From Laurent Aphecetche: Change of parameters for muons

more functionality + fix get_realpath()

add some more functions from the benchmark related
to copying files (paranoidCp, paranoidCopyFile, copyFileToLocal)

fix get_realpath to also work for (existing) directories

Add TRD-PID code (Yvonne)

setupStorageDatabase template created.

monitoring with new TRM and QTC modules

make guessRunNumber robuster by using guessRunData

List events panel in ED looks better now + preparation for sending RecPoints from reco to ED

Kinks data, rad float

kinks, Rad-YK minnor changes

export the runNumber into the env

Add Offline/FEE ADC info to each patch and highest trigger patch energy information for events that did not fire the trigger

New task DpxDpy DpyDpy DpzDpz: prabhat

update dpxdpx task: prabhat

make paranoidCp robust

bugfix: do nothing if destination==source in copy

Fix for broken compilation
=====================================
Add header files for types where functionality is used in the header file of AliJetContainer.
Fixes broken compilation on MacOS.

ATO-98 more verbose output for benchmark

ATO-98 Example config file to run /u/miranov/AliRoot/git//TPCdev/PWGPP/benchmark/benchmark.sh at  GSI batch farm

ATO-98 - Temporary Bug fix: Use proper radius range to select TOF space point. Nicer solution - use getter of AliTrackPoint to be implemented later

ATO-96 - function to make a diff file  between *.C files - ignoring prefix of OCDB path

Methods to check D+ and Ds decays with K0s

Added better efficiency parameters, changed some sparse binning

Adding checks of branching ratio of D mesons in AliAnalysisTaskSEmcCorr
Minor changes to FD class

Differential-in-eta reference multiplicity

moved to correction to pt,eta,phi, using THn, integration over ep in correction

A few size tuning modifications geared towards h-V0 correlations analyses (Tuva)

p_{T,assoc} < p{T,1/2}

 add  some more static variables

Updating HLT responsibles for Shuttle

More histograms for Raws

Change in drawing macro:
- Adding event classes for AMPT/HIJING V0M multiplicity binning

trainconfig 133 in PbPb added for phi cut

set cuts for conversion + calo to be restricted to the calorimeters as option

 increase ease-of-use of jet v2 unfolding framework

- user can now more easily tune correlation between in-plane, out-of-plane yield
- make predictions of uncertainties for higher statistics
- minimize chi2 and caluclate p-values (is now done on-the-fly using static arrays)
- no more hardcoded parameters in .cxx or .h
- output to screen is less cluttered, some info printed in C style for further processing if desired

modified photon cut strings in AddTasks for phi cut

modified Addtasks to comply with new format of ConversionPhotonCuts

added QA histograms in order to see phi distribution after cuts

modified ranges for Phi exclusion cuts in order to be able to go accross 2Pi

added 3 new cutnumbers to be able to restrict the TPC acceptance only to the good TPC sectors

 properly initialized new histogram

new macros for Kch femto in pPb

changes by Andrea for flow part of GammaConv

minor indentation change

modified MC routine to be faster

changed addtask for ConvCalo

Removing centrality check from default:
- return 1 for accepted events in case centrality is switched OFF
- switching on centrality with SetCentralityPercentileRange(min,max)

better warning when no input available

unique processID for parallel processing of QA

- a stub so far
- fix a regex + small fixes

update for Pion Source Imaging

nvartrk=7 in ESE task

ZDC automatic scripts updates (Marco Leoncino) + updates in QA config

primary particle criteria correction (ESD)

fix rejection bits for not re-reconstructed primary vertexes

changes in BF drawing macros:
- proper ROOT averaging in case of merging balance function histograms
- adding one more centrality class (0-10000) for MC V0M multiplicity binning

Adding HF daughter tracks to filter bit QA task:
- avoid double counting (to be improved)
- possibility to exclude filter bits from QA (e.g. hybrids)
- so far working only for 2 prong decays (need to understand how subsequent decays are handled)

Implement option to copy MC label from clusters to cells (for MC productions where MC labels are not available in cells). Copied and simplified from AliEMCALTenderSupply

Added plots fpr PID qa from PIDqa task + addedd mean and sigma for Nsigma_TOF + cleanup

New histograms for 2particle correl added

bug fix

Modified histogram with event counters + updated macros for D0 analysis (Massimo)

bug fixes

adding det responsible mail adresses in case of failure of automatic script failure

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

adding det responsible mail adresses in case of failure of automatic script failure

A few fixes in the OB materials and volumes in accordance with the latest specifications from Corrado (Mario)

optionally mail the full prod summary log

fix: parse the delimiter correctly

beautify the debugging output

Use the subwagon string

Update Andrea

Add switch for tail cancelation

 fix stupid streamer mistake

updates in PID selection

Add string in input for subwagons

 fix minor issue in assignment

Method 3 fix: Recalculate jet pt and direction

 changed default filterbit

fill the tree only with central events

update in Kaon Femto train

provide better debug information and use the lib

- put log statistics in the email and attach: full log summary,
stack traces and stack trace plots
- use the PWGPP/scripts/utilities.sh lib instead of locally defined
  functions

updates. add basic stack trace plot func

 calibrate the vzero signal that goes into the total Q-vector which can be retrieved via AliFlowEventSimple::GetQ(...)

- the calibrated Q-vector is now called via AliFlowEvent::GetQ()
- calibration is performed performed automatically when the flow event is filled using the flow track cuts object that is set to provide VZERO data (i.e. via calling GetStandardVZEROOnlyTrackCuts() )
- correct calibration routine will be determined from the run-number
- 10h: Q2 and Q3 are calibrated
- 11h: only Q2 is calibrated
- change is backward compatible

 fix warning: unused variables

 fix missing initialisation in named constructor

 remove temporary task that was used to troubleshoot the gamma flow anaysis

Merge branch 'master' of https://git.cern.ch/reps/AliRoot

* Config.C: use proper setting for EMCAL based on run number
* EGConfig.C:
  - Correct directions of beams
  - Do not impose a trigger particle for DPMJet pA/Ap.  This mistake
    came from (wrongly) copying the settings from LHC13f2a
* FastSim.C:
  - Allow for monitoring of local runs
  - Read GRP in master, and propagate to slaves
  - Other minor fixes
* RunFast.C: Allow specification of PROOF cluster
* simrun.sh: Fix break on lego

added methods to define the set of cuts used in the V0 and cascade re-vertexers + added methods to define the set of cuts used in the V0 and cascade re-vertexers (Domenico C.)

extend lhc11h run number and add MC efficiency label

Coverity fix (Alis Rodriguez Manso):
- remove unused dphistarmin

add possibility to extract main patch from AliAnalysisTaskEmcal::GetMainTriggerPatch

Methods to check Lc decays in the Kinematics

don't sort clusters after local reco, do this in AliITSUTrackerGlo

Select correct QA Histogram

Fix bits of selected trigger patches after removal of unwanted bits

AOD particles with cluster index 0 were not checked for their shower shape, avoid the check on the cluster index and do the shower shape cut only when the range is defined

Correct handling of seeds for MC on the fly trains

Adding AliGenerator::SetSeed which AliFatal by default
It has to be overwritten in the deriving classes

Implemented in PYTHIA6, 8, Hijing, AMPT
Change of signature in TUHKMgen which already had SetSeed function

 pid task updates from naghmeh

typo

Fix for undefined histogram for fake tracks