; tb++) {
2163       x = x0 + tb * dx + dx/2;
2164       tbIndex = CookTimeBinIndex(plane, -tb-1);
2165       ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,tbIndex);
2166       ppl->SetYmax(ymax,ymaxsensitive);
2167       ppl->SetZ(zc, zmax, zmaxsensitive);
2168       ppl->SetHoles(holes);
2169       InsertLayer(ppl);
2170     }
2171     tbIndex = CookTimeBinIndex(plane, -steps);
2172     x = (x + dx/2 + xtop)/2;
2173     dx = 2*(xtop-x);
2174     ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,tbIndex);
2175     ppl->SetYmax(ymax,ymaxsensitive);
2176     ppl->SetZ(zc, zmax,zmaxsensitive);
2177     ppl->SetHoles(holes);
2178     InsertLayer(ppl);
2179
2180     // Drift region
2181     dx = fPar->GetTimeBinSize();
2182     steps = (Int_t) (dxDrift/dx);
2183
2184     for(tb = 0; tb < steps; tb++) {
2185       x = x0 - tb * dx - dx/2;
2186       tbIndex = CookTimeBinIndex(plane, tb);
2187
2188       ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,tbIndex);
2189       ppl->SetYmax(ymax,ymaxsensitive);
2190       ppl->SetZ(zc, zmax, zmaxsensitive);
2191       ppl->SetHoles(holes);
2192       InsertLayer(ppl);
2193     }
2194     tbIndex = CookTimeBinIndex(plane, steps);
2195     x = (x - dx/2 + xbottom)/2;
2196     dx = 2*(x-xbottom);
2197     ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,tbIndex);
2198     ppl->SetYmax(ymax,ymaxsensitive);
2199     ppl->SetZ(zc, zmax, zmaxsensitive);
2200     ppl->SetHoles(holes);
2201     InsertLayer(ppl);
2202
2203     // Pad Plane
2204     xin = xtop; dx = 0.025; xout = xin + dx; rho = 1.7; radLength = 33.0;
2205     ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
2206     ppl->SetYmax(ymax,ymaxsensitive);
2207     ppl->SetZ(zc, zmax,zmax);
2208     ppl->SetHoles(holes);
2209     InsertLayer(ppl);
2210
2211     // Rohacell
2212     xin = xout; xout = xtrd + (plane + 1) * dxPlane - dxSpace;
2213     steps = 5; dx = (xout - xin)/steps; rho = 0.074; radLength = 40.6;
2214     for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
2215       x = xin + i*dx + dx/2;
2216       ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
2217       ppl->SetYmax(ymax,ymaxsensitive);
2218       ppl->SetZ(zc, zmax,zmax);
2219       ppl->SetHoles(holes);
2220       InsertLayer(ppl);
2221     }
2222
2223     // Space between the chambers, air
2224     xin = xout; xout = xtrd + (plane + 1) * dxPlane;
2225     steps = 5; dx = (xout - xin)/steps; rho = 1.29e-3; radLength = 36.66;
2226     for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
2227       x = xin + i*dx + dx/2;
2228       ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
2229       InsertLayer(ppl);
2230     }
2231   }
2232
2233   // Space between the TRD and RICH
2234   Double_t xRICH = 500.;
2235   xin = xout; xout = xRICH;
2236   steps = 200; dx = (xout - xin)/steps; rho = 1.29e-3; radLength = 36.66;
2237   for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
2238     x = xin + i*dx + dx/2;
2239     ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
2240     InsertLayer(ppl);
2241   }
2242
2243   MapTimeBinLayers();
2244   delete [] zc;
2245   delete [] zmax;
2246
2247 }
2248
2249 //______________________________________________________
2250
2251 Int_t  AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::CookTimeBinIndex(Int_t plane, Int_t localTB) const
2252 {
2253   //
2254   // depending on the digitization parameters calculates "global"
2255   // time bin index for timebin <localTB> in plane <plane>
2256   //
2257
2258   Double_t dxAmp = (Double_t) fGeom->CamHght();   // Amplification region
2259   Double_t dxDrift = (Double_t) fGeom->CdrHght(); // Drift region
2260   Double_t dx = (Double_t) fPar->GetTimeBinSize();
2261
2262   Int_t tbAmp = fPar->GetTimeBefore();
2263   Int_t maxAmp = (Int_t) ((dxAmp+0.000001)/dx);
2264   if(kTRUE) maxAmp = 0;   // intentional until we change parameter class
2265   Int_t tbDrift = fPar->GetTimeMax();
2266   Int_t maxDrift = (Int_t) ((dxDrift+0.000001)/dx);
2267
2268   Int_t tbPerPlane = TMath::Min(tbAmp,maxAmp) + TMath::Min(tbDrift,maxDrift);
2269
2270   Int_t gtb = (plane+1) * tbPerPlane - localTB - 1 - TMath::Min(tbAmp,maxAmp);
2271
2272   if((localTB < 0) &&
2273      (TMath::Abs(localTB) > TMath::Min(tbAmp,maxAmp))) return -1;
2274   if(localTB >= TMath::Min(tbDrift,maxDrift)) return -1;
2275
2276   return gtb;
2277
2278
2279 }
2280
2281 //______________________________________________________
2282
2283 void AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::MapTimeBinLayers()
2284 {
2285   //
2286   // For all sensitive time bins sets corresponding layer index
2287   // in the array fTimeBins
2288   //
2289
2290   Int_t index;
2291
2292   for(Int_t i = 0; i < fN; i++) {
2293     index = fLayers[i]->GetTimeBinIndex();
2294
2295     //    printf("gtb %d -> pl %d -> x %f \n", index, i, fLayers[i]->GetX());
2296
2297     if(index < 0) continue;
2298     if(index >= (Int_t) kMaxTimeBinIndex) {
2299       printf("*** AliTRDtracker::MapTimeBinLayers: \n");
2300       printf("    index %d exceeds allowed maximum of %d!\n",
2301              index, kMaxTimeBinIndex-1);
2302       continue;
2303     }
2304     fTimeBinIndex[index] = i;
2305   }
2306
2307   Double_t x1, dx1, x2, dx2, gap;
2308
2309   for(Int_t i = 0; i < fN-1; i++) {
2310     x1 = fLayers[i]->GetX();
2311     dx1 = fLayers[i]->GetdX();
2312     x2 = fLayers[i+1]->GetX();
2313     dx2 = fLayers[i+1]->GetdX();
2314     gap = (x2 - dx2/2) - (x1 + dx1/2);
2315     if(gap < -0.01) {
2316       printf("*** warning: layers %d and %d are overlayed:\n",i,i+1);
2317       printf("             %f + %f + %f > %f\n", x1, dx1/2, dx2/2, x2);
2318     }
2319     if(gap > 0.01) {
2320       printf("*** warning: layers %d and %d have a large gap:\n",i,i+1);
2321       printf("             (%f - %f) - (%f + %f) = %f\n",
2322              x2, dx2/2, x1, dx1, gap);
2323     }
2324   }
2325 }
2326
2327
2328 //______________________________________________________
2329
2330
2331 Int_t AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::GetLayerNumber(Double_t x) const
2332 {
2333   //
2334   // Returns the number of time bin which in radial position is closest to <x>
2335   //
2336
2337   if(x >= fLayers[fN-1]->GetX()) return fN-1;
2338   if(x <= fLayers[0]->GetX()) return 0;
2339
2340   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
2341   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
2342     if (x > fLayers[m]->GetX()) b=m+1;
2343     else e=m;
2344   }
2345   if(TMath::Abs(x - fLayers[m]->GetX()) >
2346      TMath::Abs(x - fLayers[m+1]->GetX())) return m+1;
2347   else return m;
2348
2349 }
2350
2351 //______________________________________________________
2352
2353 Int_t AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::GetInnerTimeBin() const
2354 {
2355   //
2356   // Returns number of the innermost SENSITIVE propagation layer
2357   //
2358
2359   return GetLayerNumber(0);
2360 }
2361
2362 //______________________________________________________
2363
2364 Int_t AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::GetOuterTimeBin() const
2365 {
2366   //
2367   // Returns number of the outermost SENSITIVE time bin
2368   //
2369
2370   return GetLayerNumber(GetNumberOfTimeBins() - 1);
2371 }
2372
2373 //______________________________________________________
2374
2375 Int_t AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::GetNumberOfTimeBins() const
2376 {
2377   //
2378   // Returns number of SENSITIVE time bins
2379   //
2380
2381   Int_t tb, layer;
2382   for(tb = kMaxTimeBinIndex-1; tb >=0; tb--) {
2383     layer = GetLayerNumber(tb);
2384     if(layer>=0) break;
2385   }
2386   return tb+1;
2387 }
2388
2389 //______________________________________________________
2390
2391 void AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::InsertLayer(AliTRDpropagationLayer* pl)
2392 {
2393   //
2394   // Insert layer <pl> in fLayers array.
2395   // Layers are sorted according to X coordinate.
2396
2397   if ( fN == ((Int_t) kMaxLayersPerSector)) {
2398     printf("AliTRDtrackingSector::InsertLayer(): Too many layers !\n");
2399     return;
2400   }
2401   if (fN==0) {fLayers[fN++] = pl; return;}
2402   Int_t i=Find(pl->GetX());
2403
2404   memmove(fLayers+i+1 ,fLayers+i,(fN-i)*sizeof(AliTRDpropagationLayer*));
2405   fLayers[i]=pl; fN++;
2406
2407 }
2408
2409 //______________________________________________________
2410
2411 Int_t AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::Find(Double_t x) const
2412 {
2413   //
2414   // Returns index of the propagation layer nearest to X
2415   //
2416
2417   if (x <= fLayers[0]->GetX()) return 0;
2418   if (x > fLayers[fN-1]->GetX()) return fN;
2419   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
2420   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
2421     if (x > fLayers[m]->GetX()) b=m+1;
2422     else e=m;
2423   }
2424   return m;
2425 }
2426
2427 //______________________________________________________
2428 void AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::SetZ(Double_t* center, Double_t *w, Double_t *wsensitive )
2429 {
2430   //
2431   // set centers and the width of sectors
2432   for (Int_t icham=0;icham< AliTRDgeometry::kNcham;icham++){
2433     fZc[icham] = center[icham];
2434     fZmax[icham] = w[icham];
2435     fZmaxSensitive[icham] = wsensitive[icham];
2436     //   printf("chamber\t%d\tzc\t%f\tzmax\t%f\tzsens\t%f\n",icham,fZc[icham],fZmax[icham],fZmaxSensitive[icham]);
2437   }
2438 }
2439 //______________________________________________________
2440
2441 void AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::SetHoles(Bool_t *holes)
2442 {
2443   //
2444   // set centers and the width of sectors
2445   fHole = kFALSE;
2446   for (Int_t icham=0;icham< AliTRDgeometry::kNcham;icham++){
2447     fIsHole[icham] = holes[icham];
2448     if (holes[icham]) fHole = kTRUE;
2449   }
2450 }
2451
2452
2453
2454 void AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::GetPropagationParameters(
2455         Double_t y, Double_t z, Double_t &dx, Double_t &rho, Double_t &radLength,
2456         Bool_t &lookForCluster) const
2457 {
2458   //
2459   // Returns radial step <dx>, density <rho>, rad. length <radLength>,
2460   // and sensitivity <lookForCluster> in point <y,z>
2461   //
2462
2463   dx  = fdX;
2464   rho = fRho;
2465   radLength  = fX0;
2466   lookForCluster = kFALSE;
2467   //
2468   // check dead regions in sensitive volume
2469   if(fTimeBinIndex >= 0) {
2470     //
2471     Int_t zone=-1;
2472     for(Int_t ch = 0; ch < (Int_t) kZones; ch++) {
2473       if  (TMath::Abs(z - fZc[ch]) < fZmaxSensitive[ch]){
2474         zone = ch;
2475         lookForCluster = !(fIsHole[zone]);
2476         if(TMath::Abs(y) > fYmaxSensitive){
2477           lookForCluster = kFALSE;
2478         }
2479         if (fIsHole[zone]) {
2480           //if hole
2481           rho = 1.29e-3;
2482           radLength = 36.66;
2483         }
2484       }
2485     }
2486     return;
2487   }
2488   //
2489   //
2490   // check hole
2491   if (fHole==kFALSE) return;
2492   //
2493   for(Int_t ch = 0; ch < (Int_t) kZones; ch++) {
2494     if  (TMath::Abs(z - fZc[ch]) < fZmax[ch]){
2495       if (fIsHole[ch]) {
2496         //if hole
2497         rho = 1.29e-3;
2498         radLength = 36.66;
2499       }
2500     }
2501   }
2502   return;
2503 }
2504
2505 Int_t  AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::GetZone( Double_t z) const
2506 {
2507   //
2508   //
2509   if (fTimeBinIndex < 0) return -20;  //unknown
2510   Int_t zone=-10;   // dead zone
2511   for(Int_t ch = 0; ch < (Int_t) kZones; ch++) {
2512     if(TMath::Abs(z - fZc[ch]) < fZmax[ch])
2513       zone = ch;
2514   }
2515   return zone;
2516 }
2517
2518
2519 //______________________________________________________
2520
2521 void AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::InsertCluster(AliTRDcluster* c,
2522                                                           UInt_t index) {
2523
2524 // Insert cluster in cluster array.
2525 // Clusters are sorted according to Y coordinate.
2526
2527   if(fTimeBinIndex < 0) {
2528     printf("*** attempt to insert cluster into non-sensitive time bin!\n");
2529     return;
2530   }
2531
2532   if (fN== (Int_t) kMaxClusterPerTimeBin) {
2533     printf("AliTRDpropagationLayer::InsertCluster(): Too many clusters !\n");
2534     return;
2535   }
2536   if (fN==0) {fIndex[0]=index; fClusters[fN++]=c; return;}
2537   Int_t i=Find(c->GetY());
2538   memmove(fClusters+i+1 ,fClusters+i,(fN-i)*sizeof(AliTRDcluster*));
2539   memmove(fIndex   +i+1 ,fIndex   +i,(fN-i)*sizeof(UInt_t));
2540   fIndex[i]=index; fClusters[i]=c; fN++;
2541 }
2542
2543 //______________________________________________________
2544
2545 Int_t AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::Find(Double_t y) const {
2546
2547 // Returns index of the cluster nearest in Y
2548
2549   if (y <= fClusters[0]->GetY()) return 0;
2550   if (y > fClusters[fN-1]->GetY()) return fN;
2551   Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
2552   for (; b<e; m=(b+e)/2) {
2553     if (y > fClusters[m]->GetY()) b=m+1;
2554     else e=m;
2555   }
2556   return m;
2557 }
2558
2559 //---------------------------------------------------------
2560
2561 Double_t AliTRDtracker::GetTiltFactor(const AliTRDcluster* c) {
2562 //
2563 //  Returns correction factor for tilted pads geometry
2564 //
2565
2566   Double_t h01 = sin(TMath::Pi() / 180.0 * fPar->GetTiltingAngle());
2567   Int_t det = c->GetDetector();
2568   Int_t plane = fGeom->GetPlane(det);
2569
2570   //if((plane == 1) || (plane == 3) || (plane == 5)) h01=-h01;
2571   if((plane == 0) || (plane == 2) || (plane == 4)) h01=-h01;
2572
2573   if(fNoTilt) h01 = 0;
2574
2575   return h01;
2576 }
2577
2578
2579
2580
2581
2582