pplying cell threshold for the QA histos

- Added loose rejection of light nuclei - Better treatment of PID probs w.r.t. light nuclei - Replaced most probable PID in data at low pT to some manual TPC only approach to get pure dEdx templates this way

- Special treatment if most prob PID is light nucleus only if well above el expectation (in order not to mix up at ID at very high pT)

update from Prabhat

Added macros for D0 analysis config with rsn package (Massimo)

Added new class for D0 daughter cuts (Massimo)

Added DCA of daughters and DCA product computation (Massimo)

New array for PDG code for K* and antiK* + added histos for phase space check + added sparse for reflections

Fix bug: di-muons in Z invariant mass were rejected in simulations even when it was not explicitly required (Diego)

Reweight muons from B decays (Diego)

add proper selection of primary vertex reconstruction for AODs

add proper selection of primary vertex reconstruction for AODs

add setter for the L1 trigger bits, in case automatic configuration does not work

fix finding of pad neighbours; remove methods to write them in OCDB

Round slates are rotated compared to others so the pad density
increases instead of decreasing when going from left to right:
--> increased number of possible neighbours from 10 to 12 to be
full symmetric (also consider increasing density from bottom to top)
--> corrected possibility to store the neighbours at their
corresponding position in the array (holes filled with invalid pads)

cosmetics, fix comments

#103626: Commit DCal geometry to master

Initial implementation of the DCAL Geometry (work done by Mengliang WANG for his service task). 3 versions have been implemented: - EMCAL_COMPLETE12SMV1_DCAL: 12 EMCAL SM + 6 DCAL SM - EMCAL_COMPLETE12SMV1_DCAL_DEV: 12 EMCAL SM shifted and 10 DCAL SM (this is a possible future DCAL geometry) - EMCAL_COMPLETE12SMV1_DCAL_8SM: 12 EMCAL SM and 8 DCAL SM (the current DCAL geometry)

add setters for L1 trigger threshold and Bits, in case the automatic ones are not correct, change how the L1 automatic threshold is recovered in case of old AOD format

changes in STEER for FIT

changes for FIT

fixing output type

fix in trackerV2 DeltaX

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

fix in trackerV2 DeltaX

Check CVMFS_OCDB and deal with storages accordingly

In SetDefaultStorage check environment variable triggering cvmfs case:
CVMFS_OCDB. It is supposed to be set to the cvmfs path, containing
OCDB tags (list of all files seen in each OCDB at the moment when
the AliRoot tag was created) and two scripts, to get the year from the
run number and to extract the files valid for the given run.

The method ValidateCvmfsCase validates the $OCDB_PATH path
    // and modify Uri if it is "raw://"
The "alien://" uri passed to GetStorage is converted into a
"local:///cvmfs" uri inside CreateParameter called by GetStorage, via
AlienToCvmfsUri.

E.g.: OCDB_PATH="/cvmfs/alice.cern.ch/Packages/v5-04-Rev-12"
Example of expected subtree inside OCDB_PATH:
     Ideal.list.gz
  MC/Residual.list.gz
     Full.list.gz

     2009.list.gz
data/.......
     2013.list.gz

 bin/getUriFromYear.sh
     getOCDBFilesPerRun.sh

In addition:
Set indent to standard two spaces
Fixed indentation of comments foll. method header

Get only highest sub+version in L::QueryValidFiles

Let AliCDBLocal::GetId look in the list of valid fileIds and let
AliCDBLocal::GetEntry get from the list of valid FileIds

SetRun sets AliEn URI via SetDefaultStorageFromRun also in
CVMFS case, via getUriFromYear.sh script

small changes to D0-h code (Fabio C.)
)

changes to DStar code (Sandro B.)
)

update on MC tasks by Markus

Register only requested branches to cache

Create JDL from list of local files, not template (they may differ) (Diego)

Use trigger tracks to estimate efficiencies in QA (to remove dependence on tracking) (Diego)

In Terminate: get track source based on output (Diego)

recover the L1 trigger threshold from data, set the L1 trigger for the selected trigger, set L0 by hand

Adding CORRFW to EINCLUDE

adding electron rejection to eff cont task (same way as for default BF analysis)

including some debugging and checks on the cell array and cluster cells

correcting neutral energy isolation (not included in this code before)
including option to run the task twice in the same legotrain run, with different trigger types

parametrizing the output containers names according to trigger type

Check the SPI7 and SPI8 online trigger names to fill the 2D histos (was only checked for the counter)

fix AOD class def number where change in trigger format occurred

add switches to reduce number of histograms, specially for simulations; add switch for V0 histograms since AOD does not contain v0 signal

make sure trigger wagon is not activated for simulations; switch off some histograms in case of simulations

modifications to run accordingly to the modifications in the Flow package + some rebbinning of the histos (G.Luparello)

extract dca for global and global contraint tracks with different methods

dca fix

update in Proton Femto train

using DCA() and ZAtDca() instead of PropagateToDca

Change centrality bin defintion (ADC, ZCdV)

New macro to analyze p-Pb MC data (Paul Batzing)

fix default poiType in TagPOI (thanks to Grazia Luparello)

Comment unnecessary printouts (ADC,ZCdV)

Comment printouts of filling inv mass distributions per candidate

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Int_t -> Float_t for parameter in SetBRAT

Fix typo

Fixed typo

Macro to fill OCDB with the equalization factors for 2010 p-p data. The factors are taken from Alis analysis code.

Adding analysis task for equalizing the VZERO signals in 2010 p-p data (David)

Adding analysis task for equalizing the VZERO signals in 2010 p-p data (David)

correct typo

reject events triggered with low threshold in coincidence with high threshold only optionally

 coverity fix

tunning extra event cuts

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

SetBRAT added

Adding Test bit 0 in AOD

trigger selection - crosscheck as a V0 daughter

add histograms for combination of threshold 2 trigger when there is no threshold 1 trigger

fix warning for uninitialized fLocalRho

updates from Christine for TriggerQA. New class for patch trigger QA (Christine)

remove test cout

Adding reaction plane dependent histograms to trigger QA class

Added event cut set for MC

Adding histograms

- changes for QA part of standard GG task
- changes for Dalitz task to make the output smaller (Pedro)
- changes Eta 3 particle decay channel, including Mass cut

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

Add pileup rejection in AliMuonEventCuts (Diego)

Updted macros for K* in p-Pb + extended pT-axis range

Extended pT-axis range (Neelima)

Fix for coverity defects

coverity fixes

try to fix coverity on non static array indexes plus cosmetics

coverity fix

stream fEvent (Marta)

Updates from Debojit: PID Corr

fix compilation warning on bit check on a sum

fix compilation warning on bit check on a sum

add missing initialization of new data member in constructor

Cleaning of the method CheckAOD. Comments added (Enrico)

Merge of the old ConfigSigmaStarPP.C and ConfigSigmaStarPbPb.C macros, finalized to the reuse of code - updated macros (Enrico)

Fixing coverity bugs

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

some coverity fixes

change histo axis

fix index out-of-bounds bug

work in progress

add delta-pT jet embedding task

fix coverity bug

avoid crash when no vertex is available (mcgen)

new dielectron MC tasks by Markus

update from Prabhat