merge trending into current dir instead of terget dir

improve logging of the aliroot command line

bugfix - wrong delimiters

this contains the fixes by Dario to workaround some of the quirks of EOS
and condor:
 - never make any file directly on eos, always work in tmp, then copy
 - condor does not work well with absolute paths of dependency files -
   just create them in the local working dir for makeflow, make an
additional copy to the meta/ dir on the output storage

propagate those changes to running on SGE: done

switch the output structure to the: year/period/run/pass/ structure as
it is required for the QA script.

Protection for case where Rho task does not run

pi0 Re/Mi histograms added, pi0 parameterization set to PHOS13bcdef

Rotate to frame where snp=0 before any propagation

Proper treatment of roundoff error for 0-length step

Removing wrong and useless declaration

Static cast needed by C++11

Adding RAW to EINCLUDE

Protection to differentiate jump by >pi/4 from 0-size step in GetXatLabR

macro to test ITS TPC matching with FT

Fix argument for AddTaskJetPreparation

Fix argument for AddTaskJetPreparation

Fix additional libs (load order + cdfcones)

Message

dont create any files in place to avoid problems with eos

Include dummy extreme layers in propagations for single track solution

Charged jets (pPb): Added histograms

protection against round-off errors for very small step propagation

Filling histograms that were missed

fixing implementation of jet method for hadronic correction so that clusters below the minimum et are not included

New antenna radiation task

including a histo to make the variation of isolation @ MC level locally

BadMap for LHC13bcdef updated

LHC13bcdef: time calibration for LG put same as for HG

Additional methods for single track solution, inter-detector matching study

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot
The interfaces to 100 classes added to classes in STEER.

Better formulas for the track seeding

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

100 classes interfaces for STEER classes

Incremented class version

Calculating the mean-radial cluster positions

trigger input file not mandatory anymore, remove few histograms, clean-up (Cynthia)

Remove .so for use on Mac OSX

Add macro to load EMCALJet libs

h-Jet recoil spectra task in EMCal framework; initial revision

Add default cuts for pp-2010 vs multiplicity analysis

Update copy ctor

Delete the esdTrackCut object after setting it on the default cut methods

Tightening the chi2 cut to 10, and correcting for the beampipe material

Fixes for possible leaks

A standalone comparison macro

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Fixes (Marek Bombara)

Bug fix: AliHLTOUTRawReader

added transparent access to CDH v2 or V3 header from raw reader

Caching of field param.patch is requested on compilation time by #define _MAGCHEB_CACHE_ in the AliMagWrapCheb.h

 add vzero event plane to addtasks of pid flow methods (from naghmeh )

Removing extra slash and switching off -ffp-contract=fast for icc

ALIROOT-5433 Transition to CDHv3 in HLT

Bug fix: AliHLTTPCRawSpacePointContainer

accepting also empty input blocks (0 clusters), to avoid error messages

Bug fix: AliHLTGlobalTriggerComponent

removing only temporary files, no wildcarding

CoreEnergy put in proper datamember, Ecross calculation added

set titles of variables in histograms to italic

fix filling histograms with M02 for variable weight, increase array of histograms for multiple weights and do this analysis for neutral clusters only

set titles of variables in histograms to italic

fix warning on string formatting

ALIROOT-5420 Transition to common data header V3 in the raw data. Additional patch by Timo

Bug fix, the equalized sums were completely wrong.

Speedup of B-field query by caching last patch, https://alice.its.cern.ch/jira/browse/PWGPP-59

ATO-35
make stacktrace processing safe in case of standard root crash log
adding coment fields and example usage (from provious git commit)

fix default ghost area

ATO-35
make stacktrace processing safe in case of standard root crash log

input is a (list of) text files with the stack trace (either gdb aoutput
produced with e.g. gdb --batch --quiet -ex "bt" -ex "quit" aliroot core, or the root crash log), output is a TTree formatted table.

example:

benchmark.sh stackTraceTree /foo/*/rec.log

split the production of the stacktrace summary to a separate function:
stackTraceTree

example use: ./benchmark.sh stackTraceTree */*/stacktrace.txt

adding comment

implementing jet analysis method of hadronic correction

adding function to calculate total et with systematic errors

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

update from Prabhat

Add new event mixing config. bug fixs too.

 fixed consistency in qa that was introduced 16052014

 replace unsafe usages of PropagateToDCA

pass the default OCDB storage to QA plot creation

some more updates

Set unique 120um sensor thickness for all layers in v1 setup

more verbose logging + one minor but fix

change default to a more general one

some cleanup

be smarter about the metafile naming

make log prettier

small fix

quoting, again

fix quoting

re-add the ocdb storage to the QAtrain_duo.C - why did it disappear
again?

when will it end??

i am never touching this file again

Updates
Leticia

Fix C++11 error

Fix C++11 error

K3 bug fix. NormQ/LowQ pair counting change

two plus one corr (Markus)

fix typo in axis labels

add rho mass task

minor change

jet mass updates

jet mass response bkg vector

add histo fHistMdAreavsCent

updates

add track from jet maker + missing AddTask + minor changes

remove debug statements

add option to make particles massless

add histos for matched jet to MC to JetMass task

add more mass bkg QA

 fixed issues with vzero calibration in flow package

- fixes are transparant, no user intervention necessary
- restored call to calibration database in AliFlowEvent::Fill()
- split AliFlowEvent::ClearFast() into two functions, one of which retains the calibration cache (default) and one to clear the cache
- restored AliFlowTrackCuts track factory, where an incorrect cast rejected all VZERO information

 st^Cic functions for p-value: cleanup and add all code that was used for approval

 add AOD TPC outlier cut for LHC10h and LHC11h data

- cut is disabled by default (for compatibilitiy)
- enable cut by calling AliFlowEventCuts::SetCutTPCmultiplicityOutliersAOD(kTRUE);
- select period by AliFlowEventCuts::SetLHC10h(kTRUE) or AliFlowEventCuts::SetLHC11h(kTRUE)
- on the agenda is creating a better interfact or let the event cut class determine the period by runnumber by itself

Vc: update to 0.7.4 release

Summary of the changes in Vc 0.7.4:
* fixed several compile errors / warnings with newer or old C++
  compilers
* support clean compilation with more -W flags
* fixed compilation when compiling without optimization
* added operator-- to Vector<T>
* Copying Memory now uses SIMD move instructions
* Vc::Allocator<T> now uses a minimum alignment of the SIMD types of
  the chosen Vc implementation. Thus making it useable for containers of
  builtin types.

Signed-off-by: Matthias Kretz <kretz@compeng.uni-frankfurt.de>

AnalysisTask of AliRoot vAN-20140404

new directory for Lego Train from Natalia

- Safer initialisation of V0 mother index (but should not have been a problem before)