Merge branch 'master' into flatdev

MUON trending scripts (Diego)

Modification for new trending scripts (Diego)

Increasing range of histograms for pPb

Making default settings more universal

added some hist

default to chd v3 on empty blocks

next50 trigger mask in AliHLTGlobalEsdConverterComponent

Charged jets (pPb): Different cuts

returning to vAN-20140515 version of the anlsyis task. Efficiency containers changed to THnSparse

START_TIME updated to May 04 2014, 21:02:30 GMT

Bug fix: AliHLTRawReaderPublisherComponent

fixes segmentation violation on empty events
(temporary header structs went out of scope).

Updated lmee PbPb analysis configs
Cutlib file added

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

fix spline selection for MC for train tests   - Extension
of wildcard path delimiter from / to /_
J. Wiechula

Another fix to run over pPb

Another fix to run over pPb

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

merge trending into current dir instead of terget dir

small fix for running over pPb

Solve GetAll problem with local storage and specified version

increased pt axis

Added Eta cut to reconstructed MC particles in PWG4HighPtSpectra task

Updates

Add build in .gitignore

In case the build was done in the source/build

adjust container name for cut variations

Add bkg subtraction (optional); change to LCH11h as default input set

Fixing a memory leak

improve logging of the aliroot command line

bugfix - wrong delimiters

this contains the fixes by Dario to workaround some of the quirks of EOS
and condor:
 - never make any file directly on eos, always work in tmp, then copy
 - condor does not work well with absolute paths of dependency files -
   just create them in the local working dir for makeflow, make an
additional copy to the meta/ dir on the output storage

propagate those changes to running on SGE: done

switch the output structure to the: year/period/run/pass/ structure as
it is required for the QA script.

Protection for case where Rho task does not run

pi0 Re/Mi histograms added, pi0 parameterization set to PHOS13bcdef

Rotate to frame where snp=0 before any propagation

Proper treatment of roundoff error for 0-length step

Removing wrong and useless declaration

Static cast needed by C++11

Adding RAW to EINCLUDE

Protection to differentiate jump by >pi/4 from 0-size step in GetXatLabR

macro to test ITS TPC matching with FT

Fix argument for AddTaskJetPreparation

Fix argument for AddTaskJetPreparation

Fix additional libs (load order + cdfcones)

Message

dont create any files in place to avoid problems with eos

Include dummy extreme layers in propagations for single track solution

Charged jets (pPb): Added histograms

protection against round-off errors for very small step propagation

Filling histograms that were missed

fixing implementation of jet method for hadronic correction so that clusters below the minimum et are not included

New antenna radiation task

including a histo to make the variation of isolation @ MC level locally

BadMap for LHC13bcdef updated

LHC13bcdef: time calibration for LG put same as for HG

Additional methods for single track solution, inter-detector matching study

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot
The interfaces to 100 classes added to classes in STEER.

Better formulas for the track seeding

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

100 classes interfaces for STEER classes

Incremented class version

Calculating the mean-radial cluster positions

trigger input file not mandatory anymore, remove few histograms, clean-up (Cynthia)

Remove .so for use on Mac OSX

Add macro to load EMCALJet libs

h-Jet recoil spectra task in EMCal framework; initial revision

Add default cuts for pp-2010 vs multiplicity analysis

Update copy ctor

Delete the esdTrackCut object after setting it on the default cut methods

Tightening the chi2 cut to 10, and correcting for the beampipe material

Fixes for possible leaks

A standalone comparison macro

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Fixes (Marek Bombara)

Merge remote-tracking branch 'origin/master' into flatdev

Bug fix: AliHLTOUTRawReader

added transparent access to CDH v2 or V3 header from raw reader

Caching of field param.patch is requested on compilation time by #define _MAGCHEB_CACHE_ in the AliMagWrapCheb.h

 add vzero event plane to addtasks of pid flow methods (from naghmeh )

Removing extra slash and switching off -ffp-contract=fast for icc

Merge remote-tracking branch 'origin/master' into flatdev
this to include Timos rest of patches

ALIROOT-5433 Transition to CDHv3 in HLT

Bug fix: AliHLTTPCRawSpacePointContainer

accepting also empty input blocks (0 clusters), to avoid error messages

Bug fix: AliHLTGlobalTriggerComponent

removing only temporary files, no wildcarding

Merge remote-tracking branch 'origin/master' into flatdev

CoreEnergy put in proper datamember, Ecross calculation added

set titles of variables in histograms to italic

fix filling histograms with M02 for variable weight, increase array of histograms for multiple weights and do this analysis for neutral clusters only

set titles of variables in histograms to italic

fix warning on string formatting

ALIROOT-5420 Transition to common data header V3 in the raw data. Additional patch by Timo

Bug fix, the equalized sums were completely wrong.

Speedup of B-field query by caching last patch, https://alice.its.cern.ch/jira/browse/PWGPP-59

ATO-35
make stacktrace processing safe in case of standard root crash log
adding coment fields and example usage (from provious git commit)

fix default ghost area

ATO-35
make stacktrace processing safe in case of standard root crash log

input is a (list of) text files with the stack trace (either gdb aoutput
produced with e.g. gdb --batch --quiet -ex "bt" -ex "quit" aliroot core, or the root crash log), output is a TTree formatted table.

example:

benchmark.sh stackTraceTree /foo/*/rec.log

split the production of the stacktrace summary to a separate function:
stackTraceTree

example use: ./benchmark.sh stackTraceTree */*/stacktrace.txt

adding comment

implementing jet analysis method of hadronic correction

adding function to calculate total et with systematic errors

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

update from Prabhat