EMCAL/AliEMCALQADataMakerRec.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /*
  16 Based on the QA code for PHOS written by Yves Schutz July 2007
  17
  18 Authors:  J.Klay (Cal Poly) May 2008
  19           S. Salur LBL April 2008
  20
  21 Created one histogram for QA shifter;-- Yaxian Mao: 11/2009
  22 The idea:average counts for all the towers should be flat
  23 Change all existing histograms as experts
  24
  25 Change histograms for DQM shifter: --  Yaxian Mao 04/2010
  26 Calcuate the amplitude ratio from current run and the LED reference, for QAChecker use
  27 Also calculate the ratio of amplitude from LED Monitor system (current/Reference), to check LED system
  28
  29 */
  30
  31 // --- ROOT system ---
  32 #include <TClonesArray.h>
  33 #include <TFile.h>
  34 #include <TH1F.h>
  35 #include <TH1I.h>
  36 #include <TH2F.h>
  37 #include <TLine.h>
  38 #include <TText.h>
  39 #include <TProfile.h>
  40 #include <TProfile2D.h>
  41 #include <TStyle.h>
  42 // --- Standard library ---
  43
  44
  45 // --- AliRoot header files ---
  46 #include "AliDAQ.h"
  47 #include "AliESDCaloCluster.h"
  48 #include "AliESDCaloCells.h"
  49 #include "AliESDEvent.h"
  50 #include "AliLog.h"
  51 #include "AliEMCALQADataMakerRec.h"
  52 #include "AliQAChecker.h"
  53 #include "AliEMCALDigit.h"
  54 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  55 #include "AliEMCALRawUtils.h"
  56 #include "AliEMCALReconstructor.h"
  57 #include "AliEMCALRecParam.h"
  58 #include "AliRawReader.h"
  59 #include "AliCaloRawStreamV3.h"
  60 #include "AliEMCALGeoParams.h"
  61 #include "AliRawEventHeaderBase.h"
  62 #include "AliQAManager.h"
  63 #include "AliCDBEntry.h"
  64
  65 #include "AliCaloBunchInfo.h"
  66 #include "AliCaloFitResults.h"
  67 #include "AliCaloRawAnalyzerFastFit.h"
  68 #include "AliCaloRawAnalyzerNN.h"
  69 #include "AliCaloRawAnalyzerKStandard.h"
  70 #include "AliCaloRawAnalyzerPeakFinder.h"
  71 #include "AliCaloRawAnalyzerCrude.h"
  72 #include "AliEMCALGeometry.h"
  73 #include "AliEMCALTriggerSTURawStream.h"
  74
  75 #include "AliCaloRawAnalyzerFactory.h"
  76
  77 using namespace std;
  78
  79 ClassImp(AliEMCALQADataMakerRec)
  80
  81 //____________________________________________________________________________
  82 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(Int_t fitAlgo) :
  83   AliQADataMakerRec(AliQAv1::GetDetName(AliQAv1::kEMCAL), "EMCAL Quality Assurance Data Maker"),
  84   fFittingAlgorithm(0),
  85   fRawAnalyzer(0),
  86   fRawAnalyzerTRU(0),
  87   fGeom(0),
  88   fSuperModules(20), // number of SuperModules; updated to 20 for EMCal + DCal
  89   fFirstPedestalSample(0),
  90   fLastPedestalSample(3),
  91   fFirstPedestalSampleTRU(0),
  92   fLastPedestalSampleTRU(3),
  93   fMinSignalLG(0),
  94   fMaxSignalLG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  95   fMinSignalHG(0),
  96   fMaxSignalHG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  97   fMinSignalTRU(0),
  98   fMaxSignalTRU(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  99   fMinSignalLGLEDMon(0),
 100   fMaxSignalLGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
 101   fMinSignalHGLEDMon(0),
 102   fMaxSignalHGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
 103   fCalibRefHistoPro(NULL),
 104   fCalibRefHistoH2F(NULL),
 105   fLEDMonRefHistoPro(NULL),
 106   fHighEmcHistoH2F(NULL)
 107 //  fTextSM(new TText*[fSuperModules]) ,
 108 //  fLineCol(NULL),
 109 //  fLineRow(NULL)
 110
 111 {
 112   // ctor
 113   SetFittingAlgorithm(fitAlgo);
 114
 115   fRawAnalyzerTRU =  ( AliCaloRawAnalyzerKStandard*)AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer(Algo::kFastFit);
 116
 117   fRawAnalyzerTRU->SetFixTau(kTRUE);
 118   fRawAnalyzerTRU->SetTau(2.5); // default for TRU shaper
 119
 120   fGeom = new AliEMCALGeometry("EMCAL_COMPLETE12SMV1_DCAL_8SM", "EMCAL");
 121 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
 122 //    fTextSM[sm] = NULL ;
 123 //  }
 124 }
 125
 126 //____________________________________________________________________________
 127 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(const AliEMCALQADataMakerRec& qadm) :
 128   AliQADataMakerRec(),
 129   fFittingAlgorithm(0),
 130   fRawAnalyzer(0),
 131   fRawAnalyzerTRU(0),
 132         fGeom(0),
 133   fSuperModules(qadm.GetSuperModules()),
 134   fFirstPedestalSample(qadm.GetFirstPedestalSample()),
 135   fLastPedestalSample(qadm.GetLastPedestalSample()),
 136   fFirstPedestalSampleTRU(qadm.GetFirstPedestalSampleTRU()),
 137   fLastPedestalSampleTRU(qadm.GetLastPedestalSampleTRU()),
 138   fMinSignalLG(qadm.GetMinSignalLG()),
 139   fMaxSignalLG(qadm.GetMaxSignalLG()),
 140   fMinSignalHG(qadm.GetMinSignalHG()),
 141   fMaxSignalHG(qadm.GetMaxSignalHG()),
 142   fMinSignalTRU(qadm.GetMinSignalTRU()),
 143   fMaxSignalTRU(qadm.GetMaxSignalTRU()),
 144   fMinSignalLGLEDMon(qadm.GetMinSignalLGLEDMon()),
 145   fMaxSignalLGLEDMon(qadm.GetMaxSignalLGLEDMon()),
 146   fMinSignalHGLEDMon(qadm.GetMinSignalHGLEDMon()),
 147   fMaxSignalHGLEDMon(qadm.GetMaxSignalHGLEDMon()),
 148   fCalibRefHistoPro(NULL),
 149   fCalibRefHistoH2F(NULL),
 150   fLEDMonRefHistoPro(NULL),
 151   fHighEmcHistoH2F(NULL)
 152 //  fTextSM(new TText*[fSuperModules]) ,
 153 //  fLineCol(NULL),
 154 //  fLineRow(NULL)
 155 {
 156   //copy ctor
 157   SetName((const char*)qadm.GetName()) ;
 158   SetTitle((const char*)qadm.GetTitle());
 159   SetFittingAlgorithm(qadm.GetFittingAlgorithm());
 160
 161   fRawAnalyzerTRU = (AliCaloRawAnalyzerKStandard*)AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer(Algo::kFastFit);
 162   fRawAnalyzerTRU->SetFixTau(kTRUE);
 163   fRawAnalyzerTRU->SetTau(2.5); // default for TRU shaper
 164 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
 165 //    fTextSM[sm] = qadm.fTextSM[sm] ;
 166 //  }
 167 }
 168
 169 //__________________________________________________________________
 170 AliEMCALQADataMakerRec& AliEMCALQADataMakerRec::operator = (const AliEMCALQADataMakerRec& qadm )
 171 {
 172   // Equal operator.
 173   this->~AliEMCALQADataMakerRec();
 174   new(this) AliEMCALQADataMakerRec(qadm);
 175 //  fLineCol = NULL;
 176 //  fLineRow = NULL;
 177 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
 178 //    fTextSM[sm] = qadm.fTextSM[sm] ;
 179 //  }
 180   return *this;
 181 }
 182
 183 //____________________________________________________________________________
 184 void AliEMCALQADataMakerRec::EndOfDetectorCycle(AliQAv1::TASKINDEX_t task, TObjArray ** list)
 185 {
 186   //Detector specific actions at end of cycle
 187
 188 //  if(fCycleCounter)
 189 //        GetRawsData(kNEventsPerTower)->Scale(1./fCycleCounter);
 190
 191   // do the QA checking
 192   ResetEventTrigClasses(); // reset triggers list to select all histos
 193   AliQAChecker::Instance()->Run(AliQAv1::kEMCAL, task, list) ;
 194 }
 195
 196 //____________________________________________________________________________
 197 void AliEMCALQADataMakerRec::GetCalibRefFromOCDB()
 198 {
 199   //Get the reference histogram from OCDB
 200   TString sName1("hHighEmcalRawMaxMinusMin") ;
 201   TString sName2("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin") ;
 202   sName1.Prepend(Form("%s_", AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib))) ;
 203   sName2.Prepend(Form("%s_", AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib))) ;
 204
 205   TString refStorage(AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
 206   if (!refStorage.Contains(AliQAv1::GetLabLocalOCDB()) && !refStorage.Contains(AliQAv1::GetLabAliEnOCDB())) {
 207     AliFatal(Form("%s is not a valid location for reference data", refStorage.Data())) ;
 208   } else {
 209     AliQAManager* manQA = AliQAManager::QAManager(AliQAv1::kRAWS) ;
 210     AliQAv1::SetQARefDataDirName(AliRecoParam::kCalib) ;
 211     if ( ! manQA->GetLock() ) {
 212       manQA->SetDefaultStorage(AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
 213       manQA->SetSpecificStorage("*", AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
 214       manQA->SetRun(AliCDBManager::Instance()->GetRun()) ;
 215       manQA->SetLock() ;
 216     }
 217     char * detOCDBDir = Form("%s/%s/%s", GetName(), AliQAv1::GetRefOCDBDirName(), AliQAv1::GetRefDataDirName()) ;
 218     AliCDBEntry * entry = manQA->Get(detOCDBDir, manQA->GetRun()) ;
 219     if (entry) {
 220       TList * listDetQAD =static_cast<TList *>(entry->GetObject()) ;
 221       if ( strcmp(listDetQAD->ClassName(), "TList") != 0 ) {
 222         AliError(Form("Expected a Tlist and found a %s for detector %s", listDetQAD->ClassName(), GetName())) ;
 223         listDetQAD = NULL ;
 224       }
 225       TObjArray * dirOCDB= NULL ;
 226       if ( listDetQAD )
 227         dirOCDB = static_cast<TObjArray *>(listDetQAD->FindObject(Form("%s/%s", AliQAv1::GetTaskName(AliQAv1::kRAWS).Data(), AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib)))) ;
 228       if (dirOCDB){
 229         fCalibRefHistoPro = dynamic_cast<TProfile *>(dirOCDB->FindObject(sName1.Data())) ;
 230         fLEDMonRefHistoPro = dynamic_cast<TProfile *>(dirOCDB->FindObject(sName2.Data())) ;
 231       }
 232     }
 233   }
 234
 235   if(fCalibRefHistoPro && fLEDMonRefHistoPro){
 236
 237     //Defining histograms binning, each 2D histogram covers all SMs
 238     Int_t nSMSectors = fSuperModules / 2; // 2 SMs per sector
 239     Int_t nbinsZ = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 240     Int_t nbinsPhi = nSMSectors * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
 241
 242     if(!fCalibRefHistoH2F)
 243       fCalibRefHistoH2F =  new TH2F("hCalibRefHisto", "hCalibRefHisto", nbinsZ, -0.5, nbinsZ - 0.5, nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi -0.5);
 244     ConvertProfile2H(fCalibRefHistoPro,fCalibRefHistoH2F) ;
 245   } else {
 246     AliFatal(Form("No reference object with name %s or %s found", sName1.Data(), sName2.Data())) ;
 247   }
 248 }
 249 //____________________________________________________________________________
 250 void AliEMCALQADataMakerRec::InitESDs()
 251 {
 252   //Create histograms to controll ESD
 253   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 254   const Bool_t image    = kTRUE ;
 255
 256   TH1F * h1 = new TH1F("hESDCaloClusterE",  "ESDs CaloCluster energy in EMCAL;Energy [GeV];Counts",    200, 0., 100.) ;
 257   h1->Sumw2() ;
 258   Add2ESDsList(h1, kESDCaloClusE, !expert, image)  ;
 259
 260   TH1I * h2 = new TH1I("hESDCaloClusterM", "ESDs CaloCluster multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 100, 0,  100) ;
 261   h2->Sumw2() ;
 262   Add2ESDsList(h2, kESDCaloClusM, !expert, image)  ;
 263
 264   TH1F * h3 = new TH1F("hESDCaloCellA",  "ESDs CaloCell amplitude in EMCAL;Energy [GeV];Counts",    500, 0., 50.) ;
 265   h3->Sumw2() ;
 266   Add2ESDsList(h3, kESDCaloCellA, !expert, image)  ;
 267
 268   TH1I * h4 = new TH1I("hESDCaloCellM", "ESDs CaloCell multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 200, 0,  1000) ;
 269   h4->Sumw2() ;
 270   Add2ESDsList(h4, kESDCaloCellM, !expert, image) ;
 271   //
 272   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kESDS); // this should be the last line
 273 }
 274
 275 //____________________________________________________________________________
 276 void AliEMCALQADataMakerRec::InitDigits()
 277 {
 278   // create Digits histograms in Digits subdir
 279   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 280   const Bool_t image    = kTRUE ;
 281
 282   TH1I * h0 = new TH1I("hEmcalDigits",    "Digits amplitude distribution in EMCAL;Amplitude [ADC counts];Counts",    500, 0, 500) ;
 283   h0->Sumw2() ;
 284   Add2DigitsList(h0, 0, !expert, image) ;
 285   TH1I * h1 = new TH1I("hEmcalDigitsMul", "Digits multiplicity distribution in EMCAL;# of Digits;Entries", 200, 0, 2000) ;
 286   h1->Sumw2() ;
 287   Add2DigitsList(h1, 1, !expert, image) ;
 288   //
 289   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kDIGITS); // this should be the last line
 290 }
 291
 292 //____________________________________________________________________________
 293 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRecPoints()
 294 {
 295   // create Reconstructed PoInt_ts histograms in RecPoints subdir
 296   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 297   const Bool_t image    = kTRUE ;
 298
 299   TH1F* h0 = new TH1F("hEMCALRpE","EMCAL RecPoint energies;Energy [GeV];Counts",200, 0.,20.); //GeV
 300   h0->Sumw2();
 301   Add2RecPointsList(h0,kRecPE, !expert, image);
 302
 303   TH1I* h1 = new TH1I("hEMCALRpM","EMCAL RecPoint multiplicities;# of Clusters;Entries",100,0,100);
 304   h1->Sumw2();
 305   Add2RecPointsList(h1,kRecPM, !expert, image);
 306
 307   TH1I* h2 = new TH1I("hEMCALRpDigM","EMCAL RecPoint Digit Multiplicities;# of Digits;Entries",20,0,20);
 308   h2->Sumw2();
 309   Add2RecPointsList(h2,kRecPDigM, !expert, image);
 310   //
 311   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kRECPOINTS); // this should be the last line
 312 }
 313
 314 //____________________________________________________________________________
 315 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRaws()
 316 {
 317   // create Raws histograms in Raws subdir
 318   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 319   const Bool_t saveCorr = kTRUE ;
 320   const Bool_t image    = kTRUE ;
 321   const Option_t *profileOption = "s";
 322
 323   Int_t nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
 324   Int_t nTot = fSuperModules * nTowersPerSM; // max number of towers in all SuperModules
 325
 326   //Defining histograms binning, each 2D histogram covers all SMs
 327   Int_t nSMSectors = fSuperModules / 2; // 2 SMs per sector
 328   Int_t nbinsZ = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 329   Int_t nbinsPhi = nSMSectors * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
 330
 331   Int_t nTRUCols = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUCols; //total TRU columns for 2D TRU histos
 332   Int_t nTRURows = nSMSectors*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRURows; //total TRU rows for 2D TRU histos
 333    // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 334   TProfile * h0 = new TProfile("hLowEmcalSupermodules", "Low Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
 335                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 336   Add2RawsList(h0, kNsmodLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 337   TProfile * h1 = new TProfile("hHighEmcalSupermodules", "High Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
 338                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 339   Add2RawsList(h1, kNsmodHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 340
 341   // where did max sample occur? (bins are towers)
 342   TProfile * h2 = new TProfile("hLowEmcalRawtime", "Low Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]",
 343                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 344   Add2RawsList(h2, kTimeLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 345   TProfile * h3 = new TProfile("hHighEmcalRawtime", "High Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]",
 346                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 347   Add2RawsList(h3, kTimeHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 348
 349   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are towers)
 350   TProfile * h4 = new TProfile("hLowEmcalRawMaxMinusMin", "Low Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
 351                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 352   Add2RawsList(h4, kSigLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 353   TProfile * h5 = new TProfile("hHighEmcalRawMaxMinusMin", "High Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
 354                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 355   Add2RawsList(h5, kSigHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 356
 357   // total counter: channels per event
 358   TH1I * h6 = new TH1I("hLowNtot", "Low Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200, 0, nTot) ;
 359   h6->Sumw2() ;
 360   Add2RawsList(h6, kNtotLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 361   TH1I * h7 = new TH1I("hHighNtot", "High Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200,0, nTot) ;
 362   h7->Sumw2() ;
 363   Add2RawsList(h7, kNtotHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 364
 365   // pedestal (bins are towers)
 366   TProfile * h8 = new TProfile("hLowEmcalRawPed", "Low Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
 367                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 368   Add2RawsList(h8, kPedLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 369   TProfile * h9 = new TProfile("hHighEmcalRawPed", "High Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
 370                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 371   Add2RawsList(h9, kPedHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 372
 373
 374   // now repeat the same for TRU and LEDMon data
 375   Int_t nTot2x2 = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // max number of TRU channels for all SuperModules
 376
 377   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 378   TProfile * hT0 = new TProfile("hTRUEmcalSupermodules", "TRU EMC: # of TRU channels vs SuperMod;SM Id;# of TRU channels",
 379                                 fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 380   Add2RawsList(hT0, kNsmodTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 381
 382   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are TRU channels)
 383   TProfile * hT1 = new TProfile("hTRUEmcalRawMaxMinusMin", "TRU EMC: Max - Min vs 2x2Id;2x2 Id;Max-Min [ADC counts]",
 384                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5, profileOption) ;
 385   Add2RawsList(hT1, kSigTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 386
 387   // total counter: channels per event
 388   TH1I * hT2 = new TH1I("hTRUNtot", "TRU EMC: Total Number of found TRU channels;# of TRU Channels;Counts", 200, 0, nTot2x2) ;
 389   hT2->Sumw2() ;
 390   Add2RawsList(hT2, kNtotTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 391
 392   // L0 trigger hits: # of hits (bins are TRU channels)
 393   TH2I * hT3 = new TH2I("hTRUEmcalL0hits", "L0 trigger hits: Total number of 2x2 L0 generated",  nTRUCols, -0.5, nTRUCols - 0.5, nTRURows, -0.5, nTRURows-0.5);
 394   hT3->SetOption("COLZ");
 395   //hT3->Sumw2();
 396   Add2RawsList(hT3, kNL0TRU, expert, image, !saveCorr);
 397
 398   // L0 trigger hits: average time (bins are TRU channels)
 399   TProfile2D * hT4 = new TProfile2D("hTRUEmcalL0hitsAvgTime", "L0 trigger hits: average time bin", nTRUCols, -0.5, nTRUCols - 0.5, nTRURows, -0.5, nTRURows-0.5, profileOption);
 400   hT4->SetOption("COLZ");
 401   Add2RawsList(hT4, kTimeL0TRU, expert, image, !saveCorr);
 402
 403   // L0 trigger hits: first in the event (bins are TRU channels)
 404   TH1I * hT5 = new TH1I("hTRUEmcalL0hitsFirst", "L0 trigger hits: First hit in the event", nTot2x2, -0.5, nTot2x2);
 405   hT5->Sumw2();
 406   Add2RawsList(hT5, kNL0FirstTRU, expert, !image, !saveCorr);
 407
 408   // L0 trigger hits: average time of first hit in the event (bins are TRU channels)
 409   TProfile * hT6 = new TProfile("hTRUEmcalL0hitsFirstAvgTime", "L0 trigger hits: average time of first hit", nTot2x2, -0.5, nTot2x2, profileOption);
 410   Add2RawsList(hT6, kTimeL0FirstTRU, expert, !image, !saveCorr);
 411
 412   // and also LED Mon..
 413   // LEDMon has both high and low gain channels, just as regular FEE/towers
 414   Int_t nTotLEDMon = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // max number of LEDMon channels for all SuperModules
 415
 416   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 417   TProfile * hL0 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalSupermodules", "LowLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
 418                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 419   Add2RawsList(hL0, kNsmodLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 420   TProfile * hL1 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalSupermodules", "HighLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
 421                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 422   Add2RawsList(hL1, kNsmodHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 423
 424   // where did max sample occur? (bins are strips)
 425   TProfile * hL2 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawtime", "LowLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]",
 426                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 427   Add2RawsList(hL2, kTimeLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 428   TProfile * hL3 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawtime", "HighLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]",
 429                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 430   Add2RawsList(hL3, kTimeHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 431
 432   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are strips)
 433   TProfile * hL4 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "LowLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
 434                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 435   Add2RawsList(hL4, kSigLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 436   TProfile * hL5 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "HighLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
 437                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 438   Add2RawsList(hL5, kSigHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 439
 440     // total counter: channels per event
 441   TH1I * hL6 = new TH1I("hLowLEDMonNtot", "LowLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200, 0, nTotLEDMon) ;
 442   hL6->Sumw2() ;
 443   Add2RawsList(hL6, kNtotLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 444   TH1I * hL7 = new TH1I("hHighLEDMonNtot", "HighLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200,0, nTotLEDMon) ;
 445   hL7->Sumw2() ;
 446   Add2RawsList(hL7, kNtotHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 447
 448   // pedestal (bins are strips)
 449   TProfile * hL8 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawPed", "LowLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
 450                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 451   Add2RawsList(hL8, kPedLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 452   TProfile * hL9 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawPed", "HighLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
 453                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 454   Add2RawsList(hL9, kPedHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 455
 456   //temp 2D amplitude histogram for the current run
 457   fHighEmcHistoH2F = new TH2F("h2DHighEC2", "High Gain EMC:Max - Min [ADC counts]", nbinsZ, -0.5 , nbinsZ-0.5, nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi-0.5);
 458    fHighEmcHistoH2F->SetDirectory(0) ; // this histo must be memory resident
 459   //add ratio histograms: to comapre the current run with the reference data
 460   TH2F * h15 = new TH2F("h2DRatioAmp", "High Gain Ratio to Reference:Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run}", nbinsZ, -0.5 , nbinsZ-0.5,
 461                         nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi-0.5);
 462   //settings for display in amore
 463   h15->SetTitle("Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run}");
 464   h15->SetMaximum(2.0);
 465   h15->SetMinimum(0.1);
 466   h15->SetOption("COLZ");
 467   gStyle->SetOptStat(0);
 468   Int_t color[] = {4,3,2} ;
 469   gStyle->SetPalette(3,color);
 470   h15->GetZaxis()->SetNdivisions(3);
 471   h15->UseCurrentStyle();
 472   h15->SetDirectory(0);
 473   Add2RawsList(h15, k2DRatioAmp, expert, image, !saveCorr) ;
 474
 475   TH1F * h16 = new TH1F("hRatioDist", "Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run} ratio distribution", nTot, 0., 2.);
 476   // h16->SetMinimum(0.1);
 477   // h16->SetMaximum(100.);
 478   gStyle->SetOptStat(0);
 479   h16->UseCurrentStyle();
 480   h16->SetDirectory(0);
 481   Add2RawsList(h16, kRatioDist, !expert, image, !saveCorr) ;
 482
 483   //add two histograms for shifter from the LED monitor system: comapre LED monitor with the reference run
 484   //to be used for decision whether we need to change reference data
 485   TH1F * hL10 = new TH1F("hMaxMinusMinLEDMonRatio", "LEDMon amplitude, Ratio to reference run", nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 486   //settings for display in amore
 487   hL10->SetTitle("Amplitude_{LEDMon current}/Amplitude_{LEDMon reference}");
 488   hL10->SetMaximum(2.0);
 489   hL10->SetMinimum(0.1);
 490   gStyle->SetOptStat(0);
 491   hL10->UseCurrentStyle();
 492   hL10->SetDirectory(0);
 493 //  hL10->SetOption("E");
 494   Add2RawsList(hL10, kLEDMonRatio, expert, image, !saveCorr) ;
 495
 496   TH1F * hL11 = new TH1F("hMaxMinusMinLEDMonRatioDist", "LEDMon amplitude, Ratio distribution", nTotLEDMon, 0, 2);
 497   // hL11->SetMinimum(0.1) ;
 498   gStyle->SetOptStat(0);
 499   hL11->UseCurrentStyle();
 500   hL11->SetDirectory(0);
 501   Add2RawsList(hL11, kLEDMonRatioDist, expert, image, !saveCorr) ;
 502
 503   GetCalibRefFromOCDB();
 504
 505
 506         //STU histgrams
 507
 508  //histos
 509  Int_t nSTUCols = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTUCols;
 510  Int_t nSTURows = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTURows;
 511 //              kAmpL1, kGL1, kJL1,
 512 //              kGL1V0, kJL1V0, kSTUTRU
 513
 514  TProfile2D *hS0 = new TProfile2D("hL1Amp", "Mean STU signal per Row and Column", nSTUCols, -0.5, nSTUCols-0.5, nSTURows, -0.5, nSTURows-0.5);
 515  Add2RawsList(hS0, kAmpL1, expert, !image, !saveCorr) ;
 516
 517  TH2F *hS1 = new TH2F("hL1Gamma", "L1 Gamma patch position (FastOR top-left)", nSTUCols, -0.50, nSTUCols-0.5, nSTURows + 5, -0.5, nSTURows-0.5 + 5); //+5 for better visible error box
 518  Add2RawsList(hS1, kGL1, !expert, image, !saveCorr) ;
 519
 520  TH2F *hS2 = new TH2F("hL1Jet", "L1 Jet patch position (FastOR top-left)", 12, -0.5, nSTUCols-0.5, 16, 0, nSTURows-0.5);
 521  Add2RawsList(hS2, kJL1, !expert, image, !saveCorr) ;
 522
 523  TH2I *hS3 = new TH2I("hL1GV0", "L1 Gamma patch amplitude versus V0 signal", 500, 0, 50000, 1500, 0, 1500);
 524  Add2RawsList(hS3, kGL1V0, expert, image, !saveCorr) ;
 525
 526  TH2I *hS4 = new TH2I("hL1JV0", "L1 Jet patch amplitude versus V0 signal", 500, 0, 50000, 1000, 0, 1000);
 527  Add2RawsList(hS4, kJL1V0, expert, !image, !saveCorr) ;
 528
 529  TH1I *hS5 = new TH1I("hFrameR","Link between TRU and STU", 32, 0, 32);
 530  Add2RawsList(hS5, kSTUTRU, !expert, image, !saveCorr) ;
 531
 532  hS0->SetOption("COLZ");
 533  hS1->SetOption("COLZ");
 534  hS2->SetOption("COLZ");
 535  hS3->SetOption("COLZ");
 536  hS4->SetOption("COLZ");
 537
 538   //
 539   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kRAWS); // this should be the last line
 540 }
 541
 542 //____________________________________________________________________________
 543 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeESDs(AliESDEvent * esd)
 544 {
 545   // make QA data from ESDs
 546
 547   Int_t nTot = 0 ;
 548   for ( Int_t index = 0; index < esd->GetNumberOfCaloClusters() ; index++ ) {
 549     AliESDCaloCluster * clu = esd->GetCaloCluster(index) ;
 550     if( clu->IsEMCAL() ) {
 551       FillESDsData(kESDCaloClusE,clu->E()) ;
 552       nTot++ ;
 553     }
 554   }
 555   FillESDsData(kESDCaloClusM,nTot) ;
 556
 557   //fill calo cells
 558   AliESDCaloCells* cells = esd->GetEMCALCells();
 559   FillESDsData(kESDCaloCellM,cells->GetNumberOfCells()) ;
 560
 561   for ( Int_t index = 0; index < cells->GetNumberOfCells() ; index++ ) {
 562     FillESDsData(kESDCaloCellA,cells->GetAmplitude(index)) ;
 563   }
 564   //
 565   IncEvCountCycleESDs();
 566   IncEvCountTotalESDs();
 567 }
 568
 569 //____________________________________________________________________________
 570 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRaws(AliRawReader* rawReader)
 571 {
 572   // Check that all the reference histograms exist before we try to use them - otherwise call InitRaws
 573   // RS: Attention: the counters are increments after custom modification of eventSpecie
 574   if (!fCalibRefHistoPro || !fCalibRefHistoH2F || !fLEDMonRefHistoPro || !fHighEmcHistoH2F) {
 575     InitRaws();
 576   }
 577
 578   // make sure EMCal was readout during the event
 579   Int_t emcID = AliDAQ::DetectorID("EMCAL"); // bit 18..
 580   const UInt_t *detPattern = rawReader->GetDetectorPattern();
 581   UInt_t emcInReadout = ( ((1 << emcID) & detPattern[0]) >> emcID);
 582   if (! emcInReadout) return; // no poInt_t in looking at this event, if no EMCal data
 583
 584   // setup
 585   rawReader->Reset() ;
 586   AliCaloRawStreamV3 in(rawReader,"EMCAL");
 587   rawReader->Select("EMCAL", 0, AliEMCALGeoParams::fgkLastAltroDDL) ; //select EMCAL DDL's
 588
 589   AliRecoParam::EventSpecie_t saveSpecie = fEventSpecie ;
 590   if (rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent) {
 591     SetEventSpecie(AliRecoParam::kCalib) ;
 592   }
 593
 594   const Int_t nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
 595   const Int_t nRows        = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; // number of rows per SuperModule
 596   const Int_t nStripsPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // number of strips per SuperModule
 597   const Int_t n2x2PerSM    = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // number of TRU 2x2's per SuperModule
 598   const Int_t n2x2PerTRU   = AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU;
 599   const Int_t nTot2x2      = fSuperModules * n2x2PerSM; // total TRU channel
 600
 601   // SM counters; decl. should be safe, assuming we don't get more than expected SuperModules..
 602   Int_t nTotalSMLG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]       = {0};
 603   Int_t nTotalSMHG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]       = {0};
 604   Int_t nTotalSMTRU[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]      = {0};
 605   Int_t nTotalSMLGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 606   Int_t nTotalSMHGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 607
 608   const Int_t nTRUL0ChannelBits = 10; // used for L0 trigger bits checks
 609         int firstL0TimeBin = 999;
 610   int triggers[nTot2x2][24]; //auxiliary array for L0 trigger - TODO remove hardcoded 24
 611         memset(triggers, 0, sizeof(int) * 24 * nTot2x2);
 612
 613   Int_t iSM = 0; // SuperModule index
 614   // start loop over input stream
 615   while (in.NextDDL()) {
 616     Int_t iRCU = in.GetDDLNumber() % 2; // RCU0 or RCU1, within SuperModule
 617     Int_t iDDL = in.GetDDLNumber();
 618     fRawAnalyzer->SetIsZeroSuppressed( in.GetZeroSupp() );
 619
 620     while (in.NextChannel()) {
 621       Int_t iBranch = in.GetBranch();
 622
 623       iSM = in.GetModule(); // SuperModule
 624       //prInt_tf("iSM %d DDL %d", iSM, in.GetDDLNumber());
 625       if (iSM>=0 && iSM<fSuperModules) { // valid module reading
 626
 627         Int_t nsamples = 0;
 628         vector<AliCaloBunchInfo> bunchlist;
 629         while (in.NextBunch()) {
 630           nsamples += in.GetBunchLength();
 631           bunchlist.push_back( AliCaloBunchInfo(in.GetStartTimeBin(), in.GetBunchLength(), in.GetSignals() ) );
 632         }
 633
 634         if (nsamples > 0) { // this check is needed for when we have zero-supp. on, but not sparse readout
 635           Float_t time = 0.;
 636           Float_t amp  = 0.;
 637           // indices for pedestal calc.
 638           Int_t firstPedSample = 0;
 639           Int_t lastPedSample  = 0;
 640           bool isTRUL0IdData   = false;
 641
 642           if (! in.IsTRUData() ) { // high gain, low gain, LED Mon data - all have the same shaper/sampling
 643             AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzer->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2());
 644             amp  = fitResults.GetAmp();
 645             time = fitResults.GetTof();
 646             firstPedSample = fFirstPedestalSample;
 647             lastPedSample  = fLastPedestalSample;
 648           }
 649           else { // TRU data is special, needs its own analyzer
 650             AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzerTRU->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2());
 651             amp  = fitResults.GetAmp();
 652             time = fitResults.GetTof();
 653             firstPedSample = fFirstPedestalSampleTRU;
 654             lastPedSample  = fLastPedestalSampleTRU;
 655             if (in.GetColumn() >= n2x2PerTRU) {
 656               isTRUL0IdData = true;
 657             }
 658           }
 659
 660           // pedestal samples
 661           Int_t nPed = 0;
 662           vector<Int_t> pedSamples;
 663
 664           // select earliest bunch
 665           unsigned int bunchIndex = 0;
 666           unsigned int startBin = bunchlist.at(0).GetStartBin();
 667           if (bunchlist.size() > 0) {
 668             for(unsigned int ui=1; ui < bunchlist.size(); ui++ ) {
 669               if (startBin > bunchlist.at(ui).GetStartBin() ) {
 670                 startBin = bunchlist.at(ui).GetStartBin();
 671                 bunchIndex = ui;
 672               }
 673             }
 674           }
 675
 676           // check bunch for entries in the pedestal sample range
 677           Int_t bunchLength = bunchlist.at(bunchIndex).GetLength();
 678           const UShort_t *sig = bunchlist.at(bunchIndex).GetData();
 679           Int_t timebin = 0;
 680
 681           if (! isTRUL0IdData) { // regular data, can look at pedestals
 682             for (Int_t i = 0; i<bunchLength; i++) {
 683               timebin = startBin--;
 684               if ( firstPedSample<=timebin && timebin<=lastPedSample ) {
 685                 pedSamples.push_back( sig[i] );
 686                 nPed++;
 687               }
 688             } // i
 689           }
 690           else { // TRU L0 Id Data
 691             // which TRU the channel belongs to?
 692             Int_t iTRUId = in.GetModule()*3 + (iRCU*in.GetBranch() + iRCU);
 693
 694             for (Int_t i = 0; i< bunchLength; i++) {
 695               for( Int_t j = 0; j < nTRUL0ChannelBits; j++ ){
 696                 // check if the bit j is 1
 697                 if( (sig[i] & ( 1 << j )) > 0 ){
 698                   Int_t iTRUIdInSM = (in.GetColumn() - n2x2PerTRU)*nTRUL0ChannelBits+j;
 699                   if(iTRUIdInSM < n2x2PerTRU) {
 700                     Int_t iTRUAbsId = iTRUIdInSM + n2x2PerTRU * iTRUId;
 701                     // Fill the histograms
 702                     Int_t globTRUCol, globTRURow;
 703                     GetTruChannelPosition(globTRURow, globTRUCol, iSM, iDDL, iBranch, iTRUIdInSM );
 704
 705                     FillRawsData(kNL0TRU, globTRUCol, globTRURow);
 706                     FillRawsData(kTimeL0TRU, globTRUCol, globTRURow, startBin);
 707                     triggers[iTRUAbsId][startBin] = 1;
 708
 709                     if((int)startBin < firstL0TimeBin) firstL0TimeBin = startBin;
 710                   }
 711                 }
 712               }
 713               startBin--;
 714             } // i
 715           } // TRU L0 Id data
 716
 717           // fill histograms
 718           if ( in.IsLowGain() || in.IsHighGain() ) { // regular towers
 719             Int_t towerId = iSM*nTowersPerSM + in.GetColumn()*nRows + in.GetRow();
 720             if ( in.IsLowGain() ) {
 721               nTotalSMLG[iSM]++;
 722               if ( (amp > fMinSignalLG) && (amp < fMaxSignalLG) ) {
 723                 FillRawsData(kSigLG,towerId, amp);
 724                 FillRawsData(kTimeLG,towerId, time);
 725               }
 726               if (nPed > 0) {
 727                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 728                   FillRawsData(kPedLG,towerId, pedSamples[i]);
 729                 }
 730               }
 731             } // gain==0
 732             else if ( in.IsHighGain() ) {
 733               nTotalSMHG[iSM]++;
 734               if ( (amp > fMinSignalHG) && (amp < fMaxSignalHG) ) {
 735                 FillRawsData(kSigHG,towerId, amp);
 736                 FillRawsData(kTimeHG,towerId, time);
 737               }
 738               if (nPed > 0) {
 739                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 740                   FillRawsData(kPedHG,towerId, pedSamples[i]);
 741                 }
 742               }
 743             } // gain==1
 744           } // low or high gain
 745           // TRU
 746           else if ( in.IsTRUData() && in.GetColumn()<AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU) {
 747             // for TRU data, the mapping class holds the TRU Int_ternal 2x2 number (0..95) in the Column var..
 748             Int_t iTRU = (iRCU*in.GetBranch() + iRCU); //TRU0 is from RCU0, TRU1 from RCU1, TRU2 is from branch B on RCU1
 749             Int_t iTRU2x2Id = iSM*n2x2PerSM + iTRU*AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU
 750               + in.GetColumn();
 751             nTotalSMTRU[iSM]++;
 752             if ( (amp > fMinSignalTRU) && (amp < fMaxSignalTRU) ) {
 753               FillRawsData(kSigTRU,iTRU2x2Id, amp);
 754               //FillRawsData(kTimeTRU,iTRU2x2Id, time);
 755             }
 756             //if (nPed > 0) {
 757               //for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 758                 //FillRawsData(kPedTRU,iTRU2x2Id, pedSamples[i]);
 759               //}
 760             //}
 761           }
 762           // LED Mon
 763           else if ( in.IsLEDMonData() ) {
 764             // for LED Mon data, the mapping class holds the gain info in the Row variable
 765             // and the Strip number in the Column..
 766             Int_t gain = in.GetRow();
 767             Int_t stripId = iSM*nStripsPerSM + in.GetColumn();
 768
 769             if ( gain == 0 ) {
 770               nTotalSMLGLEDMon[iSM]++;
 771               if ( (amp > fMinSignalLGLEDMon) && (amp < fMaxSignalLGLEDMon) ) {
 772                 FillRawsData(kSigLGLEDMon,stripId, amp);
 773                 FillRawsData(kTimeLGLEDMon,stripId, time);
 774               }
 775               if (nPed > 0) {
 776                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 777                   FillRawsData(kPedLGLEDMon,stripId, pedSamples[i]);
 778                 }
 779               }
 780             } // gain==0
 781             else if ( gain == 1 ) {
 782               nTotalSMHGLEDMon[iSM]++;
 783               if ( (amp > fMinSignalHGLEDMon) && (amp < fMaxSignalHGLEDMon) ) {
 784                 FillRawsData(kSigHGLEDMon,stripId, amp);
 785                 FillRawsData(kTimeHGLEDMon,stripId, time);
 786               }
 787               if (nPed > 0) {
 788                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 789                   FillRawsData(kPedHGLEDMon,stripId, pedSamples[i]);
 790                 }
 791               }
 792             } // low or high gain
 793           } // LEDMon
 794
 795         } // SM index OK
 796
 797       } // nsamples>0 check, some data found for this channel; not only trailer/header
 798     }// end while over channel
 799
 800   }//end while over DDL's, of input stream
 801   //filling some L0 trigger histos
 802   if( firstL0TimeBin < 999 ){
 803     for(Int_t i = 0; i < nTot2x2; i++) {
 804       if( triggers[i][firstL0TimeBin] > 0 ) {
 805         //histo->Fill(i,j);
 806         FillRawsData(kNL0FirstTRU, i);
 807         FillRawsData(kTimeL0FirstTRU, i, firstL0TimeBin);
 808       }
 809     }
 810   }
 811
 812   //calculate the ratio of the amplitude and fill the histograms, only if the events type is Calib
 813   // RS: operation on the group of histos kSigHG,k2DRatioAmp,kRatioDist,kLEDMonRatio,kLEDMonRatio,kSigLGLEDMon
 814   const int hGrp[] = {kSigHG,k2DRatioAmp,kRatioDist,kLEDMonRatio,kLEDMonRatioDist,kSigLGLEDMon};
 815   if ( rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent &&
 816        CheckCloningConsistency(fRawsQAList, hGrp, sizeof(hGrp)/sizeof(int)) ) {  // RS converting original code to loop over all matching triggers
 817     int nTrig =IsClonedPerTrigClass(kSigHG,fRawsQAList) ? GetNEventTrigClasses() : 0; // loop over triggers only if histos were cloned
 818     //
 819     for (int itr=-1;itr<nTrig;itr++) { // start from -1 to acknowledge original histos if they were kept
 820       TObjArray* trArr = GetMatchingRawsHistosSet(hGrp, sizeof(hGrp)/sizeof(int) ,itr);
 821       if (!trArr) continue;  // no histos for current trigger
 822       //
 823       Double_t binContent = 0.;
 824       TProfile* prSigHG      = (TProfile *)trArr->At(0); //kSigHG
 825       TH1* th2DRatioAmp      = (TH1*) trArr->At(1); //k2DRatioAmp
 826       TH1* thRatioDist       = (TH1*) trArr->At(2); //kRatioDist
 827       TH1* thLEDMonRatio     = (TH1*) trArr->At(3); //kLEDMonRatio
 828       TH1* thLEDMonRatioDist = (TH1*) trArr->At(4); //kLEDMonRatio
 829       TH1* hSigLGLEDMon      = (TH1*) trArr->At(5); //kSigLGLEDMon
 830       th2DRatioAmp->Reset("ICE");
 831       thRatioDist->Reset("ICE");
 832       thLEDMonRatio->Reset("ICE");
 833       thLEDMonRatioDist->Reset("ICE");
 834       th2DRatioAmp->ResetStats();
 835       thRatioDist->ResetStats();
 836       thLEDMonRatio->ResetStats();
 837       thLEDMonRatioDist->ResetStats();
 838       ConvertProfile2H(prSigHG, fHighEmcHistoH2F);
 839       //
 840       for(Int_t ix = 1; ix <= fHighEmcHistoH2F->GetNbinsX(); ix++) {
 841         for(Int_t iy = 1; iy <= fHighEmcHistoH2F->GetNbinsY(); iy++) {
 842           if(fCalibRefHistoH2F->GetBinContent(ix, iy))
 843             binContent = fHighEmcHistoH2F->GetBinContent(ix, iy)/fCalibRefHistoH2F->GetBinContent(ix, iy);
 844           th2DRatioAmp->SetBinContent(ix, iy, binContent);
 845           thRatioDist->Fill(binContent);
 846         }
 847       }
 848       //
 849       //Now for LED monitor system, to calculate the ratio as well
 850       Double_t binError = 0. ;
 851       // for the binError, we add the relative errors, squared
 852       Double_t relativeErrorSqr = 0. ;
 853       //
 854       for(int ib = 1; ib <= fLEDMonRefHistoPro->GetNbinsX(); ib++) {
 855         //
 856         if(fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib) != 0) {
 857           binContent = hSigLGLEDMon->GetBinContent(ib) / fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib);
 858
 859           relativeErrorSqr = TMath::Power( (fLEDMonRefHistoPro->GetBinError(ib) / fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib)), 2);
 860           if( hSigLGLEDMon->GetBinContent(ib) != 0) {
 861             relativeErrorSqr += TMath::Power( (hSigLGLEDMon->GetBinError(ib)/hSigLGLEDMon->GetBinContent(ib)), 2);
 862           }
 863         }
 864         else { // ref. run info is zero
 865           binContent = -1;
 866           relativeErrorSqr = 1;
 867         }
 868         thLEDMonRatio->SetBinContent(ib, binContent);
 869
 870         binError = sqrt(relativeErrorSqr) * binContent;
 871         thLEDMonRatio->SetBinError(ib, binError);
 872         thLEDMonRatioDist->Fill(thLEDMonRatio->GetBinContent(ib));
 873       }
 874     } // loop over eventual trigger clones
 875   }
 876   // let's also fill the SM and event counter histograms
 877   Int_t nTotalHG = 0;
 878   Int_t nTotalLG = 0;
 879   Int_t nTotalTRU = 0;
 880   Int_t nTotalHGLEDMon = 0;
 881   Int_t nTotalLGLEDMon = 0;
 882   for (iSM=0; iSM<fSuperModules; iSM++) {
 883     nTotalLG += nTotalSMLG[iSM];
 884     nTotalHG += nTotalSMHG[iSM];
 885     nTotalTRU += nTotalSMTRU[iSM];
 886     nTotalLGLEDMon += nTotalSMLGLEDMon[iSM];
 887     nTotalHGLEDMon += nTotalSMHGLEDMon[iSM];
 888     FillRawsData(kNsmodLG,iSM, nTotalSMLG[iSM]);
 889     FillRawsData(kNsmodHG,iSM, nTotalSMHG[iSM]);
 890     FillRawsData(kNsmodTRU,iSM, nTotalSMTRU[iSM]);
 891     FillRawsData(kNsmodLGLEDMon,iSM, nTotalSMLGLEDMon[iSM]);
 892     FillRawsData(kNsmodHGLEDMon,iSM, nTotalSMHGLEDMon[iSM]);
 893   }
 894
 895   FillRawsData(kNtotLG,nTotalLG);
 896   FillRawsData(kNtotHG,nTotalHG);
 897   FillRawsData(kNtotTRU,nTotalTRU);
 898   FillRawsData(kNtotLGLEDMon,nTotalLGLEDMon);
 899   FillRawsData(kNtotHGLEDMon,nTotalHGLEDMon);
 900
 901   IncEvCountCycleESDs();
 902   IncEvCountTotalESDs();
 903   SetEventSpecie(saveSpecie) ;
 904
 905         MakeRawsSTU(rawReader);
 906
 907   // just in case the next rawreader consumer forgets to reset; let's do it here again..
 908   rawReader->Reset() ;
 909   return;
 910 }
 911
 912 //____________________________________________________________________________
 913 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits()
 914 {
 915   // makes data from Digits
 916   FillDigitsData(1,fDigitsArray->GetEntriesFast()) ;
 917   TIter next(fDigitsArray) ;
 918   AliEMCALDigit * digit ;
 919   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(next())) ) {
 920     FillDigitsData(0, digit->GetAmplitude()) ;
 921   }
 922   //
 923 }
 924
 925 //____________________________________________________________________________
 926 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits(TTree * digitTree)
 927 {
 928   // makes data from Digit Tree
 929   // RS: Attention: the counters are increments in the MakeDigits()
 930   if (fDigitsArray)
 931     fDigitsArray->Clear("C") ;
 932   else
 933     fDigitsArray = new TClonesArray("AliEMCALDigit", 1000) ;
 934
 935   TBranch * branch = digitTree->GetBranch("EMCAL") ;
 936   if ( ! branch ) { AliWarning("EMCAL branch in Digit Tree not found"); return; }
 937   //
 938   branch->SetAddress(&fDigitsArray) ;
 939   branch->GetEntry(0) ;
 940   MakeDigits() ;
 941   //
 942   IncEvCountCycleDigits();
 943   IncEvCountTotalDigits();
 944   //
 945 }
 946
 947 //____________________________________________________________________________
 948 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRecPoints(TTree * clustersTree)
 949 {
 950   // makes data from RecPoints
 951   TBranch *emcbranch = clustersTree->GetBranch("EMCALECARP");
 952   if (!emcbranch) {
 953     AliError("can't get the branch with the EMCAL clusters !");
 954     return;
 955   }
 956
 957   TObjArray * emcRecPoints = new TObjArray(100) ;
 958   emcbranch->SetAddress(&emcRecPoints);
 959   emcbranch->GetEntry(0);
 960
 961   FillRecPointsData(kRecPM,emcRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 962   TIter next(emcRecPoints) ;
 963   AliEMCALRecPoint * rp ;
 964   while ( (rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(next())) ) {
 965     FillRecPointsData(kRecPE,rp->GetEnergy()) ;
 966     FillRecPointsData(kRecPDigM,rp->GetMultiplicity());
 967   }
 968   emcRecPoints->Delete();
 969   delete emcRecPoints;
 970   IncEvCountCycleRecPoints();
 971   IncEvCountTotalRecPoints();
 972 }
 973
 974 //____________________________________________________________________________
 975 void AliEMCALQADataMakerRec::StartOfDetectorCycle()
 976 {
 977   //Detector specific actions at start of cycle
 978
 979 }
 980
 981 //____________________________________________________________________________
 982 void AliEMCALQADataMakerRec::SetFittingAlgorithm(Int_t fitAlgo)
 983 {
 984   //Set fitting algorithm and initialize it if this same algorithm was not set before.
 985
 986   fRawAnalyzer =  AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer(fitAlgo);
 987   fFittingAlgorithm = fitAlgo;
 988
 989 }
 990
 991 //_____________________________________________________________________________________
 992 void AliEMCALQADataMakerRec::ConvertProfile2H(TProfile * p, TH2 * histo)
 993 {
 994   // reset histogram
 995   histo->Reset("ICE") ;
 996   histo->ResetStats();
 997
 998   Int_t nbinsProf = p->GetNbinsX();
 999
1000   // loop through the TProfile p and fill the TH2F histo
1001   Int_t row = 0;
1002   Int_t col = 0;
1003   Double_t binContent = 0;
1004   Int_t towerNum = 0; // global tower Id
1005   //  i = 0; // tower Id within SuperModule
1006   Int_t iSM = 0; // SuperModule index
1007   Int_t iSMSide = 0; // 0=A, 1=C side
1008   Int_t iSMSector = 0; // 2 SM's per sector
1009
1010   // indices for 2D plots
1011   Int_t col2d = 0;
1012   Int_t row2d = 0;
1013
1014   for (Int_t ibin = 1; ibin <= nbinsProf; ibin++) {
1015     towerNum = (Int_t) p->GetBinCenter(ibin);
1016     binContent = p->GetBinContent(ibin);
1017
1018     // figure out what the tower indices are: col, row within a SuperModule
1019     iSM = towerNum/(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols);
1020     col = (towerNum/AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows) % (AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols);
1021     row = towerNum % (AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows);
1022
1023     //DecodeTowerNum(towerNum, &SM, &col, &row);
1024     // then we calculate what the global 2D coord are, based on which SM
1025     // we are in
1026     iSMSector = iSM / 2;
1027     iSMSide = iSM % 2;
1028
1029     if (iSMSide == 1) { // C side, shown to the right
1030       col2d = col + AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
1031     }
1032     else { // A side, shown to the left
1033       col2d = col;
1034     }
1035
1036     row2d = row + iSMSector * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
1037
1038     histo->SetBinContent(col2d+1, row2d+1, binContent);
1039   }
1040 }
1041 //____________________________________________________________________________
1042 void AliEMCALQADataMakerRec::GetTruChannelPosition( Int_t &globRow, Int_t &globColumn, Int_t module, Int_t ddl, Int_t branch, Int_t column ) const
1043 { // from local to global indices
1044   Int_t mrow;
1045   Int_t mcol;
1046   Int_t trow;
1047   Int_t tcol;
1048   Int_t drow;
1049   Int_t rcu;
1050   // RCU 0 or 1
1051   rcu = ddl % 2;
1052
1053   // 12 rows of 2x2s in a module (3 TRUs by 4 rows)
1054   mrow = (module/2) * 12;
1055   // 24 columns per module, odd module numbers increased by 24
1056   mcol = (module%2) * 24;
1057
1058   // position within TRU coordinates
1059   tcol = column / 4;
1060   trow = column % 4;
1061
1062   //.combine
1063   if( module%2 == 0 ){   // A side
1064     // mirror rows
1065     trow = 3 - trow;
1066
1067     // TRU in module row addition
1068     drow = (rcu*branch+rcu) * 4;
1069
1070   }
1071   else{   // C side
1072     // mirror columns
1073     tcol = 23 - tcol;
1074
1075     // TRU in module row addition
1076     drow = (2 - (rcu*branch+rcu)) * 4;
1077   }
1078
1079   // output global row/collumn position (0,0 = SMA0, phi = 0, |eta| = max)
1080   globRow = mrow + drow + trow;
1081   globColumn = mcol + tcol;
1082   return;
1083
1084 }
1085 //____________________________________________________________________________
1086 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRawsSTU(AliRawReader* rawReader)
1087 { // STU specifics
1088   AliEMCALTriggerSTURawStream* inSTU = new AliEMCALTriggerSTURawStream(rawReader);
1089
1090   rawReader->Reset();
1091   rawReader->Select("EMCAL", 44);
1092
1093   //L1 segmentation
1094   Int_t sizeL1gsubr = 1;
1095   Int_t sizeL1gpatch = 2;
1096   Int_t sizeL1jsubr = 4;
1097
1098   Int_t iEMCALtrig[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTUCols][AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTURows];
1099   memset(iEMCALtrig, 0, sizeof(int) * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTUCols * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTURows);
1100
1101   if (inSTU->ReadPayLoad())
1102     {
1103       //Fw version (use in case of change in L1 jet
1104       Int_t fw = inSTU->GetFwVersion();
1105       Int_t sizeL1jpatch = 2+(fw >> 16);
1106
1107       //To check link
1108       Int_t mask = inSTU->GetFrameReceived() ^ inSTU->GetRegionEnable();
1109
1110       for (int i = 0; i < 32; i++)
1111         {
1112                 if (!((mask >> i) &  0x1)) FillRawsData(kSTUTRU, i);
1113         }
1114
1115       //V0 signal in STU
1116       Int_t iV0Sig = inSTU->GetV0A()+inSTU->GetV0C();
1117
1118       //FastOR amplitude receive from TRU
1119       for (Int_t i = 0; i < 32; i++)
1120         {
1121           UInt_t adc[96];
1122           for (Int_t j = 0; j < 96; j++) adc[j] = 0;
1123
1124           inSTU->GetADC(i, adc);
1125
1126           Int_t iTRU = fGeom->GetTRUIndexFromSTUIndex(i);
1127
1128           for (Int_t j = 0; j < 96; j++)
1129             {
1130               Int_t idx;
1131               fGeom->GetAbsFastORIndexFromTRU(iTRU, j, idx);
1132
1133               Int_t px, py;
1134               fGeom->GetPositionInEMCALFromAbsFastORIndex(idx, px, py);
1135
1136               iEMCALtrig[px][py] = adc[j];
1137             }
1138         }
1139
1140       //L1 Gamma patches
1141       Int_t iTRUSTU, x, y;
1142       for (Int_t i = 0; i < inSTU->GetNL1GammaPatch(0); i++)
1143         {
1144           if (inSTU->GetL1GammaPatch(i, 0, iTRUSTU, x, y)) // col (0..23), row (0..3)
1145             {
1146               Int_t iTRU;
1147               iTRU = fGeom->GetTRUIndexFromSTUIndex(iTRUSTU);
1148
1149               Int_t etaG = 23-x, phiG = y + 4 * int(iTRU/2); //position in EMCal
1150               if (iTRU%2) etaG += 24; //C-side
1151
1152               etaG = etaG - sizeL1gsubr * sizeL1gpatch + 1;
1153
1154               //Position of patch L1G (bottom-left FastOR of the patch)
1155               FillRawsData(kGL1, etaG, phiG);
1156
1157               //loop to sum amplitude of FOR in the gamma patch
1158               Int_t iL1GPatchAmp = 0;
1159               for (Int_t L1Gx = 0; L1Gx < sizeL1gpatch; L1Gx ++)
1160                 {
1161                   for (Int_t L1Gy = 0; L1Gy < sizeL1gpatch; L1Gy ++)
1162                     {
1163                       if (etaG+L1Gx < 48 && phiG+L1Gy < 64) iL1GPatchAmp += iEMCALtrig[etaG+L1Gx][phiG+L1Gy];
1164                       //cout << iEMCALtrig[etaG+L1Gx][phiG+L1Gy] << endl;
1165                     }
1166                 }
1167
1168               //if (iL1GPatchAmp > 500) cout << "L1G amp =" << iL1GPatchAmp << endl;
1169               FillRawsData(kGL1V0, iV0Sig, iL1GPatchAmp);
1170
1171             }
1172         }
1173
1174       //L1 Jet patches
1175       for (Int_t i = 0; i < inSTU->GetNL1JetPatch(0); i++)
1176         {
1177           if (inSTU->GetL1JetPatch(i, 0, x, y)) // col (0,15), row (0,11)
1178             {
1179
1180               Int_t etaJ = sizeL1jsubr * (11-y-sizeL1jpatch + 1);
1181               Int_t phiJ = sizeL1jsubr * (15-x-sizeL1jpatch + 1);
1182
1183               //position of patch L1J (FOR bottom-left)
1184               FillRawsData(kJL1, etaJ, phiJ);
1185
1186               //loop the sum aplitude of FOR in the jet patch
1187               Int_t iL1JPatchAmp = 0;
1188               for (Int_t L1Jx = 0; L1Jx < sizeL1jpatch*4; L1Jx ++)
1189                 {
1190                   for (Int_t L1Jy = 0; L1Jy < sizeL1jpatch*4; L1Jy ++)
1191                     {
1192                       if (etaJ+L1Jx < 48 && phiJ+L1Jy < 64) iL1JPatchAmp += iEMCALtrig[etaJ+L1Jx][phiJ+L1Jy];
1193                     }
1194                 }
1195
1196               //cout << "L1J amp =" << iL1JPatchAmp << endl;
1197               FillRawsData(kJL1V0, iV0Sig, iL1JPatchAmp);
1198             }
1199         }
1200     }
1201
1202   //Fill FOR amplitude histo
1203   for (Int_t i = 0; i < 48; i++)
1204     {
1205       for (Int_t j = 0; j < 60; j++)
1206         {
1207           if (iEMCALtrig[i][j] != 0) FillRawsData(kAmpL1, i, j, iEMCALtrig[i][j]);
1208         }
1209     }
1210
1211   delete inSTU;
1212   return;
1213 }
1214
1215