prod/cosmic/rec.sh

   1 #!/bin/bash
   2 #############################################################################
   3 # rec.sh. Front-end script to run reconstruction from the grid chunks
   4 # Usage:
   5 #    ./rec.sh <run_number>
   6 #############################################################################
   7 #
   8 # modification history
   9 # version 1.0  2008/03/04 02:12  Marco Meoni
  10 #
  11 # version 1.1  2008/03/28 00:33  Marco Meoni. Used aliensh instead of alien client
  12
  13 # SET THE FOLLOWING PARAMETERS IF NEEDED:
  14 # ---------------------------------------
  15 YEAR=09
  16 DIALOG=`which dialog`
  17 # ---------------------------------------
  18
  19 kill -9 `ps | grep aliroot | awk '{print $1}'`
  20
  21 export RUNNUM=$1
  22
  23 [ -z $RUNNUM ] && { echo "Please provide a run number..."; exit 1; }
  24
  25 [ ! -e "$HOME/.globus/usercert.pem" ] && { echo "FAILED: There is no certificate in $HOME/.globus"; exit 1; }
  26
  27 [ -e "/tmp/gclient_env_$UID" ] && { source /tmp/gclient_env_$UID; }
  28 alien-token-init
  29
  30 [ ! "$?" -eq "0" ] && { echo "FAILED: Token creation failed"; exit 1; }
  31
  32 VERSION=1.0
  33 TITLE="Standalone reconstruction of Grid rawdata chunks. v$VERSION"
  34
  35 # Retrieve the list of chunks from AliEn.......
  36 BASEDIR="/alice/data/20"$YEAR
  37 PATTERN="/raw/"$YEAR"0000"$RUNNUM"*0.root"
  38 gbbox find $BASEDIR $PATTERN | head -n 500 > collection.tmp
  39
  40 [ $(wc -l collection.tmp) -eq 0 ] && { echo "No chunks found for the given run"; exit 1; }
  41 rm -f collection.tmp2
  42 for ifile in `cat collection.tmp | head -n 500` ; do printf $ifile" "\|" "0" " >> collection.tmp2 ; done
  43 list=`cat collection.tmp2`
  44 rm -f collection.tmp2
  45 totChunks=`cat collection.tmp | wc -l`
  46 rm -f collection.tmp
  47
  48 tempfile=`tempfile 2>/dev/null` || tempfile=/tmp/test$$
  49 trap "rm -f $tempfile" 0 1 2 5 15
  50 $DIALOG --clear --no-cancel --title "$TITLE" \
  51         --ok-label OK --checklist "$totChunks chunks available for run $RUNNUM (only the first 500 are shown). Select chunks for reconstruction" 18 80 10 \
  52         $list 2> $tempfile
  53
  54 CHUNKS=`cat $tempfile`
  55 echo "Selected chunks:"
  56 echo $CHUNKS
  57 echo
  58
  59 $DIALOG --clear --no-cancel \
  60         --ok-label OK --radiolist "Program to run:" 15 20 5 "aliroot -b" \| on alieve \| off 2> $tempfile
  61 PROGRAM=`cat $tempfile`
  62
  63 for filename in $CHUNKS; do
  64      filename=${filename//\"/}
  65      CHUNK=`basename $filename | cut -d "." -f 1,2`
  66
  67      echo "Running AliRoot reconstruction for chunk $filename. Outputs will be stored in "$RUNNUM"/"$CHUNK"."
  68      rm -rf   $RUNNUM"/"$CHUNK
  69      mkdir -p $RUNNUM"/"$CHUNK
  70      cd       $RUNNUM"/"$CHUNK
  71      $PROGRAM -q $ALICE_ROOT/prod/cosmic/rec.C\(\"alien://$filename\"\) 2>&1 | tee rec.log
  72      cd ../..
  73 done