Merge branch 'master' into dev

Tracking update

fix conflicts and Libs

Use std output and MC trigger

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

 latest implementation of the Beam Pipe and its support on the side C in view of the ITS+MFT joint upcoming simulation production run
Raphael Tieulent <raphael.tieulent@cern.ch>

improved efficiency by caching leading jet per event, changed cuts on leading jet to simple jet kinematic variables

Mapping instance copied of when reading from file + Track Clear

This avoids problems when switching file (the mapping would be deleted).
The AliNanoAODTrack track class now has a Clear method.

hack the alien env to make it work in all cases

make the script working

changes to run on nano AODs (temporary)

first changes to run on nano AODs (temporary)

- store b and c from on-line track to AliESDTrdTrack

Force caching of the CMAKE_INSTALL_DIR variable
Reorder check on ALICE_INSTALL

be explicit about the alien user

put back also the maximum foreseen ALTRO DDL, not only the number of super modules

comment printf

Incremented ClassDef

 add bookkeeping of pythia ntrials and cross section for pt hard bins

fix the executable bit

change the logic of creating a softlink - override the old one if exists to provide a link to the most current donwload (for e.g. the LEGO train output

Merge branch 'master' of http://git.cern.ch/pub/AliRoot

Update

Remove TObject::Clone calls (JIRA 4874)

When filling the array of valid file ids, avoid calling
AliCDBId::Clone()
it has unpredictable effects (on SLC6 and with root v4-34-11
it was crashing the mchview executable).

Merge branch 'master' of http://git.cern.ch/pub/AliRoot

added AddTask macro for AliAnalysisTaskPi0FlowMCAOD

from Mesut Arslandok: add event gid to filtered trees

small updates, large scale test of this version is running

fix angle to absId mapping for extensions

Revert "Revert "#103626: Commit DCal geometry to master" since the files are broken."

This reverts commit 7fb33c06ecf4fb24f16367ecdb5a4a4e063cce9b.

move DCAL automatic geometry setting to runs larger than those of 2013

cosmetics data members comment indentation

Increase back the number of SM to 22

from Yvonne

Changed hit/match access methods from protected to public

update from Yvonne

- fast TRD PID implementation with muon constraints (Daniel Lohner)

Modification of AddTRD task for calibration (Raphaelle)

 to explain why this merge is necessary,
# especially if it merges an updated upstream into a topic branch.
#
# Lines starting with '#' will be ignored, and an empty message aborts
# the commit.

TRD macro

Merge branch 'master' of http://git.cern.ch/pub/AliRoot

TRD macro

Update from Massimo

switch off shriking of tclones array to avoid large virtual memory

Fix if both FASTJET and FASTJET_ROOT are not set

Add FASTJET package definition/finding macro for general use; use FASTJET_FOUND variable to switch on/of FASTJET usage in JETAN and PWGJE

Remove fastjet include files; do not build libFASTJETAN if there is no fastjet on the system

Separate out PWGJE (user)tasks that need fastjet; do not build when fastjet is not present

 added pdet-ppart over ppart histogram for detector response

make it work on lxplus

fixing the way the photon is isolated at mc level and adding a TH3 for the mc-truth photons isolated at mc level

 update AddTask macro from Naghmeh

update for momentum resolution study

updated for vertex study

technial fix to suppress the warning

Make the option to keep the SPD tracklets in muon AODs accessible after the ctor has been called (Laurent)

Coverity fix (Laurent)

dont process if detector container not present in the qa file to avoid overwriting with empty results

Fix (AndreaR)

- remove descriptors and classes with obsolete TRD inputs

set fill map once

avoid overwriting of  efficiency maps in multi tasks

Charged jets(pPb) framework bugfixes

Signed-off-by: loizides <cloizides@lbl.gov>

Merge branch 'master' into dev

Update in Lc task (ChiaraZ)

install GlauberMCDist.root and SpectatorSignal.root to /home/shahoian/ALICE/AliRootCurr/ZDC/

Task for Lc->K0s+p with TMVA (Chiara Z.)

Merge branch 'master' into dev

Using CMAKE_INSTALL_PREFIX_INITIALIZED_TO_DEFAULT variable to check if CMAKE_INSTALL_PREFIX is set

reduce memory internal train by ~0.5

New mehtod for tagging Lc candidates from Hijing generator

Remove usage of hardwired calibration

Using CMAKE_INSTALL_PREFIX instead of ALICE_INSTALL if set from configuration

If defined, the installation will use CMAKE_INSTALL_PREFIX, if not it will default to ALICE_INSTALL.
If ALICE_INSTALL is not defined it will default to the source directory ALICE_ROOT

Merge branch 'master' of http://git.cern.ch/pub/AliRoot

Update of the hfe package from gsi svn

Added Phi Distribution
AddTask modified to disable length cut

add p conserv at kine level, flag to speed up the analysis (Fabio C.)

Protection against missing MC header

Modified input parameters

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

- changes in Dalitztask
- modified cutnumbers for PbPb task

rebinning two histograms and removing one printout

Updates from Prabhat

fix

mixing memory updates

Putting some order in the list and number of detectors

set timing cuts LHC11h

add exotic cluster remove switch to cluster maker

New class for MC AOD analysis (B.Polishchuk)

 minor typo fix

Update from DptDpt Correlations task

changed to nanoAOD production; fix in AliAODVertex::CloneWithoutRefts

coverity fix (memory leak in binning array)

update the chain of scirpts/mcros for filtering of raw data

Disable test of requested CDB objects similarity in sim and rec in case the sim has never requested this object

Disable test of requested CDB objects similarity in sim and rec in case the sim has never requested this object

Technical fix in CheckRecoCDBvsSimuCDB

Technical fix in the CheckRecoCDBvsSimuCDB

remove debug message

remove obsolete option to set aliroot environment, the env has to be set externally

make the update of the period level QA safe (by running in a temp location and only moving after validation)

variable normalization range of the event mixing histograms for correlation functions
before: fixed 1/2*pi < dphi < 3/2*pi
now: pi - dphirange < dphi < pi + dphirange (default: dphirange = 1/6*pi)